4U28 | Genus

Total Genus 86

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	86
sequence length	240
structure length	234
Chain Sequence	SRLELLPAVDVRDGQAVRLVHGESGTETSYGSPLEAALSWQRAGAEWLHLVDLDAAFGTGDNRELVRQVTEAMDIKVELSGGIRDDASLAAALATGCTRVNLGTAALESPEWVAKVIAEHGDRIAVGLDVRGTTLKGGGDLYEALERLDKEGCARYVVTDIAKDGTLQGPNLELLRNVCAATDRPVVASGGVSSLDDLRAIAELVPLGVEGSIVGKALYAKAFTLEEALEAVAQ

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Isomerase
molecule keywords	Phosphoribosyl isomerase A
publication title	Co-occurrence of analogous enzymes determines evolution of a novel ( beta alpha )8-isomerase sub-family after non-conserved mutations in flexible loop. pubmed doi rcsb
source organism	Streptomyces sviceus atcc 29083
total genus	86
structure length	234
sequence length	240
ec nomenclature
pdb deposition date	2014-07-16

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00977	His_biosynth	Histidine biosynthesis protein

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4u28A00

2H3DA 1C29A 3MHFA 1X7FA 1FCUA 3PAJA 3LHVA 1QPRA 3IGXA 1NSJA 1M6JA 1GWJA 1KM6A 1HUVA 4FNUA 3QMSA 3W6YA 3RLVA 1KV5A 4H6KA 4Q32A 4TX9A 1YYAA 1PCKA 1W8SA 3QSTA 1TPDA 4IMFA 4ML9A 5MHBA 4IMCA 4O14A 1ZY9A 2QAFA 5TIMA 3GZ3A 4JTJA 3DFTA 3NQ8A 3Q37A 3IVTA 3ZS4A 5J5RA 1KM3A 1EP2A 6ALDA 1K8XA 4IGHA 1AMKA 5FF0A 3W7LA 1GG0A 5LZLA 1R30A 2G5WA 4O16A 3RK8A 2E5CA 1W56A 3MBDA 3NPVA 4TIMA 4TU1A 5A5WA 4ADUA 1LP6A 1SO4A 2A85A 3NQMA 3Q2DA 3UWZA 4M19A 1H63A 2PE4A 5LHFA 1ALDA 1QCWA 1X1ZA 5BW6A 1JCNA 4QNEA 5D05A 3W7MA 3I7SA 1OVDA 3FIGA 2A7RA 4N02A 3W1RA 1G6CA 4PODA 4GE8A 4NNBA 4MLJA 1B4EA 4P2VA 4MYXA 2QCNA 1IIHA 1Z42A 4LNYA 5K2ZA 1OFAA 1TPWA 1PL9A 3PUOA 4HT3A 3W76A 3W2MA 2YYTA 4RZ6A 2V8ZA 1YTKA 2JGYA 2Y89A 5IBXC 1JQVA 4ZQCA 1GEQA 2W0UA 1UUOA 1DL3A 3TAOA 3M43A 5EL1A 4POCA 3B4UA 1GJPA 2RFGA 5BMWA 3LRKA 1W54A 1ZALA 3LHTA 1W3IA 4UTWC 2UV8G 2CW6A 4AB4A 1OX6A 5HUOA 1TPFA 3E02A 3TJXA 5A8GA 3G1VA 4O4VA 4AHOA 3LX9A 2ZA3A 4FNTA 3W2NA 1SUXA 2YSWA 1M7OA 3MJYA 5HWJA 4LTSA 1FXQA 3HG5A 1X1OA 4LC8A 4WUIA 1YPFA 1HFBA 3DFOA 1A53A 3UXAA 2BTMA 1HL2A 3PBVA 