4TTUA

N-terminally truncated dextransucrase dsr-e from leuconostoc mesenteroides nrrl b-1299 in complex with isomaltotriose
Total Genus 340
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
340
sequence length
1046
structure length
1036
Chain Sequence
KGLRQDSNGKLRYFDLTTGIQAKGQFVTIGQETYYFSKDHGDAQLLPMVTEGHYGTITTAWVYRDQNNTILKGLQNINGTLQFFDPYTGEQLKGGVAKYDDKLFYFESGKGNLVSTVAGDYQDGHYISQDGQTRYADKQNQLVKGLVTVNGALQYFDNATGNQIKNQQVIVDGKTYYFDDKGNGEYLFTNTLDMSTNAFSTKNVAFNHDSSSFDHTVDGFLTADTWYRPKSILANGTTWRDSTDKDMRPLITVWWPNKNVQVNYLNFMKANGLLTTAAQYTLHSDQDLNQAAQDVQVAIERRIASEHGTDWLQKLLFESQNNNPSFVKQQFIWNKDSEYHGGGDAWFQGGYLKYGNNPLTPTTNSDYRQPGNAFDFLLANDVDNSNPVVQAENLNWLHYLMNFGTITAGQDDANFDSIRIDAVDFIHNDTIQRTYDYLRDAYQVQQSEAKANQHISLVEAGLDAGTSTIHNDALIESNLREAATLSLTNEPGKNKPLTNMLQDVDGGTLITDHTQNSTENQATPNYSIIHAHDKGVQEKVGAAITDATGADWTNFTDEQLKAGLELFYKDQRATNKKYNSYNIPSIYALMLTNKDTVPRMYYGDMYQDDGQYMANKSIYYDALVSLMTARKSYVSGGQTMSVDNHGLLKSVRFGKDAMTANDLGTSATRTEGLGVIIGNDPKLQLNDSDKVTLDMGAAHKNQKYRAVILTTRDGLATFNSDQAPTAWTNDQGTLTFSNQEINGQDNTQIRGVANPQVSGYLAVWVPVGASDNQDARTAATTTENHDGKVLHSNAALDSNLIYEGFSNFQPKATTHDELTNVVIAKNADVFNNWGITSFEMAPQYRSSGDHTFLDSTIDNGYAFTDRYDLGFNTPTKYGTDGDLRATIQALHHANMQVMADVVDNQVYNLPGKEVVSATRAGVGNDDATGFGTQLYVTNSVGGGQYQEKYAGQYLEALKAKYPDLFEGKAYDYWYKNYANDGSNPYYTLSHGDRESIPADVAIKQWSAKYMNGTNVLGNGMGYVLKDWHNGQYFKLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords Dextransucrase
publication title Structural Insights into the Carbohydrate Binding Ability of an alpha-(12) Branching Sucrase from Glycoside Hydrolase Family 70.
pubmed doi rcsb
source organism Leuconostoc mesenteroides
total genus 340
structure length 1036
sequence length 1046
ec nomenclature ec 2.4.1.5: Dextransucrase.
pdb deposition date 2014-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02324 Glyco_hydro_70 Glycosyl hydrolase family 70
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.270.10 Mainly Beta Ribbon left handed beta-beta-3-solenoid Cholin Binding 4ttuA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4ttuA03
3.20.20.470 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glucansucrase 4ttuA04
