4W87A

Crystal structure of xeg5a, a gh5 xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase from metagenomic library, in complex with a xyloglucan oligosaccharide
Total Genus 146
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
146
sequence length
339
structure length
339
Chain Sequence
DRSRVFDILSNINIGWNLGNTLDATGGGNSVNAETSWGNPKTTQEIVDTVNDRGFNAIRIPVTFANHLGPAPEYTISADWLARVKEVVDYAVNDGMYIILDTHHETNYWLKTDPNNEAALCEELAAIWKQLAEAFKDYDEKLMFEGMNEPRMAGSAKEWSGGTPAERKLINAMNKAFIDAVRATGGNNADRVLIICTYGHNSDEPTLKDLEIPSDPNIAVALHTYTPYFFTYVADGSYSVWNGSKKNDITWQYNNIKKYLIDKGIPVVITETGAQFKENTEDIVRWIGDYVGTLDQDGVKCFIWDNNIYHGNGEKFGLLNRSLLKWYNDDIVDAYVNHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase
publication title Structural Basis for Xyloglucan Specificity and alpha-d-Xylp(1 6)-d-Glcp Recognition at the -1 Subsite within the GH5 Family.
pubmed doi rcsb
source organism Uncultured bacterium
total genus 146
structure length 339
sequence length 339
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.151: Xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase.
pdb deposition date 2014-08-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4w87A00
4R27A 3CHCA 3SURA 1TR1A 1KBBA 1QI2A 5CPQA 5CLTA 1UWTA 1W3LA 1XYFA 4EKJA 4FLQA 4GPNA 4KMQA 1PX3A 2IXVA 4JFTA 1J12A 3CMGA 4CCEA 1UZ4A 4LYPA 1OT1A 4DM1A 4W8BA 1ZJBA 1NARA 3WD3A 5HPOA 3SCSA 1EO7A 4ZXOA 3WH9A 3MS8A 4RE4A 4CU8A 2PBGA 2J7CA 4UFMA 2VR5A 5M3WA 4A4AA 2FHCA 2W66A 3CGTA 1K9DA 3PBGA 3B8SA 5A6AA 4UOZA 3W81A 3F5LA 1HXJA 3NYDA 3W25A 5LA2A 5KZ6A 5CSUA 1BAGA 4CCDA 4RE2A 2D23A 1TUXA 4AMCA 3ZM8A 1JNDA 1HJXA 1IZKA 3TTSA 2DT0A 5C70A 4HA4A 1H4PA 6A3HA 3G6LA 1K9TA 2DQXA 4U5KA 1JZ5A 5A1AA 1NWSA 3WF4A 5BRPA 3K8MA 4UZUA 2G4FA 4PMQA 3ZO9A 2VRQA 5KEZA 1JDDA 2X1IA 3L4ZA 3HJEA 3RJXA 1VFUA 3FXYA 4J3UA 1GHSA 3BSHA 5EBAA 1UWUA 3L2MA 1UQZA 1MWOA 4JFVA 2J8GA 3WQVA 4D6HA 3T0DA 4HPGA 4W89A 4J3VA 1H0IA 1UA7A 3WDHA 