The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
92
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sequence length |
378
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structure length |
374
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Chain Sequence |
KLADCQERDPALSELYLVEGDSAGGSAKQGRNRKNQAILPLKGKILNVYDKMLSSQEVATLITALGCGIGRDEYNPDKLRYHSIIIMTDADVDGSHIRTLLLTFFYRQMPEIVERGHVYIAQPPLYKVKKGKQEQYIKDDEAMDQYQISIALDGATLHTNASAPALAGEALEKLVSEYNATQKMINRMERRYPKAMLKELIYQPTLTEADLSDEQTVTRWVNALVSELNDKEQHGSQWKFDVHTNAEQNLFEPIVRVRTHGVDTDYPLDHEFITGGEYRRICTLGEKLRGLLEEDAFIERGERRQPVASFEQALDWLVKESRRGLSIQRYKGLGEMNPEQLWETTMDPESRRMLRVTVKDAIAADQLFTTLMGD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Isomerase/isomerase inhibitor
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| molecule keywords |
DNA gyrase subunit A
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| publication title |
Direct control of type IIA topoisomerase activity by a chromosomally encoded regulatory protein.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Escherichia coli
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| total genus |
92
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| structure length |
374
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| sequence length |
378
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| chains with identical sequence |
D, F, H
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| ec nomenclature |
ec
5.99.1.3: Transferred entry: 5.6.2.3. |
| pdb deposition date | 2014-05-31 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globin-like | ||
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3NUH B; 4TMA B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1Y01 B; 1LFZ A; 4FBJ B; 1CQ2 A; 3EOK A; 1MLG A; 3ZXV A; 3CY5 B; 2BT6 A; 1R1Y A; 2XKI A; 4AE1 A; 2G12 A; 3GS2 A; 1O1J A; 4FWY A; 3D4X A; 3DBJ B; 2NTS A; 3B1L X; 4A8Y A; 1OFF A; 1XT9 B; 3GZN I; 4BOS C; 3O2C A; 3NY5 A; 3QZX A; 1OGW A; 4DHZ E; 1EWY C; 4RGO S; 5AQD A; 3S2A A; 1Y0A A; 1BT0 A; 1HBH A; 4F6G A; 4HH1 A; 1MG4 A; 3OAW A; 2ZS1 B; 3NMM A; 1A9W E; 5DPR A; 5CN4 A; 1RQA B; 3S65 A; 1MOH A; 4IWP