The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
32
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sequence length |
81
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structure length |
81
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Chain Sequence |
PATRILLLVLAVIIYGTAGFHFIEGESWTVSLYWTFVTIATVGYGDYSPHTPLGMYFTCTLIVLGIGTFAVAVERLLEFLI
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transport protein
|
| molecule keywords |
Calcium-gated potassium channel MthK
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| publication title |
Ionic interactions of Ba2+ blockades in the MthK K+ channel
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Methanothermobacter thermautotrophicus
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| total genus |
32
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| structure length |
81
|
| sequence length |
81
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-05-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix Hairpins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4UUJ C; 4MW8 A; 3E8B A; 4MVO A; 3X2Q C; 3ABK C; 2Q67 A; 2W0F C; 1R3I C; 3K06 A; 2EIK C; 4WFH A; 4PDV A; 3SPH A; 3SPJ A; 1XL4 A; 2R9R B; 3F5W C; 2EIM C; 4X8A A; 1BL8 A; 1XL6 A; 2DWE C; 3LDC A; 4GX2 A; 4P30 A; 4GX0 A; 4QE7 A; 4WFF A; 2WLN A; 4JTA B; 4XDL A; 4GX5 A; 4RO2 A; 2BOB C; 2X6A A; 3STZ C; 2DWD C; 4R50 A; 4RAI A; 4G28 B; 4PDL A; 1P7B A; 3IFX A; 4G27 B; 4R7C A; 2WLI A; 3SPC A; 2P7T C; 2NLJ C; 3TCU A; 4TWK A; 1M56 C; 2HVJ C; 3RBZ A; 3EFF K; 3E8H A; 3SYQ A; 4F4L A; 1S5H C; 2X6B A; 5BZB A; 4PA9 A; 4H33 A; 3LUT B; 4P9P A; 1R3K C; 5KUK A; 2YEV A; 1KKD A; 3T2M A; 2QKS A; 3OR7 C; 3RVY A; 4MVS A; 4H37 A; 3AG3 C; 3ASO C; 4PA6 A; 5EBW C; 4MTG A; 3PJS K; 4MTO A; 2EIN C; 1ZWI C; 1K4D C; 1ORQ C; 2HFE C; 1V55 C; 4DXW A; 5CBH A; 4ZBM A; 3RVZ A; 5CBF A; 2HVK C; 3SYP A; 3OR6 C; 4I9W A; 4J9Z B; 4X88 A; 4RUE A; 3R65 A; 3ZJZ A; 3E8F A; 4HZ3 A; 3IGA C; 2WLJ A; 3F7Y C; 1OCR C; 3LNM B; 3SPI A; 3SJQ C; 3F7V C; 4PDR A; 4EKW A; 2JK5 C; 2KB1 A; 2X6C A; 2DYS C; 3E83 