The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
59
|
structure length |
59
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Chain Sequence |
KRQCKVLFEYIPQNEDELELKVGDIIDINEEVEEGWWSGTLNNKLGLFPSNFVKELEVT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
CD2-associated protein
|
| publication title |
Crystal structure of the 2nd SH3 domain from human CD2AP (CMS) in complex with a proline-rich peptide (aa 76-91) from human ARAP1
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
10
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
59
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-11-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1HJD A; 2RMO A; 1QCF A; 5FW9 A; 1KJW A; 5L23 A; 3VS4 A; 1M8M A; 2J06 A; 4GBQ A; 4CC3 A; 2DL7 A; 2RQR A; 1X6G A; 1BB9 A; 2JS0 A; 1VYU A; 4DEX A; 2KXC A; 3VS6 A; 2A37 A; 1ZUY A; 2EGA A; 2E5K A; 2JM8 A; 2J6K A; 4AFU C; 1JXM A; 1RLQ C; 3R6N A; 2PTK A; 1LCK A; 1T0J A; 2MCN A; 1ZSG A; 2HCK A; 2KT8 A; 1V1C A; 3H0I A; 3EGU A; 1K0X A; 2CRE A; 2KYM A; 1UJY A; 2OAW A; 1UHC A; 4J9D A; 2RF0 A; 3LH5 A; 3C0C A; 1AWO A; 5IHK A; 1ZUK A; 2FPE A; 1UGV A; 3RNJ A; 1NLO C; 3QWX X; 1RI9 A; 3VRY A; 1NEG A; 4JZ3 A; 2ECZ A; 4FSS A; 2RPN A; 2K79 A; 1YWP A; 3EG1 A; 2DL4 A; 2DVJ A; 2C0T A; 2FPD A; 2YUO A; 1RLP C; 4WCI A; 2EKH A; 2QDL A; 1WI7 A; 3TVT A; 2DRM A; 2DJQ A; 2DRK A; 1E7O A; 1NEB A; 2MIO A; 2RQV A; 2CH4 A; 2NWM A; 1H8K A; 3NPF A; 2DMO A; 2KT1 A; 1W70 A; 4AG2 C; 2EW3 A; 3I9Q A; 1BK2 A; 3EHR A; 3M0U A; 2JT4 A; 3H41 A; 1QKX A; 4F16 A; 3UAT A; 4RTT A; 2M0Y A; 2LMJ A; 1U5S A; 1I07 A; 1AWJ A; 1K1Z A; 1PKS A; 2AK5 A; 2KXD A; 5IH2 A; 1YN8 A; 4HVV A; 2VKN A; 2LQN A; 2L2P A; 3UA6 A; 4RTY A; 4AFZ C; 5HCK A; 3ZL7 C; 4RTU A; 2SRC A; 2GBQ A; 3THK A; 4HVW A; 1M27 C; 4LE9 A; 2AKL A; 2M51 A; 4RUG A; 4LUD A; 4Z89 A; 2GNC A; 2DIL