4QS7A

Arabidopsis hexokinase 1 (athxk1) structure in glucose-bound form
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
460
structure length
455
Chain Sequence
WGRVLAILKAFEEDCATPISKLRQVADAMTVEMHAGLASDGGSKLKMLISYVDNLPSGDEKGLFYALDLGGTNFRVMRVLLGGKQERVVKQEFEEVSIPPHLMTGGSDELFNFIAEALAKFVATECEDFHLPEGRQRELGFTFSFPVKQTSLSSGSLIKWTKGFSIEEAVGQDVVGALNKALERVGLDMRIAALVNDTVGTLAGGRYYNPDVVAAVILGTGTNAAYVERATAIPKWHGLLPKSGEMVINMEWGNFRSSHLPLTEFDHTLDFESLNPGEQILEKIISGMYLGEILRRVLLKMAEDAAFFGDTVPSKLRIPFIIRTPHMSAMHNDTSPDLKIVGSKIKDILEVPTTSLKMRKVVISLCNIIATRGARLSAAGIYGILKKLGRDEVQKSVIAMDGGLFEHYTQFSECMESSLKELLGDEASGSVEVTHSNDGSGIGAALLAASHSLYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Hexokinase-1
publication title Biochemical and structural study of Arabidopsis hexokinase 1
pubmed doi rcsb
source organism Arabidopsis thaliana
total genus 162
structure length 455
sequence length 460
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4qs7A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4qs7A01
3MK6A 3EL2A 5BREA 1MWMA 4IO8A 3BEXA 4B1UB 3LM9A 5E84A 1R59O 2HOEA 3B8AX 3CJAA 3KZBA 3VF4A 2QWOA 2E88A 4J8FA 2A40A 2P9LA 3G25A 4IZ9A 3LM2A 4IWVA 1S22A 4PL8A 4BR9A 2IVOA 2D0OA 2FLOA 2FSKA 3TPQA 1X9JA 3QICA 5AQYA 2GWJA 1LOTB 2CH5A 3EZWA 2QWMA 4FWPA 4MO4A 1T44A 3O8MA 5AFUH 3VENA 4CZEA 4CJ7A 4EHTA 1MDUB 4JD2B 4BREA 3O08A 5BRFA 3GL1A 3MDQA 5AQWA 1SQKA 1GLJO 4BRNA 2P9UA 2EWSA 4FL9A 4K41A 4WQ5A 5E26A 4QS9A 2A5XA 4RWTA 4EHUA 4BRHA 5BPMA 3H1VX 2E20A 3DXKA 3ZX2A 2E2OA 2NLXA 1Z05A 3FZFA 5I9EB 2P9IB 1YVNA 3RSEA 2OANA 3AARA 3VEOA 1SAZA 2P9SB 1E4GT 2GEMA 2IVNA 4IJAA 4YDUC 4A2BA 2ZF5O 1XC3A 4RCHA 3VEVA 1H1VA 1KXPA 3QB0A 1NGCA 3VF6A 3U4LA 3WEEA 3LL3A 5AZIB 1QZ5A 1U6ZA 3GG4A 3MN5A 4B9QA 4BQZA 3SMPA 1BA0A 3FGUA 5BRDA 3ZEUA 3FZLA 1TYQB 2FXUA 3CETA 1NGHA 2F9TA 3L4IA 5LY3A 3R8EA 1GLFO 3DAWA 3FZMA 3L0QA 3H3OB 3LDPA 1QQOA 3LDOA 1XQSC 2J4RA 2VCPA 4CZJA 5AQXA 2DPNA 4WYBA 3I33A 4H5VA 3IDHA 4FWQA 1HKCA 2HMPA 4BG9A 3VEYA 1S3XA 3S41A 3DXMB 2A6AA 2P9IA 3MN7A 1BDGA 3CJ1A 1BO5O 4EIAA 3W3DA 3L6QA 4NO7A 4FOEA 1NGDA 3WUHA 3ZETB 2P9SA 3ENOA 3O5BA 2QXLA 5EX5A 3SK3A 2AP1A 4M7XA 2P9NA 