4TYHB

Ternary complex of p38 and mk2 with a p38 inhibitor
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
348
structure length
335
Chain Sequence
PTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGHRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLAGYVATRWYRAPEIMYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLAQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords MAP kinase-activated protein kinase 2
publication title Discovery of substrate selective, ATP-competitive P38 alpha MAP kinase inhibitors
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 94
structure length 335
sequence length 348
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2014-07-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4tyhB02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4tyhB01
4ERKA 2BPMA 1Z5MA 3NR9A 4PPCA 3BV2A 3E63A 3MTFA 5A14A 3FZ1A 3CKWA 3F3VA 4QP7A 5LJJA 3TEIA 3FZTA 2WTKB 4RFYA 4ORKA 2Y4IC 3GGFA 4AUAA 4L46A 5HBJA 3UZRA 4C4HA 1Q8TA 2B4SB 2YM8A 3W8QA 4O2ZA 3VBVA 1OIQA 3FC2A 4GT3A 2UZDA 1JKKA 5CY3A 4IM3A 2F7XE 3P9JA 4QP2A 4L52A 2AUHA 3KULA 4D4VA 2HZ4A 4YJUA 3CP9A 4FV3A 3O23A 5JMSA 1DAYA 3S3IA 3NIZA 4IVCA 1UNGA 2IVVA 4BTMA 1CM8A 5GNKA 3KC3A 3D14A 2WO6A 3QZHA 4F08A 5IUHA 4M67A 1ZAOA 4JBPA 2BVAA 3IDBA 3QD0A 2JBPA 2JFMA 3GBZA 2W96B 4IZ7A 3ZLWA 3PIXA 2YM6A 4ANMA 1BUHA 4E5AX 1I44A 2YIWA 4UWYA 2B1PA 5AV0A 3ZEWA 3KXZA 4UWBA 5DEYA 5AIKA 3D15A 5ANKA 3UMXA 3LOKA 1JKSA 4LGDA 2UW3A 3HMIA 3VS4A 1Q41A 3HRBA 4L8MA 4B8MA 4EK8A 2I40A 5BMMA 5M53A 4L7FA 4D2VA 5BVOA 4BIDA 3FYKX 4DG0E 2GTMA 3L8VA 4AE6A 4EONA 1XH9A 5L2QA 4YJTA 1W8CA 4I0SA 5BYYA 5M4FA 5F1ZA 2JKMA 3TNPC 4FZAB 3WARA 1YDRE 4AZWA 4Z7GA 4FKOA 5CAQA 3ZLSA 4GFOA 4XV9A 5KX8A 3QD3A 5LVOA 3NW5A 1FGIA 4R8QA 3QTZA 4YZCA 3UMWA 3LPBA 3NYVA 4JXFA 2VZ6A 3TZ7A 5AUYA 4QMXA 2BAQA 4RWKA 1IG1A 2XYUA 4YJOA 2BTRA 4PV0A 3RM6A 4PX6A 4Y73A 3VO3A 4E4MA 4RWJA 2B0QA 2Q0NA 5AX9A 1KE6A 2FA2A 4FV9A 3FXZA 4BGGA 2VN9A 3DKOA 5DR2A 4BFMA 2OIBA 3AT2A 1YKRA 1DI8A 4XP0A 1PYEA 4TNDA 4UN0C 4WHZA 4CTCA 3T8OA 