4U7BA

Crystal structure of a pre-cleavage mos1 transpososome
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
342
structure length
342
Chain Sequence
FVPNKEQTRTVLIFCFHLKKTAAESHRMLVEAFGEQVPTVKTCERWFQRFKSGDFDVDDKEHGKPPKRYEDAELQALLDEDDAQTQKQLAEQLEVSQQAVSNRLREMGKIQKVGRWVPHELNERQMERRKNTCEILLSRYKRKSFLHRIVTGDEKWIFFVNPKRKKSYVDPGQPATSTARPNRFGKKTMLCVWWDQSGVIYYELLKPGETVNAARYQQQLINLNRALQRKRPEYQKRQHRVIFLHANAPSHTARAVRDTLETLNWEVLPHAAYSPDLAPSDYHLFASMGHALAEQRFDSYESVKKWLDEWFAAKDDEFYWRGIHKLPERWEKCVASDGKYFE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/dna
molecule keywords DNA (25-MER)
publication title Structural role of the flanking DNA in mariner transposon excision.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila mauritiana
total genus 98
structure length 342
sequence length 342
chains with identical sequence B, G
ec nomenclature ec 3.1.-.-:
pdb deposition date 2014-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01359 Transposase_1 Transposase (partial DDE domain)
A PF17906 HTH_48 HTH domain in Mos1 transposase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 4u7bA02
1.10.10.1450 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 4u7bA01
3.30.420.470 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4u7bA03
2EK5A 3IWFA 4GO1A 3I64A 2H27A 3L7WA 2QQAA 2EA2A 2FBIA 1U5TC 2P5LC 1L0OC 3SXYA 3KZZA 1IN8A 4UV8A 1T98A 2JTVA 4I02A 2NNYA 1ZYRF 3HTUA 1SD4A 5FD5A 2RC4A 2BE5F 5EEGA 3K1PA 1LVAA 3F6VA 2LSOA 1F9NA 5BMZA 1T2KA 1JHFA 2IPQX 1S8NA 3C7JA 1WWXA 3BPVA 1TLHB 3CJNA 2IW5A 2XV4S 3WE2A 1UFMA 5D8LB 1J5YA 4OIOF 2KKOA 2GWRA 5IT3A 3M7GA 2DK8A 4IHTA 3JAMK 1Z6RA 3IKTA 3F72A 1TW2A 3KP5A 4OINF 1HBXG 5EEHA 1U3EM 1LJ9A 4B8XA 1R36A 3GZ6A 3CTAA 2V1DA 5FFZA 3GYHX 2VN2A 2KIFA 3FXUA 4P96A 3TO9A 2QYOA 1FBSA 2VC0A 4A6EA 2HR3A 2ELHA 1FX7A 1MJ9A 3DPTA 1S6LA 4EGZA 2QQ9A 3FZVA 5JFRA 1OYWA 1USTA 1B1BA 4KN4X 3GWZA 4BHCA 1J0RA 4HA8A 4MGRA 4FX0A 1I5ZA 1USSA 2UXXA 4BHBA 3F3XA 4ZZDA 1KQ0A 1ZG1A 4QLCU 1U2WA 2NNNA 1XN7A 4M9SA 3LSTA 4XBFA 3BDDA 