4X2FA

Selection of fragments for kinase inhibitor design: decoration is key
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
303
structure length
303
Chain Sequence
GTIARTIVLQESIGKGRFGEVWRGKWRGEEVAVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVTVEGMIKLALSTASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGTCCIADLGLAVRHDSATDTIDIAPNHRVGTKRYMAPEVLDDSINMKHFESFKRADIYAMGLVFWEIARRCSIGGIHEDYQLPYYDLVPSDPSVEEMRKVVCEQKLRPNIPNRWQSCEALRVMAKIMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSQQEGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords TGF-beta receptor type-1
publication title Selection of fragments for kinase inhibitor design: decoration is key.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 100
structure length 303
sequence length 303
ec nomenclature ec 2.7.11.30: Receptor protein serine/threonine kinase.
pdb deposition date 2014-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4x2fA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4x2fA01
2CLQA 3GU5A 5AAFA 2B9HA 4M67A 4K9YA 2F7XE 5LVMA 2OXXA 3GB2A 3SXSA 3ZEWA 2YCSA 3Q3BA 4NM0A 3C13A 4XP2A 3SV0A 2CCHA 3FAAA 4CMOA 5M44A 1OBDA 3DXQA 3BYSA 5AUZA 2YISA 4UMPA 4QYFA 2GQGA 4LMNA 4XG4A 3QKMA 5L2IA 2I0HA 1MQBA 4LYNA 5HNGA 3ROYA 3CD3A 3ZFXA 3QHRA 4BCGA 3WYYA 4IE9A 3BYUA 3GGFA 4BZDA 5IQFA 4KABA 1LPUA 2BR1A 2ZDTA 3O0GA 3SC1A 3MWUA 4BCIA 3WIKA 4EYMA 3HNGA 4HVIA 1J7UA 4YBKA 2VO6A 4C61A 3P4KA 2YIXA 3HMMA 3UE4A 4USEA 4FEVA 4XG9A 1UNHA 4E4NA 3MTFA 4GYGA 3ODZX 4QRCA 3RPSA 3EZRA 3VQHA 5AFVA 2X7FA 2PYWA 5DT4A 1FBNA 3QLGA 1Y6BA 2VWXA 2WQOA 1H07A 2UW5A 3PSCA 4JL9A 5T68A 3N9XA 2ZM3A 4MEDA 3KY2A 4A4XA 3PIYA 5C26A 3NVMB 4M15A 2BIYA 2WQEA 1GY3A 1OITA 2XK4A 4FSRA 5IQBA 4R78A 4WUAA 1BI7A 3VQUA 1ZLTA 4BCQA 4ONAA 2XBJA 4FTJA 4NW6A 4RWJA 3C7QA 3PZHA 4KIKA 4QYHA 2IN6A 4U9AA 3SA0A 1J7LA 4RZWA 2ITTA 2WELA 5CT7A 3DJ6A 3D5UA 5EM7A 5JGDA 1IG1A 3GQLA 4FTAA 4IM2A 4QQ5A 1UNGA 5K9IA 1ZYJA 3G6HA 5AP5A 4KBAA 3M1SA 2XNGA 5DNRA 2VTMA 2PVMA 2XMYA 5ACKA 2R3MA 3GU4A 3HRFA 4JBQA 4NJ3A 4U3ZA 2W1DA 4LOPA 5LVPA 5JRSA 1Q8WA 2VTAA 5E7RA 1OPJA 