4RFMA

Itk kinase domain in complex with compound 1 n-{1-[(1,1-dioxo-1-thian-2-yl)(phenyl)methyl]-1h- pyrazol-4-yl}-5,5-difluoro-5a-methyl-1h,4h,4ah,5h,5ah,6h-cyclopropa[f]indazole-3-carboxamide
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
263
structure length
249
Chain Sequence
SVIDPSELTFVQEIGSGQFGLVHLGYWLNKDKVAIKTIREGAMSEEDFIEEAEVMMKLSHPKLVQLYGVCLEQAPICLVFEFMEHGCLSDYLRTQRGLFAAETLLGMCLDVCEGMAYLEEASVIHRDLAARNCLVGENQVIKVSDFGMTRFPVKWASPEVFSFSRYSSKSDVWSFGVLMWEVFSEGKIPYENRSNSEVVEDISTGFRLYKPRLASTHVYQIMNHCWKERPEDRPAFSRLLRQLAAIAAS
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/inhibitor
molecule keywords Tyrosine-protein kinase ITK/TSK
publication title Tetrahydroindazoles as Interleukin-2 Inducible T-Cell Kinase Inhibitors. Part II. Second-Generation Analogues with Enhanced Potency, Selectivity, and Pharmacodynamic Modulation in Vivo.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 249
sequence length 263
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2014-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4rfmA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4rfmA01
1M14A 2BROA 5HCZA 3ZFMA 5D12A 5CSWA 5AV3A 5HO7A 3BPRA 4EI4A 4DFXE 5I9XA 4V0GB 3E5AA 1URCA 1STCE 1TQMA 1ZWSA 3C50A 4XJ0A 3RMFA 1Q99A 3FI3A 3LJ2A 4ITHA 2W4KA 4J95A 4BKYA 4I6QA 4GKHA 1T45A 2W1EA 4FTRA 3BYVA 4GCJA 4K11A 4O0WA 5IEXA 1M7QA 3KMUA 4QYGA 3EFKA 1KE8A 2QO2A 3MBLA 2JLDA 3PVWA 3TZ9A 4EOQA 2Y4IC 4EQCA 2WZJA 1W0XC 4G6OA 3BEGA 2YACA 5C1QB 2JKKA 3GU8A 2W5AA 1UNHA 3UTOA 5DYJA 3GI3A 2GNIA 3V04A 3BV3A 2ZB0A 3DQXA 1URWA 1YOMA 3FY2A 3LFQA 3ORPA 3FEGA 3R7EA 4FSQA 3PXZA 5J1VA 3HV3A 4S34A 4CFXA 1Z5MA 4QP8A 5HTCA 3C4XA 3G90X 4FL1A 3GBZA 4NW5A 1KE6A 1OI9A 3PXFA 5DA3A 5CENA 4O91A 3SQQA 5HU9A 1W7HA 4IWOA 3FXZA 2PUUA 5M09A 4ANMA 4F99A 2BAJA 4TRLA 2NP8A 2WELA 5BVFA 4FA2A 2VTPA 3CCNA 4DFNA 2QVSE 4QMOA 4PQNA 3D83A 1JKSA 2J9MA 4JBOA 1YXXA 3TNQB 2UZNA 4AG8A 1YI3A 2E9PA 4HZSA 2P4IA 3LOKA 3POZA 3F7ZA 5EM7A 3E64A 3ZM9A 2X0GA 1JSUA 2YM5A 5AUXA 2WIHA 4E20A 5M56A 2OJ9A 5A4LA 2RSVA 2R3FA 3C0IA 5FQDC 2WMUA 4E3CA 2GU8A 3C0HA 3ZHPC 4D1SA 3DBEA 2F4JA 