4U0VA 1HSJA 1YO5C 4LG0B 3DXJF 2ESHA 4U0WA 4EV0A 5AONA 3BJAA 4AIKA 4RB2C 2VE9A 3DQVC 2OA4A 4M71A 3J81Z 1P4WA 3E5QA 3C1DA 3REOA 3QRFF 1P6RA 5E17F 3GFJA 1YYVA 2P7CB 4ENNA 3V4GA 3KFWX 5DCMA 3FXQA 3TOAA 2ESNA 1OYIA 5J6XA 4IHSA 1H0MA 1OYYA 3V7SA 2RNJA 2IVMA 2IT0A 4CDGA 2DQLA 3GXOA 2DPUA 2GZWA 1DPRA 1K78B 1R5GA 2RDPA 1J2XA 4KMUX 2YR2A 1XSDA 2VBXA 2VBZA 4L0ZB 1TNSA 3F8NA 5AIQA 5HVQC 5ILUA 2HEOA 2G9WA 3K1NA 1WI9A 4RGUA 1FNNA 3BJOA 4ESJA 1XSVA 3CUQC 3ZMZA 3ZN1A 3F23A 2EB7A 3MWMA 2GIVA 2F5CA 5E8IA 1KYWA 1RIOH 4NB5A 4PZJA 2JZYA 3Q9VA 4G8XA 3F8FA 3OV8A 2KRFA 5HS7A 2COMA 3T8RA 3N97A 2QM3A 5F6FA 1XB4A 4EJUA 4CGZA 5H20A 2R7DA 4BH9A 1G3SA 2WWYA 3PQKA 3ELKA 2PN6A 1I1GA 1BIBA 2WC2A 5JHUA 2F7TA 3L9FA 2Y48A 4A5NA 4WXCA 4YIFA 2P5KA 3F2KA 1G3WA 2XAFA 1LDKB 2ZMEA 2FA5A 3RKWA 4RB1A 1UCRA 3J81K 4A12A 3LQRA 1EH6A 4A0YA 4P9FA 2YPRA 4L5IA 1B59A 3MCZA 5D5VB 2YX7A 1F5TA 1R23A 1TQIA 1IN5A 2F5EA 1BJAA 4KICA 1TW3A 3AAFA 4HX4A 1DPUA 1Q1HA 2YU3A 4M74A 4M9ZA 2FNPA 4WF2A 1FWZA 4ZYGA 2DK5A 1PUEE 4MTDA 3WGGA 3R0AA 2VC1A 2VODA 3RPUA 5BOXA 1WQ2A 2P5VA 1T6SA 1MGTA 5KK1A 2K7LA 4Y17A 3FMRA 5IT9Z 3GW2A 3SHFA 3SQNA 4NQWA 2XKOA 3FX3A 2D45A 3E97A 4M6YA 4ZYDA 2LNBA 3GFMA 5CJ9A 5D8KB 4ESFA 2VOOA 2E1CA 3ZMSA 1W7PB 4M72A 1ZG5A 3WGHA 3E5XA 4I09A 3QPTA 3FM3A 3KE2A 1FBUA 1YLFA 5DV5A 4R1HA 3TGNA 3WTVC 3HRUA 4A6DA 4YG2F 1O7FA 1ON2A 5HDNA 2ACJA 4GGGA 2FEZA 2XHKA 1KQ8A 3LA7A 1OKRA 1MZBA 1BBYA 2CG4A 5F1RA 4AD9A 2EFPA 2M8EA 1T0FA 1XGSA 5E1ZB 2DQRA 3ZMTA 2F2EA 4LLNA 1J75A 1HSTA 5DUKA 4KA4A 3O2PE 4RS8A 3KEQA 2CW0F 1J7KA 5A2QZ 1IN6A 1U5TB 1YFHA 2W84A 4FT8A 4I2OA 2RN7A 1QZYA 5BS6A 2GQQA 4HQMA 1REPC 4EGYA 1EH7A 3GZ5A 1ZRDA 3HHHA 5DUIA 2Z3YA 4IPAA 4HX8A 4G6QA 1TTYA 4MHGA 2ZCWA 1AOYA 1P2FA 2H6CA 3CLOA 4MDBA 3V8KA 1HW1A 4N0BA 1E17A 2AXLA 5HS9A 4ZH4F 2PJPA 1FYMA 1BC8C 4YFNF 3BZ6A 2FQ3A 1ZAOA 4BAYA 4WCGA 1XCVA 4Q5SF 5IT9K 4MEYF 2GAUA 1E2XA 1ZREA 1SD6A 4MQVA 3DKWA 5DDGA 2HTSA 2VXZA 3GEZA 4CO8A 2P4WA 1ZHFA 3OOPA 1QPMA 1K79A 2MBFA 5ICCA 1YIOA 3V8LA 4KT5C 2XKPA 4G7HF 3CO6C 4MQ9F 4CICA 2FNAA 5F64A 