4RV8A

Co-crystal structure of the catalytic domain of the inosine monophosphate dehydrogenase from cryptosporidium parvum and the inhibitor p131
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
350
structure length
326
Chain Sequence
MGTKNIGKGLTFEDILLVPNYSEVLPREVSLETKLTKNVSLKIPLISSAMDTVTEHLMAVGMARLGGIGIIHKNMDMESQVNEVLKVKNSGGLRVGAAIGVNEIERAKLLVEAGVDVIVLDSAHGHSLNIIRTLKEIKSKMNIDVIVGNVVTEEATKELIENGADGIKVGIGPGSITTRIVAGVGVPQITAIEKCSSVASKFGIPIIADGGIRYSGDIGKALAVGASSVMIGSILAGTEESPGEKELIGDTVYKYYRGMGSVGAMKSKMVPEGIEGRVKYKGEMEGVVYQLVGGLRSCMGYLGSASIEELWKKSSYVEITTDVEIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
publication title Structure of Cryptosporidium IMP dehydrogenase bound to an inhibitor with in vivo antiparasitic activity.
pubmed doi rcsb
source organism Cryptosporidium parvum
total genus 112
structure length 326
sequence length 350
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2014-11-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4rv8A00
3LXBA 4S2BA 4WY0A 4M6PA 4W9TA 2ZZ1A 1VJIA 3NPUA 3OVRA 4GWEA 3RU6A 4BI5A 5HR7A 1TYGA 2H90A 3MHUA 4M5PA 1FWNA 1JCJA 1U5JA 3S1UA 3W1MA 3B0PA 5D02A 3I7RA 3SIZA 1RQHA 3P7YA 1XI3A 1XDMA 3TU9A 5LKYA 3OVQA 2H8XA 4O14A 3LBCA 1F7BA 2BLEA 1KFCA 3A5FA 5E0KA 2NXHA 1WAUA 4JYFA 1EPXA 1H60A 4O0KA 1KM3A 1TV8A 4O53A 4IXXA 4MUZA 4WY0B 5FEZA 4UTTA 1F2JA 5AHFA 3EWYA 2FIQA 1GJPA 2ZRWA 2Y85A 5EMUA 5KITA 4JY8A 2B4GA 1PHWA 7TIMA 4O19A 4DO4A 1G7VA 3MO7A 3EWZA 3W1LA 1TRIA 3MW7A 2QUTA 1TJRA 1AW1A 3UD6A 2ZRYA 1RZMA 2VEKA 3ATYA 3C6CA 1VYSX 3CU2A 4UIOA 3FIGA 3ABQA 1KM6A 4AHPA 2QUVA 3EKZA 4IMCA 1RVGA 3HIJA 2X2GA 3PY2A 1TO3A 2FB3A 2V81A 1WOAA 4O18A 2V8ZA 3VCRA 3TQKA 3LCWA 2XN0A 3HO8A 4UTUA 3TAKA 6ALDA 1KM2A 3BW3A 1SW3A 4QIUA 3H55A 3SFKA 1WBHA 4EOUA 4NUWA 3DFSA 4O8RA 1K7FA 4LVFA 1XL9A 2Y88A 3R5EA 4ZQMA 3TJLA 4KFNA 4JICA 1IF2A 5KMYA 3W2UA 5K9XA 1YDVA 1P0KA 5LNWA 2HMCA 3W7DA 3W83A 2TYSA 3USBA 1GG1A 4HKPA 1NSJA 3QRHA 2QCCA 4M19A 5I3JA 4D2JA 3BLEA 4DF2A 5CSSA 3NO5A 4C1LA 3HF3A 4ZQNA 2E5DA 4GC4A 4UC5A 1TSIA 3Q2DA 1EX5A 3QFEA 1I4NA 2BSLA 4ADSA 3IGXA 1QO2A 3EX3A 