4U5IA

Complex structure of mutant ctcel5e (e314a) with xylobiose
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
305
structure length
295
Chain Sequence
KAVDPFEMVRKMGMGTNLGNTLEAPYEGSWSKSAMEYYFDDFKAAGYKNVRIPVRWDNHTMRTYPYTIDKAFLDRVEQVVDWSLSRGFVTIINSHHDDWIKEDYNGNIERFEKIWEQIAERFKNKSENLLFEIMNEPFGNITDEQIDDMNSRILKIIRKTNPTRIVIIGGGYWNSYNTLVNIKIPDDPYLIGTFHYYDPYEFGTWGTQEDMDTVVRVFDFVKSWSDRNNIPVYFGAFAVMAYADRTSRVKWYDFISDAALERGFACSVWDNGVFDMAIYNRDTRTFDTEILNALF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Endoglucanase H
publication title Biochemical Characterization and Structural Analysis of a Bifunctional Cellulase/Xylanase from Clostridium thermocellum
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium thermocellum atcc 27405
total genus 117
structure length 295
sequence length 305
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2014-07-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4u5iA00
2TAAA 2D0HA 1G0CA 1UA7A 1VENA 2BXYA 3VILA 5I3DA 2CERA 1NP0A 1ZB5A 4HTYA 1LL7A 1V3MA 3UR7A 3N12A 2PWGA 2JIWA 2VC9A 1UKPA 4HP5A 2EPLX 4W8AA 2W63A 1V6XA 4MNMA 3ZOAA 4JFUA 3AISA 1TMQA 2WNWA 1UWTA 4Z2HA 1IV8A 5GPRA 1LL4A 3AQUA 4JHOA 4HU0A 2UY5A 2ZUUA 3W82A 4KWUA 5A8MA 3IJ9A 3LPFA 4YN5A 3WD3A 4JIEA 2G8ZA 2OYMA 2PI6A 4TUFA 1SMAA 3VDHA 4FK9A 3ECQA 5AY7A 1HVXA 2E9BA 1GJUA 3AMGA 4WLCA 2C0HA 1LLOA 4B3KA 2CKSA 2WYSA 2VJXA 3NIYA 3OGVA 2GJPA 3MKKA 1BG4A 3IJ7A 1UZ1A 4H8VA 2BY0A 1EGZA 1G01A 1UWRA 2O9PA 3OZOA 2DDXA 4AD1A 4J27A 5DF0A 3A47A 1WAWA 1J0HA 4UFHA 3GBDA 1Q6EA 3VU2A 4E8CA 5D8WA 1KR0A 1OD8A 2B31A 2GK1A 2YA0A 2C8NA 2X8RA 2WMJA 1E55A 1KGUA 3CTTA 1ISVA 2WSPA 4LPCA 3L4XA 4GI8A 3WFZA 5CPTA 1HKKA 1XH2A 1XCXA 4PMOA 3SCPA 1MQRA 2HVMA 3ARVA 1G5AA 2Y2WA 1V3JA 2OWWA 4JCLA 1W3HA 4ZE5A 3VMOA 4EK7A 3WQ4A 1US3A 1FH9A 2WLZA 3WL0A 4P8UA 1OGBA 2QMJA 4TVDA 8CGTA 5F7UA 3S6TA 3K8KA 2J25A 4Y7EA 3T08A 1KXTA 