2XKDA 3FEGA 3D7ZA 4DE4A 1WVWA 4FZAB 3PA3A 4ORKA 4XG6A 5JK3A 4I20A 4RWLA 1TVOA 3LXLA 3SXFA 4HW7A 4ANOA 2R5TA 1P4OA 4GVAA 4RC3A 3AMBA 5CAVA 3D5XA 2ZMCA 3Q9YA 4F64A 3DFAA 3GU7A 1ZYDA 2VX1A 1Y6AA 2W99B 2YM5A 3EL8A 4MXYA 4CFWA 1H1PA 5DEYA 4MD7E 3QZFA 3LLAA 2ITXA 1UVRA 3JVSA 4LM5A 3V01A 3BHYA 4QYEA 1DAYA 3FBVA 1SNUA 1R39A 4HGEA 4RWKA 5BUEA 4YJVA 4RX5A 2OF2A 1XKKA 2W4JA 4E4MA 1KE9A 3LFAA 3QL8A 1SZMA 3VHEA 3ZONA 1PMNA 1Q41A 2RF9A 3DLSA 4C7TA 4AFJA 1VEBA 3LFFA 1I09A 4RC2A 4FKOA 4OTPA 1G5SA 2W9FB 5DIAA 4XMOA 2OJJA 5FWKK 1U54A 3ZM9A 1OKYA 4CVAA 4K11A 5ANOA 5I3RA 3NZ0A 3TKIA 4ARKA 3KQ7A 3DK7A 3FWQA 3U8WA 4CT2A 4ZSGA 2XIZA 3DDPA 2WMQA 3GC0A 1NVSA 2ONLC 4ZZNA 5CQUA 4B4LA 4D2TA 4EZ7A 4CFMA 4FV9A 4IIRA 3V3VA 4D2RA 1IA9A 1F5QA 2P4IA 5FXSA 3NSZA 3OOGA 4XRLA 5CU3A 4BCHA 4WG3A 1YWRA 4CD0A 3CEKA 3R01A 5ANKA 1OL1A 4ZTRA 4AP7A 2QOIA 2YN8A 4UWBA 5IISA 4L67A 4MNEA 5CNNA 4BF2A 1JLUE 5LCJA 2OF4A 4M69B 4WUNA 3KN6A 4XH6A 5IQDA 3FE3A 3KCFA 3A7IA 4YLJA 5LJJA 3LJ1A 4FKSA 4FT3A 4PNKA 5JSMA 1OL2A 3ZU7A 2WTCA 2PMNX 4NM7A 3HRCA 4JRVA 4M3QA 4KBCA 4RJ7A 1DS5A 1Q62A 3FLSA 4L43A 3QTZA 4M84A 4C62A 4M97A 2YDIA 4IW0A 2IW6A 3I0OA 2GTNA 4YR8A 4RFYA 3SHEA 4RLKA 4JG7A 4CT1A 4RGJA 4AGCA 3VRZA 5J8IA 3CD8A 3QRJA 2IO6A 5AP2A 5HESA 3TG1A 3VF8A 4O96A 4JQ7A 2VAGA 3R2YA 3OWPA 5E8ZA 4DGNA 3LHJA 4CFFA 3F3UA 4AUAA 5G1XA 3ZOSA 5CAPA 4PPCA 3D14A 4R5SA 2UW7A 3H4JA 4O0YA 4I4EA 5JN2A 5KKRC 4QD6A 2WO6A 4NCTA 3VUGA 4YSJA 4RJ5A 2CNVA 4QMXA 1OVEA 4QP3A 5E9EA 3P79A 4R8QA 3RALA 3MVJA 3CJGA 3ENHA 4OTWA 4DINA 3QQLA 4FMQA 3PXFA 4GK3A 4RIYB 4CMUA 5LMBA 2BZIB 3IDCA 5C8NA 5BVKA 4EEVA 2RFEA 3I7BA 2VV9A 2XK7A 4D28A 2OI4X 2XKCA 4KSQA 5HU9A 1TQMA 4IANA 2F7EE 2C3KA 3GOPA 1XHAA 4C4HA 4ZIMA 3HUBA 4K0YA 4YJRA 4XOYA 4IWPA 5IUIA 1VJYA 5M08A 4WBBB 5LVOA 1W82A 2FH9A 4DH7A 4M66A 3Q9ZA 4OTGA 4DLJA 3F6XA 2JKMA 3V8WA 4DEGA 4F6WA 2Y0AA 4YP8A 3WZDA 5K5NA 3HDNA 3POZA 5FGKA 3PY3A 2ZJWA 2E9NA 3MA3A 4UZHA 3R9OA 2ITZA 2OSCA 2OJFE 4RJ4A 2Z7SA 4A9RA 1GZOA 1OKWA 2ITWA 3QTUA 5IMEA 4O7VA 3U9NA 4DFXE 2XK3A 3LCDA 3QUPA 1W98A 4IJ9A 3QXPA 5GJFA 4KNBA 3RAHA 5AUTA 2GFCA 2QLUA 5HVKA 1L3RE 4ZS4A 