1DV7A 1VS1A 4AXKA 2CWNA 2ZRXA 3ELFA 4O15A 5D32A 4CCDA 1TPH1 3H54A 2ZTKA 4H4IA 1I2NA 2EKCA 4GJ1A 2VFFA 1ML1A 4RKAA 5A8GA 4IMEA 2ISVA 3G0UA 5BMXA 3EWXA 3CLMA 3O6YX 1TIMA 5HJLA 2C16A 4FB7A 2A21A 3MP4A 3FKRA 2Z1BA 3SZ8A 3C2FA 1VPXA 4RZ6A 2W79A 1QOQA 1LROA 2WSQA 3GK0A 2E09A 4MY9A 3TH6A 3NM3A 5LGZA 1XKYA 3NQDA 1TCDA 3CEUA 1G67A 3CTLA 1LBLA 5DCDA 3F4NA 5F4XA 4WQ6A 3QF0A 1TPVA 2Y61A 2WNQA 1LCOA 1JQXA 2ABBA 3B4UA 3W7IA 3C52A 4O17A 3KHJA 3RMJA 3NL5A 3QMRA 2Q8ZA 4KKXA 3HGRA 4NX5A 4IGHA 1DQXA 2R94A 3LTPA 3NPWA 3NDOA 2UV8G 3O6DA 4O12A 2J24A 1VLWA 8TIMA 1WDWA 1GOXA 5G4EA 2QDGA 2TPSA 1XUZA 2Z2UA 5LHFA 3HGJA 3DHFA 3M44A 1SQ7A 5EPDA 1QPQA 1RQEA 3G22A 4XTIA 3W22A 3EEGA 2JGQA 2ZFAA 2OMAA 3DFTA 4P61A 5DLCA 1AMKA 2Z6IA 1HG3A 3QEZA 3WK1A 3NXFA 1WQ5A 2CZDA 3C2VA 2ZZ7A 3M7WA 3W86A 4TO8A 2A6NA 1TV5A 3L65A 5EKYA 3I65A 1KW1A 4RXFA 3RLVA 4Y96A 4TX9A 4C1KA 1W5NA 4K7VA 3NM1A 1EP1A 4OHQA 4LOCA 3G0SA 2TSYA 3VE7A 5F2GA 5C55A 3E02A 4NNAA 3L2IA 2VFHA 3WJSA 3W9ZA 3GIYA 1G4EA 1MEHA 1UB3A 3CIWA 1WV2A 1GZGA 1H50A 4OV4A 2A7PA 4JDBA 3B0VC 1O60A 2V9DA 3NL3A 1W37A 5KZMA 4ML9A 3S5NA 1W54A 5FEPA 4JN6A 3L21A 3JS3A 3S1VA 4LY8A 4IPIA 3LV5A 1H63A 5D2TA 3UXAA 4A2RA 3PB0A 3P62A 3HMJG 3R2GA 1ZENA 2QAFA 3AO0A 4K7YA 2ZQ0A 1JVNA 2JKAA 4JD4A 4HNTA 3M41A 4MY8A 4Q32A 2W0UA 4FXRA 4RK8A 1QO5A 5F4WA 1FBAA 2DZUA 4HNUA 4FIQA 3LTSA 2GVLA 4UTLA 5LGXA 4MJZA 4LUJA 3TAOA 4XTDA 1I2RA 1PE1A 1T0OA 3DKJA 1H7WA 2FLIA 3BG5A 1XBXA 1EB3A 4RX0A 2FQIA 5FF7A 4X9SA 2WJZA 3C56A 4FXSA 4BFAA 3UNDA 1BWLA 3BO9A 1AL8A 4LVDA 5AHNA 1W5PA 2NUXA 1G4PA 2VOMA 4PEKA 4AF0B 3QMTA 3LXCA 1VHNA 1B4KA 3W7QA 1NF7A 1TQJA 2R91A 1ME8A 2PURA 1SO5A 3C3NA 3MMTA 3W7LA 4A22A 2C1HA 4ZVJA 3CWOX 3NVTA 3MBDA 1FWTA 1FDYA 2YX0A 4A2SA 1A5CA 1LORA 4RLIA 4DELA 1PCWA 5CZSA 3A5VA 1OJXA 3NQFA 4MOZA 3S6DA 3LGEA 1VH7A 2A5HA 3NNTA 1LOQA 3GDMA 4E0CA 4NJHA 3G1AA 4Y6GA 3S1WA 3O06A 2WKJA 2PRLA 1RV8A 1DKWA 5EY5A 5K9DA 4FO4A 2E5BA 1S5TA 3GNDA 3RNDA 4AMAA 5AC7A 1R46A 3QSTA 5KZDA 2G96A 1W0MA 4K39A 2YCEA 4MYAA 1CW2A 4HPJA 1LYXA 2Y7DA 1G7UA 3IIOA 3DFNA 3BGJA 5IBXA 3QQ1A 1T8XA 1GVOA 5E1QA 2QKFA 4GE8A 4WXYA 