1W9BM 1NARA 3W6MA 3MV01 4GI8A 1HVQA 1IT0A 2ZWZA 1V0MA 3ZJ8A 2W5FA 4F8XA 1MQQA 1JD7A 4D1IA 3UERA 2IXUA 2ZUVA 5ABGA 3BCDA 1GVIA 3EDJA 4QCFA 3VNYA 2Y2WA 2W66A 2CHOA 4F9JA 3II1A 3WD4A 1JD9A 1TVNA 4CN4A 1OIFA 1EA9C 1E6QM 2WVVA 1EDTA 1MXDA 1QHZA 2YDQA 4JHOA 2V3DA 4GI9A 3O9NA 2YL8A 2XYLA 4GPNA 3SCPA 4EK7A 5I79A 1E73M 3UETA 2BVDA 3KL0A 3WNKA 1HNYA 2AMGA 3VIPA 1GW1A 3IANA 2CERA 1SR0A 1UOKA 2WMKA 1HVXA 4HU0A 3VD4A 3SCNA 1BGGA 4W85A 1EQPA 2X8OA 5DO8A 2E9LA 8CGTA 1D3CA 3O6AA 1G0CA 1LWHA 3VKKA 1KXVA 3WNNA 4D6GA 2G3IA 3ZT6A 2J79A 2EPKX 2FDMA 1UD5A 1SMAA 1QOXA 2XG9A 3RJXA 3WENA 2ZOXA 5A6BA 1BYBA 2DDXA 4A3YA 4Z2IA 4H8HA 2W92A 3K1DA 3E1F1 3AHXA 2VX4A 2B31A 3WF1A 2CKRA 4ZENA 1W1PA 1QW8A 1UKTA 1LL4A 4PMYA 1CEOA 1CENA 4JL1A 1CXLA 5GNZA 3N13A 5C71A 1UA3A 2J47A 3DYPA 1BLIA 2DT3A 2FH8A 3W29A 1VEPA 3AMGA 1OGBA 1FH8A 1UHVA 1TUXA 5I5RA 1R7AA 3FNDA 3N12A 3TA9A 1EQCA 2XM2A 1CTNA 1NOWA 1B2YA 3VIHA 3B9EA 4MB1A 3OLGA 1PPIA 2CYGA 1CNVA 1HP4A 2O9RA 1MYRA 3SURA 2XVKA 4PMOA 1UR9A 1WDRA 4AC1X 3MS8A 1OM0A 1XH0A 3PTQA 4AEEA 4OIFA 1CLXA 1XCXA 1R8LA 2UY2A 4RE4A 1B3WA 2XPKA 4QAWA 3OG2A 4ATLA 1AQHA 4HMEA 1UD4A 1H5VA 4WF7A 1EOKA 4E2OA 3PZVA 4PTWA 2FHCA 1TR1A 3HN3A 5CXPA 2GJRA 2Y4SA 1UQZA 2VNCA 3TOPA 1ISWA 4TTUA 2CEQA 4MB4A 1U33A 3WY1A 1Q6FA 3O2LA 5TD4A 3ZIZA 3ZM8A 3IAQA 3LPFA 2BVTA 3U57A 3B9AA 4J3VA 1Q6EA 4MJ4A 4D6HA 5A8MA 2W63A 2OLHA 1JZ6A 3ARZA 4JFVA 1KR0A 2XUCA 4PCSA 3RMEA 5C70A 5D9PA 3ZJKA 3MUZ1 4J28A 1ZL1A 4ACYA 1CGYA 1QHPA 4W93A 2YL9A 1NWUA 4PYSA 2VX6A 1CWYA 3AMKA 4GIAA 2WMHA 4CD4A 1G94A 2YDRA 3PTMA 4M1RA 5FCZA 1B1YA 3NDYA 1CIUA 2F2HA 2DSKA 2NT1A 7TAAA 3AS3A 3RJYA 1UR4A 3N11A 1EO5A 1Q6GA 1QI2A 3QOMA 1W9UA 3F5KA 3ZO9A 4IUGA 4JAWA 1PJ9A 1JYVA 1WPCA 1AVAA 4F79A 2D2OA 1E43A 5AYIA 5BWFA 3UESA 5CGTA 3SCTA 1E70M 4CN1A 4AD4A 4UTFA 1W9VA 2FGLA 2Z1KA 2PWDA 2EPNA 5A2AA 2CCRA 1W1VA 5C8BB 4PTMA 2BMLA 1V6XA 2E9MA 3CIVA 4JKKA 3LPPA 1V6WA 4FLQA 2E8YA 2Y8VA 1BTCA 2NSXA 1AQ0A 1GOMA 4UR9A 3WH6A 3BLPX 2VJXA 1CPUA 1L0PA 4A4AA 1NP2A 2YIHA 4PSRA 3AROA 4M81A 4HOZA 2WVTA 1V3MA 3PN8A 5D9NA 4ZFMA 2DT1A 3L4VA 5CPQA 1RP9A 3ALFA 3NYDA 