4QIUA

Crystal structure of nitroalkane oxidase from pseudomonas aeruginosa in mutant complex form
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
350
structure length
350
Chain Sequence
TDRFTRLLGIQQPIIQAPMLGVSTPALAAAVSNAGGLGSIAITGSAAEKGRALIREVRGLTDKPFNVNLFCHRPGQADPARERAWLDYLKPLFAEFGAEPPVRLKNIYLSFLEDPTLLPMLLEERPAAVSFHFGAPPRDQVRALQAVGIRVLVCATTPEEAALVEAAGADAVVAQGIEAGGCRGVFEPERGDAAIGTLALVRLLAARGSLPVVAAGGIMDGRGIRAALELGASAVQMGTAFVLCPESSANAAYREALKGPRAARTALTVTMSGRSARGLPNRMFFDAAAPGVPPLPDYPFVYDATKALQTAALARGNHDFAAQWAGQGAALARELPAAELLRTLVEELRG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Nitronate monooxygenase family protein
publication title Crystal structures and reaction mechanisms of nitroalkane oxidase (NAO) from Pseudomonas aeruginosa
rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 124
structure length 350
sequence length 350
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.7.3.1: Nitroalkane oxidase.
pdb deposition date 2014-06-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03060 NMO Nitronate monooxygenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4qiuA00
1SZNA 5FF3A 4ZQCA 5AYXA 1H50A 3LV5A 4JTJA 3O06A 3VI2A 1NF7A 3G0SA 4LY8A 1W37A 3UQNA 1F6PA 4N4PA 3B0VC 2OT1A 1KM2A 2DZUA 1TQJA 2OMAA 1FWRA 1QR7A 3HGJA 2JKEA 2CU0A 1XBXA 1JCXA 3CHVA 1SO5A 2OCZA 1Z44A 3NL2A 4O4VA 1GG1A 4ZQRA 4JIQA 1SFJA 4IGHA 3A5FA 1TREA 4CQ8A 2V9DA 1OYCA 1XUZA 2A2IA 1G4SA 1SZGA 5LNSA 4N2YA 2GPTA 1MZHA 2Y7FA 4EF9A 5DN1A 1WOBA 4WOZA 2QF7A 4NNAA 1ZAIA 4LUJA 3TQKA 1MEIA 1JUKA 4ADTA 2O7SA 1HUVA 4TIMA 1SR9A 4IX0A 4UIOA 3M16A 5DELA 1MXSA 1UB3A 3EX2A 3KAOA 4RV8A 1ME7A 4NU7A 4UUIA 1AL7A 1FDJA 4JNMA 1HL2A 3DKJA 4H4IA 3FEMA 1YADA 1I2RA 3LTSA 2ZZ6A 3PSWA 1H7PA 1X6UA 3FIGA 1TCDA 4H6KA 5HWMA 1K8YA 1O5KA 1TV8A 3C2FA 3LCLA 3O1NA 3NL6A 3G0UA 1NFBA 3S8HA 2V8ZA 3TK7A 1QO2A 3TCEA 1H5YA 2ZA3A 4NJGA 1YPFA 1VCVA 3L0GA 1ICQA 4K37A 4AWTA 1WX0A 5FF0A 1EWDA 3BW4A 2FPTA 4WQ6A 2DORA 3P8JA 2YPIA 2PC4A 1OFAA 3DH7A 5AHLA 1UASA 2Q8ZA 4O18A 3TDFA 1ADOA 1FWWA 2DZTA 4FXSA 3TFCA 3EX6A 5L9FA 1A5AA 3KXQA 5AHNA 5K7JA 3IIZA 3P81A 3UY7A 5EY5A 4NJKA 