3CZGA 3GXMA 2BXZA 2J7BA 1NWUA 3VD5A 1FHLA 1H1NA 5FL1A 1QBAA 3AMGA 1BVZA 2PB1A 1FFQA 3PZ9A 4H8UA 3AS0A 1UR9A 2G3IA 4W8LA 4UOQA 4Z2JA 5ABFA 3WQWA 1YQ2A 4H8VA 3AHYA 2XG9A 3AIBA 3W26A 6TAAA 3GDBA 1CLVA 2UY4A 4OIFA 3ZJKA 3KEHA 2W91A 5BROA 2F8QA 4TTUA 5HXMA 4U3AA 3PZOA 1PJ9A 1OB0A 1VFOA 3WDIA 3GXIA 3WMSA 1US2A 5HBFA 3AMCA 5EB8A 4Z2GA 1MQPA 2BY0A 2V5DA 4AZIA 1BQCA 1A3HA 1U30A 4CU6A 2A3CA 4H04A 2WVTA 3OGSA 2PWEA 1NWTA 2VMFA 4GIAA 1K6AA 3BAJA 3BLKA 3WNKA 3K8KA 3ARXA 4M80A 5CQ1A 2YJQA 5FIPA 5E9AA 1UD3A 3IJ9A 4AYSA 1ECEA 1ISWA 4NF7A 2WMKA 1FH9A 3AI0A 3CUJA 3N17A 4QAWA 1HIZA 1ITCA 3CMJA 2WZIA 1VJZA 2YBTA 4PMVA 2WANA 3PZNA 3ZOAA 2DIEA 1N82A 1UG6A 2GJRA 3AIEA 4MB5A 1E40A 4EAMA 3GTNA 2HVMA 2WMHA 5I3DA 3T2QA 2BVYA 1B3WA 1CENA 3CLWA 2X0YA 3VPLA 4HTYA 4J27A 3SUWA 1ZL1A 1U33A 2WC7A 4MJ2A 5EMYA 2F61A 3VD9A 2WXDM 3VIIA 4HA1A 2XTKA 4F79A 4YHGA 2GSJA 3FNDA 4LX4A 4MB4A 4NZCA 3BAWA 5A8OA 1VF8A 4F66A 1HVQA 5A6BD 2WKLA 1K9FA 3N9KA 4MB3A 3QHOA 1MW1A 2OSYA 1M01A 3A47A 4WJXA 3W6LA 2D20A 3L4VA 1WNOA 4W7VA 5M17A 3WH5A 4Q22A 4W7UA 1SMAA 3DHPA 1HJWA 1B2YA 3EDDA 5GNYA 4PMDA 4CN4A 2XIIA 3WUBA 4KH2A 3ARPA 1EDGA 2E40A 3NDZA 4M56A 5A3HA 3K4AA 1JI2A 1WKYA 3B9DA 3WF3A 3N13A 3MSDA 1LQ0A 1QBBA 2QPSA 1KXVA 4J3SA 3GBDA 4MJ4A 3AHVA 1E6NA 4FK9A 1HF6A 3W24A 3GH5A 4DM2A 2XM1A 4KGJA 3SCQA 1MW0A 4HP5A 1XH2A 2CBIA 4YHEA 4B3LA 4BS0A 4AIOA 1C8YA 4EE9A 1F4AA 1WE5A 1J0IA 4OZOA 3FW6A 3GYCA 2EPMX 2QPUA 3OLIA 3VKKA 1HNYA 1EH9A 2V5CA 1UKPA 1KXTA 1EA9C 4GZIA 1E1FA 2VZOA 3BMWA 4L4OA 2ESCA 2X0HA 1AQ0A 1UH3A 5I79A 2W62A 2XHYA 4AZ6A 2PWDA 1CXLA 4P8VA 2J4GA 2W92A 1QNOA 4PMOA 3SEPA 1QW9A 1SYTA 4TXEA 4V27A 3L4TA 2DDXA 4E8DA 3RM4A 2GDUA 2VCAA 3MUAA 3IK2A 4C7GA 5I23A 1XH1A 4AIUA 4WKHA 2E9BA 3GNRA 1V3IA 2VR4A 3A6OA 2YA0A 2PC8A 5IFPA 1QI0A 3AS1A 1E43A 2D2OA 5I78A 1R7OA 2WMJA 2WCGA 1FH8A 1ISVA 1I75A 1XYZA 2J7HA 1UOKA 1UYQA 2YDSA 3WEOA 1OD8A 4HU8A 2NSXA 5BYWA 5DFAA 4MDOA 2CETA 1D2KA 2XSBA 3T09A 1JYXA 