2ITQA 3CPBA 3VHKA 5CAVA 1IRKA 3A4OX 3OT3A 3QUDA 4UV0A 3VS1A 5HTBA 3AD6A 5FRIA 3KGAA 2G2IA 1OPKA 4TWNA 3QLFA 4F63A 2PPQA 3FMNA 4ZZNA 5A14A 4PDOA 2JKQA 2ZMDA 3PPJA 3G2FA 1OM1A 4PTCA 2QOCA 5CEMA 5HLPA 4EH9A 2BRBA 2ZV2A 3PZHA 4NWMA 4BI2A 2CGXA 3V5JA 4EORA 2UW5A 4FG9A 5D7VA 3LJ0A 2XJ2A 1KE7A 4U44A 4NSTA 4U5JA 3W18A 2YIYA 1OIYA 2EUFB 5JEBA 2XJ0A 5TO8A 3BYMA 3KMMA 1NVRA 3AMYA 4CSVA 4H1JA 4I0SA 4PMTA 2GHGA 2KTYA 5AMNA 4R7IA 5C4KA 5DR2A 3NUYA 4RVTA 2AYPA 4J8MA 5AP2A 5FTQA 2BHEA 3V5WA 2Q83A 1V0OA 4TYHB 1Y8YA 3ZEWA 3ZSHA 4FV6A 1Q61A 3P1AA 4N0SA 1MUOA 4R8QA 1OUKA 2Y6OA 3JPVA 4DGLC 3Q53A 1QMZA 3I0OA 2YLEA 4FV2A 5HEZA 3UE4A 3S0OA 1MRYA 3BU3A 4K18A 2YWPA 3MY0A 3NUSA 3G0FA 3WE4A 3ZO3A 3VS0A 5DNRA 5E8SA 3BX5A 4YZMA 1BMKA 2PVJA 2WO6A 3MVLA 2QU5A 4KBAA 2R2PA 4OW8A 1Z57A 2VNWA 1F5QA 2W1CA 3KXHA 4MEDA 1WZYA 3FLYA 4E4XA 2EXMA 3C4WA 2F7XE 2XB7A 4WNMA 4ZJVA 1P5EA 1W84A 2BKZA 5E8UA 4G6LA 5H8EA 4A9TA 4PF4A 2JAMA 4TNBA 2PYWA 2H96A 1YHWA 5BUIA 4EHVA 4U6RA 4E73A 3A7JA 4AOIA 2Z02A 4NUSA 4O7NA 2VWZA 3NUNA 5I9VA 2FVDA 2R3MA 3E8DA 5IG1A 3FHRA 2XK3A 4FT7A 4JJRA 3JXWA 3G5DA 1IAJA 5IQDA 3ZM4A 2WMAA 3UBDA 3ALOA 4Y95A 4D2VA 5E8VA 2XCKA 5CSPA 4O7LA 4AZWA 3BI6A 1F0QA 1ZYDA 2XNOA 1JKKA 3IW6A 1W98A 3R1YA 3UMXA 2FSMX 2R3GA 5M57A 5I3OA 4D1XA 1CM8A 4CV9A 3KKVA 3V01A 4CRLA 4GH2A 3ZZWA 4FIGA 4CKJA 5HNBA 4ZAUA 4OGRA 3Q60A 4U42A 3D14A 3ORKA 2UZEA 5J8IA 2GNHA 2UW7A 3PA4A 3LFFA 2PMIA 3BEAA 1XJDA 3SW7A 3GCPA 2X9EA 4RJ7A 4S2ZA 2C3IB 3HYHA 2R7BA 1H0WA 3KULA 4EHZA 5BYYA 2W7XA 4XG4A 5KZIA 4XS2A 5AUZA 5JRSA 2JFMA 4M97A 2YHVA 5CU0A 3C4FA 3KVWA 4J8NA 2C6DA 1AGWA 5D1JA 5IQFA 1WBTA 2GHMA 2IZUA 5KE0A 1FINA 4UMUA 3PXKA 1XQZA 5DE2A 4BTMA 4XRJA 5IUGA 2H8HA 3QA0A 1J7UA 3PUPA 4MH7A 3VS6A 3MB6A 4D4YA 4F0FA 4H39A 3NVMB 5CQWA 3MA3A 4CGAA 2Z8CA 4GU6A 4AFJA 2RG6A 4WG3A 1E1VA 2BVAA 5A4CA 3VS5A 1U46A 2XK9A 3A7HA 1VR2A 3MTLA 4TT7A 3Q4ZA 2Q0BA 3LLAA 1SMHA 5EW8A 5C8KA 2E2BA 4IAKA 4AA0A 2F49A 4DHFA 5K0XA 2HW7A 5GJDA 4GVAA 2VTMA 4IZYA 4BDEA 1V1KA 2PZIA 3AMAA 4GYGA 2YDKA 3KRRA 4ZZMA 4XHKB 3VUKA 3A8XA 3FMLA 4RA5A 4USEA 5DWRA 5EOBA 2QOOA 3Q6UA 2BTSA 4JVGA 3R28A 4NZWB 4IHPA 4AA4A 2QR8A 2YJRA 