4W8DA

Crystal structure of mst3 with a pyrrolopyrimidine inhibitor (pf-06454589).
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
290
structure length
289
Chain Sequence
GLPGMQNLKADPEELFTKLEKIGKGSFGEVFKGIDNRTQKVVAIKIIDLEEAEDEIEDIQQEITVLSQCDSPYVTKYYGSYLKDTKLWIIMEYLGGGSALDLLEPGPLDETQIATILREILKGLDYLHSEKKIHRDIKAANVLLSEHGEVKLADFGVAGQLTDTQIKRNFVGTPFWMAPEVIKQSAYDSKADIWSLGITAIELARGEPPHSELHPMKVLFLIPKNNPPTLEGNYSKPLKEFVEACLNKEPSFRPTAKELLKHKFILRNAKKTSYLTELIDRYKRWKAEQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase 24 36 kDa subunit
publication title Discovery and preclinical profiling of 3-[4-(morpholin-4-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]benzonitrile (PF-06447475), a highly potent, selective, brain penetrant, and in vivo active LRRK2 kinase inhibitor.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 98
structure length 289
sequence length 290
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2014-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4w8dA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4w8dA01
4EORA 2XNGA 3VO3A 4GCJA 3LLTA 2R3IA 4FZ6A 1FOTA 4EKKA 4ZTSA 3QQJA 4DG0E 4N6YA 3OZ6A 3FHIA 2Y8OA 4AWIA 2R64A 4CFMA 3A60A 4JQ8A 4M97A 1S9JA 2JAMA 4IAIA 4KNBA 3QCXA 3PA3A 2PUPA 3AD6A 3O23A 3PP1A 2VTSA 3KF4A 4B6LA 1K3AA 4ORKA 2O5KA 2RGPA 5E91A 5JH6A 3ZFYA 3UPZA 1LP4A 4B8MA 4YSMA 4L01A 5BVKA 4Z16A 2WQBA 3BYSA 2B7AA 4BDKA 2PPQA 1H0WA 3UYTA 3VBYA 4ZIMA 5JFSA 3F3VA 4IC8A 3LQ5A 2GNJA 4GKHA 2YERA 3RTPA 3LMHA 2NNWB 2YJRA 3OBJA 2CGUA 2YCQA 5CVFA 4YNEA 4HGEA 2G2IA 3QGYA 4E5BA 3OW4A 3GCQA 3Q60A 4PDPA 3V5PA 3NPCA 4IB5A 3CC6A 5DEWA 4R5YA 3R28A 3SVVA 4MXYA 4BTFA 3MB6A 2YIXA 2JKQA 4FNWA 4L8MA 3VJNA 5E8WA 3TXOA 4IB3A 1ZOHA 4I4FA 4YBJA 2Y7JA 2QONA 4Y46A 2J2IB 4TWOA 3LIJA 4DBNA 2YDKA 2QR8A 3LFFA 1GY3A 5L6OA 2FYSA 2Q0BA 4AW0A 2I0VA 1ZMWA 4CFVA 5DRDA 4YGAA 3RWQA 5TT7A 2I0EA 3E8EA 3SOCA 4D4YA 3OT8A 4IVBA 4EOMA 3IDCA 3IOKA 3IKAA 2O3PA 4K1BA 3FHRA 3MBLA 4JR3A 3O17A 3FLYA 5ANEA 2OFUA 3TJCA 4LUEA 4PP9A 1ZYLA 3RHXA 2YM6A 2WQMA 5GZAA 1UA2A 2YM3A 4J71A 5HNBA 3C4ZA 2R3NA 4E3CA 3SHEA 3QRIA 