4QAIA

P. stipitis oye2.6-y78w
Total Genus 142
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
142
sequence length
404
structure length
404
Chain Sequence
SSVKISPLKDSEAFQSIKVGNNTLQTKIVYPPTTRFRALEDHTPSDLQLQYYGDRSTFPGTLLITEATFVSPQASGWEGAAPGIWTDKHAKAWKVITDKVHANGSFVSTQLIFLGRVADPAVMKTRGLNPVSASATYESDAAKEAAEAVGNPVRALTTQEVKDLVYEAYTNAAQKAMDAGFDYIELHAAHGYLLDQFLQPCTNQRTDEYGGSIENRARLILELIDHLSTIVGADKIGIRISPWATFQNMKAHKDTVHPLTTFSYLVHELQQRADKGQGIAYISVVEPRVSGNVDVSEEDQAGDNEFVSKIWKGVILKAGNYSYDAPEFKTLKEDIADKRTLVGFSRYFTSNPNLVWKLRDGIDLVPYDRNTFYSDNNYGYNTFSMDSEEVDKELEIKRVPSAIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords NADPH dehydrogenase
publication title Residues Controlling Facial Selectivity in an Alkene Reductase and Semirational Alterations to Create Stereocomplementary Variants.
pubmed doi rcsb
source organism Scheffersomyces stipitis
total genus 142
structure length 404
sequence length 404
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-05-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4qaiA00
1JCJA 3L21A 1UCWA 2ZA3A 1JCMP 2ZRYA 2ATMA 3BW4A 3PSVA 2GUUA 2WOQA 5D32A 1TV7A 1NFBA 1YTEA 2WPBA 3GDKA 3BW3A 1ADOA 3C2FA 4N9BA 3TQ0A 4DO6A 5MHBA 5FF7A 4IMGA 4ONVA 3FYOA 5D03A 5K3VA 3TR2A 4O10A 3BG3A 3IVSA 3GIYA 4UTTA 3G0UA 4FX7A 1ZCOA 4X9SA 2JKEA 4JDYA 1EP1A 2X1SA 1FWTA 1RV8A 1SQ7A 1QR7A 2E5DA 3LHTA 1BKSA 3LCLA 3KVKA 3UWZA 4FXRA 3ABOA 4O1DA 4Y90A 1TTJA 3P8JA 3R8RA 4EWND 4E2BA 1A5SA 1GVQA 5KTLA 4O11A 3KRZA 3UWUA 4FXSA 1EWDA 1B3OA 1LZOA 2Q3OA 4M6PA 1M5WA 3BLFA 1ZY9A 3EWYA 4L4LA 1XFBA 1J4EA 1ZENA 5IM51 3C2EA 4AF0A 2DORA 4Y6GA 5LNUA 4FNQA 1KTBA 3FLUA 4UFHA 1GJPA 4DF0A 2DZPA 1C8VA 1EUAA 4CQ8A 3HBLA 1O4UA 1OABA 4IMCA 2C14A 4QISA 1OFPA 2WNZA 4XBKA 3ATYA 3S8HA 1TPH1 5AHFA 3NL6A 3LTSA 4KFNA 1TSIA 1TRIA 1GTEA 4FNUA 4ZQPA 3R12A 4CCEA 4S2BA 3W1AA 3LLFA 3B05A 3EX2A 3BLEA 4XZ9A 5HWNA 3EKZA 4ORMA 2FPTA 3OHIA 1FUYA 3GR8A 3UYCA 5E93A 2VXNA 3TK7A 3TXVA 3W1PA 2QAPA 5ABTA 4PFMA 5LGXA 1ZAJA 2YGYA 3ELFA 4O28A 2R14A 1W5NA 2HMCA 3M5VA 4UC5A 4JY8A 4Y9AA 2Y63A 3SIZA 5G1YA 1LCOA 4LC8A 5D37A 3CIWA 