4UTFA

Structure of the gh99 endo-alpha-mannosidase from bacteroides xylanisolvens in complex with mannose-alpha-1,3-isofagomine and alpha- 1,2-mannobiose
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
349
structure length
348
Chain Sequence
NNLGTELDYDTFCFYYDWYGSEAIDGQYRHWAHAIAPDPNGGSGQNPGTIPGTQESIASNFYPQLGRYSSSDPNILTKHMDMFVMARTGVLALTWWNEQDETEAKRIGLILDAADKKKIKVCFHLEPYPSRNVQNLRENIVKLITRYGNHPAFYRKDGKPLFFIYDSYLIEPSEWEKLLSPGGSITIRNTAYDALMIGLWTSSPTVQRPFILNAHFDGFYTYFAATGFTYGSTPTNWVSMQKWAKENGKIFIPSVGPGYIDTRIRPWNGSVIRTRTDGQYYDAMYRKAIEAGVSAISITSFNEWHEGSQIEPAVPYTSSEFTYLDYENREPDYYLTRTAYWVGKFRSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords GLYCOSYL HYDROLASE FAMILY 71
publication title Human Gut Bacteroidetes Can Utilize Yeast Mannan Through a Selfish Mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Bacteroides xylanisolvens
total genus 128
structure length 348
sequence length 349
ec nomenclature ec 3.2.1.130: Glycoprotein endo-alpha-1,2-mannosidase.
pdb deposition date 2014-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF16317 Glyco_hydro_99 Glycosyl hydrolase family 99
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4utfA00
4M82A 3CIVA 4KH2A 3WQ6A 1CXEA 1EQPA 5D9MA 3VM7A 5JBEA 3OIHA 4QFUA 2W61A 3AMCA 1PEZA 1L8NA 4UFHA 1C3FA 1A47A 3AS3A 1V3JA 2WVSA 3W53A 1UA3A 1MYRA 3GBEA 2JALA 3L2MA 1FP9A 3O6AA 3GNPA 3BSHA 2BV9A 3SCUA 4HOXA 4U31A 4KRTA 3EDJA 3CGTA 4TVDA 4JHZA 3WF4A 1U33A 5I24A 3WQ8A 2RGLA 3AYSA 4JFVA 3THDA 1NH6A 1CGTA 4CCDA 1I75A 1E1FA 1OINA 2DSVA 2EO7A 1VEOA 3WF2A 4D6IA 2EXOA 4FLRA 3LPPA 1GQLA 4GI8A 4J3SA 2VURA 5A8MA 1FH7A 2J7CA 5AY7A 3WUEA 2XIBA 1GUVA 1BGGA 3MMWA 1X1NA 2DT0A 4HMEA 3UR8A 5EMYA 2DEPA 4JZ5A 4U3CA 3WNNA 1OSEA 3W6LA 5EB8A 4OBSA 2WPGA 1Q6EA 4HOZA 1HVXA 2ZICA 1E6NA 1JNEA 4PYSA 1VBUA 3N11A 2VRQA 5I78A 2XHYA 3WQVA 4P8UA 3PZQA 4MPKA 1GQJA 3PTQA 1ZBVA 1KR0A 4UQBA 2VCBA 3OGVA 4V2XA 2TAAA 2GJPA 1J12A 