4R3AA

Erythrobacter litoralis el346 blue-light activated histidine kinase
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
331
structure length
318
Chain Sequence
HDKEAWGRLPFSLTIADISQDDEPLIYVNRAFEQMTGYSRSSVVGRNCRFLQGEKTDPGAVERLAKAIRNCEEVEETIYNYRADGEGFWNHLLMGPLEDQDEKCRYFVGIQVDMGQSERATELDRQLAEVQHRVKNHLAMIVSMIRIQSAGGVGSQFDSLSRRVEALQLLYQEMDIKIIPLGAYLGRIASAINHIDGRGAIKVNVQADTVDVPVETAGRIGLLVSEVLTNALQHAFSDRASGVVQLRSSVMSGEQLRVTVEDDGRGIPEDCDWPNEGNLGSRIVRQLVQGLGAELNVTRGGTGTIVNIDIPLSQQKTL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
molecule keywords Blue-light-activated histidine kinase 2
publication title Full-length structure of a monomeric histidine kinase reveals basis for sensory regulation.
pubmed doi rcsb
source organism Erythrobacter litoralis htcc2594
total genus 99
structure length 318
sequence length 331
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.13.3: Histidine kinase.
pdb deposition date 2014-08-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07568 HisKA_2 Histidine kinase
A PF13426 PAS_9 PAS domain
A PF13581 HATPase_c_2 Histidine kinase-like ATPase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.450.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Beta-Lactamase Beta-Lactamase 4r3aA01
3.30.565.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Heat Shock Protein 90 Histidine kinase-like ATPase, C-terminal domain 4r3aA02
4GQTA 4DZYA 2I9VA 4I3AA 5J7EA 3CWFA 4UROA 3R92A 3LPSA 2KX6A 2CCUA 2C2AA 3Q5JA 2YE4A 1YT1A 1V9ZA 4KSGA 3A0XA 5IN9A 2YECA 4LWGA 4I3IA 4HQAA 5J71A 4QPJA 2J80A 1PVGA 4AWOA 4V26A 2PYPA 4Q20A 1Y4SA 2YE2A 2IWXA 4R3MA 3T10A 3MR0A 1NWZA 1UGUA 3B33A 4H85A 1ID0A 2BTZA 1UYCA 4O07A 2YI5A 3H82A 2ZOHA 4JGPA 4V25A 4WUDA 3PYPA 2ZDYA 1XJ6A 1I59A 2BU7A 4P8OA 1ZWHA 4NH8A 2YGFA 5D6QA 3T0ZA 3C11A 1YERA 2VV7A 4L8ZA 4LPZA 1YS3A 2QHKA 4NH9A 1V9YA 2YE7A 2QF6A 2YKCA 4B6CA 2QG2A 4LRZE 2VCIA 2XCMA 4HH3A 1S1YA 5M4EA 2QWSA 3IEDA 2HCHA 2R78A 3A0VA 1OTDA 2IOQA 2HG1A 4XT2B 5FNFA 2FWZA 5G4YA 4BBUA 3BMYA 1I5DA 3TUHA 3B25A 1LSVA 4I5SA 3UE6A 4F3LB 3O0IA 4H6JA 1TH8A 4YKWA 2VEAA 3KX0X 5BODA 1DP6A 1TBWA 4E04A 3LIBA 4GGLA 4R38A 1XFNA 5KIZA 3LYXA 4B9OA 3VHCA 5I5LA 2KDKA 2XJJA 1TS0A 3MFXA 3R4PA 1S4RA 