2E09A 4PL2A 3W7JA 3W7DA 3Q94A 2Y61A 1EA0A 1Q45A 2ZZ6A 2B7QA 3LERA 3NPVA 3LLDA 1JCNA 2NV1A 4JX4A 4A2SA 4UTTC 3NQVA 3NL3A 4TR9A 3W7PA 4UR8A 1L6SA 1IF2A 1ICPA 2F84A 4PH6A 2QDHA 2Y70A 2QCCA 5G2IA 3SI9A 1JCYA 1QFEA 2QAFA 2NX3A 3UZJA 4I7WA 5HINA 4U28A 1HFBA 3E0IA 3WJYA 4IMEA 4K37A 1GEQA 3L68A 3PWAA 4ML9A 2W6RA 4LVGA 4GUIA 4MPQA 1SZNA 4PTNA 1UUOA 2Y85A 2VFHA 2OX1A 1OYAA 5CGQA 2W0UA 4NU7A 3S6DA 1TPUA 2WO5A 5FF3A 1PCKA 3TFXA 3TMLA 1YDOA 4GBUA 3W85A 4NJJA 3BK0A 3DFQA 4MZ8A 1U5JA 4IXXA 1H60A 3STCA 2CLEA 1WDWA 2QCEA 4I9AA 1EP3A 2YDAA 3LCIA 3MWAA 2R91A 4TMCA 2TMDA 4E0CA 1SZEA 4CNPA 4KFPA 1H1ZA 3PUDA 3RFAA 1T99A 2RHGA 5EMUA 3V1PA 1XM3A 3OVRA 3W7GA 3UXDA 1EWEA 4XKYB 2P0OA 1UBSA 1FWRA 3PS7A 4LOCA 3IV3A 3TIMA 4GUJA 5C2XA 2G96A 2QCLA 4LV9A 1WV2A 1Q6RA 3A5FA 3NVTA 5K9XA 2EKCA 2X30A 4NNAA 1DVJA 4UTIA 1OF8A 3FKKA 1JULA 2NWSA 5DBTA 4HHPA 1F2JA 3G3MA 3NDOA 3W73A 4PC8A 1F6KA 3U6WA 1UJPA 3UPWA 1HTIA 1FWNA 3LXCA 2ZQ0A 1IXOA 2CU0A 2ZRUA 1T8XA 1R2TA 5BMWA 1M7PA 3IRDA 4AWUA 2A2IA 2BSLA 1TIMA 4HNUA 1LRQA 4JXCA 5AC6A 1PVNA 1TPEA 2ZA1A 1W3NA 1F74A 2E6YA 3QC3A 2C16A 1G69A 1TTPA 3N73A 1GVSA 2Y7FA 5DLCA 1I2OA 3UNDA 1GOXA 2ALDA 1QAPA 4RX0A 3W3OA 5HWMA 2G95A 4ZQCA 5LSMA 1XXXA 3EXRA 3L0GA 1RQBA 3EKLA 4MY8A 3L0NA 1KV5A 3NXFA 5CZJA 3L5MA 5HWJA 1AMKA 1XBXA 1O5KA 3PAJA 2YFNA 3M6YA 3P5YA 1W1ZA 4A2RA 2A4AA 1FXQA 1S5TA 3ANYA 5CPLA 1PL9A 4H6KA 1J2WA 4OV9A 3MP4A 3I7RA 3O6CA 1AW2A 3W87A 2YZRA 3MW7A 1YXYA 2H6RA 1WX0A 3PM6A 3BPWA 2I14A 4WY0A 5F4WA 1MXSA 2EAWA 1EP2A 1JQVA 2ZTJA 1TRDA 3T4CA 2A7RA 1U83A 4HKPA 3LB0A 3W7EA 4DQWA 1IIHA 1TQJA 3RNDA 2NV2A 1BTMA 4EF9A 4LRSA 1UASA 1KFKA 1KM1A 1WBHA 3MHUA 1MSSA 1Y0EA 3QJAA 4NZFA 1KLYA 2OT0A 3W83A 1OF6A 4Y8FA 3W84A 5AC7A 2XN0A 3S5ZA 1OJXA 1W5OA 3E02A 4ZMGA 1D3GA 4JTTA 4X2RA 2NLIA 1RR2A 5GVJA 1LOQA 2Y7GA 1VZWA 3MMTA 4CQAA 1OFBA 1S5WA 3A22A 3U8GA 1Z48A 1LRNA 3DKJA 3L66A 2DU2A 5CSSA 3DHDA 1VH7A 3O8AA 4HSNA 3W7MA 4UTJA 4LVFA 3NPXA 1YADA 1TV5A 1SR9A 1QPQA 4QAIA 3MP3A 3B04A 4GNJA 4K8EA 4WXZA 3M5ZA 3DFOA 1LOLA 2X1RA 3B0PA 1ICQA 4WOZA 3H53A 2G5WA 2NXGA 3QRHA 3M16A 4GUGA 2E1DA 5DXXA 3TX9A 2QCMA 