4UTW | Genus

Total Genus 83

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	83
sequence length	229
structure length	229
Chain Sequence	GSHHHHHHHMLDVVKGNLIVSCQALSDEPLHSSFIMGRMAIAAKQGGAAAIRAQGVNDINEIKEVTKLPIIGIIKRNYDDSEIYITPTMKEVDELLKTDCEMIALDATKRKRPNGENVKDLVDAIHAKGRLAMADISTLEEGIEAEKLGFDCVSTTLSGYTPYSKQSNSVDFELLEELVKTVKIPVICEGRINTPEELKKALDLGAYSAVVGGAITRPQQITKRFTDIL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Isomerase
molecule keywords	PUTATIVE N-ACETYLMANNOSAMINE-6-PHOSPHATE 2-EPIMERASE
publication title	Structural and Functional Characterization of the Clostridium Perfringens N-Acetylmannosamine-6-Phosphate 2-Epimerase Essential for the Sialic Acid Salvage Pathway pubmed doi rcsb
source organism	Clostridium perfringens str. 13
total genus	83
structure length	229
sequence length	229
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 5.1.3.9: N-acylglucosamine-6-phosphate 2-epimerase.
pdb deposition date	2014-07-23

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4utwA00

2NXGA 4NJJA 4YL2A 1EA0A 1QDSA 3UNDA 1QOQA 2NX1A 2ZRUA 1GG0A 2V82A 4JGDA 3S0CA 2G97A 3LXAA 4M7SA 5DBUA 4OT7A 4HNVA 3DFPA 1OABA 1OX5A 3L5MA 4OBTA 2OMAA 2DZSA 4FO4A 4JYFA 4Q33A 5DLCA 4JX5A 2HS8A 4LVDA 3SY5A 2QDGA 3L0KA 4N6EA 1EWEA 3R8RA 4UTTA 3FA5A 4K7YA 1GVOA 3DFTA 1QWGA 3PUEA 5CZSA 2GQ9A 2NWRA 2ZZ3A 5CGQA 3TE9A 1W8SA 3G1VA 1OFPA 5FF4A 3RU6A 4TMCA 4JTEA 4GUFA 3G1AA 3MYOA 4O52A 1O60A 3FOKA 3W2UA 5HQEA 1VR6A 3GK0A 4PODA 4YLWA 3LRKA 3QFEA 3KVLA 3W73A 4BI6A 1DVJA 2VEIA 3R2GA 1GOXA 3QC3A 5CG7A 1K03A 4B5NA 3TXVA 1DQWA 3DBPA 4AF0B 7TIMA 4O16A 4QISA 3WFAA 5FEZA 2F84A 3W2MA 4UC5A 3MI3A 1JUKA 3MMTA 4NZJA 1FWTA 1TPDA 3QPZA 3NYZA 4IMGA 4NJKA 1WOAA 1CW2A 3NVTA 3GXPA 4DEFA 3I7SA 3S5ZA 4ORMA 3B8DA 2DJLA 4ORIA 1TPWA 2YW4A 1O95A 3KHJA 2GJLA 3THAA 2V9DA 3LRMA 3JRKA 3TJXA 1QPQA 1F5ZA 3KAOA 2X1SA 1TRIA 1RQHA 2J9ZA 3GLCA 1TTPA 