4NU7A 2BZNA 1W5QA 3GNNA 3LCIA 3GR7A 4LRSA 3SGUA 3NPXA 4POCA 4U4MA 4LW7A 3UY8A 3UWZA 2EPHA 4I9AA 4HT3A 3W7NA 1A5BA 2NV1A 4CCCA 4CQ9A 1NF0A 1GYNA 4M6QA 2I1OA 2X16A 3G1XA 3P81A 3TK7A 4E2BA 1QR7A 1N7KA 4UFMA 2Y62A 5AOUA 2HSAA 1DJNA 2WNNA 4DQWA 4JTKA 2FPYA 3DI0A 4JX5A 5C2XA 4O0ZA 4FNRA 5HINA 3LCLA 2ZZ5A 5AC8A 1P1XA 3LLFA 3O8AA 2NX1A 1OFDA 1KBJA 3O63A 1EWDA 3L0NA 1FX6A 4QITA 1AL7A 3QMSA 5FEXA 4DBDA 1FWRA 1LZOA 2YZRA 1I2OA 5D38A 5F2LA 1O94A 2NUWA 2X1TA 3N19B 5E93A 4N4PA 5D04C 1EUAA 1GTEA 1MXSA 1TRDA 1ONRA 5HMSA 1QOPA 1JCXA 1LTDA 4EF8A 3S5ZA 3BGGA 1GG0A 3GKAA 4JIQA 3TSMA 1ICPA 1SZGA 1BEUA 2OT1A 3IIXA 3PG9A 3NZ1A 3N2MA 1S5VA 3LRMA 2V0TA 3GYEA 5F2IA 1XBZA 3W75A 2DJXA 1M7PA 2G5WA 5H91A 4A21A 1SSGA 1TREA 5MHBA 1YPIA 1KFJA 2ZRZA 3SW6A 3UPWA 5HR6A 3ABOA 2QJIA 3MI6A 1L6WA 3LRKA 4GBUA 2ZDRA 2B0MA 1QPOA 3KAOA 3I7SA 3L0KA 2E6FA 3QW3A 5I3KA 4YXGA 2CU0A 3TKFA 1ZAJA 3CT7A 4N9BA 4GRSA 4MZ8A 1T99A 1ZAIA 2G97A 1KV8A 2E5CA 1LRTA 2NWSA 4K8EA 2DZXA 1TPDA 3G24A 3G1HA 1AW5A 3EX1A 3NGJA 4K8HA 4WOZA 2Q3OA 3C61A 2RH9A 5U4NA 3SJ3A 2V2CA 4WZHA 4JTGA 1DVJA 4H6KA 1PCKA 3LHYA 4PL1A 3LHZA 3UZ5A 3ZWTA 4O1AA 3M5ZA 3SSJA 3B06A 5K2ZA 2FFCA 3MP5A 3R13A 4O50A 3EX6A 1OX4B 4M7TA 2Y7EA 3TSBA 4B5NA 1VYRA 2B7PA 2NUYA 1YXCA 4O10A 4YCPA 4NNBA 3CPRA 2YGYA 5FF4A 2AQWA 3M5VA 2QCDB 3RFAA 3PBWA 1Z48A 2WNZA 5LZLA 1H7RA 1T96A 2OX1A 1SZNA 1FUYA 2J9ZA 4O11A 2NX9A 4HPXA 2VFEA 5J5RA 1VGAA 3NG3A 3DH7A 1YXDA 3UPBA 3R89A 3W23A 1F6KA 1SZEA 1GVSA 1K8YA 2YYTA 3BW2A 4KWVA 3BARA 3C8FA 5LNVA 3GDLA 3UWVA 3A21A 1X1OA 2YPIA 4N9CA 5G1YA 2R8WA 2B7OA 4MZYA 1FXPA 1TV7A 4WX2A 3W1UA 4M6VA 1VQTA 3NR0A 3B0UX 3NPVA 1K03A 3MI3A 4NJKA 1MSSA 2Q8LA 1VLIA 1TPC1 3NQVA 4JDYA 3TW7A 2C15A 3O1NA 4GUJA 3DI1A 3TCEA 4YCOA 1IGSA 2X1RA 2NXIA 3PAJA 3IVSA 4JEQA 4Z1AA 4UFKA 1OFRA 1SPQA 2TRSA 3W1PA 1SW7A 2EGZA 4RZ5A 1DOSA 3LHVA 2WSYA 1N8FA 3EKLA 3VE9A 3PUDA 2E68A 4HSNA 4DPQA 3W2MA 3UWUA 3TV8A 2EAWA 4ZZ9A 4Z1CA 3LDVA 4DEFA 5L9FA 4JYEA 4Y90A 5K7JA 5I3GA 2QR6A 2EHHA 1TTQA 1EEPA 2VKZG 1ALDA 3LI0A 4MY1A 4PA8A 3ZFHA 3HPSA 4OT7A 5L6UA 4OBTA 3OA3A 1OF8A 3PBVA 4LC6A 5KINA 4CQAA 3JRKA 5HULA 