1H01A 3TZ9A 3JYAA 2VTQA 1JKSA 3TKUA 1P2AA 5JFXA 4QYGA 2YIYA 3QZIA 1Y8GA 3KXGA 2VN9A 4JAJA 1SNXA 3UYTA 5HBEA 4UMUA 1PY5A 2Y7JA 1WBVA 4IZ7A 4JDJA 4KWPA 5FXQA 5ICPA 2DYLA 3UNKA 3QWKA 4X3FC 4HCVA 3UNZA 2FO0A 4ERKA 4YJQA 4YPDA 4C02A 2CKEA 3P08A 3R02A 2B9IA 3QC9A 4DF3A 4C0TA 3OT3A 4HVHA 3DY7A 4DFUA 1XO2B 2YA9A 3DKGA 2WKMA 3FYJX 2BALA 1XWSA 4YZMA 2VTRA 4MWIA 1M2QA 3A99A 5IU2A 3QX2A 3ZXZA 2HELA 4B7TA 3EOCA 3P0MA 3UQFA 1T46A 2OH0E 2BROA 3CKXA 4IVAA 1HCLA 2HK5A 2YFXA 4IAIA 1AGWA 4MF0A 5A4TA 4EH6A 1G8SA 3N4UA 4OBQA 3SD0A 4L68A 2X2LA 4TYEA 3W55A 2BAJA 3R8VA 2XYNA 2C6IA 4XP3A 1Q4LA 1YOLA 2XM9A 3V5PA 4V0GB 1W8CA 5L2TA 5CY3A 4EQUA 4RFMA 1SYKA 4F6UA 5A4LA 4OTHA 4N0SA 5EI6A 4H3PA 2BZJA 1Z9XA 3DNEA 4FVQA 3HEGA 5BVOA 3UO4A 3GNIB 5E8YA 4FTIA 4C58A 2IZRA 1SMHA 3BLRA 3QC4A 2CSNA 4DLIA 4UY9A 1YOMA 2YCQA 3O8PA 4EOSA 4YTCA 3GOKA 5KCVA 4KINA 1KOBA 3S4QA 5IQIA 3QRTA 4KIKB 2UZBA 5FXRA 5DYJA 2UZNA 4EWQA 4EQCA 2GNHA 3BU3A 4RA5A 4C8BA 4DEIA 2UVYA 5L3AA 5J1WA 1PXPA 4GL9A 3EN6A 5AUUA 4NM5A 2AC5A 2VTPA 2P33A 3DXNA 5HNIX 5CANA 2JFMA 3QRIA 4E26A 3D2IA 2XNNA 2J4ZA 4Q5HA 2B7AA 4FV8A 4FKJA 4RT7A 4XCUA 2VUWA 2WTWA 3NYNA 4ITIA 3ZFMA 4XV1A 4AS0A 4O91A 4RC4A 5KUPA 1B6CB 4HCTA 3QTSA 1UWJA 2JDSA 3DBFA 3DK6A 2J5FA 4ITJA 4EK3A 3CTQA 3HMPA 3D4QA 1KE5A 5D1JA 2HENA 3UTOA 5M06A 5IQCA 4QMYA 3UG2A 1P5EA 2OXYA 4G34A 4RMZA 1O6KA 3BE2A 2ETRA 4FICA 3UQCA 2V22A 3RVGA 1BYGA 2CNUA 2PL0A 5IMXA 4CTCA 4C3FA 5M09A 3NNXA 3NYVA 4OTDA 4QMVA 3I81A 3B8RA 3MN3A 3MPAA 2EU9A 1PW2A 3BEGA 3DS6A 3UQGA 3L9LA 4USFA 4BCFA 2BILB 1TQPA 5CF8A 4B0GA 2ETMA 5I3OA 1H1SA 4LUDA 3SW7A 3PJ2A 3RAWA 2WD1A 2V7AA 4JG8A 4LV8A 3MJ2A 3N51A 2C47A 2WEVA 2P55A 4KIPA 5BVFA 2W96B 4FSZA 4JVGA 3DKCA 3G2FA 1Q61A 4FNZA 3NVKI 3NIZA 1OECA 3IW8A 4YMJA 2WMUA 2Z7RA 2F7ZE 3RZFA 3LFEA 3OS3A 4QMZA 2GNLA 3OF0A 4ZSAA 5J1VA 3OXTA 5C27A 4ZTLA 3QKKA 2Y4PA 3LCOA 3C1XA 3LLTA 1GOLA 1UU7A 2PVLA 3PJCA 3PYYA 4H3QA 4PF4A 5E1EA 4C4JA 5DEWA 2EUFB 4EOOA 4JJRA 4F1OA 3ZZEA 4D2PA 1KOAA 4RRVA 2R2PA 3ATSA 1UKHA 4FG8A 2X6EA 4NIFA 2GHLA 2XNPA 3E93A 3PG3A 3KF7A 4QO9A 2PMIA 1OIQA 5F95A 2EXMA 4CV8A 4XV2A 3NUAA 3EIDA 