5J5RA 1OK6A 1P4CA 3IIOA 5CSRA 3W2JA 3CLMA 3W7QA 1TV7A 1KLYA 2GQ8A 3O15A 1LRQA 1TPWA 2VFHA 1EP3A 3TMLA 5DY3A 3LCIA 3SECA 4GC4A 1A50A 2E5DA 3TW7A 3W7CA 3W7OA 4QNEA 2QAFA 3HIJA 4DF1A 3R5EA 2PRHA 3GKAA 4WOQA 2QCFA 1SZFA 5HNRA 2C18A 4IOTA 3TR2A 2B0MA 1WV2A 5EKYA 4JTIA 4OU1A 5HMSA 3LBCA 3U8GA 3KVLA 1Y0EA 2V82A 5DCDA 3QPZA 4JEQA 3G1SA 2I14A 4CQ9A 3LXBA 1W1ZA 3G24A 4EF8A 4UTIA 2Y7GA 5HULA 3DHDA 1VQTA 4HHPA 3AJXA 1OJXA 1DJQA 3HJZA 1S5VA 4IUOA 3INPA 4J9JA 1O60A 1YXCA 4O1BA 3TQVA 4YWIA 1DORA 3HGOA 1FDZA 1N8FA 2FIQA 4LVGA 3MYOA 1TTQA 3W2NA 4TU1A 3S1WA 3E96A 3MO7A 2R14A 5LNWA 2GQAA 3N9SA 4KWVA 3PBWA 2H3BA 1ZFJA 3N19B 1AW2A 3QC3A 4LWWA 1P0NA 5CPMA 2YW4A 5DLCA 3W85A 4E38A 1X1ZA 3C2OA 3BG5A 3H55A 1H60A 5AHMA 3PR2A 2ZZ1A 3NPVA 5D05A 1FBAA 4RR4A 4KFOA 3TA6A 1GWJA 1PHQA 3W76A 3PUOA 3QM3A 1F73A 3NVTA 3KOFA 2ZRVA 1SW3A 2NX3A 1I2NA 3EWWA 2VELA 2Y62A 4ORMA 5DXYA 4Y90A 5FEPA 3GYEA 2V2HA 4R34A 4RZ5A 5TIMA 4ADUA 3EXSA 3M47A 3O6DA 1T0OA 3CC1A 1QPNA 3B0PA 4JX4A 3E02A 3BW3A 4HNTA 1O94A 2NUYA 2YXGA 3GVGA 1DKWA 6ALDA 5F1UA 1ICPA 4IXHA 3DBPA 4HPXA 4UTMA 2ZZ7A 3CIWA 5KINA 4CCCA 3WJWA 1DQXA 1R2TA 4GFSA 2Y63A 4TMCA 3G8RA 3WK2A 5HR6A 3W7GA 5AFDA 4I7VA 2JKAA 1B4EA 4O4WA 3L5LA 1AMKA 4A22A 3NQDA 5K3VA 4JTSA 3BG9A 4LT9A 2Y85A 2NXGA 1M6JA 2H6RA 3R2GA 3QRHA 4LC6A 3UZ5A 3SI9A 1XKYA 5DCBA 3O8AA 1VC4A 2QCCA 1T99A 2R91A 5K9DA 1GVFA 4K38A 5AB3A 4XTDA 1RQBA 2I9EA 5CG7A 5D03A 3B03A 1SO4A 3GR7A 4HPJA 2J6XA 1YDOA 3PF3A 4MYAA 1HFBA 1VZWA 2ISWA 1LOQA 3UWYA 3NQGA 3TU9A 2WO5A 4IJBA 1Q3NA 4JD4A 3M44A 4MY8A 1H61A 5KTLA 4FX6M 3LCHA 3K30A 1BWKA 4GUFA 1KM3A 1C8VA 1W5OA 4UFJA 4QAIA 2XN0A 2VOMA 2E5CA 2NLIA 5D04C 1LP6A 3DFOA 2Z6JA 4MY9A 2CLLA 2TPSA 4N9BA 4L4LA 1K3UA 4O50A 4DELA 1XBVA 1DOSA 1WBHA 1KTNA 4LVDA 2P1FA 5LHFA 3JR2A 4OWGA 1WYIA 1ZENA 3T4CA 1KLZA 4RJEA 2G97A 4QIUA 2E09A 3CQ0A 1QOQA 1G69A 4O13A 4FNSA 1OFQA 5BMWA 2FPVA 3DKLA 2B4GA 4MUZA 4M7SA 3MI3A 1I45A 4LU0A 1P0KA 3L5AA 2E1DA 1GYNA 1R30A 5D30A 2ZA1A 1VGAA 1DV7A 3FOKA 4JTLA 2A1YA 3HPSA 4K36A 1KFCA 2VEMA 1H1YA 4UTJA 3TXZA 2H8XA 4DO4A 5TQLA 1FCUA 2OX1A 4XZ9A 3VKJA 3OVQA 1VPXA 1WA3A 3G8EA 3C4UA 3M43A 3HG5A 3PB2A 3T55A 