4YSJA 2KTYA 3BWFA 4ZLYA 3EQDA 4M3QA 4U41A 1PW2A 2EU9A 2W4KA 4NCTA 3V6RA 1JPAA 3DCVA 4U80A 3NS9A 4FIEA 4WO5A 2DYLA 3HZTA 1Q97A 4YC6A 3QLGA 3EQGA 4FTLA 2V7OA 3KU2A 5C9CA 3OWPA 4YJNA 3L9PA 4XG9A 4QP7A 4AXAA 3A4PA 2PE0A 2E9VA 2B52A 4MD9E 1J1CA 2QOCA 4W8EA 3GU6A 4YC3A 3S3IA 2IPXA 3CJGA 4WNKA 2F2UA 4DGMA 3SW4A 4PTEA 2VTLA 4TYHA 4FV7A 3I60A 4JNWA 4KKEA 3Q4TA 3GB2A 5IUIA 1P4FA 3GBZA 3OVVA 4USEA 1SNUA 4RC3A 5G6VA 5IQEA 1F0QA 2YCSA 3ORTA 5IA1A 3E5AA 3P23A 5KUPA 5BVWA 3UQFA 3EFJA 4GU6A 4DA5A 1WBNA 4IX3A 5AV1A 5L8JA 4NUSA 1YW2A 5JK3A 5IH6A 4CD0A 3PWYA 1FMKA 4EEVA 4EHZA 3QHWA 4YLLA 3ROCA 2ITQA 3OMVA 5EM5A 1JQHA 3VS5A 2C0OA 1VEBA 4WA9A 3GQLA 4I6BA 1WZYA 3R7VA 5CU0A 2VWVA 4J53A 5BVDA 4BCOA 1ZRZA 3UNKA 4NW6A 1ZZLA 5IDNA 4CV9A 3R2BA 3UP2A 2XKDA 4BIEA 3DNDA 4BDBA 4DGOA 3BQRA 3EL8A 5CZIA 3PRFA 5IKWA 4DEEA 2PTKA 4ZJVA 3Q5IA 3LJ1A 5F4NA 4BGQA 1FBNA 3G90X 4GIHA 4JJRA 4YJUA 5EFQA 2VUWA 2RF9A 3UNJA 2PE2A 3QD0A 3TACA 1PHKA 5FXSA 4IW0A 1OBDA 2FO0A 3NYOA 3OXZA 4R77A 4O22A 4F7JA 3P0MA 2R2PA 3ZLXA 5FBNC 4DLJA 1H0VA 2UUEA 2VTRA 4CLIA 4KKGA 5JZNA 5EYDA 1V0PA 5L8LA 3MYGA 2J0LA 5IQIA 2C5VA 1TQIA 4GW8A 4CZUA 5JQ8A 3ZEWA 2Q83A 2WTDA 5FQDC 4CYIA 3Q04A 3VUDA 4FOCA 1R1WA 2YIRA 1B6CB 1RDQE 4I4EA 4FEXA 5J95A 4BDHA 3ACKA 3TDWA 4QTBA 3KVXA 1REKA 4L53A 2VO6A 3VF8A 4AFEA 3IOPA 4DG3E 3DKCA 3ZDUA 5CEKA 2BRHA 2PK9A 1OL1A 2G2FA 3HP5A 4WSQA 5TR6A 2W1FA 5AR3A 4LFIA 3DXQA 5E9EA 5AR7A 2BDFA 2WOUA 4QPMA 5CXHA 3DGKA 4GG7A 4JG8A 3ZTXA 4C37A 5KZIA 3FLSA 3PG1A 3UO4A 3KL8A 4PRJA 4HCTA 3RP9A 2B55A 5L6WL 3UC3A 5I3RA 5HI2A 4CRSA 3ZSIA 4C3FA 4OAVB 4UMRA 3WILA 3NCZA 3MA3A 3D2KA 3VUTA 2C3JA 3TM0A 2V22A 3V5TA 5IH4A 5M4IA 4EOKA 4R8QA 4FE2A 5I9XA 1Q3WA 2WTKC 3HVCA 4RZVA 3HP2A 3SV0A 4X6QC 3F3WA 3C13A 4PUZA 4X21A 3TEIA 2IZRA 2BRMA 4QP3A 1WBVA 4ZSJA 3QGWA 2B0QA 1URCA 3IDPA 2W4JA 4A07A 4DTKA 2GHLA 2IVSA 5D41A 4RJ7A 3VUHA 4BKYA 4XLIA 3RAHA 5BYZA 3RZBA 3UVPA 3ZLSA 3A7GA 5AA8A 2UZOA 4BTJA 2OG8A 4HVSA 3KB7A 3TZ9A 4TW9A 4KSQA 2CN8A 1WAKA 1OIYA 2EXMA 5K4JA 2FA2A 1L8TA 3ALOA 4EBWA 4Z3VA 2C1AA 5CQWA 3OCTA 4A9SA 1YOMA 3PXYA 3LQ8A 2BRNA 2R3FA 3T3VA 4XBUA 5EI6A 1GJOA 2YDJA 4EH9A 