A; 1OCZ C; 3ABL C; 2OCC C; 2Q69 A; 3AG4 C; 2H8P C; 1OCO C; 4R8C A; 3JYC A; 3T1C A; 3T4Z A; 3FB6 C; 4CBC A; 3OGC C; 5E1A C; 3SYO A; 2EIJ C; 3LDD A; 4MVR A; 1M57 C; 1R3L C; 2A79 B; 3K03 A; 4OXS A; 4PA7 A; 3T4D A; 3ZRS A; 2DYR C; 3ASN C; 3OUF A; 3E89 A; 3FB5 C; 4JTC B; 2ZD9 A; 4XDK A; 3LDE A; 3SYC A; 3BEH A; 5EBM C; 1OCC C; 2ZXW C; 1R3J C; 3E8G A; 4MVM A; 4MSW C; 3UKM A; 2A0L A; 4BW5 A; 4KFM A; 1JVM A; 1J95 A; 3VOU A; 2WLL B; 4P2Z A; 5EC1 C; 2HJF C; 1LNQ A; 5B1A C; 4MVQ A; 2IH3 C; 1QLE C; 5KUM A; 4X89 A; 4MS2 A; 2IH1 C; 4PA4 A; 2QTO A; 4XDJ A; 2A9H A; 2AHZ A; 3UM7 A; 3K04 A; 5CBG A; 2Q6A A; 4LCU C; 4RUF A; 5EK0 A; 2Q68 A; 5J9P C; 3TET A; 2ITC C; 3E86 A; 4MTF A; 4HYO A; 3STL C; 3FB7 C; 2AHY A; 3WG7 C; 1G4Y B; 4GX1 A; 3K0G A; 5EC2 C; 4JTD B; 1K4C C; 2K1E A; 4QE9 A; 5IY5 C; 2Y69 C; 4MVU A; 4PDM A; 4P9O A; 2WLI B; 3AG2 C; 3K0D A; 5B3S C; 2WLK A; 2ATK C; 4WFE A; 3AG1 C; 4MW3 A; 4LP8 A; 3KG2 A; 2WLH A; 3SPG A; 4QNH B; 2BOC C; 3GB7 C; 3RW0 A; 3FB8 C; 2HG5 C; 2WLM A; 5B1B C; 3SYA A; 2ITD C; 4J9Y B; 3ABM C; 3K08 A; 4PA3 A; 1V54 C; 4WFG A; 3HPL C; 4MVZ A; 4R6Z A; 2WLL A; 5EBL C; 2EIL C; 3OUS A; 4LBE C; #chains in the Genus database with same CATH topology 2QGN A; 2DMX A; 1YDX A; 2CTQ A; 5IY5 B; 2JS3 A; 2OT5 A; 5LA6 B; 3UO2 A; 1VQ4 V; 4DR3 O; 3T1H O; 4QE7 A; 1XNR O; 2VRZ A; 4CH4 A; 3CRM A; 4G27 B; 3X2Q B; 1R73 A; 4LF4 O; 5L3G A; 4Z2W A; 3RBZ A; 1KMI Z; 4EB6 A; 4I55 B; 3ZMV A; 1KKD A; 2PF4 E; 2PY5 A; 2BTQ B; 4H37 A; 4MTG A; 5CMU A; 2HFE C; 3DGE A; 3K58 A; 2L6L A; 5JJJ B; 1SQP H; 2UXX A; 2XAJ A; 3R65 A; 3IGA C; 2PI5 A; 4DR6 B; 4X64 O; 4TT3 G; 2IU0 A; 4JAA A; 1H2K A; 2JK5 C; 1OCZ C; 3NXS A; 2XAQ A; 2Y4T A; 3FB6 C; 2HR3 A; 4NTW A; 1COW G; 5GTI Z; 1NR7 A; 4G2K A; 3A0H Z; 1AJN A; 1M93 A; 2C2A A; 1R6K A; 1IUR A; 1PKX A; 4UFZ A; 4U3J A; 2Q0A A; 2A0L A; 4X62 B; 3P30 A; 4JAV A; 4KFM A; 2Y0P A; 4X1Y A; 4EEQ A; 3I5D A; 4YIP A; 2OTL V; 5H6R A; 2UUC B; 2NNU A; 2YID A; 4JI3 O; 2FB5 A; 3APQ A; 1UJW B; 3L74 H; 4CS3 A; 3P3P A; 5EK0 A; 3STL C; 2QKA A; 5JJN B; 2K1E A; 1KYO F; 1Q7Y W; 5IWA B; 4KXR A; 2ZE7 A; 4WFE A; 1OCZ B; 