4TT6A

Crystal structure of atad2a bromodomain double mutant n1063a-y1064a in apo form
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
SMQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLRDIDLICSNALEAAPDRDPGDRLIRHRACALRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Gene regulation
molecule keywords ATPase family AAA domain-containing protein 2
publication title Observed bromodomain flexibility reveals histone peptide- and small molecule ligand-compatible forms of ATAD2.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 53
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2014-06-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4tt6A00
5IIDA 3UV5A 4QR4A 4BW3A 4OGJA 5E3DA 5TB6A 2WP2A 4OGIA 4NYXA 2OO1A 2DVQA 5LKZA 5LJ0A 1WUMA 2DVRA 5H1UA 3TLPA 4UITA 5BT4A 5H1VA 4HXMA 5L99A 5EICA 4O7BA 5ETDA 2RNWA 5A5RA 5E0RA 5HRWA 4LR6A 4QYDA 5E9YA 5I80A 4A9HA 4PS5A 5ENIA 2E3KA 4QSXA 5EWVA 5FE8A 4HXPA 4UIWA 5EK9A 5IGKA 4O76A 4Y03A 5FG4A 4ALGA 4A9LA 3ZYUA 5I1QA 5HRVA 4UYEA 4YYKA 5DLZA 4UIUA 4CFLA 4CUSA 5TCMA 3D7CA 5FG6A 2N9GA 2DWWA 3DAIA 4HXRA 4UYDA 5ETBA 4QSQA 5EPBA 4YK0A 3SVFA 4AKNA 5J0DA 4NXJA 4HBYA 4Z1SA 4O7CA 5CQTA 5EPRA 3O36A 4QEVA 4TS8A 5D3RA 4YY4A 4QUTA 5C85A 3G0LA 5ENFA 4O75A 5C87A 5D3JA 5EWHA 2R0YA 5AMEA 5F1LA 4MR4A 5DBMA 5IG6A 4HXOA 5DY7A 4YH3A 2WP1A 5FH7A 3U5NA 5COIA 2DATA 3LJWA 5ENCA 4KV4A 3Q2EA 2RI7A 4HXNA 4O70A 4NQNA 5A85A 5FE2A 4CL9A 5L97A 5FFWA 4Q0OA 5A83A 5HEMA 4YYGA 3QZSA 5I86A 4Z6HA 5FE4A 5KTXA 2LSPB 2H60A 4O74A 5DFDA 3UV4A 5D0CA 5C4QA 5L98A 2DKWA 4LC2A 5CTLA 4PTBA 5DYCA 5A7CA 3RCWA 3I3JA 4O72A 5D3PA 4BHWA 3DWYA 4XYAA 2MJVB 4DONA 5EM3A 3IU5A 5HQ7A 5L8UA 4UIYA 3U5PA 5II2A 4YADA 4MR5A 4NUDA 5E9KA 5F62A 4IOQA 4YY6A 5IGMA 2KTBB 3MQMA 3LXJA 2RNXA 3IU6A 4UYGA 2YELA 4N4FA 4RVRA 4N4GA 1JSPB 4XUAA 4QSUA 5C8GA 4NQMA 4LYSA 5KO4A 4ZW1A 5HENA 5CUCA 5EU1A 4TTEA 5E9LA 5CGPA 5EGUA 4QSTA 3HMEA 2L84A 4J0RA 5DFCA 5E74A 3UVDA 4YYHA 4YYMA 5ENBA 3O33A 3FKMX 3UW9A 5A5OA 5FE5A 4MEPA 5BT5A 1F68A 3O35A 5EA1A 3MUKA 