2VWXA 5HEZA 4O7VA 2IN6A 2ERKA 1P4OA 2J0JA 3Q9XA 4FSWA 4JOAA 4DYMA 5IISA 3OCGA 4C36A 4G3GA 4GG5A 4ZS0A 3U6IA 3IW4A 1CKJA 2ITOA 3ET7A 4UALA 2OFVA 3Q4CA 5FG8A 5KMMA 4QQTA 4HNIA 5CY3A 2CCIA 4KS7A 5AJQA 4KRCA 3QTRA 3ULIA 3BRBA 1AD5A 1WBOA 3MW1A 4FKPA 1J91A 4DEHA 1A06A 5C27A 4EQMA 3HA8A 4TYHB 3A8XA 2DQ7X 4FZ7A 4BDCA 3QD4A 2YFXA 3ZHPC 4DFZE 4L46A 3A7FA 4BBEA 5JRSA 4MXXA 2Y4PA 1SVEA 4QYEA 5K4IA 1OL6A 3QTUA 3HAMA 4AF3A 4MBJA 4D1ZA 2W17A 3OCBA 3C0IA 3ORZA 4FTRA 5DR9A 4FTTA 4LL0A 3N4UA 3R2YA 4ZK5A 2C3KA 3QRUA 4PL3A 4QMNA 1PMUA 4I5PA 1Q5KA 3QUPA 3ZO1A 1FINA 4AZTA 4CQEA 5BQ0A 4MXCA 2C6TA 4O91A 4B0GA 1OVEA 5HO6A 1A9UA 2JIVA 5HTCA 4IC7A 2J7TA 5E8SA 1JSUA 1IAHA 5CEMA 3RPYA 1KV1A 3JY9A 3NW7A 4O0RA 1LEZA 3DAKA 5DIAA 5BPYA 2R0IA 2X4FA 2WZJA 3DV3A 3V5JA 4FNYA 4BC6A 5JZJA 5KNJA 1OB3A 4S30A 3SRVA 2BROA 3R71A 5D10A 5HLPA 5IG1A 2A2AA 3DFAA 2HW6A 1YHVA 3DBQA 4JBVA 4E4NA 3TNWA 3BV3A 5IH5A 3ALNA 4L3JA 4I6QA 3ANQA 3R7IA 3QD2B 3RK5A 1R0EA 1JNKA 4OAUC 3OOMA 5LXMA 3KCKA 2XNNA 5AUWA 5AP7A 3R83A 3UIMA 2C0IA 4GU9A 3ULZA 5DT4A 3GOKA 2X2MA 1IA9A 4D4SA 2VTPA 2JLDA 3E88A 4I0TA 2OXDA 4FKSA 5HU3A 5AADA 1I09A 4G31A 4MYGA 4TT7A 4Y5QA 3JR1A 2I0YA 5CNOA 3OF0A 2O0UA 2HCKA 3UVQA 5E8XA 3VAPA 1YI3A 3T9IA 3PVUA 5CX9A 4YURA 1OIQA 4G3FA 2E9NA 5CI6A 2OJ9A 1AGWA 1YHWA 2F49A 1U4DA 1Y6AA 2XK8A 3W18A 4QTCA 4S34A 3AT2A 1KUTA 4IM0A 4MNEA 5BVFA 3HL7A 4IJPA 5HICA 3PXQA 3B2WA 3I1AA 1UWHA 5I9VA 4ZJJA 4HYSA 1AQ1A 1BI7A 3EZVA 2BTRA 3F7ZA 4QTAA 4X7QA 2JDTA 1ZARA 5ETCA 4BWKA 4G3CA 2UZNA 3QTQA 3LM5A 2GQSA 3OOGA 3TIZA 4HPTE 5CWZA 1BMKA 4U97A 4CZTA 2VTIA 5CAUA 1GIIA 3Q9ZA 4U0IA 2OO8X 4TPTA 5B7VA 2UZDA 4O0XA 3RCJA 5A46A 4HW7A 3LCDA 3ZOSA 2FSLX 1ZLTA 3U8WA 2JFLA 1O6LA 4BTMA 3S1HA 3QZGA 4K33A 4UXQA 3OP5A 4KUJA 1K2PA 3FXXA 3KMWA 4NSTA 4LRMA 5D7VA 5AUTA 1YI4A 2UZEA 2WIPA 3R0TA 1IA8A 4PNIA 3QC9A 5HE2A 2WMVA 3TV7A 3OWJA 4FTCA 1J7UA 3KKVA 3EYHA 3ZUTA 4CYJA 4MXZA 4WG4A 4O0YA 4G6LA 3I5ZA 3ZZEA 2G9XA 4XG6A 3GC9A 5F95A 5HNGA 3AC1A 3ANRA 2OJGA 4DFLA 3CY3A 5IEYA 4HVHA 2CNUA 4A4LA 3C4EA 3GI3A 3R1QA 3Q2MA 4MHAA 2C3IB 1VYWA 1OGUA 5H9BA 2BRBA 5H3QA 4UMQA 4C4JA 3AD4A 4QNYA 4XG4A 4MAOA 