4U3AA

Crystal structure of ctcel5e
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
304
structure length
292
Chain Sequence
AVDPFEMVRKMGMGTNLGNTLEAPYEGSWSKSAMEYYFDDFKAAGYKNVRIPVRWDNHTMRTYPYTIDKAFLDRVEQVVDWSLSRGFVTIINSHHDDWIKEDYNGNIERFEKIWEQIAERFKNKSENLLFEIMNEPFGNITDEQIDDMNSRILKIIRKTNPTRIVIIGGGYWNSYNTLVNIKIPDDPYLIGTFHYYDPYETWGTQEDMDTVVRVFDFVKSWSDRNNIPVYFGEFAVMAYADRTSRVKWYDFISDAALERGFACSVWDNGVFDMAIYNRDTRTFDTEILNALF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Endoglucanase H
publication title Biochemical Characterization and Structural Analysis of a Bifunctional Cellulase/Xylanase from Clostridium thermocellum
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium thermocellum atcc 27405
total genus 119
structure length 292
sequence length 304
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2014-07-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4u3aA00
3AIRA 1QNPA 4TTUA 3ZO9A 5I2UA 4U2ZA 2WVUA 2WZEA 3I3DA 1DWGM 1UQZA 3VO0A 3WL1A 4ZXOA 1RD6A 2OWWA 1O6IA 1CYGA 4D6JA 1CNVA 3WNLA 2VURA 8A3HA 1PIFA 3WIJA 3CUHA 3VD7A 4UOJA 1BSIA 1A47A 5GPRA 2Y5EA 1W32A 3FY1A 1OGGA 1H1NA 4FLOA 1GNXA 1MWOA 1UD8A 4AZCB 3ZQ9A 1V6WA 2CBUA 3U7BA 5EBAA 3CBWA 1FHDA 4PMUA 2D23A 3EDJA 4V28A 2CERA 4P8VA 1BG9A 1JNDA 2PWGA 5D9PA 1K9EA 1LL4A 2BVYA 1E4LA 3PZNA 2WHLA 2XPKA 1L0PA 1B3VA 2ZE0A 3D3AA 3OB8A 1PEZA 3GBDA 1UD4A 3AJ7A 3KWXA 1QW8A 2D0FA 3N18A 1V0LA 3WEMA 1E0WA 2D0HA 2PBGA 4P8UA 4OOZA 2VO5A 1HJWA 5CGMA 3ZSSA 2IXVA 4HA3A 1U30A 4NF7A 1GORA 4PTWA 2PWFA 4JKKA 4J3SA 5AC5A 3ZJ8A 3MMUA 3TOPA 1FP8A 3CO4A 3EYPA 1US2A 2WMGA 1RPKA 3TTYA 1E56A 2IXUA 1R7OA 1FFQA 3A3HA 3WQ4A 1OGSA 5D9OA 2CBJA 1XH0A 2A3HA 2E8YA 3GH5A 4YHEA 4H8HA 1QHPA 3GYCA 3AXXA 1OT1A 1XGZA 4EKJA 2WSKA 3BAJA 2BVTA 3BCDA 3EMQA 4MB1A 2BXYA 2Z1SA 4W7VA 2FGLA 3OZOA 3THCA 4GZIA 2V38A 2BHYA 4ZE4A 2WVTA 5CPQA 4W8BA 1KBBA 3WFLA 4GQRA 4GO9A 