4UTHA

Xena - oxidized - y183f variant
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
359
structure length
357
Chain Sequence
SALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMCQYMAEDGMINDWHHVHLAGLARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIAADDTRGWETIASAIAFGAHLPKVPREMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGFLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPDTNIPWGPAFMGPIAERVRREALPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHWLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords NADH:flavin oxidoreductase
publication title Redox-dependent substrate-cofactor interactions in the Michaelis-complex of a flavin-dependent oxidoreductase
doi rcsb
source organism Pseudomonas putida
total genus 125
structure length 357
sequence length 359
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4uthA00
4R7JA 4ZVJA 1BTMA 2E5CA 3FJ6A 4QM1A 3T7VA 1KM3A 4K7YA 4ONVA 4N6EA 4FNPA 5FEZA 1GWJA 4MOZA 5CPMA 2CLMA 2PURA 5BMWA 4TIMA 1CW2A 4O1CA 3QM3A 3FKKA 5K3VA 3W2KA 2B7OA 4O11A 3LXCA 1T99A 3CEPA 2Q3RA 3L0GA 4UFKA 2YDAA 4NX0A 3PUDA 5D02A 5AC6A 2GVLA 1YTKA 2E68A 4O12A 3TW7A 4DF0A 1JCMP 2BZNA 1GEQA 1FDYA 3WK2A 3EX3A 1QDSA 3QW4B 1EB3A 3W84A 3IGUA 4MVAA 1A5BA 3GNNA 3FKRA 3WJZA 3NEVA 4OHQA 4JS3A 4LRTA 4PFMA 5C54A 3KXQA 3VI2A 3G18A 2CLKA 2ZZ5A 4LRSA 1OVDA 2ZRWA 4O4VA 5FF0A 3OEXA 3CM4A 5LNWA 1EPXA 1FXQA 1I4NA 4GWEA 3E49A 1GZGA 2DZXA 1DVJA 1EP1A 2H3DA 3C56A 4YWIA 3ZWTA 1GTEA 1H62A 3KVJA 2F84A 3O8AA 3INPA 1JJKA 2QUUA 2FQIA 3C3NA 1OFEA 3D0CA 1A53A 1JUBA 5D33A 1H63A 5AHMA 4IUOA 2GUUA 3TMQA 4EIVA 3WJXA 1WXJA 4RZ5A 3OVQA 1B3OA 3G1XA 1F05A 3W1RA 2RDUA 4GC4A 3M7WA 3WK0A 4GUFA 1WAUA 3P82A 3ABOA 3KHJA 3GDKA 4GE8A 3G1DA 2P0OA 4YXGA 2A7RA 1ME7A 3NM1A 5KZMA 4Y90A 1W31A 2CW6A 1VLIA 1F73A 3LCHA 4AH7A 1GJPA 4RXGA 3F1QA 3W7MA 1QPOA 3QH2A 3PSWA 5IBXC 1O60A 5HJLA 1KM4A 4Y6GA 3E12A 3FOKA 1JR1A 1FCVA 1VC4A 5BNKA 5C6MA 1GVSA 3MI2A 3S5OA 3RFAA 4IXXA 3S1UA 5D05A 3W9ZA 1W3IA 2ZA1A 5AYZA 1TTJA 3GDRA 5I3KA 4NUWA 2J88A 4FX8A 1TB3A 4BK9A 3LI1A 3G0SA 