4W5ZA

High resolution crystal structure of catalytic domain of chitinase 60 from psychrophilic bacteria moritella marina.
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
323
structure length
323
Chain Sequence
GTITSQDDNVVVGYWHNWCDGRGYQGGNAPCVELKTVNPQYNVVNISFMKVYDIAEGRIPTFKLDPTIALSEAEFIAQIDTLNSQGRSVLIALGGADAHIELTRGDEDALAAEIIRLTDLYGFDGLDIDLEQAAITAKDNQFVIPAALKMVKEHYRKTGDNFMITMAPEFPYLTANGAYTPYLTELDGYYDFINPQFYNQGGDGLWIEGVGWIAQNNDALKEEFIYYIADSLINGTRNYHKIPHDKLVFGLPSNIDAAATGYIQDPQDLYKAFDRLKAQGQPLRGVMTWSVNWDMGTDAANNSYNQQFIKDYGNFIHNQLPPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Chitinase 60
publication title High resolution crystal structure of catalytic domain of Chitinase 60 from psychrophilic bacteria Moritella marina.
rcsb
source organism Vibrio marinus
total genus 126
structure length 323
sequence length 323
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2014-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4w5zA00
3NUKA 3VNZA 3AMLA 1D7FA 1W9UA 2XG9A 3I3BA 1OINA 3HMCA 2DT3A 3VMPA 1E3XA 1JZ8A 2GJRA 2FHBA 2J25A 3W6MA 1DWJM 2G3MA 4N42A 1E6ZA 1KBKA 2O9OA 4Z2HA 1V6VA 1YHTA 2VQTA 2D2OA 4F9DA 2V5DA 3L4ZA 2OWCA 3SCWA 1UQYA 3WENA 5BXRA 3VIKA 1RPKA 4Z2LA 1BYBA 3W81A 1EQCA 2J7HA 3L4VA 1B3VA 1Q6EA 4D6CA 1J11A 2XSBA 4H8UA 4P7LA 1K6AA 4ZE4A 3IJ7A 2GUYA 1GOQA 1B3XA 2Y5EA 3UG3A 3AMKA 5HXMA 4DWSD 1TR1A 3WNKA 1UD2A 3G6LA 1WAWA 3LPFA 1HJUA 1JAEA 1A47A 3WMSA 1UA3A 4PMVA 5ABFB 1FHDA 3THDA 2O9RA 1I75A 5D9OA 2VOTA 1ISXA 2JE8A 2VUYA 1C92A 4DM2A 5FCZA 3HU7A 4P7QA 1HL9A 3KL5A 1J0IA 2J7GA 1H09A 4PMOA 1JGIA 2XFRA 3S6TA 1BTCA 1WO2A 1IZJA 5LA1A 5CGMA 4BQ5A 4AZ6A 4UFLA 2E0PA 4LX4A 1XCWA 5KZ6A 3VIPA 1UH4A 3NSMA 1CGTA 4PMQA 5BROA 5JIPA 2VRQA 4LYRA 4LYQA 2W91A 5BWFA 4DWSA 2WXDM 4AXNA 1CGWA 2E9MA 2V3EA 1UD6A 1CGXA 4PTWA 1KXVA 4J7RA 2X1IA 2PBGA 4PBGA 4AISA 2BHZA 3BMVA 2B31A 3FXYA 4J28A 3ARZA 3TTQA 