4K08A 3TZ2A 4BQGA 1DP8A 4EEUA 4URLA 1NHIA 1R62A 1YC3A 3E4PA 3G7EA 4CWFA 4U7OA 4B7PA 2XHRA 3VHAA 4O09A 4EXOA 5F6AA 4M4XA 1EI1A 3NHQA 4NXFA 4HY1A 4MPCA 5FWKA 3D36A 2YEHA 1YC1A 4NH7A 3SL2A 2WI1A 2WI4A 4YWZA 2XX5A 3WQ9A 4HYMA 1UYMA 1D06A 4YKZA 4ASAA 4DJ3A 1THNA 4LPBA 2YKIA 4QPKA 1BKNA 2HKJA 3R4OA 1AM1A 3MNRP 1B3QA 3U2DA 3U2KA 4GT8A 3VHDA 2GFDA 4AWPA 1KZNA 4KQVA 4JGOA 3A0WA 3F1NB 2W0NA 3F1OB 4YKRA 3LI9A 2XDLA 2WI6A 4MP2A 3O6OA 1UYIA 4GHIB 3CGYA 3RH8B 3HZ5A 5C93A 2L0WA 1DP9A 1T1CA 2WEQA 2YJXA 3OW6A 4XC0A 3CGZA 1UWNX 4FCQA 3UB8A 1U2OA 5HD5A 4HJ6A 4CE2A 2ZBKB 1T1BA 2H28A 1Y4UA 4AWQA 1P97A 3PHYA 4RQ9A 5CTWA 1F98A 1VB6A 1MZUA 4MPNA 4CWSA 5F5YA 2YE6A 3QDDA 1UYHA 2JKIA 4CWTA 1G28A 3O2FA 2Z6DA 4MBCA 2CCSA 2CMNA 1YT2A 3MQQA 3E4OA 3UB9A 4EMVA 4WF0A 1JNUA 4E01A 4PKYA 2OWHA 2YEFA 3R4MA 2XDKA 3RLRA 4XKAA 2Q8HA 2YI0A 3HJKA 4HP4A 5AVEA 2V0UA 4PKYG 4HJ4A 2Q8IA 5GGZA 3LIAA 2ZKJA 1TS7A 3GIEA 2PD7A 1Y8NA 4HJ3A 4MB9A 2PR6A 4O05A 5G4ZA 1ZXNA 3CRKA 3H7WA 1TILA 1A4HA 4ASFA 1UYFA 2JHEA 5HDCA 2WI5A 3OWDA 4EFUA 1UWPX 2A24B 4R1FA 3OMUA 5D7CA 1YC4A 5M4NA 2D01A 4MP7A 1N9NA 4NXGA 4JGRA 2CCTA 3A0YA 2CG9A 3INXA 1MX0A 5CF0A 3NOTC 1GKZA 3G7BA 1Y28A 2YI6A 4EGKA 2XX2A 4FCPA 3ZM7A 2XDXA 4WUBA 4EETB 5IDJA 3LNUA 3OPDA 3C8CA 1Y8PA 4KUOA 3EHJA 1I5BA 2V9AA 2XHXA 3GECA 3EWKA 4L91A 1T19A 3SW1A 4GEEA 3A0RA 1NHHA 3EKOA 3GIGA 2INWA 1XFQA 3UB7A 4EEPA 2K5BA 3TZ4A 4MN5A 4HY8A 1Z5AA 2CGFA 4L90A 4YKQA 4CWPA 4XKOA 2YEGA 3F1PB 4I3HA 2WKQA 2BYIA 3T0HA 2YEBA 3CRLA 5CPHA 3K97A 3C2WA 1Y8OA 1QYEA 1S16A 3EEHA 4KQDA 1YESA 2BYHA 2M1CA 1F9IA 4L9FA 4EESA 1S1ZA 3F1NA 4LRYC 2YEAA 1TIDA 3F1OA 4WL9A 2PYRA 3LIDA 5HSQA 2BRCA 3E4QA 4GHIA 1EW0A 4CWQA 5DJTA 2WERA 5FNDA 3G75A 4BAEA 2FWYA 4XIRA 4YKXA 1H7SA 5HDDA 3RKZA 2BASA 4NXEA 1XJ2A 1UY8A 3MJQA 4HIAA 1OTIA 1OJ5A 2YK2A 2YE3A 4LWIA 5IU1A 4MOTA 2YEJA 3IBRA 4FCRA 2YKBA 3Q5LA 5CTYA 4E02A 3HHUA 3GDIA 1OSFA 1GSXA 2VW5A 3RLPA 1UY9A 3B28A 4DUHA 2UWDA 3ICYA 3T2SA 3ZXOA 3A0TA 1ZW9A 2VCJA 5BOCA 3NMQA 3NOPC 4GS9A 1UY7A 2Z6CA 5TBMA 2ESAA 2YKFA 1S14A 2BU5A 5HD3A 1OT6A 4P7AA 1GSWA 4XCJA 3K3CA 1YT0A 2V1BA 5M4KA 3BY8A 1D7EA 3HZ1A 3FC7A 2V0WA 1LSWA 3D2RA 1S67L 2BREA 4HZ0A 4BXIA 4HXWA 2VV6A 3G6OA 4HZ5A 4GW9A 5HWTA 3GIFA 3Q5KA 5L3JA 2GQPA 3D72A 2A24A 3IS2B 