5EB8A 2EPKX 1Q6DA 1WDQA 5M3WA 1DWGM 4GZJA 5FIPA 4ACZB 2GVYA 2ZE0A 2D24A 3ZT5A 1UOKA 1ECEA 1ZJBA 1US2A 2DSUA 5DEZA 4W85A 5I0DA 4Z2GA 1EDTA 3ZIZA 2AOSA 1KWKA 4OZOA 1X6LA 4AZHA 1OD0A 3AMCA 1JZ3A 1W32A 1TR1A 2XVPA 4J3VA 4OIFA 4AD4A 4B16A 3WUBA 1BQCA 4HA4A 3CZJA 1C7SA 1B9ZA 3WIJA 1E56A 1JI2A 4YHGA 1HL9A 3KWXA 3APGA 3O2LA 4U31A 4QFUA 3CHFA 1OIFA 3AIVA 3TTYA 1UG6A 3OB8A 1JD9A 2DPEA 4W89A 2CCRA 4MB5A 3WH9A 1E6XM 1V0NA 2EPOA 1I1WA 2J7DA 2GK1B 1JFHA 1ZS2A 5I79A 3CGTA 5I2UA 4PTXA 3AMLA 3AICA 4XB3A 3CUIA 1FH7A 1H2JA 4W86A 4AZBA 2GFTA 4FLSA 1E0WA 2CETA 2XHYA 1BYAA 3W38A 3BC9A 5CPQA 3NUKA 3VIHA 1FHDA 5CJ5A 3MU7A 1JF5A 5JIPA 4GO9A 3WD2A 3ZQ9A 1QHOA 4P7QA 4TXEA 1ZL1A 1A47A 1GCYA 3KL0A 2WK2A 2WWCA 4S3JA 1MXDA 1VBRA 1O6IA 3ZT7A 4KGLA 4CD7A 4PSPA 4W7VA 2Y8KA 2ZX9A 2EQDA 1E70M 2XG9A 1W9BM 1TE1A 5EFDA 1M03A 1JZ4A 3LPPA 5LA0A 1E3XA 4DWSD 2PWEA 5E0CA 1JIBA 2XTKA 4JL2A 5HBFA 2VMFA 4GINA 1J0JA 4B15A 1UZ4A 2G3NA 2J7CA 4OKDA 4R27A 3RO8A 1NWSA 1JYNA 3ALFA 5A8PA 1OGGA 3WMBA 3UR8A 1KBKA 3WKZA 3DECA 1CWYA 1E4NA 1MQPA 2DSZA 2OYLA 1NWTA 2VZTA 1QBAA 4P8VA 1QNRA 5A8NA 1F4AA 3D3AA 4NF7A 3T2OA 1DHKA 1UWUA 2NSXA 3EDKA 2BHZA 2DSWA 4PMVA 3VD9A 1UR9A 4DWSA 2CPUA 4UZUA 2DQXA 2VURA 4WKHA 4AMCA 3EDFA 5IHSA 1ISZA 2J78A 1X1NA 2FHFA 1NOUA 2JIEA 3LPOA 4AWEA 3BH4A 4H41A 4JAWA 3VM7A 4AISA 2ZXBA 1XYFA 3N04A 2V3DA 3AIBA 4FLOA 4QP0A 3PTMA 4MPKA 2DH3A 4NZCA 1VFOA 3N15A 5IXEA 4ZE4A 1VEOA 3WL1A 6CGTA 2J77A 3AXXA 4NSBA 1V6UA 4LX4A 5AC4A 4WKAA 4RL3A 4A3YA 4HU8A 4F9JA 2YBUA 5E6ZA 4KRTA 2Y4SA 1R86A 2J7FA 1EOKA 1E6SM 1E72M 3POCA 1H4PA 3WF3A 3CIVA 4X9YA 1R87A 1XSJA 1J0YA 5D9OA 1EH9A 4A4AA 2CYGA 1AQ0A 5A95A 2WMGA 3IK2A 3SURA 2YDRA 4J3SA 5CQ1A 2Z1SA 1L0PA 1E43A 1UD3A 3VGDA 3MSGA 4UQ9A 4MNLA 3AIRA 3EYPA 3W27A 1KCKA 3CUFA 2W67A 4V2XA 3VD3A 1CLXA 4N42A 3VGEA 1V6YA 4HOWA 2D23A 3T0DA 1GOOA 2YLLA 4UFMA 1R7AA 1WZAA 3RDKA 4W7WA 4D1IA 2BVYA 3M46A 1DWAM 