1DP0A 2GK1B 2DEPA 3WQ8A 3EYPA 3RPMA 1G1YA 1E9LA 2JE8A 4AYSA 1WZAA 5BXPA 5HNNA 1J0KA 2ZX7A 4M82A 4J3WA 2CKSA 4NRSA 5IDIA 3FN9A 2VMFA 4CU8A 2CESA 3OLEA 4XV0A 1MQRA 1B90A 4H41A 1HF6A 1HIZA 3GNOA 4HPHA 1W2VA 5M17A 1KWKA 4J3UA 5E09A 2ZXBA 2V05A 3AYRA 2J7BA 3K8LA 1XD1A 5BXSA 3PZQA 3FHAA 3W25A 2QF8A 1W9DM 3CHCA 3ARUA 2GDVA 1ISYA 3WQVA 2BHYA 1GHSA 4MNKA 1KGWA 4LYRA 4JKLA 1O7AA 2WNWA 3WH9A 1H0GA 4JFTA 3MV11 2NW0A 3WBEA 5A1AA 1FP8A 2J7CA 2GK1A 3D3AA 2Y24A 1VEOA 4DUVA 3DHUA 4YN5A 4IPNB 3GH7A 3GTNA 4UFKA 4CVWA 4ACZB 1C7TA 4NC0A 1V02A 2WSKA 2WCSA 4GO9A 1JL8A 4HA3A 3AHVA 1UYQA 6A3HA 2JF6A 1ODZA 3HZ3A 4OJYA 4AD2A 4TTGA 4B3KA 4QFUA 1QNQA 3I3EA 1UKPA 4FLOA 2BY2A 3WNMA 1H11A 1E6ZA 4PMVA 3WMCA 2DSUA 1HKKA 4HTYA 5CSYA 4GKLA 1CGUA 2J7FA 1S46A 4U3AA 1HX0A 2X0YA 4B9YA 1XCWA 3AIBA 3TTOA 1DWFM 3T09A 4H8VA 3IJ7A 4H2CA 4BA0A 2YJQA 3KE0A 4YHEA 2D3LA 1JI2A 1UKOA 3KEHA 4OZOA 2CHNA 1WNOA 4MTVA 1CDGA 4ACZA 1JIBA 4R27A 3SUVA 3KWXA 1EGZA 1KCKA 2WCAA 1CXEA 2DT2A 2VOTA 1WB0A 2WKGA 3TTSA 4D6CA 2V5CA 1E71M 3CUFA 1KGXA 1J18A 4U33A 1UR0A 3WD0A 4UQBA 4IPLA 1V6UA 3U7BA 4CD8A 5D9MA 1JF5A 1GOWA 4GZIA 1RD6A 1UA7A 1ECEA 1B3ZA 3BAWA 5CLTA 3MMDA 3ARSA 1FA2A 4OBSA 5AYBA 1VRXA 2CBIA 5JBFA 3AZRA 1BVNP 4CD5A 3CUGA 2RGLA 1QBBA 1WO2A 1W1YA 2WBGA 1GVYA 1BF2A 1QVBA 2YBUA 4LYPA 3VGDA 3UCQA 5CGMA 1BSIA 3EMQA 4EAMA 1WDQA 3ZJ6A 2BV9A 3IJ9A 3VIGA 2VRJA 4D1JA 2CNCA 3VIJA 3T0DA 5JIPA 4X0VA 4NC2A 1CBGA 4CU6A 2YA1A 1E0WA 3AMCA 2WHJA 3VD3A 3LPGA 1KXTA 1U2YA 1A3HA 1XH2A 4MPKA 5KZ6A 2ZXQA 3S2CA 2YL5A 1HN1A 1JZ5A 1FHDA 1XC6A 1MW0A 5FOOA 3APGA 2V3GA 3K8MA 4PCTA 2E8ZA 1UD2A 3AMLA 1NWTA 5A6LA 1W91A 1UKQA 5A8OA 1V3KA 4CCDA 3DC0A 5ABEA 1UWSA 4PSPA 1NH6A 1UR1A 1OWQA 4AZCB 2C0HA 4BZYA 4TVCA 2DQXA 1E6XM 2J8GA 1K9FA 2JFEX 4IM4A 1C90A 3MANA 2J25A 2WMFA 1IV8A 3QOKA 3WELA 3CHFA 5AC5A 3VINA 4R5EA 3W6LA 2EJ1A 1UZ1A 3UR8A 2WANA 1QI0A 1V3LA 2W4XA 1CGWA 1QNSA 3NSXA 3A4AA 2CBVA 1YQ2A 1H0IA 3OIHA 3N18A 3AHYA 1JFHA 1OSEA 4LYQA 4KWUA 4PUDA 2VR5A 5F7UA 2GDUA 2BHUA 2CBJA 2X8RA 2VCAA 3MU7A 5HBFA 1M7XA 4D71A 1PX4A 3WUGA 2O9OA 2WM0A 3WH5A 5GNYA 1MW1A 7A3HA 3AIQA 3A6OA 3VIIA 2IUZA 5EFFA 1E4NA 1TA3B 2UY5A 