4RC4A

Crystal structure of ser/thr kinase pim1 in complex with mitoxantrone derivatives
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
273
structure length
272
Chain Sequence
PLESQYQVGPLLGSGGFGSVYSGIRVSDNLPVAIKHVEKDRISDWGELPNGTRVPMEVVLLKKVSSGFSGVIRLLDWFERPDSFVLILERPEPVQDLFDFITERGALQEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILIDLNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCGDIPFEHDEEIIRGQVFFRQRVSECQHLIRWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQETAEIHLH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase pim-1
publication title Crystal structure of Ser/Thr kinase Pim1 in complex with Mitoxantrone derivatives
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 272
sequence length 273
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2014-09-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4rc4A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4rc4A01
3TXOA 5KHWA 3VWAA 4I6HA 3W2QA 5T68A 5CSVA 4I5CA 4YO6A 1AGWA 4O7WA 5AR4A 3PDTA 3KVXA 5BUJA 3KCKA 5BYYA 3GCSA 2VTAA 3CC6A 2HZNA 2QLQA 2WMUA 5HBEA 4PQNA 4DFBA 4NW6A 5ANEA 4Y5HA 3QAME 4ANNA 2XKFA 1KV1A 2C5YA 4F64A 1PXOA 4ORKA 3COHA 4I3ZA 4WNOA 2XNEA 4XG2A 3WE4A 3TKIA 4EYJA 3WILA 2PVKA 5GHVA 1H00A 4IB0A 1WBNA 4P90A 2R3FA 2X7OA 5IA4A 3VVHA 3R8MA 3NYNA 5EG3A 2YABA 3PA5A 1GZKA 1PF8A 2XIZA 4IX3A 3L9MA 2NRYA 3SQQA 4ZZOA 1ZYDA 3V5PA 1K3AA 4RLLA 2J51A 4EONA 1JAMA 2C69A 1YI4A 1CKPA 3DLSA 4PWNA 3O2MA 4PTGA 3PY0A 2IJMA 2X81A 5KMKA 3TV6A 1ERKA 4QMWA 3SV0A 3QU0A 2WO6A 4X2NA 2G2HA 1XJDA 1I44A 3JYAA 2JIUA 4WHZA 1Z57A 2A0CX 4FL1A 2UW8A 5J87A 3NUYA 3SG8A 4L00A 4HVSA 3NMUF 3D0EA 4XX9A 3C0GA 2O64A 1WZYA 4BGHA 4IQ6A 3SC1A 3GGFA 5DRBA 3R00A 3GCVA 3E87A 3SVVA 3SXRA 3F7ZA 1OL6A 4LYNA 2BFXA 3WZUA 4ASDA 4GKHA 4QTBA 3OUNB 3E7OA 3GU6A 4QPMA 4AZVA 5LMKA 3A7GA 5LXMA 4ITHA 3DNEA 3S4QA 4DGMA 3U55A 3H30A 