A; 2VWF A; 1SSH A; 1X69 A; 4RTX A; 5EC7 A; 1SRM A; 2CDT A; 3M0S A; 3RBB B; 3ULR B; 1FMK A; 3VS0 A; 1GBQ A; 2A28 A; 2HEQ A; 3SHW A; 1E6H A; 2J7I A; 1Z9Q A; 2BZY A; 2C0O A; 1NYG A; 2NUZ A; 4ORZ A; 3VS2 A; 1N5Z A; 4OML A; 1T0H A; 4CC2 A; 2W0Z A; 1OV3 A; 1U06 A; 1Y57 A; 4J9C A; 2FEI A; 4ZNX A; 1UG1 A; 1Z9Z A; 3KFV A; 2GTO A; 1FYN A; 2FG0 A; 1AZE A; 1GCP A; 1PRL C; 2CUD A; 2DA9 A; 2FO0 A; 4DEY A; 1T3S A; 1ABQ A; 1WXU A; 2LJ1 A; 1GL5 A; 2I0N A; 2K3B A; 2LZ6 B; 1U3O A; 1OPL A; 1SEM A; 2X3W D; 2AZS A; 1MV3 A; 5FWB A; 2ROT A; 3EG2 A; 1M3A A; 1PKT A; 4OMN A; 2DE0 X; 1X43 A; 1KSW A; 2KBT A; 1X27 A; 1K9A A; 3I5S A; 2RQU A; 1ARK A; 4F17 A; 4HVU A; 5ECA A; 1UTI A; 1BBZ A; 3UA7 A; 1UE9 A; 3TSZ A; 2L3P A; 4GLM A; 1KFZ A; 2LQW A; 3QWY A; 4EIK A; 2V1R A; 1UUE A; 4E6R A; 3H0H A; 3VS1 A; 1CSK A; 4QT7 A; 4Z88 A; 2EQI A; 2DX1 A; 1CKB A; 4KRT A; 2DL3 A; 4LNP A; 3CQT A; 2GQI A; 5IXF A; 2F2W A; 5FWC A; 2P4R A; 2EBP A; 1I1J A; 4R0K A; 2RN8 A; 2ED0 A; 2DL8 A; 1W1F A; 3NGP A; 3M0P A; 1PHT A; 2YSQ A; 2JMA A; 1G2B A; 3M0T A; 1WYX A; 2AZV A; 2YUP A; 3VS7 A; 1UDL A; 2DF6 A; 2K9G A; 4J9I A; 3UF4 A; 2HBW A; 1GCQ C; 1OOT A; 4OMM A; 1I0C A; 2H8H A; 2IIM A; 1JQQ A; 2G6F X; 2EYW A; 1ZUU A; 2LCS A; 2CSI A; 2D0N A; 1M30 A; 3EHQ A; 3VRZ A; 2KE9 A; 1J3T A; 2ED1 A; 2JM9 A; 2K7A A; 1UFF A; 1A0N B; 4JPB W; 2PZ1 A; 4JJC A; 4JZ4 A; 3TSW A; 2D8H A; 2RQT A; 1NM7 A; 4X1V A; 2J6F A; 5IXB A; 2VVK A; 2F2V A; 4D8D A; 1VA7 A; 3EG3 A; 1QWF A; 2SEM A; 1WXB A; 2EYZ A; 3GBQ A; 4RTZ A; 1GRI A; 1YCS B; 4A63 B; 2RNA A; 1PRM C; 1BU1 A; 2ESW A; 2AKK A; 1AWX A; 2D8J A; 1ZX6 A; 2LNH B; 2OJ2 A; 3VS3 A; 2YDL A; 2BTT A; 2EVR A; 1RUW A; 2MOX A; 1NLP C; 2KRM A; 1JO8 A; 2F2X A; 1HD3 A; 2O88 A; 4AFS C; 2L3S A; 2EYX A; 4J9E A; 1AEY A; 1AVZ C; 4M4Z A; 1WA7 A; 2DLP A; 2BZX A; 2EPD A; 3IQL A; 2GGR A; 2ENM A; 3I35 A; 4CC4 B; 