3LWFA 3SFZA 4I98B 3KP4A 2B0LA 4UV9A 1TBXA 2EV0A 1S7AA 2D2WA 2PMUA 3VEPA 3WTUC 3RYPA 2V1UA 2A6EF 1T39A 3ML6A 2A3SA 2BEOA 4KFCA 3M1EA 3VB2A 3HTSB 4ZZLA 4M73A 4P55A 3MEXA 5A2QK 1WRJA 2ZFWA 2VT2A 2XAJA 4IVNA 3VFZA 3FXRA 2V6CA 3K9KA 1FBQA 2OD5A 3J80Z 1D3YA 3I5UA 3GX4X 4LJZF 4EJTA 1QQIA 2P6TA 3D5LA 3NEUA 2R7FA 4EM1A 4HZFA 1SMTA 3K69A 5D6EA 4LD5A 3TO6A 4GYGA 3WG9A 3S2WA 5D6FA 1IAWA 1QO0D 1W4MA 3F8CA 2EFQA 4CXFA 1A04A 5CVVA 1ZN2A 3QU6A 3CO7C 3I59B 4KDPA 3HSEA 1ZLJA 4LLLA 1SD7A 3Q5FA 3DF8A 3RDIA 5HLGA 2DO7A 1HXDA 3RJPA 1XMKA 1XD7A 3RI4A 5HS8A 2HQRA 4PDKA 2M5WA 3HIFA 4OU0A 3QP5A 4Z2YA 2JPCA 2PFBA 4DNCA 4JQFA 5LGTA 1XCBA 1ZRFA 4ON0A 3TQNA 3C3WA 5TRDA 5E20A 1BI1A 2M30A 3T1BA 5FD6A 1XMAA 1I6XA 1IUYA 3HRMA 3LAJA 2FXAA 4KNYA 5L3GA 3H3ZA 1RI7A 4H0EA 4OOIA 4EVIA 1ZLKA 1L3LA 2O61A 4UVCA 3L00A 2F5FA 2XIGA 5FGMA 1P4AA 2EV6A 3B73A 1MDMB 2DT5A 2FOKA 1KU3A 3JW4A 4EM0B 2OQRA 1FZPB 3PQJA 3KCCA 2YSRA 3KEOA 3KLNA 2JSCA 4I0AA 4RB3C 3J80K 1XDUA 3ERED 3VODA 4OMZA 1ULYA 2Q8KA 2UZKA 5LEKA 1CF7B 2CYYA 3M8EA 2X4HA 2HTJA 1UHWA 3GFIA 1PP8F 2FSWA 2OAZA 3R0JA 1RNLA 4N9IA 4WXHA 2E7XA 4LK0F 5AIPA 1U78A 2DAOA 3K9TA 4GCVA 3R6SA 5LEJA 3F22A 5L3DA 1ZARA 4RAYA 4HV5A 1DUXC 2EA4A 2HGCA 2O0YA 2OQGA 1Z6TA 2QENA 2A5YB 2FMYA 5H6QA 5ICEA 3NRVA 2XASA 1RZ4A 3EYYA 4G6DA 3E5UA 2VBYA 5CR4A 3KETA 2HS5A 1AWCA 1DP7P 3KP6A 4TV7A 1O3QA 1JHHA 5K5OA 3K2ZA 3R61A 1KQ9A 1FPQA 2M87A 3BP8A 2IRFG 1W7PA 2G7UA 5DD8A 3JTGA 2GA1A 2ZJ2A 3IRRA 1FC3A 2L4AA 1UB9A 5ERIA 4D0PA 5H6RA 2KJCA 4UXNA 3T0YA 5LHHA 2C6YA 1HKSA 5E1WA 2XVCA 4HYEA 1O3TA 1XGOA 4JBAA 1J59A 4K2EA 1O3SA 3IWZA 5D4RA 1SFEA 5K5QA 1KA8A 3IHUA 4EJVA 1T38A 3R60A 5D4SA 3IC7A 1YTYA 2PBIA 2K4JA 2EFOA 2L02A 3QP6A 1LQ1A 2QUFA 5CVJA 3F6OA 2V9VA 3DEUA 4XSXF 4MEXF 2MC3A 4Y15A 1GXPA 1U5TA 1IRFA 3ECOA 4RGSA 3F21A 1EV7A 1ONVA 2W25A 3PFIA 2QQBA 2QWWA 1U8RA 3IKVA 1BI3A 3QAHA 4LGWA 4BXUA 3G3ZA 2QBYB 5HDKA 4L9JA 5DCMB 3RPQA 1ZGAA 4YFXF 1LEBA 1D8KA 2K4BA 2MA3A 2DW4A 2NS0A 4LK1F 4XSZF 2JRTA 1HW2A 3WU1B 4KIGA 2GA2A 1B4AA 1GXQA 2KIUA 3KP7A 1IXCA 3HRTA 5L3CA 2Y75A 