1TRDA 3SI9A 5D2VA 4M5PA 2PURA 2E77A 3QW3A 2CLFA 2RDTA 3SY5A 1VC4A 5D02A 1SQ7A 3DZ1A 4G1KA 1OX4B 4IQLA 4R34A 3I7QA 2FFCA 3ABSA 3L5LA 3I68A 1QOPA 4OV4A 2JGQA 3W1NA 4LT9A 1QMLA 1XBZA 1XM3A 4ADSA 3L21A 3GYEA 3QJAA 2Z0IA 1ONRA 2F7FA 1YDVA 4QITA 3S42A 3QH2A 3U2OA 2ISVA 2J6XA 2X1SA 3QMTA 4UUIA 1GYNA 1Q6RA 2BWGA 5CG7A 3C61A 1JCYA 3LV6A 3B0VC 3NG3A 3QF0A 3UYCA 1Q45A 4X9SA 1DHPA 3CTLA 2R8WA 2YFOA 4UCGA 2C14A 2H6RA 1JVNA 2FPVA 4FX8A 4Z08A 3V1PA 3N9RA 4DO5A 2VKZG 4UTLA 3LCFA 2QEZA 2YCEA 1NVMA 2GOUA 3MI2A 2Y85A 4QNWA 4RX0A 1H7NA 1XUUA 5HJLA 2FPTA 1ME9A 3B06A 4FO4A 1TPUA 3W7GA 5D37A 5C55A 1KM5A 2QCLA 5D2WA 1WX0A 1TTIA 1FWRA 1SPQA 1THFD 1F74A 5LGZA 4HNTA 3IIXA 1KM0A 5U7SA 4JTGA 4ADTA 3BGGA 4R7JA 2ALDA 2C3ZA 1SZNA 4JICA 1LTDA 2GUUA 4JX6A 3EEGA 3O07A 1OX5A 4FEZA 5F4WA 1XL9A 4LVDA 1KW1A 3H55A 5IBXA 2QR6A 1XC4A 3GAYA 3FYPA 3BW4A 3KVMA 3TCEA 2Y7EA 3THQA 4GBUA 4NU7A 1TPH1 1F05A 4MPQA 3TR2A 4I7UA 4XKYB 5KZEA 2VFHA 3W88A 3FKRA 1QPNA 3G3DA 1UB3A 4UTWA 5D38A 2ZCGA 4LV9A 3W1LA 2QCCA 4AMAA 3TJLA 1FXPA 3W7NA 4C1KA 2ZZ3A 1KFEA 1Z44A 3FJ6A 3CEUA 5LNWA 1G4PA 2NWSA 2Y63A 3BVJA 3W7IA 1GG1A 2CZFA 4FNRA 3SIZA 3L2IA 3M47A 5FEPA 3W1XA 3TSBA 3TIMA 2ZYFA 4J9JA 3STCA 4NX0A 4EWND 3MYPA 1VYPX 1AG1O 4GFSA 2FB2A 2CZDA 3OIXA 3IGSA 3LCWA 2BLEA 4JY9A 3VE9A 3TAKA 2C15A 1FQ0A 1XBVA 4BF9A 4CNPA 4A3UA 4LOCA 1SU5A 2VFEA 3TK7A 3RFAA 2CLMA 1DJQA 3W86A 4IMEA 3PM6A 2YXGA 3NGJA 3M7WA 5CPNA 1J2WA 3QM3A 3DKJA 4E0CA 3P61A 2QCMA 3WJWA 1GTHA 1VRDA 1Z41A 3LLFA 3TQKA 5D2TA 2W6RA 3GKAA 2WPBA 3C2OA 4TMBA 5LNVA 1F5ZA 3PB2A 3MHUA 5AHIA 5EBUA 2H8ZA 1JR1A 3W7CA 2V5LA 4WY0B 2ISWA 4XTIA 1TCDA 3GDKA 2NV1A 2WJZA 2ZZ4A 4GUGA 3F1QA 3HGJA 4AXKA 1QOQA 3PSVA 4DEFA 1M5WA 5C2XA 1D3HA 4WXYA 4NT0A 4YCOA 1JRBA 3P7YA 1I2OA 1LORA 3DFNA 4TMCA 5FEZA 1WYIA 3DU0A 4ICNA 2X1TA 4AWUA 1P1XA 2V2DA 2C16A 5TQLA 1ZAIA 2NX3A 1VHNA 5DY2A 4PL2A 3CIXA 4BR1A 1ZJIA 1JRCA 4DF1A 5K9DA 2X2GA 3A5FA 1LM1A 1TYGA 4PA8A 4JTKA 2GVGA 5I3IA 4GJ1A 5D32A 2ZBTA 2WNNA 2NZLA 1FWWA 3L0KA 3PBYA 4JIQA 3LI1A 5F2IA 4ZZ9A 3P62A 5G1TA 3ZFHA 3E49A 1MEHA 3C52A 3OBKA 4BWLC 3NZRA 3W7KA 4O8RA 3STFA 3DI1A 4GUJA 2A7PA 