4WIWA

Crystal structure of c-terminal domain of putative chitinase from desulfitobacterium hafniense dcb-2
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
348
structure length
348
Chain Sequence
NAKISLQYWDGYASYETYLRQLSLIPGKATDYVDYVSPNWRGSIGTDGSLKLVWDEGSSNYKQLTNMAHGLGMKVLPLINGSGATLNTLLKSPAAREKLIGEIVVLLKNTNADGVVIDFETPLDYGDVKDPYDGVRNDLTAFMESLHSELQSMNKLVVMAVMPRMSSSQYWLDAYDYEALSHAVDYLHVMTYDHHYRTSAPGPIAPYPWIKQVLTYIQGQGVDMSKVLMGIPYYGRDWVVDGKDANGNPTYNSTAFGYSKALELADSYGATITYSKYNDADPVGTPTFKYTDEKGVEHTVFFDDYTSWNAKLSIINEFGLAGVGPWAMGWVDENTAEGLFPLLNQHLR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Glycoside hydrolase family 18
publication title Crystal structure of C-terminal domain of putative chitinase from Desulfitobacterium hafniense DCB-2
rcsb
source organism Desulfitobacterium hafniense
total genus 96
structure length 348
sequence length 348
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4wiwA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4wiwA01
1BYBA 2DIJA 3K8LA 2BV9A 4S3JA 1R7OA 5M03A 4QLJA 3CUGA 4PMZA 1HXJA 1GCYA 2W92A 1BYCA 3GBDA 4GI6A 4PEEA 4GO9A 1VFUA 3VO0A 1E9LA 5A94A 3HMCA 4Q7NA 4H8VA 1EGZA 3EMZA 4EK7A 3WNNA 1CGYA 1EXPA 2QF8A 4BCEA 1E6QM 1ZBWA 4PMVA 1JZ5A 1I1WA 3W82A 2J75A 1LF1A 4UNIA 5GNXA 1C7TA 2J7HA 3N12A 1YQ2A 4HPHA 1TG7A 3K46A 2ZXQA 1CECA 1C90A 2WVVB 2WC4A 4LPCA 3AFBA 7CGTA 1JNDA 3LPPA 1V02A 1DWGM 1H49A 2JF7A 4OJYA 1GOKA 1ODUA 1QPKA 4CKQA 4HU8A 3LPFA 3FY1A 1CBGA 4E2OA 5CZKA 1WDQA 2IXUA 4FMVA 3BGAA 1BSIA 1NWRA 1CDGA 3VD4A 1J0KA 1BHGA 1ISZA 3ZJ6A 4D1JA 3OBAA 3PBGA 4JCLA 1LL4A 5AYIA 4MB4A 1Y7VA 3W38A 3AICA 4M80A 5HNNA 4W5ZA 4XB3A 1O7AA 5BXTA 1W3HA 3NCOA 4BQ2A 2CCRA 4U5IA 3WEMA 3WH6A 1U33A 1DWJM 2FHBA 2EBNA 1B31A 5DFAA 1QNSA 2EO7A 3VDHA 1ZBVA 2QV4A 4JHZA 3W81A 2OLHA 4CVWA 1VB9A 3A4AA 2G8ZA 3WMCA 1GNXA 4DUWA 1HF6A 4UTFA 1Q6FA 4DM1A 1JAKA 4C7DA 2CKSA 3ZM8A 4W85A 5JH8A 3U7BA 4B9YA 4QLLA 2QMKA 3S6TA 1KQZA 3DYOA 4PMOA 4W7VA 5BROA 2CPUA 1SFSA 1H0GA 1MXGA 2ZXBA 2E9LA 1E56A 4U31A 1W9VA 2BVYA 1US2A 1XH0A 1ODZA 3GH5A 4JFUA 1JD7A 3N18A 3CZJA 3I3EA 2A3CA 1DHKA 4M24A 