3L0KA 5U4NA 2NUWA 1EPXA 1LROA 4OT7A 2Q8LA 3WJYA 4KFNA 4JICA 3LHUA 4LV9A 1ONRA 3MP4A 4QM1A 4P2VA 3UWVA 2DZWA 1D9EA 3QPYA 2FPYA 2Z6IA 3ZWSA 2NX1A 3CB8A 2GQ9A 5J5DA 3L5MA 1GVOA 2Y89A 4Q32A 3IIXA 4UTLA 4O57A 4PC8A 5CPNA 2Z2UA 3OVPA 1F6KA 3C52A 3PUEA 1K8XA 1E51A 1SQ7A 2PCQA 4Y96A 3G0XA 1S5WA 3UPWA 4M6PA 3FJLA 3ABQA 3SJ3A 1OX5A 3CT7A 4WY0F 1F76A 3BARA 4LNYA 1VYRA 4O17A 1XC4A 5AYYA 4K8EA 4RZ4A 3LX9A 3EXTA 4CNPA 4ML9A 1TPB1 1OG0A 3BO9A 1G4EA 3C8FA 1JUBA 3LLDA 1MSSA 1LBLA 1DL3A 1VLWA 3VE9A 3KRSA 2JBMA 4MKNA 4KKXA 1C9DA 1CX9A 2R94A 4BF9A 1W5PA 3T78A 2QUUA 4WX2A 1VCFA 2CLFA 2X2GA 4A21A 3DAQA 3DXIA 3B0UX 4HSOA 3N2XA 1W31A 2QDHA 2EKCA 3W7MA 4NNBA 3L68A 1JQXA 2V0TA 3W1LA 1B57A 1YTKA 4Z1AA 2QKFA 3G22A 3PBYA 5F4XA 3A24A 1AW5A 2WNQA 3L66A 1IGSA 1GTEA 4UTHA 3LGEA 4DF2A 1NSJA 3ELFA 1F5ZA 3W83A 2A5HA 1LCOA 3LTPA 1F05A 3CM4A 5E1QA 1W8SA 2P0OA 2O7QA 4LV4A 2Y61A 2YYUA 1UCWA 3GXTA 5A8GA 3LCGA 4MOZA 3WJSA 1FX6A 1F74A 3GX9A 5L6UA 3UY8A 4BI7A 4QITA 1KW1A 4CQAA 3NGJA 1M7PA 1ZCOA 2E5BA 4PTNA 4FNPA 5CZSA 1LORA 1G67A 4BWLC 3H54A 5DY2A 5KZMA 1XDLA 1XFBA 3UXDA 8TIMA 1F7BA 1Q6OA 1SU5A 3GKFA 1L9WA 4IMDA 3LV6A 2QDGA 2WNZA 3W75A 1PCKA 3QFEA 3SW6A 2H90A 4AAJA 3NQ8A 4R7JA 4BWLA 1GTHA 1EUNA 4GUJA 2A85A 5D02A 3BLEA 3TAKA 3GR8A 3UWWA 4OHQA 3MJYA 3HMJG 1RR2A 3PS7A 2DZSA 2WOQA 1KFKA 3P84A 4PEKA 4ZQOA 1W0MA 1EWEA 1DJNA 3MBDA 3VCRA 1OABA 3TXVA 1Z41A 3OEXA 2GOUA 3W1UA 2QCNA 3IGUA 1KBIA 3PUDA 5CKSA 3W2KA 2ZA2A 5CPLA 1AL8A 3S5OA 1M5WA 1KFBA 5D2TA 1KM6A 2EGZA 2XN1A 4IMCA 4O15A 1TRDA 1LDCA 1TJPA 5LHEA 3B06A 3PBVA 1TO3A 1RD5A 3W7LA 1XL9A 1TTJA 5LNUA 3GNDA 1M7OA 4ALDA 2Q3OA 3NDOA 4GNJA 2WSRA 3HBLA 1SW0A 2RDUA 4YL2A 2QJGA 2Y6ZA 3THAA 1FUYA 2KZHA 2B7QA 1UBSA 1F2JA 3P5YA 1TQXA 3WJZA 3LCXA 5FF7A 3UYCA 2OZ0A 3IGSA 2QCEA 2NXHA 4JYFA 3UXAA 1FWNA 3MWAA 2A7NA 4C1LA 2ISVA 4I7UA 4CCEA 1WBJA 2VXNA 1YTEA 3NQFA 3DHFA 1R2RA 5AOUA 4X9SA 4UMAA 2QCGA 4XBSA 4ZL1A 4A29A 4Z1BA 3C56A 2ZQ0A 3TSBA 4Y6GA 1YDNA 3NEVA 4M6QA 1QWGA 4NJHA 2ZRWA 1H7XA 2E6YA 4LRSA 2X16A 4ORIA 4QQ3A 2CZDA 4UMBA 2CLMA 3V75A 5IBXC 3BLIA 2NWRA 1DBTA 1CW2A 5HINA 3CIXA 3DI1A 1HO4A 5D2XA 5F4WA 3TSDA 1SFLA 1SO3A 4TO8A 