5IHI A; 4IIM A; 2K6D A; 2KYB A; 2K2M A; 4ESR A; 1HSQ A; 3SEM A; 1AZG B; 1G83 A; 1ZLM A; 4OMP A; 1XOV A; 3I5R A; 3PVL A; 4F14 A; 1NYF A; 2LJ3 A; 2FRY A; 1QKW A; 1WDX A; 1NG2 A; 2ROL A; 4Z8A A; 4OMO A; 2ABL A; 2OI3 A; 1W6X A; 1AD5 A; 5GJW B; 2V1Q A; 1H3H A; 1GBR A; 4RTW A; 2YT6 A; 1WX6 A; 4OMQ A; 1ZBJ A; 4JJD A; 2B86 A; 4CC7 A; 4J9H A; 5I11 A; 1OEB A; 4AG1 C; 3M0R A; 1VYV A; 1YP5 A; 2EGC A; 3NHN A; 2J05 A; 4Y92 A; 4AFQ C; 4LUE A; 3NMZ C; 1QWE A; 1JEG A; 3FJ5 A; 3PE0 A; 5GJV B; 2HSP A; 2PNI A; 2X3X D; 1MUZ A; 2CH4 W; 2FRW A; 3H0F A; 2L0A A; 1S1N A; 1YNZ A; 1X6B A; 2HDA A; 4HXJ A; 3JV3 A; 1WIE A; 2A36 A; 2JXB A; 2KRS A; 2EYY A; 1X2K A; 1GFD A; 4IIO A; 1JXO A; 1YWO A; 1PNJ A; 3O5Z A; 2DNU A; 1M3B A; 1QLY A; 2CUB A; 1VYT A; 1CKA A; 4LN2 A; 2RQW A; 2BZ8 A; 2DM1 A; 2YUN A; 2O9V A; 1K4U S; 1WLP B; 4J9B A; 1E6G A; 1AWW A; 1B07 A; 2DL5 A; 4HCK A; 1ABO A; 2KEA A; 2J6O A; 1T3L A; 3U23 A; 1MV0 B; 1GFC A; 1K76 A; 2DYB A; 1JU5 C; 3PVQ A; 2YUQ A; 2LP5 A; 1WXT A; 1OPK A; 2JTE A; 2KNB B; 4K11 A; 3A98 A; 1UEC A; 2C0I A; 2O31 A; 1TUD A; 2KRN A; 1IO6 A; 2KGT A; 2L3Q A; 4D8K A; 1UJ0 A; 2O2O A; 2CSQ A; 4J9F A; 1EFN A; 3M0Q A; 1SHF A; 1TUC A; 2FPF A; 1KIK A; 1GCQ A; 1SHG A; 1M3C A; 1PWT A; 2LX7 A; 2LJ0 A; 4J9G A; 2JS2 A; 2DBM A; 1X2Q A; 2EGE A; 2KRO A; 1B3Q A; 2W10 A; 2CT4 A; 2GTJ A; 3REB B; 3VS5 A; 2A08 A; 5IHN A; 2JW4 A; 2O9S A; 1WFW A; 2CT3 A; 2D1X A; 1TG0 A; 5I22 A; 2KR3 A; 1SPK A; 4RTV A; 2XMF A; 1SRL A; 3EG0 A; 3REA B; 1AOJ A; 1UHF A; 4JJB A; 1H92 A; 1Y0M A; 2JMC A; 1K0S A; 2DBK A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4R55 A; 4Y91 A; 3CC7 T; 2QGF B; 5AYF A; 3L42 A; 3OYL A; 2RJC A; 4IUP A; 2LCL A; 1M8M A; 4GBQ A; 2E12 A; 3CCM A; 2RQR A; 3EGX A; 3MP6 A; 1YJW Q; 2DXT A; 3NTI A; 4KGV B; 1MMG A; 4JDS A; 3JCM V; 2EKO A; 4C92 C; 4ME7 A; 4F7U G; 3EG9 A; 1RLQ C; 