2DT0A 5D8ZA 5FL0A 3ZOAA 4UQ9A 4TTGA 1ZBKA 3IAQA 3OBAA 1UA7A 2GK1A 2ESCA 4GPNA 3AYSA 2DH3A 1XC6A 1MXGA 1TUXA 2DSUA 3SCVA 4AD4A 1E6PA 1FH9A 4OJYA 4PEEA 5A6KA 3MUIA 4GINA 1ISXA 1HX0A 1AQHA 4LGXA 2ZIDA 2ZUWA 4W7WA 2WK2A 3TTSA 1CGYA 1ZJBA 4P7NA 2G4FA 2EBNA 1LJYA 3GZAA 2XWDA 4H7VA 4N42A 2XSAA 3VDBA 4W89A 3TP4A 2CHOA 3AQUA 4AD5A 3AHVA 2EPMX 4CN6A 4CN1A 2JF6A 1V3KA 2HISA 3G6MA 3ARTA 3L4VA 3MUZ1 4LYPA 4WK9A 2VJXA 4HU8A 4PTXA 4DM2A 3W26A 4FLSA 1UZ4A 4OZOA 1EOKA 1CENA 1H4PA 1UD2A 1U33A 1VB9A 3OGVA 4D71A 3RDKA 4PSPA 4PMNA 5BXTA 2ZXBA 3MV11 1WKYA 3A6OA 3I3BA 3VOCA 3WUFA 3ARRA 2FHFA 5CXPA 3MUY1 3W37A 2PWDA 1E5NA 3BAWA 1KQZA 4E8CA 3AI0A 3WNKA 5D9MA 3OG2A 3BXWA 2E4TA 5I6SA 4J3XA 3QGVA 1GOQA 4XZWA 2J47A 1TMQA 8CGTA 2PF0A 3VTRA 1P6WA 1G1YA 2J8FA 1E55A 1PX4A 3ZJ6A 4IPNB 2W67A 3ALGA 1VF8A 4HZ6A 4KMQA 1CXLA 1W1YA 2PC8A 1HF6A 4KH2A 3QHOA 4GI9A 1QPKA 3ARWA 1R7AA 3WD1A 3WD0A 3WNOA 1JXKA 1JL8A 4KRTA 5E0FA 4S3JA 2XM1A 4MDPA 1K9FA 3WELA 2WB5A 3CZKA 4MJ2A 3AIQA 4MPKA 4GXPA 5DF0A 1C90A 2VCAA 3UERA 2UWFA 4JCLA 4AIUA 3D5HA 1YHTA 1ZU8A 2DDXA 1E4NA 4MDOA 4L4PA 1B3XA 3MV01 4J3UA 1MFUA 4AD1A 1BF2A 3AIBA 4EE9A 5F7UA 2E0PA 3GXMA 1WZKA 2WKLA 2WMIA 1HT6A 2WZHA 1H41A 1CGXA 3K8MA 3SCPA 4JFTA 3U5UA 5JIPA 2VVNA 4JKLA 3WQWA 4D6EA 1HP4A 3BAXA 4W86A 1PIGA 1HN1A 2YDRA 3WMCA 1E1EA 2VX4A 1HVQA 1PZ2A 1J0JA 3NYDA 4JHZA 2YA0A 1R87A 4UFJA 5ABGA 1EO7A 1J0IA 4XZBA 4EK7A 2GJRA 3RIKA 1US3A 2CCRA 4D6IA 2WCAA 3VX1A 2ZUMA 2JALA 1MQPA 1TZ7A 1VJSA 3L2MA 4TVCA 2WYSA 1W3LA 2PWHA 2J25A 1FA2A 3S6TA 4BQ4A 1BAGA 4UR9A 5DT7A 3CHEA 2W62A 2J7FA 2ZUNA 2V3GA 3VD5A 1NQ6A 3NUKA 2OSYA 3N04A 3VGEA 1BTCA 3DYOA 3AFBA 3WH9A 3OZPA 1UUQA 2EO7A 1IT0A 2E9LA 1WDSA 4HPHA 5I24A 1C3FA 1C92A 1R8LA 3OIHA 7A3HA 3N9KA 5BRPA 1UH2A 1NWUA 4QLJA 2VZOA 3AMGA 1V3MA 2DSVA 3W29A 1XSIA 1UR9A 1S46A 3BMWA 5A2BA 4XX6A 2C8NA 4X9YA 2JF7A 4PMQA 3SCWA 1W9DM 1OWQA 1UZ1A 4S3KA 