4S2CA

Covalent complex of e. coli transaldolase talb with fructose-6-phosphate
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
316
structure length
316
Chain Sequence
TDKLTSLRQYTTVVADTGDIAAMKLYQPQDATTNPSLILNAAQIPEYRKLIDDAVAWAKQQSNDRAQQIVDATDKLAVNIGLEILKLVPGRISTQVDARLSYDTEASIAKAKRLIKLYNDAGISNDRILIKLASTWQGIRAAEQLEKEGINCNLTLLFSFAQARACAEAGVFLISPFVGRILDWYKANTDKKEYAPAEDPGVVSVSEIYQYYKEHGYETVVMGASFRNIGEILELAGCDRLTIAPTLLKELAESEGAIERKLSYTGEVKARPARITESEFLWQHNQDPMAVDKLAEGIRKFAIDQEKLEKMIGDLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Transaldolase B
publication title Novel mode of inhibition by D-tagatose 6-phosphate through a Heyns rearrangement in the active site of transaldolase B variants.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli k-12
total genus 135
structure length 316
sequence length 316
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.2.1.2: Transaldolase.
pdb deposition date 2015-01-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00923 TAL_FSA Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4s2cA00
2CFFA 4IGHA 2RDTA 3LBMA 4N9EA 4UR7A 2C18A 3DFOA 4ZMGA 2R14A 3CLMA 3S1UA 5HWMA 1OF6A 2ZA1A 4K8EA 3UPWA 3LTPA 2NX9A 4FXRA 1W5OA 1B4EA 3QC3A 3W22A 3QYQA 1H60A 2J9XA 2OCZA 1XKYA 4GUIA 3VE7A 3OEXA 3EKLA 2E5CA 4JY8A 3H54A 3ATZA 3FKRA 1WOAA 1TSIA 4FNSA 3HGSA 3DHFA 3DKLA 3V1PA 2CLKA 5SWUA 2QUTA 2HMCA 1OFPA 2QCEA 3VKJA 3LXCA 4WJEA 1UASA 3TJXA 3PS7A 1AW1A 3TFXA 3L21A 3IIZA 1VRDA 2ZTJA 2QDHA 2C16A 3NA8A 3DH7A 2ABAA 2JGYA 4HN4A 2X1RA 3KAOA 1HO1A 2Y89A 4UMCA 3LCFA 3GX9A 1TJRA 3HMJG 3CWOX 1G4EA 3A24A 1KM2A 1WBHA 1TB3A 2QCMA 4R53A 3ZR4A 3A22A 3N14A 4YWIA 3WK2A 4HPXA 4AHPA 2DZUA 3NQGA 1YTKA 2V2HA 2OX1A 4IMFA 5HULA 1RQHA 3NO5A 3I68A 2A85A 2VEPA 3L5AA 3MHGA 5CZJA 1C8VA 1SO5A 2CLFA 1H7WA 1NAL1 3DAQA 3W2UA 4O53A 4FHAA 3DENA 1OX4A 1OFAA 4YL2A 4DF0A 1JCNA 3L66A 4OBTA 4IMCA 5LNVA 4JTLA 4M6VA 4MVAA 2V0TA 5HWNA 3LX9A 3NDOA 1TV7A 3DFPA 3QF0A 1OYBA 1KFBA 4QM1A 2P1FA 1AL7A 3GDKA 4JTEA 4N4QA 4WY0B 3STCA 3O1NA 2WKJA 2ZZ3A 2E6AA 1L2UA 1VYPX 1OFOA 3LLDA 3KX6A 1A50A 3PSVA 3CEPA 3HGJA 1MEWA 