The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
33
|
sequence length |
82
|
structure length |
82
|
Chain Sequence |
PEALTVAATEVRRIRDRAIQSDAQVAPMTTAVRPPAADLVSEKAATFLVEYARKYRQTIAAAAVVLEEFAHALTTGADKYAT
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein transport
|
| molecule keywords |
PE family protein PE25
|
| publication title |
Structure of a PE-PPE-EspG complex from Mycobacterium tuberculosis reveals molecular specificity of ESX protein secretion.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Mycobacterium tuberculosis
|
| total genus |
33
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| structure length |
82
|
| sequence length |
82
|
| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-08-14 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | HP0062-like domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4J7K A; 4W4K A; 4IYI A; 4J42 A; 4J10 A; 4KXR A; 2G38 A; 4J7J A; 4J11 A; 2GTS A; 4J41 A; 3FX7 A; 4W4L A; 4IYH A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4JI4 B; 1ZUQ A; 4WFB V; 2HHH B; 1DF4 A; 1UFI A; 2BSK B; 1K3E A; 2CUG A; 3OTO O; 4TWK A; 5BMV B; 1G4Y B; 3CJH A; 2RMK B; 4JAU A; 4IL6 Z; 2X7R B; 3T1H O; 1N36 O; 1VQ4 V; 2ZD9 A; 3CWB H; 2BOC C; 5DED A; 2AGA A; 2HR3 A; 5CA1 B; 1SQX H; 2ZDI A; 2XUM A; 4FLV A; 4B3S B; 2RNB A; 3A0B Z; 3E89 A; 4A5U B; 1B3Q A; 4PD4 F; 5JCO C; 2YXH A; 4O2B B; 4PHZ A; 4TQF A; 1F7Y A; 5B3S C; 4LF6 O; 3W7T A; 5C93 A; 1RPR A; 1DLB A; 2Y48 A; 2P6J A; 4X20 A; 2DYR B; 3UO3 A; 3K0D A; 3CHX A; 1ZX3 A; 2WA4 A; 1JJO A; 1I5X A; 3JD3 A; 3QF7 A; 4X66 B; 4LF9 B; 2Y0P A; 5KUK A; 4TUY A; 2BOB C; 2GUZ A; 5DEC A; 1AP6 A; 3ZRW A; 1H8H G; 3WB0 A; 3LSU A; 1IBL B; 1SA0 A; 4FJC C; 2G38 A; 1QLE C; 3RYC A; 1FXK A; 2YI9 A; 3HKB B; 4KUM A; 3I56 V; 3KCY A; 1VQ5 V; 4X88 A; 4XDL A; 1DGS A; 1KP2 A; 1VF5 B; 1H2K A; 3T2M A; 3RYI B; 2OTL