3PULA 3UY8A 1EP1A 3CEPA 3C2FA 3NL6A 4NJHA 3KAOA 2Y61A 1MXSA 1RVGA 2YX0A 1QO2A 5BRBA 2QCFA 3S5NA 1G67A 3A9IA 4YMZA 3G8EA 3G1FA 3A21A 4FNPA 5DXYA 1HO1A 2A5HA 4Z1DA 3W9ZA 4MOZA 3HGOA 1WDWA 3EXSA 4DO6A 3TQ0A 3MP5A 2NX1A 1U5JA 2VFDA 4DBDA 1YPIA 1L6YA 5SWUA 1DQXA 5DCBA 3OVQA 5DBTA 3NQGA 3BW3A 1S5WA 1AW2A 1H5YA 4O57A 4WOZA 1B9BA 3M5XA 4ZQOA 3BARA 4N6EA 1OG0A 1QO5A 3BO9A 3NL3A 3CIWA 3GXPA 4AHPA 4LVFA 3O05A 4JX4A 4MY1A 2V2CA 2DZWA 3N73A 3PC0A 2ATMA 4O28A 4BI7A 1IXOA 1VZWA 1L6WA 4A2RA 3W74A 1RQBA 3ABQA 2O7QA 1EUNA 1WV2A 3P8IA 4NQ1A 3UD6A 1Q3NA 4M6VA 4NJIA 1LRNA 3HOJA 2B7PA 5L6UA 3UY7A 3W87A 2ZRVA 1SW0A 3M5ZA 3EX3A 2TMDA 1UJPA 4OWGA 1KFJA 3W1QA 1B4KA 3NQ7A 4OHQA 3QFEA 3PR2A 5DLCA 4HSNA 2FIQA 1TPC1 1ADOA 1WOAA 2ZZ6A 5HWNA 4DF0A 3KVLA 4GXMA 1OF8A 5L9FA 1TTJA 2DORA 4O1BA 3NL5A 4MFEA 1SW7A 3DI0A 1DBTA 2B7OA 3IIOA 4KWVA 2QCGA 1SZFA 1XDLA 4BI5A 2E6YA 5J5DA 3LTYA 2VEKA 4DELA 5C54A 1GVQA 2C19A 4XTDA 4S1FA 1AW5A 1W5QA 5EKYA 3T7VA 4RKAA 1OYBA 4M6PA 2X30A 2FPYA 2ZTKA 3EB2A 5AHEA 3LI0A 3RMJA 1K7EA 1VLWA 3L68A 4N9EA 3W22A 4NXKA 3WFAA 1S5VA 1W0MA 4IOTA 5FESA 3HB9A 3LHYA 3EX6A 2DZXA 1H50A 2C13A 1P0NA 1VJIA 4IX2A 1LLZA 3BG3A 2A1YA 5KMYA 3TW7A 3PF3A 1G4SA 3S1VA 1VHCA 3NZ1A 4N9BA 4QSHA 2WNQA 4XWUA 4JDYA 5G2HA 4BWLA 3MYOA 2A6LA 4IXHA 4O0KA 3W84A 3M1ZA 1YXCA 3B03A 1OK4A 1JULA 1R46A 3LXBA 3PWAA 4HIBA 4LC6A 4WZHA 4RZ4A 5D33A 3LB0A 5FEWA 3E12A 2GVJA 1C9DA 2CLOA 4K6AA 4R33A 4JTSA 3G1YA 4ZL1A 1GVSA 1SFLA 3ZWTA 3HG4A 1GT8A 3PBWA 3O16A 2FDSA 3EWUA 1QR7A 5EY5A 1TJRA 4RXFA 2J9XA 3TDFA 4K8EA 3EWXA 1EPXA 1RQEA 1YXDA 4OGZA 3T44A 2GJLA 3HIJA 2DZTA 3TNOA 1VQTA 3ZR4A 1VCVA 1PV8A 3FKKA 2VELA 3FYOA 1KA9F 1UASA 1F73A 4N6FA 3SFKA 3OVPA 2W79A 3NOEA 1I45A 5H91A 4QJ1A 1ZFJA 1L6SA 4A21A 3FOKA 4MKNA 2VXNA 3EXRA 3B0PA 2CLEA 1ZAJA 1LOQA 4IX0A 4UFIA 1LBFA 4XBKA 2DZSA 1WQ5A 3KHJA 1A5AA 1QFEA 1SZGA 3IVSA 3L65A 4K7VA 4NJGA 3RLUA 4EF8A 1E51A 4MFDA 2VENA 3S1UA 3UWQA 1KTBA 3TUUA 3W7EA 2ZZ1A 5F2GA 5G4EA 4O4WA 1GZGA 2YW4A 2WSRA 2H90A 2OMAA 3W7OA 4LS2A 3LBCA 3B8DA 1IXQA 4WY0F 3WJYA 4OT7A 1GVFA 2ZRZA 2OCZA 3IVUA 1A5BA 5LKYA 1KLZA 2WOQA 4Y96A 3SJ3A 