4LZRA 5I29A 3LQJA 4ALHA 4OUFA 5CRMA 5A81A 4TZ2A 5DW1A 4C66A 4YBTA 5A5PA 2OSSA 4Q0NA 5EV9A 4CUPA 5D25A 5E9MA 5FH6A 4NR4A 2NXBA 1X0JA 4IORA 4UIVA 4MR6A 4QR3A 4LRGA 4YYNA 3Q2FA 4O77A 5CQ3A 4ZQLA 5FB0A 5F25A 5E73A 5AMFA 3UVWA 4QSRA 4LZ2A 3JVMA 3SVHA 5EQ1A 5LKTA 5F36A 5I89A 4X2IA 3JVLA 4LDFA 4BJXA 5LUUA 5D7XA 4QZSA 4ZC9A 4IR4A 5DLXA 2F6NA 4YBMA 5F1HA 4UYFA 5H1TA 5KU3A 5ACYA 5I88A 5DW2A 5JWMA 5FBXA 4LZSA 5CP5A 4HBXA 3MXFA 4NYWA 4QC1A 3U5MA 3P5OA 5K29A 4IR3A 4NRAA 1EQFA 3AQAA 5EWCA 4MEQA 3P1CA 2YW5A 5E9VA 5EPSA 2YDWA 4O78A 4PCIA 4N3WA 5DFBA 2L5EA 5DYUA 2YEMA 4QEWA 4A9JA 4F3IA 2E7NA 5FE0A 4BW1A 4WIVA 5LKXA 2YQDA 4N4IA 5HM0A 5LVRA 1WUGA 4Z6IA 5F61A 4QYLA 5L96A 4PY6A 5F5ZA 5I40A 5EP7A 4XUBA 3P1EA 4A9IA 3G0JA 5EVAA 4KCXA 4YC9A 4HXSA 5LVQA 5D26A 2RO1A 5BT3A 4QUUA 4NR6A 5C89A 4A9NA 5HFQA 5A5SA 4A9FA 5AD2A 4PCEA 5G4SA 2RFJA 4TQNA 5CU8A 3P1DA 5A82A 5KTUA 2RS9B 4UYHA 2R0VA 5F3AA 3JVJA 5EWWA 2OUOA 4WHWA 5LJ1A 4O7AA 4O71A 4QB3A 4MEOA 3ONIA 1N72A 3NXBA 5CUEA 5AD3A 5CQ6A 5DX4A 5DKHA 2DVVA 4QC3A 4TT4A 4E96A 4CLBA 4NR7A 5I7XA 4CUQA 5I7YA 4UIZA 4TU4A 4NR8A 5F63A 5CRZA 4TU6A 2D9EA 5IBNA 3UV2A 3O34A 3LQIA 5KTWA 4TYLA 5G4RA 5EI4A 5CQ8A 2L85A 4QSSA 4QSVA 4IR5A 5CUAA 3MB4A 5ENJA 2YEKA 4J0SA 3AADA 4QEUA 2YYNA 4BW4A 1ZS5A 2FSAA 3S92A 4QNSA 2R0SA 5FG5A 5EISA 5HCLA 1E6IA 3P1FA 5CZGA 5HQ5A 5D3HA 5FE3A 5F60A 4XY8A 4NRCA 4YH4A 5IGNA 4HBWA 4WHUA 5E7DA 4Z1QA 4C67A 4NR9A 4HXKA 5D3TA 5E9IA 4HBVA 4NYVA 5CY9A 3U5OA 5FFVA 4YATA 5L8TA 5JI8A 3LQHA 3MULA 1JM4B 5D24A 2R10A 5HJCA 4LYWA 4YBSA 4TT2A 2E7OA 5HLSA 3MB3A 3O37A 5CPEA 4MR3A 3HMHA 5I83A 3JVKA 4J1PA 4A9KA 4O7FA 5ENHA 4QSWA 4LYIA 4A9EA 5HRXA 4N4HA 5DKDA 5DYAA 3U5LA 3S91A 5DKCA 3U5KA 3QZVA 4NR5A 5FE6A 4HXLA 4GPJA 5CUGA 5KHMA 5FDZA 5EWDA 5CUBA 5CFWA 3K2JA 4KV1A 5A5NA 5FH8A 5FB1A 4A9MA 4A9OA 5C7NA 5H85A 5E3GA 4TZ8A 4QBMA 5FE7A 3QZTA 4IR6A 2DVSA 3HMFA 5CQ7A 4YAXA 5A5QA 4O7EA 5LKUA 4XY9A 5ENGA 4Z93A 4PKLA 5FFYA 2F6JA 2G4AA 4UIXA 2GRCA 4J3IA 5CS8A 5ENEA 3SVGA 4QY4A 4QR5A 5CQAA 4NS5A 5HELA 5HQ6A 5LJ2A 4FLPA 2I8NA 