4QS8A

Arabidopsis hexokinase 1 (athxk1) structure in ligand-free form
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
462
structure length
455
Chain Sequence
GKWGRVLAILKAFEEDCATPISKLRQVADAMTVEMHAGLASDGGSKLKMLISYVDNLPSGDEKGLFYALDLGGTNFRVMRVLLGGKQERVVKQEFEEVSIPPHLMTGGSDELFNFIAEALAKFVATECEFHLPEGRQRELGFTFSFPVKQTSLSSGSLIKWTKGFSIEEAVGQDVVGALNKALERVGLDMRIAALVNDTVGTLAGGRYYNPDVVAAVILGTGTNAAYVERATAIPKWHGLLPKSGEMVINMEWGNFRSSHLPLTEFDHTLDFESLNPGEQILEKIISGMYLGEILRRVLLKMAEDAAFFGDTVPSKLRIPFIIRTPHMSAMHNDTSPDLKIVGSKIKDILEVPTTSLKMRKVVISLCNIIATRGARLSAAGIYGILKKLGRDTTKSVIAMDGGLFEHYTQFSECMESSLKELLGDEASGSVEVTHSNDGSGIGAALLAASHSLYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Hexokinase-1
publication title Biochemical and structural study of Arabidopsis hexokinase 1
pubmed doi rcsb
source organism Arabidopsis thaliana
total genus 165
structure length 455
sequence length 462
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4qs8A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4qs8A01
1MWKA 5EY4A 3M6GA 1HKGA 2IVNA 3GOIA 3FR0A 4MO4A 1SAZA 2QWNA 3H1VX 1G99A 4H5NA 2E2NA 4QS8A 5AZJA 5E26A 2YJFA 3CJBA 2QW9A 5AQQA 1T44A 3ENHA 1HLUA 1GLBG 2P9PA 4JAXA 3R8EA 1ZXOA 4RCHA 4DHYA 5I9EB 4BRPA 2QWPA 4FWRA 2ASOA 3U4LA 5AQGA 2F9WA 4O8KA 2P9NB 2P9KB 3IDHA 4PKGA 3HI0A 2VWBA 3A5LC 1XC3A 3MMVA 3UKRA 1RDWX 4H5RA 1U2VA 2H3GX 1MWMA 2CH6A 2DPNA 3C7NB 4AM6A 3ZX2A 5AQHA 4JN4A 2QXLA 3RSEA 5JLHA 2D1KA 4IWVA 4PL8A 2KHOA 1Q18A 3LDOA 1NMDA 2P9SA 4BRAA 1NBWA 2E2PA 4BROA 4B9QA 2WUSA 4K43A 4XEIA 2YJEA 1R59O 4H0VB 2FSNA 4NB4A 4IXCA 3VOVA 1QZ5A 5AZIA 3LL3A 4CZJA 4IJNA 3H6EA 3H46O 4BQLA 3BUZB 3WT0A 1NGEA 3D2EA 4PKIA 1NGJA 2F9TA 2IIRA 3WXIA 1ESVA 4BGAA 1K8KA 1NGFA 3QFPA 5BPMA 3M1FA 1TUYA 5F0XA 3FLCO 5AQKA 1HJOA 1GLJO 3D2FB 2HF4A 4H0YB 3LDPA 3MDQA 5AQRA 4CZEA 5EXWA 3VETA 4CZFA 3HZ6A 1KAYA 1LOTB 1P8ZA 1WUAA 1X9JA 1CZAN 2W41A 1E4FT 3O8MA 4HWIA 5AQFA 4MLEA 4BC2A 2V52B 3A0IX 2I7NA 1DGKN 1HX1A 4H0OA 4BRLA 4EFHA 2QWLA 3W3DA 2HOEA 2GWKA 5BRFA 2IVOA 2P9IA 4BRIA 2OANA 1QQMA 4LC9B 3R6MA 3MCPA 3CQYA 3IUCA 5ADXA 3CI5A 1SQKA 3QBXA 4FWPA 3FZHA 4KBOA 2D0PA 2ZF5O 4M7YA 3I33A 2EWSA 