1H08A 5JT2A 3PXQA 3ODYX 3R73A 1YOJA 2RFDA 4FG8A 4B8MA 1Q8UA 2QR8A 5CEKA 3KRRA 5E7RA 4KIKB 4TWPA 1YXSA 4MD9E 2OH0E 5IF1A 4F0GA 3EQPA 3R9OA 1NA7A 3EYHA 1H8FA 4H3PA 4NL0A 2J7TA 4PDSA 2WOUA 4A4XA 4MD7E 1JNKA 3C4CA 4RWKA 2PZYA 4RWLA 4GG5A 5DRDA 4DCEA 4QPAA 4A9SA 2WB8A 4Q5EA 3UOLA 2X4ZA 3DGKA 4I5PA 3ELJA 3E7VA 3GCPA 3I7BA 1YXXA 4BCHA 3TDWA 1QPJA 3BU3A 1KE6A 3RAIA 3V51A 3DTCA 3QC4A 4P5ZA 2R9SA 4AN2A 3CY2A 1EH4A 3M42A 4G31A 4GS6A 2CMWA 3E8EA 3FY2A 3PG1A 2QHNA 4O22A 3RPYA 5J79A 5LVLA 3MH0A 1H25A 4GU6A 4UY9A 4RIOA 3OWPA 3TZ7A 3WYYA 5M4IA 3MPAA 2W0JA 3MVMA 1LEZA 2VTPA 5KKRB 3VN9A 2WNTA 3F3TA 4TRLA 4BCPA 1IR3A 3LMGA 3UPXA 2E9UA 2WTJA 2X8IA 3DFCB 2BDFA 3QQLA 3R01A 2C68A 2JEDA 4JXFA 4FNYA 5DN3A 4ENXA 2I0YA 5KMIA 4IB1A 2WTVA 2WMWA 5GJDA 2W5AA 4Q5HA 4JR3A 2R3OA 5CT0A 1HCKA 3GC8A 3FE3A 2C4GA 2CDZA 3LCOA 3A60A 3MJ2A 4S31A 4X0MA 3TUBA 4YLKA 1BYGA 3N4TA 1S9IA 5ANJA 3F69A 3DKOA 5AP5A 2QOHA 2YCFA 1UA2A 1YW2A 4D28A 1VJYA 4G9RA 2UZOA 4YZBA 4U6RA 4CLIA 3BV3A 1BX6A 2Q0NA 4TNDA 5EQEA 5EYMA 3MVJA 1H0WA 2IZUA 4G1WA 4DGGA 1V0BA 5B7VA 5IMXA 2V5QA 4JVGA 3UO5A 2Y6OA 2RG6A 3OY1A 4PRJA 1XH8A 4TYHA 4DH8A 5IH5A 5IZFA 1SNXA 3MA3A 4BN1A 4FNXA 4PP7A 4ALWA 2RFSA 3ALNA 4XRLA 4XOYA 1Y6AA 5CVGA 4OBQA 3CTJA 4FUXA 5E9EA 3R02A 3V8WA 2H96A 2YIXA 4L3LA 4AZWA 3JUHA 2BKKA 5L2WA 3GQIA 5F94A 1XQZA 4MXCA 4RIYB 3R9DA 5EKOA 4IX6A 1H01A 5CXZA 2NPQA 4IE9A 4CG8A 3EL7A 1OGUA 2ERZE 4FEVA 3R9RA 3GQLA 3V01A 4I22A 4B99A 3NGAA 4GJ3A 2KULA 3ZS5A 5AP1A 5EM7A 4C4EA 5AAEA 4A9RA 4O6EA 3H10A 1U5QA 4JQ7A 1RW8A 3HMMA 5TKDA 4IJPA 3GUBA 5I9XA 3WIKA 2GHMA 1OBGA 1GAGA 3FMNA 4YPDA 4FGRA 2ESMA 4DF3A 2J9MA 2O63A 3BV2A 3G0FA 3C5IA 3VBQA 5HE0A 5D9HA 4XP2A 4RVLA 3DA6A 5JK3A 5K5XA 4EUTA 4LGHA 1FGKA 3FL5A 5L6WL 3DBFA 3KXXA 4XBRA 2YJRA 2WTCA 4ZZMA 2VO3A 3F3WA 3P78A 3R30A 5AV0A 4C7TA 3NR9A 4ANQA 3AGLA 4O0TA 4V0GA 1UVRA 4QNAA 5F95A 4DN5A 4EL9A 3PVWA 1GY3A 