3M43A 2H3BA 2X2GA 3PB0A 1TV8A 4TR9A 1YYAA 4TX9A 3W76A 5C55A 3FYOA 3P82A 5AOUA 2HS6A 2QCGA 4E38A 2CFFA 4O53A 3W88A 4LY8A 3RFAA 3STCA 3F4WA 5K2ZA 4TU1A 1VZWA 3BLIA 2E6FA 3MYPA 4JTTA 1NF7A 3NXFA 1FXQA 4ZQCA 4RV8A 1IF2A 3M5YA 1YDOA 3TJLA 1PE1A 1ZFJA 4UR8A 5TBOA 2Q8ZA 2C3ZA 1OYCA 1I2OA 3IGXA 3SECA 3MP4A 2J6XA 3NPVA 5AHMA 2QR6A 2A85A 3M44A 4CQ8A 3ATYA 3GAKA 2CU0A 4JTGA 1PHQA 4KWVA 5A5WA 3NZ1A 1XL9A 3FJ6A 1WBJA 4OV9A 4UTWC 4O12A 1WYIA 4FIQA 4KFPA 1TYGA 1QOPA 3UWZA 4LVBA 1K7XA 3TV8A 3QMRA 4K38A 1X7FA 1VPXA 4ADUA 4YCOA 4X3ZA 3LTSA 2OJPA 2X1RA 3LDVA 1ZY9A 1PS9A 1KTBA 4HT3A 1IXQA 1L2UA 5F4SA 2NV1A 4UR7A 3CT7A 4Y90A 3DKJA 4AXKA 3FLUA 1SZFA 4TO8A 4RX0A 5LSMA 1ME7A 4S2CA 2Y7EA 1FXPA 5DBTA 1FY6A 2J27A 2WPBA 2CLOA 4FXSA 1W5MA 1SFLA 2VFHA 3HB9A 5TQLA 3KVMA 3C52A 4RJEA 4WXYA 4GFSA 4BF9A 3B04A 3WK0A 1WV2A 4L4LA 4ONVA 4QSHA 4A3UA 5H2ZA 3UY8A 3A5FA 3PY2A 3G1XA 1DHPA 4MJMA 4MFDA 3C4UA 3WK2A 1H5YA 4LWWA 3W7RA 3BW2A 3ZS4A 4S1FA 2XN2A 1FX6A 4JD4A 2EAWA 3HF3A 3VE7A 1OFOA 4LS0A 5FF7A 4DO6A 2OT1A 3P8IA 3SJ3A 1OYBA 3IGUA 5BNKA 1BWKA 5ABTA 4DQWA 5L6UA 3JR2A 1GPWA 3UD6A 3P84A 2YSWA 3Q37A 2WSQA 4ML9A 1NSJA 1QPNA 1YLVA 2NXHA 1G4EA 2CZFA 3DGRA 2V81A 4DELA 3R5EA 2VKZG 1ZHAA 1SZEA 3GIYA 2NX3A 3H55A 1L6WA 3LM7A 4A21A 4CNOA 4JYDA 2YZRA 3BW4A 1O5XA 2PCQA 1G4SA 2DZXA 3W1MA 2A7PA 3W85A 2DP3A 1YXYA 3USBA 1I2QA 3W75A 4JTHA 1SW3A 3PG8A 3S1XA 1MZHA 4GUHA 4EWND 3TH6A 5LHFA 3WJWA 1OX4A 3GDTA 1VYPX 4CNPA 1T8XA 4DBEA 1X1ZA 3W72A 1TJRA 3NQ7A 5I3IA 3EWUA 1LRQA 1R2RA 2Y88A 1TO3A 1OHLA 1LROA 5G1YA 1W5PA 3NR0A 4IX2A 2YGYA 3W1LA 3QH2A 1SW0A 2RKXA 3SFKA 4JYEA 1F6KA 3L2IA 3M9YA 3CTLA 4HNTA 3BK0A 5IBXA 3S5NA 3EX3A 2ABBA 1JQVA 2ZA1A 4JS3A 1W0MA 4LVAA 3A21A 2CLFA 5AB3A 4O0KA 3W1QA 3HG2A 3I6RA 4AHPA 4XKYA 4QAIA 3G0XA 5AHNA 4XBKA 3MP5A 4IMEA 3UZJA 3NEVA 3DAQA 1KM2A 4M5PA 3NL2A 4I9AA 4Y8FA 2NUWA 3DI1A 4NJHA 3E96A 4NU7A 1QCWA 3F1QA 2ZYFA 2QUTA 2D73A 5HR7A 3LCGA 