2WC4A 1UD3A 3W26A 3EDDA 3VDBA 4WLCA 4UQ9A 2ZX5A 2A3BA 3L4TA 3ARTA 1UWUA 1UWQA 4AZCA 3MSDA 4P7QA 2D20A 1BPLB 1QBAA 4TVUA 1P6WA 3QHNA 3QGVA 4MB5A 3CUIA 4CKQA 1EXPA 2D3NA 1SMDA 1E4LA 1KQYA 4AEFA 3K4DA 2YBTA 4PMQA 2PB1A 5A8NA 4GQRA 1Q6DA 2PWHA 1LQ0A 4V2XA 2J62A 3UG5A 4HZ6A 4C7DA 4X36A 1E1EA 1UWTA 5DEZA 3WDQA 4KRUA 1WZKA 1BAGA 4QDMA 1J0ZA 1QNRA 1WCGA 3UG4A 4AW7A 3BXWA 5GQBA 1J11A 3VTRA 4DM1A 1G01A 3WBAA 1X6LA 1R87A 2EBNA 1JYXA 4X0NA 1JDCA 3AXHA 1TA3A 4UFJA 1LL7A 1TFVA 4HMCA 3WKZA 3SUUA 3WF4A 3OA5A 2BY1A 3SCOA 1E0VA 1DTUA 3W81A 1KQZA 3W27A 1AQMA 1C3FA 4FLSA 3VD9A 2XVNA 2XIBA 3CMJA 4MDOA 1UR8A 4P7RA 1Q4NX 2WLYA 3RM9A 2FHFA 1A47A 5LA2A 1Z32X 4LX4A 3EDKA 5GPRA 3WDHA 4U3CA 3GH4A 1K9EA 2EQDA 2HVMA 2QJ6A 1GOQA 3JUGA 3QHOA 2G41A 4M8UA 2AOSA 3WEMA 2E3ZA 2WAGA 2G7CA 5A94A 3PZIA 4HA4A 3BSHA 3J7HA 4J3XA 1CECA 4EE9A 3WF2A 2G3JA 3WSUA 2ZUWA 4WKFA 5BRQA 2J74A 2UY3A 1HL8A 5M03A 1FFRA 1HJQA 4UFHA 3A47A 3OLDA 1ISZA 1EHAA 2J7GA 2W61A 3CH9A 4WKAA 2PF0A 3WL0A 4H04A 1GZJA 4BS0A 4W5UA 3N04A 2VZVA 1E56A 4PMDA 3IK2A 1V0NA 2ZX6A 1HXJA 5GNXA 1W3JA 4U31A 1KR1A 5JIWA 1TE1A 1KXHA 3AHZA 4LPCA 4WIWA 4UQCA 2BVYA 2X8MA 2O9PA 2D22A 1DEDA 1JNEA 1J0YA 2BXZA 1QI3A 2PWEA 5DT5A 2DSZA 5IHRA 1B3YA 3B9DA 4JHZA 2ZXDA 3WDJA 2D23A 1TG7A 1D7FA 2VUYA 5CLWA 3VGEA 3I3BA 3CZKA 4ZXOA 1WKYA 3GXFA 3WN6A 4URIA 1JI1A 2VQTA 1VFMA 1NOUA 4MNLA 3VILA 1J10A 5HDRA 3RM4A 3WQ4A 3RIKA 3UG3A 3VGBA 2V04A 2PWGA 1LLOA 1B3VA 1JZ2A 3ZSSA 3ZT5A 5BYWA 4CVUA 3AS2A 3WQ6A 3BAJA 1BFNA 7CGTA 2BFGA 4MNMA 4PUEA 1JDDA 2BXYA 4UQDA 5CG0A 3CGTA 3QR3A 9CGTA 4HP5A 3AHTA 3L4UA 5EFDA 4D6DA 1E0XA 3RILA 2DH2A 2VVNA 1ITXA 2WHKA 1GOOA 2CIPA 4PTXA 4RE2A 1VJSA 1CXKA 3K46A 1V6YA 1JG9A 1GCYA 3SCUA 3AS0A 1JFXA 2ZUSA 1DWHM 4N0RA 5A3HA 1QNPA 2WWDA 4RE3A 3EBVA 1MW2A 4NZCA 1UH4A 1E15A 4NSBA 4H7VA 5I3DA 2W91A 1DWAM 2DT0A 1GORA 1HL9A 1UG6A 1EHNA 3DYOA 2GSJA 3VD7A 1BYDA 3SEPA 2VZSA 1CXHA 3T2OA 1I75A 3KLKA 2OYMA 2YLAA 1GJUA 2ZICA 1UQYA 4HA1A 3AIRA 3BMWA 5ABHA 4P8XA 3EDFA 1C91A 1VBRA 4NBYA 3M6DA 3VGGA 3N15A 2BY0A 3CZLA 1V0LA 3IAPA 3NIYA 5JBDA 5A6AA 4UCFA 1PEZA 4BQ5A 1R7OA 3VVGA 1F4HA 1RH9A 1GHRA 1OINA 3W82A 1JZ3A 