3L4TA 1FH8A 2Y5EA 3WF0A 1HVQA 3G6MA 1J18A 2OLHA 2BVTA 1E0VA 1V02A 3RJYA 1HJXA 3CO4A 3ZQ9A 5D4YA 3WENA 3FHAA 1QI3A 2D24A 3VMNA 1SFSA 2D20A 3IAPA 2CHNA 4C7GA 1C7TA 4CCEA 1HN1A 4TX6A 4LQ1A 1W3JA 2WMJA 3WN6A 3WMBA 1ISXA 5IHRA 1E0XA 4E8CA 5A6BA 1QBAA 1JAKA 4J3UA 2E3ZA 3VNYA 3BLPX 5GNXA 1E5JA 4A3HA 3WY1A 4PUDA 2ZUUA 4LX4A 3WUBA 2XTKA 2AMGA 4B16A 1ISVA 1JF6A 1P6WA 1QW9A 4W7VA 1LL6A 4S3KA 2YJQA 3VO0A 1U30A 1TMQA 2VZOA 4CU8A 1LWHA 2CERA 4UOQA 2O92A 3MUY1 2FGLA 2BNJA 2BHYA 2DH3A 1J0IA 3MUAA 3BAWA 4PMOA 3KZSA 1G5AA 3ZOAA 1QVBA 1CGUA 1BSIA 5BCAA 1JDCA 3DYPA 4MDPA 5HDRA 3ZJKA 2WBKA 3NSNA 4GZJA 1UR4A 1HJQA 4GXPA 3W24A 1K9DA 3RO8A 3DECA 1M01A 1WZMA 3OLIA 3GYCA 3VKKA 3SCOA 2F61A 1HIZA 2VJXA 2Y8VA 4AW7A 3WEMA 3VD5A 4ATLA 2WCGA 3W0KA 3W82A 4J3XA 3RM8A 3M07A 3N04A 3WD4A 5DT5A 3NCOA 2J7FA 1KXTA 4X0VA 3A4AA 3SUWA 4UOZA 2CIPA 5A2AA 4CU6A 1VENA 4JCMA 1E71M 3NDZA 1W91A 4HOWA 2WHMA 3AIUA 3I3EA 4J7RA 1W9UA 3VGFA 4ZXLA 4AIOA 1DP0A 1VJZA 4B9ZA 1UUQA 3MSGA 2CKSA 2QPUA 1I1XA 1D3CA 1E72M 2YLAA 2GK1B 1CXHA 4XB3A 3J7HA 4GIAA 4ACZB 1LG2A 1JFXA 4LGXA 2PBOA 3VDBA 1IZKA 3VIFA 3VGEA 4XUYA 5I23A 3OLEA 4JL2A 2X09A 1HF6A 4S3JA 1R85A 4HU0A 5CPSA 1WPCA 2JF7A 4F8XA 4GI6A 2A3HA 3TTYA 3I3DA 3UESA 4J3VA 5A8OA 3N1AA 2WHKA 3WH7A 1UA7A 1PX8A 3OZOA 5A8QA 4FK9A 4RE2A 3IJ8A 3HU7A 5C71A 1MXGA 2WCSA 3TOPA 3GXFA 4JFSA 3VGHA 1V0NA 3K8MA 1KGUA 4IM4A 3UERA 1ISZA 7A3HA 3QHOA 2A3EA 1WAWA 1NOUA 3WDIA 1G94A 3B9EA 3MSDA 2XWEA 2XIIA 4M80A 4YN5A 1PJ9A 4MAZA 2WMIA 1TUXA 1KFWA 2WXDM 1CLVA 4NRRA 2VQUA 2DIEA 3VIHA 3WEZA 3CPUA 3OZPA 1VFMA 1XYZA 4DM2A 1X6NA 4GO8A 2DSUA 4PMQA 5HBFA 3PHAA 2CKRA 2X2YA 3U5YA 2J77A 4OKDA 2ZXQA 1HP4A 3TONA 1R7OA 4C7FA 3OLDA 1AVAA 1TG7A 1V6VA 3AHYA 2X0YA 4PTXA 3VDAA 5CPQA 5ECUA 1H0GA 1KBBA 5D9NA 4BA0A 3OGSA 2CBUA 5A6SA 5BXSA 2DDXA 1E6RA 3A4WA 4CD8A 4MDOA 4FMVA 5CZKA 1GOMA 4WKFA 1W9XA 3TTQA 4D71A 2WMIB 2WANA 4ACYA 1KWKA 3WNMA 2FHFA 2IUZA 4HTYA 3U7VA 1BVZA 2AAAA 3K46A 1XCWA 