4WKHA

Crystal structure of human chitotriosidase-1 catalytic domain in complex with chitobiose (1mm) at 1.05 a resolution
Total Genus 133
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
133
sequence length
369
structure length
368
Chain Sequence
AKLVCYFTNWAQYRQGEARFLPKDLDPSLCTHLIYAFAGMTNHQLSTTENDETLYQEFNGLKKMNPKLKTLLAIGGWNFGTQKFTDMVATANNRQTFVNSAIRFLRKYSFDGLDLDWEYPGSQGSPAVDKERFTTLVQDLANAFQQEAQTSGKERLLLSAAVPAGQTYVDAGYEVDKIAQNLDFVNLMAYDFHGSWEKVTGHNSPLYKRQEESGAAASLNVDAAVQQWLQKGTPASKLILGMPTYGRSFTLASSSDTRVGAPATGSGTPGPFTKEGGMLAYYEVCSWKGATKQRIQDQKVPYIFRDNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGLGGAMVWALDLDDFAGFSCNQGRYPLIQTLRQELSLVPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Chitotriosidase-1
publication title New insights into the enzymatic mechanism of human chitotriosidase (CHIT1) catalytic domain by atomic resolution X-ray diffraction and hybrid QM/MM.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 133
structure length 368
sequence length 369
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2014-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4wkhA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4wkhA01
3VIOA 1G94A 3WQ4A 2RGLA 1UKSA 5CG0A 2VURA 1AMYA 1ZJAA 4XX6A 1IZJA 4TUFA 1JFHA 3NSNA 1KR0A 2VR4A 3EMQA 2G41A 1PX8A 1WAWA 1J0IA 4AZ6A 3TONA 2VZOA 2AAAA 1JI2A 1UHVA 3WL1A 1GVIA 4AD1A 1DP0A 2ZXBA 3ZMRA 1AVAA 2E9LA 1VFOA 1XCWA 4JFTA 2RGMA 4XZWA 4CD5A 3MV11 4PRWA 1TUXA 1OB0A 3NSMA 5FCZA 1B3XA 1C7TA 4WKAA 4U3AA 1CEOA 1VEPA 1EHNA 4L4PA 4MB1A 4DM1A 1ZBWA 1NOWA 4HZ7A 2JIWA 3A4WA 4FLRA 5M03A 1U33A 2WANA 3WD3A 1W3LA 4JKKA 2VCCA 3TTYA 1V3KA 3BXWA 2OSYA 4UFHA 4AC1X 4HMCA 4AY1A 3ARWA 3CZLA 1QPKA 3WQVA 4PMUA 4ZEPA 1SFSA 1UA3A 3N04A 1HVQA 2D23A 4PYSA 4AZCB 1E4LA 2JEQA 1ODUA 2CHOA 1ZB5A 3PZGA 4IPNB 4AMCA 3VD3A 3AIRA 1OIMA 3A4XA 2BHUA 4MB3A 