4RLI | Genus

Total Genus 129

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	129
sequence length	350
structure length	350
Chain Sequence	LQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPRARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
publication title	Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (DHODH) with DH03A048 rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	129
structure length	350
sequence length	350
ec nomenclature	ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date	2014-10-17

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4rliA00

4JIQA 3NQEA 3TX9A 1DKWA 3NQ6A 2E5BA 4D2JA 1YTDA 4Y6GA 2TRSA 2NLIA 4Z1DA 2WOQA 3OA3A 4HSOA 1F73A 3BW4A 1P1XA 3PC0A 3HPZA 1QPNA 1Q45A 3LHWA 4A2SA 4O52A 1W5MA 2WSQA 1LBMA 5LNSA 5CZTA 3L0NA 3EXSA 2LLEA 3DGRA 2FQIA 3L65A 3Q2DA 3A23A 2DZVA 4Q33A 4RJEA 1KTBA 3GR8A 4UCGA 4ORMA 4O1BA 4J9JA 2Y61A 2CWNA 3NVTA 5IM51 1OX5A 2ISVA 4ALDA 5HNRA 3MP5A 3PY2A 1XBYA 5CZJA 5BOOA 2J9XA 4K37A 4AF0A 4IOTA 4O11A 1OF6A 2X1TA 3WJYA 2R94A 1KM0A 3F4NA 4IPIA 2H8ZA 3PUDA 3HBLA 4CCDA 4IJBA 3FLUA 3MUXA 4QITA 2P0OA 1OYBA 1KFCA 1U83A 3E96A 1WAUA 4QQ3A 4WXYA 3C8FA 1YYAA 1C9DA 3O07A 3LOTA 2CLOA 2BX7A 4MKNA 1IXQA 4FXRA 3W7JA 3QC3A 3IRDA 1SFJA 3STCA 4B5NA 1ZAHA 5AHEA 3G8EA 3LRKA 2EGZA 1ONRA 2ZYFA 3BARA 3MBFA 1VYPX 1I45A 3SECA 5LGZA 1DHPA 1FX6A 3W7QA 2FTPA 1H7NA 4FO4A 1OFEA 5H2ZA 1QNVA 2FPTA 3LLDA 1OG0A 1FCUA 1JUEA 5DCDA 3PBUA 1EP3A 1SO6A 3UNDA 2VEPA 3GXNA 5HUOA 4POCA 4JYEA 4ZQOA 2X1RA 3K30A 4NNAA 4FX8A 4PEKA 3W7NA 4WQ6A 4DELA 4N4QA 2A6NA 4JXCA 2C14A 1HO1A 2JGQA 3C6CA 1K03A 2ZTKA 2C0AA 3LI1A 2FB3A 4O50A 1D3HA 4N9BA 3C0JA 3PG8A 1OX6A 3KFTA 1CX9A 3EX4A 3BV4A 2CLMA 4HNVA 3GDLA 3PSWA 4RXGA 4YXGA 4K6AA 3C4UA 4S2CA 4XKYA 2G97A 4MJZA 4Y8FA 4JYFA 4Q32A 1K7FA 4K8HA 4UC5A 1ICPA 