3TXVA 4LY8A 2R94A 2Y7GA 3S1WA 1ZHAA 3OA3A 1FBAA 3B04A 3I6RA 1H51A 3G1SA 5KTLA 3R13A 2DP3A 5HR6A 3BLFA 2F84A 1MZHA 2C6QA 4AHQA 1FWTA 4JTTA 1OFDA 4N4PA 4Z1BA 4LVGA 3WJZA 3HQ1A 1QNVA 1H7XA 2NUYA 3P80A 2DZUA 3M0ZA 1KM1A 3AO0A 4U28A 1NAL1 5I3FA 4O50A 1VLIA 2G96A 2DZPA 3C6CA 1JCMP 3TSMA 1AL8A 2RKXA 3M16A 4GUFA 1EWEA 4BI6A 5LNRA 4O52A 1OYAA 3IIZA 2E5BA 2V9DA 2ZRYA 4GNJA 4UTHA 3NQAA 5K4ZA 2OT0A 1FY6A 4YCPA 3I65A 4ORIA 1K3UA 4K36A 1I8JA 3MBFA 4N9CA 5AYZA 3EWWA 1EEPA 2ZZ5A 4JTIA 4HN4A 4OBTA 3W07A 4NX5A 2VEPA 3C0JA 2GPTA 3TFXA 2V81A 5CGQA 1C8VA 4NJJA 2WKJA 4ONVA 4JEQA 4IPIA 2ABBA 4HKPA 2PC4A 1W1ZA 2QUVA 3S1XA 1QPOA 2H8XA 3NNTA 2Y6ZA 4UFHA 4PTNA 1FDJA 4BK9A 3O63A 4FX7A 1ICPA 1XI3A 2A7NA 5E93A 2YGYA 3N14A 5AHLA 1NF0A 1UUMA 1T8XA 3HG3A 3HPSA 4MZ1A 4FNQA 4K8HA 3OHIA 3JS3A 4WX2A 1D9EA 1G7VA 3FA5A 4JTHA 1EIXA 3RF9A 4UMCA 3YPIA 1TQJA 3D0CA 1KFKA 4WD0A 1FCBA 4UFKA 2OX1A 4UMAA 2R14A 1TO3A 4ORMA 3NQFA 2P1FA 1ME7A 1FCQA 2WSQA 3G1XA 3WK2A 3MUXA 2E6DA 4CCDA 3KX6A 2B0MA 3STGA 1YDOA 1H60A 4IPJA 4P61A 3FS2A 2J88A 3R2GA 4CQ9A 4YWIA 3MMTA 3GVGA 1K02A 3A22A 3KRZA 4M7TA 4CNOA 2TRSA 2WSYA 2ZRUA 1TPEA 2IQTA 1IIGA 3QC3A 1X6UA 3TC6A 5HQEA 3NPXA 3GDMA 1OFQA 1BEUA 3PG8A 2CZ5A 4MJMA 5BOOA 3W23A 5C5YA 2NUWA 4UTMA 1HTIA 2JBMA 2Y88A 3P5ZA 2GVLA 3BW2A 3M9YA 3HJZA 1OHLA 1LOLA 3DAQA 1YXYA 2Q8LA 3LERA 4TR9A 3BLIA 1U83A 4QIUA 1WAUA 1OFBA 3FJLA 1H1ZA 5KINA 4MIMA 3TU9A 1W5NA 5G2IA 3N34A 1ZENA 5CPMA 3TSDA 3W71A 2BZNA 4OV9A 2QUTA 1XFBA 1VR6A 3GAKA 1H7PA 3BPWA 4MZYA 1JCLA 1A50A 3A5VA 5CKSA 4UNLA 3HBLA 4E2BA 2LLEA 5EYWA 4PCFA 4O0ZA 3N2MA 3TMQA 5KSWA 1HG3A 4CLMA 1QAPA 3GNDA 4MY8A 3O06A 2QDHA 3S6DA 1EA0A 4Z0SA 4U4MA 1H61A 3ABOA 2HTMA 1LRTA 2CLLA 5C6MA 3VE7A 3TXZA 1F6PA 5AC7A 4DBEA 2J24A 1PS9A 1ME8A 2EKCA 4AF0B 3HG2A 2E68A 3E0IA 4HHPA 3NQEA 3P5YA 1DORA 5T26A 1MSSA 1VYSX 2G95A 4WOQA 4O19A 4WJEA 3CT7A 4Y8FA 4FB7A 2H3BA 1DKWA 2GQ9A 4UMBA 1H7WA 1KM4A 1P5BA 4DQWA 1O5XA 4O13A 2C1HA 2QJHA 4ZQPA 3DXIA 4O15A 3TROA 1XBXA 4KFNA 1EUAA 3JR2A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4U28A

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