4UWBA 5AM6A 4O0XA 2PVMA 4YZMA 4O6LA 3AD4A 4OTPA 5DR2A 3FUPA 3TJCA 4I5MA 4DEDA 3W2CA 2ITPA 5HVKA 3DTWA 3ZXZA 4ZTMA 3ZMMA 4U5JA 3BZ3A 4I0RA 4QMXA 4KAOA 4UWYA 1FPUA 4BIBA 2JDVA 3D7ZA 3ORXA 3SAYA 1K2PA 2F4JA 4F09A 4EORA 3AMAA 5HO6A 4EQUA 4BTMA 3U4UA 2YJSA 3FMMA 3PRIA 5ANOA 5H2UA 1H1QA 2X8EA 4MXOA 3FXXA 3R8PA 3ZFMA 4M66A 2PL0A 4DE4A 1G5SA 4FIIA 4BTFA 4BB4A 3I7CA 3E8NA 3N4UA 4DCAA 2IVTA 3KC3A 3HKOA 3HMPA 3FBVA 4XNEA 4R7BA 3SW4A 1LEWA 2AC5A 4O38A 4YZDA 5AV3A 3CTHA 3NCGA 4IZ5A 1UNLA 4LV5A 1FINA 2BR1A 3A7IA 4RFMA 5AMNA 3A7FA 5L2QA 3W8LA 3ZLWA 3K3IA 3QF9A 4FT9A 4C02A 1LR4A 3K5VA 3FMKA 4GIIA 4LG4A 1H1WA 1Y8GA 4X2FA 4ZTQA 4AW2A 2CGVA 2YDIA 3UPZA 3OW4A 2E9PA 4UXQA 3DJ5A 4XYFA 2WIHA 4FTOA 4EJNA 3NW5A 2CPKE 3P0MA 3Q52A 4IIRA 4XV3A 4GUBA 2X2MA 3BEAA 5EM6A 3ULIA 3ZZWA 4E5WA 4ASXA 1AD5A 5B2MA 4HCTA 3PPKA 4E73A 4RIWA 2XRUA 3ZUUA 5LVMA 3G33A 3LE6A 4BBMA 3R2YA 3BEGA 4BI1A 4O7YA 4FT3A 5EK7A 2EXMA 2OFUA 2XF0A 4KSPA 2JFMA 2PMIA 4ERWA 5LWMA 2Q83A 2CHLA 5CWZA 4I0TA 3AC1A 3TUCA 2ZYBA 5GZ9A 3VNTA 1R0PA 4IDTA 5C1QB 5CU3A 4O7VA 1PKGA 3QCXA 4CV8A 1J91A 2QR7A 2RL5A 3PA4A 2BAJA 3JR1A 5BYZA 2X1NA 4FICA 4H1JA 4RLKA 4BCMA 4GKIA 4ZP5A 3ZC6A 4NM3A 1ZXEA 3E92A 2QCSA 4ZEGA 3OCGA 4HVGA 2GMXA 5KMOA 4AUAA 1MRVA 3TNHA 1OBDA 2V62A 2PU8A 4EEVA 1P2AA 4JBPA 5L2IA 3C4ZA 5FM2A 3D83A 2QNJA 3KL8A 4FV7A 2I0VA 4MF1A 4MQ1A 4OT6A 4EZ3A 3EN9A 2O5KA 4RJ8A 2C3IB 4YLLA 3PY1A 2R3IA 3ALOA 2RSVA 3NUUA 5HE1A 5AJQA 4LM5A 2Y4PA 3FYJX 2YM5A 2P33A 2XS0A 4D1SA 5IDNA 3FSKA 3I1AA 5IQHA 3EFJA 3OZ6A 4B9DA 2Z02A 2WQOA 3QCYA 4ACGA 5CI6A 1Q4LA 3OVVA 1WBTA 3E3BX 2HY0A 4ACMA 3BLHA 2WHBA 1O9UA 3DBDA 3E63A 4BWXA 4CSVA 3LKMA 4WUAA 2J4ZA 4PDOA 4DG3E 1JBPE 1ZZLA 3GNIB 3UGCA 3AC3A 3RWPA 4ZS0A 2FSOX 3GEQA 3LFFA 3G15A 3M11A 3MPTA 5ETCA 1KWPA 2GTNA 3LHJA 3HV6A 4E4MA 4GV1A 3DXNA 4MNEB 4O91A 3F5PA 3H3CA 4FK6A 5EHYA 3AT4A 4DG2E 5L6OA 3MIAA 5E8WA 5HO8A 3WI6A 