4RWTA

Structure of actin-lmod complex
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
369
structure length
369
Chain Sequence
ALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIREDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAKSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-5C
publication title Mechanisms of leiomodin 2-mediated regulation of actin filament in muscle cells.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 107
structure length 369
sequence length 369
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-12-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4rwtA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4rwtA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4rwtA03
3KZBA 1V4TA 4BRIA 2P9IB 2WUSA 4QS9A 2A5XA 3WEEB 3UKRA 4CZMA 5AQFA 2PAVA 3D7EO 5LJWA 3O4WA 1V4SA 2Q97A 3CJBA 3QDKA 4FWSA 5FPNA 2QWMA 1X9JA 4BRKA 5BRDA 5E26A 4IJAA 2ZGZA 3CHWA 3ZETB 2P9LB 1DEJA 4A2BA 4BRFA 3UKUB 5AQTA 2EWSA 1GLFO 2YHYA 3WT0A 1X3NA 4CZGA 5AFUH 2F9WA 4LC9B 3CJCA 1GLBG 2BTFA 3D2FB 1TUUA 2DPNA 4H0VB 2NLXA 4IXCA 2I7NA 4M7YA 4CZHA 2V7YA 3GL1A 3H1VX 5F0XA 3CQYA 3FZLA 4CJ7A 3AAQA 4CI6A 5BRHA 4FWNA 4A61A 5AQGA 2P9PB 4BR9A 4DB3A 1NLVA 4EFHA 1NGCA 1BDGA 2E2NA 1Y64A 5AZIB 4DQ8A 4AM7A 5JLFA 2HF3A 2P9KA 1NWKA 3GE1A 2E1YA 4JHDA 3ZEUA 1YXQA 4BG9A 3VGKA 3OHRA 4Z94A 3P4IA 3L4IA 4WQ4A 3QFPA 3SJHA 4ISGA 4NO7A 1R59O 3GBTA 3QB0A 1WOQA 2VWBA 3GDQA 4BRHA 1T44A 3O1BA 3ULEB 4FWOA 3VF6A 4CZJA 5ADXH 4XH1A 3VEWA 5AQIA 2E20A 4RTFD 3WXJA 3GG4A 5AQZA 3DXMB 3FZKA 4GNIA 1RDWX 2P9NB 3A5OC 2GWKA 3VEVA 1GLAG 1MDUB 1HUXA 3VGLA 4K25A 4BG8A 4BRMA 3VOVA 3AAPA 5EVZA 4M7XA 1IG8A 4HTLA 3O8MA 5E84A 3WXKA 2E2QA 3VEOA 4BRAA 3C7NB 2P9UA 3D2EA 1IJJA 1HX1A 3QBXA 3W3DA 4A62A 1TYQA 3HI0A 4H5WA 3H6EA 3J8AA 3DXKB 3R8EA 5AQVA 3TU5A 2CGKA 3RSEA 1HKBA 2GWJA 1NGBA 3LDQA 1ZBSA 5AQNA 3VETA 5LY3A 3HSCA 2FF6A 3AARA 3ENHA 1XQSC 4CZKA 2W40A 3UE5A 5AQWA 2E1ZA 4JAXA 5BPLA 1JCGA 5ELZA 4FOEA 3SK3A 4FPBA 3A5MC 3VERA 3WUHA 1J6ZA 4KBOA 3BF1A 4F9OA 1ATSA 4FWPA 5B8HA 1YVNA 1E4FT 1X3MA 3CJ1A 