4X0VA

Structure of a gh5 family lichenase from caldicellulosiruptor sp. f32
Total Genus 151
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
151
sequence length
375
structure length
375
Chain Sequence
RAKIPEIKIASRKIPNNAALKFVKDMKIGWNLGNTFDAAFENPSFDDELLYETAWCGVKTTKQMIDTVKKAGFNTIRIPVSWHNHVTGSNFTISKRWLDRVQQVVDYAMKNKMYVIINIHHDIMPGYYYPNSQHLQTSIKYVKSIWTQVATRFKNYNDHLIFEAVNEPRLTGSRFEWWLDMNNPECRDAVEAINKLNQVFVDTVRSTGGNNVSRYLMVPGYAAAPEYVLIDEFKIPKDSSKYKNRIIISVHAYRPYNFALQAPNESGSVSEWSVNSEESRRDIDYFMDKLYDKFVSKGIPVVIGEFGARDKNGNLQSRVEFAAYYVRAARARGITCCWWDNNAFYGNGENFGLLDRKTLKWVYPEIVSAMMKYAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-1,3-1,4-glucanase
publication title Structural Insights into the Substrate Specificity of a Glycoside Hydrolase Family 5 Lichenase from Caldicellulosiruptor sp. F32
pubmed doi rcsb
source organism Caldicellulosiruptor sp. f32
total genus 151
structure length 375
sequence length 375
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 3.2.1.-:
pdb deposition date 2014-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4x0vA00
3WFLA 4MB1A 4M80A 3GH5A 2WCAA 4MNLA 3VMOA 1W91A 3FN9A 1IT0A 1QNQA 1E3XA 4YPJA 4DWSB 3ECQA 3IJ9A 2CESA 1JG9A 4KMQA 1V6XA 4FMVA 2G3JA 3SCTA 1XV8A 2EPNA 2WMHA 3CUHA 1CECA 4BZYA 2TAAA 1V0KA 1KWGA 1LG1A 3BAKA 3CZJA 1KBKA 5LYRA 1LLOA 2WNWA 1WDQA 3VMPA 4GINA 4AD0A 3D5HA 5A6SA 1KXQA 1WDRA 1OGSA 3QR3A 3KWXA 5AYBA 2OWCA 1PJ9A 4XZWA 4V2XA 3AI0A 4NRSA 2OYMA 1E6SM 3A3HA 1DWIM 2ZX8A 1J01A 2XM1A 3B9AA 1NWTA 4Z2JA 3RO8A 1VFFA 5IHRA 2WYSA 1KXTA 1G1YA 4UFHA 1V0NA 1JDDA 3AMLA 1M7XA 2PBGA 3BAJA 1EDTA 5TD4A 4JKKA 1V3JA 1ZJBA 1TE1A 8A3HA 4E4PA 4NSBA 5A1AA 4HOZA 1JYVA 4ZFMA 1A47A 4AZCB 1UR8A 2F61A 3TTYA 3KE0A 4EANA 3NJ3A 1EOMA 1Q6EA 1WE5A 1CXFA 2FH8A 4AXNA 1US3A 2WHLA 1UH3A 2VURA 1NH6A 3FHQA 3SCRA 2W5FA 4AZIA 1H09A 5GNZA 1EXPA 1TZ7A 3FW6A 4Z2GA 3UG3A 4Z2IA 1CGYA 1UZ4A 4CVUA 3MUY1 2ZUUA 