A; 1V8C A; 2EVK A; 1RFA A; 3K3U A; 2N7E A; 4AWJ A; 3PVL A; 1CP0 A; 1IT2 A; 3ZJN A; 1O1M B; 1J7Y B; 1Z2M A; 2V8A B; 1HBI A; 2D2N A; 3QJD A; 3ZJI A; 5KDQ A; 1TGZ B; 2NMQ A; 3ASE A; 4MEL A; 1GLI A; 2BKM A; 2MGJ A; 3SDL C; 2LH1 A; 2G1E A; 4MQC B; 2HHD A; 3UHZ A; 1V1P A; 2V1F A; 2AL6 A; 3WAM A; 5CNF A; 4BBN C; 2ZLU B; 3N9Y C; 4A90 A; 4AP4 C; 4PS3 A; 3S66 A; 4IDI A; 1WXQ A; 1LFY A; 3W4U A; 3RQR A; 5KER B; 3UI0 A; 2GRZ A; 1C1Y B; 2RDG A; 2O5B X; 3L13 A; 2GL3 A; 3GK9 A; 3O7N A; 2AYO B; 2JQR B; 4BKG A; 2FRK X; 1JP6 A; 3V2V A; 1WAC A; 1QT9 A; 4BS9 A; 2KMA A; 1WZ3 A; 1VXH A; 1Y4P A; 3WTG B; 1E8W A; 5CHQ A; 2SPM A; 1LH2 A; 4BOZ B; 1UVK A; 1HV4 B; 4DDG D; 5IA7 A; 3HM3 A; 2RAO A; 4MGI E; 3VH4 B; 2EKT A; 3N3K B; 1NEK B; 1QXD B; 2WXQ A; 2A4Z A; 2DLB A; 1TY2 A; 1T1N A; 1FRD A; 1YEN A; 4JWS C; 3MC8 A; 1C7C B; 1MLK A; 1SE2 A; 1G09 B; 3WCU B; 4GB9 A; 3UHH A; 4MT5 A; 1Y35 B; 4REZ A; 3EU1 B; 2KO3 A; 2R61 A; 1HGB A; 1J40 B; 3IXF A; 3AE7 B; 2LEK A; 3KUZ A; 3QCA A; 1IPG A; 5J2R A; 4UDU C; 1JQ4 A; 5BO4 B; 3N32 A; 1WRD B; 1LTW A; 2DKD A; 5HLQ A; 2HDE A; 4U8U B; 1I35 A; 2D3A A; 3A9K A; 4NZI A; 3NFE B; 2BB6 A; 3DPD A; 5JOM A; 2KQ7 A; 3QM5 A; 1N5X A; 3B2F A; 1YOG A; 4YU3 A; 5GMV A; 1JRO A; 4F4O A; 1V86 A; 3AQ7 A; 1HGC A; 3BK1 A; 1C7B B; 3WCW B; 3CSF A; 3IFW B; 1Y4G A; 4ESU A; 2KFK B; 1Y2Z A; 2OJR A; 2HZ1 A; 2VJH A; 4H07 A; 5E83 A; 3I9V 1; 4HWI B; 2NSS A; 2C7N B; 3H7S A; 2GBM A; 5HKH A; 1UEL A; 1XF5 L; 5C1Z A; 3QM6 A; 2O6V B; 3UGY A; 3ZDM C; 3PT8 B; 3ODQ B; 4HPM B; 1MYF A; 1JL6 A; 3SDN A; 2VRR B; 3AUL A; 1H8C A; 1IUE A; 1CIO A; 2D2M B; 2MGE A; 3DCG A; 3S1J A; 4NXC A; 4HRT B; 4B3W A; 3UHD A; 4XWW A; 3UQB A; 4NPN A; 5AZG A; 2JZZ A; 2O5S X; 3R5I B; 4HVB A; 3ZKJ C; 2VLX A; 1CO8 A; 4ZVA A; 1MTI A; 2ZLX B; 1HDB B; 1TKY A; 1JY7 B; 2JLG A; 3U30 A; 1S5Y B; 1Y83 B; 2QIL A; 3AEF B; 1D6E C; 3A1Q A; 3RD2 A; 2MHB B; 5AB8 A; 3VRF B; 1ISN A; 2PW9 A; 3OJ4 B; 2IY0 B; 1MDT A; 2VML A; 1A70 A; 4L7Y B; 3W5U B; 3SHQ A; 2LHB A; 2INN E; 1LA6 A; 1J7C A; 2BWF A; 2WX0 A; 2KWV B; 4NQL B; 1BZP A; 2C9W B; 1Y5K A; 2DAF A; 1VRA B; 3ARJ A; 3RYT A; 5JDO F; 1MYH A; 112M A; 1YZI A; 1YG5 A; 3WCT D; 3W1Y A; 3UHU A; 4K81 A; 1Y0T A; 1Y7C A; 4PYU A; 5EE3 A; 1C76 A; 