5I77A 3EDFA 4PUEA 4U33A 2A3CA 4CCCA 1JYNA 4U2YA 3II1A 1M04A 4BQ5A 3EBVA 2XFYA 1UWUA 1JZ8A 2VT0A 4BCEA 2WHKA 1UKQA 3G6LA 4IUGA 1OCQA 1GOIA 2O9TA 3WD3A 3WH5A 1UWRA 4HOWA 1EOMA 3AMLA 1E4MM 1C93A 1E43A 6A3HA 4MNKA 1VBRA 5DT5A 1E9LA 1BYBA 2VX7A 1E72M 1ISYA 3WDIA 1W91A 2VUYA 3WDRA 1ESWA 4GQQA 1DHKA 3AMDA 2VZUA 2J7CA 2EXOA 4UFIA 3CLWA 4HMEA 1UR2A 2BFGA 3A4AA 3DHUA 3AIUA 4H41A 4CGTA 5DMYA 1HJXA 4ACYA 4JIEA 1J18A 3VIPA 4CD4A 3BGAA 1QBAA 1PX3A 5I79A 1W3HA 3B8SA 2G8ZA 3JUGA 5I3DA 4PBGA 4JFSA 1GONA 3ZT5A 1W9PA 4MJ4A 1TVNA 3SUSA 1AQ0A 5A6BA 2VTFA 2VZSA 1V0NA 4UFMA 3MKKA 3W0KA 2XUCA 4JFUA 2BV9A 1IZKA 1XCXA 1B3YA 1GQKA 4HA1A 5AY7A 3VMNA 1HXJA 1QI2A 4F8XA 1ZL1A 2X8RA 1MYRA 2DSKA 4FLRA 3W24A 2WZIA 2OYLA 4X0NA 2J7EA 3WBAA 3AHZA 3KL0A 1E6ZA 1LG2A 4DWSC 1MVYA 2J8GA 4CCDA 3CGTA 2V3FA 3GXIA 3U57A 4CD7A 5HPCA 1NARA 1HJVA 5I5RA 4HOZA 1ZS2A 2XSBA 3W81A 4P7LA 2YJQA 9CGTA 1EO5A 4HP5A 3AROA 2DH2A 4YHGA 1PAMA 1WCGA 1VEMA 3FAWA 3PN8A 4QCEA 4ACZB 4NSBA 4UCFA 3KZSA 4IISA 5ABFA 1XRVA 2EEXA 4GIAA 3O9NA 2CKSA 4HOXA 4P7RA 2DT2A 3FXYA 4JL2A 5ABFB 3N17A 2VCBA 2PI6A 1BG4A 2VR5A 2XIIA 1GCYA 1GHRA 1K9TA 3AS1A 1TFVA 7CGTA 4J28A 4UOQA 5A3HA 1AVAA 3T08A 3A47A 4PMXA 2DEPA 4CCEA 2ZXAA 2YA2A 1JYWA 3CHCA 3U5YA 1MQQA 5A8QA 4OKDA 3AXIA 3M46A 3CUJA 3VDHA 1PBGA 1KXQA 1V03A 4LYQA 1GQIA 3NCOA 2E9BA 4UZSA 3WFZA 3KEHA 3RCNA 2EJ1A 2XGBA 3DYMA 1ZBCA 3ALFA 4J3VA 3O2LA 5JBEA 1CXEA 2MANA 3WF3A 1CIUA 4AIEA 4X0VA 1M03A 4DM1A 2CIPA 3W6MA 3ECQA 4D6HA 1JIBA 2WVSA 1Y7VA 2GVYA 4AZIA 3O6AA 1Q4NX 3CUIA 3WH7A 3FW6A 3AMCA 1R85A 3EDEA 3W82A 2Y4SA 3AHYA 1J9YA 5CJ5A 1JD9A 1B0IA 1UWSA 3IK2A 1QI4A 4TXEA 4C7DA 4F9DA 3CMGA 4WJXA 4M56A 3CZJA 3AMKA 4Q22A 4F66A 4H04A 1HJQA 1XD0A 4W93A 4UFKA 3N15A 2BXZA 4D6DA 1VFOA 4OIFA 2FH6A 2WCSA 2W61A 3VGBA 4UTFA 1J0ZA 5EMYA 4ZEPA 2YL6A 2NT1A 1UR8A 4JHOA 3N1AA 5IDIA 1UOKA 1W1TA 2XVPA 1R86A 4PMDA 4PSRA 1HVXA 3GXFA 4CU8A 