1NQ6A 4FLSA 1CGVA 3CZKA 4JZ5A 5AC4A 1L0PA 3NCOA 1H49A 2G3NA 4UFLA 4PUDA 3NYDA 1JIBA 1KR1A 5HXMA 1IV8A 2WB5A 3TTQA 2GJRA 2DQXA 4E2OA 2VOTA 4LQ1A 2BFGA 2V3FA 3WDRA 4GQRA 1NWRA 1B3WA 3VKKA 2D24A 4HTYA 1AMYA 3CO4A 4UZUA 3A4XA 4M24A 5M5DA 1QPKA 4CCEA 5A8MA 5I23A 4CU6A 1AQMA 3VILA 1EQCA 1KGUA 2DPEA 4A3HA 4L4PA 4KGLA 1OIMA 4GQQA 4AZ5A 2DT0A 5M3WA 4MB4A 3MS8A 3WNKA 4D72A 4OOZA 5KZ6A 1XCWA 2YIHA 1O6IA 3CUIA 1W9XA 3GZAA 2W61A 3AIWA 1WDPA 1J18A 1PX3A 3N1AA 3T0DA 5ABFA 4WKAA 3AJ7A 4F9DA 3AZSA 1CGUA 4RE3A 2GDVA 1FH7A 4FLOA 4PMQA 3NUKA 4BA0A 4AY1A 5A6JA 1TMQA 4GZIA 3SCWA 1OIFA 2W62A 4W5UA 3T0BA 4DM2A 3VIIA 2PF0A 1C93A 2BY1A 3BAYA 4D6EA 1Q6FA 2JEPA 1CGWA 1V0MA 3APGA 1JZ4A 4M29A 2OWWA 3CHDA 4PMXA 5BXRA 3ZT6A 3WH9A 1EH9A 3PZ9A 3OBAA 4PMNA 4NF7A 2IUZA 3S2CA 1BF2A 1OWQA 1W9BM 4QLJA 3AISA 2WMGA 1PX8A 1Q6DA 2WMJA 2ZUWA 3II1A 1OCQA 3UCQA 1V03A 1EDQA 1M04A 2G4FA 5FL0A 2WPGA 3PN8A 2V38A 3WKZA 3GNPA 1J9YA 2W63A 3EDKA 5IXEA 2WVVB 3WDPP 3OIHA 4Z2LA 1H1NA 1CBGA 1DP0A 4D1JA 2FHFA 2CBUA 4UFJA 1SYTA 5HOSA 3CMGA 2UY2A 3VIGA 2D3LA 1FHDA 1KGWA 3ARXA 2NW0A 4Z2HA 3WBAA 5I0DA 3I3BA 1G9HA 4J3SA 1ZB5A 2E4TA 3VM7A 3MKKA 3CZGA 4AEEA 4CVWA 1V3LA 1V6UA 1XSKA 2E8ZA 2CCRA 5IDIA 1C8YA 3NSNA 1LL6A 4B16A 3CUFA 3OZOA 2X1IA 2E40A 3WDIA 2JIWA 6TAAA 3PHAA 1KFWA 1CGXA 1MQRA 1FFQA 2WK2A 2O9OA 4P7RA 3GNRA 2XG9A 4PRWA 5M03A 1W9VA 4IM4A 4QDMA 4W84A 2QHAA 4AYSA 4DUWA 2BV9A 2PC8A 3KZSA 2JALA 1XC6A 1E1FA 3VIMA 2UY5A 1ISXA 3MMUA 3L2MA 1GUVA 1E55A 3VGBA 3OLEA 1BPLB 2YBUA 2IXVA 4J3TA 1U30A 2VL4A 4JHZA 1GQIA 2ZOXA 3POHA 4ACZB 1DHKA 4BCEA 1LF1A 1E4LA 2VZOA 2AAAA 2XSAA 2WZEA 1TFVA 4JFVA 3CGTA 2V5CA 4B15A 3UR8A 4D6CA 3SUTA 2VVSA 4HOWA 1HJQA 2BXYA 5CGTA 3SCNA 1K9DA 4N0RA 2WZIA 2CHOA 3OGVA 3W82A 2WMIA 1FHLA 4PCTA 1GOOA 1QOXA 3ARRA 1KXVA 2X8RA 1R8LA 1FFRA 2ZUVA 2XTKA 3CH9A 4PSRA 3ZO9A 1UA3A 2DEPA 2VNCA 3ZJKA 4EE9A 4M56A 4DUXA 2Z1KA 3WSUA 3L4YA 3O9NA 3VX0A 1CXIA 2E9MA 3HU7A 