1WBJA 3D0CA 4ONVA 5G4WA 3RFAA 3MP4A 5LSMA 3OA3A 4MLRA 1SZEA 3GDTA 5EL1A 2QKFA 1G7VA 4BI5A 1LOQA 1PE1A 1TRIA 5LGZA 1DQWA 4GFSA 4UTTC 1Z42A 3TNOA 4E0CA 4N9DA 1YLVA 3P62A 5D2VA 3W1QA 1VYSX 3TQKA 1X1OA 5D04C 1ZAIA 2GQ9A 1H7RA 1ZAJA 4EF9A 3O8AA 4LVGA 5LNWA 1W37A 4AXKA 3F03K 3S0CA 3UY8A 1LBLA 4Z1CA 4GC4A 4NJIA 1DOSA 3LGEA 2QCDA 4Z0JA 3MYPA 1W5PA 2NLIA 4HSOA 3JRKA 2ZRVA 3W2KA 1DVJA 2P10A 4I7WA 1Z44A 4AAJA 1SPQA 2DZWA 3INPA 3I6RA 3L0NA 3MUXA 5E93A 3S1XA 5CPOA 4GUFA 3GZ3A 2P0OA 5G2WA 2J6XA 4KFOA 5AHIA 1LP6A 3ANYA 3SSJA 4FX6M 4UR8A 3NPVA 4K38A 2QF7A 4ADTA 1VS1A 4NX5A 3W7LA 3UWWA 4GWEA 3MYOA 2KZHA 3ABOA 3U8GA 3DFTA 3AJXA 4WXYA 2TYSA 1H62A 5D37A 2NXHA 4M6QA 3E49A 4O1CA 3FLUA 3NG3A 3M0ZA 2NXIA 2VXNA 3NGJA 3JR2A 5D2XA 3A21A 3O07A 3W86A 5DY3A 5G4EA 3CPRA 3M5YA 1LORA 3O06A 4LC8A 1F74A 1J5TA 2CLLA 3SIZA 3HIJA 3O15A 4OU1A 2R91A 2YFOA 1OG0A 1BKSA 1QWGA 1OFBA 1KLYA 4WY0F 1GOXA 4UFIA 3MHFA 3NNTA 4Z1BA 2YW3A 3E0IA 3G1YA 4LW7A 3UPBA 2HTMA 1VR6A 3STEA 2H8XA 1FWWA 3B04A 1OX4B 2Y85A 5HMSA 2WPBA 2ZZ4A 5LZLA 4OHQA 5D2WA 3C6CA 2Q3OA 1SUXA 4O15A 4HKPA 3W88A 2DJLA 1ME9A 1LOLA 4EOUA 1IXQA 4UTJA 1V5XA 1H7OA 3Q37A 1H7PA 1WQ5A 4JN6A 3TMLA 1K7FA 3TU9A 4IOTA 3T7VA 1ZY9A 2Z6JA 4LY8A 3TAOA 4DQWA 3LOTA 4POCA 2A7RA 3EXTA 1FDYA 4XKYA 4PA8A 2A1YA 3KXQA 3W76A 1AW5A 3EX2A 1PHQA 1GVOA 2C19A 4FNPA 4LS0A 4K37A 3FIGA 4BI6A 1H63A 3W72A 3T55A 4QIUA 2QCCA 5CPMA 6TIMA 4OWGA 2OMAA 1FDZA 2J24A 3NAVA 5HINA 3NM3A 2VFFA 4DELA 3GR8A 2FLIA 1R2RA 2CU0A 1LCOA 3ZWTA 2B0MA 1KTBA 4MZYA 3G0UA 2QCLA 1SR9A 2EPHA 4IJBA 2QCDB 2YGYA 1ME8A 3TQVA 4JIPA 4WX2A 3QMRA 3UZ5A 1MEIA 5FESA 4LOCA 4K7YA 1I2RA 5K2ZA 2HSAA 3CQ0A 1LLWA 4JX5A 2JBMA 5C55A 2NZLA 5DXYA 2J9ZA 4KWVA 1Y0EA 1GVSA 4ZQPA 2OZ0A 4A2RA 1OVDA 4A29A 2E09A 2Q8ZA 4NXKA 5L6UA 3HO8A 3KHJA 1K3UA 4LV4A 4RZ6A 3PSWA 1LM1A 5F4SA 2Q8LA 3HPXA 4WQ6A 1F73A 3NQFA 5DCBA 3R13A 2Z1BA 1EIXA 2ZFAA 4EF8A 3THQA 4ADUA 4BR1A 4Z1AA 1JULA 6ALDA 3BGJA 4IQLA 3QW4B 3FJ6A 1GEQA 1C9DA 3FEMA 1KFCA 2QJIA 2JKAA 2XN1A 4QISA 4K36A 1OFQA 1F6KA 1WOBA 3B0PA 1F76A 3BW2A 3LRKA 3TFCA 4IWWA 4JTKA 4BFAA 3SI9A 4LVFA 4RZ5A 4XTIA 1HL2A 4JTTA 3TKFA 3M43A 