3R6N A; 4PJL A; 4X34 A; 4E2F B; 3C4S A; 1I81 A; 2Y90 A; 2XD0 A; 4E7L A; 4OB0 B; 2KT8 A; 3V7R A; 1RI0 A; 4XK8 E; 3PNW C; 3EGU A; 1UJY A; 2YRC A; 2P84 A; 4J9D A; 2RF0 A; 3X24 B; 2E65 A; 4DOW A; 1XQH A; 3G71 T; 2CP2 A; 1IHV A; 3QWX X; 3VRY A; 4B6M A; 5D7U A; 1NEG A; 3I56 T; 4JZ3 A; 2DIG A; 2EAY A; 3G4S Q; 5I2S A; 2YRV A; 2CP6 A; 2KVQ G; 3CCL T; 4FSS A; 2COZ A; 4A4F A; 4KGZ B; 4IUU A; 4X9D A; 1M2O A; 4WCI A; 3V7S A; 2MMP A; 3TVT A; 2VXE A; 2DJQ A; 4A4H A; 4EMK C; 1D1C A; 3WVD B; 1NEB A; 2MIO A; 1D0Y A; 2RQV A; 1UB4 A; 1H8K A; 4M75 A; 2RJE A; 3C12 A; 4OB2 B; 2DMO A; 4KUI A; 4N4I A; 2KT1 A; 3CXC A; 1W70 A; 4AG2 C; 2FZG B; 5LJ3 g; 5A0G A; 1SF9 A; 3M0U A; 1Q81 R; 4F16 A; 2LC4 A; 4JRP A; 1K8A C; 2F5T X; 5KYX A; 2DTH A; 2M16 A; 2MYS A; 1I07 A; 5IH2 A; 1PKS A; 3QDR B; 2O01 E; 4HVV A; 4RTY A; 2SRC A; 3THK A; 1VQ9 T; 3FLG A; 2M51 A; 1Q7Y U; 2LT4 A; 4AMC A; 5GAN 8; 1WHH A; 5HKC A; 1M1K C; 8AT1 B; 3QBY A; 5GAN 4; 5KYU A; 3JCM J; 4RTX A; 2E6Z A; 5I21 A; 3VU3 C; 4RKU E; 3M0S A; 3ULR B; 1FMK A; 1MGQ A; 1WZO A; 1TS9 A; 4PJO E; 3CPW S; 1R0C B; 3UDC A; 1WHG A; 4MDW A; 4XU1 A; 1NJI C; 2RK1 A; 1W4S A; 3CC2 T; 2HEQ A; 4DQ2 A; 3P8B B; 3SHW A; 3SWN B; 1E6H A; 2J7I A; 4KT0 E; 2CP7 A; 3CBO A; 2W0Z A; 1OV3 A; 1Y57 A; 2GQV A; 2QEX T; 1KD1 C; 4J8O A; 3X28 B; 3CCU Q; 4P5N A; 4XAX B; 2FG0 A; 1AZE A; 5EG2 A; 1PRL C; 1WXU A; 1VQ8 A; 2LJ1 A; 2DO3 A; 2LZ6 B; 2MI6 A; 4M7D D; 3AT1 B; 2L89 A; 4PJO G; 4BD3 A; 5CIU A; 3OS5 A; 2ROT A; 1WHJ A; 4PFP A; 1PKT A; 2DE0 X; 2E1H A; 1LPL A; 2E5Q A; 2KBT A; 1Q86 U; 1PSF A; 3I5S A; 5GAN d; 4F17 A; 4HVU A; 1N8R R; 1W2B A; 5ECA A; 3V8L A; 2E10 A; 3BDL A; 3OYJ A; 3LH0 A; 4GLM A; 4M77 F; 1BI0 A; 3CBM A; 1VQO T; 4JUV A; 4DBH A; 4XU2 A; 4E7S A; 1OI1 A; 3VS1 A; 5LJ5 j; 4KRT A; 4M77 D; 1I4K 1; 3L2W A; 5LJ3 e; 2GQI A; 5IXF A; 2DKG A; 3JAM E; 5IT9 E; 5FWC A; 