4WG4A

Calcium-dependent protein kinase 1 from toxoplasma gondii (tgcdpk1) in complex with inhibitor uw1613
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
465
structure length
454
Chain Sequence
STAIFSDRYKGQRVLGKGSFGEVILCKDKITGQECAVKVISKRQVKQKTDKESLLREVQLLKQLDHPNIMKLYEFFEDKGYFYLVGEVYTGGELFDEIISRKRFSEVDAARIIRQVLSGITYMHKNKIVHRDLKPENLLLESKSKDANIRIIDFGLSTHFEASKKMKDKIGTAYYIAPEVLHGTYDEKCDVWSTGVILYILLSGCPPFNGANEYDILKKVEKGKYTFELPQWKKVSESAKDLIRKMLTYVPSMRISARDALDHEWIQTYTKDVPSLDNAILNIRQFQGTQKLAQAALLYMGSKLTSQDETKELTAIFHKMDKNGDGQLDRAELIEGYKELMRMKGQDASMLDASAVEHEVDQVLDAVYIEYSEFVTVAMDRKTLLSRERLERAFRMFDSDNSGKISSTELATIFGVSDVDSETWKSVLSEVDKNNDGEVDFDEFQQMLLKLCGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Calmodulin-domain protein kinase 1
publication title Calcium-Dependent Protein Kinase 1 from Toxoplasma gondii (TgCDPK1) in complex with inhibitor UW1613
rcsb
source organism Toxoplasma gondii
total genus 163
structure length 454
sequence length 465
ec nomenclature ec 2.7.11.17: Calcium/calmodulin-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2014-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF13405 EF-hand_6 EF-hand domain
A PF13499 EF-hand_7 EF-hand domain pair
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4wg4A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4wg4A01
2CLQA 4I1ZA 2GNLA 3ZONA 4ZY4A 4II5A 1WVYA 5IEVA 3FZRA 4D2TA 2OF2A 2PYWA 3CTJA 3A4PA 3FL4A 4WT6A 5GZ8A 2C69A 1UNLA 4LYNA 4E5BA 3F88A 4AT4A 4OTPA 1JAMA 2Y8OA 3PJ3A 5FEQA 3ATSA 1JQHA 3L8XA 2JBPA 5AIRA 5E1SA 4AFJA 4DFNA 1PF8A 1UU8A 1H27A 3UC3A 4U79A 4BDJA 3NUAA 5ACBC 4YJTA 3ZDIA 2V7AA 4ANSA 2C1BA 4BBMA 5I0BA 3P78A 2CGWA 3DGKA 5LOHA 3NGAA 4PQNA 3TKUA 1UKIA 3D2IA 5ANJA 2F57A 2C3IB 3A7FA 3QZFA 3D83A 4FTQA 3LFNA 4E26A 4DG2E 4U42A 3JVRA 4F6WA 4O0RA 2UW3A 4YP8A 3DBDA 2BTSA 4FV4A 5K3YA 3Q53A 5HG9A 2IJMA 3F5XA 3FMJA 3DJ5A 2J5FA 3LFCA 5FUTA 4CFMA 4QP9A 2VV9A 3S3IA 5EI2A 3ZZEA 3ODZX 1QPJA 1ND4A 5GZ9A 2R3JA 3IW7A 4ZZOA 3R04A 3HMOA 3CD8A 1ZMUA 3TWJA 3F82A 3R7GA 4OLIA 3BCEA 4JQEA 1H08A 3E7VA 4YC8A 2X2MA 3MPAA 4FV0A 2OXYA 3MVLA 3COMA 5FM2A 3PFQA 2G2FA 3PPJA 1W98A 2YLEA 3LE6A 3OG7A 5M55A 3VS0A 