4K43A 2E88A 3F9MA 4I6MA 4PL8A 4MLHA 2QXLA 1KAXA 2FSKA 2QWRA 2QWPA 4K42A 2Q36A 3VF2A 3A5LC 4JNEA 4BRCA 1KAYA 2YI1A 3KHYA 5AQKA 3DAWA 5BPMA 3ATVA 1ZXOA 4BRQA 1BU6O 5JLHA 1K8KA 3IUCA 3M6GA 5AR0A 4B9QA 3CETA 1WUAA 2A6AA 4B1YB 4CZIA 4HWIA 1H1VA 3ENOA 2FSNA 4XH4A 5KQ8A 2Q0RA 1GLJO 3FR0A 1JCEA 3H3NO 4IZ9A 2KHOA 3JS6A 5AFUA 5BN9A 2GUPA 1ESVA 1SZ2A 2ZWHA 4FSVA 3MK6A 4DCHA 3FZMA 3CJAA 2HOEA 4BC5A 1ZC6A 2NRHA 5JMVA 1BA0A 3FFKB 3B8AX 2IVOA 2FSJA 3BP8A 3FZFA 5AQPA 4B1WB 2ASPA 4BRNA 1NMDA 3HBTA 5AZJA 4H5RA 3EKSA 3H1QA 3CJ9A 1G99A 4IWVA 2A40A 3MDQA 3U9DA 1HJOA 5KPTA 3H46O 4AM6A 5AQSA 1GLEG 2YCHA 5AQMA 2E8AA 3FE1A 2YHWA 4O8KA 4EAHD 1QZ6A 1DGKN 4FPAA 4PKGA 3HZ6A 1XC3A 4BVOA 2P9SA 3DJCA 3HTVA 2F9TA 4FO0A 4QS8A 5ADXA 1Z6RA 4NB4A 2YHXA 1NM1A 2IVPA 3A8YA 3FLCO 1P8ZA 3A5NC 4C23A 4EHUA 4L3QA 3U8XA 3LDNA 5BPNA 1BOTO 2HF4A 2V52B 4BC2A 2VYPA 5FPDA 2UYTA 2P9IA 5EOYA 4YDUA 4E1JA 1NBWA 3WEEA 2FXUA 4H0PA 2ASOA 3CERA 1GLDG 2OANA 3U9ZA 4GY2B 3KVGA 4FWQA 4CZLA 3QBWA 4M63C 2P9LA 3ZETA 4DHYA 4EIAA 2FF3B 3MN5A 4CBXA 4BGBA 3UKUA 4CD1A 4XEIA 2Q1NA 2VCPA 3L6QA 2W41A 3CJ7A 2NZTA 3M3ZA 1LOTB 5JICA 1Q18A 1QZ5A 4BRGA 1GLCG 1NGHA 2P9KB 3SMPA 3D2FA 4JHDB 3MMVA 3EZWA 3S41A 3ZEUB 3FZHA 2V7ZA 3LL3A 4WQ5A 5BREA 1MA9B 2QWLA 1U2VB 3IMXA 4H0TB 1HPMA 3QMLA 3CQXA 4BRLA 3BUZB 3EO3A 2P9PA 5EX5A 2H3GX 1ATNA 1HLUA 2FLOA 2A42A 3BEXA 5AZIA 4EHTA 4H0YB 4MO4A 4RWTA 1BUPA 5AQHA 3LM9A 5EXWA 1NGFA 2QW9A 1SAZA 3JXUA 3IDHA 3SMSA 3VEZA 4JD2B 3UB5A 3CI5A 4K41A 1T6DA 2V51B 1CZAN 3LDPA 2IVNA 4H0OA 5AQLA 3EL2A 5AQOA 3C0BA 3O08A 1JCFA 3ULEA 5F1XA 3O80A 3QICA 2AP1A 3SLCA 3VGMA 5KQDA 2D4WA 2P9UB 3D2EB 5AQUA 4CZEA 3BF3A 1NGIA 1OKJA 4H5NA 1QHAA 5BR9A 1GLLO 1TYQB 4ISFA 3DXMA 2D0PA 2P9NA 3A0IX 3AY9A 3RSEB 4H03B 1NGJA 2GTDA 5AQRA 3O1WA 4CBUA 1YUWA 1YAGA 4WQ4C 1BWFO 4FWRA 5TKYA 3FGUA 1QQNA 5KPZA 1D4XA 4BRDA 5LJVA 1XUPO 2GEMA 3C7NA 4BR4A 2BUPA 3VENA 3VEXA 4B1ZA 1KAZA 2CGJA 4BGAA 3WQUA 4BQLA 3ID8A 1Z05A 3DXKA 1HKGA 1SQKA 3I33A 4FWLA 2CH6A 1E4GT 3LM2A 4BR2A 2A41A 3G25A 5BRFA 4WYBA 1U6ZA 3ZX0A 3I8BA 3EN9A 4I6MB 3TPQA 3VESA 5KPRA 4H5VA 4BC4A 