4FWSA 1DKGD 3TPQA 3EN9A 3A5NC 2V7ZA 3H45C 4GY2B 5ADXH 4O5FA 1NGGA 1RFQA 4BRKA 5AFUA 1QHAA 5KPTA 4MO5A 4I6MB 2A42A 3WQTA 2PAVA 3QBWA 3DXMB 3WUHA 4YDUA 1WOQA 5AFUH 2AP1A 2IVPA 5AQOA 2FSKA 3UE5A 5AQUA 2CH5A 4BRNA 3WEEA 1Y64A 3HSCA 4AM7A 3DXKB 3QB0A 4FWKA 2A41A 3CERA 1HKBA 2ASPA 3QMLA 3DWLA 5AQIA 2QWRA 2FF6A 2GELA 1V4TA 5B8HA 3KHYA 2CGKA 5ELZA 2VCPA 1HKCA 1TYQA 4ISFA 4BR7A 3DAWA 3MN5A 4WQ4C 2A6AA 1JCFA 3VERA 1IG8A 4BQZA 4BR9A 3ENOA 3ZEUB 5BPLA 4CJ7A 1XUPO 3CJ7A 3CJAA 1MA9B 5BPNA 5AQJA 2CGLA 1KAZA 3EKSA 5AQXA 3KZBA 4JHDB 4BR2A 3ULEB 2YHXA 4FWMA 3EKUA 3DJCA 2PBDA 2A40A 2ASMA 4Z94A 1ZBSA 4FPBA 3UB5A 3UKUB 3O5BA 1GLEG 2GEMA 5CE3A 4CZGA 4XH4A 4BVOA 4H5WA 3VESA 1ATSA 4E1JA 2Q0UA 3MN9A 5EX5A 1NGAA 2P9NA 4FWNA 1HUXA 5JLFA 1BO5O 2P9KA 2Q97A 3ATVA 2YHYA 2YI1A 3GBTA 4J8FA 3ZX0A 1BA0A 5F2RA 3W0LA 4EHTA 5BRDA 3CETA 3VEXA 2CGJA 2VYPA 3AAPA 4A61A 3P4IA 4FL9A 4B1ZA 1JCEA 1NGBA 4RTFD 1QQOA 4K41A 4GNIA 1ATRA 4CBWA 5EVZA 1BU6O 3U9DA 1NGDA 4EIAA 3EZWA 1D4XA 5AQVA 2E20A 5KPZA 3SMPA 4BC4A 3L6QA 4L3QA 1QQNA 5EOYA 4JNEA 4FOIA 2E1YA 4JD2B 4BG8A 2GWJA 3MK6A 4H0TB 4BR4A 1C0GA 4MLHA 1GLLO 3BP8A 4BRGA 2P9LB 1DEJA 4CZKA 1S22A 4WQ5C 3WXJA 4BRHA 3FZLA 3BEXA 3G25A 5BR9A 3QICA 3AY9A 2ITMA 3AARA 2YCHA 4B1UB 4WQ5A 3VGKA 4FO0A 3GE1A 1NLVA 2Q36A 4CZIA 5AQZA 1HPMA 3SJHA 3SK3A 3TU5A 4CZLA 3FE1A 4DB3A 3VEZA 1T6CA 3A8YA 1KAXA 4BGBA 3VEVA 2ZGYA 4Y0WA 1T6DA 4DQ8A 1BA1A 2ZWHA 4XH5A 1YAGA 3CJ9A 2QWQA 2P9UB 5LY3A 1X3MA 2ZGZA 5TKYA 3ZETA 2Q31A 1OKJA 3VEOA 3ZX3A 2BTFA 2HF3A 3ID8A 3CJCA 3JXUA 4M7XA 2GTDA 2FXUA 4BRQA 3FZFA 3WEEB 3SMSA 3O08A 3VF4A 4H5TA 4B1YB 1XQSC 1ZC6A 3WQUA 3CQXA 1SZ2A 4BC3A 2A5XA 2HMPA 5AQWA 4BC5A 5AZJB 2W40A 4K25A 5AQNA 3DXMA 4A2AA 1NGHA 1TYQB 1H1VA 2QWOA 5AQLA 5FPMA 2P9PB 2J4RA 3LDLA 4CD1A 3DXKA 3KVGA 5BREA 4XH1A 5AR0A 4QS7A 5FPNA 1TUUA 4ISEA 4WQ4A 4WYBA 1BG3A 1BDGA 2FLOA 2FF3B 5KQ8A 1NM1A 3H1QA 3LDQA 4RWTA 1BUPA 2NLXA 5AQPA 2Q2RA 3VGMA 3O1WA 4H03B 2E1ZA 3UKRB 1YUWA 1QZ6A 3WXKA 1U2VB 4EAHD 3L0QA 1GLDG 3RSEB 2A3ZA 1Z05A 1J6ZA 1Z6RA 1JCGA 1NGIA 3ZEUA 2E8AA 3F9MA 4BREA 3H3OB 2P9SB 3SLCA 1YVNA 2NZTA 1EQYA 4IZ9A 4BRDA 5F1XA 4JHDA 3ULEA 4PL7A 4CBUA 3HTVA 4BG9A 