V; 4O4H B; 2UXD O; 3BVO A; 1GKF A; 4E4E A; 3WB2 A; 4LR3 A; 4YY3 B; 4GKK O; 3TET A; 4CH3 A; 1PD3 A; 3RT3 C; 3JAT A; 3DGE A; 2R9R B; 2VRZ A; 4FFB A; 3FB6 C; 2JRI A; 1NH2 B; 1HNW O; 3OMN B; 1US6 A; 1NR1 A; 2DQ3 A; 3QO8 A; 3QO7 A; 2UXB B; 3TJT A; 5DM6 V; 3JAK A; 5JQG B; 4TSF G; 4DR3 O; 4DV2 B; 2RQ6 A; 4UVB A; 3OGC C; 1VAR A; 4UV9 A; 4B3M B; 1XNQ B; 1TVK A; 3SYA A; 4DYL A; 3W7X A; 3CSX A; 3B8N A; 1MZE A; 4LBE C; 4LFA O; 3EXA A; 1GAX A; 4DK1 A; 5C8Y A; 3ETE A; 4B7K A; 2DJV A; 3Q4H A; 4OPH A; 1OZ0 A; 3HR0 A; 4ZHQ A; 4BWA A; 4AI8 A; 1BHB A; 3JSN A; 4WFF A; 3CRQ A; 5IYD O; 2Q4P A; 4TQD A; 1D2D A; 1AI6 A; 4PDM A; 4JGS A; 3ZHU A; 3ZRX A; 5ITZ B; 3AG4 B; 5LYJ A; 3OD4 A; 1O9G A; 1D5N A; 2QKA A; 4X65 B; 4J80 A; 1QBZ A; 1P7B A; 4DR7 O; 3OAA G; 5GTH Z; 3SPC A; 4GX0 A; 5BR8 O; 2WLK A; 2YXY A; 3CP1 A; 1GN4 A; 1V54 C; 2OT5 A; 4G27 B; 5EYP A; 2QWN B; 5IY5 B; 2Q69 A; 1RPO A; 2QE7 G; 1N4C A; 3K06 A; 2V4D A; 2QM7 A; 4GCZ A; 1W59 A; 2UXN A; 2YEV B; 2ZE6 A; 4L8J A; 3ZS8 C; 2L35 A; 3E8G A; 2BTQ B; 4YHH B; 1R3K C; 2IU0 A; 1JJ2 U; 2QWP B; 2LO1 A; 3D36 C; 4JAA A; 5IWA O; 1OCC B; 4DK0 A; 4PDL A; 3LSQ A; 1IBM B; 1PNL A; 4I55 A; 1JQ0 A; 1B04 A; 3D8C A; 1SQB H; 2F4V O; 3ICX A; 1WN7 A; 4DV6 O; 4DV7 O; 1Q6H A; 5L3G A; 4AQY B; 3UT5 B; 3ABK B; 3FAV B; 3MHH C; 4EEQ A; 3DC5 A; 5KLV H; 1X59 A; 2ZCE A; 5J2T B; 2W0F C; 3TGU H; 3CMA V; 5H9C A; 2ZXW B; 4DR2 B; 4LF5 O; 4OGQ B; 4O4I A; 1IUR A; 1PKX A; 1AI5 A; 1PL0 A; 3A0H Z; 3AK1 A; 5FL7 G; 2Q7G A; 2RJZ A; 4I50 A; 4ASU G; 4TT3 G; 1NVP B; 2ITC C; 1I7F A; 4DR1 O; 4NXM B; 1M4U A; 3K0G A; 3U0Z A; 1FYJ A; 3J81 N; 4DW1 A; 2IW5 A; 3ZHR A; 2GHY A; 3F7V C; 5F2V O; 1FFX B; 1YEW A; 3HPL C; 1QNM A; 2UUC O; 1IZ3 A; 1E1R G; 2F43 G; 2QJ1 A; 3JAS A; 1Y76 A; 3CEI A; 3JD4 A; 4BR6 A; 4LWS A; 4ZKI A; 4CS2 A; 4JI1 O; 1B6Q A; 1XRE A; 4JI5 B; 3QVN A; 4F6R B; 3E8H A; 3K5O A; 3B2E E; 1N0N A; 3LUT