4JNMA 1TPB1 2ABBA 2CLIA 3MP5A 4Z08A 1BWKA 5F1UA 1W56A 4DXVA 3LLFA 2XN0A 3FFSA 3SGZA 1NF0A 5D02A 3W87A 3C52A 3P61A 4LU0A 4UUIA 1Q6QA 3S9YA 3ZFHA 1QCWA 4N4PA 3HG5A 2W6RA 1G4TA 5AHNA 5CKSA 3W07A 4GNJA 4N6FA 1FXQA 3TAKA 1T96A 1KM3A 1KFLA 5AYYA 3W1NA 3E02A 3W1UA 1SFLA 3M5VA 4C1LA 3GNDA 4UFMA 2PRLA 3PB0A 4ZL1A 4IMGA 3U2OA 4MY9A 4XKYB 3G1AA 5K9CA 2QUVA 3OVQA 2E5DA 3DFSA 3L0KA 5EY5A 5KZMA 4FX7A 4QNWA 1Q45A 5FF7A 3SW6A 3OIXA 5CPNA 5F2GA 3MP3A 4UTIA 3QSTA 1P1XA 4S2BA 1XXXA 4L4MA 3G18A 5LHEA 2J27A 1QPQA 3R5EA 2PRMA 2X1TA 1JRCA 1JCLA 5DN1A 1TRDA 5KITA 1X7FA 1JJKA 1VLWA 4MLJA 4UNLA 1KTCA 3M7WA 4AF0B 1O95A 1LLZA 4JD4A 1TPVA 3CTLA 4O52A 3LHZA 1P0NA 5G1TA 3ABQA 3TC6A 4NQ1A 4L4LA 4Y8FA 5HR7A 1XL9A 2GPTA 1FDJA 3R12A 1M5WA 2WO5A 3EXRA 4YXGA 3C0JA 1EUNA 2E68A 5I3KA 1SZNA 3F4NA 3RMJA 1A5BA 1NVMA 2QJGA 3SGUA 3WJZA 4O14A 3G8EA 4FEZA 1H1YA 2E6YA 3ELFA 5F2IA 1Q6RA 3SR7A 5IBXA 2G97A 1GVQA 1VJIA 4NZJA 3ABSA 2G96A 3P84A 4NNAA 1S3HA 4TMBA 3O6DA 3TMQA 3MBFA 5FI8A 4K7VA 4UTWA 4HNNA 2V9DA 4O11A 2BLEA 4XTDA 3MBDA 3P74A 1DORA 1UB3A 2ALDA 4TIMA 3GDRA 3L0GA 3BO9A 5TBOA 3CIXA 1FQ0A 4R33A 3LBCA 5KTLA 1Z41A 2PE4A 4ZZ9A 4UNKA 4AVFA 4S2CA 1WYIA 4RV8A 4CNPA 1RD5A 1PL9A 1I4NA 2Y70A 3KRUA 4JYDA 3DFQA 3WK0A 4FF7A 4MJZA 3M44A 1A5CA 1B57A 3GXNA 2C13A 2RDUA 1M6JA 4D2JA 3E9AA 3C2RA 5DBTA 4XWUA 2A6NA 2GOUA 2TSYA 3SECA 3W6YA 2VEIA 3M6YA 2V5LA 2CLHA 4FNRA 3C56A 1XCFA 1TPFA 4LC6A 2CZDA 2HS8A 4O1DA 3A23A 2VFDA 1RZMA 4RZ4A 2GQAA 3LB0A 1A5SA 3G3MA 3NVTA 4JTGA 3NQVA 5AHFA 1JQVA 3T44A 3TX9A 4U4MA 3W3OA 2ZRXA 3K30A 1XBXA 1YDNA 3PUEA 2GVGA 3PWAA 3G1SA 1GPWA 3BW3A 4JGDA 2QUUA 5AFDA 3EWXA 3BV4A 2NXGA 4RXFA 3IIOA 3LDVA 4Y6GA 1FWRA 3A9IA 4MJMA 1CX9A 2WSQA 3MI6A 5CZSA 3NQ7A 3W7EA 1QOQA 3C2FA 2YYUA 2X1UA 1GZGA 3KOFA 4HSNA 3UD6A 4NJGA 4ALDA 3I65A 1YXCA 4EVZA 4Z1DA 4CQ8A 1NSJA 3JS3A 4O1AA 1JUEA 2ZA2A 3DHDA 3TROA 5TIMA 1N8FA 1L6YA 1GQNA 2FQIA 3B8DA 4FX8A 1OYAA 3NQ6A 3BW4A 4OGZA 1MXSA 4XBSA 4YCPA 3L9CA 4WD0A 4IXXA 4Y96A 1HUVA 5C2XA 4IPJA 4O28A 3Q2DA 3ZWSA 4NT0A 1X6UA 1AK5A 1BWLA 2FTPA 4O50A 2B7NA 3T4CA 3W1RA 5K7JA 4N9BA 2C6QA 4MIMA 5D38A 4FIRA 4NJHA 4XUGA 