7CGTA 2WZIA 1J0KA 4TTGA 1UZ4A 3MS8A 2EPLX 4UZUA 4PMOA 4MAVA 4PEEA 5C8BB 1JGIA 5DT5A 2V3DA 3VD4A 3I3BA 2FHFA 2GFTA 2OSXA 1ITXA 1IZKA 4JFWA 4BQ2A 5HBFA 1XSIA 4FMVA 3AJ7A 5LA2A 4ZXOA 3BH4A 3W28A 4QP0A 4EAMA 5A8OA 1E4IA 3RILA 4JL2A 3VNZA 3SEPA 1JYWA 5FKYA 1FH7A 3WNLA 5M17A 3MV01 3WSUA 4KGJA 3AMGA 5A69A 2G3NA 2GJXB 3ARYA 2WK2A 2VRKA 1W32A 1OT1A 2ZX5A 3AFBA 1OD8A 1JXJA 3L2MA 1PAMA 1B2YA 4UNIA 1F4AA 1B3YA 3VGEA 2J7GA 3AISA 4URIA 1RP9A 3SIMA 1GOWA 3ZSSA 4UOZA 1HL8A 2BXZA 1J10A 4H7VA 5D4YA 1DEDA 3O2LA 2EPMX 4S3KA 3MUZ1 4PBGA 2OLHA 3F5JA 2ZUSA 1UQZA 1R86A 2J47A 5FD0A 3UETA 3SCUA 1DTUA 2CIPA 1HKJA 1XHGA 4BF7A 3BSHA 4X9YA 2W5FA 4GI8A 5BWFA 1E15A 2X09A 2WVTA 4MDOA 5DO8A 4CGTA 2WM0A 2DSWA 4Q7NA 1QOXA 2W91A 4B3KA 4U33A 3HJEA 4J3SA 5LA0A 3VIHA 4ML4A 1E4MM 4PN2A 4D6IA 2YL8A 1BYBA 3CBWA 3UR7A 3IAQA 3N12A 3CUJA 2VQUA 1CYGA 5CSYA 5C71A 3WENA 5JH8A 3ZT7A 4LXFA 1GOKA 3S6TA 1FH8A 2BY2A 2WWCA 4W8LA 2V3FA 3CGTA 4MJ2A 1W9DM 2Y5EA 1NOUA 4M29A 4UQBA 2XVNA 2XVLA 4AYSA 3ARPA 2WVVA 1UG6A 1TZ7A 4D6DA 3VDBA 4GPNA 4F9JA 1OGBA 3T0AA 2XIBA 2FHCA 3WFZA 5I5RA 3WDQA 5D9MA 3N1AA 3QOKA 3VILA 3TOPA 1BG4A 1BF2A 5GQBA 3CMGA 4P8UA 3BLPX 1W1TA 5JUVA 2WLZA 1CWYA 4FLSA 1OM0A 1PIFA 3AXIA 3ARUA 4JCLA 4ATLA 1CXFA 2FH8A 3OGRA 3GXDA 4YHGA 3W38A 4MB5A 5DT7A 1LWJA 4NZCA 5CLWA 1ZU8A 2FH6A 3WFLA 5DFAA 2HISA 4J7RA 4EK7A 2Z1SA 3EDFA 1E6ZA 1W3JA 3AIUA 3SUTA 4HOZA 3L4XA 3RIKA 1JZ7A 4W84A 4P8WA 4FK9A 2VVNA 4YHEA 4HU8A 1EO5A 3EDDA 4UQCA 3WQWA 1JAKA 1QI3A 3FAXA 2O9TA 2VZSA 3ZT5A 3AIVA 3VGHA 1E5NA 4RE3A 5A8PA 5BXSA 1H2JA 1LG2A 5EFFA 3DECA 1F4HA 1MVYA 3WNOA 3PZVA 4D6EA 3J7HA 4MAZA 1C93A 1WZKA 4U5KA 2DQXA 5A8MA 1HN1A 2V5CA 2VMFA 3AROA 1BYCA 3TP4A 1V6UA 3W6LA 4DWSC 4J3WA 4H2CA 5D9NA 2CKRA 2Z1KA 3F4VA 1KXVA 5JBEA 2BXYA 3OGSA 5ECUA 4ZE4A 1E56A 1EO7A 3B9DA 1HJXA 1E6XM 4ZFMA 5IFTA 1Q4NX 4AD5A 5A8QA 1B3WA 1ISXA 1Y7VA 1EDQA 3GTNA 