5A1AA 5TD4A 2QPSA 1C8QA 3W25A 1M7XA 4FF5A 2UWFA 5CGMA 2WZIA 5HOSA 5DT7A 3ZJ7A 3QOKA 1JZ7A 1L8NA 1Q6GA 6A3HA 3W6LA 4MB3A 1TCMA 1E15A 4UOJA 4WSKA 1GPFA 2PWDA 4QCFA 2CXGA 1KQYA 4Z2LA 2W92A 4PMRA 3K8MA 5GQBA 3AHTA 4JKKA 3VVGA 4CGTA 3BLPX 3HMCA 1E73M 2ZUTA 2FHCA 5BRPA 4MB1A 5A3HA 2WKLA 3G6LA 4M24A 1JFXA 1G1YA 1E71M 3TOPA 3AYRA 1KQZA 1KXVA 3MUIA 2IXVA 3AZTA 1WZLA 4W84A 2W61A 3K4AA 1QI3A 1MW1A 4PRWA 1XYZA 4BCEA 3F4VA 5ABEA 2WHMA 3VX0A 4XZBA 3WH8A 3VGHA 4EE9A 1BYBA 2DT0A 3N1AA 5D9MA 2XVNA 3WDRA 1EOMA 5CSUA 1VBUA 4KGJA 4U3AA 2YL5A 5JUVA 3SCQA 4F8XA 4F66A 3I3EA 2WPGA 2G3JA 3WY1A 4CD8A 2X0YA 2E4TA 1KB3A 3II1A 3VDBA 3CZLA 3LMYA 2CBUA 3L4ZA 4W7UA 4UQBA 2JF7A 2ZX7A 1XH1A 5JIWA 1RD6A 1WDSA 4PYSA 1UKTA 1OIMA 4YPJA 3MMDA 1ODZA 3A6OA 4BQ2A 3EDEA 3BSHA 2WC3A 2HISA 2VZOA 3WEMA 1HJQA 3F5KA 3EDJA 3GZAA 1PIFA 3VMPA 1JDAA 5M17A 3WN6A 1V02A 2XM1A 1K9DA 3N17A 3S2CA 4UNIA 3EDDA 1NOFA 1CIUA 4UCFA 4TX6A 3ALGA 3W37A 3ZT6A 3EBVA 2G3IA 1QHZA 3N13A 5DMYA 3L4VA 1PZ3A 1UD4A 4KRUA 1CGXA 5BCAA 2YLAA 3I3BA 3RM8A 5JBFA 1E1FA 2FGZA 3M7SA 1K9EA 1HVQA 1W1PA 2Y8VA 4AD0A 3AHVA 2VCCA 3OG2A 1OSEA 3GXFA 1GONA 4J7RA 3U5YA 3CZGA 4GI6A 3U7BA 2VZSA 2YA2A 3PZMA 3W29A 4IPNB 3G6MA 4XX6A 1X6NA 4GKLA 2WZHA 1W3LA 2WW5A 2XGBA 3L2LA 2E3ZA 3TP4A 4H8UA 3F5JA 1KWGA 5DFAA 2WVUA 3PZIA 4HPHA 3SCTA 2GDVA 1KCLA 2VVSA 4M80A 4E8DA 4UOZA 5CPSA 1J01A 1B1YA 1VFFA 2E9MA 5BXSA 2CEQA 5C70A 4BA0A 5IFTA 2JEPA 4AW7A 3UG5A 5E09A 3BXWA 3NSNA 3PZNA 3PTQA 1ZBCA 4ZEPA 5A2CA 2NW0A 3VTRA 1BHGA 2O9TA 5HPOA 2ZUNA 1FHLA 3N9KA 4AYSA 2XVKA 2XM2A 3GM8A 3WBAA 4CU8A 1WZMA 3T09A 3ZJ8A 1BF2A 3UETA 3EMCA 3UG3A 1C8YA 3IANA 4QLLA 1LWHA 2BVDA 4U5KA 2ZXDA 1V3KA 1VFUA 3BAIA 1CXIA 1VIWA 2F61A 1CGUA 3MANA 2VCBA 4MJ2A 2CBIA 1GW1A 1ZBVA 2VI0A 1Q4NX 2J79A 1B2YA 4D6FA 4BF7A 2ZWYA 3SCOA 1KXHA 3PZTA 2XJ7A 4UQEA 2PC8A 3ARXA 1B30A 1BAGA 3VIMA 2DH2A 4CN1A 1HL8A 2X2YA 3NDYA 1UUQA 1LWJA 3WUGA 