2ZCGA 1IXQA 3L5LA 3HG4A 4UR8A 1HFBA 4I7UA 1FY6A 4ADUA 2Z6JA 1I45A 2A7RA 5D03A 3GB6A 1G4TA 3S0CA 1OFAA 4WXZA 4O28A 3TA6A 5BOOA 1YLVA 4J9JA 5KZEA 3LX9A 4YWIA 3EX4A 1BTMA 4BF9A 5G2HA 1W56A 2O7SA 3P61A 3HGOA 3KVKA 4MJMA 3NQCA 1CX9A 2VFIA 1XXXA 4M7SA 5AHIA 4NVTA 3IEBA 2ZA1A 1A50A 3N2XA 1ZCOA 2NZLA 3W7MA 3STCA 1ZY9A 1Q6RA 3NA8A 3M5YA 4UMCA 3MYOA 2GJNA 3NZRA 4TMBA 3TDFA 2WQPA 5CG7A 2WO5A 3DXIA 3INPA 1M6JA 2QUUA 3CWNA 4QISA 2V2HA 4RR4A 3GAKA 1H1ZA 3GKFA 4P2VA 3TQVA 3LHTA 5HWNA 3LOTA 4PFMA 2TMDA 3C0JA 4LV9A 1DORA 1OF6A 3HG3A 1W5MA 3WJZA 4IPJA 4RV8A 4PCFA 3ZS4A 3C2EA 3LM7A 1GTHA 5D30A 1EUNA 4JGDA 5LNSA 4IMFA 4Q4KA 5BRBA 1AW2A 4DXVA 4NQ1A 2C0AA 2ZRUA 1D3HA 4UUIA 4RZ4A 2RDTA 3GZ3A 2A7NA 2FPTA 1SSDA 3M16A 1L9WA 3WK0A 3W7KA 1IXPA 2CLHA 3L9CA 3SECA 2DZSA 1ZAHA 3QPYA 4FX7A 4LT9A 2XFWA 5DCEA 4RJEA 3MI2A 2QJHA 4FNPA 3TJXA 1QPRA 1O5KA 1NFBA 4QM1A 2RDUA 4JTSA 1SFJA 4ZQPA 2HS6A 3N14A 4JYDA 2CZ5A 4QAIA 4JY9A 3KFTA 3NQ7A 4UFLA 3W1AA 3VKJA 1TPUA 4O4VA 3W2JA 3IRDA 1ICQA 3G0XA 3E12A 3PULA 5SWUA 1JCYA 3UWQA 1ADOA 2J27A 4UTHA 4JTLA 1JCLA 1TPB1 3E96A 3KOFA 1QDSA 3P67A 3DGRA 3A23A 1N55A 4O1CA 2GOUA 3LBMA 3G1YA 5C6MA 1AK5A 4JTUA 1S5WA 4UNKA 3PVFA 3TIMA 3O16A 4HNVA 4ADTA 2H3BA 3TSDA 2GQAA 5G4WA 4KWWA 3N9RA 3W7GA 3DBPA 4PTNA 2V5LA 2QCFA 3LCHA 4Y9AA 4HNNA 3W72A 5DN1A 1YTDA 2NLIA 2GQ9A 1PIIA 4FF7A 2VC6A 4K37A 3LXAA 2PRMA 4HHPA 4Z1DA 1MZHA 4GUGA 1KFKA 3PM6A 1X1ZA 3U6WA 1VR6A 5DXXA 4UMAA 4MFEA 3GDRA 1F05A 4L4MA 3RLUA 1EIXA 3DKLA 3E9AA 1IXOA 1R30A 5DXYA 1KM4A 1GVRA 2CLKA 3GVGA 1OK6A 5LNUA 4R7JA 4QNEA 4XKYA 5AYZA 4JX4A 2YDAA 1VC4A 2XN1A 4MLJA 3R8RA 3IGSA 4CNNA 1DHPA 3G3DA 4HN4A 3W2LA 4FIRA 1KV5A 4XBSA 5FF0A 3WJYA 1O5XA 2JGYA 1KLYA 4UTTC 6TIMA 4UXDA 1VHCA 3LCFA 1KTBA 2GVGA 3BVJA 4AHQA 4LVBA 4AEOA 1KLZA 1LRNA 2PRHA 1YTEA 1Q6OA 1DL3A 4BI6A 3L66A 2QDHA 3LHUA 4IUOA 1JCNA 4AWTA 1U83A 4H3DA 5EA9A 2YW3A 3GR8A 3W88A 3MYPA 1QAPA 2QCNA 4LVAA 1XM3A 3CEPA 1ZHAA 1SZFA 2CZFA 4MKNA 2Y63A 2B7QA 4YLWA 5ABTA 4BWLA 1DJQA 5C5YA 2QCGA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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