1RD6A 1UA3A 1KR0A 5BXSA 4GO8A 3PZQA 3AHTA 2XFRA 4D6IA 1UWQA 1A47A 3U7BA 3CZKA 4IUGA 1V02A 2DSUA 4W5UA 1V6YA 3N11A 1CEOA 1L8NA 3MUZ1 1E71M 1MYRA 3M7SA 4IM4A 3UR7A 5AC5A 3ZMRA 1QPKA 1ZBVA 3W29A 5A6MA 4UNIA 5CZKA 1SMDA 2CNCA 4GI8A 1CYGA 4ATWA 3SCTA 1NP2A 1B3VA 4FLRA 5DMYA 5ABFB 4J28A 2BNJA 4H7VA 4PSPA 3SCPA 1EQCA 4DWSA 2VO5A 3TTQA 1XV8A 3F5JA 5ECUA 3VU2A 3AROA 1DWAM 4W85A 2XYLA 2WMIA 1E55A 1BSIA 5BXPA 3DECA 2XUCA 4QCEA 1FH7A 3SCUA 3WFLA 4ATLA 3EMZA 4M82A 3IJ7A 4UCFA 1OBAA 3II1A 5D9MA 1V0NA 1PBGA 2O92A 3S6TA 1W3HA 3EDEA 3L4XA 2CXGA 2QHAA 5JBDA 1C92A 2WK2A 1JD7A 1DP0A 4NI3A 2A3EA 2JEQA 3BCFA 2BV9A 1H2JA 2YL8A 4S3JA 2ZOXA 2BVDA 2VNCA 3K46A 1EO5A 2E0PA 1E1EA 3SCRA 3DHUA 4B15A 1BF2A 1WPCA 1W3KA 2DT3A 1QI5A 2ZE0A 2Y2WA 4CCCA 4JL2A 2DSKA 2YOCA 4H2CA 2ZWYA 1V3MA 1E0WA 5AYIA 3D5HA 4AD5A 1JXJA 1JD9A 5CGTA 2QF8A 3VTRA 2W63A 4UQBA 3GXDA 1BYDA 1W9DM 1QI4A 4GI6A 3VDHA 1OIMA 3UR8A 4J3TA 4UFJA 3VNYA 3JUGA 2OLHA 4MAZA 4BQ4A 5A6JA 1OGSA 4CD7A 4F9DA 3MMWA 3PHAA 3PZTA 1TE1A 1WZKA 1E3XA 4PN2A 3OA5A 4W5ZA 2BHZA 3VGDA 1QW8A 2GDVA 2CIPA 4P7LA 1LL4A 2VOTA 4PTWA 4GXPA 2FGLA 1UWSA 2E3ZA 4QLLA 1Q6CA 1RH9A 1LG2A 4U31A 1HJSA 1CGYA 4TVDA 3F4VA 4ACZB 4IPNB 1HKKA 4AIEA 3QR3A 2RGLA 5M03A 3VVGA 1EIBA 3VM7A 3GBEA 4JIEA 3VGGA 1TCMA 1QVBA 4HOZA 3AISA 1JIBA 3BC9A 4CD5A 1GONA 3CBWA 1L0PA 4GINA 1UD8A 2WHJA 2X05A 4AD2A 3GNPA 4IPLA 3S2CA 3AFBA 2WVSA 3WEZA 2J77A 2NT1A 3AZTA 1H49A 4MNJA 3GXFA 1GPFA 2D0FA 3VIKA 4DUWA 3ARRA 2AAAA 4QLJA 1CZ1A 1WAWA 2DIJA 1VJSA 4P7NA 2XPKA 5BXRA 3VO0A 2D24A 1R87A 2WLYA 2Y8VA 4N42A 1WDRA 4AD4A 2VX7A 4GKLA 4AD1A 4UOJA 5CGMA 1UKSA 3LPGA 5A69A 3BAYA 3M07A 1JYWA 2VI0A 3VM5A 4Z2IA 1JZ6A 1XD1A 1C7SA 3QHNA 2WMGA 3I3BA 3N04A 2CKRA 1H5VA 5A6SA 2HISA 1OM0A 3F5KA 3CHFA 3EDFA 4PBGA 3CPUA 3PZUA 3VNZA 1TFVA 1GVIA 1HKJA 4W8AA 1R86A 1GOQA 3G6MA 2WLZA 1GOKA 3UCQA 1CPUA 1Q6GA 3WEMA 2DH3A 2DT2A 4AEEA 1F4HA 3W82A 1UZ1A 1KQZA 4UQAA 3K8LA 1PX4A 3W27A 2W5FA 4FMVA 