2WSQA 2GVGA 3EXSA 5IBXA 4AF0A 3HIJA 5HUPA 1GVRA 3W7IA 3TAOA 1SR9A 4AEOA 2VFHA 2VFEA 2WJZA 4UTIA 3GXNA 5HINA 1SO5A 4R53A 4YCPA 5DCBA 1H61A 2OMAA 3EX2A 3RLVA 1I2NA 3TNOA 3ZFHA 4UR8A 1M5WA 4QNWA 3MMTA 3QEZA 1OX6A 2OJPA 3P62A 1GT8A 3OIXA 4RX0A 4IPJA 3W7QA 2JGQA 1DKWA 3EWYA 2B7PA 4JY8A 2QCMA 2RFGA 1DHPA 1ME8A 5KZDA 5CG7A 4UTTA 1SSGA 4OV9A 1YYAA 5HULA 3G8EA 4MUZA 2A7NA 5EYWA 5FEXA 4JEQA 4Z1AA 1VJIA 5GVJA 3PVFA 4MY1A 4MY8A 4QNEA 3IGSA 6ALDA 1VQTA 4OBTA 4C1LA 3UY8A 3L65A 3Q58A 3M41A 4WY0B 2QAFA 2X2GA 1I2PA 4IXHA 4R34A 5G2WA 3LXAA 3LXBA 5U4NA 1TTIA 1KW1A 3W7PA 1BWLA 3GVGA 3RK8A 1YXYA 2BX7A 4GUGA 3NM3A 1L6WA 2DZWA 4L4MA 4IMFA 4R33A 2TRSA 5I3JA 1S5TA 2E09A 3BG5A 3DFOA 3CIWA 4JICA 3IIVA 4NXKA 1LYXA 3W86A 3N19B 1YDNA 5D38A 1K03A 3TDFA 4AWUA 4BI6A 3K30A 3LHVA 2FPVA 4UFMA 1TQJA 2A6NA 4ORMA 1F74A 1L9WA 4AXKA 4JTEA 3KRSA 3KVMA 1M6JA 2NV2A 3LI0A 5CZSA 4FNQA 2VC6A 5AYYA 3S1VA 1C9DA 4PL1A 3TXVA 4JIQA 1M7PA 4UFJA 4XBSA 1VGAA 3UPBA 4OGZA 3T78A 1UJPA 1ZCOA 1SPQA 3HG3A 1KFLA 3W1XA 1XL9A 4I9AA 3CWOX 4UTUA 5K4XA 2B7QA 3HG2A 3STFA 4GUIA 4UNLA 4O1DA 3W76A 3FEMA 3LOTA 4WOQA 4LWWA 3EWUA 1I45A 3P5YA 5C55A 4IOTA 4Z1DA 1DQWA 4LOCA 2FFCA 3P67A 3LCXA 4FEZA 2PE4A 2JKEA 4WY0F 1H7WA 5K9XA 3KAOA 3FFSA 5K7JA 3CIXA 5F2GA 3NL6A 1JQXA 3CHVA 3A23A 4BWLA 3LRKA 2J9XA 5DBTA 1FDJA 3DU0A 3DKJA 2JKPA 2W0UA 3QC3A 2G96A 2VFGA 5SWUA 1IXPA 1SO3A 4TU1A 3NNTA 4RV8A 2OT0A 1TV8A 2QCFA 2GQ9A 3Q37A 4LVDA 1WX0A 3TR2A 1JCNA 3A21A 4GNJA 4DO5A 2F7FA 1Q6LA 3SFKA 4KFPA 1T96A 1TPFA 1ZJIA 4AB4A 1ADOA 4GXMA 3NZRA 3N34A 4UTWA 3GDLA 4GJ1A 3LV5A 3CTLA 1ZAJA 3W2JA 1LORA 1I2QA 3OHIA 3TIMA 2EHHA 1EA0A 5LKYA 2I1OA 3QFEA 4O4WA 1JQVA 4B5NA 1TIMA 1HO4A 1Z48A 3ATZA 2FIQA 4O18A 4O52A 4HHPA 4MKNA 2Z0IA 1GQNA 3P5ZA 1X7FA 3DZ1A 3M5ZA 3TAKA 4LW7A 4U28A 3W1UA 1KTBA 3L5AA 1W3TA 4K38A 3NA8A 1OX4B 2ZBTA 3DI0A 1O95A 3RF9A 5HUOA 1G7UA 1SZNA 1G69A 2Z6IA 2X1UA 4LU0A 2A5HA 1ZY9A 3GKFA 2VKZG 3PULA 1QNVA 2A6LA 2VEMA 1K7EA 3G8RA 4Q32A 3C8FA 4LY8A 4WXYA 3G1AA 4GFSA 4O1AA 3UZ5A 4NZJA 2NUXA 3W74A 1JUEA 1K8XA 2NXHA 4UTKA 2C13A 1MO0A 4M7TA 4L4LA 1K3UA 