3VO3A 2ETRA 4UN0C 2HW7A 2ZB1A 2B0QA 3EN4A 3COKA 3CTHA 3VS3A 3DDQA 2QO2A 3BE9A 3FZ1A 3KXNA 4I93A 4USFA 2UZUE 2R3OA 3DAEA 3L8PA 4RC3A 5AAFA 2Y4IC 5TE0A 2OH0E 3HMNA 4X21A 3R7YA 4FIHA 4JAJA 5FG8A 4M0YA 4UYNA 3OUNB 5DI1A 2XS0A 4AGDA 3L1SA 5FXRA 1KV2A 4DTKA 4I5CA 3OTVA 3OXTA 4BWPA 3TNQB 3I4BA 1Y6BA 4XNEA 4BDEA 4E7WA 3G0FA 2WIPA 4J52A 5JFVA 1ZZLA 2YHVA 2CGUA 2HAKA 3FZPA 2QU6A 2JAVA 3FLYA 3AXWA 3MYGA 3R9DA 2PMNX 4FYNA 4UY9A 4BDDA 4ZSAA 4GU9A 5M44A 2OLCA 4DEGA 5IU2A 4ITIA 3ZLSA 3IG7A 3PZEA 3P7CA 4RRVA 3BX5A 3P23A 4UWCA 3QUDA 4K11A 2DUVA 2W4KA 4F1OA 2H34A 3BU6A 4IM2A 3GENA 4Q2AA 4MD9E 4DH8A 4YJUA 3EFKA 4MWIA 5M51A 3S1HA 3LQ5A 4IANA 5L6WL 3ENMA 3BYUA 5CYIA 2JKOA 1A06A 3IW6A 3MIAA 3QA8A 4FSQA 4QPMA 4XH6A 1MUOA 5ANKA 2JDVA 3RZBA 4NEUA 4EH8A 5EKNA 3SW7A 4TW9A 4QMUA 5ETAA 4C4EA 2JC6A 1FGIA 3HMPA 3KVXA 5J7HA 1Q8ZA 3MY1A 5HBJA 3DQWA 1G8AA 4XJ0A 4KABA 3CJGA 3BQRA 3IK3A 3V6SA 5JFWA 3DPKA 4U45A 4JS8A 3TV7A 4MD7E 4QTDA 4BTJA 3I5NA 1OECA 2QOOA 3Q96A 4K0YA 4E4LA 3I79A 4MEDA 4CLJA 5EDQA 5BPYA 2C0IA 3A61A 1IRKA 4JQ8A 4NFNA 2B54A 2JEDA 2XNPA 2O3PA 4MXOA 3TZ7A 5IA1A 5HNIX 3BHTA 3EL8A 3KRWA 5GHVA 5J9LA 4YTHA 3JR1A 3O7LB 2GHMA 4IB0A 3QKMA 5KKRB 1JSVA 3RNIA 3S0OA 4FTUA 3AD4A 4BDKA 2ITQA 4TYIA 4ERWA 2W9ZB 4AN2A 4F6SA 4XYFA 3Q9WA 1XH6A 4ZSLA 3UVRA 5BYYA 4L67A 3DLZA 2I0YA 2WEVA 3AC2A 3LIJA 4CKIA 3N51A 4F1TA 2WAJA 3FI8A 1JLUE 4QRCA 2VTHA 3EYHA 5KMJA 5T68A 4IBMA 2XKEA 4BKYA 5DT4A 4BVUA 1Z9XA 2PL0A 5LWMA 2HCKA 2Y6MA 4ACGA 3FMMA 2ITVA 3M1SA 4IDTA 4OGRA 4CV8A 3LPBA 3NRMA 3EYGA 3ODYX 3VBQA 1YDSE 2E9PA 4Z9LA 2YISA 5EOBA 3SRVA 3MH0A 2YIQA 2W1DA 4L3PA 5L4QA 4KSPA 3GFEA 2EVAA 3O51A 3R30A 4S31A 3BEAA 3IQ7A 2XKFA 5AX9A 2XP2A 4O1PA 3F69A 2PUUA 5HLNA 4F7JA 4HJOA 4E93A 2BRMA 1JSTA 4YJPA 4FK6A 2JFMA 3AC1A 4AS0A 2J0JA 4C58A 4RBLA 4Z7HA 2FO0A 1Y91A 3ZBFA 4QNAA 4RQKA 4GK4A 1VJYA 5E4HA 3PUPA 3DKFA 4U0IA 2UW0A 3LFSA 3Q3BA 4LRKA 4PP9A 4XUFA 3LFDA 4WG4A 4YBJA 4O96A 1GIHA 4N57A 5BYLA 3TDWA 3NZ0A 1G5SA 4GIHA 5HG7A 3QU0A 2FUMA 2IG7A 2G2HA 2GTMA 3O71A 3U6HA 3COIA 3V5LA 2OFVA 4FIGA 5HQ0A 5HX6A 3KREA 5HE2A 5JEBA 3LLAA 1XKKA 2VTSA 4WBBB 5CF5A 5DH3A 4GFGA 4KS8A 5IF1A 5AWMA 1FVRA 2HWOA 3QCSA 5FTOA 3GVUA 3SRVB 1EH4A 3I1AA 5DOSA 