4RIXA 5CEOA 3SGCA 3EH9A 3D2KA 3KXNA 2BPMA 4RVMA 5FDXA 4RX5A 1YDRE 4M67A 3HMMA 5M4CA 4K77A 2YZAA 3D0EA 3EOCA 3TN8A 5IZFA 3DDPA 1PKDA 3ORZA 4L53A 4IM2A 3EHAA 3GU5A 1H01A 2W06A 2QO9A 4FIFA 3QFVA 3MVHA 3F6XA 4F7SA 3GENA 1JQHA 4OBOA 4BI0A 3EZRA 5HIEA 3EL7A 5DN3A 4ZMEA 1GJOA 4QMZA 5DRDA 1WBOA 2J0JA 3FLSA 4IZAA 5CF8A 4D55A 4M13A 3K3JA 5CVHA 4LUDA 5ACKA 4W4WA 4F6WA 4UN0C 4FL2A 2X1NA 2PL0A 5FGKA 2I40A 4TKSA 5DFPA 3OY1A 4GRBA 3EMGA 3QGWA 4YBJA 5HCYA 4RC4A 1KV1A 1GZNA 3OC1A 2CLQA 2OJIA 2VRXA 4FG8A 4QPMA 3RAWA 4YNEA 5HD4A 2OLCA 4H58A 5D11A 3QQLA 3Q4UA 1YOJA 4JX7A 4MNEA 3GCUA 3TV6A 4ZEGA 4QQCA 5HORA 4UX9A 3BYSA 3FV8A 5ACBC 1B38A 2NPQA 4EZ5A 4FVQA 3HGKA 3NNVA 5DLSA 5FXRA 2XIZA 3W1FA 2UVYA 4ZTSA 2C6TA 4Z7HA 5CZIA 4FI1A 4OTHA 4BIBA 1OGUA 3MVMA 1Z9XA 3U4WA 5L3AA 1XH8A 4LMUA 4QTAA 2QHNA 4ACGA 4BDAA 2YLFA 1S9JA 4XG7A 4YLJA 2VO7A 1NXKA 4BCHA 4CLJA 2G1TA 3O17A 4JI9A 3PTGA 4MKCA 2CDZA 3OCTA 2Z7RA 1H26A 3AXWA 3DQWA 4DEDA 3REPA 3R1NA 1ZYLA 3FSKA 4FT3A 3U6JA 2OF2A 2X8IA 2ZB1A 4YZCA 4D1ZA 4EC8A 4CKRA 1OIQA 4ZLYA 4XG2A 5ETCA 2Y6MA 2GNLA 4MK0A 2BRMA 4AGDA 1PW2A 5CI6A 5C9CA 4EH7A 1YXSA 4TL0A 4ORKA 3FZRA 5IA0A 4IDVA 4YO4A 4S30A 1H0VA 4DGMA 3V8WA 4XNEA 4YJRA 1J7IA 3NUXA 2Z7LA 4FNXA 3KL8A 3R6XA 4FTIA 4QPAA 3SV0A 2JGZA 4HOKA 5HCXA 1H1QA 4FSUA 5FEDA 3RM7A 5KMLA 1FVRA 4BICA 4ONAA 3B8RA 3QKLA 5J5TA 1A9UA 5BVNA 2CNUA 2PVLA 3G9LX 3RKBA 2PE1A 1IASA 1VEBA 3VW6A 4RWIA 4C2WA 4QP3A 4LL5A 4M68A 2WMVA 3LMGA 1UU3A 3AC3A 2PULA 2PVYA 4I5CA 3K5VA 4IX5A 4KKEA 1I09A 3QA8A 5EHLA 2GDOA 4YTHA 5AP6A 3NS9A 2FSLX 1ZOGA 3UYSA 3UO5A 2O64A 4M3QA 4D9UA 3S00A 3TCPA 3EN6A 2VTAA 3C5IA 4XUFA 2PK9A 4D2RA 4HGTA 4L3JA 2YJSA 3V6SA 2NRUA 3D5WA 4UYNA 3NIEA 4P7EA 4ZSAA 4FEWA 2NRYA 3NAXA 5E8TA 4DG2E 3MESA 4IC8A 1PRYA 4MTAA 3F2AA 2R3QA 5FEQA 2OFUA 3RZBA 4QTBA 2HWOA 4DGOA 3WI6A 1OB3A 3P08A 3R30A 3VW8A 3OF0A 2WNTA 3BE9A 4CMUA 2UZDA 2SRCA 5ITAA 3P5KA 3DK7A 4KKGA 2LGCA 5KMJA 4FKQA 2W99B 3EYHA 3B2WA 3FMKA 4CCBA 3FI4A 3DFAA 3QCQA 2CJMA 2V62A 3MW1A 3OUNB 4FIJA 5CEQA 3WOWA 4QMNA 4FV4A 3NCZA 5HGIA 4K0YA 3D5VA 4JXFA 3F3ZA 4U45A 5HIBA 3RCJA 2J90A 3IGOA 3ZFYA 4N4SA 1ZMWA 3M42A 2Q0NA 2J2IB 2Y7JA 