1KM6A 1T99A 3B03A 3GVGA 1MZHA 4DXVA 4OV9A 1ZALA 1B4KA 3QJAA 4FF7A 4FX7A 1FWTA 1HG3A 1TPWA 3QMSA 1KTNA 3IGXA 1V5XA 1LBLA 2EHHA 2W0UA 5FF4A 1QOQA 3N3MA 2VENA 3UWVA 3BG9A 8TIMA 2ATMA 2QCLA 4ADSA 1LLWA 2VFDA 4RV8A 5E93A 1U5JA 1SW0A 5CGQA 3B06A 3LB0A 4IMGA 3V1PA 1GYNA 3QYQA 4IPJA 3L5MA 5DXYA 2YPIA 4U4MA 3BO9A 4K7VA 3W1PA 5I3GA 4MFEA 1H63A 1J4EA 5DCBA 4DO6A 3G3DA 3BW3A 3THQA 3RLVA 3FKKA 3UYCA 2DORA 3R8RA 2QJHA 2XFWA 3NGJA 3C2RA 2OZ0A 4QIUA 2NUYA 3DFTA 1OX4A 1C29A 1YLVA 4GUJA 4NVTA 1H50A 3W23A 3SSJA 3G1HA 3I65A 3EXTA 3N9SA 4O19A 3LHVA 1OFRA 1PE1A 1FCBA 1W3IA 4KWWA 4LNYA 4O1CA 3UWWA 3TW6A 4HN4A 2RKXA 3DAQA 3GIYA 4FNUA 4ADTA 1JJKA 3MP4A 3PM6A 1TSIA 5AC7A 4N9EA 4RR4A 3NQ2A 1YTKA 2B7NA 5LKYA 2Y6ZA 1TIMA 3O15A 1MEHA 1YXCA 2E6YA 4WY0B 5G2HA 4BR1A 2V2CA 3BG3A 3MI3A 4CCCA 1NEYA 3KAOA 2OT1A 1L9WA 5AHFA 4MYAA 1F74A 2QUUA 1X1OA 5K4ZA 1XUZA 3W87A 3VI2A 3KHJA 3KVKA 5K9DA 1SO3A 3LDVA 3EX2A 4H3DA 1JR1A 3DFSA 3LX9A 3QMTA 5FI8A 2DJXA 2VEKA 4ZVJA 1OFDA 5E0KA 3MHUA 3W2UA 1EPXA 5HJLA 5BMXA 1TMHA 3LCFA 3G8RA 4JTFA 2NWRA 1VZWA 4O8RA 4XWUA 2GVGA 2C19A 3C2VA 3LCGA 1TTPA 1DQXA 4OE7A 1OK4A 5D05A 1KV8A 3TV8A 3QPZA 2NUXA 3G1VA 3GKAA 3WJSA 1JQXA 5EL1A 5I3FA 2RDTA 1O4UA 3DI0A 2CFFA 2P10A 3S1VA 5EY5A 3P67A 2B0MA 1VCGA 4HHPA 1W31A 3C2EA 5LSMA 4P61A 5AHNA 3W86A 2Y7FA 1R2SA 3TW7A 3LLFA 1DBTA 2JBMA 5HUPA 4BK9A 5D09A 3W7DA 1WV2A 1GG0A 4LVFA 2VC6A 1PHWA 2C13A 3NQFA 3I7QA 3N14A 3VKJA 3W7OA 3L0KA 4UFLA 2C6QA 5KTLA 1G4SA 1M7OA 1AW5A 3DFOA 2R14A 1JUKA 3G22A 1ZCOA 1F5ZA 4I7VA 3EEGA 3E02A 3P74A 5C2XA 3CQ0A 2QCGA 3NL5A 1PHQA 1KM3A 5U4NA 4UMBA 5HULA 3TJLA 1FQ0A 2Q8ZA 3QM3A 1AG1O 3MJYA 1H61A 1D3GA 1G69A 2C3ZA 3QZEA 2W6RA 2DZUA 4A22A 4OV4A 2A7PA 3FJ6A 2HS8A 3RMJA 3ZWSA 5F2IA 4DEFA 4QISA 3B0PA 4O4VA 3SIZA 2TSYA 3GXPA 1EB3A 2DZTA 3S5NA 1TTQA 3DKLA 4FIQA 1PV8A 4CLMA 1O60A 