2ITMA 3R9PA 3DWLA 3UKRB 4B1XB 5FPEA 4YDUC 4XH5A 1ATRA 3EKUA 4FL9A 4IO8A 2E2OA 1C0GA 3CIPA 1LCUA 4PKHA 2YJFA 1RFQA 5FPMA 4CZFA 1NGDA 3MN7A 3W0LA 1U2VA 3LDLA 3MCPA 4O5FA 2AA4A 2Q2RA 4B1UB 2I7PA 3MN9A 1K8KB 1NGAA 4H5TA 4BREA 4A2AA 5AQQA 1BG3A 3R6MA 3L0QA 3VF4A 4BR7A 1MWKA 2E2PA 2ZF5O 4QS7A 4MO5A 2A3ZA 2ASMA 4FWKA 3O5BA 3VPZA 1S3XA 2HMPA 4BC3A 4JD2A 3MN6A 3ATUA 1TUYA 4WQ5C 1S22A 5AQYA 3WXIA 2QWNA 3HM8A 3H45C 2ZGYA 3WQTA 3H3OB 1BO5O 4BQZA 3VEYA 2CH5A 4PKIA 2D1KA 1HKCA 3ZX2A 4CBWA 3WXLA 4RCHA 5AQXA 4ISEA 4J8FA 1QQMA 2J4RA 5AZJB 3LDOA 5F2RA 1RGIA 1NGGA 1QQOA 3IFRA 3QFUA 5CE3A 4PL7A 1MWMA 5AQJA 1T6CA 4FOIA 4FWMA 1C0FA 2CGLA 3U4LA 5I9EB 4BRPA 4BVPA 4H0XB 1EQYA 2Q31A 3ZX3A 2IIRA 3GOIA 4MLEA 4B1VA 4BROA 1KXPA 4BR0A 1BA1A 2QWOA 2P9SB 2PBDA 2QM1A 2D0OA 1DKGD 2YJEA 3O6WA 4Y0WA 4JN4A 2QWQA 4CD3A 1NGEA 4BR5A 5EY4A 5BN8A 2GELA 2Q0UA 4IJNA 3M1FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1S9GA 1OVYA 2WUSA 3HVRA 1E3MA 1TKXA 1VSEA 4KHPK 2D0AA 5LJWA 5KRTA 3NH1A 1V4SA 2Q97A 3CJBA 1P90A 3CCVN 1NKBA 2P9LB 3RMCA 1DTTA 3K9JA 3HSTB 2QEXN 3MEEA 3DMJA 4EZ6A 1BIZA 4A2BA 3WNGA 4PHTX 3CD6N 1W7AA 3IRXA 2ZJRL 4W5QA 4HUEA 3HP6A 2F9WA 2Z1GA 4LC9B 1VQ9N 2DPNA 4H0VB 2I7NA 3H1VX 5LMUK 5K14A 4PUOA 3AAQA 5BRHA 4J2DA 4CJQA 4MQ3A 4DB3A 2OPSA 4EFHA 1QQCA 1YJNN 1BDGA 4E7IA 2E2NA 3OYGA 1Y64A 5JLFA 2LSNA 2P9KA 3D6RA 3GE1A 3SUNA 2YX6A 3ZEUA 3M8SA 3ALYA 2KTQA 4I2QA 3S9HA 4U67L 4KREA 4QAGA 3SJHA 4WQ4A 3SV4A 3OYJA 4NO7A 4M3XA 2HW3A 2VWBA 1NMNA 1Q7YO 3HL8A 4JKCA 4FWOA 1D5AA 5FRMA 4XH1A 4JK9A 4C1NK 4FZZA 1BIUA 3VQ7A 4JEPA 3LAKA 3LPUA 1KSPA 2ATQA 1GOCA 2P9NB 2OZSA 1GLAG 3VGLA 4K25A 5KI6A 4CIFA 3M5RA 4M7XA 1IG8A 4BDPA 4Z4CA 4M3UA 2YKNA 4EZ9A 4BRAA 2P9UA 1IJJA 4FJ7A 1NK4A 3QBXA 3MAQA 2GV9A 1HYZA 5C12A 3T69A 3QIOA 3TU5A 4DLGA 1EX4A 3SPZA 4W5RA 4CEAA 1RDUA 2FF6A 4NCBA 4DQQA 1QE1A 4KV8A 3O4QA 1YITN 2G8IA 2W40A 5AQWA 4JAXA 1TAUA 3SUPA 4LF6K 3VERA 4DU3A 4F9OA 4M3YA 1ATSA 1C1AA 4FWPA 4YOTA 1TL1A 4CEDA 4C8LA 1E4FT 3OY9A 3S5TA 4OPAA 3ZT1A 3FFIA 1HRHA 3F9MA 4GKJK 4IEEA 2QXLA 4CHQA 2QWPA 3CMAN 1Q9XA 3VF2A 2BANA 3E66A 