4LGGA 2OU7A 1M7NA 3F3WA 3F2RA 1CKIA 3UODA 3KREA 2XNBA 4USDA 4FSYA 3F3TA 2V62A 3F9NA 4O1PA 4E20A 1UA2A 4F9AA 3PFQA 3LFSA 5CU0A 2YIRA 4IX3A 3CC6A 4G3FA 3W8QA 2I0VA 1V0OA 2C6DA 2VTNA 5AV1A 3O7LB 3QCYA 4IB5A 4IWDA 3TKHA 3ZSHA 5EDQA 5A54A 5J7HA 2R3QA 4JXFA 4NKAA 5BYYA 3PRIA 1M2RA 3GXLA 3P5KA 3I79A 3SAYA 4Q2AA 3VC4A 3ZLXA 3TNQB 2EB3A 5HLPA 4A4LA 3N4TA 5C4KA 2C6EA 5EOBA 4D4VA 2PUIA 2R0UA 4LL0A 3FMJA 3FY0A 4X3JA 3G90X 4C37A 4I21A 2R7IA 3CBLA 4K33A 4MK0A 4E4LA 3TXOA 2XBAA 4EHGA 4PV0A 1W83A 4D4SA 3TM0A 3E88A 2GQRA 4FL1A 2XM8A 5AUWA 5EQYA 3KXZA 1OZ1A 2VZ6A 4ZP5A 5FG8A 3TT0A 3SGCA 4ZMEA 3RTPA 1OPKA 2W5HA 5CU2A 5HTBA 4IC8A 3QRUA 4CCBA 4BDEA 4P5QA 3ZS5A 3VBWA 4FG9A 3FZOA 2BAKA 2C1AA 3O51A 4CSVA 5HG8A 3S0OA 3D2KA 3A2CA 3NRMA 3TZ8A 3FHRA 3FMKA 5AR5A 3AMYA 3QD2B 1BUHA 2QOQA 5AMNA 3PXQA 4W4WA 2QR7A 3V51A 3UC3A 5J9ZA 3FLWA 4I22A 3SVVA 3I6UA 4WNOA 5CAOA 3SLSA 1BI8A 2X8DA 5DMZA 3PY0A 1E9HA 4NH1A 4M7IA 3FKNA 1B39A 1FPUA 2VO0A 3FXWA 4DGLC 2DWBA 4J99A 2GQSA 3COKA 5HOAA 1YI4A 3WZEA 1NXKA 3VS4A 4BWXA 4D4YA 5LXMA 3QZHA 2VTHA 1X8BA 4OTFA 4J8MA 3ZUTA 3VNTA 5HLWA 4HYSA 5B2MA 4DCAA 3FYKX 3HDMA 3UZPA 4FV0A 3DBEA 4CKIA 5AEPA 2YLEA 5EYDA 5JFSA 1PHKA 4AGUA 4U41A 4X2FA 3CPCA 4OT6A 3BYVA 5AP0A 5HO8A 3A7GA 3H3CA 3UIXA 1YWNA 2PK9A 1U59A 4IVCA 3JY0A 3TJCA 5G6VA 4O7WA 3NNWA 2WTDA 3IGGA 4JBPA 4Y8DA 2C5NA 1MP8A 1JSUA 4NKSA 5FD2A 2WTKC 3MFTA 3HAMA 3WZUA 1XH6A 5CLPA 2QKWB 3POOA 2RGPA 1MQ4A 2WTJA 5LWNA 4FTMA 5DG5A 4AN3A 1IA8A 3C4CA 4G3EA 5EM6A 3ZO3A 3NAYA 5AP1A 4AW0A 3LZBA 1H8FA 4F0FA 1WBSA 4QYYA 3W2SA 1Q8ZA 2YITA 4FIFA 3EKKA 4O7RA 5J9YA 3W33A 2OJ9A 2R3FA 3G33A 4RQKA 4F0IA 4GFMA 2UZTA 2BTRA 4BZNA 3JY9A 1KSWA 4CLJA 5A4EA 3NCGA 2VWBA 3HA6A 2BDWA 4QTCA 4TXCA 4E1ZA 5HICA 4R3RA 4EH2A 2C68A 4BKZA 5IUHA 3TNWA 3S1HA 3RPVA 4ZOGA 1M17A 1J91A 1ZZLA 2XCKA 4I0SA 3E92A 2PUNA 3FQHA 2R3IA 2Z2WA 4FV2A 5HIEA 2PUUA 3LMIA 5LQFA 1YXTA 3RP9A 4JBVA 3R22A 3IW7A 4GW8A 1UKIA 3C5UA 2FB8A 1Q3WA 4DT9A 3KRRA 4W8DA 4UN0C 4DN5A 4EOMA 2Y6OA 4GVJA 4ZEGA 5E92A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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