4BCFA 4XHKB 3C4EA 1OECA 5F9EA 4I92A 5A46A 4X2JA 4AE9A 5BVWA 2XK6A 3HA6A 2BPMA 3TDVA 2QONA 2X2KA 4LRJA 2R3LA 3CKWA 4RMZA 3KEXA 1K9AA 2B53A 4I24A 3BPRA 4WA9A 4FTLA 1JKSA 3VC4A 4DINA 2J0KA 3VIDA 3FI8A 3SG9A 2V7OA 4AW0A 4MCVA 4YSJA 3NUAA 1XH4A 3R63A 4L7SA 5BVEA 3LLAA 2I40A 4FV4A 4WD5A 3COMA 3RI1A 5AUYA 3LFNA 3CTQA 4I94A 4WG5A 4FKVA 2OU7A 3V5TA 4NFMA 4CQGA 4F6UA 2ITUA 3GENA 4Z3VA 5M08A 1NVQA 4TZRA 3Q9YA 3BE2A 4HCVA 1MQ4A 4KABA 1DM2A 4XG8A 4EOIA 2GQRA 3D94A 5IUGA 4IB3A 3BKBA 3NNUA 1OPKA 1BL7A 4OTWA 5E92A 4BL1A 3B2TA 2UW3A 5AAGA 4XEYA 3FZOA 4XV2A 5AUTA 5CZHA 3RVGA 3QA8A 3UO6A 2ITVA 3VO3A 1F5QA 4E5AX 3AQVA 4UMTA 3RM7A 3MSSA 3KMMA 5HZNA 4YJTA 5LARA 5CF8A 2JDTA 3BHVA 3HV3A 4BWPA 5BVNA 4IM2A 5CTPA 3QQHA 4O7TA 3H9RA 4L01A 5ICPA 2HAKA 3Q96A 4MNFA 2PWLA 2W1EA 3O8UA 2G9XA 4FVQA 3QX2A 3PWDA 4PDPA 5I9WA 3UQCA 2PZRA 3OF0A 3ZSGA 3QWJA 3POOA 4WSYA 3KMUA 1SVEA 4QTAA 5EYKA 3KU2A 4EOSA 3PSBA 3BYOA 4G3DA 1YHSA 2W1ZA 2V55A 3IW4A 3RPVA 3QQJA 4FIEA 3SXSA 4CG9A 1H27A 4U80A 3C9WA 3DCVA 2GNJA 5JN2A 3UNKA 4X2KA 3SX9A 4BTKA 2VWIA 4QQCA 4U45A 1JVPP 1Q8TA 3GU4A 5DA3A 2G15A 3CP9A 3R9NA 4MWHA 2YIQA 2XRWA 3VS6A 5HG9A 3TZMA 5HG7A 5BVKA 1H28A 3O8PA 4F9BA 4H36A 4YHTA 5TF9A 4GFMA 3G2FA 1OL5A 4RBLA 3RINA 1NVRA 1IAHA 4J98A 3OROA 2JC6A 4DEBA 3FZTA 3HMOA 4IC7A 3OXTA 4O0RA 4YP8A 3TL8A 3W32A 3BHUA 3EFKA 3ANQA 3F66A 3L9LA 3RPRA 3RMFA 4RPVA 4CZUA 4F9AA 5JGAA 1CM8A 4QT1A 4O7SA 3F5GA 4FL2A 4HVIA 4AZTA 4I0SA 2WQEA 5IU2A 1ZMWA 2JKKA 4TYJA 4FTCA 4A4LA 4ERKA 3OBGA 2WAJA 4DFXE 1E1VA 3QYZA 3R1YA 2HY81 4XV9A 5FP5A 3U8WA 3ZYAA 4RC3A 4I6BA 4DEHA 4ARKA 5H8GA 4QMPA 4K33A 2PZPA 2ETMA 3KF4A 3PXKA 4MXAA 1GNGA 5CI7A 4YJOA 1PW2A 3A61A 3HP5A 3D9VA 4FC0A 4PV0A 2OJJA 1VZOA 3LM0A 4G3FA 4FOBA 4O2PA 3V5WA 5B2KA 4L45A 1PYXA 2OJIA 3OP5A 1NT2A 4XBUA 5K9IA 3FHRA 4CFMA 4AAAA 4PP9A 3VF9A 4JS8A 2PE0A 3K54A 4AW5A 4EH7A 4EQMA 3NCZA 2VWWA 4QMTA 3I6WA 