1H51A 3GXTA 1TTQA 1G4SA 3IIPA 1KA9F 1I45A 3W7HA 1D9EA 3N73A 1U5JA 5K9XA 3DFNA 3VI2A 2CW6A 2C0AA 2WOQA 2HS6A 1B3OA 4Q32A 4FNUA 4LUJA 3NQ2A 3GVGA 4JTUA 5H2ZA 3MO7A 3IVTA 7TIMA 3ATYA 3GNNA 3LRLA 1DJNA 5D2TA 3NR0A 4AWUA 4BK9A 2VC6A 4ADSA 5LNSA 3LCIA 4NJKA 1TPWA 5I3HA 2WSRA 3NL5A 5KINA 2DZXA 1O5XA 1ZENA 5D2YA 1W3TA 1FCUA 1EWEA 3GXPA 1TO3A 2B7OA 3P8IA 5AN7A 2ZYFA 1I2OA 1G6CA 3TV8A 3M41A 5E1QA 3EB2A 4AWTA 2CZEA 2ZQ0A 3EKZA 4UTLA 1OX6A 1IIGA 2WNZA 2VELA 3O63A 2GQ8A 4HHPA 5LNRA 4LWWA 1O5KA 1K03A 1SQ7A 4BF9A 3USBA 3EX1A 4DPQA 2RH9A 5G2HA 2A7PA 2QCHA 3NL3A 3TCEA 5EA9A 1OFDA 4I7UA 2DZTA 3UNDA 3S1WA 4E2DA 3W7IA 1DL3A 3GIYA 3M1ZA 1V7YA 3LHYA 4PTNA 4AB4A 2ZRYA 1TPUA 2E6FA 1W8SA 4WOQA 4QJ1A 4LVAA 5CZ0A 4RCXA 1TREA 3MI3A 3O05A 3TXZA 4Y9AA 2QDGA 1FWNA 5A5WA 3M9YA 3TE9A 2AGKA 5FF2A 5I3GA 5BRBA 5FEPA 3S5YA 1VCFA 2CLMA 4HPJA 1W5NA 2QJHA 4TMCA 1R30A 5FF0A 1AG1O 1KBJA 1QAPA 4O13A 3OVPA 5AYXA 4CQAA 4OE7A 3GAKA 3DU0A 5I3IA 1B9BA 1JCJA 4ZQRA 2A6LA 4LS2A 5I3JA 1IF2A 4MPQA 3S5ZA 2A7NA 2YCEA 4LV9A 3IGXA 2BSLA 2ZZ1A 3PBWA 1AW2A 5F4WA 3UWUA 8TIMA 3GK0A 1T99A 4KWWA 1YXYA 3FJLA 1F5ZA 3PF3A 4JR5A 4MZ8A 5F1VA 3QZEA 1ZNNA 5CZTA 5KMYA 1EA0A 3KRSA 5DCDA 4NX0A 1XM3A 3W7KA 3BK0A 3VCRA 3W1AA 1GVFA 4TX9A 3EWUA 1KTNA 3RLUA 4QSHA 3B4UA 3G1DA 2JKPA 2FPYA 3PUDA 3S42A 2TRSA 3DZ1A 3HPZA 3GYEA 3A5FA 3LCLA 3QQ1A 3CWNA 1K7EA 1ICPA 3M47A 2C14A 3W1LA 3LXAA 4O16A 4DF1A 1RQBA 3BLFA 4IUOA 1W31A 3L5LA 4NU7A 3B03A 3N9SA 4N6EA 4MFDA 4IMDA 1SZGA 3LHVA 1UBSA 2RDWA 1OF8A 1TV5A 1VPXA 3RK8A 2EHHA 1VQTA 1VZWA 1SSDA 1KFEA 3PBUA 1ZCOA 1RPXA 3NQ8A 4KKXA 3BPWA 5D05A 2RFGA 4M19A 4OV9A 3E96A 3HF3A 1MSSA 3S5NA 3KVLA 2ZZ7A 1FUYA 1PS9A 1W54A 1TYGA 1UJPA 4BI7A 4UMAA 2V2CA 2ZRUA 1H5YA 1H7XA 3KVKA 2R94A 3W7PA 3W7GA 4LUIA 1X8FA 2OJPA 2TPSA 1L6WA 2C15A 3C3NA 1S5WA 2B4GA 3RU6A 3W2NA 5K4ZA 3LV5A 1PVNA 3G0XA 2W79A 1P0KA 1HTIA 4N02A 3PULA 3SZ8A 4OQVA 2CLOA 2JKEA 2J88A 2Z6IA 1UUMA 3LCXA 1HO4A 1DKWA 4M7SA 5BOOA 2V5BA 1ICSA 3F4WA 4M5PA 5DY2A 3W83A 3QW3A 3MJYA 2XN2A 3P5YA 3LTYA 3WJWA 1SO3A 4M6PA 1FBAA 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 3TDF A;  5BNK A;  4E2B