4W8BA

Crystal structure of xeg5b, a gh5 xyloglucan-specific beta-1,4-glucanase from ruminal metagenomic library, in complex with xxlg
Total Genus 157
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
157
sequence length
386
structure length
386
Chain Sequence
KDAQAIAKDMYPGWNLGNTLEATGSGLDAETSWQPTLTTQQIIDAVKAAGFKSVRIPCSWDIHSDSNGEIDAQWMARVKQVVNYCINDGIYVVLNDHWDNGWIEVLGFSKSSSSYQAVDEATITSKITRLKDLWTQIANEFKDYDEHLLFAGLNEPFQEYSLFSGHHEELTPILCRYNQAFVEAVRATGGNNAQRTLVVQGPSTNINSSVNYMTADKLPETAGRLMVEVHYYDPGQFCGTFDASGDNAFYFWGAANHSTDHNATYGEEAYMLSQFGLLKTAYTSLGYPVIIGEYAALQRTISGDQNKHNASVKYFYQCVNEYATNNGIIAFAWDTNDTNGLNSEGGSSTIIDRANSAVVGNNAMEGVKAGVAAGKWPFLEHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Exo-xyloglucanase
publication title Structural Basis for Xyloglucan Specificity and alpha-d-Xylp(1 6)-d-Glcp Recognition at the -1 Subsite within the GH5 Family.
pubmed doi rcsb
source organism Uncultured bacterium
total genus 157
structure length 386
sequence length 386
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-08-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4w8bA00
3ARVA 2OWCA 3OZPA 3T2QA 1M53A 4BQ2A 1PPIA 1V0KA 3W38A 1XSJA 2ZUVA 3L4WA 2VQUA 4HPGA 3WUFA 4KH2A 2O92A 2EPNA 1W1PA 1E0XA 2C8NA 3F5KA 4H8UA 1JFXA 2CBJA 4AISA 2Y2WA 2ESCA 1ITXA 2D0GA 4UCFA 3TTSA 2V38A 3VD3A 4AEFA 1W9BM 4PN2A 7CGTA 4WSKA 1V3LA 3CZKA 4HZ7A 2BY0A 1GZJA 2JFEX 3GNRA 1FP9A 4JL2A 4AD4A 9CGTA 3AHTA 1H3GA 2BXYA 3CZJA 1EHAA 3T0BA 3GXDA 4Z2IA 1Y7VA 4D6CA 1UD6A 1VAHA 3WDJA 3T0DA 2WVTA 1J9YA 3VU2A 1PJ9A 2W66A 4D6EA 1G9HA 3WMBA 5F7UA 2XTKA 1JYNA 4CN6A 2WHJA 1V0NA 3BAJA 5HDRA 3ZSSA 5ABFA 1W3LA 5IHSA 3ARYA 1BGGA 3SEPA 2WCSA 3PZMA 3ZM8A 2DSKA 5AC5A 4LYPA 3PZNA 1MW0A 1CXHA 3W28A 2JF6A 2NT1A 4GKLA 1CXIA 2WSKA 2VVSA 1E6XM 1QI5A 5I3DA 2ZICA 3OGRA 5I24A 3ARXA 1H1NA 1KBBA 3VIHA 1B30A 2ZX5A 1CZ1A 3AQUA 2J4GA 3FY1A 5LYRA 5GQBA 3U7VA 2DT1A 3VM5A 1MXDA 1UR4A 