1HJSA 4CD6A 3UG4A 2VR5A 2YL8A 4MJ4A 1NWUA 4JHOA 2BXZA 3IANA 2WHJA 1PAMA 4URIA 4TUFA 1RD6A 2NSXA 5GNYA 2XVPA 3ARXA 1TVPA 1W2PA 3SIMA 4KGJA 3VGBA 3L4UA 3WNLA 4GQQA 4DUVA 3UEQA 1OIFA 1C8QA 5I3DA 1XGZA 1B31A 1H4PA 2WZEA 4PEEA 1US2A 4UQEA 3OLGA 1IV8A 4E2OA 3PZ9A 3BAKA 1V3IA 1DWJM 2D0GA 5HXMA 5ABFA 1QNRA 3UR7A 2WAGA 4W8LA 1OWQA 3AOFA 2NT0A 2Z1SA 1VFOA 1XCXA 1NARA 4P7RA 1TA3B 3L4XA 1UWIA 3TTOA 5M17A 1MWOA 4JCLA 1PX3A 2VUYA 1RPKA 3KL0A 2OYLA 4D1JA 1LJYA 3AXIA 1LL4A 4WF7A 1JZ2A 4W5UA 4A3YA 1LWJA 2ZX6A 3AHZA 2W91A 5F7UA 1YHTA 1V6UA 2E8ZA 4UNIA 2EPOA 3M46A 1E6QM 4JFUA 1CNVA 5ABHA 4AD5A 5BXRA 5DF0A 2CHOA 1Q4NX 5IFPA 2F2HA 4UFKA 3BLKA 4PCTA 3W6MA 1WCGA 1XV8A 3SCWA 4BZYA 5BXTA 1NWTA 2ZXDA 1K9EA 4WJXA 2WWCA 4A4AA 4MADA 3EMQA 4TOQA 2PWGA 3AICA 1HKIA 1XD0A 2C7FA 1JD7A 2YA1A 4XV0A 3EMCA 3ARTA 3WDHA 2DT2A 3DYOA 5AC4A 1XH0A 5JIPA 5GNZA 3AIWA 2DQXA 2EPNA 2CEQA 1EIBA 1MW1A 1WE5A 3OB8A 3WQ4A 4AZCA 1ZBKA 3QOKA 1M7XA 4M29A 1UWSA 2E40A 5E0FA 3W27A 3W81A 2VC9A 1EHAA 3WUGA 1JZ4A 2E9BA 1CIUA 3POCA 1HL9A 1R8LA 1AMYA 1VFFA 3VDCA 2W92A 2WW5A 1W1TA 2CBVA 1UKOA 1TZ7A 4U2ZA 4DWSB 3K8KA 4WKHA 4Q22A 3BGAA 4RL3A 4WIWA 4P7LA 3BMWA 4GZIA 4HA4A 1C8XA 1W1VA 4PMYA 2D3NA 1GVIA 1EDTA 1FHDA 4AC1X 5KEZA 1BG4A 1KXVA 1MFVA 1QI4A 1UKTA 1OCQA 4MNMA 2JF6A 3O2LA 2OSWA 4H8VA 4P7NA 2XM2A 2YIHA 4HMDA 1BAGA 4B15A 4AD3A 1KB3A 3DC0A 2YL6A 4LPCA 1PZ3A 1RH9A 1DWIM 1UR9A 3AS2A 4PSRA 4M56A 1E3ZA 1D7FA 3ZSSA 5I0DA 1Y7VA 2CYGA 1E6PA 2WC7A 2IXUA 1KCLA 3AROA 3TA9A 3S2CA 4FLOA 1UQYA 4D6JA 1FFRA 2WNWA 1UR1A 4UFIA 1OBAA 1US3A 5A1AA 3VOCA 4CVWA 1MW3A 1UQZA 3AI0A 3THCA 2BVYA 2VX4A 5A69A 3M6DA 4N42A 4DWSD 3WL1A 4OIFA 5CLTA 3VU2A 2PB1A 2XWDA 4L4OA 3W25A 1E4IA 2X05A 4HU8A 1ITXA 2QPSA 3RIKA 5LA2A 1KXQA 3ARWA 1CEOA 3ARUA 2VR4A 4WSKA 1HKMA 1M04A 4AYSA 2NW0A 5C70A 1HNYA 4V28A 4GPNA 4LYQA 2G8ZA 1GZJA 3WF3A 3VD7A 1B30A 3T2OA 1HL8A 3PZIA 4RE3A 1UHVA 2C8NA 3L4ZA 3OGRA 4AZ7A 4U2YA 1BG9A 3WNPA 4PBGA 2VX6A 1BPLB 