6TAAA 3ZT7A 1ISWA 1X1NA 3VM5A 4E4PA 3EDDA 4D1IA 3SEPA 4MNLA 4FLQA 4W5ZA 5FIPA 2OSXA 3VGGA 3W38A 2C0HA 1V6YA 5IXEA 3CMJA 2W66A 1RP9A 3F5KA 5GNZA 3ZJKA 4LPCA 2F61A 5CQ1A 1D7FA 5A8NA 1OIMA 1UD5A 1G5AA 3HU7A 3WN6A 3SIMA 2WC4A 2FH8A 5JIWA 3HJEA 1GUVA 2VL4A 3GH7A 3ZR5A 1LL7A 3U7VA 4H8VA 2J7HA 1JZ6A 2YA1A 3EDKA 3PZMA 3IJ9A 2DQXA 4J7RA 3BAIA 2GK1B 1H5VA 3WF4A 3WH6A 5HOSA 1V3IA 1WNOA 1EGZA 2WXDM 3T0DA 1H2JA 1QHZA 3UESA 1PZ3A 1V02A 1JYXA 1BYCA 1JFXA 2YL8A 5I0DA 4XV0A 4C7FA 3AZRA 3K1DA 4CUCA 2WMFA 3GH4A 2CKRA 3HMCA 4PMRA 5JBDA 1C7SA 3MS8A 1TVPA 4HMCA 3FN9A 3VIMA 5M3WA 2WLYA 3WUEA 3POHA 1XH2A 1E70M 4F79A 2WW5A 2CETA 4B9YA 2W92A 4UFLA 4KRUA 5C71A 1FHLA 4IPLA 1WP6A 2WNWA 5A6BD 1HL9A 4E2OA 3T0AA 5BXRA 3F5LA 3WQ5A 1V3HA 3A4WA 4DWSD 1KGXA 5C70A 1SYTA 3AOFA 1EDTA 4AWEA 4M81A 3FAXA 4CD6A 3SCNA 1RP8A 4GZJA 1E71M 1UA3A 4W87A 5ABEA 1V3JA 1CGWA 4N0RA 4W88A 3WQ8A 3NIYA 1Q6CA 2ZWYA 3K8KA 3VD4A 1V6VA 2ZWZA 1BHGA 2CBIA 3ARYA 4PUDA 1FH7A 1D2KA 2AMGA 2DT3A 1NWRA 4AZ5A 3T0BA 5BWFA 1KQYA 1H11A 4FMVA 3UETA 4CKQA 2VRJA 4MB4A 5CGTA 1E6SM 1GOMA 2FDMA 4NRRA 3WD4A 1UR4A 3WSUA 4CVUA 4TX6A 3GNOA 2V5DA 1NH6A 4B16A 4R27A 2PWEA 1BYAA 4PMOA 4CU7A 1MXDA 1FOBA 3TTOA 1OD0A 3SUTA 1UD6A 1ECEA 5A6LA 5A2CA 4DUWA 1E0VA 2CYGA 2YLLA 5E09A 2AOSA 4P7OA 1V08A 3L4TA 3VD3A 2VNCA 1VAHA 2BS9A 1UH4A 3OGRA 1BYDA 3CUFA 4JZ5A 4UFHA 3CPUA 1KB3A 1GJWA 2GJXA 4YN5A 3T2PA 5BYWA 3ZT6A 6CGTA 1KXVA 1M7XA 1VIWA 1DWJM 5EFFA 5LA0A 2WBGA 2GSJA 4GKLA 2D2OA 1HNYA 4MB3A 1DP0A 1MFVA 3VKKA 4CVWA 3T2QA 5E6YA 3AZTA 4HU0A 1JXJA 2QHAA 3VIOA 2ZX7A 4HA4A 1A3HA 3CIVA 1H3GA 4GI6A 4HPGA 5KZ6A 4PTMA 2J75A 3IAPA 2WMIB 3VIIA 4UQCA 2OLHA 1WB0A 5IHSA 3BLPX 1B3WA 3K4AA 4PCTA 2W5FA 1B31A 2VQUA 1QNQA 3AS2A 2X1IA 1XSJA 4ZE5A 1HKMA 2G3MA 3SUWA 3ZR6A 1SMAA 3FNDA 5A6JA 4J3TA 3SURA 4W8AA 1LL6A 2BY3A 4BZYA 4F9JA 1QI3A 4JKMA 1ZBVA 2XYLA 1I75A 2A3BA 1PPIA 3WNMA 4JFVA 1HL8A 3N11A 