1VJZA 5CXPA 4HZ6A 1MW3A 3ARQA 3AMKA 1UR0A 3TA9A 1UKOA 4J3UA 1ISWA 1XCWA 2GJXA 4B3KA 1CXEA 4PSPA 2YBUA 1MVYA 5CSYA 1XGZA 1UKTA 5GNYA 3SCOA 5ECUA 3WN6A 2XVPA 4DUXA 1QI2A 3F5KA 1JXJA 3HU7A 4QLKA 1JNEA 2DT3A 1UQYA 3ARUA 1E4IA 4URIA 3WSUA 1WDSA 4UFKA 4P8VA 3U5YA 4HMEA 1BAGA 2PB1A 1ZB5A 2E8ZA 2DGAA 3OIHA 3OGRA 3BAJA 2Y24A 3W6LA 3EDDA 4AZBA 3L2LA 3K8MA 4ACZA 3SCQA 3WFLA 2VCCA 3ZO9A 3WH9A 2YL9A 3N17A 3DYMA 3ZR6A 3WKZA 1B2YA 1ITCA 3UR8A 3AIUA 4NZCA 3T2QA 3CZGA 2JFEX 3WQ6A 1YHTA 4OOUA 4TUFA 3AHVA 2FGZA 2WMKA 2ZUVA 3WUBA 1CEOA 3BLPX 4WJXA 3THCA 4W8AA 4QAWA 4PSRA 2VJXA 1E71M 1JFHA 3PZOA 1JL8A 4ATDA 1HX0A 4UFMA 2WB5A 1HL9A 3WEZA 1B3YA 2A3EA 1HNYA 3ARVA 4DM2A 3WF2A 5F7UA 1OINA 4LX4A 2FHCA 3GXMA 3ARWA 1OBAA 5E0FA 2WPGA 1H41A 1MQRA 4CN1A 1EIBA 3AIVA 2OWXA 1GQJA 2DIEA 3BCDA 3DYPA 1D3CA 4J7RA 1BYAA 4WSJA 2XJ7A 2EPMX 1ECEA 3I3DA 2WHMA 1E5NA 2WXDM 4GI8A 4V28A 3NSMA 1WNOA 3UCQA 1VEOA 2WHKA 4H8UA 4Z2GA 3CUIA 2C8NA 2J4GA 3WD4A 3AHTA 2EXOA 1NP2A 3CH9A 3VTRA 2GJPA 5C70A 3WD2A 4GIAA 2O9PA 3EBVA 2CERA 3GZAA 1PJ9A 1J0JA 1KGUA 1PX4A 3K8KA 1DTUA 2F61A 2W91A 1W2PA 4F8XA 4JKLA 5A2CA 3AHZA 4M8UA 4HTYA 1C8YA 2VUYA 1F4AA 3SCUA 1FH7A 1JYNA 1BVNP 4HA1A 1JZ2A 4NI3A 4UR9A 3AYSA 3UG5A 3T09A 1VFOA 1J18A 5A6JA 3GNRA 3CHEA 2F8QA 5AY7A 4MJ2A 1C8XA 1V6WA 4H2CA 3UERA 3ZMRA 1KWKA 5I23A 4CCCA 1CXKA 3OLIA 3WENA 1QHOA 1FFRA 3WIJA 5A69A 4W89A 4EKJA 1W1TA 1V02E 3A3HA 3EMQA 5JBDA 2E9BA 4XUYA 1VBUA 3WDJA 1J0IA 4OZOA 2CBUA 4ZE5A 5A3HA 1GUVA 3UETA 1V3IA 4KH2A 3F5JA 3OB8A 3L4XA 4PMRA 4ZENA 1X6LA 1E6NA 2D22A 3VPLA 5A2BA 1UWIA 1H4PA 5M3WA 1UR8A 1VF8A 1VIWA 1WPCA 3W24A 2BY0A 2CHOA 1UUQA 1CXHA 4UFJA 2IXVA 2D3LA 3POHA 4D6JA 3AS2A 2A3BA 1VBRA 1NH6A 2XPKA 1CXFA 4Z2IA 4HA4A 2BY1A 3AXIA 3GBEA 4CD6A 2C0HA 4HPGA 4KRUA 5CLTA 5I6SA 2G4FA 4ATWA 4UCFA 3ZSSA 4GXPA 2GJRA 3BH4A 2CIPA 5E6ZA 4KWUA 4N0RA 2ESCA 2ZE0A 5ABGA 2J79A 1NQ6A 2WMJA 1EHAA 1W9BM 4R5EA 1JD9A 3L4TA 1E1FA 3F5LA 2YKKA 1Q6GA 2BS9A 1UR1A 4AEFA 1GZJA 1V6XA 3CHCA 3BCFA 4JHOA 4B15A 4GZJA 1B0IA 1C8QA 4QCEA 4ZFMA 2BFGA 3WH8A 2OYLA 1K6AA 1BG4A 1HJSA 3OZOA 1LG1A 2CHNA 2VL4A 3SCPA 1CGUA 3FHAA 