5C70A 1QHOA 4Q22A 4JFVA 2GJRA 1AQMA 8A3HA 4U3AA 4M56A 3TTOA 4EANA 2YLAA 2CYGA 1TG7A 5DO8A 1HJSA 3WQ4A 4R5EA 1UWUA 3VO0A 5TD4A 1HXJA 3ARQA 2DIEA 3MMWA 5EFDA 5A6LA 2J7BA 2CBUA 4IM4A 4QLKA 3AJ7A 3U57A 2DDXA 2A3CA 3UESA 1VFMA 2V3GA 5A2CA 2E8YA 3SCNA 1E9LA 1CPUA 3VTRA 4E8DA 3A6OA 2XVLA 1UKQA 3BAKA 1HJVA 3GXFA 1DWHM 1OGBA 1XSIA 4NRRA 4U5KA 4PYSA 2WKGA 3K8MA 2YL9A 3TA9A 4URIA 3VM7A 3OB8A 4BA0A 1BVNP 1W2VA 1ESWA 2FHBA 1UOKA 1MW2A 3ZR5A 3CUFA 3MMUA 4XB3A 1WE5A 1CGTA 2W63A 3KL0A 3WQ6A 1CGUA 4QFUA 1EXPA 2RGLA 5DT5A 1LWHA 5HPCA 5D9OA 1KWGA 3FN9A 5HOSA 1KQYA 5E0FA 4RE2A 1JD7A 4CVWA 1WB0A 2J7GA 2WZHA 4MDPA 3VGHA 3VIPA 4YN5A 4BF7A 2IXVA 5BWFA 4D6FA 2WBKA 1GQLA 1OBAA 3WDHA 1EDTA 4TX8A 2XFFA 3AHXA 2XSBA 3AZTA 3O9NA 1V6WA 4Z2GA 3SUSA 1BF2A 1GUVA 1JF5A 3W24A 1F4HA 4QLJA 4U31A 3ZJKA 1A3HA 2VTFA 2W4XA 3EDFA 5M5DA 1V6UA 3VPLA 4KRUA 1CWYA 1NWUA 1B3VA 1GJWA 5CG0A 4GZEA 3MV01 4WF7A 2CKRA 1X1NA 3WDPP 4MB4A 1GOWA 1O7AA 1ZBVA 3UCQA 2D2OA 2ZX6A 1E6RA 1I1XA 2V3DA 1WO2A 3WSUA 3PZVA 5E09A 2WMJA 3J7HA 4PEEA 4W84A 4L4PA 3BAWA 4W7UA 4AIUA 2VR5A 1OM0A 2WWCA 3G6MA 1E6SM 4ZXOA 3NCOA 3PZGA 1D3CA 2XSAA 2GSJA 3AZRA 1PZ3A 3L4YA 4DUVA 5ABGA 4BS0A 5I77A 4ZXLA 1XD0A 4ACZB 4TVDA 1BHGA 1F4AA 1C3FA 3CIVA 1B3XA 3A3HA 3TONA 1KCLA 3VDHA 2WHLA 4U2YA 2GJXA 1UH2A 1US3A 4F9JA 1ISXA 2W61A 4AZ5A 3PHAA 3GTNA 4GQQA 2PWHA 1XCXA 3MV11 2WC4A 2XIBA 5A6BA 3GNPA 4AZCB 3ARWA 1XHGA 2Q8XA 2ZUUA 3WF0A 4HOWA 3NDZA 1V02A 1JZ2A 4LYRA 3BAYA 2D0FA 3W26A 2V5DA 1MFVA 1H0GA 3RPMA 4DM2A 1DWFM 2OSXA 2BVYA 2WVVB 4YPJA 4TX6A 1CIUA 3FAXA 3VDBA 3AIEA 2QHAA 3SCTA 4LGXA 1OD0A 3EMZA 3CHFA 5FD0A 1KXTA 2CBVA 3NJ3A 1FA2A 3GDBA 4PMVA 2G3IA 3WBEA 3BSGA 3CZGA 3QOMA 1QHPA 3I3DA 2HVMA 4P7LA 2J7FA 3ALFA 2VZOA 3RCNA 1X6NA 3FNDA 1LL4A 3W53A 1EGZA 2X0YA 4BCEA 3AS3A 2CHOA 4NF7A 2DSUA 5A2BA 5BRQA 4QAWA 4E4PA 1GOMA 5A3HA 5CPTA 3B9DA 1R85A 3D5HA 2GJPA 3WEOA 1YQ2A 1JFHA 2BS9A 2NT0A 5A8MA 1QNOA 3QHNA 1JAEA 2CERA 