4MAZA 3EDEA 2PBGA 4P8VA 4CN6A 2HISA 3QHMA 3BMVA 2WLZA 3IJ8A 1M03A 2A3HA 3ZQ9A 1DHKA 3VMOA 1NWSA 4JFUA 2V5DA 4W8AA 2PWFA 4V27A 1E4IA 2XIIA 2WBKA 3TTQA 1V02E 1V03A 1IZJA 3ZJ7A 1ZBVA 4AZIA 4DWSB 3B8SA 2ZXAA 2OWWA 2FHBA 3GH5A 4GINA 2GFTA 3NJ3A 3VDAA 1CYGA 2Y8KA 1M04A 4D6IA 1EIBA 4GQQA 4MJ2A 1GJWA 3WDPP 1JDAA 3OB8A 5DMYA 2WVUA 1XSJA 2WC3A 5BROA 4YPJA 1YHTA 1KBBA 1HCXA 1NM9A 3KL5A 4QLLA 3VDHA 2BS9A 3BLKA 2V3FA 4MB3A 1HJSA 4HPGA 1H3GA 4HOXA 3VMPA 2JEQA 1M53A 1QI5A 1ZS2A 2WK2A 2ZUMA 3SCRA 3PZ9A 1FFQA 4AXNA 4AZBA 3AJ7A 3PZTA 3VDCA 2WHLA 5CPTA 4B16A 3AXIA 1B30A 3L2MA 2EEXA 4D6FA 1LWJA 3L4WA 1XYZA 4XZWA 1WAWA 4BQ3A 2YOCA 3FAWA 5A6JA 1R86A 3GBDA 4PMRA 2PBOA 4DWSA 3THDA 2Y5EA 1HJXA 3MUY1 3HIAA 1DWJM 2D1ZA 3GXIA 2ZUUA 1U30A 2V3EA 3WDIA 3VIOA 3SUTA 4GI6A 3GNRA 4W84A 2V38A 1HJWA 2WZHA 4UOJA 1LF1A 4Z2GA 1C8QA 2D0GA 1E6PA 3AZTA 2OSYA 5EMYA 2A3EA 2JEPA 2PC8A 2WSPA 4PMZA 2VX7A 2E0PA 3WUFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1W9B M;  1NAR A;  3W6M A;  3MV0 1;  4GI8 A;  1HVQ A;  1IT0 A;  2ZWZ A;  1V0M A;  3ZJ8 A;  2W5F A;  4F8X A;  1MQQ A;  1JD7 A;  4D1I A;  3UER A;  2IXU A;  2ZUV A;  5ABG A;  3BCD A;  1GVI A;  3EDJ A;  4QCF A;  3VNY A;  2Y2W A;  2W66 A;  2CHO A;  4F9J A;  3II1 A;  3WD4 A;  1JD9 A;  1TVN A;  4CN4 A;  1OIF A;  1EA9 C;  1E6Q M;  2WVV A;  1EDT A;  1MXD A;  1QHZ A;  2YDQ A;  4JHO A;  2V3D A;  4GI9 A;  3O9N A;  2YL8 A;  2XYL A;  4GPN A;  3SCP A;  4EK7 A;  5I79 A;  1E73 M;  3UET A;  2BVD A;  3KL0 A;  3WNK A;  1HNY A;  2AMG A;  3VIP A;  1GW1 A;  3IAN A;  2CER A;  1SR0 A;  1UOK A;  2WMK A;  1HVX A;  4HU0 A;  3VD4 A;  3SCN A;  1BGG A;  4W85 A;  1EQP A;  2X8O A;  5DO8 A;  2E9L A;  8CGT A;  1D3C A;  3O6A A;  1G0C A;  1LWH A;  3VKK A;  1KXV A;  3WNN A;  4D6G A;  2G3I A;  3ZT6 A;  2J79 A;  2EPK X;  2FDM A;  1UD5 A;  1SMA A;  1QOX A;  2XG9 A;  3RJX A;  3WEN A;  2ZOX A;  5A6B A;  1BYB A;  2DDX A;  4A3Y A;  4Z2I A;  4H8H A;  2W92 A;  3K1D A;  3E1F 1;  3AHX A;  2VX4 A;  2B31 A;  3WF1 A;  2CKR A;  4ZEN A;  1W1P A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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