1TYGA 2ZQ0A 3ABSA 4OT7A 3EXRA 3N73A 1ME8A 4LT9A 1W0MA 6ALDA 3NG3A 3M5ZA 3C3NA 3DI1A 1H62A 3HPSA 1T96A 1TV8A 5EA9A 2GJNA 4UTIA 3CB8A 3GR7A 3GNNA 3W9ZA 3NR0A 5G4WA 3G0UA 3T4CA 3NQDA 1ME9A 4QNEA 5D32A 1TPC1 5D04C 1O94A 4LC6A 2QF7A 3NQCA 2G95A 1NF7A 3L5LA 1WYIA 1YDVA 2QCCA 4NJIA 5CPNA 3MI6A 2OT0A 5LNUA 3HIJA 1UASA 3KRSA 5DN1A 4XTDA 2YCEA 3M47A 3L21A 1QCWA 3W85A 3LCWA 4JTLA 1VHCA 4RZ4A 2E1DA 1O5XA 3NQVA 3CM4A 1RZMA 1QPRA 5G5IA 4PODA 1YADA 4UTTA 1P5BA 2CLHA 1OFBA 3HGJA 4X3ZA 1W56A 2WPBA 1TV5A 1TCDA 1KA9F 4W9TA 4AHQA 2VKZG 4EIVA 3OHIA 1ZENA 2C16A 4O18A 4Z1BA 2QCDA 3TAKA 4UXDA 2WNZA 4LVAA 4ZQMA 3OBKA 5CPOA 1VC4A 4MIMA 1QO2A 3QEZA 3ZWTA 4GNJA 3M5VA 1J2WA 3PAJA 5KSWA 3OVQA 3TFXA 2Y62A 4YCPA 3GZ3A 3S1UA 1GVQA 3VE9A 2YXGA 4LU0A 1OABA 3GDRA 3NA8A 1GG1A 1WX0A 4S2BA 1ICSA 3TKFA 4EOUA 3W1QA 1JCXA 4EF8A 3P61A 4N6EA 3KXQA 4IXXA 4NNCA 4I7WA 1W37A 3WK3A 1OFOA 4E0CA 3L66A 1XM3A 5BMWA 3TSDA 2QJIA 1VYRA 2O7QA 3ATYA 1H51A 5HMSA 2JK2A 4I9AA 4PL2A 3GDMA 2VFGA 3TAOA 3T40A 4X2RA 1B4EA 1YDNA 2NX3A 3LI0A 1B3OA 3JS3A 2Y7EA 1KBIA 1XXXA 3R12A 1LDCA 2C1HA 3W7CA 3W84A 7TIMA 1N7KA 1L2UA 3C56A 3HOJA 4H4IA 3UWUA 1X8FA 3IIXA 1CW2A 3P60A 3OEXA 4IWWA 5F2LA 4L4LA 3B04A 1SSDA 3UWYA 3HJZA 4HNNA 1KFEA 3A5VA 1UB3A 5HWNA 4WX2A 4JGDA 3P84A 4WUIA 4DO5A 3O05A 1VH7A 3LM7A 1SSGA 1ZNNA 3CU2A 3W6YA 2A5HA 3AO0A 4KFPA 4RK8A 2B7QA 5J5DA 3M43A 5AHIA 1FWSA 4QAIA 5SWUA 4IMFA 3UWQA 1JVNA 1YTEA 3PBWA 4TMBA 1IIHA 3BK0A 2H6RA 2OJPA 3KRUA 1LOSA 2ZZ3A 2E5DA 3S0CA 1QO5A 3MI2A 5U7SA 1PL9A 1B9BA 4UTMA 1QPQA 4JICA 4ZMGA 1EUNA 2QUTA 2V82A 1JCLA 3TCEA 5CKSA 4QM1A 5IBXA 3INPA 2CU0A 4CQ8A 5K9CA 3SY5A 1I2OA 3TU9A 3UY8A 1FUYA 2ZRZA 2NV2A 4MY9A 4MVAA 1TTJA 4XQ6A 4UTTC 3TQVA 1JQVA 3TC7A 5KZMA 1FCVA 4Z08A 1R2RA 3FFSA 5D2TA 2GJLA 1P0NA 3I68A 3LGEA 4FIRA 3PS7A 2Q3RA 2VFHA 3DFNA 3HGOA 1XDMA 1MEWA 