3T2QA 3DECA 3WF1A 3WBAA 2WMHA 1CPUA 4AWEA 4F79A 1KR1A 4B9YA 3PTKA 1G94A 4MNJA 1BAGA 2J47A 2BY0A 4DWSC 2HISA 1XH0A 2PWHA 2ZUMA 3WDRA 4CCDA 2YLAA 1E55A 1LJYA 5GQBA 3GNPA 2J7FA 1XSJA 2WVUA 2VURA 2JIEA 4ATDA 1V3IA 3FNDA 2AAAA 3AROA 4FF5A 3F4VA 3EYPA 4FLSA 1OD0A 3UG5A 2VCBA 3CGTA 3ARUA 2Y4SA 2ZUNA 1NP2A 5I6SA 2CHNA 2VVNA 3VM7A 4NRRA 1LWHA 5GNXA 1BFNA 1VFUA 2DDXA 1E0WA 1B30A 1NQ6A 4PYSA 4TVUA 1E6PA 4W93A 2G41A 2VX4A 2GVYA 2FDMA 3WDQA 2V3FA 4B9ZA 5IFTA 1GOMA 3IANA 1E6QM 1VBUA 2E4TA 1OIMA 1UZ4A 4DUXA 1XH2A 4ZE5A 1UKPA 1LF1A 4UCFA 2X09A 4WLCA 3AXIA 4AZ5A 2YJQA 3BGAA 1VIWA 2YL9A 1NWSA 3MU7A 3WN6A 2G4FA 1VFMA 3AS1A 3VD3A 3K8KA 1CGYA 5EFDA 1WCGA 1DWFM 3WF4A 1WDQA 5DEZA 3N1AA 3WQ8A 3WD1A 4PMXA 3VGEA 2WHJA 3DHUA 1UKTA 1W9PA 1WZKA 1VEOA 3W6LA 3VD9A 4UOQA 4PMZA 2J62A 2XWDA 1TFVA 4AD5A 3UCQA 3UETA 3U57A 3VGBA 4Q7NA 1ITXA 4H8HA 1QI5A 3MUZ1 3VOCA 3CUJA 5C71A 1CYGA 4AC1X 5BRQA 5M5DA 2WCSA 1W2PA 1R7OA 1ZBCA 2YDRA 2J78A 1H0GA 3MSDA 3CBWA 2WMJA 5HOSA 3KWXA 4J27A 1DWIM 3AISA 3N15A 1XGZA 5AY7A 5IHSA 1B3WA 3SUSA 3IJ8A 3MV01 3CO4A 3GBDA 1HP5A 1SYTA 4GI6A 3ZR6A 3VD4A 1HJQA 2BVTA 2D1ZA 4PCSA 3UESA 2YDQA 3W24A 5CG0A 1XYZA 5AC4A 4JL1A 3THCA 4C7FA 2GK1B 3WNMA 2ZX5A 3T0AA 3MUY1 4D1JA 3VO0A 3EMZA 1H5VA 3II1A 4H8VA 4U2YA 3W37A 1RD6A 2UY2A 1GCYA 1R8LA 1OT1A 1B3ZA 1GOWA 3WF0A 2WMFA 1JDDA 3BAKA 2XVLA 2WAGA 2EPMX 4HU8A 1R86A 3WKZA 4XV0A 3N18A 1Q6GA 4N0RA 2OSYA 1OB0A 4PSPA 2E8YA 1KFWA 1E6XM 1V02E 3GH5A 4ZEPA 5I78A 1DHKA 3WEOA 4K68A 3IK2A 4PUDA 2WMGA 3FAXA 4PMUA 1MW0A 1BHGA 3N04A 3NSNA 2F2HA 4TTUA 1QNOA 4CD4A 3W27A 3ZR5A 4WKHA 4UZUA 1EHNA 4UQEA 4CVUA 3K8LA 3APGA 5E6ZA 1J10A 2XWEA 2W5FA 1X1NA 4M82A 1E1FA 3MMWA 4PMYA 1E4NA 3WQVA 1H41A 1UD8A 2Z1KA 1XV8A 1JYXA 1AQMA 1XSIA 2YIHA 3M07A 2CEQA 2WK2A 3FY1A 2V5CA 1C91A 2VTFA 5FOOA 4D6GA 4W8AA 4AZGA 3WFLA 4D71A 2CNCA 4S3JA 5JBDA 3GTNA 5JUVA 4GQRA 4MDOA 9CGTA 2FH8A 2D20A 2DGAA 2WHMA 4D6DA 