1OKJA 3U9ZA 3D2EB 4O5FA 4BRIA 5KPTA 1X3MA 2QWQA 5AZIA 4FOIA 2P9PB 4AM6A 1HPMA 2BUPA 4XEIA 1C0GA 1V4SA 1K8KB 1ZBSA 5JLHA 2QWNA 4HWIA 3CQXA 4BRMA 2W40A 3HTVA 1TYQA 2KHOA 4A2AA 4AM7A 4BVOA 4MLEA 5AR0A 3GBTA 3O4WA 5KQDA 3CJ7A 1NGEA 5FPEA 1JCFA 4BC5A 3VGKA 3I8BA 3IMXA 4QS8A 3LDNA 2CGKA 4ISEA 4I6MB 1BG3A 2ASOA 5AQGA 1RFQA 4BGAA 1NGFA 4CD3A 2GELA 2YJFA 5JLFA 4FWOA 2D0PA 5TKYA 2E8AA 1Z6RA 1NWKA 3QMLA 3MN9A 3IFRA 4H0YB 2P9KB 4M63C 3AY9A 4CBXA 4Y0WA 5AQZA 1Y64A 1ZXOA 3D7EO 1MWKA 4BC4A 2P9PA 2WUSA 5BN9A 3C0BA 5AQJA 1HUXA 2YHWA 2QM1A 3CJCA 5AFUA 1BUPA 3EN9A 2VYPA 3CJ9A 4CZMA 2FF6A 4BRAA 2A42A 3CIPA 3CHWA 4WQ4C 2GWKA 3BP8A 4PL7A 1HKBA 4H03B 1U2VB 1ATNA 1HLUA 1YAGA 3M1FA 4XH4A 4MO5A 3F9MA 4I6MA 3QBXA 4BRFA 4CZHA 2PBDA 4WQ5C 1T6DA 3O80A 3M3ZA 4PKHA 4FPBA 3ZX0A 1Q18A 4L3QA 2QWLA 3EKSA 5KQ8A 3EO3A 1NLVA 4KBOA 4FWNA 3HZ6A 3MCPA 3HBTA 4B1WB 4MLHA 3VEWA 5AQVA 2E1ZA 5AQRA 5JICA 5AQNA 3MN6A 3ULEB 4BR7A 5AQMA 3HSCA 3MMVA 1QHAA 3IUCA 2E1YA 1QQNA 1TUYA 4BRLA 4C23A 4EAHD 4BVPA 3UKUB 3OHRA 4JD2A 5AQIA 5AQFA 1E4FT 1NGJA 1P8ZA 1GLDG 4B1YB 3R6MA 3DJCA 3WXJA 2QW9A 2V7ZA 4B1XB 5BPLA 1GLLO 1TUUA 3FR0A 3WT0A 2ASPA 3KHYA 4H5NA 4BRKA 5BPNA 3CI5A 5AQLA 1U2VA 1NM1A 2ZGYA 3SJHA 2I7NA 4M7YA 5JMVA 4BR0A 4QS7A 1NGIA 1DGKN 1GLEG 3W0LA 3FLCO 5BRHA 3BF3A 1EQYA 5AQKA 3UKRB 2Q36A 2FF3B 4CZGA 2QWRA 4GNIA 5EOYA 4BQLA 4CZLA 4JN4A 4B1ZA 4PKGA 2ITMA 3ULEA 3A5OC 2I7PA 5FPDA 1LCUA 4BR2A 1ATRA 2YHXA 3ID8A 3AAPA 1DEJA 3VF2A 3UKUA 2HF4A 1BWFO 3CERA 4JHDB 4CBWA 4DCHA 1IG8A 4ISFA 3P4IA 1YUWA 3VETA 4FWSA 2D1KA 4H0XB 3SLCA 1JCGA 1GLBG 4H5TA 3WXLA 4B1VA 1HKGA 2AA4A 3J8AA 3AAQA 5EVZA 4E1JA 1CZAN 3O1BA 3DXMA 1V4TA 5BN8A 1BOTO 1GLCG 4BR5A 2NZTA 3JXUA 4BGBA 3A5MC 3VPZA 4K42A 2Q1NA 4RTFD 3ZETA 3O6WA 4FWMA 3H3NO 1NMDA 3O1WA 3D2EA 3BUZB 1KAZA 1QQMA 3H6EA 3UKRA 4CZIA 1IJJA 5KPRA 5CE3A 2E2PA 4FWRA 5ELZA 3D2FB 5AZJB 2A3ZA 1WOQA 4FSVA 3GOIA 3H45C 4LC9B 2HF3A 3ZX3A 4BR4A 5ADXH 1K8KA 4DHYA 3VOVA 3UE5A 2GTDA 1D4XA 5ADXA 4NB4A 1NGAA 3RSEB 3WXIA 4O8KA 3WEEB 1GLAG 4JNEA 4JHDA 3ENHA 4WQ4A 3WQUA 4DB3A 3ZEUB 4BC3A 1BU6O 2CGJA 4CZKA 2ZWHA 3JS6A 5AQQA 1WUAA 4H0TB 2D4WA 4XH1A 1ESVA 2CH6A 1HJOA 5FPNA 1XUPO 