4WYBA

Structure of the bud6 flank domain in complex with actin
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
367
structure length
357
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein/protein binding
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structure of a Bud6/Actin Complex Reveals a Novel WH2-like Actin Monomer Recruitment Motif.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 96
structure length 357
sequence length 367
chains with identical sequence C, E, G, I, K, M, O, Q, S, U, X
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-11-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 4wybA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4wybA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4wybA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4wybA04
2E1ZA 3ZX2A 2ZGYA 5KPZA 1U2VA 5BN9A 4BVPA 4BG8A 1NGHA 1GLFO 5AFUH 3A5NC 3CQXA 4MO5A 4BR5A 4HWIA 1Z6RA 4BR7A 4JHDA 3UKUB 3CIPA 5AZJA 2Q2RA 3VEVA 5BPNA 2BUPA 3IFRA 1GLAG 3FZFA 3UE5A 1GLDG 3AY9A 1LOTB 2ASPA 3QDKA 4BQZA 4GY2B 2P9PA 3P4IA 2H3GX 2F9TA 4B1YB 2P9SA 1MWKA 1GLJO 1ATSA 3DXMB 3WQTA 4BR2A 3EKUA 3VEOA 3RSEB 3M1FA 3WEEB 3A5MC 3O8MA 4XH4A 4BC2A 4O5FA 1KAYA 3WXIA 4IO8A 1RGIA 4A2BA 2A41A 3ID8A 1HLUA 2HF3A 5AQRA 2HOEA 2QWOA 3TPQA 2PAVA 4B1ZA 5AQMA 4BVOA 2A40A 3QICA 2ZWHA 5KQ8A 2FF3B 1BDGA 4BRQA 1WUAA 5AQKA 4BROA 3EN9A 5LY3A 3G25A 2QWQA 3GBTA 1NMDA 3BF1A 2CGJA 3GG4A 4CZIA 2V52B 3CJAA 2UYTA 3AARA 1QQOA 5AFUA 4BR4A 4FWKA 2Q0RA 3GE1A 1OKJA 2WUSA 4CI6A 1NGFA 1HJOA 4CZGA 5F2RA 4M7XA 2Q1NA 4BRMA 2NRHA 3ATUA 5BRFA 1BU6O 2GWKA 1KAZA 3CJ1A 3MN5A 1U2VB 4C23A 4H03B 2V7YA 3M6GA 3VERA 1KXPA 4EFHA 1Q18A 1NBWA 4BG9A 1E4FT 3QFUA 4JHDB 5AZJB 4KBOA 4MLEA 2Q31A 3WT0A 4CJ7A 4JN4A 1QZ6A 1XC3A 2P9NA 5BPMA 3VF2A 4FSVA 5BR9A 3LDQA 4AM7A 3W3DA 2P9PB 4BGAA 3H46O 5AQZA 4IWVA 2VCPA 2P9LA 1IG8A 5AQGA 2ZGZA 2KHOA 2BTFA 3QBXA 2CGKA 4HTLA 2A6AA 4YDUC 4CZMA 1NGDA 1ESVA 3VESA 5AQUA 1DGKN 1HX1A 2FSNA 1NWKA 4B9QA 4BRAA 1NGJA 4BREA 2A42A 5I9EB 5AZIA 2FF6A 2E2OA 5ADXA 3BUZB 4QS9A 4B1UB 3MN6A 4H0XB 1MWMA 5AQFA 3LDPA 