5EW8A 1XBAA 5IZFA 5K9IA 1QCFA 4EHVA 4UX9A 3JXWA 4M13A 4RWKA 3FMNA 4YZCA 4YTCA 2XK9A 2FA2A 1ERKA 2I1MA 2W4JA 2OF4A 5KCVA 4IB3A 5JT2A 3D4QA 3SX9A 1H4LA 4PDOA 2GS2A 3LJ2A 5F20A 4AG8A 3C0GA 3P08A 4ACDA 3VUMA 5K5XA 1CKJA 3IPHA 2V0DA 4I4EA 4C8BA 5M08A 3GU7A 3TZMA 3OWPA 4F9CA 4RIWA 5CVHA 2GS6A 4U3ZA 4NL0A 2HZ4A 3K5UA 5H8BA 1VYWA 3OEFX 4D2VA 5BMSA 5CEOA 1ZLTA 4ZMFA 3BQCA 1S9IA 4F09A 4L68A 1YI4A 2YIXA 3C4XA 2R3QA 3K5VA 4Q9ZA 4XOZA 2PTKA 3FZTA 5K0KA 3SQQA 1TVOA 2YIYA 3TJDA 4BI0A 4CG9A 3KK9A 2UW5A 5E8VA 3R7UA 1Q24A 2ITZA 2UZVA 3QTXA 3MVJA 4HCVA 5IKWA 4DGOA 4UMQA 3QKKA 4FF8A 4ZOGA 3HNGA 4C38A 3R1YA 4I23A 1XH8A 4ZY6A 4IM0A 3ANQA 4CD0A 5CEMA 3TI1A 1YXVA 4OTGA 5CQWA 3R8PA 3FKOA 4GW8A 3VS6A 5CANA 5LMKC 3P9JA 4RIWB 4DINA 4PL3A 4GJ3A 2HENA 1WVXA 4JIAA 1QPEA 2WELA 4XG2A 4DH7A 4EOKA 5JGAA 2CNVA 5M09A 2GMXA 3W1FA 2WTVA 3CCNA 3E8CA 3UE4A 2CCHA 4I41A 2X2KA 5IMEA 3ZM9A 4P2KA 3IO7A 5DHJA 4LOOA 3ZXTA 3KB7A 4WG3A 2QOHA 2R9SA 2V62A 3HAVA 3ORIA 5CF4A 3DAKA 4CRSA 1ATPE 1S9JA 4P90A 1U46A 3CPCA 2A19B 4AGUA 4AWIA 2HZIA 1SVGA 3BZ3A 3I6UA 4UZHA 4WSYA 3BU5A 4J1RA 1M14A 1ZY5A 3KK8A 2EXEA 2GNHA 2BALA 2VX3A 3VW6A 4RVLA 3ZHPC 4HZSA 4IM3A 4QMZA 3VWAA 4BB4A 3FLZA 4P4CA 3V01A 3ZMMA 2OIQA 4EK8A 1KE8A 2RFEA 5DWRA 2ZDTA 2VTRA 2Z8CA 4FV2A 2V5QA 5KMOA 2ACXA 2E9OA 4U44A 3Q4UA 5HCXA 4AZFA 4C4IA 4OT6A 3BYMA 1O6KA 3CQEA 3MPTA 2NRYA 3SW4A 4EC9A 4A9RA 5I9XA 4E6DA 5TO8A 2ZMDA 3CEKA 1YXXA 1ZOHA 3FMKA 5CVFA 3KKVA 2ZYBA 4BDGA 1J7LA 2QU5A 3VVHA 3AD5A 2DYLA 4EK5A 2AC3A 2OJJA 4GT4A 3EHAA 4C62A 5DFPA 3LFFA 3PSBA 3FKNA 4B7TA 1UVRA 3FHIA 3OCGA 3C4EA 4AOIA 3HV5A 4JVGA 4U8ZA 2JD5A 4AGWA 4FIJA 3C0IA 4AW0A 3ORMA 2Z7SA 4MD8E 4D2SA 5KHXA 4WSQA 1ZYDA 2B55A 3TKIA 4TZRA 2KTYA 3E93A 3PA4A 4KIKA 4TKSA 5ACKA 3EN9A 5BVWA 4GCJA 4ALWA 3GQIA 2Z7LA 3EQGA 4O27B 2WPAA 2WTKC 3PY1A 1Y57A 4OR5A 4XX9A 3R02A 2G2IA 4FKVA 3OFMA 4PTGA 4LMUA 4AFEA 4ZTSA 2BFYA 5DBXA 3D14A 4YJVA 3BELA 5BVKA 2V55A 3O96A 4AT5A 4M14A 3AGMA 2G9XA 2P0CA 4ZLYA 3SC1A 3WF9A 4HVHA 2WXVA 1ZRZA 4DAWA 3PPZA 4EJNA 4FSNA 3AG9A 2WMQA 3GU4A 2XNOA 4UBAA 3CQWA 5IUIA 3P1AA 4U97A 5F4NA 3TUCA 3CY2A 3CXWA 4W4YA 2B9IA 2J51A 3QRKA 3VUTA 4O22A 2EXCX 3H10A 2WZJA 4KB8A 3SOAA 3U9CA 4KIKB 3CKWA 