1XTD A; 1YBY A; 1QCO A; 4LD9 K; 2E6N A; 4FYY B; 2NUT B; 3NGP A; 3HTR A; 1VQN T; 2JMA A; 5GAO l; 4MZM A; 1KD1 U; 2ZPI B; 1R8O B; 2QA4 A; 2K9G A; 3DLM A; 3JB9 I; 4IUV A; 2HBW A; 3TU4 K; 2LDM A; 1I0C A; 3A1P A; 2H8H A; 1JQQ A; 3FB9 A; 1M1F A; 3VRZ A; 1G5V A; 1VQN A; 2PVG B; 3MEU A; 3A5Z B; 2ED1 A; 2JM9 A; 4JPB W; 3TSW A; 3D7S B; 3RIR A; 4J7F A; 1D0X A; 4X1V A; 3CPF A; 5D6Y A; 2VVK A; 5AT1 B; 4LDU A; 3J81 E; 2HBP A; 1VA7 A; 5GAN h; 2SEM A; 2EYZ A; 4RTZ A; 3A8L B; 3C94 A; 5LJ5 f; 2HAX A; 1WNL A; 2RNA A; 1Q82 U; 1BU1 A; 8ATC B; 2MF2 A; 3M58 A; 2YLB A; 1LOJ A; 2YDL A; 5C0M A; 3S3N A; 2BTT A; 2KY9 A; 3RMQ A; 4BE2 A; 1JO8 A; 1M90 C; 3GF5 A; 4AFS C; 2L3S A; 4F7U B; 1AEY A; 4PJN A; 1IZ6 A; 3VKI A; 3HPW A; 3QZ5 B; 2BZX A; 3M4G A; 2P0K A; 3VV0 A; 3H6Z A; 4FYX B; 4JLI A; 3OW2 P; 3G1J A; 4C8Q E; 2QTX A; 3SEM A; 1AZG B; 1G83 A; 1ZLM A; 4OMP A; 3EG9 B; 5GMK i; 4OVA A; 1OZ2 A; 2LJ3 A; 3PT9 A; 4PJM A; 1F1B B; 3DB3 A; 4Z8A A; 2VC8 A; 3LX7 A; 1IRE B; 2OTL T; 4EMG A; 3FEO A; 4RTW A; 4BAC A; 4J9H A; 5I11 A; 3NHN A; 1WPY A; 2EGC A; 4Y92 A; 2K3Y A; 4AFQ C; 1VQ6 T; 4E7K A; 3FJ5 A; 4C8Q G; 2VGN A; 3RER A; 3MJX A; 2HSP A; 1VIF A; 2F1L A; 2CH4 W; 2K5F A; 4L59 A; 4HXJ A; 2FHD A; 1WIE A; 2JXB A; 1VQ8 Q; 2KRS A; 3GP8 A; 3F70 A; 1VQ6 A; 3CXC S; 1GFD A; 5KYW B; 1JXO A; 4O5V A; 2R5A A; 4LN2 A; 3CCS Q; 4MZT A; 3SDZ A; 4E7H A; 2RJD A; 1KC8 U; 9ATC B; 3FJP A; 4HCK A; 1ABO A; 5KE2 A; 1K9M R; 1YJW T; 3PFS A; 3P8D A; 3PVQ A; 2M0O A; 2QQ9 A; 3GLX A; 4L5G A; 3A98 A; 4JJN K; 1UEC A; 4OGC A; 2IG0 A; 2MWP A; 5CKB A; 3ZEH A; 2EQM A; 3QUI A; 2KGT A; 4IUR A; 1UJ0 A; 5KE3 A; 1TWB A; 2RI2 A; 3OYE A; 3JCM X; 1TUC A; 1GCQ A; 1SHG A; 1PWT A; 3OYG A; 4PJO D; 5A0D A; 2BIV A; 2GTJ A; 2L8D A; 4N0A C; 2A08 A; 5IHN A; 4XU0 A; 2JW4 A; 2CT3 A; 3G4S T; 2VUB A; 2RHY A; 2QA4 Q; 5DLQ E; 1RAI B; 1SPK A; 3E9F A; 4RTV