4HU8A 4Z2LA 3L4XA 3OZOA 4MAVA 3WBAA 3MUZ1 3AYRA 4A4AA 4OBSA 1NP2A 1C7TA 3ZJ8A 1G94A 3AIQA 1KFWA 4WK9A 3PZTA 1BQCA 1L8NA 1JZ6A 4JFTA 5HNNA 1ZB5A 3VDCA 1O6IA 4QDMA 2IUZA 1QOXA 2VRQA 5CZKA 4X9YA 3L4TA 5D8ZA 4M24A 3AMCA 3L2MA 1OCQA 1EDGA 2PBGA 3VIKA 4BQ4A 3VX1A 4JHOA 1VJSA 3K46A 3PZIA 5A6KA 1H0IA 1E4IA 3PZ9A 4TUFA 4GI8A 1GOQA 2D23A 3L4ZA 4H04A 2C7FA 3EMQA 3MSGA 5C8BB 3NYDA 3WNKA 4EE9A 1CENA 4WJXA 2EO7A 1XD1A 3B9AA 1E72M 2J77A 1W9DM 3ZQ9A 2XHYA 2UY2A 2WC3A 3O6AA 1KGUA 3ZOAA 2X05A 1US2A 2ZXQA 4CKQA 2VOTA 4MADA 5KZ6A 3SIMA 1UZ4A 4OIFA 4CVUA 1I1WA 4PCSA 1W9XA 4W85A 1Q4NX 1CXKA 1OIMA 1IV8A 2CIPA 4JHZA 1UR9A 3WQ5A 1ZBCA 2UY5A 1KR1A 4W7WA 3N9KA 1UA3A 2VZSA 2VZUA 4D6IA 3K1DA 2O9PA 5GPRA 3KEHA 4ATLA 4XUYA 5FOOA 2VC9A 1ZJAA 1FFRA 3BMWA 1UD8A 3VILA 5BRPA 5BROA 4W86A 5ABEA 1NP0A 2C0HA 4AMCA 4Z2HA 1GOKA 4OOZA 1KB3A 2ZUSA 1FHLA 1UR8A 4GINA 5A1AA 4JFSA 3OBAA 1OINA 3FXYA 4MB1A 1GVYA 1EH9A 2J7HA 3AS2A 2FGZA 2WANA 3W82A 4JL1A 4OOUA 2YLLA 2ZUNA 1H11A 1WZAA 3VMPA 1GQKA 2CXGA 3B9EA 2E9BA 2PC8A 3ARTA 4AD5A 5BCAA 2Y8KA 3BCFA 4PMDA 3TOPA 1J10A 1QHZA 4UFHA 1J01A 3A47A 4X0VA 1E0WA 4UQAA 1E6NA 1OGSA 1QNSA 1UZ1A 4GO9A 2PF0A 4IPLA 4J3VA 3HMCA 3UG3A 5FCZA 2VCCA 3WD0A 3DYPA 3WN6A 1V03A 5GNZA 4C7GA 4AC1X 5E0CA 4CD7A 1QI3A 2BY2A 2V3EA 4XZBA 1N82A 2YBUA 5CLTA 5AY7A 5AC4A 1JIBA 2B31A 2JEQA 5DFAA 1UHVA 4MNMA 2PWEA 4DWSC 3GH5A 4U3CA 1JDCA 2DGAA 1UYQA 4AEEA 1LJYA 1E4LA 1R7AA 3WL0A 2CETA 3WEMA 4ACZA 4JFUA 4JKMA 5EMYA 1SYTA 3UEQA 2G41A 2ZX9A 4W93A 3ZSTA 4OJYA 3L4VA 3BXWA 3VINA 2DQXA 4FF5A 2WLYA 3ZO9A 2DT0A 5CLWA 1CLVA 5AYBA 1RP8A 3EMCA 4AZCA 4HA1A 3AROA 5A6SA 1V08A 1H09A 3F5LA 4CD5A 2XFYA 1RH9A 4D6JA 1YHTA 1U2YA 2WVVA 3CHEA 1NQ6A 2ZOXA 3AMDA 4U2ZA 5E9AA 2YOCA 4WLCA 4KGLA 5BXSA 1QBAA 4PUDA 1JYVA 4AIOA 3MUY1 2YDQA 4TVCA 4D6DA 5HBFA 3S6TA 1JDDA 5DMYA 1UKPA 3OGVA 1J0ZA 3TTYA 1E1FA 4AYSA 1B3ZA 1XH1A 3SUVA 1JZ3A 1NARA 2FDMA 1UWRA 3WDIA 5FIPA 2VX5A 2VCAA 3CZLA 3DYOA 