2D3NA 3RPMA 4GQRA 3SCOA 1GQJA 1ESWA 1XCWA 1M7XA 4MTVA 5JBFA 1G5AA 1Q6EA 1PIFA 5A6BA 3UG3A 1S46A 2EO7A 2WHKA 4TOQA 3ZIZA 2GJPA 2OYKA 1US3A 1EXPA 1MQRA 5ABGA 5I5RA 4A3HA 1GHRA 1EQPA 2B31A 2ZUWA 3CTTA 2V38A 1V3LA 1BGGA 1GQLA 1MVYA 1ISXA 1JAKA 5D9PA 1UR2A 1OD0A 4C7DA 4U33A 2D3LA 3CO4A 1UR0A 4NRSA 2ZX5A 3CIVA 3OIHA 1GJWA 3TP4A 1KFWA 1BHGA 3BAXA 4MNMA 4DWSB 2XVKA 3U57A 5CG0A 2JIEA 3WNNA 2WC3A 1QNSA 4TX8A 4HU0A 1GOMA 5D9OA 4WSJA 7TAAA 2WMIB 1J10A 3L4WA 4BF7A 4P8WA 2DSVA 2ZUTA 3O9NA 5DT5A 3VDAA 3TONA 1LG1A 3UEQA 4TX6A 4AWEA 4P8XA 3ZJ7A 3FY1A 4D71A 2DT1A 4MB1A 4U2ZA 2RGMA 1DTUA 1E5NA 1HL9A 2A3HA 2WZHA 1I1XA 4ML4A 3CUFA 3AJ7A 3M46A 4ZFMA 2XVGA 1V6UA 5DEZA 1Q4NX 2ZXQA 4XV0A 3AIWA 1BYBA 3ZR5A 4W88A 4UFHA 1TZ7A 1DWIM 3BXWA 4MNLA 2JALA 4P7RA 2Z1KA 1UR8A 2J47A 3FN9A 1B30A 1VEMA 4R5EA 3SUTA 1XC6A 3OG2A 3WBEA 2WMFA 5CXPA 3VIFA 3NJ3A 3VIOA 5E6YA 4W93A 1W2VA 4D72A 1TG7A 1EHAA 2AMGA 1E3ZA 3WL1A 4S3KA 4YPJA 1JDCA 4HMDA 2J74A 1KBKA 1WP6A 4EK7A 4PMRA 4URIA 1W3JA 2VZVA 3WNMA 1CECA 2BXYA 4XZWA 5BRQA 1UKOA 5HNNA 3I3DA 3DYPA 4JAWA 4P7OA 4JCLA 3LPOA 1OCQA 2CEQA 1GQIA 2EJ1A 1XCXA 1UUQA 2WWDA 3VD7A 3OGRA 3UESA 1AQMA 1MW3A 5JUVA 1UR1A 1NWRA 2CBUA 3QOKA 4LPCA 3DYMA 4Z2HA 1FFRA 1UWRA 1E6QM 3ZJ6A 4W84A 2VVSA 4ACZA 3ZQ9A 2PI6A 2VJXA 3TTYA 1PZ2A 1UHVA 3FAWA 1QHPA 1JZ7A 2D1ZA 5A95A 3WY1A 2XIBA 4UZSA 1VRXA 5IXEA 3NSXA 1QNRA 4OJYA 1UD4A 5A2BA 3EDJA 1B1YA 3UERA 3CH9A 2E8YA 4MNKA 3SCWA 2BFGA 1VIWA 1X1NA 4H8HA 2VX4A 1QHZA 1WDPA 2JIWA 4PSRA 3CUGA 1UWIA 3SUVA 1XSKA 5IDIA 4D6EA 8CGTA 4CUCA 1TA3B 4V28A 2WAGA 4ATDA 3QOMA 3MANA 3WD0A 1NOUA 2WHLA 3CHDA 3HN3A 4CVUA 2BY2A 2PBOA 2OSXA 1CGXA 2V3EA 4PMZA 3WQ8A 3BSGA 3AYRA 3AMDA 4W87A 1KCLA 1BGAA 1ZJAA 3TA9A 3VIPA 3RO8A 5GNXA 2D22A 2BHUA 1GOIA 5FL0A 1CGWA 3APGA 4K68A 1D3CA 4ZXLA 4XB3A 1WZMA 3W6MA 2NW0A 2GUYA 2ZX9A 2G3MA 2VURA 3VIJA 1MXDA 1RPKA 3WDQA 2ZX6A 4UFKA 2J25A 1UH2A 1W1VA 4M81A 4JHZA 1V6VA 2YDRA 3AZRA 3W53A 1E4NA 3DYOA 2TAAA 