4X2KA

Selection of fragments for kinase inhibitor design: decoration is key
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
303
structure length
303
Chain Sequence
GTIARTIVLQESIGKGRFGEVWRGKWRGEEVAVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVTVEGMIKLALSTASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGTCCIADLGLAVRHDSATDTIDIAPNHRVGTKRYMAPEVLDDSINMKHFESFKRADIYAMGLVFWEIARRCSIGGIHEDYQLPYYDLVPSDPSVEEMRKVVCEQKLRPNIPNRWQSCEALRVMAKIMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSQQEGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords TGF-beta receptor type-1
publication title Selection of fragments for kinase inhibitor design: decoration is key.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 100
structure length 303
sequence length 303
ec nomenclature ec 2.7.11.30: Receptor protein serine/threonine kinase.
pdb deposition date 2014-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4x2kA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4x2kA01
2XEZA 5CSHA 3CBLA 5AIKA 4AZFA 3RAIA 4AA0A 1GIJA 4AFJA 3HRFA 3MB6A 3NW7A 2ZJWA 3F69A 3UO5A 3BCEA 4XG7A 4LM5A 5JT2A 3ULIA 4TWCA 5HOAA 4YZNA 3HDMA 3ZLWA 2YAKA 3R0TA 3RM7A 5BVFA 3TNQB 3I5NA 3Q60A 4UALA 5E92A 3RZBA 2PPQA 4BYJA 1W98A 3VBVA 3QQUA 4RIYB 3UNZA 4QYHA 3AT3A 3D7ZA 3VQHA 4XHKB 3VUIA 4O7VA 5E8WA 4IQ6A 5K3YA 2F49A 5CI7A 4B8MA 4LI5A 4BC6A 3UC3A 4E6CA 2R9SA 3LFAA 4AZSA 4FV2A 4OTFA 4C3FA 1UNLA 2WO6A 3EB0A 2JDTA 4AZWA 4HNFA 2UZBA 2DQ7X 1PY5A 4K11A 4ASEA 3R28A 2YHVA 3HMMA 2ETMA 5L8KA 4YJNA 3OXIA 2ZOQA 5CS6A 2AUHA 2X8EA 3NYXA 3OC1A 3U87A 3RPOA 2H8HA 1PKDA 4FL2A 4AN3A 5IF1A 1G3NA 1H28A 4AP7A 2GNFA 3LXKA 5HE2A 4KSPA 2YM8A 4X21A 4AN9A 2PVFA 3BLQA 2Y9QA 5DT4A 4HVIA 4FV8A 1YOLA 2YFXA 4QYFA 1QCFA 3K3IA 5AP3A 4U40A 1JSTA 2XKCA 3OXZA 4KB8A 2XA4A 3VW8A 4FVRA 3R8UA 3V5QA 5I4NA 5CSWA 5H9BA 3G9NA 4L52A 5AEPA 2JAVA 4BTKA 4C4GA 4WOVA 2UZEA 4FG7A 3BI6A 4MNEA 3AT4A 3CR0A 4AF3A 4F99A 2UZUE 3TACA 5E9EA 2WMUA 1XR1A 4HCVA 5LVOA 1DS5A 2BRMA 1NY3A 3DU8A 5FRIA 3E8DA 2CGXA 4OTHA 3MY5A 4ENXA 3SA0A 1Q5KA 4ONAA 5F20A 3KRLA 5EK7A 1P4OA 3FLZA 2H9VA 3ATTA 2HOGA 1NVRA 3NUNA 4KABA 4D0WA 1OIYA 3DJ6A 4O0UA 1GJOA 3SKCA 2IVUA 4I5PA 4DGMA 4EH7A 2W7XA 4I6FA 2HK5A 3C7QA 4BBEA 3JPVA 2G2HA 4FL3A 3WF5A 1OBDA 1YI4A 5F1ZA 1NXKA 1UU7A 4ZTQA 4TNBA 3K2LA 3NR9A 4JL9A 5C8NA 2JKOA 2XB7A 3LAUA 4OR5A 