3UVXA 4YABA 4YYJA 2D82A 5F2PA 5DYXA 4QSPA 3GG3A 4CURA 4IOOA 4CUTA 5II1A 4CFKA 5D3SA 5CUDA 4BW2A 5D3NA 3UVYA 4CUUA 4NUCA 5CQ5A 5HFRA 4TT6A 4UYFB 4YYDA 5CQ4A 2RNYA 5D3LA 5FE9A 4YYIA 4MENA 5FE1A 5IGLA 4NUEA 4NRBA 2I7KA 3U5JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5IIDA 3UV5A 4QR4A 4BW3A 4OGJA 5E3DA 5TB6A 2WP2A 4OGIA 4NYXA 2OO1A 2DVQA 5LKZA 5LJ0A 1WUMA 1PUOA 2DVRA 5H1UA 3TLPA 4UITA 5BT4A 5H1VA 4HXMA 5L99A 5EICA 4O7BA 5ETDA 2RNWA 5A5RA 5E0RA 5HRWA 4LR6A 4QYDA 5E9YA 5I80A 4A9HA 4PS5A 5ENIA 2E3KA 4QSXA 5EWVA 5FE8A 4HXPA 4UIWA 5EK9A 5IGKA 4O76A 4Y03A 5FG4A 4ALGA 4A9LA 3ZYUA 5I1QA 5HRVA 4UYEA 4YYKA 5DLZA 4UIUA 4CFLA 4CUSA 5TCMA 3D7CA 5FG6A 2N9GA 2DWWA 3DAIA 4HXRA 4UYDA 5ETBA 4QSQA 5EPBA 4YK0A 3SVFA 4AKNA 5J0DA 4NXJA 4HBYA 4Z1SA 4O7CA 5CQTA 5EPRA 3O36A 4QEVA 4TS8A 5D3RA 4AI6A 4YY4A 4QUTA 5C85A 3G0LA 5ENFA 4O75A 5C87A 5D3JA 5EWHA 2R0YA 5AMEA 5F1LA 4MR4A 5DBMA 5IG6A 4HXOA 5DY7A 4YH3A 2WP1A 5FH7A 3U5NA 5COIA 2DATA 3LJWA 5ENCA 4KV4A 3Q2EA 2RI7A 4HXNA 4O70A 4NQNA 5A85A 5FE2A 4CL9A 5L97A 5FFWA 4Q0OA 5A83A 5HEMA 4YYGA 3QZSA 5I86A 4Z6HA 5FE4A 5KTXA 2LSPB 2H60A 4O74A 5DFDA 3UV4A 5D0CA 5C4QA 5L98A 2DKWA 4LC2A 5CTLA 4PTBA 5DYCA 5A7CA 3RCWA 3I3JA 4O72A 5D3PA 4BHWA 3DWYA 2EJNA 4XYAA 2MJVB 4DONA 5EM3A 3IU5A 5HQ7A 5L8UA 4UIYA 3U5PA 5II2A 4YADA 4MR5A 4NUDA 5E9KA 5F62A 4IOQA 4YY6A 5IGMA 2KTBB 3MQMA 3LXJA 2RNXA 3IU6A 4UYGA 2YELA 4N4FA 4RVRA 4N4GA 1JSPB 4XUAA 4QSUA 5C8GA 4NQMA 4LYSA 5KO4A 4ZW1A 5HENA 5CUCA 5EU1A 4TTEA 5E9LA 5CGPA 5EGUA 4QSTA 3HMEA 2L84A 4J0RA 5DFCA 5E74A 3UVDA 4YYHA 4YYMA 5ENBA 3O33A 3FKMX 3UW9A 5A5OA 5FE5A 4MEPA 5BT5A 1F68A 3O35A 5EA1A 3MUKA 4LZRA 5I29A 3LQJA 4ALHA 4OUFA 5CRMA 5A81A 4TZ2A 5DW1A 4C66A 4YBTA 5A5PA 2OSSA 4Q0NA 5EV9A 4CUPA 5D25A 5E9MA 5FH6A 4NR4A 2NXBA 1X0JA 4IORA 4UIVA 4MR6A 4QR3A 4LRGA 4YYNA 3Q2FA 4O77A 5CQ3A 4ZQLA 5FB0A 5F25A 5E73A 5AMFA 3UVWA 4QSRA 4LZ2A 3JVMA 3SVHA 5EQ1A 5LKTA 5F36A 5I89A 4X2IA 3JVLA 4LDFA 4BJXA 5LUUA 5D7XA 4QZSA 4ZC9A 4IR4A 5DLXA 2F6NA 4YBMA 5F1HA 4UYFA 5H1TA 5KU3A 5ACYA 5I88A 5DW2A 