2TMDA 4CNNA 4LVGA 3LLFA 4XWUA 3CM4A 3FJLA 2EPHA 3CHVA 4FHAA 5CSRA 2VC6A 3SIZA 4HSOA 2G95A 1JUEA 5HR6A 4WUIA 4QNWA 1NFBA 1PCWA 2C0AA 2NV2A 4LUIA 3W7EA 3BGGA 2BX7A 1G7VA 3PS7A 3IRDA 3FS2A 3G24A 4N9BA 2FDSA 2GQ8A 2WNZA 4UMBA 3SSJA 3W7NA 3EB2A 1H7RA 4NX0A 5FEPA 3IV3A 3PM6A 3LERA 2J9YA 5EYWA 3TU9A 5KMYA 3GB6A 1CX9A 1H60A 2ZZ1A 4I7WA 2NX9A 4Y9AA 1B3OA 3O6DA 3FIGA 4IJBA 1V7YA 3O8AA 3HJZA 1QMLA 3S42A 3MW7A 4GUGA 4FXRA 3C2VA 2E6AA 5AC7A 3C0JA 2KZHA 6TIMA 4DXVA 4RCXA 1TRDA 1QO5A 2B7PA 4M6PA 1JCJA 3EWBX 4M19A 2A1YA 3TAKA 3QZEA 4GC4A 5HNRA 1BTMA 1R46A 2ISWA 5D04C 3LHWA 4HPXA 3L68A 1LM1A 2VEPA 4PTNA 3G1FA 4DF1A 4AHOA 4MUZA 3P80A 3G8RA 5EKYA 3N2XA 2A6NA 3P62A 1GWJA 1Q6LA 3G0UA 4O4WA 1F05A 5DY2A 2WJZA 3NA8A 3GR8A 2EGZA 1KTCA 2E5DA 1J2WA 5DXXA 1YTDA 3Q94A 3VKJA 3FYPA 3MP3A 1K8YA 1KM3A 1JULA 1M7OA 4OE7A 1K7EA 3G1DA 3ZWTA 4UXDA 3W7IA 3SR7A 4DO4A 3CWOX 1ONRA 4Q4KA 2P0OA 1YDVA 1VYRA 4ZQMA 4OU1A 4GUIA 1TPFA 1O94A 2V8ZA 1KFJA 1C29A 3O6YX 5FI8A 2QJHA 4BR1A 2C19A 1VC4A 1ICQA 4A2SA 3E02A 5HUPA 1OYAA 1TSIA 2ZRWA 3O15A 4PC8A 4R7JA 1B4KA 2WOQA 3GVGA 3UWVA 1TPB1 5EY5A 3TC7A 1UJPA 2OX1A 3B0PA 4BWLC 1WOBA 4DF0A 2GUUA 1KM0A 3ABRA 4K8EA 3S9YA 2YXGA 5EMUA 4R34A 5KZDA 3LCIA 1OVDA 3V75A 4LNYA 3W2NA 1XBZA 3LCWA 4PL1A 1SZGA 4XZ9A 5F2IA 4JTFA 3PVFA 4NX5A 1XKYA 1QPRA 1Q6RA 3W1AA 3M1ZA 5HWJA 4HN4A 1WDWA 3E0IA 2EF9A 3LV5A 4U28A 1VH7A 1I4NA 3PF3A 3KXQA 4O10A 4OV4A 4Z1DA 2QAFA 1Q6OA 4MZ8A 2F7FA 2WKJA 5BMWA 1LLZA 2FPVA 2H3DA 1JCMP 4D2JA 4FNPA 3MI6A 1QNVA 2ATMA 4UMAA 4RXFA 2B0MA 4BWLA 3PC0A 3UPWA 1H1ZA 2ZFAA 5J5RA 3OA3A 2BWGA 1LYXA 3STEA 5KSWA 3OVRA 4Q32A 5G4WA 3NPXA 1GVFA 2WO5A 1KV8A 2ZZ7A 3MO7A 2Z2UA 3VCRA 1KM6A 3LCLA 3NNTA 1C8VA 3H53A 2JBMA 1X8FA 3HPZA 3O63A 3GXNA 3NL5A 4UFLA 5KZEA 3U6WA 2OT0A 4WY0B 5I3GA 3TFXA 1HG3A 4RKAA 1YTKA 3GDLA 2QCNA 1ICPA 5G2HA 1DJNA 1ZALA 3M5VA 2Y7DA 3WJXA 2VFEA 2Z0IA 1KFKA 4IPIA 1SO5A 2WNQA 3LV6A 1L6SA 3KVJA 