3VPLA 1ZBVA 3FHAA 1KQYA 2J77A 1UD2A 4W89A 2CNCA 2W63A 4X0NA 1UR2A 4AZIA 2YL9A 3GH4A 3UESA 4QAWA 4WSKA 1NWUA 4PUDA 3L4UA 4GZEA 1CXKA 3K4AA 6TAAA 1R8LA 3PZTA 2X0HA 3AMKA 3GBEA 4MNJA 1KXTA 2ZUTA 1ECEA 4PMVA 4W8AA 2FGLA 2BV9A 4MNMA 3WF4A 1JZ4A 1R87A 4U3CA 1V3LA 1GHSA 2D20A 1FP8A 4KH2A 4V27A 2A3EA 2QPUA 5I23A 4JFUA 1UR8A 1RD6A 4W7VA 1GCYA 4OJYA 1G9HA 2W4XA 1CLVA 1QNRA 3O6AA 4W87A 3MU7A 1XYZA 1U30A 3BAJA 3VDAA 3UG4A 3VIPA 4DWSA 2WCAA 3VIGA 5CSUA 2DSUA 1NWSA 2E4TA 3FN9A 1FA2A 1P6WA 2OYKA 2VTFA 2PWHA 4ATDA 3L4ZA 4B16A 1XGZA 2D3LA 2PWDA 2EQDA 2Y8VA 1E0XA 4JCMA 4BQ3A 3VD9A 3A4AA 4OIFA 4CU7A 3KEHA 4KRUA 2WHMA 3K46A 2F8QA 3NDZA 1IT0A 2WCSA 3BLKA 3PZNA 1KQZA 2J7CA 3VINA 4TVUA 1KFWA 2D0GA 2BY1A 1D3CA 4Q22A 4LYQA 4D6CA 1E72M 1QW8A 3AQUA 3ZJKA 4BA0A 4V28A 3AS1A 3WKZA 4JKLA 1US2A 1JZ3A 4U5IA 4DM2A 4GIAA 2CETA 1QBBA 3PTQA 4UOQA 2BVDA 1NH6A 4LX4A 4D6JA 1BVZA 1SMAA 3VGFA 1UYQA 3VGDA 1V08A 3EYPA 4MNKA 3DYPA 4JAWA 3PZOA 2VVSA 2ZOXA 4HU0A 3WH8A 5BCAA 5I6SA 1BTCA 3QOMA 2BVTA 4LYRA 1EIBA 1FHDA 1V6XA 5JIPA 2WMKA 3UCQA 5CZKA 1BVNP 3CUFA 3E1F1 3ZR5A 3NJ3A 3K8KA 1NM9A 1ESWA 3N15A 1V6YA 1V3HA 1J0ZA 1R85A 1UH2A 5D9PA 1HKKA 3F5KA 2J7EA 4XB3A 4AIOA 3OG2A 4D6HA 2J75A 5BXTA 4FLOA 1ZJBA 1BSIA 4D6FA 1CBGA 4HA3A 4DWSD 3W81A 1E4NA 3VMNA 1J01A 1J0HA 1J0JA 4W88A 4WK9A 2CBJA 4JKMA 2XWEA 4MPKA 2WC4A 3SCOA 2XHYA 3TA9A 3WNPA 1JYVA 3L4WA 2BY3A 1JDCA 3VVGA 1RPKA 3AZRA 3AZTA 4R5EA 4UQDA 4OBRA 3OB8A 3BC9A 3U5YA 1OIFA 1OBAA 4CD6A 3GNOA 3PZIA 7A3HA 1JYNA 1JFXA 2O9RA 5I0DA 2WKGA 1VRXA 4GINA 4RE2A 3WL0A 2V3GA 4P8VA 1N82A 1I1XA 2QMJA 1K9EA 1E0WA 4M56A 5BRPA 3M6DA 2GJRA 1CGVA 3MUAA 3POHA 4A3HA 1JZ6A 2O9PA 4M1RA 5A6JA 3WUFA 1EGZA 2OWCA 1C3FA 3N17A 2ZUMA 1TA3B 3ZR6A 3T0DA 1XH0A 1GQLA 2WBKA 4PSPA 1QNQA 5DF0A 2VX6A 2G8ZA 4DUXA 3THDA 3ZOAA 1FHLA 2DEPA 4IM4A 3CPUA 4ATWA 1KWKA 2XYLA 3AICA 3F5LA 1Z32X 1QI4A 4AD3A 1L0PA 4AZGA 