A; 1EIF A; 1SRL A; 3REA B; 4M78 C; 1AOJ A; 1H92 A; 2JMC A; 3SWN A; 2JZ2 A; 1R0B G; 2V8J A; 1QCF A; 1VQN Q; 1YJN A; 4BI8 B; 5FW9 A; 1KJW A; 5L23 A; 3VS4 A; 2J06 A; 4FT4 A; 3C95 A; 5GAO p; 2XDP A; 2JTF A; 4DEX A; 4E7I A; 2FB7 A; 4JRK A; 4LDY A; 1M9S A; 3VS6 A; 4EMH A; 3JB9 J; 2E5K A; 5GAN 6; 1W2B S; 2RJF A; 1T0J A; 4C92 E; 1BI1 A; 3FC3 A; 2HCK A; 4LXC A; 2EQK A; 2XHC A; 2DER A; 2XK0 A; 1KK7 A; 2CRE A; 2QK0 A; 2LVM A; 1UHC A; 3VJP A; 4FL6 A; 1QP2 A; 4HA8 A; 4RG8 A; 3LH5 A; 2ZPH B; 5CKD A; 1UGV A; 3RNJ A; 3QZ9 B; 1NLO C; 4M7D A; 1RI9 A; 3QXE B; 4KGX B; 1QVG P; 2RPN A; 5LJ3 j; 5KYY A; 5DM7 R; 2YUO A; 1RLP C; 2EJF A; 2EKH A; 2DRM A; 1XJW B; 4PK4 A; 2I2L A; 4M77 E; 1G3W A; 3PMT A; 4KUD K; 3QPH A; 5GAN g; 3OB9 A; 3CCU T; 1WQW A; 4XTY A; 4JS5 A; 1KQ2 A; 2EW3 A; 3I9Q A; 2PU9 B; 3HSB A; 1BK2 A; 2JT4 A; 3H41 A; 1QKX A; 4BDY A; 1TXQ A; 4A4K A; 4V2S A; 5GAN 5; 1U5S A; 2RHU A; 2EYQ A; 3CCU A; 2LQN A; 3UA6 A; 3ZBD A; 5GMK e; 3MO8 A; 5HCK A; 1BKB A; 4MZP A; 4ZTF A; 4M77 G; 2K4Y A; 4VUB A; 2AKL A; 1EZZ B; 4RUG A; 3EFO B; 2RM4 A; 1D1A A; 3KXT A; 4KUL A; 1SSH A; 3CD6 Q; 4M78 F; 2QQA A; 5LJ3 f; 2XIC A; 5GAO q; 1K73 U; 3SWN C; 3S3M A; 2CDT A; 3RBB B; 3QJ6 A; 1O75 A; 4M78 D; 1MHN A; 3JB9 F; 3GOX A; 1SG5 A; 2CP3 A; 1GBQ A; 4C8Q D; 2PUK B; 3CCE T; 2DET A; 2C0O A; 4ORZ A; 3VS2 A; 1NYG A; 4F7U A; 4CC2 A; 2K3X A; 2DK3 A; 4PKC C; 2Y4Y A; 2PVD B; 2LCC A; 3KFV A; 3MHX A; 3A8M B; 2DA9 A; 4DEY A; 1ZA1 B; 2AHJ B; 5DLO A; 2K3B A; 2DIQ A; 1U3O A; 3RDV A; 3CCE A; 1OPL A; 1QMC A; 1JJ2 P; 4HT9 A; 1MV3 A; 2Y4X A; 1Q7Y C; 3A8H B; 4J83 A; 2FL7 A; 4QVC A; 1X43 A; 1KSW A; 2EQU A; 2JTM A; 3QYG B; 3EH2 A; 1HK9 A; 4NOY A; 1UTI A; 1K8A R; 1Y71 A; 4E7Z A; 1YJN Q; 2RH2 A; 2HMA A; 2LQW A; 1C0M A; 5GAN e; 1KQS P; 2ATC B; 4MMK A; 2DYI A; 1D1B A; 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