1HJSA 2ZICA 1VFUA 1WPCA 3VNYA 4KGJA 4ZFMA 1BVNP 1V0KA 1SFSA 4LQ1A 4AC1X 4GO8A 3WUBA 5A69A 3QHNA 2QMJA 1WDQA 4PMVA 2NSXA 4ATDA 1N82A 2WM0A 2DIJA 1QI5A 1EHAA 3SCOA 4PMZA 1JZ5A 5ECUA 3PZQA 3SUUA 7TAAA 2XWEA 3MO4A 3EMCA 1SMDA 1HKJA 3PTKA 4W7UA 2X0HA 3B9AA 3K8LA 3ZM8A 4CN4A 5I78A 4EAMA 1CGTA 1G01A 4JL1A 3ZSTA 2V3DA 4WSKA 4ML4A 2WHMA 2DPEA 2FGZA 2B31A 2YLAA 2Y8KA 5FD0A 3PTQA 1W9VA 1J0YA 3KE0A 4P7QA 1B3ZA 3PZUA 4P8XA 3MUAA 2O9OA 3LPPA 4WF7A 2YBTA 3VIJA 4RL3A 3RM4A 3NJ3A 3AIVA 3PBGA 1VJZA 2W91A 3B9EA 3BCFA 1OIFA 1E3ZA 1KXHA 1E0XA 2CEQA 2GDVA 5A8OA 1J0HA 1OB0A 1J10A 3PTMA 5GNXA 3QOMA 3SUVA 1KWGA 1NP2A 1OBAA 3BMVA 3TONA 1I1XA 1QI0A 4GI8A 1WDRA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3AIR A;  1QNP A;  4TTU A;  3ZO9 A;  5I2U A;  4U2Z A;  2WVU A;  2WZE A;  3I3D A;  1DWG M;  1UQZ A;  3VO0 A;  3WL1 A;  4ZXO A;  1RD6 A;  2OWW A;  1O6I A;  1CYG A;  4D6J A;  1CNV A;  3WNL A;  2VUR A;  8A3H A;  1PIF A;  3WIJ A;  3CUH A;  3VD7 A;  4UOJ A;  1BSI A;  1A47 A;  5GPR A;  2Y5E A;  1W32 A;  3FY1 A;  1OGG A;  1H1N A;  4FLO A;  1GNX A;  1MWO A;  1UD8 A;  4AZC B;  3ZQ9 A;  1V6W A;  2CBU A;  3U7B A;  5EBA A;  3CBW A;  1FHD A;  4PMU A;  2D23 A;  3EDJ A;  4V28 A;  2CER A;  4P8V A;  1BG9 A;  1JND A;  2PWG A;  5D9P A;  1K9E A;  1LL4 A;  2BVY A;  1E4L A;  3PZN A;  2WHL A;  2XPK A;  1L0P A;  1B3V A;  2ZE0 A;  3D3A A;  3OB8 A;  1PEZ A;  3GBD A;  1UD4 A;  3AJ7 A;  3KWX A;  1QW8 A;  2D0F A;  3N18 A;  1V0L A;  3WEM A;  1E0W A;  2D0H A;  2PBG A;  4P8U A;  4OOZ A;  2VO5 A;  1HJW A;  5CGM A;  3ZSS A;  2IXV A;  4HA3 A;  1U30 A;  4NF7 A;  1GOR A;  4PTW A;  2PWF A;  4JKK A;  4J3S A;  5AC5 A;  3ZJ8 A;  3MMU A;  3TOP A;  1FP8 A;  3CO4 A;  3EYP A;  1US2 A;  2WMG A;  1RPK A;  3TTY A;  1E56 A;  2IXU A;  1R7O A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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