3EWZA 2YXGA 5D2TA 1XKYA 4MLJA 3DXIA 4P61A 4I7VA 1LM1A 1NEYA 1YXDA 3HIJA 2E6AA 3ZS4A 3PBYA 5K9CA 4AB4A 3G1VA 1LP6A 2H3BA 4QM1A 3EX1A 3FKRA 2CZFA 3HG3A 1PIIA 1ZHAA 4ZQOA 1QPNA 1L6YA 2H8XA 4IOTA 3FEMA 3OBKA 3FS2A 4TIMA 3TROA 1W3TA 1DQWA 2JBMA 3ZWSA 2VOMA 1IIGA 4NJGA 4RKAA 4Z0JA 4JICA 4DXVA 1ZNNA 5AHEA 1JCXA 1C29A 1VR6A 4LT9A 2GVJA 4UTHA 1HUVA 4LVAA 3C6CA 2GVLA 3G1SA 3VI2A 3QPYA 4O8RA 4RZ4A 2Y88A 1H7NA 3B03A 1IXPA 4ZZ9A 1KM2A 2WV8A 4AXKA 3W22A 3RMJA 2GQAA 1W8SA 4FEZA 3OVPA 3S1XA 3NQ8A 1KFJA 2J9XA 4X22A 1IGSA 1YLVA 5C6MA 1XBZA 2O7QA 2WQPA 3GDMA 2ZZ7A 3PB0A 5FEWA 3L0KA 1SO6A 4AAJA 3EB2A 1X7FA 1KTNA 4BI6A 1PV8A 3W2UA 2YX0A 2ZBTA 1VCGA 2RKXA 1X6UA 2OCZA 3NZRA 3F4NA 5EKYA 3SFKA 1OFAA 4LTSA 4OQVA 3P5ZA 4QSHA 4FIQA 5E0KA 4UTMA 4RXFA 3GDRA 4L4MA 5F4SA 2B7NA 2QCDB 3ZFHA 2ZZ1A 2FTPA 4CNNA 5G4EA 3MI6A 4LNYA 2QJHA 3P8IA 2JK2A 2J88A 3ABSA 3PUOA 3T44A 3SR7A 2R8WA 2XFWA 3W7OA 3W07A 3O16A 1I2PA 4DO4A 4Y96A 5LHFA 1OFDA 1ML1A 3IVTA 5AYXA 2ISWA 2A7NA 4RCXA 3LHZA 4LWWA 1A5AA 2CWNA 4A22A 4DEFA 3G8EA 5DELA 3EEGA 3TJLA 4QITA 4DELA 3UWYA 2YSWA 5CZ0A 2QEZA 1WOBA 2FB3A 3M43A 2AAMA 3PVFA 1XDLA 3WJZA 3R2GA 4PODA 4DPQA 1W3IA 3O1NA 5DCDA 4XQ6A 4BF9A 2ZCGA 1C9DA 1TJPA 3K30A 4N4PA 4UCGA 3STGA 1LTDA 4N02A 1OX4B 4UFMA 3V75A 5LNVA 1K03A 4LW7A 3BARA 4NQ1A 1WYIA 4OE7A 1RVGA 5LGZA 1GT8A 3W7NA 3IEBA 3W1XA 1M7OA 3LTPA 5CPMA 1F5ZA 3TC7A 1GVFA 3GVGA 3W74A 5AHNA 3QZEA 2HS8A 4O0ZA 1MO0A 1SU5A 2ZRVA 5CPNA 2YYTA 2Y6ZA 1SO5A 3GXPA 3D0CA 3NPWA 3GKFA 3NYZA 1OVDA 2ZRXA 4N6EA 1EPXA 3EWXA 5TQLA 1T96A 2Y7EA 3TUUA 2J6XA 4C1LA 4N4QA 2V2CA 1LROA 5CZSA 1O95A 1PS9A 5F2LA 1O5XA 2IQTA 1ALDA 4EOUA 4GC4A 2OT1A 5AN7A 3W7KA 3N9RA 1F76A 5EA9A 3N19B 1UB3A 3M9YA 4Z08A 1DL3A 3DAQA 3HGJA 4JS3A 4O1BA 3BVJA 3STEA 1LLZA 3DHFA 4EF8A 1LBMA 3VCRA 5HUOA 4K36A 1G7UA 4JTGA 2BZNA 2WSQA 4LV4A 5K7JA 3NQAA 4UMAA 3S9YA 2CLOA 1B57A 1RD5A 1EEPA 2E6DA 4YXGA 2NX1A 1RQHA 4IJBA 4AMAA 5K2ZA 2DZSA 3TAOA 3HG4A 2ZRZA 5E1QA 3KFTA 2CLFA 3TQKA 4HT3A 4K8HA 1K7FA 3MBDA 3FIGA 3KHJA 4TMBA 3BLIA 1R2RA 3RF9A 1S5VA 3WK0A 3TMQA 4WY0F 3FJ6A 3PC0A 3IIXA 4CNOA 3GX9A 1H50A 2V81A 4BWLA 