3ZIZA 3K4DA 2ZUWA 2E8YA 1KCKA 2WC3A 5GQBA 1EA9C 3KEHA 1LLOA 4KMQA 1W9PA 4D72A 2YLLA 2W63A 1G0CA 2WLYA 5I77A 1W9VA 2FGZA 1FH9A 3W26A 1JAEA 3ARVA 3T09A 3VIMA 1FP8A 1VEPA 5FCZA 2B31A 2A3BA 2ZX5A 5CGMA 2J7DA 1E6SM 1E3XA 1GJUA 2GDUA 2J75A 3F5LA 3UETA 2WMGA 1FA2A 3WH5A 5HPOA 2BY0A 6TAAA 2YDQA 1ISYA 2WZHA 4V27A 2W67A 3WUFA 1M03A 4P7OA 1AQMA 3MS8A 4D6HA 1HX0A 2EBNA 1XSJA 1CYGA 1BVNP 3MV01 1B3WA 4E4PA 3L4VA 1NWRA 1K6AA 5HOSA 4JKKA 2WYSA 5DO8A 2VVNA 4OOZA 4MNJA 1WZKA 2V3EA 2W4XA 1FHLA 3D3AA 3E1F1 2X8RA 3PZGA 1U2YA 1GJWA 1HJWA 3VMPA 3VPLA 1JYWA 3AHTA 2J62A 2WMKA 3S6TA 2FDMA 3VTRA 5D9PA 2Y4SA 1ZS2A 1YQ2A 2D1ZA 4HP5A 5DEZA 3BAXA 2VX5A 2DSZA 3FHQA 1EHNA 4ZFMA 2W62A 1OGBA 4CN1A 4HA3A 2GFTA 1B3YA 2VVSA 3AMKA 2EQDA 1Q6DA 2G3IA 1B3XA 1JDAA 4XZWA 3LPOA 2QLYA 4JKLA 4ZEPA 2C0HA 1MW0A 4AEEA 1B0IA 2YOCA 3GH5A 3PN8A 4TTGA 2BXYA 4ATWA 1ESWA 2VL4A 3ZM8A 2CBIA 4BF7A 3DYMA 3PZVA 1VBRA 3L4WA 3AIRA 3LPFA 2GUYA 5A6KA 3WH9A 4AZHA 1N82A 1V6WA 2MANA 4KRUA 2PI6A 3CUGA 1W9BM 3A4XA 1JDDA 5EFFA 5DFAA 2XSBA 4ZE5A 3WD3A 4UTFA 3QGVA 1W3KA 1UG6A 2GK1A 1G01A 1H5VA 3VD4A 3A3HA 4ACZA 4N0RA 3PZTA 1BTCA 3MANA 5IHSA 3AXXA 2QMKA 3HN3A 1GOOA 4GINA 1M53A 3MUZ1 4Z2HA 2E4TA 2XFRA 2XYLA 1KXHA 2VO5A 1WDPA 3WKZA 4QAWA 5E9AA 3PZOA 4AWEA 1E73M 1B90A 3CZGA 1MFUA 1RP8A 4W7UA 5FIPA 4F79A 1AQ0A 4XZBA 2D3LA 4QLKA 4TVUA 2ZUTA 5BROA 1W9DM 4BQ2A 4TVCA 4UQAA 5HPCA 2WVUA 2DT3A 4PMUA 2VRJA 4CUCA 4R27A 4EE9A 3BH4A 1CGVA 3N9KA 1LG1A 2CETA 2CXGA 1CENA 1GQIA 3HJEA 4PTVA 3M7SA 4P7QA 2QMJA 2BY3A 2YKKA 2E9LA 1CDGA 2GDVA 2HISA 7CGTA 4HMCA 1JYNA 1CGXA 4JIEA 3CUJA 1JD9A 3N15A 4MB3A 3EDKA 4P8XA 2V3GA 3AMLA 1CXFA 1UWUA 2NT1A 1PIFA 1WNOA 5CQ1A 3WD2A 4PTMA 2YL5A 4W87A 2PWHA 4OJYA 3AIVA 5CSYA 1O6IA 2J7BA 2G41A 1UR8A 2BHUA 1GHRA 3WIJA 2ZUMA 3KL3A 1XSKA 4U33A 4W5ZA 4CKQA 4YHGA 3T08A 5LA0A 3MUIA 1JZ6A 3AIEA 3A47A 1XH2A 3TP4A 3FNDA 1V0LA 3WNKA 1BHGA 5DT7A 3A6OA 1XH1A 2O9RA 4Z2JA 2QV4A 2XPKA 1QHPA 1JG9A 1QNPA 2DGAA 