3SURA 3OGVA 4AC1X 3A6OA 2CXGA 3VGEA 4CD5A 4XZBA 3AS1A 4LXFA 2D0GA 2GK1B 3WNMA 1E5JA 2PBOA 4U3AA 1LL6A 1K9EA 3VVGA 5FOOA 1R8LA 3VGDA 1JYWA 1I1XA 4WK9A 2XYLA 1SMDA 1ZJAA 4GI9A 5I0DA 3OLDA 4PRWA 4ACYA 1HIZA 1E0XA 5BXSA 1K9TA 3MU7A 4P8WA 4W7WA 2NW0A 3SCVA 4AD0A 4TVCA 1M7XA 2WBKA 5EFFA 1XHGA 3CUHA 4BQ5A 4W93A 5A8PA 4S3KA 3NIYA 5D9MA 1MXDA 1H09A 4AZCB 2OWWA 1WCGA 1IT0A 4YHGA 3VX0A 1BLIA 1CGWA 3KL5A 2WNWA 2VX7A 4P7QA 4WKHA 1AMYA 1DEDA 1XH2A 1J12A 1QHZA 2WHJA 3PHAA 3RPMA 5I78A 2WW5A 3BAYA 2VO5A 3N15A 1TUXA 3WBEA 1W1YA 1E3XA 2VCAA 4DWSA 3NJ3A 2J62A 2D20A 2TAAA 5DMYA 3AMGA 4LYQA 4HMCA 3AZRA 4PCSA 4UOZA 4WKFA 1CGTA 2W5FA 3SUSA 2WCGA 2WMIB 3VIOA 1JZ3A 2VMFA 1UD8A 1M04A 2BY2A 3CIVA 3A4WA 4HMDA 1NOWA 1BVZA 2VX5A 2VQTA 3I3BA 4GZEA 3QOKA 4MNKA 1QW9A 2X8RA 5E9AA 3UEQA 3WDIA 3SCNA 1BQCA 1XC6A 3DHPA 1G94A 5HPOA 4M82A 3VIKA 2ZX9A 4F9DA 2J7EA 1UWRA 2JE8A 5AC4A 5DO8A 3BC9A 2E0PA 3T08A 1OIFA 4AZIA 2YA1A 3PZTA 4M81A 5I3DA 3ALFA 3PZ9A 2J47A 1CXLA 2VCBA 3WDQA 2Y8KA 4D6HA 5C8BB 1GOOA 2WK2A 4B3LA 1JI1A 1EOKA 3EYPA 3QGVA 1TMQA 4IPNB 1UG6A 2XVKA 5FD0A 4PMYA 3MSDA 2QPSA 3KE0A 3AIWA 3TOPA 1V08A 2YLLA 3MUAA 3ZJ8A 3K1DA 1ZBCA 1FA2A 1C92A 3QHOA 1FHLA 2BVDA 3FAXA 4UOQA 3L4UA 3MANA 1C91A 5JIPA 2ZOXA 1PX3A 2ZUTA 3ZJKA 2EQDA 1VFFA 4AD4A 3OLEA 2XFFA 3WF0A 5ABFB 1C93A 4UFIA 4MTVA 4ML4A 1SR0A 2GFTA 3ZR5A 4P7RA 5DT7A 1QI0A 3AISA 3MV01 4CU8A 3THDA 2OWCA 3FNDA 1UWSA 2CITA 5A8OA 5KZ6A 5BXRA 4WSKA 1UKQA 2VR4A 1KGWA 4DUVA 5BRPA 4D71A 3L2MA 1FHDA 2WZHA 3AJ7A 4Z2JA 1ZBKA 1DWAM 1EA9C 3WBAA 6A3HA 1UYQA 2A3AA 3EDFA 3RM8A 4Z2HA 3W26A 2WVSA 4GINA 3ARPA 3AMLA 3UESA 4WF7A 2HVMA 1AVAA 1X1NA 1HKIA 4M1RA 3N1AA 4MDPA 1OGGA 3WMSA 3GTNA 2JIWA 3BXWA 3WD3A 1E6SM 1KXVA 5CGMA 3FHQA 2PI6A 5ABEA 3AROA 4J28A 2YDSA 4D6CA 4CD7A 4ZXOA 1I75A 3NDYA 3AMCA 1V3HA 5CGTA 4WIWA 1E6ZA 2XFRA 5BWFA 5AC5A 1QBBA 4J3VA 3TTSA 3WH5A 1JF5A 2G3NA 3BSHA 4CCDA 4D6IA 2E4TA 5DF0A 1E1EA 2WC3A 1G0CA 1W2VA 5JUVA 4KMQA 2ZX7A 1PZ2A 3VGHA 2D2OA 4MB1A 1PEZA 2ZUSA 1FFQA 2EJ1A 3VD3A 3WDPP 1VEPA 5AYBA 3BMVA 1E72M 2AOSA 3TTQA 1RH9A 3WELA 3IANA 4CGTA 4P8UA 1EHNA 1QOXA 1W9DM 2PBGA 4AXNA 