5I4NA 3FL4A 3WF6A 3NNUA 4CFFA 3F5GA 4IM3A 4DFUA 3EQHA 4EK8A 3GC8A 4FZAB 4RJ5A 5M06A 4EYJA 5IMEA 5FEQA 5AV0A 3WZJA 3NR9A 4FVPA 3DNEA 3D2IA 4OGRA 3AC4A 4EQUA 2HENA 4XP2A 4ANNA 3FMKA 3OHTA 3VQHA 3ORKA 4RWIA 4BCHA 4DGGA 5HD7A 3C50A 4LMUA 2PMNX 4UBAA 5LVLA 5CF6A 5M4FA 5BVEA 2YA9A 4LL5A 5AUYA 2C5XA 3AGMA 3CIKA 2W1EA 4NKSA 4R7HA 4BBMA 3HEGA 4IMYA 5ANGA 3ZDIA 3PIXA 3I0QA 2I40A 3E3BX 5DWRA 3KN5A 4IHPA 4XV1A 2ZJWA 3BIZA 4HYHA 1CKIA 4R78A 3QX2A 5DN3A 4G6NA 1E1VA 5AR8A 1J3HA 1PYXA 3SRVB 1ZMVA 5KZ0A 4L3PA 5A4CA 4EOLA 4ZP5A 5CEQA 4TTHB 3SX9A 4F1MA 5E8YA 4L00A 4V01A 2F7EE 3KF7A 2XIYA 2NRYA 5I9UA 4TYIA 1YXUA 3WF7A 3ZONA 2ESMA 1W98A 4R7IA 2IWIA 3BELA 4LGGA 4S33A 4TYGA 3R7EA 2VO7A 2F7ZE 2PVJA 2ERZE 2YLEA 3U9NA 1R3CA 1S9IA 4FTKA 3TZ8A 4O7LA 1MP8A 2V5QA 4H39A 4TNDA 3LXPA 2X7GA 1XJDA 3GC0A 3QTZA 1PYEA 4TY1A 4XYFA 3G9LX 4EK6A 5IPJA 4FGRA 3FSKA 2PUIA 4YNOA 4H05A 3AC3A 3NX8A 3Q32A 3FEGA 2Z7LA 3R9HA 2B1PA 4EOJA 2X8EA 5DNRA 3V8SA 3AXWA 2R3KA 4UMPA 3QBNA 3FI4A 2IW8A 4WT6A 4CRLA 3VW8A 2WTVA 3SGCA 2IW9A 4TKSA 3V51A 3HKOA 4M67A 4OBQA 4BI2A 3WBLA 1GAGA 2XK4A 2XJ1A 3DKOA 3PVBA 2J90A 4DH8A 4BCJA 5CF4A 3EKNA 5EW9A 3AD5A 3I7CA 1H28A 2ITYA 2UVYA 4QT1A 4ZSAA 2X2LA 5GIPE 2CSNA 2GS2A 4J8NA 4MNEB 2OJIA 3DA6A 3OFMA 2CJMA 3BEGA 4U40A 4RVTA 1YWNA 3SXRA 5FDXA 4CFUA 3G15A 3H9OA 3O8PA 3Q4UA 4IEBA 4WNOA 1BYGA 1H1WA 3FZOA 2BZIB 3RNIA 3PFQA 4NH1A 4G5PA 4FNXA 4ZSEA 3CQWA 4AOIA 4EK4A 2X39A 2QD9A 2Y6OA 2XK9A 4OTWA 2C6OA 5DT0A 1H26A 1W8CA 4JIKA 4YJRA 3UC4A 3COKA 3GUBA 5M4UA 2NPQA 3HLLA 3HV5A 5H2UA 2IVUA 4G16A 2PVRA 3PTGA 4RVMA 3VS2A 1WBWA 2IZSA 3F7WA 3BQCA 3DK6A 4CKJA 2XIKA 5IA0A 5F9EA 4FVRA 3E93A 5CEOA 4ZLOA 3PRIA 4FC0A 2EVAA 4P90A 4R1YA 3D83A 3UIBA 1P2AA 4FTJA 5KMOA 3QALE 2OH0E 4OTDA 5EI2A 4KIPA 4O27B 4O1OA 1PXOA 2P4IA 4FV9A 2YABA 4IZYA 4O38A 4CCBA 4D0XA 4LGHA 2BPMA 4FEQA 4GUEA 2G01A 1H1PA 3DZOA 4J1RA 3FXZA 4FV2A 2WTKB 4YJTA 4DHFA 3TCPA 5M55A 1JAMA 4QYFA 5CF5A 1E9HA 5IA2A 4YO6A 4KBAA 4IB0A 5ANJA 3FE3A 5K0XA 3VF9A 2VWWA 4FKOA 4RQVA 3UJGA 3QKLA 5D12A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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