1ZBCA 1CTNA 3L4YA 1E5NA 1BYCA 3AMGA 3LPGA 3VMOA 3NDYA 3FAXA 4QDMA 5CPTA 4AISA 2WK2A 1W1PA 4X9YA 3CMGA 3RM4A 1GPFA 5E0CA 1ZJAA 4LYRA 1W3LA 4BS0A 3WDQA 4PMVA 1OGGA 2CNCA 3PZMA 1SYTA 3SUSA 1OGSA 2XFFA 3SCSA 4HZ6A 5JIWA 6CGTA 4RE4A 1KBKA 3N18A 1QNQA 4W7WA 3AHVA 4TTUA 4MTVA 3ZT7A 1JZ7A 1LL7A 1H3GA 1KQZA 4WKAA 1V08A 3NIYA 3CHCA 5A2BA 1J0YA 1TCMA 5IFTA 3EMZA 4PTWA 3CHEA 1J11A 1UH4A 1CXKA 4W86A 3RM9A 1X6LA 1TA3A 3AS1A 4W88A 4LYPA 1TR1A 4EK7A 1UH3A 2WLZA 3ZR5A 2ZWZA 1UR0A 5E6ZA 2W66A 1WDQA 3VVGA 1B3ZA 3ZSTA 2XVKA 2BY1A 1UD6A 2XGIA 3F5KA 4M24A 5JUVA 1VJSA 1C90A 4AIEA 1JI1A 5I5RA 4PMXA 1K9FA 1V0MA 5A2CA 4TX8A 4UOJA 2OSYA 3U57A 1UD3A 3CZKA 2GJXA 3ZO9A 3F4VA 4F66A 5A8NA 1LQ0A 3RCNA 2ZUSA 3EYPA 1KGWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4M82 A;  3CIV A;  4KH2 A;  3WQ6 A;  1CXE A;  1EQP A;  5D9M A;  3VM7 A;  5JBE A;  3OIH A;  4QFU A;  2W61 A;  3AMC A;  1PEZ A;  1L8N A;  4UFH A;  1C3F A;  1A47 A;  3AS3 A;  1V3J A;  2WVS A;  3W53 A;  1UA3 A;  1MYR A;  3GBE A;  2JAL A;  3L2M A;  1FP9 A;  3O6A A;  3GNP A;  3BSH A;  2BV9 A;  3SCU A;  4HOX A;  4U31 A;  4KRT A;  3EDJ A;  3CGT A;  4TVD A;  4JHZ A;  3WF4 A;  1U33 A;  5I24 A;  3WQ8 A;  2RGL A;  3AYS A;  4JFV A;  3THD A;  1NH6 A;  1CGT A;  4CCD A;  1I75 A;  1E1F A;  1OIN A;  2DSV A;  2EO7 A;  1VEO A;  3WF2 A;  4D6I A;  2EXO A;  4FLR A;  3LPP A;  1GQL A;  4GI8 A;  4J3S A;  2VUR A;  5A8M A;  1FH7 A;  2J7C A;  5AY7 A;  3WUE A;  2XIB A;  1GUV A;  1BGG A;  3MMW A;  1X1N A;  2DT0 A;  4HME A;  3UR8 A;  5EMY A;  2DEP A;  4JZ5 A;  4U3C A;  3WNN A;  1OSE A;  3W6L A;  5EB8 A;  4OBS A;  2WPG A;  1Q6E A;  4HOZ A;  1HVX A;  2ZIC A;  1E6N A;  1JNE A;  4PYS A;  1VBU A;  3N11 A;  2VRQ A;  5I78 A;  2XHY A;  3WQV A;  4P8U A;  3PZQ A;  4MPK A;  1GQJ A;  3PTQ A;  1ZBV A;  1KR0 A;  4UQB A;  2VCB A;  3OGV A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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