4XV0A 2VRQA 1TG7A 1OD8A 1SMDA 1JFHA 4EKJA 1K9FA 3W37A 5A6KA 4ZEPA 1W3HA 4GO8A 3T09A 4JCMA 3PZNA 1BYCA 1GVIA 1UZ1A 2XVLA 4X9YA 1J12A 1M03A 4D6JA 3WL0A 1BGAA 4XX6A 4R27A 1ITCA 1UD3A 2G41A 3CUGA 3F5JA 4UQBA 1C8XA 1E15A 1XYFA 3VD5A 1KGXA 1WO2A 2WAGA 5IFTA 3MUZ1 2BY0A 4BQ5A 2XWDA 1MYRA 4ATDA 2BVYA 3WUBA 4RE4A 2VCBA 2J4GA 4EAMA 1E5NA 3WDJA 3ARYA 3BSGA 1SFSA 4GI6A 5A95A 4GI8A 1BG9A 3OLDA 1B31A 4HU8A 3E1F1 3QOKA 3SUWA 2VQTA 3EBVA 4DWSA 3CZEA 1HX0A 3ZT5A 1HP4A 3FHAA 1DWHM 4W8LA 3ARQA 2J7BA 3WFZA 3WF1A 4ZE5A 1ZBWA 3CZLA 3CHFA 3GH7A 2W66A 2WM0A 3TONA 1VENA 2E3ZA 3AIVA 1R87A 4NI3A 2GSJA 5JUVA 3VD7A 2PBOA 3ZJ7A 5BXSA 5CSUA 3WD2A 5I3DA 1CXHA 4W7WA 4D71A 1XH0A 2J7DA 3MU7A 2VR5A 1JYXA 3RM9A 5CPQA 3WMBA 1H2JA 2V3EA 2QF8A 3IK2A 2XYLA 4HMEA 1FP9A 1I75A 4U31A 3MV11 4TXEA 4PMYA 3VINA 4XZBA 1BGGA 1MFUA 1B3VA 3WBEA 1VBUA 1KR0A 4WSKA 1QW9A 1HJXA 3WD4A 3FAWA 2O9PA 2BS9A 3BCDA 5JBEA 2J25A 4U3AA 4AZCA 4J3WA 1PEZA 2EXOA 2Q8XA 3LPOA 3WN6A 5A94A 5D8WA 3M07A 1G0CA 3VIHA 3AMGA 1W2VA 3UR7A 1KB3A 3EMQA 1JNDA 4AIEA 3CHEA 3M6DA 2ZUNA 4A3YA 3B8SA 1JXKA 3W4RA 1WZAA 3WQ8A 4LYRA 2VI0A 1VRXA 4MNKA 2CERA 3VIJA 2BVDA 4PN2A 2JF7A 3EDEA 3MANA 1BTCA 4QAWA 2YDSA 4CU7A 1MXDA 2CPUA 1CDGA 5HDRA 2ZXQA 4UOZA 4C7FA 1WNOA 3AXHA 1UH2A 1NM9A 2DH3A 2EBNA 5M17A 1BYDA 4S3JA 4IPNB 1B2YA 1WZLA 5DF0A 4WJXA 1UWTA 4AEFA 2F2HA 3DC0A 1BYBA 2VQUA 3G6MA 4W93A 6CGTA 4TVDA 3G6LA 1UH4A 2VVNA 4QP0A 1UD8A 6A3HA 2AOSA 2ZIDA 4D6FA 1UD2A 2XVPA 4B3KA 4JFTA 3IJ7A 2ZXBA 3U5UA 2PWHA 1CWYA 2WXDM 1JDAA 2FH6A 1WAWA 3W6LA 3DECA 3GYCA 1VEPA 2YBTA 1AVAA 1E6NA 2UWFA 2A3BA 2D22A 4F79A 1GPFA 2AMGA 3WIJA 1JF6A 2VO5A 5I78A 1EQPA 1BAGA 4MDOA 2YJQA 3BLKA 3WEMA 5A8OA 1XYZA 1MW2A 1OD0A 1CXLA 3WH6A 1KXHA 1UYQA 2X0HA 2F8QA 2DT3A 2ZX6A 4PCSA 4MNJA 2XVNA 1QBAA 2JFEX 1B90A 4WKFA 2YL8A 1XH2A 1OT1A 1UKQA 1B9ZA 3OG2A 1KCKA 1TA3B 4N42A 4UQCA 5HPCA 3N04A 1Z32X 3U5YA 4EK7A 1VB9A 4TTGA 3U7BA 3BXWA 2WVVA 2FHCA 1JZ6A 