3C7NA 2D0OA 5AQSA 3ATUA 3O6WA 2Q0RA 5AZIB 3GG4A 4PKHA 5BN9A 3UKUA 3JS6A 4BRMA 3LDNA 3FGUA 3H3NO 3FZMA 2FSJA 4HTLA 4CD3A 1BOTO 5LJVA 2AA4A 3D2EB 3O1BA 2YHWA 4A2BA 4CZHA 4F9OA 3VGLA 3LM2A 3FZKA 1K8KB 1V4SA 2V7YA 5E84A 2I7PA 5JMVA 3U8XA 1BWFO 3O4WA 4B1WB 4CBXA 3EL2A 3J8AA 4IJAA 3U9ZA 3WXLA 4BR5A 1KXPA 4BRFA 5AQYA 1IJJA 1U6ZA 4FWOA 1GLFO 1NWKA 3CHWA 1ATNA 2Q1NA 2QM1A 3GL1A 2BUPA 4H5VA 3CJ1A 4QS9A 4BVPA 5FPDA 4DCHA 3EO3A 4BR0A 3A5OC 4A62A 3L4IA 3VF2A 4B1XB 2GUPA 3D2FA 4EHUA 1YXQA 3QFUA 4FOEA 3OHRA 3IMXA 3M3ZA 2P9IB 4FSVA 2QWMA 1X3NA 3LM9A 2V51B 4JD2A 3FFKB 3VF6A 1LCUA 5KPRA 3IFRA 4CZMA 2NRHA 4H0XB 3GDQA 4FPAA 3BF3A 5AQMA 2P9LA 1S3XA 3HM8A 3VEWA 4BRCA 5FPEA 4K42A 3ZETB 3R9PA 5LJWA 3B8AX 3D7EO 1C0FA 3MN7A 4FWLA 5BRHA 2E88A 5BN8A 3I8BA 3CIPA 3A5MC 3HBTA 4IO8A 3VPZA 2D4WA 2E2QA 3C0BA 1GLAG 1NGCA 4H0PA 2P9UA 1GLCG 3AAQA 4NO7A 4M63C 2UYTA 3VENA 4YDUC 5JICA 5KQDA 4B1VA 3S41A 4C23A 1RGIA 4I6MA 1MDUB 5AQTA 4CI6A 3O80A 4FWQA 4ISGA 1E4GT 3MN6A 3QDKA 3VEYA 2E2OA 3BF1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CJSA 1EWQA 3GOIA 3LZIA 2HW3A 5GAEP 1BISA 2HHTA 4QS8A 3HRGA 4DF4A 5E26A 5LMUK 2QW9A 3OS1A 1T44A 4R79A 4JAXA 3RR8A 3SQ0A 1ZBLA 4KTZA 4JKDA 1XHXA 1TK0A 1A5XA 4FWRA 3TABA 2F9WA 3FFIA 2O8DB 3UKRA 1VK0A 2W42A 3JAMO 3EE9A 3OYNA 1M90O 2QXLA 1VSMA 2KHOA 4ELVA 2KQ2A 1Q18A 1NK8A 1NJXA 1NMDA 1NBWA 4NXMK 1NKEA 4BROA 4B9QA 3K9KA 1RT5A 2YJEA 4H0VB 4AILC 2NRRA 1QZ5A 3KLHA 3V9ZA 4FJIA 3AVHA 3BUZB 4MQ3A 3WT0A 4LF5K 2OPRA 4E19A 1NGJA 1J53A 3WXIA 4O4GA 3AVJA 3DM2A 4Z4FA 1K8KA 1RDAA 3FLCO 3SPZA 4AHVA 1DTTA 3JYTA 3NVKA 5AQRA 5EXWA 4CZFA 1J54A 1WNSA 3HZ6A 3HOTA 1LOTB 1P8ZA 3MWPA 1HNVA 2UXDK 1E4FT 3O8MA 3OW2M 4BC2A 1CZ9A 3CCLN 3CFRA 4H0OA 4M41A 3VQAA 3NGYA 1SV5A 5M1QA 3W3DA 1U49A 2HOEA 1L3VA 2DY4A 4BRIA 3CCJN 3R6MA 2GV9A 3MCPA 1REVA 1RBUA 3OYJA 5ADXA 3CI5A 3DRRA 4JI0K 4DV7K 2D0PA 1C6VA 1KRPA 5HRSA 4AQYK 4PQUA 2IDOA 3A5NC 4Y1DA 3H45C 3WNHA 2HBMA 3VQCA 4CJQA 4O5FA 2F96A 1JLEA 4KH6A 3CC4N 4E7HA 3KD1E 4DLEA 2FSKA 2CH5A 3WEEA 4AM7A 4FWKA 5MLCQ 1HKBA 3V9XA 5AQIA 3OJUA 1V4TA 3AVLA 1N6QA 2ZJQL 4K8XA 4BR7A 4DR2K 3VERA 1EO1A 5J2PA 1QTMA 3KKRA 2ZJRL 3CJAA 