A;  1QML A;  4O19 A;  2EGZ A;  3I7S A;  4HIB A;  2BTM A;  5K4X A;  1XDM A;  2ISS A;  5DEL A;  4AMA A;  3GDM A;  5TQL A;  3TXV A;  2ISW A;  1AMK A;  3QH2 A;  2VEK A;  1N7K A;  3CIW A;  3B05 A;  1KM4 A;  1VLI A;  2QR6 A;  3HGO A;  5EKY A;  1NEY A;  1WV2 A;  2JGQ A;  3TSM A;  3HQ1 A;  4JIC A;  3PB2 A;  3PVF A;  1GG1 A;  1G69 A;  2YFN A;  4CCC A;  3EEG A;  3I7Q A;  2QAP A;  3QMS A;  2FB3 A;  3NL2 A;  1VHC A;  1RQE A;  4O0K A;  1SW3 A;  1W5Q A;  2AQW A;  4TO8 A;  1W0M A;  3PG8 A;  1Q6L A;  2NX3 A;  3LXB A;  2H3D A;  3W7C A;  4YCO A;  4WY0 A;  2QCF A;  4J9J A;  1BTM A;  1R2T A;  5G5I A;  5FF3 A;  5C6M A;  2WSY A;  5HR6 A;  5DCE A;  1OAB A;  4X2R A;  3MHU A;  1B4K A;  4JS3 A;  3E12 A;  2I9E A;  5AC7 A;  4JTS A;  3N3M A;  4QAI A;  4ZVJ A;  3G3D A;  5AHL A;  2VKZ G;  3FOK A;  1K02 A;  5C54 A;  3W7Q A;  1LRO A;  4IXH A;  3L68 A;  4OV4 A;  4K39 A;  1HFB A;  3EWZ A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2CFF A;  3F4V A;  2GOK A;  4IGH A;  2HVN A;  2PDL A;  3OA5 A;  4N9E A;  3UVI A;  2EG7 A;  4ZMG A;  3CLM A;  2R1L A;  4C7D A;  4D8A A;  1R38 A;  5CCZ A;  1H60 A;  3N25 A;  3DGB A;  1D2K A;  3L23 A;  3VE7 A;  1XJB A;  1UD6 A;  3OEX A;  3ABZ A;  1KB3 A;  3AWO A;  2E5C A;  3BTN A;  4B5S A;  3ATZ A;  1JG9 A;  3WEL A;  4KER A;  4FNS A;  3HGS A;  1FHU A;  4JFS A;  3KCO A;  2QUT A;  5BYW A;  1I9C B;  3KEH A;  3PS7 A;  3L21 A;  3BMW A;  2QDH A;  4G1N A;  3WDP P;  1O6I A;  3AWN A;  3VIJ A;  1W32 A;  3LCF A;  1KM2 A;  1TB3 A;  2AL2 A;  4R53 A;  3ZR4 A;  1ECE A;  1RY0 A;  4YWI A;  3WK2 A;  4HPX A;  4NY2 A;  5A3H A;  3O0K A;  4TV5 A;  3EB3 A;  3I68 A;  2A85 A;  1U1J A;  5A2C A;  5CZJ A;  1SO5 A;  2CLF A;  4PTM A;  1NAL 1;  3DAQ A;  4L4P A;  4GIR A;  4JQA A;  1E1C A;  1E3X A;  3O7U A;  3DEN A;  1OFA A;  4YL2 A;  1P0B A;  1TV4 A;  4JTL A;  4CEX C;  3S2M A;  1P7T B;  3WFZ A;  1GJU A;  1XLC A;  3UPM A;  5HWN A;  3LX9 A;  1TV7 A;  3WD3 A;  3V0U A;  5D9M A;  3LBO A;  1KFB A;  5LA0 A;  2D3N A;  1GOK A;  1DE5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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