3I7RA 5D02A 3P61A 5EBUA 1U83A 3CC1A 3PAJA 4K36A 3GKFA 4EIVA 2YX0A 3QQ0A 1W54A 4P61A 1I45A 3NZRA 3EWXA 4JEQA 4FB7A 4A29A 5D2XA 2AAMA 3KRZA 5CZTA 1EWDA 1LORA 2H6RA 3HGSA 1HUVA 4N9DA 3NQ6A 4MIMA 4CCCA 2ZRXA 1G69A 1IIGA 1S3HA 4N2YA 4QITA 2A4AA 1W5QA 1GYNA 2CLKA 1TV7A 1XBXA 2GVLA 2G96A 1HO4A 1FCVA 3C8FA 1YPIA 2C13A 2PURA 5AHEA 2ISVA 2IQTA 3DFSA 3W7CA 2ISSA 3NM3A 4C1LA 3CIXA 3CB8A 3LHTA 4H4IA 4O28A 1TQXA 1WBHA 3BVJA 4I7UA 4UNKA 3W70A 4HKPA 1GVRA 1KM5A 4YMZA 1VHCA 5G1TA 1XUZA 3HGJA 5BW6A 5BOOA 3DZ1A 4O11A 1TTIA 3LHZA 4IUOA 4PEKA 2PRHA 4LS2A 3PG9A 1PIIA 1ML1A 3QMSA 4NT0A 2CLIA 4FX6M 1SSGA 2QUVA 5LNUA 3IVSA 1ICSA 3O07A 3F03K 4L4MA 1AW1A 4H6KA 2QCDB 4ZZ9A 3S5YA 1SO4A 4MZ1A 3SW6A 3M0ZA 3YPIA 5E93A 3MJYA 5EA9A 3DFOA 2V30A 1JR1A 4LRTA 2E77A 2CW6A 2RDWA 1OFAA 3WJZA 5HJLA 3NQMA 1JVNA 1O4UA 1GTEA 4JTUA 1XFBA 2A5HA 5CPMA 1ZCOA 1SU5A 1AW5A 4GRSA 5D2WA 4ZL1A 1GG1A 1Z44A 5AC6A 4BFAA 3LLDA 2YPIA 2CZDA 4IMCA 3P81A 2RDTA 4IPJA 2QF7A 3I65A 2W79A 4UFHA 2DZTA 1DL3A 3QSTA 3UXAA 1SR9A 2ZTJA 3GXTA 1B4EA 1FDJA 1LTDA 3IVUA 1GZGA 3CEUA 3N34A 3TIMA 5KZMA 2V0TA 3L0NA 3V1PA 5D09A 1BEUA 2VEMA 4LC8A 1DJQA 3R12A 1DQXA 1TCDA 2FFCA 5K4XA 3T7VA 3W7LA 1H51A 2ZTKA 3A22A 4LUJA 1E51A 4LC6A 4MLJA 5DCDA 5TIMA 4UTKA 3UQNA 4WD0A 4QJ1A 5F2LA 2A21A 1BKSA 2V2CA 4EF9A 4AVFA 5HWMA 5BRBA 1I2NA 1G67A 2VFDA 3BG9A 1SO3A 4NVTA 1EPXA 1H1YA 1AW2A 4JN6A 1KBIA 3S1VA 3S1WA 4Y6GA 2FB2A 1TIMA 2H90A 1AK5A 4LV9A 2B7OA 2NLIA 1TPVA 1EUAA 5LNVA 1T99A 1QFEA 3QEZA 4S2BA 1GVQA 4ADTA 1TPEA 5D2VA 3O6CA 5T26A 4JX6A 2XN1A 4MYAA 1OF8A 4UMCA 3UPBA 2FPTA 4LV4A 2C15A 3DHDA 3P7YA 3NQDA 5IBXC 1EIXA 3NM1A 3W2LA 2Y7FA 2X1TA 1HL2A 2E68A 4UFMA 3S8HA 1T96A 1C9DA 2AGKA 1TJPA 3NQ2A 5FF2A 3FFSA 5G2WA 4LTSA 2R14A 3W84A 2GVGA 2JKAA 5I3HA 1HFBA 4AEOA 1OG0A 2B7NA 1PL9A 2DORA 3E12A 1ZENA 3Q2DA 4AB4A 5BMXA 3OBKA 3HPXA 3M5ZA 5K9DA 3HG5A 3I68A 3TFCA 1I2PA 1OJXA 4NNBA 3E49A 4HSNA 3TSMA 1RV8A 4HNUA 