4EM7A 2YGAA 4EEHA 3PEJA 2YGEA 2PD8A 3P7NA 2EXLA 1H7UA 4YKYA 1U0ZA 4X9LA 2EA9A 1BXDA 2P7JA 1EA6A 4DJ2A 4E00A 1UYLA 4MPEA 3MXQA 4PRVA 2K7SA 2YK9A 4HI4A 2PHYA 1BYQA 4L93A 4LP0A 2YKJA 5J4EA 1MU5A 4KUKA 2IWSA 4XTJA 2WI7A 4R6LA 2YEIA 3A0SA 2E0AA 1B63A 2ZDXA 4AS9A 5F5RA 5EFWA 1YSRA 1XJ4A 4K4OA 1S66L 2QJ7A 4XT2A 5IS1A 3ZXQA 3ULFA 3CWVA 2V1AA 4URMA 5D6PA 2O1VA 3QTFA 2BU8A 4WUCA 3F1PA 2WKRA 3T50A 1GSVA 4F3LA 4L9GA 2BT0A 4H7QA 3R91A 1ODVA 4LWFA 1UYGA 4CWNA 2O1UA 4XDMA 3CAXA 3K3DA 5DKKA 1AH8A 2BU6A 1GKXA 5CTXA 5M4MA 1BYWA 1KIJA 2L4RA 3C0EA 5J6AA 4WLAA 2Q2EB 2OWJA 1AJ6A 5A8BA 3EHGA 2XD6A 4CE3A 3A0ZA 2GJ3A 4JAVA 1YETA 2YEDA 4HYPA 3TZ0A 4HOIA 4HXZA 5D7DA 4LRXC 4ASGA 1N9LA 3BWLA 2FYPA 4GFNA 4ZKIA 2QJ5A 2XJXA 4W7TA 5DJUA 4YKUA 1GJVA 1I5CA 4CE1A 3BY9A 3RTYA 1UYEA 1N9OA 2XX4A 2XJGA 4ZVIA 4U93A 3VOLA 4U7NA 5F68A 2H8MA 5HWWA 4LWHA 1P0ZA 3K60A 3BM9A 3LI8A 3LIEA 4EERA 1XJ3A 4HP9A 4EW7A 1B62A 3NJAA 2YI7A 4BIZA 2HV1A 3FV5A 2WKPA 4LLOB 4KSHA 3KE6A 3UMDA 4XITA 3VE4A 2JN7A 3LUQA 3UB6A 4BBVA 2CH4A 1YSZA 2XDSA 2YKEA 4FPPA 4ASBA 1OTAA 4I38A 2XABA 3K99A 2BU2A 5M4PA 4BBTA 4JGQA 4GCZA 1NHJA 3R4NA 3H9WA 3MQOA 3B27A 1UY6A 2WI2A 4FMTA 1T1AA 4O0BA 5J3WA 1ZXMA 3INWA 4L94A 2PNRA 1OJGA 4R70A 1OTEA 3HYYA 4BIUA 2VLGA 3LIFA 1QY8A 2H55A 3H80A 1T18A 4JASA 3ZKDA 3IS2A 4XIPA 3ZQ5A 1OTBA 2QFOA 2QKPA 3OWBA 3H7WB 2PR5A 1AMWA 4I3JA 1LL8A 2L1MA 3H82B 3U67A 3HJIA 5F69A 1Z59A 2YEEA 3DGEA 2ZBBA 2WEPA 1QZRA 5D7RA 3OLOA 3HEKA 3PEHA 4NXBA 1Z5CA 4HHDA 4PU9A 3HYZA 2IOPA 4XCLA 1KOUA 4PL9A 4HNBA 3EHHA 2XDUA 4H81A 3FT8A 4MN6A 4CWOA 2IWUA 3RLQA 3GIGB 1JM6A 2BSMA 3CLOA 1LSXA 5HWVA 2YKHA 1UYKA 2FXSA 5HDSA 3JZ3A 4EGHA 2D02A 4KTNA 3ZKBA 1DRMA 3K98A 5CTUA 4HY6A 1I5AA 3VADA 3FG8A 4KFGA 5DKLA 2XHTA 3B24A 1WA9A 4O04A 4URNA 4R3AA 1US7A 2O1WA 4H6JB 2XK2A 3FT5A 1BGQA 2WI3A 4CWRA 3B26A 4WN5A 1AH6A 2Q8GA 2QG0A 3TTZA 4BQJA 3EHFA 3UMEA 5AVFA 4XD8A 3TZ5A 5HZHA 3D0BA 4PRXA 2YJWA 1S4SA 1I58A 2YE8A 2PDRA 3T1KA 2JJCA 1TS6A 3EKRA 3VE3A 4KP4A 1TS8A 2Q8FA 2W27A 2ZOIA 2VV8A 1L0OA 3NOUC 4JAUA 4YKTA 2B02A 5F3KA 3WHAA 5M4HA 2YE5A 4LWEA 1TC6A 1UYDA 4EGIA 5FNCA 4XIQA 4HH2A 2VWCA 4XKKA 1OT9A 4JQLA 1X0OA 4L9EA 1TC0A 1Z5BA 4EQ1A 2OOLA 5IDMA 2AKPA 4GS9B 3H4LA 4XE2A 3LICA 2YE9A 2BZ5A 1LT0A 5TBMB 2IORA 4EFTA 4I39A 4WUJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ESIA 2I9VA 3O86A 2JBFA 2C2AA 1YT1A 2B18A 2P9VA 4LWGA 2HHIA 5IT5A 2I72A 1SKOA 1NYYA 2PYPA 1XGIA 2IWXA 5DVAA 2LB5A 3S4XA 1NWZA 3B33A 3OCNA 4V25A 2PT7A 1I59A 1K6SA 3MQ0A 1L0EA 2BU7A 1K57A 4NH8A 3HLFA 5D6QA 5FSRA 2VV7A 4L8ZA 4LPZA 3HLDA 5L09A 2VX8A 4NH9A 1V9YA 2QG2A 2VCIA 4LGWA 5M4EA 1GHMA 2W3HA 2MJ6A 2HCHA 2JE5A 3A0VA 1OTDA 2IOQA 5FNFA 3W4QA 5AQ7A 5EV0A 2VK3A 1LSVA 4I5SA 4X53A 3EQUA 3MBZA 4H6JA 1TH8A 1H0MA 2VEAA 3DTEA 4GJ4A 1TBWA 3C7VA 1D1JA 1DJBA 3LYXA 4B9OA 4U0XA 1TS0A 2WGIA 3U2AA 3TZ2A 2RL3A 3G7EA 4CWFA 4U7OA 3V5MA 1N9BA 4B7PA 3E2KA 3IH8A 2V8FA 4JF5A 4ME4A 1CEFA 4UQIS 4EQIA 4QY6A 5CRFA 4YWZA 2XX5A 3FWLA 5FL3A 4E6WA 3QP2A 3KO6A 2FZ0A 3LCEA 1PI4A 4PM5A 3O87A 4ASAA 1MXOA 3IQAA 4PM8A 2RCXA 3R4OA 1AM1A 3U2KA 2GFDA 1KZNA 2FFYA 3A0WA 2WI6A 3S5TA 3O6OA 4GHIB 5C93A 1DP9A 2WEQA 3T4OA 3CGZA 5AJGA 4FCQA 3DWKA 2Y2GA 2GZAA 2K2NA 5HD5A 2A49A 5FA7A 3Q7VA 1Y4UA 3IXBA 1FR1A 4MPNA 2WAFA 2YE6A 4DXBA 3QDDA 5L8MA 5CGXA 4G3WA 5F1GA 2Z2MB 2Z6DA 4MBCA 4O01A 4X69A 4U0TA 1XA1A 2XDMA 3PAGA 3IWOA 1IYQA 4EMVA 4QHCA 1SDEA 3R4MA 3N8SA 2Q8HA 3ZGAB 1L2SA 3SH8A 2ZL1B 4HJ4A 5E2HA 4S2OA 3LIAA 1TS7A 4QPRA 3PBRA 3CUEC 4HJ3A 1KE4A 4MB9A 3FKVA 3CRKA 3M2KA 4EFUA 1KGFA 2JHEA 1XA7A 1UYFA 4O8GA 3KYEA 2FTKA 3OMUA 2Y2PA 3S1YA 5CF0A 1GKZA 3V50A 3G7BA 1Y28A 1YMXA 1ZC2A 2XX2A 2HJEA 1H8MA 1K55C 2ZMAA 4WUBA 4KUOA 2V9AA 4KZ3A 4L91A 4KZ9A 1YLPA 2XD1A 3GIGA 2WZZA 3VP2A 4HY8A 2CGFA 3JVVA 4L90A 2Y2JA 4XKOA 1H8ZA 4R1GA 3CRLA 5CPHA 3K97A 1ERQA 3UY6A 1QYEA 3EEHA 4LRYC 2UWXA 3M6BA 3F1OA 1TIDA 1W63Q 2BRCA 4U3TA 3E4QA 3HLCA 4CWQA 5DJTA 5FNDA 2P9VB 4BAEA 2FWYA 4YKXA 1W63M 2EXAA 1XJ2A 2OLUA 3MJQA 1OTIA 1EWZA 3EEAA 1JTGA 2NUTC 3CJMA 4FSFA 2YKBA 4UAAA 2P08A 3RLPA 4Q0IA 2VW5A 2QYBA 3ZNYA 1ZW9A 4ZJ3A 1EROA 3NOPC 4GS9A 4K0XA 3TJZC 3U4LP 5FAQA 2Z6CA 2C5WB 3IH9A 1J3WA 4YOFA 1S14A 4GDBA 4QJGA 3NULA 1OT6A 5CX7A 4P7AA 3K3CA 1YT0A 2K31A 3BRMA 3BY8A 3FZCA 2J8YA 3VP3A 4HZ0A 1BTLA 3OPLA 2XRNA 1CQAA 4N9KA 3NCKA 3GIFA 2GQPA 2A24A 1TF1A 4KG6A 4EM7A 3PAEA 2YGAA 4B88A 4Y7PA 5L07A 2EX6A 1H7UA 4X9LA 4PPRA 1BXDA 2XK1A 3IWQA 1YM1A 2K7SA 4HI4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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