3Q6WA 2QOQA 1ZXEA 4ANLA 2UW8A 1H27A 4FOBA 5AP7A 5FEQA 4JG7A 4AT4A 4FR4A 4C4IA 4EBWA 3MESA 4I6FA 4ZZOA 2OBJA 2GQRA 4EJ7A 3H9RA 2XRUA 3PJ1A 4XP2A 4ZS4A 1OITA 2UZTA 1UWJA 5CEOA 4JQ8A 1PXPA 4TWOA 2QKRA 2GHLA 4BYIA 2VX0A 3V8SA 3R1YA 4M0YA 1JVPP 2R3FA 5CU0A 2RF9A 2VTHA 3PY0A 4G1WA 5IDNA 4PDSA 5KMMA 4ZLZA 2XNPA 5AADA 4FG9A 5A4LA 1SM2A 3P7AA 3BWJA 3IS5A 3FLWA 2DWBA 4JBOA 4PUZA 5CSPA 3Q4CA 5M57A 2ZVAA 4FKGA 4FKPA 4Y8DA 4BDFA 4DAWA 2FGIA 2WTKC 2ZV7A 2PSQA 3FMKA 4I5PA 4BR3A 3ET7A 5CZIA 3VQUA 3LW0A 1REKA 3BI6A 4BBMA 4FKVA 4IW0A 3ZMMA 4JBQA 2C6KA 3P4KA 5CVFA 4YJVA 4JI9A 5CU3A 4EZ3A 4EH3A 3VHEA 3E8EA 3Q32A 5HNGA 3OT8A 4QMLA 4F1MA 3UNKA 3LCTA 2GTNA 2JC6A 2OJFE 5CT0A 4W4XA 4FIIA 5HKMA 4G31A 2BKKA 2HCKA 2HIWA 3QRJA 5J9LA 2PMNX 3KF7A 4P7EA 4U44A 2PUNA 1MUOA 2VO6A 2BFYA 4I1ZA 5J95A 3JY9A 5D11A 1OKVA 5HX8A 3PXFA 2OU7A 4OT5A 3RPOA 4TT7A 1WAKA 4ITHA 3MY0A 4CD0A 4YZNA 2W0JA 2HY81 2R3NA 3BHTA 3QL8A 3VULA 2VX1A 5AAEA 3LIJA 4GT4A 1V0PA 3MDYA 4D1XA 1H0WA 3GP0A 2GQSA 3VF8A 4L3PA 3FI4A 2J5EA 4BWXA 2ETMA 2XK8A 4J99A 3DV3A 1XO2B 3PXQA 1V0BA 1YI3A 3IGOA 3PUPA 4DFNA 1AGWA 2IN6A 3F5PA 1QCFA 4V05A 3HMPA 3OTUA 3MS9A 3SV0A 3LHJA 5L3AA 4IDTA 4FKRA 1M2PA 1J7UA 1XH8A 3BBWA 3CJFA 3ORZA 1XBAA 3FZPA 2QNJA 3R8ZA 5IQGA 4QRCA 5CLPA 2RGPA 4WIHA 5EI6A 4NCTC 5FQDC 2HY0A 4HPUE 3QALE 3TZ8A 1W7HA 3A8WA 3D2IA 5M07A 1Q62A 3EB0A 4USFA 3CQEA 4LMNA 3WYYA 3IECA 4GIIA 4H1MA 3QHRA 5A6OA 5EDQA 4XV1A 3K3JA 4G5PA 3OHTA 2X0GA 3E64A 4O6EA 3ACJA 3QGWA 3ORXA 3ROYA 4F9AA 1RE8A 5TF9A 3RNIA 4DCAA 5DWRA 1F0QA 1FMKA 2H34A 2WEVA 2XCKA 3I7BA 3QRUA 3R2BA 2VNYA 3QWKA 4D1ZA 4DC2A 3KGAA 3AC8A 3QCQA 4OLIA 3LCKA 2ITUA 4UMQA 4XBUA 1O6LA 4AACA 3LFFA 3L8SA 4R5SA 1LEZA 1BI8A 1UNHA 5KE0A 4DFLA 5AR4A 3FLQA 3PVBA 1ZZLA 3PZHA 3BU3A 1OMWA 4PL5A 4QMOA 4F9BA 4MWHA 2V22A 2X2LA 3UNJA 5FEDA 4FZDB 2YM3A 4TXCA 3UE4A 2JITA 1ZRZA 5K3YA 2R3GA 4EOLA 3DQXA 1WMKA 3EL8A 1OPJA 2RFEA 4XLVA 2C5VA 1KE8A 4ZEGA 3ULZA 2WTVA 2XEZA 1Q99A 3LXPA 1OIUA 1MRYA 2P2HA 2ZDUA 3HLLA 2Y4PA 1FINA 4IAKA 3R83A 4B8LA 3VWAA 4OUCA 4J8MA 3OFMA 4FEWA 3CS9A 3EJ1A 3FPMA 