4EZ9A 4M3UA 2YNGA 5AQJA 4CJLA 3T1YK 3KD5E 4BE2A 2NRZA 3MEGA 3ULEB 2YHXA 4FWMA 2HHSA 3Q7CA 1T7PA 3TSUA 3DJCA 3DRPA 4BWMA 2PBDA 2A40A 1RILA 4Z94A 4DSLA 3RMBA 3SUOA 3AVKA 4CZGA 4H5WA 3VESA 3HM9A 4DFMA 1L5UA 2OCEA 3MN9A 5JLFA 2P9NA 3L2VA 3SV3A 2Q97A 1RDDA 1BA0A 1YTUA 1F21A 3W0LA 4Z4CA 4FM2A 1RDUA 5HL7L 1BQMA 5AJ3K 2VYPA 4A61A 1O1WA 4JKGB 1NGBA 3CG7A 4CHYA 3CCQN 1QQOA 1N36K 3OS2A 4RW9A 5EVZA 3U9DA 2O8FA 4Z4EA 3I0SA 4CECA 4EIAA 3EZWA 3BZKA 4HUGA 2ZE2A 2E20A 1IKYA 3L6QA 1VQ5N 5CHIA 3MX2A 3TR8A 4DU4A 5D3GA 1LWFA 3WNGA 1S1UA 3CF5L 1S1VA 3DMJA 3THWA 5E41A 1U04A 3MK6A 4H0TB 4BR4A 1D9DA 1DEJA 4CZKA 1YIJN 4ZHRA 4WQ5C 1WBDA 4BY9C 3T1HK 3U6FA 3AARA 3KK3A 2RF2A 3CFOA 1YJ9N 4WQ5A 3VGKA 3OYLA 3LP3A 1YVUA 4G1QA 4CZIA 5FLXO 1HPMA 3BY5A 3TU5A 4CHNA 4DB3A 3A8YA 1TL3A 3B6OA 3VEVA 4DQ8A 1NNEA 2ZWHA 1P90A 4N5SA 1D9FA 2R7YA 2QWQA 1NU0A 4DG1A 1Q81O 3ZETA 1HJRA 4NLCA 4LH5A 3VEOA 2ETJA 3T7ZA 3O9TA 1NK7A 4DSKA 4HCCA 4AF1A 1RBSA 3MXIA 2D0CA 3RMDA 3E9PA 2O4IA 4WFNL 3C95A 1HQUA 4CK2A 3VF4A 4FK4A 3LP2A 3CD6N 1XQSC 2A5XA 3E1YA 3EEQA 2HMPA 2KKZA 2G8VA 2W40A 4K25A 3F5TA 1KCFA 4RW4A 3TAGA 3OBYA 3P31A 2QKBA 3QESA 3OYGA 5FPNA 3ALYA 4WQ4A 1S6QA 2ZJPL 1BDGA 2FF3B 2Q2RA 4H03B 1JLBA 2PY5A 1S9GA 4EZ6A 3C6TA 2A3ZA 1J6ZA 1NGIA 1NMNA 3ZEUA 2HVIA 4N41A 1VSDA 3H3OB 2KZZA 4LF8K 4E7JA 4C8OA 2NZTA 4CHPA 4JI7K 1CXQA 4MDAA 4F2RA 4BACA 4PL7A 1VQ7N 3HTVA 1LAVA 2YNIA 4FZXC 3C7NA 2BH1A 4NCAA 3OYDA 4E7IA 3UKUA 2F8SA 2HNDA 3OJSA 4YNQA 3D2EB 3MECA 4UY8O 2WFBA 4A2BA 4DV0K 4F9OA 1QSLA 4B9VA 5FROA 2I7PA 4IFVA 4K0KK 1BWFO 1OH7A 1VSEA 1KXPA 3L3VA 5AQYA 3KK2A 1IJJA 1U6ZA 4FWOA 1TK5A 3CHWA 4CGHA 3QEXA 1C0TA 2ATQA 4BVPA 3TI0A 3EO3A 4A62A 1TKDA 4EHUA 3QFUA 1WAFA 1VRTA 4CJTA 3IMXA 2AJQA 4FSVA 4X64K 4PY5A 4FLWA 1QVGM 3LM9A 4HCBA 3AA2A 4Z0UA 1S3XA 3T3FA 3VA3A 5M1OA 3VQPA 4E3SA 3C94A 1HYZA 1IH7A 3E01A 2JLEA 5HRNA 4KPYA 5FPEA 4DFKA 1HYVA 2X6SA 5LJWA 3B8AX 4JS5A 1C0MA 3D7EO 4CVNE 3MN7A 2ZM6K 1U45A 5BRHA 1VSKA 5BN8A 1WSGA 4B8CA 4IO8A 3ZSXA 3K58A 4CGDA 3VPZA 2D4WA 5GINA 3MXJA 1GLAG 3HO1A 3C6AA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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