5C55A 4IUOA 2D73A 4ADSA 5LNSA 5HQEA 2CLHA 3TSBA 4UIOA 3MHGA 4WQ6A 1XI3A 3PR2A 1QCWA 1X1OA 1QPRA 4LVBA 1KW1A 2X1UA 4LUJA 1GVOA 4FO4A 1FCQA 3TCEA 1G4SA 4NT0A 3CB8A 3G1DA 3NQ2A 4JYDA 2GQ9A 3W7CA 1KFBA 3N14A 4UUIA 2VENA 1TPWA 3P7YA 4MLRA 3VFLA 4GJ1A 3EWUA 3NGJA 1NF7A 3P61A 1KA9F 4YL2A 1JCLA 1SSGA 1ZALA 2C0AA 3VKJA 5FEPA 2ZA2A 3G1XA 1OFRA 4MUZA 4FX6M 2EGZA 4OWGA 5HULA 1FDYA 3M5XA 1P0NA 1A5BA 5TBOA 3O6DA 5KITA 3CEUA 3CIXA 4XBSA 4FIRA 3NQ6A 2Y89A 4FNTA 4OGZA 3O06A 2FDSA 3GB6A 2GJNA 1B9BA 1QWGA 3EWWA 4DF1A 4HN4A 1WA3A 4NNBA 3P74A 1SFJA 3DFTA 2BWGA 3R13A 4KWVA 3UD6A 5HNRA 1DBTA 3A23A 3PY2A 3H54A 3P84A 3C8FA 1DJNA 5FF2A 5DXYA 5DN1A 1CW2A 5FF0A 1FCVA 1XUUA 1FXPA 3L67A 4O12A 3TW6A 2V0TA 1B4EA 3TKFA 3MI2A 2YCEA 2A7PA 2Y62A 3KAOA 4LS0A 1O60A 5K4ZA 1AL8A 2QUVA 3W70A 2DJLA 1KBJA 2A0NA 1QNVA 3DI1A 5HR6A 5D30A 4CQ9A 4RZ6A 1MEHA 1DORA 1VCFA 1UUMA 3TXZA 1NVMA 4BWLC 4O18A 4JTLA 3LHWA 4MZ1A 2GOUA 4G1KA 3LBMA 2PE4A 3PBWA 4TO8A 1GG1A 4UMBA 1B4KA 4IGHA 4RK8A 2E6FA 1DV7A 1JRBA 1L2UA 4CLMA 2VEKA 1KBIA 1W5MA 1H51A 3HQ1A 4ZL1A 3NL5A 4H4IA 2FIQA 4GE8A 4JDBA 1XCFA 5DCBA 3UY7A 1QO2A 1KFEA 1HO1A 1KFCA 4HSOA 1OX6A 3MO7A 3HMJG 3S42A 4QIUA 5FF4A 1TO3A 5BRBA 3G3DA 3YPIA 3S5YA 4IX2A 4LY8A 1VYPX 2YR1A 1XDMA 1I2NA 2DZWA 3KRSA 3LM7A 3WJWA 3CHVA 3MI3A 3SECA 3DFSA 4TX9A 1G4TA 4KKXA 4C1KA 2EHHA 1TPC1 3W9ZA 3M0ZA 1TMHA 1YDNA 4JTIA 3WK2A 1HO4A 1R47A 4JN6A 5I3GA 1AG1O 2E68A 1TCDA 1YDVA 3NL2A 3GNDA 4O16A 4NX5A 4GUFA 3E12A 3G1HA 2QCGA 4O13A 1VYRA 3A5VA 3L5AA 3W1TA 3DI0A 3PUEA 3HPSA 1X1ZA 2C6QA 6ALDA 3EWBX 4R34A 3R5EA 1TPVA 3GAYA 3M47A 4OBTA 3MBFA 3W1LA 4CCDA 2GVGA 3LXAA 3TW7A 3EXSA 4M7SA 3SJ3A 4LUIA 1H63A 3BGGA 4JTUA 4AH7A 1NF0A 1K8ZA 3INPA 3KVMA 5D33A 4M19A 4WXYA 2ZTKA 3LCWA 4XKYA 2NXIA 4JR5A 3EX6A 4PCFA 2RFGA 5BOOA 1K02A 2QUUA 3N2MA 2WKJA 3A21A 5CKSA 7TIMA 3KOFA 3S5NA 2CLMA 4AWTA 1K8XA 2W79A 4ICNA 1AL7A 4O1CA 3PBVA 3SW6A 2LLEA 3N34A 3CWNA 3EX3A 2C19A 3LBCA 3IGUA 2NX9A 1R2SA 1KM5A 4K39A 3UPBA 4HPXA 2FJKA 1X8FA 4JX6A 3G18A 4JTEA 2QR6A 4M6QA 2ZZ5A 4JTSA 4MFEA 1GWJA 3LXBA 5EY5A 1H7OA 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 