1Y5J A; 1Y5F A; 3PO0 A; 4P16 A; 3U52 E; 1NGK A; 1Y8I A; 1HDA A; 2K22 A; 1P7F A; 1XLP A; 2IGG A; 1M6M A; 5EUI A; 4A8S A; 1YGD B; 4M8M A; 4OZC A; 2ZS0 B; 2ZWJ A; 1P7E A; 4QAY A; 2YSK A; 2XNA C; 5JZE B; 1RVW A; 4ZYS A; 1TJE A; 1UBQ A; 1P0R A; 1O1L A; 2H35 B; 2BS2 B; 2OJW A; 1F5O A; 1ABY B; 1WLA A; 2BWE S; 1Y0W A; 1YGF A; 2VJR A; 2OH9 A; 4ZIZ B; 3PLV A; 1HA7 A; 1RQ3 B; 2D60 B; 3AQ9 A; 4L23 A; 5BMH A; 1YN3 A; 1RPS B; 1YMC A; 2JL9 A; 2MX2 A; 4MQH A; 3S48 C; 1YEQ B; 1KRH A; 2VYZ A; 3AQ6 A; 1V6E A; 4HPL B; 1VZ6 A; 4F68 A; 1OQY A; 2HBS A; 4RMA A; 1E90 A; 1WM2 A; 2IZV B; 4MH8 A; 2RPV A; 1XF6 C; 3T3O A; 1OBM A; 1E0Z A; 3O18 B; 2K9X A; 1UZX B; 5C6E B; 2MLB A; 2V3S A; 4O4Z A; 4RH6 A; 1LFT B; 2GBJ A; 4F6F A; 4YTN B; 1GJZ A; 3K9P B; 2W6X A; 4LDT D; 1MLF A; 2IG3 A; 4EZJ A; 5CMV A; 2DAJ A; 3ZOM A; 2WXK A; 5D3I B; 3IG3 A; 4WJO A; 4KN3 A; 4NAW A; 1ON7 A; 3FS4 B; 1A4F A; 1N9X A; 1R1X B; 3X0W A; 1ECN A; 1BUW B; 2BV8 B; 5F0B A; 1GOZ A; 4EZL A; 3ARL A; 1T0R C; 4M4A A; 1I7Y B; 3IT6 B; 1DXV B; 1SBB B; 2PJH A; 1EBC A; 2DZI A; 1J3Z A; 4MBA A; 4OF9 A; 4ROM B; 6HBW B; 3FC4 A; 1RM6 C; 1EYX A; 2KNB A; 1XZ5 B; 2I2Y A; 3Q3N C; 1B8D B; 1RWS A; 1WVP A; 2UUL D; 3SEB A; 4HSW A; 2L0F A; 1C77 A; 1U7R A; 1WY8 A; 3MKB B; 1LFL A; 1O1I A; 3V61 A; 3L54 A; 1Q1F A; 1MLL A; 4ZHO A; 1WE7 A; 4D2K A; 3H6N A; 4RCO A; 1Y0C A; 3HYU B; 1CH7 A; 3TM3 A; 2JX5 A; 1WJU A; 5KKK A; 3UHN A; 3GKT A; 3QK0 A; 3MP9 A; 3VTW A; 1YEV A; 4DC7 A; 2W9N A; 4UZV A; 2M19 A; 1CH9 A; 4JGH B; 3ZJQ A; 4W9I A; 1V2Y A; 3G4V A; 1ZXH A; 3QJC B; 1NI2 A; 4MSQ B; 1BZ0 A; 2L0T A; 3RUI B; 1BIN A; 2REX A; 1ZXI A; 3TCA A; 2MGK A; 1A01 A; 3GOU B; 1FN3 A; 1MFW A; 3HC9 A; 1N61 A; 3GQG B; 1V4U A; 3IBE A; 2QMB A; 3NOB A; 2JWU A; 2SPL A; 3VTU A; 4OHJ A; 1XCT L; 2GTL D; 4ROL A; 1MOC A; 2FCM A; 2NR2 A; 4FJZ A; 5D3D A; 1NI3 A; 4H0M A; 1N5W A; 2V1G A; 5SW7 B; 2M8S A; 3L17 A; 5AZQ A; 3R2I A; 3LQD B; 1NQP A; 5CNG A; 3AEA B; 2QLS B; 1F65 A; 3EFU A; 2ZNV C; 3AEB B; 1KLU D; 1X9F D; 1Y7D A; 4M0W A; 4WWP A; 3RNB C; 1YJ1 A; 4GDL A; 3W5V B; 3ZJS A; 3KMF A; 2VEB A; 1YQB A; 3WAO A; 4WJG 1; 2V3N A; 1O1O A; 3BRP A; 1GJN A; 3A5B A; 5E29 A; 1FRR A; 1WE6 A; 2FRF A; 4KDI C; 1K1K B; 1G0A A; 3WCQ A; 1O1N A; 3RNA C; 