4EKJA 1HP5A 1G5AA 1FOBA 2J75A 3FHQA 1PX3A 7TAAA 1NWSA 4MNJA 3OLEA 2VX4A 3VD7A 1ODZA 1E5NA 1QNPA 1W1YA 2J25A 2FHCA 4J27A 4CN4A 1OD8A 1HNYA 2ZE0A 3GXMA 1NWTA 3A4XA 2ZUWA 4NSBA 4HPHA 2MANA 4UTFA 2WKLA 2J8GA 2XGBA 3VOCA 2WC7A 5JIWA 4MJ4A 1VJZA 4JKLA 1U33A 2W92A 4XV0A 1GOOA 1B31A 2GVYA 1P6WA 1V3KA 4UQCA 3AIWA 1EQPA 1BYCA 2O9OA 2VZVA 2DPEA 3CH9A 3RDKA 1K9EA 1MQPA 2AMGA 1K9FA 3WELA 4D72A 5HXMA 2J47A 3JUGA 3IK2A 3GH7A 3EDDA 5CXPA 2FH6A 4PMYA 1KGXA 3W6LA 1ZBWA 4GXPA 4JZ5A 1HJQA 3CHCA 1E40A 4H8HA 4YHGA 1HP4A 3CGTA 1NOWA 3WF3A 1EA9C 2Y24A 5A94A 1UKTA 4IUGA 1G01A 2O9RA 2WMHA 4K68A 1C90A 4BQ3A 1KWKA 1HJXA 3BLKA 2VRKA 1IZJA 3UERA 3U5YA 4CUCA 4QLLA 1HKIA 5KEZA 2A3HA 3UETA 3M6DA 1WZKA 3W81A 3OG2A 3CUJA 1ISYA 1EO5A 1H2JA 1VEMA 3VIIA 1V6YA 2WMKA 1AQ0A 2X2YA 1QI2A 1BYDA 1FH8A 3AHYA 1ISZA 3SUWA 1WAWA 3KWXA 3NIYA 4UZUA 4XZWA 1UD3A 2AOSA 4A3YA 1UG6A 2J7CA 3RJYA 4FMVA 1OB0A 3K4AA 3AXXA 1QI4A 3BCDA 1ZJBA 5A95A 4ZEPA 4AD0A 1CGWA 5D4YA 3T08A 1VFUA 1FH7A 1V3JA 3CPUA 4GZIA 3WD4A 1UWQA 1DWAM 1OWQA 1UD4A 3SCVA 2J62A 2X09A 4OKDA 2QV4A 3N13A 4PTXA 2XFRA 3UG4A 1QNQA 1HN1A 1PIFA 3BH4A 3ZJ6A 1VBRA 1QW8A 2EQDA 2XVPA 1VF8A 3NDYA 3CUIA 1RP9A 3CZEA 1IT0A 3CHDA 1GJUA 1HJUA 3IJ9A 4CD8A 2VVNA 4J3SA 2WMIB 4GI9A 1EHNA 2XGIA 3GNOA 1M03A 3CMJA 3II1A 3SCOA 4PSPA 2QMJA 1J18A 4Q7NA 5JBDA 3N15A 5JUVA 2WZEA 2FHFA 4DM1A 3VIOA 4N42A 4HMEA 4F8XA 1WDSA 2YA0A 1LQ0A 4W5UA 1UA7A 2WMGA 1CXEA 1A47A 4B9YA 3RM8A 1GORA 4JCLA 4UZSA 2Y4SA 4V28A 4UFKA 1QW9A 2E9LA 2VCBA 3AIUA 3VIJA 2YL6A 3VX0A 1CGXA 3BSHA 3WDQA 3D3AA 2WVUA 4PMRA 4B3KA 2WWDA 4GIAA 1E4NA 2JIWA 4KWUA 2FH8A 3DHUA 1MW3A 3NSMA 4F79A 1E6ZA 2X0HA 4PMZA 1B1YA 2XG9A 4PTWA 1W32A 3FW6A 1BVZA 1ZL1A 4CU8A 3LPFA 2GUYA 1IZKA 3W6MA 3VIMA 1UUQA 3AZSA 2DH3A 1H4PA 1UKOA 2WHMA 1KCKA 4W8AA 2ZUMA 3FAWA 5GNXA 3KZSA 2CBIA 1EO7A 3N1AA 2JEPA 1UWSA 2YBTA 3THDA 2BFGA 5BXRA 4W88A 1W9PA 1VFOA 2A3BA 4CCCA 1TA3B 5BXPA 1E71M 2UWFA 1W9UA 3K8KA 