3QDKA 4GY2B 4K25A 1DKGD 4BRCA 1C0FA 4YDUA 3VGLA 4Z94A 3VGMA 1RDWX 3LDLA 2P9KA 3U9DA 2Q0UA 5KPZA 2ASMA 2IVPA 4BG8A 4FWKA 3SMSA 5F0XA 4H5RA 4IXCA 3D2FA 5AZJA 4BROA 1NBWA 4BRGA 2IIRA 2P9NB 2Q97A 4DQ8A 2NRHA 4PKIA 4FWLA 1T6CA 1YXQA 1J6ZA 4CI6A 3A5NC 3VERA 3VESA 5AQPA 4IJNA 3ATVA 3WXKA 3LDQA 1ZC6A 3CJBA 1RGIA 3A5LC 1KAXA 1QZ6A 1X3NA 2YI1A 5AQUA 2VWBA 2YHYA 4BRQA 3VEXA 5AQHA 4A61A 2FSNA 3C7NB 4FPAA 2Q2RA 4A62A 2FSJA 4ISGA 5EY4A 4CBUA 2GUPA 3WQTA 4FO0A 1KAYA 2CGLA 1JCEA 2Q31A 1ATSA 3VEZA 3R9PA 3TU5A 1HX1A 3U8XA 4HTLA 4F9OA 5F1XA 2E2QA 4JAXA 3HI0A 5LJWA 2V52B 3KVGA 4H5WA 2QWPA 3ATUA 4H0OA 1NGGA 4BC2A 2YCHA 2P9LB 3UB5A 3QBWA 3BF1A 3HM8A 2Q0RA 2PAVA 3DWLA 2E2NA 2V7YA 3GDQA 3CQYA 2F9WA 5AQSA 1NGBA 3FZKA 1G99A 2H3GX 3GE1A 2UYTA 5FPMA 3A8YA 5EXWA 4K43A 4CD1A 5B8HA 1SZ2A 4BRDA 3QFPA 2V51B 2BTFA 4H0VB 3EKUA 3FE1A 3A0IX 4CZFA 1BA1A 1MA9B 2P9UB 2W41A 2YJEA 3QFUA 5AQOA 4H0PA 5AQTA 2ZGZA 3H1QA 4XH5A 3M6GA 3C7NA 3FZHA 3DXKB 5BR9A 3FFKB 5LJVA 4BRPA 4EFHA 5F2RA 3H46O 2A41A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3EL2A 3OYNA 2P5OA 4I2PA 3LM9A 4FJGA 1I39A 1X9WA 1IBMK 2O8CB 1KFDA 1KVCA 2QWOA 2E88A 3AO4A 4LF9K 2P9LA 3LM2A 4DR7K 2D0OA 2FLOA 4J2BA 1BIUA 2IC3A 1LOTB 3PUFA 5AFUH 3TWHA 3F2KA 4KHQA 4JD2B 3NE6A 4LD0A 4Y1DA 2Y1JA 4H4MA 2HMIA 4MQ3A 1N6QA 1X9SA 3KLHA 1SQKA 3AVHA 4FL9A 5E26A 2A5XA 5JVHL 4DFMA 4RWTA 2O8DB 1UA0A 1Z05A 2P9IB 4LY7A 3DLLL 4LFBK 4YOXA 1JLCA 3CQ8A 4O0JA 2P9SB 2IVNA 4YDUC 5FRNA 3KD5E 1VQ7N 4A2BA 3KTQA 3DLEA 1KXPA 1NGCA 1C1AA 3LL3A 5K14A 5C12A 3VQ8A 3AVGA 3MN5A 4BQZA 4B9QA 5HLFA 3OYMA 4FLVA 3FGUA 3O4NA 5BRDA 2Z1JA 4K0KK 1NGHA 2WONA 4JKHA 5C0YA 3SI6A 1GLFO 1WSGA 1TV6A 2HSTA 3S3NA 3V9UA 3DYAA 2VQEK 5GAGP 3LPUA 3CXCM 1ILYA 3I33A 3MECA 3VEYA 2YNGA 3DXMB 1VSHA 1FKPA 3CJ1A 1BO5O 1Z25A 4EIAA 4X65K 4E7HA 3ZETB 3SK3A 2NRWA 5EX5A 1IH7A 4CJFA 4DV2K 4M7XA 3D2EB 3MEGA 3K5MA 1T03A 4E1NA 4HTUA 4OKJA 4N47A 4BRIA 1X3MA 4KHYA 4AM6A 5IT9O 4XEIA 2O8BB 4CK1A 4GVEA 4DR5K 4GV9A 5JLHA 4HWIA 4W5QA 3OJSA 2ZQBA 2KHOA 1VSKA 3KWGA 3GBTA 2O8EB 3CJ7A 1NGEA 4BC5A 3PSFA 1NK8A 1HYZA 3TAPA 1HNIA 4B9UA 3IMXA 4CF0A 2KLAA 4QS8A 4B9VA 3CCEN 2GX9A 1UWBA 4U67L 