3ZX0A 3WUHA 1MDUB 1BA1A 3JS6A 2YI1A 4PKGA 3CJBA 5LJWA 3VGLA 4B1WB 1SQKA 5AQXA 3CI5A 3LDOA 3VOVA 4J8FA 1V4SA 4A61A 5KPRA 3CJCA 5AQNA 4H0PA 3H3NO 5EXWA 1WOQA 5LJVA 4K43A 3BP8A 2Q36A 5TKYA 2A3ZA 3FGUA 1NGCA 2D0OA 1ZXOA 1C0GA 3EZWA 3BEXA 1Z05A 4FWSA 3B8AX 1NGIA 2FXUA 3J8AA 1NLVA 1HUXA 2P9KB 4CZEA 3L0QA 4CBWA 4NB4A 4DQ8A 3LL3A 4FO0A 4XH1A 5AQYA 1YAGA 3ULEA 2J4RA 2QW9A 3VPZA 3SK3A 1E4GT 4FPBA 2V51B 3S41A 3LM2A 4DCHA 3KVGA 2ASOA 5JICA 1H1VA 1HKBA 3FZMA 4CBXA 3WQUA 1TYQA 2IVPA 4CBUA 5JMVA 3QFPA 4GNIA 3R6MA 2P9LB 1P8ZA 3VEWA 4IJNA 1T6DA 4WQ4A 1KAXA 4FWMA 2E2PA 5JLFA 3MDQA 1GLCG 1X9JA 5AQWA 3BF3A 2GEMA 3C7NA 4LC9B 2GWJA 2CH5A 5AR0A 3MN9A 2W40A 3HM8A 3A5LC 4JD2A 4DB3A 4FWNA 5FPMA 3D2EA 4E1JA 4I6MA 3FZLA 1GLLO 2V7ZA 4FOEA 4BRDA 3HZ6A 2ZF5O 3GOIA 1HKGA 3VETA 2VYPA 1K8KA 3ATVA 3EKSA 1ATNA 3F9MA 1DEJA 3VEXA 3OHRA 1QHAA 1RDWX 3HBTA 4CZLA 1JCFA 2W41A 2YCHA 1ZBSA 2GELA 2NZTA 4FWQA 3U8XA 4BGBA 2OANA 4WQ5A 3FLCO 5AQTA 3UKUA 4FOIA 3L6QA 4IJAA 1T44A 1RFQA 5AQOA 4H5VA 3O4WA 3U9DA 4CD3A 2P9SB 5EOYA 4PL7A 4FWPA 1NM1A 3W0LA 1XQSC 2IIRA 3HTVA 4NO7A 4FWOA 3O6WA 4BQLA 3ULEB 4H5TA 3ZX3A 5AQJA 1CZAN 3ENOA 2PBDA 3VENA 5KQDA 3QB0A 1J6ZA 4QS7A 2I7NA 1DKGD 4PKIA 2D4WA 2E2QA 3UB5A 2P9UA 3WXJA 2HF4A 3CJ7A 3KZBA 5AQQA 4ISEA 1U6ZA 4O8KA 2FSJA 4A2AA 5F0XA 5E84A 3TU5A 1G99A 3SMSA 4BRFA 2Q0UA 3JXUA 2I7PA 3FZHA 5AQLA 1NGBA 1YXQA 5EVZA 3I8BA 4JD2B 4EAHD 5CE3A 3KHYA 1YVNA 3D2EB 4K41A 4I6MB 2GUPA 5FPEA 3H1VX 3O5BA 2QWRA 5FPNA 2EWSA 3DXKA 4FWLA 2VWBA 4IXCA 3GL1A 3UKRA 1JCGA 1K8KB 4PKHA 3VF4A 3VGMA 1BWFO 4K42A 4M63C 3M3ZA 1QQNA 1Y64A 2YJEA 3LDNA 3IDHA 1QQMA 2CGLA 5E26A 4EIAA 1SAZA 1C0FA 3MN7A 3CQYA 5EX5A 2NLXA 4JAXA 1XUPO 3MMVA 4ISGA 3O1WA 3HSCA 4BRIA 2D0PA 4XEIA 3MCPA 2DPNA 1EQYA 2P9NB 4BRNA 3CERA 3A0IX 2P9IA 4BRKA 2Q97A 4H0YB 1NGEA 1NGAA 1BOTO 3FE1A 4CZHA 3O80A 3VGKA 4BR0A 3SLCA 4BRPA 5KPTA 3H1QA 4WQ4C 3H3OB 4H5NA 5B8HA 1S22A 1IJJA 4AM6A 1D4XA 1TUUA 5AQVA 4BC4A 4H0OA 1LCUA 2E20A 3LDLA 4EHTA 4CZJA 4PL8A 4XH5A 3R9PA 3A8YA 2CH6A 1BO5O 3ZEUA 3VEZA 2E8AA 2FLOA 2P9UB 3FR0A 1X3MA 4WYBA 2ASMA 3H6EA 4H5RA 5AZIB 5BRHA 4BRHA 3ZETA 5BPLA 