2WCAA 4Y7EA 1LJYA 1WDQA 1J9YA 1R7AA 2EEXA 3WF0A 1I1WA 1MW2A 3ARQA 3EBVA 3SUSA 2YBUA 2CITA 2ZICA 5GNZA 3EMQA 1XD0A 5EFFA 1VENA 1CGTA 4J3XA 2BHYA 1GZJA 4HPHA 4JFUA 3AIUA 4CN1A 2OSWA 1E70M 2E8ZA 4OOUA 3RMEA 3T08A 3WD1A 3PZIA 2GK1B 4L4PA 1YHTA 3ZSTA 5I24A 5LA1A 3AIVA 2OWXA 2YL6A 1DWGM 1B90A 1EDTA 3WSUA 1JF6A 1U2YA 3AMLA 3WN6A 3NIYA 2J75A 1E6XM 1XSIA 3PZGA 1Q6FA 4M24A 2J79A 4JFSA 1ZB5A 1V0LA 4PMYA 4UQDA 3MUY1 1M03A 3PZMA 4AZHA 1M53A 1V3JA 2YDQA 1VAHA 1LWJA 1KWGA 1V3HA 1VEOA 2XVLA 4BQ2A 1E4LA 2AOSA 1V0KA 3WD4A 1QI3A 4AW7A 3VMOA 3CUHA 4MADA 1LL6A 3PZVA 3WNOA 5BXTA 3VGHA 1UQYA 1G9HA 2ZUVA 4KRUA 3QHMA 3MMUA 4TVCA 5D8WA 2WSKA 5A94A 1E9LA 1WZAA 4OBSA 4PUDA 5A8NA 3OGVA 1KGWA 1HVXA 4AZBA 3VINA 5A6KA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4R27 A;  3CHC A;  3SUR A;  1TR1 A;  1KBB A;  1QI2 A;  5CPQ A;  5CLT A;  1UWT A;  1W3L A;  1XYF A;  4EKJ A;  4FLQ A;  4GPN A;  4KMQ A;  1PX3 A;  2IXV A;  4JFT A;  1J12 A;  3CMG A;  4CCE A;  1UZ4 A;  4LYP A;  1OT1 A;  4DM1 A;  4W8B A;  1ZJB A;  1NAR A;  3WD3 A;  5HPO A;  3SCS A;  1EO7 A;  4ZXO A;  3WH9 A;  3MS8 A;  4RE4 A;  4CU8 A;  2PBG A;  2J7C A;  4UFM A;  2VR5 A;  5M3W A;  4A4A A;  2FHC A;  2W66 A;  3CGT A;  1K9D A;  3PBG A;  3B8S A;  5A6A A;  4UOZ A;  3W81 A;  3F5L A;  1HXJ A;  3NYD A;  3W25 A;  5LA2 A;  5KZ6 A;  5CSU A;  1BAG A;  4CCD A;  4RE2 A;  2D23 A;  1TUX A;  4AMC A;  3ZM8 A;  1JND A;  1HJX A;  1IZK A;  3TTS A;  2DT0 A;  5C70 A;  4HA4 A;  1H4P A;  6A3H A;  3G6L A;  1K9T A;  2DQX A;  4U5K A;  1JZ5 A;  5A1A A;  1NWS A;  3WF4 A;  5BRP A;  3K8M A;  4UZU A;  2G4F A;  4PMQ A;  3ZO9 A;  2VRQ A;  5KEZ A;  1JDD A;  2X1I A;  3L4Z A;  3HJE A;  3RJX A;  1VFU A;  3FXY A;  4J3U A;  1GHS A;  3BSH A;  5EBA A;  1UWU A;  3L2M A;  1UQZ A;  1MWO A;  4JFV A;  2J8G A;  3WQV A;  4D6H A;  3T0D A;  4HPG A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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