B; 2QGN A; 2UUB O; 5L3D A; 1XI1 A; 3NR7 A; 2WSS G; 1F51 A; 1Z5W A; 1HNX O; 3T1Y O; 5KMG B; 5LP6 A; 1XMQ O; 4UVA A; 1NTZ H; 1ZL8 B; 3L74 H; 4CH5 A; 5L3F A; 4UFZ A; 1XL4 A; 3PN1 A; 1BL8 A; 1K73 W; 3ABL B; 2HJD A; 2CE4 A; 1XHZ A; 3CJH B; 1N33 O; 1YTF D; 1VQL V; 4Z1M G; 1EM1 A; 3OW2 U; 3EVK A; 1R6K A; 2QWO B; 4H0L B; 4DV1 O; 1JX9 A; 1SZX A; 4UCT A; 3WB1 A; 4IYI A; 5KHH A; 4HBN A; 4QE9 A; 1O9H A; 1XHX A; 4MW3 A; 3F5T A; 1PV0 A; 3CCV V; 4JAS A; 1T5E A; 3ZHQ A; 3JD1 A; 4X20 B; 1YHQ V; 1W0J G; 1VQ7 V; 3T1C A; 5B1A C; 4TUY B; 2GUZ B; 3ZRW B; 4CS3 A; 5CBG A; 4R6Z A; 1LR1 A; 3AG1 C; 3HKE A; 1IBK O; 1Q5O A; 1SA0 B; 3BPZ A; 2N05 A; 4PA9 A; 3RYC B; 4BAY A; 1EBO A; 3E35 A; 1FXK B; 4DO2 A; 3ABT A; 4FLZ A; 2HEP A; 1RSO A; 4X9Q A; 3P3P A; 1ROP A; 5IJ9 A; 4UCV A; 1PP9 H; 4B7E A; 5KHI A; 3SGI A; 1VQK V; 2ZM6 O; 1YF2 A; 3FD9 A; 1HR0 B; 5KUM A; 1E79 G; 3FB8 C; 3CCM V; 1MZF A; 2CTP A; 2RDC A; 1LUW A; 5J2U A; 3JAT B; 4FZ1 A; 4UB6 Z; 4LFA B; 1H2S B; 3AG2 C; 4FFB B; 3QO5 A; 3L73 H; 1N0J A; 1DTO A; 1ZLZ A; 1FKA O; 3JAK B; 4J10 A; 3K3W A; 4DV4 O; 1LNQ A; 1RFY A; 2R70 A; 2D2C B; 4QPJ A; 2ZNJ A; 1KUQ A; 2XT9 A; 3G67 A; 4DR7 B; 1TVK B; 3IFX A; 1K5S A; 4EFE A; 2Q5Z A; 3B40 A; 5C8Y B; 1WPB A; 2LFR A; 4NTW A; 3DXR A; 3M7M X; 3Q4H B; 4JI2 B; 1VQ6 V; 4DR4 O; 4Z2W A; 5LGU A; 2LGW A; 4X62 B; 1IXB A; 4ZHQ B; 4IYH A; 4FLU A; 3JAW A; 1VF7 A; 2NNU A; 1THZ A; 5LYJ B; 4XBF A; 2CTQ A; 3CCR V; 4L87 A; 3JYC A; 3VQX A; 2EIM C; 2F66 C; 2PTM A; 3DC6 A; 4FK5 C; 4N23 A; 1VIB A; 3UKM A; 3K79 A; 4JI0 O; 2E74 B; 3ZRV A; 1BE3 H; 3QG5 A; 2KG7 A; 1OCO C; 4NVP A; 5EYP B; 3GWO A; 3L72 H; 1YDX A; 2E75 B; 2F4V B; 4KHP O; 2QTS A; 4DV6 B; 4DV7 B; 3ZIA G; 1YTF B; 3SPH A; 4NXN O; 3C3T A; 2QTO A; 3O9O A; 5JH7 A; 1K5Q A; 2EIL B; 3D3I A; 4WFE A; 3I5D A; 1JMK C; 4LF5 B; 1W2B U; 4MVO A; 1DF5 A; 2B5U A; 2Q8V A; 2ILM A; 4CC6 A; 3JAM N; 3JD0 A; 4IGG A; 