1JG9A 3VIHA 4PCTA 3G6MA 1FHLA 1C93A 3ZT6A 3GXDA 3WEZA 1Q6DA 3AJ7A 1DTUA 1W9VA 2D0HA 1FOBA 2UY5A 4XZWA 4QFUA 4PMDA 2J75A 4TX8A 2EQDA 8CGTA 3VU2A 3VILA 4HMEA 2VZTA 5IHRA 1EDTA 2UY3A 4WK9A 2PWEA 4YHEA 3ARVA 7A3HA 4J3UA 3SUTA 3D3AA 3OGRA 3OGSA 3WL0A 2XGIA 1RP9A 3AIVA 3VIIA 3L2LA 4P8UA 3FW6A 1W9DM 1EH9A 1BYDA 1W1YA 1M03A 4B3KA 1BF2A 1G01A 1HIZA 4MB5A 3GNOA 1TA3B 1UWQA 5IFPA 1E0VA 3VNYA 4M80A 1PX8A 3T09A 2YBTA 4OBSA 2CBUA 3I3DA 5D9MA 2ZX6A 3AFBA 4R27A 5A8MA 3KZSA 3CHFA 1VRXA 3A6OA 3B8SA 3QHMA 1DEDA 2WW5A 2E8ZA 1WE5A 4ZENA 3AIWA 3VMOA 4DWSB 1PZ3A 3CIVA 3AMDA 3VM5A 3WNNA 4QLJA 1H0IA 3K8MA 3ARRA 1CXLA 1HVQA 2V3DA 1M01A 1MW1A 4D6IA 4NZCA 5DMYA 3EMCA 4IPNB 4AD2A 2ZE0A 4XUYA 3F5KA 1GVIA 1GONA 1ZJBA 3F5JA 2VR4A 3GH4A 1BQCA 1D3CA 2Q8XA 3WH7A 1VJZA 2WNWA 1E40A 1J0ZA 1NWRA 1PBGA 4WSKA 2W61A 2Y8VA 4JFVA 1KWKA 1C7SA 2XFYA 2YBUA 2DQXA 3AIEA 1TE1A 4PRWA 1QNSA 2WC3A 4HPGA 4CD6A 3SCVA 3WD2A 2EPKX 3VDAA 3CTTA 4AD0A 1TG7A 2DSVA 3ZMRA 1UWTA 2DSZA 3A4XA 3WIJA 4V27A 1FP8A 2ZXAA 2XVKA 4JHZA 2G3JA 3UERA 4MPKA 4X0VA 5A6LA 5D8ZA 3CZ8A 2EO7A 1UHVA 3SCPA 1NOWA 1QI0A 2XJ7A 2D22A 2BVDA 1R87A 3CHEA 5HNNA 4YPJA 1JF5A 3NDZA 3AHYA 1EGZA 3OLIA 3BAJA 1NP0A 5I5RA 3BCDA 2VCCA 5D8WA 3ZO9A 3VUPA 1BGGA 1NARA 1IT0A 2W62A 4D6EA 2OLHA 1MFVA 2AOSA 3F5LA 4AY1A 1BPLB 3A47A 1V3LA 5I24A 3VVGA 2VRJA 4GI8A 3EMQA 4AD3A 3AS3A 3EDFA 4CKQA 4WF7A 5FKYA 3PZUA 3W25A 3KL0A 3NCOA 1KWGA 1GOKA 2WHKA 4TX6A 3SUWA 4TUFA 5LA2A 1BVNP 2VQUA 5AYIA 2YA0A 1UH2A 1SMAA 4MAZA 1HT6A 2CPUA 4KRTA 1V3MA 2WZIA 4UQ9A 1E3ZA 2CKRA 1SFSA 3U5YA 5A3HA 4U31A 4TXEA 5I0DA 1UD4A 2CESA 3VIFA 3MUIA 3B9EA 1R85A 4HZ8A 4HOZA 5CZKA 4EAMA 3GBEA 3SIMA 4FLOA 2UY4A 3ALGA 3K4DA 1JZ7A 1VB9A 2D0GA 4DUWA 1HL8A 2A3HA 1OBAA 4CVWA 1VJSA 1E72M 1MFUA 3ARXA 3EDKA 4JFSA 3MO4A 1CXEA 2RGLA 3NSXA 1G1YA 3PZOA 4RL3A 5CLTA 3N12A 4YHGA 3T2PA 1D2KA 1PAMA 2WWDA 3JUGA 4B3LA 1WDSA 1NOUA 2CETA 1GORA 3ARSA 3WD4A 