3SI9A 4A21A 3N3MA 3W2LA 1AW1A 2GQ8A 4OV4A 1YPIA 1VCVA 3B8DA 4MIMA 3TFCA 4LNYA 5G1YA 1K8YA 1R2RA 4QIUA 3NGJA 1KV5A 4WZHA 5KSWA 2PRHA 2WPBA 3UZJA 2WOQA 3TUUA 3I6RA 4MZYA 5EY5A 1KTNA 4FIQA 3ZR4A 3UQNA 4O8RA 1LP6A 5DXXA 3DBPA 1OG0A 4K39A 1ICQA 3GLCA 4O1BA 3A9IA 2ZYFA 2VEKA 5D32A 3NQDA 5DN1A 5CZTA 3TV8A 1FWRA 5EBUA 1SZGA 4ADTA 3THQA 1ME9A 3N9RA 4H6KA 3R12A 3O63A 4UTLA 1QOQA 1EUNA 4RR4A 2EKCA 4AWTA 3IIOA 3M6YA 1XI3A 4K6AA 1NFBA 4JD4A 4P61A 3TMLA 3S9YA 2A1YA 3G1FA 2PRLA 4H4IA 4DPQA 1EP2A 1RQEA 1RR2A 1RZMA 3TQVA 2ABBA 1KV8A 1KTCA 2JKAA 5C5YA 3TQKA 1U5JA 1QWGA 4J9JA 1WDWA 4Y8FA 2Y61A 3TSBA 3VKJA 4EOUA 5K9CA 4HPXA 3NAVA 1ZAIA 2DJXA 3W7HA 1OK6A 1Q6RA 2FPYA 1VCGA 3RLUA 3CB8A 1FY6A 3C2EA 4PCFA 3U6WA 4Q33A 4ADSA 1Q6QA 3T4CA 3NQAA 1NF7A 4DBDA 1N8FA 3FA5A 2I14A 5AC8A 4OU1A 4HNVA 4YCOA 4JGDA 2PCQA 4LVFA 5HMSA 4KWVA 3W7EA 3FIGA 2A85A 5LGZA 4C1KA 5CSRA 1CX9A 1IXNA 1D3GA 1UCWA 2ZRZA 2YXGA 1H7OA 2Y63A 2ABAA 4MYAA 1P4CA 1IXQA 2ALDA 2P10A 3A5FA 4IX0A 3S5ZA 4CNOA 3W7JA 1YPFA 3S1XA 4NNCA 1XBVA 1TPWA 3P60A 3HF3A 3FJLA 1FX6A 4MJMA 4S2CA 5BMXA 4ORIA 5D2YA 1FWTA 2J24A 4JY9A 5U7SA 1RV8A 4O14A 5D04C 1IIGA 3GKAA 4N9DA 4FNSA 3T40A 1G4EA 1VR6A 1PHQA 5FF2A 4NXSA 3TX9A 1D9EA 5KITA 1F6PA 3DHDA 3KVKA 1IF2A 3TC7A 3P8JA 5DXYA 4PEKA 4U4MA 2R94A 2QJGA 2O7QA 3MJYA 4O0ZA 4XTIA 4JTUA 3E0IA 2E5DA 3EB2A 3WK3A 3R2GA 3W73A 1BWKA 5G4WA 2Y7EA 5H2ZA 3PG9A 4MLJA 3A22A 1RQHA 3ABQA 3NR0A 3LRLA 3O06A 3Q2DA 1PIIA 2C3ZA 3W7LA 1YADA 5F1VA 3C52A 3N2XA 2Q8LA 4NT0A 5D03A 2E77A 2OT1A 2NLIA 3LBCA 3QPYA 1SO6A 4WJEA 3LERA 2C18A 3O6CA 1IIHA 3GXTA 2B7NA 3W85A 1S3HA 4M6PA 1Z42A 3EXRA 1VS1A 3DFPA 1VYRA 5LNRA 3VE7A 2ZZ7A 2Y89A 3B4UA 1CI1A 2YPIA 1OFRA 5AHFA 3HBLA 1YDVA 1LBMA 3LHWA 4QISA 1OFDA 3FYOA 4O19A 5CPOA 3TK7A 3STEA 3TXZA 3P74A 1LLZA 1TV5A 3BVJA 3PBYA 2G97A 3PF3A 2XFWA 4DEFA 3MO7A 4QSHA 4IWWA 1RD5A 3LTPA 3W7KA 3LM7A 5HR6A 3A5VA 2RHGA 3DENA 3W7NA 1I2RA 1DV7A 1W5NA 3LTSA 2D73A 3DFNA 1OYCA 2PRMA 1TRIA 3TKFA 3LCLA 1QMLA 3DAQA 4LC6A 3STGA 1ONRA 3DXIA 4HIBA 3W70A 3E9AA 4O10A 5D09A 2V9DA 4CLMA 2WKJA 3PY2A 3LHZA 3BO9A 2ZZ1A 