5JWMA 5FBXA 4LZSA 5CP5A 4HBXA 3MXFA 4NYWA 4QC1A 3U5MA 3P5OA 5K29A 4IR3A 4NRAA 1EQFA 3AQAA 5EWCA 4MEQA 3D1BA 3P1CA 2YW5A 5E9VA 5EPSA 1ZKRA 2YDWA 4O78A 4PCIA 4N3WA 5DFBA 2L5EA 5DYUA 2YEMA 4QEWA 4A9JA 4F3IA 2E7NA 5FE0A 4BW1A 4WIVA 5LKXA 2YQDA 4N4IA 3ERRA 5HM0A 5LVRA 1WUGA 4AKHA 4Z6IA 5F61A 4QYLA 5L96A 4PY6A 5F5ZA 5I40A 5EP7A 4XUBA 3P1EA 4A9IA 3G0JA 5EVAA 4KCXA 4YC9A 4HXSA 5LVQA 5D26A 2RO1A 5BT3A 4QUUA 4NR6A 5C89A 4A9NA 5HFQA 5A5SA 4A9FA 5AD2A 4PCEA 5G4SA 2RFJA 4TQNA 5CU8A 3P1DA 5A82A 5KTUA 2RS9B 4UYHA 2R0VA 5F3AA 3JVJA 5EWWA 2OUOA 4WHWA 5LJ1A 4O7AA 4O71A 4QB3A 4MEOA 3ONIA 1N72A 3NXBA 5CUEA 5AD3A 5CQ6A 5DX4A 5DKHA 2DVVA 4QC3A 4TT4A 4E96A 4CLBA 4NR7A 5I7XA 4CUQA 5I7YA 4UIZA 4TU4A 4AKIA 4NR8A 5F63A 5CRZA 4TU6A 2D9EA 5IBNA 3UV2A 3O34A 3LQIA 5KTWA 4TYLA 5G4RA 5EI4A 5CQ8A 2L85A 4QSSA 4QSVA 4IR5A 5CUAA 3MB4A 5ENJA 2YEKA 3VKHA 4J0SA 3AADA 4QEUA 2YYNA 4BW4A 1ZS5A 2FSAA 3S92A 4QNSA 4AKGA 2R0SA 5FG5A 5EISA 5HCLA 1E6IA 3P1FA 5CZGA 5HQ5A 5D3HA 5FE3A 5F60A 4XY8A 4NRCA 4YH4A 5IGNA 4HBWA 4WHUA 5E7DA 4Z1QA 4C67A 4NR9A 4HXKA 5D3TA 5E9IA 4HBVA 4NYVA 5CY9A 3U5OA 5FFVA 4YATA 5L8TA 5JI8A 3LQHA 3MULA 1JM4B 5D24A 2R10A 5HJCA 4LYWA 4YBSA 4TT2A 2E7OA 5HLSA 3MB3A 3O37A 5CPEA 4MR3A 3HMHA 5I83A 3JVKA 4J1PA 4A9KA 4O7FA 5ENHA 4QSWA 4LYIA 4A9EA 5HRXA 4N4HA 5DKDA 5DYAA 3U5LA 3S91A 5DKCA 3U5KA 3QZVA 4NR5A 5FE6A 4HXLA 4GPJA 5CUGA 5KHMA 5FDZA 5EWDA 5CUBA 5CFWA 3K2JA 4KV1A 5A5NA 5FH8A 5FB1A 4A9MA 4A9OA 5C7NA 3VKGA 5H85A 5E3GA 4TZ8A 4QBMA 5FE7A 3QZTA 4IR6A 2DVSA 3HMFA 5CQ7A 4YAXA 5A5QA 4O7EA 5LKUA 4XY9A 5ENGA 4Z93A 4PKLA 5FFYA 2F6JA 3D1DA 2G4AA 4UIXA 2GRCA 4J3IA 5CS8A 5ENEA 3SVGA 4QY4A 4QR5A 5CQAA 4NS5A 5HELA 5HQ6A 5LJ2A 4FLPA 2I8NA 3UVXA 4YABA 4YYJA 2D82A 5F2PA 5DYXA 4QSPA 3GG3A 4CURA 4IOOA 4CUTA 5II1A 4CFKA 5D3SA 5CUDA 4BW2A 5D3NA 3UVYA 4CUUA 4NUCA 5CQ5A 5HFRA 4TT6A 4UYFB 4YYDA 5CQ4A 2RNYA 5D3LA 5FE9A 4YYIA 4MENA 5FE1A 5IGLA 4NUEA 4NRBA 2I7KA 3U5JA
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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