4JG8A 4E4MA 4YTFA 5LOHA 3O7LD 4APCA 2X39A 4AT5A 3TZ7A 4U7ZA 5BVEA 4ID7A 1YVJA 3FI2A 3AMAA 4I23A 4IWQA 1V0OA 1WBOA 4G2FA 1R78A 2WMTA 2UV2A 3G0FA 4YC8A 2X8DA 3PXQA 2F7ZE 4DCEA 4K33A 3DV3A 5C8KA 5FEEA 3TUBA 2C0OA 5HLPA 4FT0A 4CRSA 1S9JA 2F4JA 5M44A 1Y6BA 3I1AA 3Q6WA 3QQKA 4HYUA 5D10A 3FMDA 4PMSA 4NWMA 2Y7JA 1E1XA 3ORIA 4FYOA 2VNWA 4DG2E 2V0DA 4LUEA 3FLQA 4YGAA 3C9WA 5IQGA 1YOMA 2R2PA 4KIKB 2E9VA 3R9OA 3CIKA 2GNHA 4FL1A 4EYJA 1JNKA 3KQ7A 2C3LA 4UZHA 1OMWA 3U8WA 3VC4A 3ZDIA 3LE6A 4FI1A 4PL5A 4E1ZA 3PLSA 2X2MA 4YBKA 4JXFA 4UV0A 4ZJIA 1J1BA 3OT3A 1K9AA 2WOTA 2NO3A 3MPTA 4RWIA 3GU7A 3LCSA 5T6KA 4EOSA 2PMNX 5KHWA 2WMWA 4KIQA 5CNOA 4FT5A 3HDNA 3LW0A 5JMSA 3RTPA 3RJCA 2JKQA 3VUTA 3WE4A 4G6OA 5BYLA 5LXMA 1ZMWA 4UWBA 3ZRLA 4CZTA 4GEOA 4NK9A 2FSOX 1R0EA 2C5OA 3UG1A 4PMPA 5B2LA 2HY81 3PJ8A 4FV5A 4E4XA 4XLVA 4EH9A 5EQYA 1Z5MA 4HGTA 5AUVA 2XUUA 3JY0A 2QLUA 4KWPA 3VS5A 4A4OA 4IFGA 5L2WA 1DM2A 2FGIA 2WXVA 4N6YA 5CEQA 1LR4A 3VBXA 1H26A 1SNUA 2C6OA 4CYJA 3RAHA 5L8LA 4QMSA 3GP0A 1PRYA 4S31A 1Q41A 2C1AA 3A99A 4KS8A 5HBHA 5M51A 2JKKA 5IA0A 3BU6A 4HGLA 4F9WA 1KV2A 2ONLC 3NNWA 4RPVA 4WA9A 1Q62A 3THBA 4YJOA 3R04A 3MH2A 4TXCA 3ZUVA 4MVFA 1JWHA 3PLAE 2PE2A 4RX9A 3VS6A 3PRFA 2FH9A 5AUZA 2YIWA 2IPXA 3E87A 4XG3A 5IMEA 3UMXA 5A46A 4FTTA 5IEYA 1X8BA 4CXAA 2VTOA 4IX6A 1CSNA 3DKOA 3NYVA 4CLIA 3BPRA 1TVOA 4D0XA 3VUKA 3DOGA 3SHEA 4NW6A 2UW5A 4U97A 3NNXA 3IDPA 4QD6A 3JVRA 3T9IA 2BTSA 3QBNA 3WOWA 3FQSA 2XP2A 3TNWA 1PMNA 5CU4A 3I6UA 4KNBA 2C5YA 2PVMA 4R6VA 3RI1A 3HL7A 5C9CA 2R3HA 3W16A 3WF7A 3R1NA 4X6RA 4O86A 4NM3A 4YTCA 2ZM3A 2QKWB 4RIWA 4BZNA 3S1HA 4R5YA 4YP8A 3LFCA 2PVJA 4IZ5A 4O27B 2LGCA 4F6UA 1BMKA 4MAOA 2WFYA 4U41A 5M09A 1JLUE 2IN6A 2ZM4A 3BE2A 4RZWA 5DWRA 5EM5A 2QOFA 3FQEA 1YQJA 2B7AA 5DGZA 4YMJA 4QP2A 3OF0A 4IX4A 3GEQA 5F4NA 4BDFA 2WQMA 4J96A 5LVLA 3KN6A 4BTFA 4IWOA 5TF9A 3BKBA 3C4WA 3EZRA 3OG7A 4L44A 2R4BA 1A06A 4G6LA 4LRJA 1ERKA 3DFCB 4PUZA 1R39A 4S32A 2PUPA 3MFRA 2WQOA 1U4DA 2BVAA 4RGJA 3LKMA 4JNWA 2E9NA 3Q5IA 4FTAA 3CSVA 1RQQA 5IA1A 2V62A 1IEPA 4RZVA 2GNJA 3UQFA 2GS6A 3VQUA 4U3YA 4JX3A 3U9CA 4PL4A 4FK3A 4ANNA 3LM5A 3E3BX 4IE9A 4IVCA 3G15A 4DBXA 5DEYA 2FB8A 3MH3A 5IUIA 4P5QA 2LAVA 4IWDA 3ORNA 4C57A 2XM8A 3DKFA 3I60A 3QTXA 4DT8A 3AD4A 3CJFA 2CKPA 4IB5A 4WBBB 4NZWB 4BDCA 1V0PA 3SXFA 4D58A 5F9EA 3DXPA 3BX5A 3H30A 5AX9A 4ASXA 4B7TA 4BWKA 3PVUA 4OTWA 1FGKA 