4UFMA 2YW4A 3WFAA 3M5XA 2VFFA 1RV8A 3QW3A 3TXVA 3D0CA 2CLLA 2BWGA 3O06A 5DXXA 2ABAA 1W3NA 2A1YA 3W1AA 5F4XA 4MZ8A 3W2KA 2HSAA 4FNPA 2DZSA 3W7HA 5EBUA 1A53A 3R13A 5EMUA 4MLRA 1S3HA 1PVNA 2A21A 3TC6A 1GEQA 3A24A 3GX9A 3HGSA 3DBPA 4ZZ9A 2CZDA 4LV4A 3DFQA 1TRDA 4ICNA 4M7SA 5KMYA 4HSNA 3TNOA 4UTUA 3W1RA 1Z41A 5LZLA 3G0XA 1T8XA 1R2TA 3NEVA 2Y70A 2NXHA 4OBTA 3ATZA 4JX5A 1K8YA 2I9EA 2CLKA 2QKFA 4M5PA 1K3UA 2H3DA 1VCFA 3TH6A 1F7BA 1LORA 2ZA3A 4LS2A 2NX9A 4E2BA 3KVMA 3L5AA 4YWIA 1HUVA 2QJGA 2C15A 4DBEA 4BI5A 2V81A 3LBCA 1W1ZA 2QAPA 4M6PA 4HNUA 4QNWA 1DORA 1EA0A 5HWJA 3JR2A 2D73A 3DXIA 4AF0B 3DU0A 1BTMA 2NUWA 2ZA2A 4AMAA 5DCEA 3DFPA 3MWAA 5EPDA 2ZRYA 1XFBA 4KFOA 2Y63A 3TMQA 2P1FA 1TPDA 4JN6A 5AHLA 1GVRA 2HMCA 2WNQA 3NPUA 4BWLC 3BLEA 1R30A 3ZS4A 5MHBA 4IMCA 2PE4A 2J6XA 1AL8A 1Q6LA 3HGRA 1EP2A 4NZFA 3CTLA 5FF2A 5KZEA 3MP3A 5DBUA 5FF3A 4O4WA 3L68A 3W7MA 3M6YA 2B7OA 4NXKA 4AEOA 4ZQCA 4WY0F 1LM1A 3PF3A 4YCOA 3TROA 4HPJA 4MY1A 4JX6A 1M7PA 4ZQRA 3T55A 4K36A 2ZZ6A 4JTIA 5IBXC 3TA6A 4MZ1A 2ZA1A 3TJXA 1ME7A 2FPYA 3O6YX 4UIOA 2YGYA 3NQGA 1LOQA 3O6CA 1N55A 3NXFA 4M6VA 3NPXA 4N6FA 3G1SA 1Y0EA 3BW2A 4DQWA 2B7PA 2CZ5A 2WNNA 2YFNA 3IV3A 5KITA 1MSSA 2GUUA 3F03K 5LHFA 3T44A 4IGHA 2NXIA 5J5RA 4QJ1A 4X22A 3NDOA 4O28A 4DPPA 4ORIA 4AXKA 4UTJA 3HG5A 4LRSA 4WJEA 3P8IA 1SZNA 3N34A 1AK5A 3PG9A 2QEZA 1MEIA 1JRCA 3HQ1A 1H1ZA 4XTIA 3O16A 3IIZA 5H91A 4XKYB 1R46A 5TQLA 4GUGA 1RPXA 3QW4B 4K8EA 2OMAA 1YXDA 2QDGA 4H6KA 1JCJA 2V5BA 3PBVA 4PFMA 5K2ZA 3GB6A 4RX0A 3O63A 1BWKA 3C2OA 3CEUA 1VRDA 4GWEA 1K8ZA 1BKSA 2FB2A 1UBSA 1PCKA 1QFEA 2ZRXA 2ZBTA 4UNKA 1WA3A 2FLIA 2O7SA 5D2VA 3SGZA 4JTSA 4LVDA 3EKZA 3UQNA 2A6LA 1XKYA 2OX1A 2AAMA 1H7OA 3DHDA 4MPQA 5HR6A 3USBA 4TX9A 1F76A 3HG3A 3PBYA 3W72A 1G6CA 2FPVA 3S1WA 2PRHA 2F84A 2PRMA 3FYPA 5FEPA 2PCQA 4O16A 1XDLA 5DLCA 3W7PA 