2QOBA 1RDQE 3W2SA 5AP0A 4YR8A 3F7WA 5IA2A 2XVDA 4O0RA 5IA5A 1EH4A 2YCFA 5LXMA 3SVVA 2YERA 1WBSA 3KXNA 2G1TA 5FG8A 4AZFA 2J5FA 4JX3A 4O0SA 4CG9A 5IPJA 5AFVA 1OKWA 4U42A 3P86A 5M06A 1YHWA 4QMVA 3C51A 4DG3E 4H36A 3RK9A 3Q53A 4BCNA 4EC9A 2VO3A 2GNIA 1HCLA 2W5HA 2ITWA 3POZA 3Q4TA 3GCPA 4IB3A 4WG3A 3WZDA 2XP2A 2PMLX 5J5TA 4I5CA 3DXPA 3QZFA 1J91A 5ETIA 3IW5A 5KMKA 4MAOA 2OICA 4FNZA 5H2UA 4BKZA 2QR8A 4RJ8A 1J7LA 3VVHA 1ND4A 4YP8A 2J7TA 3RHKA 2P33A 4ANQA 3DFAA 4W8DA 4E6CA 1W82A 1I09A 3F5XA 5CWZA 3SRVB 5DR6A 4HYUA 5EG3A 3HRCA 4BHZA 3O17A 2JKKA 2AYPA 4RVTA 4C37A 2C3LA 3CGFA 3NDMA 4FV6A 2VUWA 3HRFA 4C7TA 3ZM4A 3MFUA 4E26A 4TZRA 1DI9A 5M55A 1QPDA 2J0MB 4YZ9A 5B7VA 3UOJA 2WU7A 3I79A 3VUMA 3W18A 3ZFMA 4Z3VA 5C26A 3OEFX 3SW7A 2R3QA 4OBQA 3G5DA 1B6CB 1GY3A 2JDTA 1ZY5A 5FTQA 1ZMWA 1H26A 4IVDA 5ACBC 4R6VA 3NZ0A 2GPHA 4UALA 1Q97A 2BRGA 4EH9A 4M3QA 5M44A 4F1TA 2HZIA 1IASA 3A60A 4D2TA 5EHYA 4RX9A 4TYJA 1WFCA 2XA4A 4HGEA 4JAJA 4L9IA 4WG4A 3H0ZA 4DFZE 4Z9LA 1ZYLA 2CN5A 1JOWB 3NUYA 3K5UA 4K8AA 1TVOA 1WVYA 3P79A 4NK9A 4CV8A 4A7CA 2PE2A 5AP2A 4NT4A 4D4SA 5E8WA 4N57A 1G5SA 3I6WA 4TPTA 4YBJA 3QXOA 3VW8A 1BYGA 3C4FA 3EQDA 2PZYA 5EDPA 3DB6A 3QC4A 2VWUA 3DBQA 3O96A 5D7VA 4D9TA 5L6PA 1RQQA 2RG5A 4FEQA 3BBTB 3NNVA 4LMUA 4QTBA 3VHKA 4ACHA 1JAMA 4F1OA 1FGKA 3Q60A 4G16A 4RBLA 5E8YA 4A4OA 4TTHB 1YXTA 4YZDA 4AFJA 3QCSA 3BZ3A 2BRHA 3QKKA 3CD3A 4MBJA 3Q2JA 3A7JA 3FXXA 3QBNA 1KE7A 2WOUA 3MFSA 4IIRA 5E92A 4C62A 2C68A 3MW1A 2B54A 2X81A 3GOPA 5AM7A 5FXQA 5D10A 5K5XA 1ZYCA 4FGRA 2O64A 4RRVA 3CTHA 3MFTA 3TACA 5CTPA 4EHGA 4EWQA 2WQEA 2OI4X 3EFWA 4FYOA 3DTWA 3ODZX 2JFLA 2PVFA 3VJOA 3ZHPC 5ETCA 5BMSA 4DTKA 4TWPA 2GMXA 2W4KA 3NCGA 3FI3A 4WBBB 3FPQA 4TWCA 4UWCA 4GVAA 5EYMA 2R0UA 3ZFYA 4M12A 4IBMA 4BN1A 4ZTNA 5HG7A 5M51A 3C13A 3IW7A 3LJ0A 3CXWA 5IISA 2X9EA 3UQFA 2UZWE 3HDMA 4U8ZA 2PVMA 4I5MA 4QP8A 4M69A 3FBVA 4FK3A 4FVQA 3LXLA 4USDA 4DYMA 4O0YA 2RFSA 1GZNA 3OW3A 4RVKA 3LLAA 2HZNA 2WKMA 5EK7A 4Y83A 4XG8A 3FI8A 2AC3A 5CX9A 2X7FA 2V5QA 3EL7A 3QTIA 4FSRA 3AXWA 2LGCA 4XNEA 4EJNA 2Y7JA 4ALWA 4KKEA 