1H3GA 1QBAA 1MQPA 5A8QA 5CXPA 1PX4A 4PSRA 1Y7VA 2PWGA 4UOJA 1TCMA 3OG2A 4J3SA 4FLQA 2O9PA 2ZOXA 2GDUA 4M56A 2WVSA 1VEMA 3PZTA 4CD8A 3LPOA 1C90A 2CBIA 5I23A 1NWUA 4NSBA 5E09A 1VBRA 1UR0A 4Z2KA 3AMGA 3VGHA 3BAXA 1L0PA 1H4PA 1GW1A 2J7EA 1UWRA 4KGLA 2OYMA 3RM9A 2VRKA 5LA0A 4AIUA 5A2BA 2F8QA 2XFFA 2QLYA 3WH6A 1W2VA 3WMBA 3WF3A 4BCEA 3UR7A 3RM8A 1C8QA 5A94A 2BHYA 3UG4A 2CITA 2VNCA 2BY3A 3W38A 3SCOA 3OLEA 5M3WA 3AIBA 3AIUA 4U5KA 1QBBA 3E1F1 4UR9A 3WY1A 4XZBA 3VIGA 2J7CA 2WM0A 3NDYA 3CMJA 5HBFA 1KR0A 2ZXBA 5ABHA 4WKAA 2JIWA 3BH4A 5FL0A 3POCA 4AIEA 3AQUA 1E56A 1XSKA 5A69A 3VDBA 2JF6A 2XIBA 1EIBA 2NT1A 3AICA 4KMQA 3ZT5A 5FIPA 3L4UA 1OM0A 1E9LA 1KBBA 1NH6A 2ZUSA 4V28A 1U33A 1JFHA 2XM2A 1B9ZA 3HN3A 1M04A 3BSHA 3A4AA 3AS2A 3DHPA 3PZVA 2E9BA 4P7OA 2WMIA 5A6JA 2A3EA 2XVPA 1B0IA 5DT5A 1LL7A 4D6HA 3B9AA 1UKOA 4W8LA 3WF2A 4QAWA 1UG6A 2PI6A 2RGMA 5I77A 1CNVA 2CYGA 5ABFA 5A8NA 1JDAA 1Q6FA 4BZYA 5A6AA 2J4GA 5C8BB 3WH8A 2DSUA 2DPEA 1JZ4A 2DIJA 1Z32X 5A6SA 3ARPA 3BAWA 2GFTA 3RJXA 2YA2A 1WPCA 5EMYA 1PIFA 3A3HA 3T0DA 3TONA 4AEFA 4CU8A 5BXTA 1X6LA 4W7UA 3I3EA 4JIEA 2FGZA 4AZHA 3MV11 1JD7A 3OIHA 4QLLA 2OWXA 4IISA 1JYWA 4DUVA 2XVNA 1WDRA 4U2ZA 3VD5A 5IDIA 2AMGA 1JAKA 1HNYA 4XX6A 1VEPA 4W5UA 3VX0A 4OOUA 3WDIA 4BQ2A 2XPKA 1GHRA 4JCMA 4PMRA 2WWCA 2X05A 1OCQA 2NT0A 5A6BA 5JBEA 2DH2A 4NF7A 2X8RA 1ZBVA 4GO8A 4PUEA 4HA3A 1UD3A 3FAWA 4J3TA 4ACYA 1JI2A 8A3HA 1UWUA 1XRVA 4AYSA 1EHAA 1GQIA 1UR9A 1HJXA 4QP0A 4HPHA 4OZOA 2J74A 1KXTA 5HDRA 1XD0A 3IJ9A 4ZXOA 1BLIA 1UWSA 4P7RA 2ZX7A 4W85A 2CHOA 2CCRA 2ZX9A 3L4YA 3CHCA 1TUXA 1Q6CA 1W3HA 5DT7A 1GNXA 3WQ6A 4EK7A 2BHUA 1H49A 4YN5A 3ZOAA 2VX5A 2CKSA 1OGGA 2J8FA 4Z2IA 2BVYA 4MNKA 3WQWA 3CUGA 3SUUA 4AD4A 1CXHA 1KGWA 4HA1A 2XVGA 4KGJA 4NI3A 3ZIZA 2X2YA 1MYRA 3ECQA 2D3NA 2ZWYA 5D9PA 4DM1A 2OSWA 1V02A 1UZ1A 1OD8A 2Y2WA 2CERA 2W66A 2GSJA 4ZFMA 3RILA 3CZGA 1JL8A 4HZ7A 3ZJKA 3VIOA 3ARTA 2XIIA 