3JTHA 4GXOA 3KZYA 5E1XA 1XGMA 4KMFA 1W7PD 4A2UA 2F5DA 4Q47A 2BV6A 4OMYA 3ABTA 1V4RA 5E18F 2WV0A 4I0BA 3QPHA 1OPCA 3SZTA 2XAHA 3HOTA 5J8FA 3TDUC 2Q2EA 3T5XA 5L3EA 5ILSA 3EETA 2IA2A 5LRRA 4HX7A 1KU2A 2ZO4A 2L54A 2W85A 5HLHA 4S04A 3ABUA 1BOAA 4I7HA 1FYKA 2YX4A 1JE8A 3WTSC 4ETSA 2L3DA 3R4KA 3GO5A 1HQCA 5DEQA 3LA3A 4F7ZA 2XUBA 3ZMUA 2A68F 3Q9SA 2H6BA 5JVTA 2ISZA 3KLOA 4R79A 4IRHA 3U1DA 2RV8A 3LFKA 4FHTA 1O7LA 2ZMEB 2ZNYA 3TOBA 4UHTA 3I0TA 1PP7U 2FF4A 1FP1D 2LKPA 5KVRA 1GVJA 5ED4A 1B6AA 4HOBA 2NAZA 1P92A 2EJRA 3ECHA 4OIRF 1IXSB 2PLYA 3EQLF 4U88A 4I01A 4ZYHA 3WE3A 1IXRC 1IN4A 1BIAA 3BROA 4UVBA 3J7AO 3I59A 1MJBA 1FSEA 2A61A 4HBLA 2BBYA 3MAJA 5L3BA 2XAGA 5TJJA 3E6MA 1LDJA 1G3YA 3COAC 2XRNA 5HOOA 2QLZA 2M1BA 1EH8A 2LDUA 3I71A 3GFLA 1FP2A 1Z7UA 3E3VA 2PG4A 2TDXA 1QZZA 1YS6A 3LAPA 3FF5A 2A6HF 1XDSA 2FMLA 4HDVA 4BYYA 2FU4A 3E6BA 3MZYA 2ZNZA 1F1ZA 4UUVA 2PQ8A 4LB6B 4EMSA 1PDNC 2W57A 2IP2A 1YQAA 4IF4A 2ZKZA 4L9TA 3V7RA 1Z1DA 4BNCA 1STZA 4L9VA 1KYZA 1H9GA 2ZXJA 4XLNF 3MZHA 4HF2A 2FBHA 4L5JA 2UXNA 4YIIA 4N9HA 1R58A 4U0YA 3BOQA 4WXDA 1MDMA 3K0LA 1IN7A 2ETHA 3KP2A 1ZG3A 2V1XA 1BI2A 2OBPA 4RAZA 3JSPA 4LG0A 3K9JA 3RKYA 3V8JA 4G9YA 2FE3A 3ZQ7A 1SFUA 2QZ8A 3ZPLA 5FB2A 1UHMA 1CF7A 4G7OF 1B9MA 2VE8A 5DCFA 5D5WB 2X0LA 3FMSA 4RB0A 2IA0A 4KUMA 4RGXA 3DFGA 4U7BA 5LLQA 4L18B 1WSUA 2HYFA 3O6BB 2H94A 1ON1A 4MNUA 4WWCA 3ZP5A 3U2RA 3VOEA 2P6SA 3WU0A 4O3MA 5CVUA 1R22A 1K78A 2HFHA 5FLXZ 1B9NA 4GYIA 3L2CA 1X3UA 2UWMA 2FRHA 4P9UA 2HKOA 4B09A 5BPDA 3CUQB 1G4DA 3BPXA 4MTEA 4KIBA 4AWXB 2K27A 2OU2A 1R7JA 2P7VB 2A07F 3RTRA 4U7DA 5K1YA 2JPBA 5LBQA 4UVAA 2BGCA 3U9GA 4EJWA 3B02A 1BN5A 1KU9A 1XSXA 1QNTA 4OIPF 1ODDA 3HSFA 1FYLA 3NQOA 2PMHA 2LF8A 3I4PA 4CZZA 1BM9A 4LFUA 1IZ1A 4IJAA 1J9IA 3IL2A 4KYWA 3W6JB 3ZN0A 2E1NA 3E6DA 5E8GA 1D8JA 5JI6A 1HKTA 1SAXA 4JK1X 4RGRA 2OZUA 2VONA 1TQMA 3WTWC 1U6GA 1SFXA 3HOSA 1P4XA 3FMQA 4A5MA 3RIRA 3HUGA 5JR3A 3W6KB 4EQQA 1OR7A 3HSRA 5LGNA 3O3KA 2ADUA 3E6CC 3RYRA 3GUDA 2HOEA 1XGNA 2CO5A 3CUOA 3WTYC 1FSHA 4Y13A 4ZYEA 1BI0A 1R1TA 1R1VA 3BWGA 