1NKD A; 4I55 B; 2QWR B; 4JTA B; 4B3R O; 2PI4 A; 3U10 A; 2YI8 A; 2KQX A; 4HNA A; 3OFN G; 4JI6 B; 3CS5 A; 4J9Z B; 2B1G A; 5JCO A; 5HFM A; 2IJK A; 1F4N A; 2F23 A; 3THO A; 3X2Q B; 4LF4 O; 2CH7 A; 4FPP A; 4O4I B; 3IAY A; 4DW0 A; 3RVY A; 4E2L A; 4DR6 O; 1WB7 A; 1K4C C; 1BZK A; 2WLL A; 4I50 B; 4JI3 O; 3SYC A; 5CA3 A; 1Q81 W; 2A3Q A; 2BCC H; 4UVC A; 1HNZ O; 1BQ0 A; 1I94 O; 3WFV A; 1Y66 A; 2F95 B; 1QHT A; 2AW9 A; 5DN6 G; 3KCX A; 2Q0O C; 1SF9 A; 2P67 A; 1YVW A; 1I5Y A; 2B1I A; 1KYO F; 2ZR3 A; 4LH7 A; 4YJ3 A; 3P3N A; 3C3S A; 3C90 A; 5LGN A; 4DR5 O; 1KKD A; 4J11 A; 3ETD A; 3BY6 A; 3JAS B; 4OPA A; 2VWJ A; 1M57 B; 1S5H C; 1Y76 B; 1R3J C; 4LWS B; 4DXW A; 3AG3 B; 2FTK A; 2AXT Z; 2WLI A; 2CDY A; 2XOK G; 1K92 A; 1AB3 A; 3E86 A; 4LFC B; 2P4V A; 3J7A U; 4MTX A; 3IJ4 A; 1Q6I A; 2YDE A; 3K08 A; 1ARO P; 1K97 A; 1S0V A; 2EIK C; 5KX5 A; 5BZB A; 4BW5 A; 2GSM B; 3CME V; 3MHS C; 1V9P A; 3RVZ A; 4QJF B; 1EN5 A; 1GN3 A; 5LP6 B; 4FLT A; 2P90 A; 2M6Y A; 4UCS A; 1YJW V; 3ZN1 A; 2ZQM A; 4JV5 O; 1WB8 A; 2R9I A; 3K58 A; 4P2Z A; 1VQP V; 4K0K B; 2EIN C; 3FB7 C; 1U97 A; 2QKC A; 2RN9 A; 3CCS V; 2OCC C; 5L3C A; 3FKS G; 1NS1 A; 4AHC A; 5K1P A; 2ZIN A; 2PGG A; 1IBK B; 2VQF O; 2NR5 A; 1CPY A; 4R7C A; 2Y4T A; 3AK3 A; 4BIO A; 4DUZ B; 2HG5 C; 1NBM G; 4RQE A; 1M1K W; 3BAB A; 2ARH A; 1JFF A; 4X8A A; 3W7W A; 4NYK A; 3SR2 C; 5D5Q A; 2Q7E A; 2A9H A; 1KBH A; 1GM8 A; 1AVM A; 2IM9 A; 3F5W C; 2EIJ B; 4OX9 B; 3ZMZ A; 4MVM A; 3T4Z A; 3HKE B; 4RUF A; 4B3T O; 3CCU V; 1XQ8 A; 2Y0I A; 2HKO A; 3D36 A; 1KEC A; 3OMI B; 1JVM A; 1RSO B; 2JEU A; 5IJ9 B; 3L9D A; 2VS0 A; 4UUJ C; 3KG2 A; 2JDI G; 5TIS Z; 1YIJ V; 4QIW F; 3ABM B; 4D6T H; 4EB6 A; 1VQ9 V; 3JSL A; 2E76 B; 1S5L Z; 3QNE A; 1IXM A; 2E5L O; 3A0R A; 3OTF A; 5J2U B; 3BA9 A; 1KU9 A; 1IVS A; 4JYA B; 5LA6 A; 1N32 O; 4JI7 O; 4X1I A; 3SJA C; 4RO2 A; 2F1M A; 3K9A A; 4DR4 B; 1OCZ C; 2GDS A; 4R50 A; 