1NWTA 1RH9A 3NDYA 1BHGA 3SCSA 3TTOA 3ZO9A 3IANA 3VM7A 2WHKA 1JIBA 1H0GA 2YA2A 2ZUVA 3EMCA 2OWWA 5EBAA 2J7DA 2X1IA 4V2XA 5F7UA 4OZOA 3WQ6A 3U57A 4H8UA 4RE4A 1V0KA 3WUEA 1MW1A 3ARZA 2PWGA 1GJWA 4WSJA 3AHYA 5EFDA 1OCQA 2WMIA 2DT3A 4CN6A 2GUYA 1WDRA 3GNPA 1JZ5A 1MFVA 4CVWA 2JEPA 1UH3A 1J18A 2WKLA 3FW6A 1PIGA 1RP8A 2VX5A 3VU2A 3ARXA 1DHKA 4M80A 1CNVA 3CHDA 3DYMA 5A94A 4QCEA 2XFFA 5BXPA 1FH9A 1QHOA 4QFUA 5M3WA 1H11A 4J3UA 4F79A 4AZHA 2WVVB 5EMYA 1BYDA 8A3HA 3MUY1 1QI0A 2YDRA 3AIWA 1HX0A 2EPKX 1E1FA 1CXIA 4F9DA 3VIKA 1JZ2A 4GXPA 1M7XA 3VIMA 2DGAA 3WH5A 2UWFA 1MQQA 1V6WA 1K9TA 3UR8A 4J3VA 2QMKA 2XIIA 1IV8A 3LMYA 5GNXA 1EOKA 2NT1A 4HA4A 5ABFA 4M81A 1HJWA 4GZJA 3WD0A 1UR1A 3VIFA 3GH5A 5A6SA 2J74A 1JI1A 1D2KA 5A6BA 4B15A 4D6GA 3CZEA 2BY0A 1ISZA 3O9NA 1LWHA 3WD4A 2D22A 1VF8A 2J8GA 3WDPP 2YIHA 2DT2A 3DC0A 3CHFA 1FP9A 1PX3A 2YJQA 5A6MA 4KMQA 1JYXA 3AS3A 4TXEA 4UZSA 1C8YA 1W9XA 2NW0A 3L4YA 1ZBCA 1OD0A 1PEZA 3RDKA 4GI6A 2VQTA 5BXRA 3WDIA 1B31A 2VX7A 1HKIA 3B8SA 3CH9A 2TAAA 2YKKA 1H4PA 1H1NA 1E6QM 4Z2IA 2F2HA 1VEMA 5E0CA 4U2YA 3LPOA 5LA1A 1KBBA 3OLGA 3SCWA 1TG7A 3WEZA 1WDPA 1AQHA 1HT6A 5KEZA 2J25A 4UFLA 2ZWYA 3JUGA 5A2AA 3SCVA 2BNJA 2Y8KA 3VIIA 2XSAA 3AZSA 7TAAA 5AC4A 5GPRA 2WC7A 2WYSA 3CLWA 3WEOA 3RPMA 1X6NA 2DT0A 1QNPA 5C70A 1U2YA 4AW7A 1TMQA 1VFFA 1XC6A 3VO0A 2DH2A 2J8FA 3LPFA 5A8NA 5I24A 1TVPA 3ZM8A 2WB5A 1GPFA 2CYGA 8CGTA 4CKQA 4M8UA 1VJSA 2EPNA 3WF1A 3SUSA 1E5JA 2X0YA 1PBGA 1PPIA 1PZ2A 1C90A 3WUBA 5A6BD 3THCA 1XV8A 1BPLB 5GNZA 5IHRA 1I75A 1XH1A 1QHZA 3WH7A 1MFUA 3WMSA 3WH6A 2NT0A 5AYIA 2QV4A 1WKYA 3SCPA 1C8XA 1EH9A 1UWSA 1UKPA 4GI9A 3ARSA 2BVYA 3MANA 1GOIA 2Y4SA 3GXFA 5D9OA 4PTXA 3TTSA 3ZT6A 4UFJA 2ZUWA 1KR1A 1UH4A 2IXVA 4BZYA 6A3HA 3WY1A 1UA7A 4QLLA 3AXXA 5BYWA 4KWUA 3OBAA 2VRQA 3A3HA 4ZE5A 1H09A 1C91A 1CLXA 1QNSA 3T2PA 3W29A 3VMPA 2XVGA 4WF7A 2W66A 3AXHA 1BGGA 1J12A 2GJXA 