1V08A 1ZBKA 2CBJA 2GJXA 3MUAA 5BRPA 2E3ZA 1V6XA 4UQAA 1ITCA 1ISYA 1QW9A 1ZS2A 3VDHA 4A3HA 2YA1A 1CWYA 2WLZA 1OSEA 4L4PA 2VZOA 1EXPA 4MB1A 2JEQA 1JI1A 1CLXA 4EANA 1LG2A 1HKKA 4UNIA 3CUFA 2BNJA 4CD5A 1ODZA 4JAWA 1MW2A 2PB1A 4GZEA 2J77A 1PJ9A 2VZSA 3OLDA 3ZT7A 5DF0A 2TAAA 3WUBA 2IXUA 4HU0A 1J9YA 2DIEA 1K9DA 2VI0A 1E0XA 3SCNA 4PMNA 3AXXA 4Q22A 1WKYA 1X6NA 3W4RA 3KEHA 4TVDA 3ALFA 5I3DA 1DWAM 4TVCA 2MANA 3LPPA 4CGTA 5LYRA 1GQJA 4U5IA 2F61A 5I79A 1W9XA 1I1WA 1W91A 1P6WA 4LYPA 2VX6A 4AW7A 5JIWA 3CHDA 4AMCA 1GUVA 4UFMA 3OA5A 3GZAA 1SR0A 1MXGA 4AEEA 3A4WA 5CGTA 1WZMA 2D24A 1VENA 1E71M 4B16A 1E4LA 4D1IA 1LG1A 1UD5A 1UKQA 4ML4A 3ARQA 5A8PA 4P8WA 3WNPA 3VX1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3NUK A;  3VNZ A;  3AML A;  1D7F A;  1W9U A;  2XG9 A;  3I3B A;  1OIN A;  3HMC A;  2DT3 A;  3VMP A;  1E3X A;  1JZ8 A;  2GJR A;  2FHB A;  2J25 A;  3W6M A;  1DWJ M;  2G3M A;  4N42 A;  1E6Z A;  1KBK A;  2O9O A;  4Z2H A;  1V6V A;  1YHT A;  2VQT A;  2D2O A;  4F9D A;  2V5D A;  3L4Z A;  2OWC A;  3SCW A;  1UQY A;  3WEN A;  5BXR A;  3VIK A;  1RPK A;  4Z2L A;  1BYB A;  3W81 A;  1EQC A;  2J7H A;  3L4V A;  1B3V A;  1Q6E A;  4D6C A;  1J11 A;  2XSB A;  4H8U A;  4P7L A;  1K6A A;  4ZE4 A;  3IJ7 A;  2GUY A;  1GOQ A;  1B3X A;  2Y5E A;  3UG3 A;  3AMK A;  5HXM A;  4DWS D;  1TR1 A;  3WNK A;  1UD2 A;  3G6L A;  1WAW A;  3LPF A;  1HJU A;  1JAE A;  1A47 A;  3WMS A;  1UA3 A;  4PMV A;  5ABF B;  1FHD A;  3THD A;  2O9R A;  1I75 A;  5D9O A;  2VOT A;  1ISX A;  2JE8 A;  2VUY A;  1C92 A;  4DM2 A;  5FCZ A;  3HU7 A;  4P7Q A;  1HL9 A;  3KL5 A;  1J0I A;  2J7G A;  1H09 A;  4PMO A;  1JGI A;  2XFR A;  3S6T A;  1BTC A;  1WO2 A;  1IZJ A;  5LA1 A;  5CGM A;  4BQ5 A;  4AZ6 A;  4UFL A;  2E0P A;  4LX4 A;  1XCW A;  5KZ6 A;  3VIP A;  1UH4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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