9CGTA 4AWEA 4NZCA 1TCMA 4CD7A 2RGLA 3MSGA 1B30A 1E6PA 5HBFA 1M01A 4H04A 1J0HA 1E0WA 2ZX7A 5A6BD 4LXFA 4R5EA 5E6YA 1QW8A 4WKHA 1BVNP 1YHTA 1E9LA 5FKYA 4X0VA 2Y4SA 5D9NA 5ABGA 4MNMA 1CYGA 2Y8VA 3BC9A 3BH4A 3TTOA 4XUYA 5A8QA 2X05A 1GJUA 3IAPA 1V6YA 3AMKA 1NOFA 2DH2A 3BSHA 5I24A 5CXPA 4P8WA 3MUIA 1JL8A 4GZEA 2J7GA 3PZUA 4HA1A 4Q7NA 1JAKA 2J79A 2D20A 3ALGA 4CUCA 2GDUA 4AD1A 1QBBA 3ZT7A 1DEDA 1J0IA 5CZKA 1F4AA 2YA1A 1EO5A 3A6OA 2EPOA 5ABHA 1UWQA 1RPKA 2E8YA 1TUXA 2ZE0A 1BSIA 1N82A 1R85A 3VNYA 4H8HA 4UNIA 4ACZA 3WQVA 1XSIA 2CBIA 5CJ5A 3W27A 3SCQA 3S6TA 3BGAA 4U33A 4AMCA 1PAMA 1CZ1A 2FGLA 2DT2A 1VFUA 2IXUA 2G3IA 2X2YA 4J7RA 2GK1A 1ISYA 2MANA 4BQ4A 2GJPA 1JZ7A 1IZKA 2CXGA 1CPUA 3OB8A 3FNDA 2XM2A 2YOCA 1NP0A 2VJXA 2ZX9A 4MJ2A 3W6MA 4JAWA 4MAZA 3WL1A 3WH7A 4D6DA 1W3LA 3MMDA 4K68A 2DSUA 4F8XA 2EJ1A 3WQ4A 3O6AA 3VIOA 4JFWA 4F66A 3M46A 3KEHA 1UG6A 3LPPA 2XFFA 2VZVA 3EMZA 3TOPA 4OJYA 3FY1A 1JI1A 1HF6A 3WNNA 2J62A 1R7OA 3VMNA 2CYGA 4QFUA 7A3HA 5D9MA 1TR1A 2D0HA 3U57A 1X6LA 1ESWA 1C92A 3THCA 2CBVA 3LPFA 2WSPA 1BVZA 3VDCA 3SEPA 3AIUA 4H7VA 4H8VA 3U7VA 4PTMA 2YDRA 5DT5A 2JF6A 1C7TA 3UESA 3VGEA 3AHXA 1CXEA 1ZL1A 3AQUA 4U5KA 1GQJA 2Y5EA 4JL2A 3FXYA 1KBBA 2CKRA 3VIFA 1E43A 4B9ZA 3WD3A 4J3XA 4X0NA 2ZUTA 2WC7A 4AC1X 5I79A 3BAWA 2CHNA 2C8NA 4LPCA 3UG4A 4UQAA 1E3ZA 4IUGA 1CGTA 3WNMA 2BY3A 2XJ7A 5BWFA 3AXXA 4YHEA 2CIPA 4UQDA 3NIYA 4JCLA 5EMYA 3N15A 1AQ0A 1HKKA 3CUJA 1G94A 1J0JA 1JFXA 1UD6A 4ACYA 1FP8A 1KQZA 1U2YA 3UETA 3AIQA 1E70M 2Z1SA 2X0YA 4LYPA 4KWUA 4UFMA 4UZSA 1GQKA 2CNCA 2VR4A 2D0GA 2FDMA 2B31A 1TVPA 1DWJM 1GVYA 3B9DA 3AHZA 4AZHA 1JI2A 2WZHA 3SUVA 2QMJA 4OBRA 4WIWA 3WUGA 2NT1A 5LA0A 1UWIA 3VU2A 3W53A 3L4WA 1EIBA 5DFAA 8CGTA 4J3UA 3GTNA 4BF7A 2NSXA 4OOUA 2XFYA 4P7NA 3AS0A 3W25A 1QI4A 2A3AA 3NDYA 2V3GA 2FGZA 2XIIA 3MMWA 3WUEA 3W28A 3NSMA 2VTFA 1HJUA 3OA5A 1UWSA 1QNRA 1JGIA 3EMCA 3AHTA 2DIEA 3O2LA 1W2PA 2ESCA 2QPUA 4PTVA 2VX6A 1W1VA 