5LHI A; 3A0R A; 5EZY A; 4QNH B; 2B1I A; 1MOF A; 2F66 C; 1S5J A; 3T1C A; 1OV9 A; 1TA8 A; 3UO3 A; 4KUM A; 3JAL B; 1XL4 A; 3CPW U; 3K3W A; 2E3C A; 4W4L A; 5CA0 A; 4XDL A; 4JYB A; 3OW2 U; 3CJH A; 4LWS A; 1MZE A; 4RAI A; 1VQ6 V; 3E2E A; 3QO5 A; 1M56 C; 1YZB A; 5C93 A; 5CB4 A; 4H33 A; 4DK0 A; 1F51 A; 1JPX A; 1YTF D; 2UXB B; 1QU7 A; 3L70 H; 4DR2 O; 3MHS C; 3ZRW A; 2EIN C; 2Y4U A; 1Q43 A; 5FPR A; 5FNV B; 3CWB H; 4Q20 A; 3AK1 A; 1VQM V; 4DV4 B; 3BAB A; 3JD2 A; 3O65 A; 5C8Y B; 3S3W A; 1KQS U; 3JAR B; 3BAA A; 1FYJ A; 4NXN O; 3HKC A; 1I08 A; 1BHB A; 5LP6 A; 1BQ0 A; 1KUQ A; 2QWR B; 1HR0 O; 1B3Q A; 3FB5 C; 1PPJ H; 2LW1 A; 4O2B B; 1ZAU A; 1M56 B; 3H9V A; 2CH7 A; 4L8J A; 1Y6X A; 3B4S A; 1H8H G; 1JFF A; 4YY3 B; 1W0J G; 2YIA A; 3ZS8 C; 1DF4 A; 3CD6 V; 1NTK H; 2Q7G A; 2QTO A; 4ZOL B; 2EIN B; 5LYJ B; 1G1X B; 2OTJ V; 1QR9 A; 2B9Z A; 2CTP A; 1HW7 A; 3RT3 C; 5JQG A; 1TUB B; 1MZF A; 3ETQ A; 1JJ2 U; 1FS0 G; 1KD1 W; 2DW4 A; 4QIW F; 1GAX A; 3FD9 A; 3CME V; 1VF6 A; 2BOC C; 4TV8 B; 4NKG B; 1VQK V; 2WWW A; 4MW8 A; 4MVO A; 2QSA A; 5B66 Z; 3VQY A; 1R3I C; 3CRQ A; 3SPH A; 2R9R B; 5B3S B; 1DGS A; 2DWE C; 4TV9 A; 1KB9 F; 4KHP B; 3MD0 A; 5J2U B; 1JA8 A; 2GV9 A; 2BSK B; 4JV5 O; 1EN4 A; 3B40 A; 2D3O W; 3SPC A; 4LFC B; 3SJB C; 1JX9 A; 2ZE6 A; 4NR1 A; 1NQT A; 2IJJ A; 3CS5 A; 3THO A; 1YSC A; 4JI4 O; 4X64 B; 3ZHT A; 4DXW A; 2V7Q G; 2XAG A; 4YXW G; 2EJR A; 4I9W A; 3T1Y O; 4K8Z A; 1TGO A; 5B5E Z; 4DV5 O; 2AZ2 A; 3F7V C; 1TVK A; 5IJ9 A; 1K3E A; 3JYC A; 4U7O A; 4J7K A; 5CA0 B; 4B3S O; 3ZN0 A; 1HNW O; 2HKO A; 3C90 A; 4JZG A; 1N32 B; 3ZRS A; 4B08 A; 2DQ0 A; 2GHY A; 1OCC C; 1G6U A; 3L72 H; 4MSW C; 4EFE A; 4LF5 O; 4CS2 A; 1SA0 B; 1H38 A; 5LGU A; 3OT7 A; 1OCO B; 4YJ2 B; 3D3I A; 2HJF C; 1FFX B; 1G8M A; 1B04 A; 4DR7 O; 3BHP A; 3RYC B; 1K97 A; 1U96 A; 1AVM A; 2N05 A; 4BW9 A; 2ZXW B; 4WFB V; 4AQY B; 4DRX B; 1OHH G; 5TIS Z; 4DR5 B; 4UV9 A; 4JI1 O; 1XBL A; 2X0L A; 1J5E O; 4UCV A; 4JI5 O; 2YIB A; 4JYA O; 5BMV B; 5LP6 B; 4QPJ A; 4IGG A; 4I4T A; 1FAF A; 2QM4 A; 1S77 D; 3OFN G; 3CCS V; 1OCC B; 2EIM C; 4OPA A; 4J41 A; 5JWP A; 1JFF B; 5KHK A; 4NXM B; 