3AHXA 4D6IA 1YQ2A 2PWHA 1FP9A 3QHMA 2YBTA 1GOKA 3WBEA 4N0RA 4UR9A 3RJYA 4C7GA 4OOZA 4U33A 3BAXA 2VUYA 3W28A 2XSBA 1BFNA 2BY3A 4BQ4A 4D6GA 3VUPA 3BAYA 4MJ4A 1LG2A 2ZXAA 3TA9A 1ZJAA 1Z32X 1CECA 3HU7A 3A4XA 1UQYA 1OWQA 4JL1A 1VB9A 3QHOA 1H11A 1N82A 4XUYA 3DHUA 4PMNA 4MAZA 1OT1A 2V38A 3WNPA 4PMZA 1HXJA 3AIUA 3DYOA 4CU7A 1GHRA 3GDBA 2UY3A 5CZKA 3WNOA 3VMNA 4OOUA 2EPNA 4QCEA 1U2YA 4LXFA 3VNZA 1B90A 5GNZA 1UD2A 3VGGA 4AIEA 4AIOA 4WF7A 3UERA 1E1EA 2YOCA 1V03A 2EPMX 4U2ZA 4GO8A 1GORA 4MNKA 1EXPA 1TFVA 2JEQA 1JAKA 1H0GA 5E0FA 2ZUWA 3PTKA 4J3XA 4AZGA 5HPCA 4Q7NA 4GQRA 4CUCA 5A6SA 4NRSA 4X0VA 3AYSA 5CGTA 1TA3A 3AZSA 1CDGA 3NDZA 1UR1A 1EDGA 5I24A 4AC1X 5EBAA 1W1YA 1K9FA 2DT2A 1FH8A 3ARTA 3ARWA 1UA3A 2DGAA 4S3KA 1MXGA 1V6WA 2DT3A 1EQCA 1J0IA 3FXYA 3RM9A 2CNCA 3WMCA 2WAGA 2YJQA 2QMKA 2XVGA 1C8XA 3ARSA 4AD2A 3OGSA 4JCMA 4PMXA 4PTWA 5A6MA 1W9UA 1HNYA 5LA2A 1NQ6A 1W9DM 4W87A 1DTUA 1W9VA 2CKRA 3A3HA 2XPKA 2MANA 3VKKA 4RE4A 4HZ6A 4U2YA 1S46A 5A94A 1D3CA 4MDOA 2WANA 1CXEA 4Z2JA 1KGXA 1E4MM 3NJ3A 3WD4A 1C91A 2GUYA 4HOXA 2GJRA 4PMQA 3QHNA 4IPLA 1DEDA 1QNOA 4NRRA 4TVCA 1XV8A 3WDQA 2GJXA 1PEZA 4J28A 5C8BB 2VQUA 4V27A 1GQLA 2PB1A 1WB0A 5BRQA 2V5DA 1V0KA 4J3WA 3AXIA 2BHYA 4CD6A 2PBOA 3CUGA 1JDDA 1XGZA 1WDPA 1QI5A 3BCDA 2QF8A 4JFWA 1GHSA 1E6ZA 1ISWA 4DUVA 1XHGA 1HT6A 3ARPA 1V08A 1BTCA 3KZSA 3VD5A 1AVAA 5DT5A 4P7RA 3TTOA 3GH7A 1QBBA 3VDAA 2X1IA 3MV11 1E40A 3FW6A 4AZCA 1C7TA 1XSKA 1TA3B 2VVNA 4A3HA 1NH6A 1R85A 3GXIA 1UH2A 1DWJM 1C93A 1CENA 1ISYA 4JFSA 5AYIA 1D2KA 3SUVA 1CYGA 3OLGA 3K1DA 2WHLA 2O92A 3SUWA 3CMGA 4CCEA 1J12A 1MW2A 2YKKA 4J3TA 3CHDA 1JZ2A 2AMGA 1ZBKA 2VO5A 2UY2A 1EIBA 5KZ6A 5JBDA 3MUY1 2ZUSA 3VIKA 3D5HA 5AYBA 1H49A 4U5IA 1FFQA 4Z2KA 5A2BA 2JE8A 3OLDA 2CBJA 4AY1A 1UH4A 2X09A 4ZENA 1FP8A 5M5DA 2J74A 1QPKA 2BFGA 1MFVA 5A6LA 5A2AA 2BNJA 3CLWA 5FL1A 1OINA 3OBAA 2DT1A 4P7OA 1QVBA 3VINA 4FMVA 1ODUA 3KEHA 