1RFQA 1NGFA 1RBRA 5M1PA 4CE9A 2GELA 2E6LA 2QK9A 2D0PA 4M3TA 5TKYA 2E8AA 4M63C 3S3MA 5M1QA 1GOAA 2BDPA 4CHOA 3AY9A 4CBXA 4FVMA 3HPHA 4CFBA 1HNZK 3HO1A 5C15A 4XIUA 4BE1A 4DTRA 2KTQA 3C0BA 5AQJA 2QKKA 4DR6K 2QM1A 5AFUA 2FBVA 3ISNC 2HHQA 3G71N 1NK5A 3ID6A 2FF6A 3PX6A 3RWUA 1FJGK 3TI0A 4WQ4C 2KZZA 1IBLK 3KJVA 4A59A 1HKBA 4H03B 1N36K 3I0RA 1HLUA 4ELUA 2W42A 1JLQA 1YI2N 4XH4A 1SV5A 4X66K 4CIEA 3CCRN 3FFIA 4WQ5C 5GIOA 2O8CA 4IOAL 3CCLN 2YX6A 1Q18A 3VTHA 2QWLA 3EKSA 5J1EA 5KQ8A 1NLVA 1VQMN 3MCPA 3SYZA 4CF1A 3AA5X 4CEQA 5AQVA 1RDBA 2E1ZA 1HNXK 1NNEA 3MN6A 4IDHA 4DQQA 2WC9A 3THYB 3MMVA 3CPWM 4NYNA 3TSQA 4DSLA 1QQNA 3VQDA 1RDUA 2RHKA 3ZSYA 4LF8K 3L2RA 4JD2A 5AQIA 4DQSA 1E4FT 4B1YB 1GLDG 3R6MA 3WXJA 3NCIA 1VSLA 2P5GA 3C6AA 3WT0A 1WBDA 4CJPA 4QOZB 5BPNA 3O4QA 2ZGYA 3SJHA 4M7YA 4M45A 3AO2A 3VQCA 1GLEG 3HYFA 5D3GA 1N34K 4LF6K 3OA9A 4CJQA 1CXQA 3NDKA 4IEEA 2Q36A 3ZYYX 3C95A 3V1OA 2KKZA 3F73A 4GNIA 3VQ9A 4ZHRA 3SAFA 3HJFA 5J2MA 3WNFA 1RDDA 2IGIA 4KTZA 3ULEA 2I7PA 4E7KA 4PHTX 4RW9A 2HF4A 1BWFO 4FJKA 4CBWA 3DOKA 2HBKA 4ISFA 4LSNA 5SWMA 5GIPA 1G15A 1RDAA 1X1PA 4B1VA 4HVJA 1HKGA 1HR0K 5EVZA 4E1JA 1XMOK 4I7FA 4DS4A 3DXMA 2G8WA 1KC8O 1V4TA 1GLCG 1QQCA 1JLFA 1S6QA 4YNQA 1SL0A 2Q1NA 1RT7A 3ZETA 3CCVN 1FK9A 3D2EA 1EWRA 3BUZB 1BQNA 3H6EA 3N4PA 5ELZA 4IFVA 1J5EK 5BR8K 2ZJRL 2O8BA 4LC9B 5HRRA 3CMEN 1Z26A 3T1AA 1NGAA 3CCUN 5CHIA 3C65A 4WF9L 3OTOK 4FJIA 1N5YA 4C8MA 3TANA 1SKRA 3AVKA 1NKCA 3WQUA 4CJRA 1N8RO 2WFBA 4KI4A 4JI0K 1WUAA 3RR7A 4BE0A 2A1RA 2O8FB 3G6EN 5FPNA 5J2PA 3DRPA 1QVGM 2Q0UA 1HJRA 4FWKA 3SMSA 4OVLA 2A1SA 4PQUA 4FJLA 5J2NA 4CCHA 1T8EA 3ITHA 4V19S 3NH1A 1T6CA 3HP6A 5DMRA 4CHYA 1YF5L 4IJNA 1HNVA 1GOBA 4FVUA 4DFJA 4O4GA 3A5LC 4CJUA 4CESA 4OLBA 1X3NA 4NLCA 1XI1A 1Q8IA 4BRQA 4NCBA 3VEXA 1HQEA 4BE2A 2Q2RA 3CCQN 4A62A 2FSJA 3HL8A 4DWIA 2LSNA 5C2FA 4CBUA 2RF2A 4FLUA 4CEBA 1KAYA 4DQIA 4K8ZA 1NJWA 4F9OA 3O9RA 5LJWA 4CJ4A 1VQKN 4KTQA 2QWPA 1Q86O 3SBGA 4O5BA 4H0OA 3WNGA 2GBZA 3THYA 2P9LB 3UB5A 4KHSA 3LDSA 4CGJA 3ALYA 3CC2N 3QETA 5E41A 4B08A 3KK2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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