2BCC H; 4Z1V A; 4GKJ O; 3G4S V; 5EYP A; 2JJ2 G; 3TCU A; 2EUL A; 3JAW B; 1BS3 A; 1ARO P; 2X6B A; 3LUT B; 2MK3 A; 2E74 B; 4P9P A; 4DV0 B; 4X66 O; 2PUS A; 4OX9 O; 3OAA G; 1WLE A; 3OEE G; 1IBM B; 3A2F A; 5EBW C; 3VQV A; 3B77 A; 4JYY A; 4DV6 B; 2Q9L A; 1XQ8 A; 4DR4 O; 3ZJZ A; 3K5M A; 3CCR V; 1K8A W; 2QWO B; 3W7S A; 3CXH F; 4O4L A; 3TXS A; 3D8C A; 4F6E A; 3PN1 A; 4O4H A; 3AG4 C; 1NVP D; 2H8P C; 1BSM A; 4JAS A; 4TV9 B; 1ENV A; 5JJE B; 3T4Z A; 5K1X A; 1SES A; 5JH7 A; 2P06 A; 3T4D A; 1L8D A; 3WB0 A; 2IJI A; 3H1K H; 5KHI A; 1K9M W; 2QWP B; 3A0B Z; 4UV8 A; 4O4I B; 3M99 B; 3ETE A; 4LFA B; 1QLE C; 1BQZ A; 1AI6 A; 3JSN A; 4Z1M G; 4H0L B; 5CBG A; 4X1K A; 2E75 B; 2QWQ B; 1I5X A; 4HYO A; 4LF6 B; 1MA1 A; 1EN6 A; 4JZ2 A; 2HP8 A; 1M1K W; 1K4C C; 4QE9 A; 4DR6 O; 3IJ4 A; 1NU1 H; 2QJ1 A; 3AK3 A; 3AG2 C; 1SC5 B; 5J2T B; 1VQP V; 2WLM A; 4IIJ A; 3ZED A; 1V54 C; 4MVZ A; 1EZV H; 4QGP A; 3DTU B; 2AXT Z; 3WG7 B; 4JI8 B; 1N0N A; 4GLX A; 2EIK C; 3SPJ A; 5BXZ A; 2F95 B; 4X62 O; 3E35 A; 1SRY A; 4LNU B; 4RO2 A; 1Q90 D; 1EN5 A; 2Q0O C; 2UUC O; 5KX5 B; 4PI2 A; 5AG2 A; 1QLE B; 3CC2 V; 1GK9 A; 1N34 B; 1SQG A; 3CXC U; 5KA6 A; 1Y76 A; 4PA9 A; 2JGD B; 2Z3Y A; 1RSO A; 1VQ9 V; 1F23 A; 5KLV H; 4LF8 O; 4FFB B; 2HEP A; 1ZTE A; 4MTO A; 4W4K A; 3AG2 B; 1QCE A; 3FAV B; 5IWA O; 1K4D C; 3KCY A; 4J80 A; 1V54 B; 1JMK C; 2JVD A; 1MSW D; 3MDS A; 2WLJ A; 3ZMS A; 5H9C A; 3LNM B; 1VF7 A; 1XHX A; 2ZT9 B; 1W59 A; 4I4T B; 3R66 A; 1WP7 A; 4PD4 F; 4LF5 B; 1GM8 A; 3OEH G; 4HBN A; 1S3J A; 3U11 A; 2ADQ B; 5E1A C; 3HKE B; 3E89 A; 1DK1 A; 3K9S A; 1FKA O; 5EBM C; 5EYP B; 4DV7 B; 1Z2G A; 4MVM A; 5KA5 A; 1JVM A; 1XI1 A; 1B06 A; 5B1N A; 2WLL B; 3ABU A; 3L73 H; 4ABM A; 2YIB D; 1FD9 A; 5HFL A; 2UUB B; 1M57 B; 2LGQ A; 1GTO A; 2A9H A; 4RWU A; 2CDY A; 1K33 A; 2ILM A; 5K1P A; 4MTF A; 3BA9 A; 5LHG A; 2UXN A; 3B09 A; 4DV4 O; 1BGY H; 5IY5 C; 1ZL8 A; 1GN3 A; 1YIT V; 4O4J A; 2WLI B; 2E5L B; 4O4H B; 4AIL C; 3RW0 A; 5KMG A; 1JOY A; 4J9Y B; 4X20 B; 3CB2 A; 1YIJ V; 2UU9 B; 4ZHQ B; 2OYQ A; 3UKM A; 1ZX3 A; 3X2Q C; 1Q8I A; 3K06 A; 4TUY A; 3ZHV A; 1Y66 A; 1Z5V A; 3UT5 A; 1KKC A; 