3IIZA 1DORA 3CU2A 3LCHA 1R47A 1GVSA 1JQXA 4JX4A 4RZ5A 4N02A 3NL3A 1VYSX 4MPQA 4O1AA 5MHBA 1S5TA 4N6FA 3ZWSA 3EXSA 2Z1BA 3LGEA 4EOUA 3S5OA 2ZRVA 3TW6A 4C1KA 3CWNA 3THQA 1KA9F 1I2RA 4LS1A 1RQEA 3NPUA 3NOEA 1HO1A 4MY1A 4UUIA 5HULA 1P0NA 3CLMA 3BARA 4JICA 1KFLA 4HHPA 1FBAA 2V2HA 1YPFA 3IEBA 2DZUA 5AHFA 3TKFA 5SWUA 4R53A 3C2RA 1LDCA 3C56A 3P8JA 4MOZA 3NQ8A 3WK3A 3W2KA 5AC8A 2CLLA 2QCMA 3ZR4A 3QW4B 2GQAA 3QM3A 3TMLA 3JS3A 1T0OA 2B4GA 3NAVA 4DBDA 1LOLA 4IGHA 1H7NA 4FNQA 4K7VA 3PBWA 4JTIA 1SPQA 1WX0A 2W0UA 1PVNA 2PE4A 2ZCGA 3T78A 2Y61A 1X6UA 3PULA 1RPXA 1EEPA 3LHYA 3M41A 5DN1A 1O5KA 5U7SA 1JCYA 1ADOA 1K02A 4NJGA 1OFDA 1FCBA 1PCKA 5LNWA 3W7QA 2FLIA 1U5JA 1W37A 4OGZA 1FCUA 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3CEPA 3GNNA 2QCEA 5D2TA 2BXVA 5CZ0A 1M6JA 1A5SA 5G5IA 1N55A 4DPPA 4RR4A 1SUXA 3TR2A 3NL6A 5KITA 3HG3A 3EEGA 4MKNA 2EKCA 2YFNA 2EHHA 2W6RA 4R33A 2XN0A 2J9XA 1MEHA 2E09A 3NG3A 4XKYB 1LOQA 4LT9A 4EF8A 4O8RA 3TNOA 3W7GA 3OVQA 4FX8A 1Z41A 3TXZA 3NGJA 5D33A 4O0ZA 5D05A 2ATSA 4HPJA 4TMBA 1P0KA 1RQBA 1VGAA 1VLIA 3BLFA 4NNCA 4JTSA 4O1DA 1SZNA 1WAUA 4K8HA 5LGXA 1YXDA 3UYCA 2O7QA 4WXZA 2QKFA 1F74A 5FEXA 3U2OA 3M16A 1EP2A 3L21A 2A6LA 1HTIA 2I1OA 3PB2A 1P1XA 3MBFA 2JKEA 5AHIA 4PL2A 5D37A 2WSYA 4P2VA 3T4CA 1XDLA 3W7HA 3WJYA 1IGSA 3G22A 1XI3A 4RZ6A 4WY0F 5KINA 3EX4A 1SSDA 2ZZ6A 4LVFA 3HGRA 4N9EA 1XUUA 5D2YA 1IXNA 3DH7A 1VHNA 2H8ZA 3QJAA 4K6AA 5DCBA 5DY3A 2BSLA 1RVGA 1KBJA 3CIWA 2UV8G 1LZOA 5KTLA 5F2MA 5DCEA 5K9CA 4K39A 3P60A 3BLEA 1G4PA 3C2OA 3LBCA 3A23A 4TIMA 2NXIA 2V5LA 3W1RA 3EWYA 4UTHA 3HG4A 3S6DA 4NNAA 1H50A 4CCEA 3RLVA 2PRLA 4YWIA 4WQ6A 4WZHA 4ZQNA 3LHVA 1MXSA 4UTLA 5K9XA 4PCFA 2CLMA 3H54A 4W9TA 1WA3A 5I3FA 1ZAHA 1JCNA 2ALDA 2QEZA 2VFGA 2A2IA 3ANYA 2TPSA 1DKWA 4MY9A 1YTEA 3IIVA 5AYXA 1UB3A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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