1FVRA 4ALVA 4FT7A 3ZSIA 3FYKX 4YTIA 4NEUA 5IQEA 3A99A 3P79A 4IHPA 3TM0A 4Z16A 1U5RA 1XBBA 4ID7A 4WO5A 4P5QA 2V22A 2BDJA 2ACXA 3R22A 1R39A 5BQ0A 3AD5A 5HI2A 3DT1A 3D15A 2UUEA 4O0VA 4D4SA 4QMQA 2VO7A 2UVZA 3AOXA 4CMOA 4DGNA 4FVRA 4NW5A 4DEIA 3ATSA 4X3FC 4RX5A 2O8YA 4EBWA 4OTHA 4DTAA 4DHFA 2EXEA 3ZSHA 5HICA 3SW7A 3U4WA 5JRSA 3VF8A 2GNIA 2WKMA 4NJDA 1OVEA 4GIHA 3AC2A 5FWKK 1M52A 2XIRA 4QP9A 1URCA 4E7WA 4YMJA 2BILB 1KSWA 5J1VA 3ORMA 5M09A 1O6KA 4FIFA 4FZFB 4PTEA 1A06A 5FXSA 3FWQA 1E9HA 4GVAA 4O2ZA 5HG8A 1NY3A 1APME 3DQWA 4LUEA 3VBXA 3WE8A 4UEUA 3FKOA 3JXWA 4NKSA 4A9TA 5IA3A 4YJQA 3OC1A 3T3VA 1PXJA 2J0LA 4UMPA 3PSDA 1XR1A 4YHFA 3R83A 3UZPA 5IPJA 3MWUA 5DR6A 3FMJA 5BVOA 3QKKA 3V8SA 5HTIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3TXO A;  5KHW A;  3VWA A;  4I6H A;  3W2Q A;  5T68 A;  5CSV A;  4I5C A;  4YO6 A;  1AGW A;  4O7W A;  5AR4 A;  3PDT A;  3KVX A;  5BUJ A;  3KCK A;  5BYY A;  3GCS A;  2VTA A;  3CC6 A;  2HZN A;  2QLQ A;  2WMU A;  5HBE A;  4PQN A;  4DFB A;  4NW6 A;  5ANE A;  4O4F A;  4Y5H A;  3QAM E;  4ANN A;  2XKF A;  1KV1 A;  2C5Y A;  4F64 A;  1PXO A;  4ORK A;  3COH A;  4I3Z A;  4WNO A;  2XNE A;  4XG2 A;  3WE4 A;  3TKI A;  4EYJ A;  3WIL A;  2PVK A;  5GHV A;  1H00 A;  4IB0 A;  1WBN A;  4P90 A;  2R3F A;  2X7O A;  5IA4 A;  3VVH A;  3R8M A;  3NYN A;  5EG3 A;  2YAB A;  3PA5 A;  1GZK A;  1PF8 A;  2XIZ A;  4IX3 A;  3L9M A;  2NRY A;  3SQQ A;  4ZZO A;  1ZYD A;  3V5P A;  1K3A A;  4RLL A;  2J51 A;  4EON A;  1JAM A;  2C69 A;  1YI4 A;  1CKP A;  3DLS A;  4PWN A;  3O2M A;  4PTG A;  3PY0 A;  2IJM A;  2X81 A;  5KMK A;  3TV6 A;  1ERK A;  4QMW A;  3SV0 A;  3QU0 A;  2WO6 A;  4X2N A;  2G2H A;  1XJD A;  1I44 A;  3JYA A;  2JIU A;  4WHZ A;  1Z57 A;  2A0C X;  4FL1 A;  2UW8 A;  5J87 A;  3NUY A;  4FRF A;  3SG8 A;  4L00 A;  4HVS A;  3NMU F; 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