1YW7A 2D1HA 3I54A 1S7OA 4Q4ZF 2G7HA 1ZGJA 2MD5A 2QBYA 2EWNA 5D5UB 2STWA 4AIJA 2P8TA 2HYGD 5FLXK 4XLPF 3HYIA 1S29A 5CYVA 3G73A 4CHUA 5BPIA 1KGSA 3QU3A 4M9XA 1IF1A 5FFXA 3K1MA 4WK8F 4EM2A 1R00A 4HLXA 2J5PA 5HLIA 2HDCA 1FT9A 2FBKA 1K6OA 3LA2A 5CVRA 3I58A 1WKMA 1R5HA 3LQQA 3GVAA 4Q48A 1YW8A 4M6XA 1LEAA 4PCQA 4R8HA 2DU9A 3DV8A 3H92A 5DYMA 1LB2A 4MDAA 3WGIA 1CGPA 2AS5F 4L0YB 4LB5A 2MLKA 2L4MA 3V7CA 4IRGA 3FHZA 3M9AA 3ZMVA 4AIHA 3WTXC 5ICFA 4LMYA 3EYIA 2MH2A 4HQEA 1I1SA 2NYXA 4IRIA 2O8XA 3FM5A 4PGGA 1Z9CA 2Z9OA 2VOPA 2O6GE 1I27A 1SD5A 1D5VA 4AVPA 4G94A 2RGVA 2V79A 4HF1A 3EUHA 4XRFA 2Z33A 4OIQF 5CVIA 5J8CA 4A0ZA 1GHCA 1W5SA 3P7NA 4HF0A 3TO7A 5L3FA 4O6JA 2PI0A 2E7WA 1FOKA 3P9KA 4HV6A 2ZBKA 4DQ2A 1DDNA 2RKHA 2H09A 3ZMDA 2RQPA 5DD4A 3ISPA 4FX4A 3H3UA 3TKYA 1QGPA 3D0SA 1H9TA 1ZH5A 5D5XB 2R3SA 2RVCA 5LGUA 1K7AA 4G7ZF 3GF2A 3ROUA 3MFKA 2GXGA 4EJOA 4P5OA 2L01A 3P9IA 3C18A 1LDDA 5ILVA 3WTTC 1F4KA 5CLSA 2EFNA 4WX9A 1TNTA 3SZPA 3GLXA 1JGSA 4KIFA 2DTRA 1QBJA 1TQPA 3FWEA 3WODF 5ICGA 2VT3A 2HQNA 1Z05A 5FO5A 5BQTA 4QWQA 1RUNA 2CSOA 2VBWA 2Z5UA 3CDHA 2IA1A 2MLGA 2ISYA 2HKXA 1SMYF 3L09A 2NRAC 2QVOA 3I53A 2EFWA 2KIMA 2GXBA 4YFKF 2W24A 3ULQB 4HAMA 4LLGF 2XAQA 2Y0MA 2JT1A 2CGPA 4ASNA 2MH9A 2HWVA 4O5VA 1ZRCA 1NHAA 1MJAA 2KJBA 2J5OA 2DLLA 2LF7A 1Y0UA 3KP3A 3EDPA 1R1UA 3F8BA 3BY6A 1YG2A 1Z91A 1V3FA 3DPLC 1S3JA 1BC7C 3IRQA 1OMIA 5LHGA 5K5RA 1G3TA 4HW0A 2DFIA 4HDUA 4KN7X 2DI3A 3N4MA 2Z99A 1FY7A 1YW9A 1JXSA 3BJ6A 4CYDA 2HZTA 2M45A 2XGXA 2PEXA 4S05A 2O3FA 3JSOA 4NHJA 3HRSA 4A0XA 2OZ6A 2CQKA 1KU7A 4ENMA 2O03A 4ESBA 1W5TA 3T8TA 1MKMA 1G6NA 2K02A 6PAXA 4ENKA 1LNWA 2K86A 1IW7F 3QOPA 3F8MA 3CUQA 1O57A 2STTA 3JAMZ 4IXAA 3M8FA 4UNOA 1RUOA 3P9CA 2XROA 5HDGA 5LHIA 1YS7A 1O3RA 4PGHA 1C0WA 2Q0OA 4BHPA 4ENJA 3MQ0A 2D1VA 5LRSA 2CFXA 4BQAA 4L9NA 2BYVE 1VTNC 2DBBA 2A69F 3WTZA 3HHGA 2CWEA 3DP7A 3RKXA 4E70A 1FLIA 2EV5A 2DPDA 3TDZC 1MD0A 2WTEA 1HKQA 4HLYA 1HW5A 2IJLA 1IRGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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