1TUYA 5AQSA 2YHWA 2QM1A 2ITMA 4RCHA 3IUCA 3LM9A 3D2FA 2QWLA 1MA9B 2AP1A 3FFKB 3U4LA 1HKCA 4FWRA 3QMLA 3WXKA 5ADXH 5EY4A 3EL2A 3I33A 3R8EA 2QWNA 2QWPA 4DHYA 3CJ9A 1BG3A 4WQ5C 5AQIA 3DXKB 3DJCA 2YJFA 1SZ2A 3HI0A 5AQPA 3CHWA 3IMXA 2GTDA 3AAPA 3UKRB 3EO3A 2F9WA 2E1YA 4Y0WA 4MLHA 4JNEA 3O08A 4BC5A 1S3XA 1V4TA 3AAQA 2A5XA 5AQHA 3ENHA 2P9KA 2YHXA 4B1XB 4H0VB 4RWTA 4IZ9A 3H45C 1YUWA 2IVNA 4MO4A 3DXMA 4BRCA 3O1BA 5ELZA 4A62A 3RSEA 3VF6A 3WEEA 4BRLA 1BA0A 4B1VA 1R59O 3L4IA 4EHUA 2E2NA 1BUPA 1GLBG 5BREA 2P9IB 3A5OC 2HMPA 1TYQB 4BR9A 1X3NA 4BC3A 2FSKA 1QZ5A 3U9ZA 5BN8A 3SJHA 4H5WA 3DAWA 3CETA 1JCEA 3MK6A 4RTFD 2AA4A 4YDUA 4FL9A 3D7EO 4QS8A 4H0TB 4L3QA 5BRDA 3C7NB 5JLHA 2E88A 5FPDA 2IVOA 4FPAA 4CD1A 3ZEUB 5F1XA 4Z94A 1ATRA 1NGGA 2YHYA 3VEYA 1HPMA 1GLEG 3GDQA 4M7YA 3ZETB 3QBWA 4F9OA 3FZKA 3WXLA 2QWMA 4BRGA 2QXLA 1ZC6A 1T6CA 4K25A 4ISFA 3C0BA 4CZKA 3DWLA 4CZFA 3SMPA 2D1KA 3D2FB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NK5A 2E1ZA 5KPZA 3QIOA 5BN9A 3T7ZA 4JKFA 4BG8A 1ILYA 4KHNA 1VK0A 5HL7L 2O4GA 4JK7A 3M8PA 3CIPA 1TAQA 1Q81O 1YVUA 4R79A 4NCAA 5BPNA 4Y1DA 2BUPA 3LALA 4CFAA 3AY9A 1A5VA 4LY7A 4GY2B 4B8AB 2P9PA 1RBVA 2H3GX 1BI4A 3NE6A 1BGXT 5M1FA 1U49A 1KVCA 3CMAN 4CGDA 5J2MA 1ATSA 3CC2N 3WQTA 4IBNA 4DTUA 4IFEA 4FJGA 3V81A 4H8KA 4JI3K 5HRPA 4Z4GA 3O9QA 4FLYA 3WXIA 1TKTA 3ID8A 5AQRA 3C6AA 4HCCA 4GVMA 1UWBA 4DQRA 1TGOA 3TPQA 3AVCA 1S72N 2P51A 4OPAA 2VG7A 4B1ZA 4LF6K 2EX3A 1TK5A 1OH7A 2A40A 3MXMA 3QICA 5J2NA 1BDGA 4BRQA 1JXBA 5AQKA 2EHGA 3TAGA 4B9LA 3G25A 3QIPA 3PX4A 2GX9A 3E01A 4I7FA 3CJAA 2QI2A 4HHTA 5AFUA 1KQSM 4BR4A 4FWKA 2Q0RA 4YFUA 1K9MO 3R3LA 2WUSA 2G8FA 4LF4K 3SNNA 5F2RA 4M7XA 4F2SA 2VG6A 2XY8A 3P83D 1KAZA 3J81O 2G8HA 2BDPA 4BY9C 4C23A 2V7YA 1TK8A 1IH7A 5K14A 4EFHA 4OPJA 3QFUA 4KBOA 1S1VA 2Q31A 3WT0A 4DQPA 1RT1A 3PX6A 1JLBA 5BPMA 3V9XA 4OJRA 1LAWA 2P9PB 1BI4B 2YNHA 4BGAA 4DV5K 2DTUA 5AQGA 3T1AA 3KK1A 2KHOA 4I2QA 4DQIA 4AH9A 4E7JA 1QHTA 1LWFA 4HTLA 4FLVA 2A6AA 4YDUC 2ZE2A 4DS5A 1ESVA 2FSNA 3ZSWA 1NWKA 4PQUA 1NGJA 3KWIA 2F8SA 4CVNE 2F7TA 5AZIA 3TAMA 3D45A 5ADXA 4B1UB 1M90O 3MN6A 