4E4PA 2UY4A 6TAAA 3TONA 2E0PA 2ZOXA 2VQTA 5ECUA 4YHEA 3O6AA 2VT0A 1K9TA 3AOFA 4WJXA 3GBEA 4CKQA 1QHPA 1E4IA 3L4UA 3F5LA 1V3LA 3PHAA 3WUFA 3ZJ6A 2VRKA 1YHTA 2XVLA 3ARZA 1VEPA 3L4YA 4DWSB 2E8YA 1HP4A 2ZICA 1MW0A 5I77A 2CHNA 1AMYA 3SCSA 1C92A 1UWIA 2O9OA 3AS3A 3CZKA 3WDIA 1WE5A 5D4YA 1PZ2A 4JFTA 4JHZA 2G3MA 3BAKA 1QNSA 1GVYA 3BAWA 1H3GA 1OB0A 4PMUA 4V28A 3MO4A 1BYDA 3AS2A 3PBGA 1J9YA 1PX3A 5I23A 4QAWA 2QV4A 2YL6A 2W62A 1V02E 3THDA 1J10A 1EDQA 2WWDA 4GPNA 4BZYA 4CCDA 4AEEA 1J0ZA 1QOXA 3SUUA 2VX5A 1JYWA 1E6RA 4GZEA 2Y5EA 5I5RA 4AIUA 3WH5A 3N11A 3VIOA 4P7NA 1XD0A 1B31A 3SCVA 4LQ1A 4QDMA 4KMQA 1HKIA 1E6NA 3FHQA 4W5UA 3T2QA 1E0VA 1GOIA 3MV01 2VX7A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2TAA A;  2D0H A;  1G0C A;  1UA7 A;  1VEN A;  2BXY A;  3VIL A;  5I3D A;  2CER A;  1NP0 A;  1ZB5 A;  4HTY A;  1LL7 A;  1V3M A;  3UR7 A;  3N12 A;  2PWG A;  2JIW A;  2VC9 A;  1UKP A;  4HP5 A;  2EPL X;  4W8A A;  2W63 A;  1V6X A;  4MNM A;  3ZOA A;  4JFU A;  3AIS A;  1TMQ A;  2WNW A;  1UWT A;  4Z2H A;  1IV8 A;  5GPR A;  1LL4 A;  3AQU A;  4JHO A;  4HU0 A;  2UY5 A;  2ZUU A;  3W82 A;  4KWU A;  5A8M A;  3IJ9 A;  3LPF A;  4YN5 A;  3WD3 A;  4JIE A;  2G8Z A;  2OYM A;  2PI6 A;  4TUF A;  1SMA A;  3VDH A;  4FK9 A;  3ECQ A;  5AY7 A;  1HVX A;  2E9B A;  1GJU A;  3AMG A;  4WLC A;  2C0H A;  1LLO A;  4B3K A;  2CKS A;  2WYS A;  2VJX A;  3NIY A;  3OGV A;  2GJP A;  3MKK A;  1BG4 A;  3IJ7 A;  1UZ1 A;  4H8V A;  2BY0 A;  1EGZ A;  1G01 A;  1UWR A;  2O9P A;  3OZO A;  2DDX A;  4AD1 A;  4J27 A;  5DF0 A;  3A47 A;  1WAW A;  1J0H A;  4UFH A;  3GBD A;  1Q6E A;  3VU2 A;  4E8C A;  5D8W A;  1KR0 A;  1OD8 A;  2B31 A;  2GK1 A;  2YA0 A;  2C8N A;  2X8R A;  2WMJ A;  1E55 A;  1KGU A;  3CTT A;  1ISV A;  2WSP A;  4LPC A;  3L4X A;  4GI8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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