3NUPA 3PVBA 3SOAA 5I9YA 4PMMA 3OT8A 4WA9A 4AE9A 5K4IA 4EKKA 3QQKA 4FMQA 4C02A 2FO0A 3KXGA 4BZDA 4C0TA 3IW8A 3PIXA 4QYEA 4CEGA 5J9YA 4HVHA 1KSWA 3UP2A 4UZHA 2XEYA 3RTPA 3DU8A 4HGEA 1OKWA 3TG1A 3DBCA 5BVEA 4W9XA 3UVQA 4CMTA 4S33A 3F3UA 3P7CA 4AX8A 4B8LA 3R9RA 2IG7A 4ACCA 1BL7A 2O5KA 4W4YA 2UZLA 3ZC5A 4NEUA 4BCPA 4F1MA 5AIKA 3JY0A 4E5BA 1VYWA 4PMPA 1DI8A 3MN3A 4FIIA 3HV5A 4G3EA 4MXYA 3H3CA 4A9YA 3UC3A 3Q9WA 2WTWA 5I9WA 2XM8A 3EZVA 3FLNC 5GJFA 4BYJA 3A60A 4IC7A 1SNUA 4LMNA 4TYJA 3TKUA 2WMRA 3VUGA 2E9UA 2IVTA 5JQ8A 2VWUA 2J5FA 2R3LA 2R9SA 4IB0A 1P4FA 4X3FA 3PA3A 4FR4A 4H3PA 5AAEA 4MQ2A 5EM6A 2G9XA 2G2HA 4K6ZA 4O7YA 2ACXA 4UWCA 1H07A 4ANOA 5CAPA 5DMZA 3NIZA 5AV0A 4CT1A 4JG6A 4OBPA 3UVPA 2ZOQA 4M14A 3P7AA 4ZY4A 3UQCA 3IW7A 3UGCA 1UWJA 2RFNA 4IBMA 3PVGA 5DT4A 3R9NA 4ACDA 3SRVB 1AQ1A 3FQEA 4Q5EA 4IX6A 4WUAA 4MNEB 2RFEA 3L8SA 2JBPA 2VO6A 3NYNA 3QC9A 3HA8A 2HZ0A 4WG4A 4EOPA 4EK6A 2G15A 3PFQA 4A07A 3R2BA 2RL5A 3L8VA 3ORIA 3LPBA 4S32A 1LEZA 2J7TA 2QU6A 1XH9A 5F20A 3TUBA 4CKIA 2ETRA 5I0BA 1NT2A 3VJNA 5HVYA 3C13A 4XH6A 4DGNA 3L8PA 2C6IA 3PXYA 4RZVA 1X8BA 2WMSA 1Y57A 5D9HA 4BCGA 3H30A 3GC0A 4HYIA 2W17A 3TZ8A 4L67A 3QTZA 4I5PA 3WF7A 5DPVA 3H4JA 4U8ZA 2BUJA 3FY0A 4KUJA 5J7HA 2O0UA 3OD6X 3OUKA 3RINA 3Q3BA 4BCIA 5DT0A 5CNNA 4IW0A 4D9TA 3RGFA 3BBWA 3FQHA 3MWUA 4PPAA 1OBDA 3JR1A 2HW6A 1J7LA 4ZSLA 3I0QA 4QP2A 2WMTA 1QPEA 3Q96A 4ENXA 3KXMA 3Q4TA 4F7NA 2ONLA 1Q8WA 4FKWA 5CEPA 3PWDA 4OTPA 2QLQA 4QQTA 5KMMA 3KB7A 4FZAB 5M08A 4QRCA 2YN8A 3PIYA 3GC7A 3BYOA 1FGIA 1PXNA 1DM2A 2W05A 4G9RA 4GYIA 2HWPA 3QAME 2R7IA 3ALNA 4KBCA 3HMIA 4WUNA 4YJVA 5ANIA 3UC4A 3LFAA 3Q5IA 3OS3A 2PUIA 3RP9A 3FQSA 4BCMA 3QQGA 1BL6A 2ZM3A 4GFGA 3JS2A 1WBWA 4USDA 4KAOA 3ZS5A 4OAVB 1BLXA 3AQVA 5GZ9A 3ZBFA 2XNMA 3KRXA 3LCOA 4FF8A 4QO9A 2V55A 4QP1A 3R1SA 5CU3A 5ANJA 5L8KA 3KEXA 1NVSA 1Q3WA 4ENYA 3I5NA 1XR1A 5HG8A 2I0YA 4IDTA 5EI8A 5TOZA 2F9GA 2WQOA 3DKCA 2OJFE 5BVKA 5EQYA 4HW7A 5A46A 1HOWA 2PHKA 3U9NA 4F9AA 4WSQA 4AGCA 3VUTA 3C5UA 3QHWA 4JNWA 2UUEA 4QP4A 5AR5A 4XP0A 3BRBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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