1JZ8A 1VEMA 1HL9A 5BRPA 1ISWA 1GJWA 3GH4A 5DT7A 5JBDA 1B3YA 4L4OA 4MDPA 4HZ6A 1H4PA 1R86A 2J74A 1C3FA 5BYWA 3QOMA 1XSJA 4PEEA 4W8BA 1DWFM 4CN1A 1LJYA 4UCFA 1MQPA 3UEQA 3FAXA 4BS0A 4AIOA 1HVXA 3VTRA 4AIUA 2JEQA 3N9KA 4J27A 3OLGA 3RJYA 1QHOA 3WH5A 1GOIA 3AIBA 2ZUMA 2DSKA 2O9RA 2XHYA 3ZIZA 4NRRA 1V3HA 3MUAA 4TVCA 1JYNA 1WB0A 1C8QA 5HPOA 3ZSTA 3AZRA 4OIFA 5CGMA 4UOJA 3AOFA 3AS1A 2WHKA 1SR0A 3GNOA 1HXJA 2CETA 1UUQA 1AQHA 2WLZA 3VGFA 4WSJA 2UY3A 1W9DM 1QI2A 4WK9A 4W89A 3L4XA 4MB3A 4CD4A 3VGGA 2WBKA 1JZ2A 2Y2WA 2ZXAA 3K4AA 1HKMA 4U5IA 4W86A 4W87A 5A2CA 1UKSA 4HPGA 3W24A 4UTFA 3SUSA 3CBWA 3AYSA 3AXIA 3VNZA 3L4ZA 1ZBCA 3GBDA 3I3EA 2PB1A 4HMDA 4CD5A 2ZUSA 3DHPA 2GUYA 2C7FA 2W91A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3WFL A;  4MB1 A;  4M80 A;  3GH5 A;  2WCA A;  4MNL A;  3VMO A;  1W91 A;  3FN9 A;  1IT0 A;  1QNQ A;  1E3X A;  4YPJ A;  4DWS B;  3ECQ A;  3IJ9 A;  2CES A;  1JG9 A;  4KMQ A;  1V6X A;  4FMV A;  2G3J A;  3SCT A;  1XV8 A;  2EPN A;  2WMH A;  3CUH A;  1CEC A;  4BZY A;  2TAA A;  1V0K A;  1KWG A;  1LG1 A;  3BAK A;  3CZJ A;  1KBK A;  5LYR A;  1LLO A;  2WNW A;  1WDQ A;  3VMP A;  4GIN A;  4AD0 A;  3D5H A;  5A6S A;  1KXQ A;  1WDR A;  1OGS A;  3QR3 A;  3KWX A;  5AYB A;  2OWC A;  1PJ9 A;  4XZW A;  4V2X A;  3AI0 A;  4NRS A;  2OYM A;  1E6S M;  3A3H A;  1DWI M;  2ZX8 A;  1J01 A;  2XM1 A;  3B9A A;  1NWT A;  4Z2J A;  3RO8 A;  1VFF A;  5IHR A;  2WYS A;  1KXT A;  1G1Y A;  4UFH A;  1V0N A;  1JDD A;  3AML A;  1M7X A;  2PBG A;  3BAJ A;  1EDT A;  5TD4 A;  4JKK A;  1V3J A;  1ZJB A;  1TE1 A;  8A3H A;  4E4P A;  4NSB A;  5A1A A;  4HOZ A;  1JYV A;  4ZFM A;  1A47 A;  4AZC B;  1UR8 A;  2F61 A;  3TTY A;  3KE0 A;  4EAN A;  3NJ3 A;  1EOM A;  1Q6E A;  1WE5 A;  1CXF A;  2FH8 A;  4AXN A;  1US3 A;  2WHL A;  1UH3 A;  2VUR A;  1NH6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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