1CIUA 2ZWZA 2JE8A 4GZIA 2V38A 2EEXA 3CZJA 1HP4A 1K6AA 3HMCA 4W7UA 1UOKA 3WEMA 1BG9A 3RJXA 3VGBA 2CBIA 3HU7A 4MNLA 2XGIA 3EMZA 3W82A 5FIPA 1W1VA 4D1IA 1DWJM 4ACZB 3AS0A 4P7QA 1XD1A 1D7FA 1OT2A 1OGGA 3GM8A 2WSPA 2GDVA 1W1PA 1UKTA 2W67A 3QHMA 1B1YA 2E40A 4JIEA 2DSKA 1BYAA 3AI0A 4HZ6A 4H41A 4DUWA 3ECQA 2D0FA 3WQ5A 2A3AA 1V0NA 2XSBA 4AWEA 2WHLA 1B90A 1GQKA 1ITCA 5ABGA 1UR0A 1V3MA 1G5AA 2W61A 1CENA 5DMYA 2JIEA 1G01A 4J28A 3BAYA 5A1AA 1HF6A 3WF0A 2ESCA 1R7AA 1CXHA 1V0LA 3QHNA 4PTWA 5IHSA 2ZXQA 1H0IA 4OKDA 3RM9A 1M03A 4JHZA 1E6NA 3I3EA 4CUCA 2GK1A 2XVPA 5CGMA 1VAHA 1C92A 1QW9A 3VIJA 5JBFA 4U31A 3VUPA 3W53A 4U2ZA 4RL3A 3PZQA 3CUIA 3W27A 4J3TA 5LYRA 2ZX6A 2CPUA 4DUVA 3AS2A 1E6PA 2UY4A 2XVKA 3NYDA 1NP2A 1E6RA 9CGTA 3T2QA 4AD2A 1BAGA 1E1EA 4IUGA 1QHPA 4GQQA 1MQPA 5D8ZA 2ZICA 2WC3A 3BCDA 2WHJA 2XUCA 4X0VA 1CGUA 4WJXA 2GDUA 1OINA 2O92A 1GHRA 2WXDM 2PB1A 2CERA 2ZX7A 3OZOA 2YDQA 3EDKA 4B3LA 2G3IA 1CXEA 1E70M 3SURA 1M04A 5A95A 3BAKA 4W5ZA 1B3VA 3FY1A 1V02E 1V3JA 3GXMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1KGU A;  1CGX A;  3DHP A;  4CCC A;  4XUY A;  2D1Z A;  5E70 A;  1VFU A;  2XG9 A;  5AY7 A;  3RM8 A;  2WMH A;  4P8X A;  3GYC A;  1GOM A;  2PWE A;  1WZM A;  4J3X A;  3W26 A;  3B9E A;  1MW3 A;  4ACY A;  4K68 A;  3RM4 A;  1WNO A;  2XWD A;  4WIW A;  2WZE A;  4AIE A;  3WNK A;  3NUK A;  1KWG A;  1ISV A;  1KGW A;  2YL6 A;  5CPQ A;  3NCO A;  2E9M A;  1DWH M;  4W8B A;  3W0K A;  2PF0 A;  1Q6C A;  1E43 A;  1XSK A;  2A3C A;  4KRT A;  5A6A A;  3AYS A;  1MXG A;  2F61 A;  1CTN A;  2CHN A;  3L4V A;  1VBR A;  1GQJ A;  1KB3 A;  3ZJ6 A;  5ABF B;  2X8R A;  3WMC A;  3CHC A;  4CU6 A;  2EO7 A;  1J0Y A;  5TD4 A;  3AHT A;  1GOQ A;  5M5D A;  3WDJ A;  4A4A A;  1QI2 A;  3LPG A;  3WN6 A;  4HP5 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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