4LF8 O; 2WLM A; 5IE9 A; 3LDC A; 2Y69 C; 2EBO A; 2A06 H; 1WNS A; 3UQ8 A; 1P84 F; 2P4K A; 3CC7 V; 4PA6 A; 1K34 A; 5LMU B; 4MS2 A; 3WG7 B; 2IBZ H; 2DW4 A; 2YIB D; 3R66 A; 4MTF A; 3STL C; 3DXR B; 2E3C A; 2CK3 G; 1MSW D; 3JAW B; 2W6I G; 3LNM B; 3ASO B; 1VQN V; 3QTC A; 1NI8 A; 5A9G A; 2OWO A; 1PNM A; 1V55 C; 1XNR O; 5EZY A; 3S3X A; 5KHJ A; 4CZZ A; 3SJQ C; 1XBL A; 4X64 O; 2GTS A; 2ZE5 A; 1RM1 B; 2KG7 B; 3AK2 A; 4WCE V; 3ZHS A; 4B3R B; 2WA3 A; 4YJ2 A; 2Q0A A; 5H5N A; 3ZCC A; 1AI4 A; 2LW7 A; 2DYS B; 3SPG A; 2IH1 C; 3E8B A; 2PI5 A; 1Q90 D; 3ZMV A; 5LBQ A; 1WA8 A; 2WLN A; 1TA8 A; 2ODM A; 5B1B C; 5JH7 B; 2NN4 A; 4DV0 O; 4RUE A; 1VF6 C; 4ZI7 A; 2UUA O; 2V1D A; 4ABM A; 1MOF A; 4DV5 O; 1S72 V; 3ETG A; 3K03 A; 4DR6 B; 1A32 A; 4J7J A; 3RN4 A; 3K57 A; 4HNA B; 3CYO A; 1XMO O; 1SER A; 3R65 A; 3IC9 A; 3CE2 A; 1FJG B; 1J5E O; 1HNZ B; 2Q9L A; 4JAV A; 3MD0 A; 4D7T A; 2X6A A; 2PYL A; 1Q86 W; 1KD1 W; 2VQE O; 5B3S B; 1E1Q G; 4YIO A; 2W0X A; 5K1X A; 5LMN O; 4GKJ O; 2WAM A; 1PL4 A; 1JA8 A; 2CH7 B; 4F6E A; 2JGD A; 2MW2 B; 5JJE B; 2L6L A; 3JCU Z; 3APQ A; 1M5I A; 2WLL B; 2ZR2 A; 1EZJ A; 1SES A; 3O65 A; 3UCS C; 1QLE B; 2D3O W; 4JF3 A; 3OUF A; 2Z3Y A; 3OTO B; 2QWQ B; 3MAQ A; 3VQW A; 3T1H B; 1N36 B; 3MDS A; 4YJ3 B; 4P30 A; 1WAZ A; 2GV9 A; 4ZBM A; 1JPX A; 2UXC O; 4GYC B; 4X1K A; 1EN4 A; 2GBO A; 3A8T A; 2WLI B; 3N27 A; 3ZX6 A; 4O4L A; 4LF6 B; 2Z0A A; 1Q43 A; 4FVM A; 3SYP A; 3RYF A; 4LNU A; 3VQV A; 1FFT B; 5KX5 B; 1WPX A; 2N04 A; 3OM3 B; 3J80 N; 1S77 D; 2XTA A; 4DV3 O; 2HHH O; 3K5M A; 5GON A; 4I0X A; 1MG1 A; 3S3W A; 2H3O A; 2ZKO A; 5IJ0 A; 4FIP C; 4D7S A; 2C2A A; 3RYH A; 1BS3 A; 2Q67 A; 1AR1 B; 4MSW C; 4W4K A; 2UXD B; 1G1X B; 2WLH A; 3ASN C; 2QEX V; 1XDC A; 3LSS A; 4MT8 A; 1R73 A; 1QVF U; 3RWR D; 1I08 A; 1OCR C; 4HYO A; 4GKK B; 5D5P A; 1BQZ A; 1YSC A; 2YIA A; 3FYE B; 1HNW B; 4B3T B; 1QVG U; 1P7G A; 4X66 O; 3KZI Z; 4PA3 