4HOWA 4M56A 4CD8A 4W5UA 1EDQA 1NOUA 2YOCA 3AIEA 3D3AA 4MDOA 1UD6A 1V03A 3PN8A 2GUYA 3GXDA 2J7GA 3MUZ1 4BQ3A 4J3WA 3L4YA 3T0DA 3VNYA 1MYRA 2WVUA 1EOMA 3B9DA 3NYDA 2RGLA 1TZ7A 1LG2A 3CHFA 4TVDA 4UZSA 5D9OA 3U5UA 2WKGA 3PZQA 4X0NA 3SUWA 2XGBA 2UY5A 1F4HA 4QCFA 3M46A 4P8XA 1W9UA 1TE1A 1UZ4A 2ZUWA 3O9NA 5A95A 4UQAA 3QR3A 3N9KA 2JEPA 3ARZA 1WZMA 1TA3A 1CXIA 4JIEA 1JYVA 1ZJBA 3VINA 1MFUA 4X0VA 1W91A 4P7NA 3VX1A 4W8BA 2XTKA 2XM2A 2DQXA 2EPKX 6CGTA 3W25A 3RM4A 1WE5A 3WUFA 5A6KA 4FLSA 3FAWA 3TONA 5CG0A 4L4PA 3W37A 2G3MA 4OOZA 1W9PA 1EO5A 1V3KA 5HDRA 4OBRA 3PZGA 3OLGA 4V2XA 2Y8VA 4PN2A 4PUEA 1J0ZA 1OSEA 1ISVA 1MW2A 3VIIA 3WFZA 3VMOA 4PYSA 2V38A 4K68A 1JYXA 3VM7A 3W29A 3VDAA 1H5VA 1UA3A 2ZUMA 1BGAA 1B3VA 2XVGA 1HJWA 2HISA 2ZX5A 4TOQA 1FP9A 2VRKA 2W4XA 3WD1A 1G9HA 2WAGA 4JFSA 3IK2A 3GXFA 1UH4A 5E70A 2J7BA 3SCWA 2UY3A 3WF1A 3TTOA 3NSXA 3J7HA 4XZWA 1JFXA 4HU0A 2DH3A 2BHUA 2GJXB 1E15A 3CUFA 1C7SA 1BPLB 3SUVA 2FDMA 5BRQA 1CGXA 3SUUA 1KFWA 3RIKA 2YBTA 1UOKA 5IHSA 1ESWA 4XV0A 1HJXA 3VD5A 3WF4A 2JF6A 3AXXA 1W1PA 3VU2A 1JI2A 1ISXA 3EDEA 3VIGA 2EPLX 1GQLA 4HZ8A 1E4NA 4EE9A 1GPFA 3SCRA 2UY4A 2W66A 1PX8A 2VX4A 2GDVA 4GO8A 1HP5A 4LYPA 4MB5A 4J3TA 5IXEA 1XCXA 1G1YA 3VDBA 4Z2LA 2VZOA 4YHEA 4ACZB 1E70M 1HVQA 4BZYA 4P7OA 2YL6A 1E6RA 2V3DA 2ZWZA 3MO4A 1GJWA 4D6EA 3BAXA 4A3HA 5CJ5A 3GM8A 2BNJA 5D9PA 4TX8A 3L4ZA 3CGTA 3MSGA 1JF6A 4MNJA 1CENA 4Z2KA 5M5DA 1GOWA 1K9DA 3JUGA 2J7CA 1VEMA 1KB3A 1BFNA 2WMGA 1JXKA 4MPKA 4A4AA 2CYGA 2WM0A 1EQPA 1B3ZA 2XIBA 1VJSA 3S2CA 4U2ZA 5A8NA 2EPOA 1Q6DA 1NP0A 2D3NA 2X0YA 2J8GA 2EEXA 3RCNA 3VM5A 4KGJA 1J9YA 2ZX8A 2ZUNA 3KL0A 3E1F1 1AQMA 1ITXA 1NWUA 1OB0A 1E3ZA 4AW7A 1JIBA 2DSVA 1B90A 1IZKA 4H8HA 2WYSA 3KEHA 5KEZA 3NUKA 2D0FA 1QW8A 3WQVA 4E4PA 1WDPA 2XIIA 3MUY1 2PWGA 2W62A 1UR4A 2J25A 3GH4A 2Z1KA 1J0HA 4PCTA 2NT1A 3VUPA 2BY3A 4IM4A 3ARSA 3IAPA 2BXYA 4J27A 3G6LA 5DT5A 2E8YA 2PF0A 4AD1A 1VAHA 5GPRA 1HVXA 5HOSA 1PIGA 4CUCA 3MS8A 2YLAA 1HT6A 3WF3A 5C71A 1Z32X 3AOFA 3BMWA 3VGFA 4MAZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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