1RRB A; 1YVQ B; 4KJT A; 1JDO A; 2LVO A; 2MBQ A; 1K0Y B; 3QJE A; 4WH4 A; 3RZW C; 4BJA A; 2RGF A; 2KN5 A; 3TSS A; 3CIU B; 5J18 A; 1FO4 A; 1STE A; 111M A; 2ZFO D; 3X23 A; 1XG0 C; 2KAC A; 1UT0 A; 1IGC A; 1RTX A; 4GLS C; 4AE0 A; 3EHV A; 1KD2 B; 5FKA C; 4B9K A; 1YHU D; 4FUL A; 4IWQ A; 1UFJ A; 1TS2 A; 3G53 A; 1BZZ B; 1QI8 B; 3M3A A; 2M6Z B; 5FR3 A; 1YFF B; 1VXC A; 2BK9 A; 3Q69 A; 1LJW B; 2L76 A; 2ZT3 A; 4N7N A; 1MBI A; 3G4R A; 1OR6 A; 1H4R A; 4O1T A; 1WGY A; 2W72 B; 4GOC A; 4RF0 A; 1GVH A; 1X46 A; 4YTP B; 1CMY B; 2BTE A; 4RM8 A; 4OZB A; 1WR1 A; 5CN9 A; 3ZNZ B; 3CMM B; 5AZF A; 4AJY B; 1OUT B; 3A9J B; 2MGD A; 2DN2 B; 4HCP B; 4S17 A; 4TV3 A; 4ZRI A; 3LQ9 A; 2W6Y A; 3WCV A; 2JT4 B; 2WDV B; 2UUL A; 2D07 B; 3HEP A; 1VWT B; 1V81 A; 1OQR A; 1RSE A; 3GDJ A; 2J7Q B; 3GQP A; 2UU7 A; 4XDD A; 5CNB A; 2J96 A; 1I4G A; 2NPT A; 3QAQ A; 3WA0 A; 2DWQ A; 2HTH A; 1T0Q C; 3KQ4 A; 3WAL A; 4C7Z A; 3RNC C; 1BIJ B; 4DHZ B; 2VRY A; 4F6J A; 2HTM E; 3AI5 A; 3Q2A C; 2J0J A; 1J7A A; 4F6D A; 2ZCB A; 5HU6 A; 1Y31 B; 3G4U A; 1EU4 A; 2ZCC A; 4TUU A; 4CYE A; 1OQQ A; 4IG7 B; 1ZUD 2; 1G6J A; 3J9C A; 1F0Z A; 1XLO A; 1ET6 A; 2NCN A; 3RZF A; 1DTI A; 1JWS D; 3I3T B; 3AE3 B; 5EE0 A; 2D3B A; 3BCQ A; 4PK1 A; 4MQI A; 4WCH D; 4XGA B; 1GDI A; 3KW5 B; 2FIF A; 1ALL B; 4MDK E; 4II3 B; 3AT5 A; 2CMM A; 4LCD E; 1QIL A; 5LLI A; 3IA3 B; 1N60 A; 3BA2 A; 1HAB A; 3PIA A; 1YEU A; 3G4Y A; 1L6U A; 1WMU B; 1HBR A; 3B08 A; 4O35 A; 2O2V B; 2ZW1 A; 2IDY A; 3AT6 B; 3ABV B; 4YJJ A; 2IGD A; 3KWV A; 3L0W B; 2BYE A; 4K7S A; 2BVC A; 2GTL A; 3SDH A; 1MYG A; 3D7O A; 1YIW A; 2WDT B; 2B76 B; 1TS3 A; 1CBM A; 1WH3 A; 2D3G A; 3UHI A; 1WXS A; 4GXB A; 4PNJ A; 4XE0 A; 3FAH A; 5TSS A; 5EOH A; 1J41 A; 1NEJ B; 1NAZ A; 3B75 B; 1QQR A; 4L2M A; 3ECX A; 1DOI A; 3PEL A; 3EA6 A; 3MJU B; 1ECO A; 1A6K A; 1Y4F B; 2NBV B; 1HDS A; 3MC0 B; 2BWH A; 1PBX A; 4RGM A; 3UHS A; 4RMP A; 1RQ4 B; 2X8X X; 1R4N B; 4HRO A; 1Y4R A; 3WFW A; 3VFK A; 4N7P A; 3P5Q A; 5ILP A; 1PYW D; 4JLC A; 3UIO B; 4TQ0 A; 1BAB A; 1BJE A; 3DHR A; 2JU6 X; 2ZFO A; 1IRC A; 2MH7 A; 3SFD B; 1A0U A; 2Z6N A; 2HBD B; 4N8T A; 1DXD A; 1LFZ B; 1D5M C; 5GXG B; 1D5Z C; 1YHU A; 3EOK B; 1BUI C; 2OED A; 1SB3 C; 4GXE A; 1R1Y B; 1OJ6 A; 1O1J B; 3D4X B; 