3CT7 A;  3MUX A;  1QOQ A;  3O15 A;  2X1T A;  2X16 A;  3DZ1 A;  4YWI A;  4P2V A;  3NAV A;  5T26 A;  4PA8 A;  1F05 A;  2FFC A;  2WSR A;  3OEX A;  4I7U A;  1J5T A;  3C0J A;  1OK6 A;  4UFK A;  5LNW A;  2OZ0 A;  1RPX A;  3OIX A;  2QUT A;  3Q37 A;  3GDT A;  4BR1 A;  4CCC A;  4UTK A;  3DU0 A;  2TYS A;  4Q32 A;  1OYC A;  2A85 A;  4XWU A;  5BMX A;  2DZT A;  1I4N A;  1OHL A;  3RLU A;  4Z1C A;  5AHL A;  2HSA A;  4Z0S A;  3NO5 A;  3W1U A;  3R89 A;  4JGD A;  5D2X A;  1W54 A;  3BW2 A;  3VE7 A;  3MYO A;  3LX9 A;  4MKN A;  3I6R A;  2PRH A;  3NEV A;  1ZAH A;  4FNS A;  3C61 A;  8TIM A;  4Q4K A;  5D38 A;  4A3U A;  3W7I A;  4YCO A;  1BWL A;  1RQE A;  3WK1 A;  2VEP A;  2H3D A;  2A5H A;  1Q6Q A;  1H61 A;  1XBV A;  2OJP A;  4FNP A;  3KVJ A;  3NR0 A;  3T40 A;  2VEM A;  4EVZ A;  3NQD A;  3H55 A;  1JJK A;  1EX5 A;  4JY9 A;  1I45 A;  3BO9 A;  4M7T A;  3W2N A;  1AW1 A;  1YTK A;  1TQX A;  1XBY A;  1G6C A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1KKO A;  1UCW A;  3CAS A;  3FHA A;  4NRR A;  2JEQ A;  3VXG A;  5D32 A;  3RM9 A;  2Q6Z A;  1MW3 A;  1FH8 A;  2PDK A;  1SJC A;  2NSX A;  4N9B A;  4AWE A;  3TQ0 A;  3H12 A;  4IMG A;  4ONV A;  5D03 A;  3BG3 A;  2FGL A;  3BIC A;  3G0U A;  1R5Y A;  2IUZ A;  1R9Y A;  1ZCO A;  5TF0 A;  2VD9 A;  4X9S A;  4Z2I A;  2AAA A;  1UKT A;  1SQ7 A;  3SCV A;  2E5D A;  1BKS A;  4IP4 A;  3UWZ A;  1GKR A;  3GC5 A;  4KQN A;  1Q6F A;  4O1D A;  3P8J A;  3CQK A;  4PMU A;  4H01 A;  1RP9 A;  2XPK A;  4E2B A;  2V68 A;  3GR4 A;  1R0M A;  3VUS A;  4HZ6 A;  4ATW A;  1A0C A;  4Q3M A;  3THD A;  1OZM A;  3BLF A;  3E1F 1;  2CBU A;  3FA4 A;  1XFB A;  1ZEN A;  3DYM A;  3WLP A;  3EKG A;  1K6W A;  1O5R A;  3IAC A;  5CSY A;  1GQK A;  3ALG A;  4Q4S A;  2DZP A;  4H9Y A;  1C8V A;  3QGV A;  1PIG A;  1UZ1 A;  1K4H A;  1NDY A;  3T1G A;  1ECQ A;  3PZI A;  4D1J A;  4KWU A;  5AHF A;  1WKD A;  2QVN A;  3LTS A;  4KFN A;  3VCC A;  4IL2 A;  2JQX A;  3RLH A;  4CCE A;  2IPF A;  4S2B A;  3LY0 A;  4S3F A;  1SMA A;  3W1A A;  3LLF A;  3B05 A;  4YPJ A; 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