1LRTA 4O54A 4AXKA 4WZHA 5K4ZA 4D2JA 1IIGA 2RDTA 5HJLA 5IBXA 3P62A 1VHNA 1TRIA 4EWND 1G4PA 1PS9A 4JR5A 3W2MA 4GJ1A 4BK9A 3G1VA 1J5TA 2WPBA 3TIMA 3NZ1A 1NEYA 1I2QA 1OYBA 1H51A 1R46A 2V5BA 3BK0A 3S0CA 5BMXA 1WXJA 2BLEA 4NZFA 3HGSA 5DBUA 3DU0A 4AH7A 5MHBA 3PB0A 4N9DA 3NNTA 5IM51 1VLIA 3NG3A 4JGDA 4QJ1A 3PBUA 4OE7A 3ABOA 3IGXA 3P67A 3QMTA 4FO4A 5CZ0A 1OF8A 1ML1A 2NV2A 1WOAA 4UXDA 1OX6A 3S5ZA 3HB9A 3M5VA 4Y9AA 4R33A 4JTGA 1NAL1 1GZGA 1XI3A 3FLUA 3F03K 1PL9A 5SWUA 1I2PA 2CLHA 4GBUA 2Y88A 4EVZA 3G1AA 1KA9F 3VE7A 4S1FA 4IQLA 1TYGA 4QNWA 3W1TA 3W7KA 3LB0A 5F4SA 1TPFA 2F7FA 3LERA 3NXFA 4IMGA 5K4XA 5F2LA 2B7OA 4GWEA 4O0ZA 2WSYA 3TUUA 3EWZA 3G1DA 4FEZA 1EP2A 3DZ1A 3F1QA 2HS8A 3NL5A 4XTIA 1TMHA 1VRDA 4DQWA 3FYOA 1DHPA 3O6CA 3LCFA 4N02A 2VFGA 2VEKA 4JDBA 2C16A 1IXNA 3CWOX 3W1QA 4NX0A 2B7PA 3C0JA 4IPIA 3B05A 1ZAHA 4N4QA 4GUGA 3O16A 3N34A 3GAKA 2X1SA 4OV9A 3M41A 2ABAA 4UTKA 5FEWA 4MFDA 4K39A 1OFDA 4JTUA 5D32A 4DO6A 5KZEA 3THQA 4XUGA 4OQVA 3EEGA 4DXVA 1EA0A 4GXMA 2QAPA 1SUXA 1W3NA 1OFRA 3WJXA 2E6DA 1D3HA 3FKKA 4HN4A 2J9XA 3F4NA 1WAUA 3EB2A 3W70A 3LRKA 3MW7A 4MZYA 1W3TA 1ZJIA 2PRLA 4RCXA 2WV8A 4RLIA 4O11A 2VKZG 4JS3A 1YTDA 1NF0A 4KWWA 3CWNA 4FX8A 2W6RA 4CNNA 2G95A 3W2LA 5EBUA 2QCDA 3SFKA 5D09A 4FHAA 3M0ZA 3W3OA 4P61A 3NYZA 3QMRA 4O16A 3MMTA 5BW6A 5F2GA 4ZQPA 1JCYA 5DCEA 1TB3A 2G96A 1QFEA 4UMCA 3ABRA 2RHGA 2FLIA 1AW1A 4JX6A 1GG0A 2E77A 4RK8A 4CNOA 3P82A 2A4AA 2C3ZA 2IQTA 1XDMA 1DVJA 1KFJA 1GOXA 2PURA 2FFCA 2X30A 2J24A 1VYPX 4JDYA 1KM5A 5BRBA 1U5JA 1AK5A 3LXCA 3EWUA 3OG3A 3I7RA 1QPRA 4G1KA 1BKSA 5H91A 2D73A 3PAJA 2GVLA 4E2DA 3FFSA 4O0KA 2ZDRA 2FDSA 3LOTA 1X8FA 3DFSA 5I3GA 3G1HA 1I2OA 2V81A 3QMSA 1LOSA 2V5LA 4JY9A 4S2CA 1GYLA 4LW7A 3TW6A 2YZRA 1MEHA 1JR1A 2YYTA 3W88A 3AO0A 2ZZ4A 3TE9A 3QW4B 3Q37A 7TIMA 3BV4A 3GB6A 3KRUA 4MZ1A 5HUOA 1V5XA 1TPH1 1XUUA 3HG4A 1RZMA 2ZTKA 4LC8A 4POCA 4BFAA 4A2SA 1GPWA 2GJNA 4JN6A 3MP5A 3FYPA 1T8XA 3W1MA 3W1XA 1QCWA 1VR6A 3ZWTA 4LOCA 4Z1DA 4C1KA 4A3UA 1A53A 2DU2A 3P61A 3YPIA 2NX9A 1TV5A 3MHFA 4ADSA 4X2RA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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