2A7PA 3MHGA 1ICSA 5MHBA 2QCDB 3RMJA 1I2OA 1GOXA 3THAA 4M6VA 5I3HA 2QAPA 1H60A 1DBTA 1ZALA 1WYIA 2YYUA 3BGJA 3MYOA 5AFDA 3LRMA 1F5ZA 1VHNA 2G95A 3KVLA 4Y96A 1FCQA 4GRSA 3WFAA 2Z6JA 3R8RA 3PC0A 3QSTA 4FO4A 4OE7A 2C1HA 2ZFAA 3KFTA 1PCWA 5LGXA 3IIPA 1W1ZA 4A2SA 3GIYA 2ZDRA 5K4ZA 3C2FA 1O5KA 2A21A 2ZQ0A 2H6RA 2NUWA 2YSWA 1W5QA 1H1ZA 5E1QA 4NJHA 4DQWA 1B9BA 1K02A 3MI6A 5FESA 3W3OA 2FB2A 5KZEA 1LDCA 4YLWA 5A8GA 5LHEA 1XM3A 2XN2A 3OA3A 3M5YA 3GZ3A 2ZTJA 4ZQNA 2B0MA 4UIOA 3M47A 1DJNA 1PCKA 1U83A 4JYDA 4WY0A 1QO5A 1QPRA 2ZZ3A 4AHQA 4NQ1A 5BW6A 4O28A 4X2RA 4JTLA 4LUJA 1X8FA 1KM5A 1R2TA 5G5IA 3P80A 1TPUA 2CZFA 2NX1A 5F4SA 3TCEA 2WV8A 2DJLA 3SGZA 1QR7A 3GNDA 3NZ1A 1G4PA 3SJ3A 5AYXA 4JN6A 4ZMGA 3LCIA 3AO0A 1TO3A 3C4UA 3DFSA 4POCA 2GJLA 2R91A 3LHYA 4X9SA 1Z41A 3DI1A 5D2VA 4HNNA 3M5VA 3I68A 1SW0A 2CZ5A 1LLWA 3UWZA 2VELA 1ICPA 3GB6A 3Q94A 2EGZA 3MP3A 1K7XA 1R46A 1N55A 3LDVA 2ATSA 3PM6A 2YW3A 1SQ7A 3N9SA 5F2LA 3L0KA 2J27A 3N14A 3PS7A 5L6UA 3MWAA 3IV3A 3RU6A 4FXRA 3QF0A 4DPPA 4HPJA 1YDOA 5KMYA 1ZENA 2YW4A 3WJSA 4BI5A 1SO4A 4XKYB 4O15A 3C2VA 3I65A 3SIZA 3IVTA 1QOPA 4ML9A 2QEZA 3IVSA 1MXSA 3CPRA 1F2JA 2BWGA 1XC4A 1P1XA 2NX3A 1ZAHA 3MP4A 1VCFA 2IQTA 3HPSA 3MI3A 3MP5A 4MY9A 2YFNA 1XCFA 3MBFA 3EX6A 5AHNA 5FI8A 1P0NA 3QMSA 3S8HA 1KFBA 2XN0A 1SZFA 2VFDA 2X30A 5FEWA 2C6QA 3EKLA 3W07A 4HNTA 1Q3NA 5CSSA 2VFFA 1WOAA 3IIZA 3S1WA 4HT3A 2DZPA 1TV7A 4E0CA 3C6CA 3TU9A 2X1RA 4N4PA 3GYEA 1TPC1 3SY5A 3EX4A 2Y70A 3NO5A 2BXVA 2TMDA 4NJIA 3GR7A 1GVQA 2FB3A 1Y0EA 1JRCA 4NNBA 1L6SA 4FX6M 1GYLA 1UASA 1HO1A 2NWRA 4EVZA 3F4WA 4IGHA 1ZHAA 3ABSA 2P1FA 2CU0A 5D30A 1OX4A 4ADUA 4RZ4A 3ZS4A 1PHWA 2Q8ZA 4IX2A 2GOUA 1VLWA 2ZZ2A 3U8GA 3VFLA 5FEPA 1OK4A 2V2DA 3W88A 1X1ZA 1S5VA 4RZ6A 1P0KA 3L5MA 4E38A 2O7SA 3O1NA 3NL3A 2GQAA 1DOSA 3UY7A 3QJAA 3TROA 4JTJA 3IEBA 1FXPA 3LV6A 4DO4A 1E51A 4AVFA 1W54A 4DELA 3V75A 4IJBA 1QFEA 3SW6A 3MYPA 3F03K 4UUIA 5A5WA 1B4KA 2HTMA 2ZRUA 5T26A 1SUXA 3JR2A 1TPVA 1A5SA 4Q4KA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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