1CECA 4E2OA 1MYRA 2D0HA 1XYZA 1QBBA 1NH6A 1JL8A 3RJXA 1WP6A 2VI0A 3AIRA 2OYKA 1E5JA 6A3HA 1E3XA 3RILA 4AZIA 2DT2A 1UQYA 4J3WA 2G3NA 4L4OA 3WY1A 2J7DA 2RGMA 3BLPX 2OSWA 3VNYA 3WKZA 3T2PA 1WDQA 3I3EA 3B8SA 2CKSA 4CD4A 1TE1A 4AY1A 5CSUA 2JF7A 4RE3A 4WIWA 1B3WA 1H49A 1HKJA 4H8VA 4ZE5A 5ABHA 1J0JA 1BLIA 2PWDA 4UQ9A 1KBKA 2WZIA 2XUCA 2BHUA 5IFTA 2BHYA 1FH9A 4UQDA 3EDEA 5I23A 4RE4A 1BAGA 3PZQA 3ZT7A 1Q6FA 5D9NA 5C71A 3PTKA 4H2CA 5M17A 3VUPA 1Z32X 2DSZA 2ZUTA 3PTMA 3AIVA 3WUEA 5IHRA 5A8NA 2W67A 2Y5EA 1QNRA 3SCWA 2GK1B 1ODUA 3AS0A 1GNXA 2Z1KA 4IPNB 2WK2A 2D20A 2QMKA 4F9DA 1WKYA 3WH6A 1MQQA 2D1ZA 1GONA 1HIZA 3CMGA 4HA4A 1CTNA 3LPGA 6CGTA 1V3MA 2WMFA 4UNIA 3ZR6A 2F8QA 2PI6A 5D8WA 4W7VA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3ARV A;  2OWC A;  3OZP A;  3T2Q A;  1M53 A;  4BQ2 A;  1PPI A;  1V0K A;  3W38 A;  1XSJ A;  2ZUV A;  3L4W A;  2VQU A;  4HPG A;  3WUF A;  4KH2 A;  2O92 A;  2EPN A;  1W1P A;  1E0X A;  2C8N A;  3F5K A;  4H8U A;  1JFX A;  2CBJ A;  4AIS A;  2Y2W A;  2ESC A;  1ITX A;  2D0G A;  4UCF A;  3TTS A;  2V38 A;  3VD3 A;  4AEF A;  1W9B M;  4PN2 A;  7CGT A;  4WSK A;  1V3L A;  3CZK A;  4HZ7 A;  2BY0 A;  1GZJ A;  2JFE X;  3GNR A;  1FP9 A;  4JL2 A;  4AD4 A;  9CGT A;  3AHT A;  1H3G A;  2BXY A;  3CZJ A;  1EHA A;  3T0B A;  3GXD A;  4Z2I A;  1Y7V A;  4D6C A;  1UD6 A;  1VAH A;  3WDJ A;  3T0D A;  2WVT A;  1J9Y A;  3VU2 A;  1PJ9 A;  2W66 A;  4D6E A;  1G9H A;  3WMB A;  5F7U A;  2XTK A;  1JYN A;  4CN6 A;  2WHJ A;  1V0N A;  3BAJ A;  5HDR A;  3ZSS A;  5ABF A;  1W3L A;  5IHS A;  3ARY A;  1BGG A;  3SEP A;  2WCS A;  3PZM A;  3ZM8 A;  2DSK A;  5AC5 A;  4LYP A;  3PZN A;  1MW0 A;  1CXH A;  3W28 A;  2JF6 A;  2NT1 A;  4GKL A;  1CXI A;  2WSK A;  2VVS A;  1E6X M;  1QI5 A;  5I3D A;  2ZIC A;  3OGR A;  5I24 A;  3ARX A;  1H1N A;  1KBB A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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