2QJL A; 3PSE B; 1TES A; 3GE8 C; 1DM1 A; 1MKO A; 1NS6 A; 2VYY A; 4KGT A; 3O2C B; 1S5X A; 1QOG A; 1LIA A; 1VXB A; 3WCT C; 4NJ7 A; 2FE8 A; 3AEG B; 1UX8 A; 3M38 A; 3DVG Y; 1LXD A; 2G0V A; 1L0Y B; 4PO5 A; 1Y0A B; 4XX5 A; 4YSY B; 1HBH B; 4ZVB A; 2EVP A; 3AU4 A; 3NMM B; 2WXO A; 3TLD A; 4DHJ B; 1JCK B; 2KKC A; 1WGD A; 3S65 B; 1Y4V A; 1DOY A; 2G3H A; 1BZ1 A; 1IOP A; 4NI1 A; 3EUB 2; 3GUQ A; 1TIF A; 2IO2 B; 3GKV A; 3R66 C; 4ANX A; 4GU2 A; 4KSK C; 3OWE B; 1E8Z A; 2D2N B; 3QJD B; 5KDQ B; 2MCN B; 2B3A A; 4W9L A; 1URY A; 1IGD A; 3UBV A; 3DVG X; 4RFB A; 1GLI B; 1R4N I; 2O5T X; 2ZST A; 2HHD B; 2JLF A; 2MYA A; 1V1P B; 2EKE C; 3ZNH B; 1NBF C; 1L4D B; 4KSL C; 2L1A A; 3KMF C; 5CN7 A; 1OTR B; 1HEZ E; 1JRP A; 4EOY A; 2INP E; 2LRU A; 2HZ2 A; 3S66 B; 2HZ3 A; 2G9H D; 1FHJ A; 2JXX A; 1LFY B; 3W4U B; 5J17 A; 2ZT2 A; 2L05 A; 2LVP A; 3H1U A; 3GIO A; 1BZZ A; 2AA1 A; 3AMZ A; 1CPC A; 1NPG A; 1V4X A; 3VUX A; 2Y3A A; 1UUP A; 4GZG A; 2M0A A; 4KIK A; 4DC8 A; 2LXA A; 1Y4P B; 1ZP0 B; 2D6C A; 4ANV A; 1F9J A; 2QU0 A; 2FUH B; 3QWZ B; 3Q14 C; 2VLZ A; 4LNK A; 1PUT A; 3UHE A; 2RAO B; 5I4D A; 3VH3 B; 3N1X C; 1T1N B; 1YEN B; 2BBC A; 3B0A A; 4AVD A; 1IRD A; 4I6P A; 1WX8 A; 2L00 B; 1AJH A; 4MQG A; 3V3X A; 1C3T A; 1DGJ A; 3HRW A; 4PQ6 A; 4NQK E; 1HI8 A; 2GRF A; 3MJ5 A; 3TEX A; 3KUN A; 2HHE A; 1HGB B; 2QFN A; 2R80 A; 1K8R B; 4IT8 A; 3RJ6 A; 2PKO A; 3MFG A; 2KDI A; 5KHO A; 4DXA B; 2JVC A; 3GQR A; 3A9K B; 3AE1 B; 4WIP A; 4G1B A; 2VH1 A; 1WIA A; 3LB4 A; 2EMT A; 3GOE A; 4LNF A; 4N58 A; 2XBB C; 5B85 A; 4YU3 B; 3HM6 X; 2X4A A; 3GYS A; 4F4O B; 4KKI A; 1HGC B; 3ZJT A; 4M01 A; 2AUR A; 1Y4G B; 1YOV B; 2XN9 C; 2D3C A; 2HBC A; 3ZRC A; 1Y09 A; 1Y2Z B; 2CS4 A; 1WMH A; 2WDQ B; 4ICU A; 1GCV A; 3FH9 A; 2MGL A; 1UGM A; 2VJH B; 2YEP F; 1MNH A; 2C7J A; 5E83 B; 3HIZ A; 4DQO C; 2C7L A; 3E5O A; 1TKG A; 2UYZ B; 1COH A; 3L4P A; 1GUA B; 3RJN B; 2E6X A; 2R1H A; 4KZC A; 2ZNV B; 4LLG M; 1KOT A; 3RCZ A; 1YMA A; 1PFD A; 3BY4 B; 3ZRF A; 1UH6 A; 2RI4 A; 2JY6 A; 4ZRP A; 3VRB B; 1BVC A; 2R50 A; 1UMO A; 2G0R A; 3PI9 A; 4PQB A; 1EO6 A; 2Z85 A; 3QX1 A; 4HKZ E; 2J42 A; 2GTL C; 2KHW B; 5C3J B; 4MH0 E; 4AUQ C; 2O5M X; 3MHZ A; 2UUM A; 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