3RK9A 5IA3A 2Z7QA 3ZLXA 1NXKA 3Q4ZA 4JIKA 4BCNA 3EWHA 2QR7A 3CGOA 4GH2A 4IX5A 3EQIA 4DG0E 4CGAA 2O2UA 3LZBA 1SM2A 3W2CA 1O6YA 4NJ3A 3KMMA 4C61A 3KXZA 4R78A 3PVBA 4QMYA 4DFUA 1OIUA 3HECA 1P2AA 3VBVA 3GU5A 4KINA 4IAZA 3DT1A 4NKSA 2CLXA 2B7AA 1LEWA 3QTQA 2J9MA 2CKOA 2BDWA 3W2QA 4JDIA 3RPOA 5F95A 2XNMA 4GYGA 3ZUVA 2I7QA 2VD5A 3VRZA 1CKPA 2VTLA 3VW8A 5GJDA 3GOPA 4H58A 3TEIA 4BI1A 1H0VA 2UZWE 3HP5A 5J87A 4KBKA 4G16A 4N4SA 4C4GA 2YAKA 1IEPA 3BKBA 3R8MA 5IQAA 3KXGA 4EEVA 3PP1A 3P86A 5FRIA 1W0XC 5J95A 5FBOA 4EOOA 5J1VA 4OTWA 3U4WA 4AT3A 4O91A 1Y8YA 4R1VA 2WU6A 3DXNA 3UMWA 3MESA 2B52A 2BUJA 4QMWA 2PVRA 3KXMA 3WZKA 1JOWB 4L7FA 4CQEA 3IW4A 2FVDA 5KBRA 4QMLA 5IQBA 4MQ2A 3ZUUA 3MBLA 4L3JA 4F7NA 3H0YA 3SKCA 1K2PA 2F7ZE 4JX7A 5EHYA 4OW8A 1Q61A 3OWKA 3RM6A 2HXQA 5HORA 3FHRA 1GZOA 4IWOA 4TTHB 2W1FA 4J7BA 5AUVA 4RQVA 3UYTA 5AUZA 1KV1A 4FIIA 1KE9A 2ZVAA 3W16A 2XIYA 5CEPA 4YHJA 4R7BA 1Q4LA 4BCOA 1SMHA 2WQEA 4DH3A 3FZSA 1XH5A 1F5QA 1REKA 3ALOA 3EN5A 1UWJA 4RVTA 3G9NA 4X3FA 4U80A 4BCMA 2GS7A 3NCZA 3RWPA 4OTHA 4IVBA 4MXAA 3TUBA 5A6OA 2YN8A 3OWLA 4K33A 4LG4A 5CENA 4JI9A 1U5RA 4H05A 4MXXA 3OT8A 4NW5A 5FEEA 3UOLA 5LJJA 3RAHA 1VZOA 2O5KA 4IJ9A 2P2IA 4ID7A 3NNVA 2XK8A 3BV2A 4FTCA 5ETFA 4RIXB 1H01A 4AE9A 2I0HA 4R8QA 2IVTA 4I0TA 3RPVA 5IUGA 4ZSGA 3QXOA 4I6FA 2XNGA 5LVNA 2WMSA 1IASA 2QI8A 2C47A 2WB8A 3FMEA 2QHMA 3WI6A 2GCDA 1SVHA 3C1XA 3VS7A 4AW2A 3QD4A 3Q9YA 4MVFA 4WRGA 4X3FB 3D5WA 3I60A 2R3KA 3GCUA 3PIYA 4KKEA 4C4HA 4FOCA 4OBPA 5FTGA 5LQFA 2YITA 4FTKA 4FTMA 4KS7A 4O0SA 4U43A 4D2WA 5BVDA 1LUFA 2GNFA 3I6WA 5C4LA 2VO7A 4J71A 5AP0A 3I7BA 3NAYA 4EHGA 3F3VA 3HDMA 2UZTA 4IWQA 4YJSA 4C35A 5GINE 4CKRA 3GCPA 5CSXA 5E91A 3MTLA 2P4IA 4JT3A 2PU8A 1H24A 2R3HA 5EYCA 4I5HA 4HGLA 5LVLA 4RVMA 3FLWA 3VS5A 2JDSA 1PXOA 2WQOA 3ZSHA 5AR4A 4HZRA 3OY1A 3ZYAA 3C13A 5AP7A 1OL6A 3NSZA 2VU3A 3ID6C 3QQHA 1PMEA 2SRCA 3MFRA 4CYJA 3DB8A 5AJQA 4L44A 4WNPA 1OIQA 5C26A 2C5YA 2YA9A 1PXNA 3LJ1A 1L3RE 4MNEA 3VQHA 4GRBA 2F7XE 4LGGA 3VHKA 3QHWA 2I6LA 3B2TA 3HV7A 4M67A 5HCZA 1WZYA 2XYUA 4HPUE 3PVWA 4S30A 2W1ZA 4L01A 5FBNC 1R0EA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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