2W6I G; 1JR9 A; 3RYH A; 4GX5 A; 4YY3 O; 1PM9 A; 4IHJ B; 4X1K B; 1AJQ A; 3SDL A; 3WU2 Z; 3B8N A; 4F4L A; 4JI6 B; 5JCO C; 3JAS A; 3JD3 A; 2RQ6 A; 3GVM A; 3H1H H; 1VQ8 V; 3W7T A; 2EZO A; 2BE3 A; 2HHH B; 4J10 A; 2GDS A; 2KQX A; 2R72 A; 1H2G A; 2EBO A; 3JD0 A; 5CBF A; 1WPB A; 4B3M B; 2XTA A; 3CC7 V; 3JAT A; 1RM1 B; 3CCL V; 3ZCC A; 1L1F A; 2OCH A; 1UFI A; 1Y74 A; 5DED A; 4NTY A; 4KHP O; 3CRA A; 1ROP A; 2A79 B; 3CCE V; 1BT8 A; 1U97 A; 1N0J A; 4JPR A; 3E8G A; 3CHX A; 4LFC O; 4HNA A; 4TQF A; 1EFR G; 2Q6A A; 3HR0 A; 3CRC A; 5J9P C; 2YXL A; 3RYF B; 1VQO V; 1ZSP A; 2UXC B; 3QG5 A; 3BY6 A; 2ATK C; 1IBK B; 1QNM A; 1DTO A; 5LGT A; 2JS5 A; 2QDO A; 2XAH A; 3HPL C; 2GSM B; 4I7Z B; 4JF3 A; 4LH6 A; 1N32 O; 3FKS G; 1XDC A; 3EXA A; 4C7U A; 4FMT A; 3BCC H; 3F5W C; 3AG1 B; 4LF8 B; 4CS4 A; 4FK5 C; 1RP3 B; 2V1D A; 3AG7 A; 1SQB H; 2MW2 B; 3DXR A; 3Q4H B; 2QE7 G; 2DQ3 A; 3SYQ A; 1YVW A; 1X4T A; 4I50 A; 5BZB A; 1PD3 A; 3N2K B; 3ETG A; 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2ZD9 A; 1VQ7 V; 1N34 O; 5EZY B; 3SYC A; 2FTK A; 2ZXW C; 4LR3 A; 1R3J C; 2LGW A; 1OZ0 A; 3ZBH A; 2V4D A; 1J95 A; 3VOU A; 1HP8 A; 4IYI A; 4MTX A; 1N36 O; 2ZR3 A; 1VQ5 V; 1THZ A; 3WFV A; 3G67 A; 2IH3 C; 3RWR D; 4TSF G; 2ZM6 B; 4YJ3 B; 2EJ7 A; 4BR6 A; 1KEC A; 2IJH A; 4O2A A; 5L3B A; 5LP6 C; 1AI7 A; 3UQ8 A; 3CJH B; 4LWS B; 1MAB G; 3HKD A; 5H5N A; 3CCM V; 5CB4 B; 3A8T A; 4WFG A; 4TOI A; 3QO7 A; 3N27 A; 3GWK C; 5B1A C; 5KUM A; 3ZRW B; 1HNX B; 1GH6 A; 4DV7 O; 1I5Y A; 3TGU H; 3KZI Z; 4JGS A; 1FJG B; 3W7U A; 1PNK A; 1QBZ A; 2UUB O; 4G28 B; 4FLZ A; 1P7B A; 1AP6 A; 5LMU B; 1VF6 C; 1IX9 A; 1F4M A; 3I56 V; 2HVJ C; 3DC5 A; 3HKC B; 2AGA A; 5KHH A; 2QM8 A; 4WBN A; 2QKS A; 1IXB A; 1H8E G; 3K57 A; 1VQL V; 1FXK A; 3RVY A; 3EVK A; 2H3O A; 2Y0I A; 4PA6 A; 3LSQ A; 2HJD A; 2E5L O; 2VS0 A; 3JD1 A; 2CH7 B; 2DE0 X; 4UB8 Z; 2UU9 O; 1NVP B; 5B1A B; 3B8M A; 2XOK G; 2DYS C; 3WB1 A; 5JQG B; 1ZLZ A; 2R9I A; 1FFT B; 1PL0 A; 5CA1 B; 3U10 A; 3RYI A; 2JEU A; 2ZCE A; 1MNG A; 1D5A A; 3K9A A; 3RN4 A; 4DO2 A; 4PA7 A; 2ZE8 A; 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