3QNOA 1KAYA 4AHCA 3L8BA 3VQ5A 2A1RA 5JVGL 1RTHA 4JKGA 3HRGA 1ZXOA 5HP1A 4KH6A 3CC4N 3CPEA 5AR0A 2P5GA 4IBNA 1ZYQA 4HWIA 4FLZA 1NJWA 1X1PA 4IDKA 1NJYA 3ENOA 2O8CB 2FBTA 3V4IA 1GLJO 1JCEA 2O8FB 5BN9A 3PY8A 3O9TA 4YOUA 4DTRA 4DCHA 3FZMA 2HOEA 3AVLA 1KFDA 5JMVA 1BA0A 3FFKB 3B8AX 2FSJA 2OCEA 5AQPA 4FYDA 2ASPA 4BRNA 2GX9A 4FZXC 3HBTA 4CGFA 3ZT0A 3RRHA 3SQ0A 3TTFA 1L3VA 1LAWA 3KWIA 2WFBA 2Z1HA 4IWVA 2OZMA 5HRNA 3U9DA 5KPTA 1VSFA 4FLXA 4AM6A 4LF7K 1XWLA 1JL1A 5AQMA 2E8AA 3FE1A 4O8KA 3TAEA 4FLTA 4IOXA 4KAZA 2GBZA 3HZ6A 1XC3A 1VSHA 4BVOA 4Y1CA 5ADXA 2YHXA 3OS0A 1ZBHA 3AVBA 4C23A 3A5NC 4TSXA 4L3QA 3U8XA 3I0SA 3P31A 1BOTO 1N5YA 5E41A 2HHXA 1M90O 4E1JA 1FW6A 2HHWA 1W97L 1K8AO 2WONA 4O5BA 3OJSA 2IGIA 1TV6A 3U6FA 2R7YA 2DTUA 4CGGA 4EIAA 3O9UA 3AVIA 3I56N 3CCEN 4CD1A 2VCPA 2W41A 3CJ7A 1LOTB 5JICA 1QZ5A 3AVNA 4R5PA 2P9KB 1CLQA 4FXDA 4IO9L 3MMVA 4DSFA 3ZEUB 3T3FA 1U2VB 3IMXA 4AHSA 3S3MA 4JI4K 3EO3A 5EX5A 4BE1A 3ZYYX 2FLOA 1VQMN 3F73A 3BEXA 5AZIA 4EHTA 1UA1A 4H0YB 4YOXA 1NGFA 3C6UA 3KD1E 4LFCK 3SMSA 3NF6A 4K41A 3QEWA 3ASMA 4CVNE 4ILGB 4E3SA 1MU2A 3DLHA 4F2RA 3DLGA 1JLGA 3ULEA 2OTJN 4CJ4A 3F9KA 4GV9A 1WSHA 2D4WA 2P9UB 1OKJA 1QVFM 1Y97A 2D0PA 3C6HA 3A0IX 1S1TA 1KTQA 1T3VA 3ID6A 3V9SA 4CBUA 1YUWA 1YAGA 4WQ4C 4XIUA 3PIOL 4FJIA 3NGYA 1QQNA 5J2MA 3LP3A 5KPZA 4ID5A 4FJNA 5FDLA 3CYGA 1IKYA 3LPTA 4E89A 3VENA 1KAZA 3QESA 3QIPA 4YFUA 3ZSXA 1Z05A 1HKGA 4GV3A 5SZTA 2CH6A 3M8QA 1J9AA 4BR2A 3K2PA 3THWA 1U6ZA 4H5VA 2W6LA 3NFAA 4B1XB 3EKUA 4FL9A 1C0GA 1HYSA 1J5EK 4CZFA 4B9UA 3L2VA 3W0LA 1KC8O 1KFSA 1VSJA 1VQ7N 4WFBL 4A59A 4H5TA 1NGAA 4A2AA 5AQQA 1F21A 3R6MA 4E0DA 3OS2A 2E2PA 2ZF5O 4OGCA 4QS7A 1HNVA 2DFHA 4MO5A 2A3ZA 1J5OA 2ASMA 5T7BA 1HR0K 3O5BA 3DLRA 4BC3A 2VG5A 4OPKA 4JD2A 1VQLN 4G9ZA 1VSIA 4WQ5C 3NCIA 2QWNA 4DF4A 1KVBA 2ZGYA 1S1WA 3F2KA 3O9QA 1NJZA 4DF8A 1JXBA 5C25A 3HT3A 2VWJA 4BE2A 4CJUA 3TI0A 2D1KA 3VQPA 3QEPA 3NGZA 3AVKA 4CK1A 2KKZA 2J4RA 3DLKA 1RGIA 5CE3A 5GADP 4AH9A 3IS9A 4X62K 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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