5H9BA 3ZU7A 3ZYAA 4XH6A 3VJNA 4B99A 5EM8A 2R7IA 4ASDA 3P0MA 3EQCA 3QZIA 2NNWB 2OGVA 4XG3A 3HX4A 1JPAA 5EQYA 3E3BX 4DG2E 4E6AA 3AC3A 4FV8A 3L9LA 5ICPA 4OAUC 4RJ7A 1P4FA 2R3PA 3ORPA 3NWWA 3H9OA 3Q04A 3OBJA 4NYEA 3O50A 3HECA 4FT0A 2BUJA 2Z02A 3BEAA 3N51A 3OCTA 3WF7A 4FIEA 4FIFA 4MNEB 4U80A 1IR3A 5AUWA 4AFEA 1H1SA 4LOQA 2YIXA 1TQPA 4ZJVA 1QMZA 4FIGA 1ZWSA 1YHVA 4KSPA 4YJSA 3LXKA 1GZKA 4XX9A 3FLZA 3KMWA 5AA8A 3V3VA 3EOCA 3TDVA 5LARA 1UVRA 4IADA 2B9JA 4JT3A 3ZUVA 5JSMA 1LEWA 4RIOA 4ACGA 1BL6A 1PY5A 2HW6A 1PXKA 2PPQA 3WOWA 2BHEA 1PMNA 3GCSA 2XKDA 3FEGA 5AEPA 2IO6A 2UVZA 2X2KA 3JVSA 4QPAA 4WD5A 4XV2A 1UKHA 5L2IA 4FEUA 5B2LA 3QQHA 4Z55A 4EK4A 4CFMA 5IH6A 5IMXA 3BLQA 5T6KA 4C3RA 5CQWA 2X8IA 3DNEA 4XUFA 4OTHA 3CCNA 5JH6A 2QOOA 3OC1A 2XNOA 4L67A 2HENA 4FT5A 1KSWA 4AW0A 4ENXA 2WMXA 1YW2A 3FXWA 3PXKA 5C4LA 2EXCX 3DU8A 2QD9A 4CZUA 3R02A 3QTXA 4UYAA 3C4CA 5AR2A 2C0OA 1VR2A 2OW3A 4PY1A 4IB5A 2QOIA 2XIYA 3JS2A 4BF2A 1FPUA 3QCXA 2R5TA 3HGKA 4XG7A 1GOLA 3QGYA 4K33A 3T9TA 4BCFA 4C38A 5AP4A 1Y57A 2WTCA 3VUIA 2PUUA 4FIJA 3FDNA 5AX3A 4FE2A 2CSNA 2UZOA 2VWBA 3VS5A 4CT1A 1H0VA 5EM5A 3UO5A 5IEVA 5IH5A 3HNGA 4MNEA 4MF0A 4YPSA 3DB8A 4Z7HA 1CKIA 3VAPA 1VZOA 3G6GA 4OW8A 5E8VA 4H05A 5CI7A 4I21A 4X2GA 3ORNA 1OVEA 4HYIA 4AGWA 3SA0A 4CGAA 3AC4A 4EOIA 5DR9A 4DF3A 1SYKA 4D0WA 2PVJA 3A2CA 3PYYA 4JL9A 2XUUA 4L00A 1FVRA 3N4TA 1ZYJA 3MYGA 3NUSA 4YO6A 5DVRA 2VV9A 5LMBA 1VEBA 3H4JA 2QLQA 1Q5KA 4UXQA 3SC1A 4ZTLA 3ZUUA 4AGUA 4D4YA 4DGNA 5K4JA 3P78A 4MXOA 3TV6A 4BTFA 5KCVA 4LUEA 3FKLA 1XJDA 2G9XA 3VS3A 3A7GA 1JSTA 5K4IA 2VGOA 5HG9A 5IEXA 1YHSA 5DN3A 2PVRA 3KF4A 4LRJA 4V04A 4C0TA 4F99A 2J0JA 2FSTX 4YSJA 4CMTA 2H96A 3VUGA 2ITYA 2PMIA 2Y6OA 3JR1A 2B52A 2Y4IB 3I5ZA 5HG8A 4X2FA 1ZYDA 5TE0A 2XMYA 3MI9A 3MV5A 3NS9A 4UB7A 1H25A 3U8WA 1Y91A 3ZFXA 2QVSE 1U5QA 2YJRA 2XBJA 3GB2A 5DPVA 3NUNA 2QHMA 4ZTQA 5KHXA 3DNDA 4EOMA 3W32A 1A06A 4DE4A 3D5WA 4K77A 4M97A 4BCKA 3HA6A 3P5KA 3RWPA 4H39A 4EC8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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