A; 1V54 B; 2DMX A; 4DR3 B; 2ETN A; 4NTY A; 1VQO V; 4CBC A; 1IBL O; 4MTG A; 4DUY O; 1JFF B; 1GMG A; 4Q20 A; 5FNV A; 2LP7 A; 3CXH F; 3H1J H; 1QLN A; 1BSM A; 4GX1 A; 3OT7 A; 5KAI Z; 2DQ0 A; 3IGA C; 5B66 Z; 2YXL A; 4JI7 B; 4J7Z A; 1TAE A; 1M56 C; 4LF8 B; 2HLD G; 5EIB C; 2JGU A; 1ZAU A; 1WP7 A; 2DYR C; 2UXB O; 4EB6 B; 3CX5 F; 2X6C A; 5BR8 B; 4MVZ A; 1MAB G; 4DV2 O; 3BA8 A; 5IYZ A; 4TV9 A; 3HB3 B; 1HP8 A; 4U7O A; 2AHY A; 3CD6 V; 5LA6 B; 5LHG A; 1WP8 A; 4X1I B; 5EC1 C; 4LP8 A; 2AZ0 A; 1H2M A; 4QGP A; 1S3J A; 3H1K H; 1N34 O; 1ZSP A; 1SS3 A; 1HDJ A; 3JAL A; 2QKS A; 2KKW A; 3ETQ A; 1FS0 G; 1KB9 F; 1AP5 A; 3B77 A; 3VOU A; 5IWA B; 3CCE V; 2P7T C; 3APO A; 4EKW A; 1R6T A; 1H2N A; 4X65 O; 3BHP A; 3SYO A; 3GVM A; 3OGI B; 5EK0 A; 2KB1 A; 3N2K A; 5LXT A; 1OHH G; 5LOV A; 2K1E A; 3TXQ A; 3PJS K; 4NKG B; 1Q8I A; 5EIB D; 3LDD A; 1KP3 A; 1QCE A; 2DWE C; 1BT8 A; 5J9P C; 1M93 A; 4ZOL A; 2X0L A; 2JK5 C; 1PM9 A; 4R8C A; 1YXB A; 5EZY B; 1GRJ A; 2FL4 A; 3RBZ A; 1Y4M A; 2OCH A; 3CB2 A; 3UO2 A; 4UCR A; 2GTA A; 3G4S V; 3B8M A; 4YJ2 B; 4JYC A; 3E83 A; 2K9P A; 2LFS A; 1XMO B; 1JOY A; 1BMF G; 1IBM O; 2YUA A; 1AR5 A; 3AG4 C; 3BCC H; 4DR1 B; 4ICG A; 2ZT9 B; 4U3J A; 1WA8 B; 4JZ2 A; 4FM2 A; 4FZ0 A; 1ZWI C; 2XND G; 1PPJ H; 3G80 A; 4GT1 A; 4G2K A; 4ZI7 B; 4AQY O; 4GKJ B; 3E2E A; 2VWK A; 3M99 B; 2EX3 A; 2UUC B; 1JCH A; 2YS8 A; 3OMA B; 2FB5 A; 4KXR A; 4IHJ A; 1R1B A; 5KA6 A; 4X1Y A; 3ZJZ A; 2ZNI A; 1B06 A; 5IY5 C; 2O57 A; 4JI1 B; 3SYQ A; 5EBL C; 2OYQ A; 1AR4 A; 4J9Y B; 4AIL C; 1EFR G; 2EUL A; 4OXS A; 1NT2 B; 2UUB B; 5GTI Z; 4KP4 A; 3T4D A; 5CA0 A; 1OV9 A; 1NR7 A; 2JGD B; 5B1O A; 1SQP H; 1OCC C; 1LUV A; 3DTU B; 4WBN A; 1HNX B; 3T1Y B; 5B1A B; 4MW8 A; 2CGN A; 3ASN B; 1XMQ B; 2QSA A; 1MMM A; 1AJN A; 4TV8 A; 2YC0 A; 3P30 A; 3AG1 B; 1TUE B; 1CXZ B; 4B08 A; 3ABK C; 2AHZ A; 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