2DY4A 1MWMA 3AVHA 4X66K 3LDPA 3JS6A 4OKJA 4KHQA 5LJWA 5C2DA 2GBZA 3CI5A 3VOVA 3NF6A 5KPRA 5EU7A 3CJCA 3AVGA 1BL3A 4H0PA 4DV6K 5LJVA 4K43A 3BP8A 2Q36A 5TKYA 1NGCA 2D0OA 1C0GA 3EZWA 3BEXA 3B8AX 2FXUA 3DI6A 4AHVA 1RT7A 4KHSA 1RDDA 1OH5A 4RW8A 1C1CA 4XH1A 1N5YA 5CZ2A 3O9UA 3ULEA 4LF8K 3V6DA 3SK3A 1YI2N 1YIJN 3ZT3A 1NK6A 1C6VA 1HKBA 3WQUA 1TYQA 1KRPA 1X9SA 3QFPA 4GNIA 4BWJA 1Q82O 1P8ZA 2FBTA 1NK0A 1T6DA 4WQ4A 3HVTA 2NRTA 4OKKA 4JI6K 5I42A 2DFHA 4B9UA 2E2PA 5JLFA 3BF3A 4LC9B 3C7NA 4XIUA 4JYAK 1W2BM 4DF8A 3DLLL 5H1SQ 3O4NA 3HP9A 4E1JA 1XHXA 3FZLA 4CIFA 4FOEA 3CG7A 1Q9XA 2R7YA 1CXUA 2Z1HA 3WXMB 2IAJA 1WBDA 1ATNA 4JKBA 3C6UA 1X9WA 4CZLA 3TAQA 3P5JA 1B9FA 1S1WA 3PY8A 1RTHA 3BY5A 4WQ5A 4FZYA 5AQTA 3UKUA 2C1GA 4CJRA 3L6QA 4CHPA 4IJAA 3QNNA 1RILA 1I3AA 3KWGA 4DV7K 4CGHA 5HRSA 2OA8A 2IDOA 4M3YA 3LAMA 4CD3A 3EEQA 4OPKA 3HTVA 4NO7A 4B08A 4RG8A 4BECA 1YHQN 3ULEB 4H5TA 1T7PA 4KAZA 3PSIA 2X74A 4CEQA 1HMVA 3QB0A 1KVAA 2I7NA 1DKGD 3UB5A 2E2QA 2KW4A 3WXJA 5FLXO 1L3TA 1C0MA 4DMNA 3IAYA 3CJ7A 3KZBA 1UAXA 4ISEA 2FSJA 4A2AA 3SMSA 4BRFA 5GAHP 2I7PA 4CHYA 1J5OA 3HYFA 3P39A 5AQLA 1CZBA 4EAHD 2GUIA 3ASMA 2QA4N 1OVYA 4JKHA 3T1YK 3SQ1A 1M1KO 3AO1A 1W9HA 5IT9O 4CHNA 4F3TA 1KVBA 4YY3K 1GOBA 2PYLA 3GL1A 4WCEL 3F5TA 3CM6A 1NG9A 1QS4A 4B3OA 4CEBA 4CESA 2UU9K 1KTQA 3CFPA 1QQNA 1VQON 3E1YA 1R0AA 3NVKA 5GIOA 4FLZA 4GW6A 1RCHA 3MN7A 4WFNL 2NLXA 1T8EA 1XUPO 4FJ8A 4ISGA 3HSCA 2Z1GA 1WBBA 3C6HA 1L3UA 4XEIA 2DPNA 1EQYA 4M3RA 5FDLA 1IKVA 1J9AA 4AF1A 3OYLA 4BRKA 4B9NA 4FJ5A 4CGFA 2FBYA 2QKKA 3PUFA 4GMJB 3VGKA 4BR0A 2E5LK 3SLCA 4E0DA 3KK3A 4FM2A 4AQYK 4CERA 2YHAA 3H3OB 4H5NA 2VG5A 1VQ9N 1S22A 1U45A 1W0HA 1KSPA 4AM6A 5JENA 1D4XA 3A8YA 4OGCA 4HUFA 2CH6A 1BO5O 3QEWA 3VEZA 3FR0A 3AO5A 1BIUA 3MEDA 4CJFA 4CF9A 3OS1A 1RBTA 3ZETA 4CF0A 1TUYA 4NLCA 1U47A 4RCHA 3TAPA 1IO2A 2QWLA 3SJJA 1MA9B 1LWEA 4BE7B 1ITGA 2OTJN 1NKCA 1W7AA 3EL2A 3R8EA 5KRTA 5HRNA 3V9WA 1UA0A 4DV3K 3KTQA 1A5XA 4Z4EA 2QEXN 3HI0A 3LP0A 3IMXA 3AAPA 3G71N 2BGGA 3O08A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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