2ZZ2A 2YR1A 3TIMA 1WQ5A 1TJPA 2ZZ1A 3PUOA 1JUBA 4FNQA 1VR6A 1NSJA 3NQ7A 5F1UA 3PWAA 2RDUA 4UTHA 1ZHAA 4K7YA 3S6DA 3B0VC 3W7RA 4FNRA 1PCWA 3R5EA 2YDAA 1OX4B 3GKFA 3NO5A 4GRSA 2ZCGA 3LTYA 3GAYA 4M6QA 4X9SA 1F05A 1M6JA 1W8SA 2Z1BA 1G4TA 3IVSA 1G7VA 1IXOA 1Q6RA 1Q6OA 3FIGA 3GDKA 1EIXA 5LNWA 1OYCA 3EWWA 4KWVA 2QCNA 3S5OA 5CSRA 3LHZA 1UJPA 1SZEA 2ISSA 4EF9A 1QPOA 4YL2A 5F2GA 1KM2A 1Q6QA 5I3HA 3UPBA 1G4EA 2VELA 1XBVA 2QDHA 2A0NA 3C2FA 1VGAA 3GXTA 5TIMA 3T78A 2WJZA 2ZRUA 1K8XA 4UUIA 2Z6IA 3MMTA 5DY3A 4LVGA 4JY9A 2H8XA 5FESA 3NM1A 4N02A 1UCWA 5G2WA 5L6UA 1RR2A 3SGUA 4JNMA 3O6DA 4N9CA 3LXAA 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3DH7A 1OYAA 4DF2A 1XC4A 3IVTA 4RZ6A 2X1SA 3G1YA 3LBMA 1TQJA 4L4MA 4TIMA 3W70A 4GBUA 3TR2A 3UD6A 3EX6A 2AGKA 3SZ8A 1TPEA 3G1DA 2GOUA 5HR7A 1TO3A 1GJPA 2I14A 4JTHA 5AFDA 1LZOA 3W07A 1KM5A 3UY7A 1I2QA 5I3IA 1DJQA 4UTLA 1NFBA 3N2XA 3W22A 2J27A 3CIWA 1FWNA 3DKJA 4GUHA 3RF9A 2CZFA 4O53A 2VFEA 5AN7A 4OU1A 4KFNA 3G1AA 4PA8A 1KFKA 1CI1A 3G1XA 2NZLA 3SW6A 2GVJA 4OGZA 2YFOA 4CNPA 2A7NA 3P7YA 1AMKA 4FXSA 3N2MA 1HFBA 3TMLA 4C1KA 1AW2A 3Q58A 3BPWA 4OWGA 4ZQPA 4TU1A 1NAL1 1Z44A 3A22A 1ICQA 1GVOA 1A5CA 2WSRA 4LTSA 1BWLA 4CQ9A 1SZGA 2G96A 4BWLA 3OVPA 1G67A 3E12A 4UFJA 4Q4KA 3B4UA 3SI9A 3CHVA 2J9YA 4JYDA 5BW6A 1UUMA 4HT3A 1F6PA 3PB2A 4DF0A 3NZRA 2R91A 4IQLA 3M0ZA 3W7LA 4JDYA 1NF0A 1LYXA 4TR9A 1S5TA 2XN0A 4K39A 2QAFA 1ZJIA 4ONVA 4A29A 1ML1A 1XUUA 3WJZA 4NJKA 4LW7A 3LRMA 1HL2A 3NYZA 2AQWA 1A5AA 2Y7GA 1OJXA 4O10A 1P0KA 4RKAA 1KM1A 2A85A 1H7PA 4JX4A 2UV8G 2BSLA 1JCYA 2I1OA 4PCFA 3QPYA 1F2JA 2ZZ5A 3L67A 3W2MA 3EWBX 3P80A 4WD0A 4N9DA 1GTEA 1GYLA 1A5SA 2YSWA 3UPWA 2QCHA 5KZDA 5LNVA 3ABOA 5C5YA 2DP3A 3G0SA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4RLIA

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