3FMEA 1XKKA 3PPKA 4IX3A 4MXCA 2BZKB 3ZH8A 3VS7A 4ANSA 4UBAA 4Y73A 4C35A 3ZOSA 3LHJA 4IAZA 4R7IA 3WYYA 4II5A 4G34A 2R3IA 5JZNA 3MWUA 4OAUC 3LFFA 4BDKA 5LMAA 4QTBA 5C4KA 3OT8A 4XYFA 3R7UA 5IA2A 4NL0A 2RSVA 2JFLA 2ONLA 3K5VA 5C01A 5I9VA 4G9RA 3U51A 4YTHA 3HAVA 4QMMA 3TV7A 4D1XA 1OL2A 4C4EA 4F7JA 4GK3A 1PHKA 3S3IA 3FMMA 3VN9A 1M7NA 1MRVA 2WD1A 2P2HA 2HAKA 2VTMA 4FZFB 1SVHA 2REIA 2HY0A 4PF4A 2RFDA 3AD5A 3PVBA 5E1SA 1YW2A 5AR2A 3QA0A 2X4ZA 4C58A 2QOKA 2WELA 1YHSA 5DE2A 1KOBA 4RFMA 5KMMA 3JUHA 3EQPA 5I9WA 4W9XA 2VTAA 2RG6A 3P78A 3MI9A 3F7WA 4IM2A 5CASA 4QNYA 4YHJA 1MUOA 2XNOA 4OTQA 5CAVA 2B9IA 4ZTRA 4C61A 3OD6X 3ULZA 4IW0A 2F9GA 3A8XA 3OCGA 4XRLA 5DEWA 3O7LB 4HVSA 3S00A 4LYNA 2ZDTA 4GRBA 3P7BA 2O8YA 3QGYA 3ZRKA 1QPJA 2AYPA 5K4JA 3NYOA 2VGPA 5I9XA 3GU5A 4EK5A 3FHRA 5M08A 1JKTA 4OTGA 3D83A 3SW4A 4YPSA 4QQJA 5JEBA 5D7VA 3TXOA 4YLLA 2YIRA 3DBCA 3I4BA 2CCIA 3NUSA 4U80A 2J0IA 3KVXA 1T46A 2W05A 4FKVA 4WKQA 2BIKB 3E5AA 4K18A 5CSXA 4GSBA 2UW8A 4U0IA 4Y5HA 4DTBA 2QOCA 4X3JA 3CD3A 3LFDA 4EJ7A 3BV3A 2UVYA 2QG7A 4I93A 5GJFA 2XRUA 1YXSA 3G6GA 2VX0A 3OXTA 3MGYA 4NCTC 4CT2A 2CLXA 4FGRA 4UN0C 4X2GA 5HQ0A 2X8IA 3F3TA 3IW8A 3O51A 3K3JA 3KXHA 3OZ6A 4FV0A 4JLCA 4MXXA 4RIXB 5G1XA 4F08A 3P23A 3VNTA 4YHFA 5HNBA 1NW1A 5ACBC 5IEXA 3MPAA 5AR4A 4GIIA 4YJPA 1OL7A 3I79A 3R63A 3RNYA 4Q9ZA 4M66A 4FIJA 5FTQA 2YZLA 3Q2MA 5E91A 4W8DA 4HGSA 2F57A 2NRUA 4O22A 4CFXA 5CT7A 1XH9A 2HXLA 3BYVA 3UYTA 5IH5A 2QKRA 4YZDA 2YM4A 3CPBA 4AGUA 4O82A 4JG7A 3AC4A 4GH2A 4W9WA 2QO2A 5BYYA 4ZMFA 4V04A 5BPYA 4BN1A 3U4UA 1AQ1A 3KULA 4ASDA 4C2WA 3LFBA 4M13A 4GT4A 2UZOA 5CEIA 5FXSA 2J2IB 3QZFA 4H36A 5IH6A 2GPHA 1A48A 1JSVA 4R5SA 2PK9A 4EEVA 4GYIA 1HCKA 3BYOA 5EM8A 2XIZA 2HENA 1M52A 3KL8A 4R77A 1SZMA 2UZLA 3MTFA 4CT1A 2BZHB 4EOJA 1GZKA 1MP8A 4EK8A 3LLAA 1KV1A 2NRYA 5GZ8A 4CEGA 1FQ1B 5GZAA 5AMNA 2OJ9A 3A4PA 4UEUA 4ZY5A 1BL6A 2J50A 3AG9A 5B0XA 5J9YA 4F9YA 3E7VA 3PJ2A 2CKEA 4TYHB 3TNHA 3TI1A 3V5WA 4FTQA 2XIRA 2Z8CA 5CXHA 4O1PA 3ENHA 2P33A 5BVWA 4N6ZA 5IQDA 1XBAA 5ANJA 4CVAA 1BYGA 2P4IA 2VWXA 5A54A 4CKIA 4IB1A 1CKIA 5H8BA 5AA8A 5KMKA 4QPMA 2X1NA 3VS4A 1YWVA 4JDJA 3MFSA 3NSZA 1LEWA 4A9TA 2ERZE 4F9CA 5GIOE 2XKEA 2WMRA 2JBPA 2RFNA 5IQEA 3T3UA 2YIYA 4YC6A 2JFMA 3SXSA 3IK3A 4J71A 3W10A 4Z55A 4O7TA 3BHTA 3DTCA 2GHGA 2JC6A 5ETIA 3REPA 5E8YA 4CFMA 3O96A 4RWLA 1F3MC 2PWLA 5HU9A 1URCA 4DH3A 5CAUA 5M4CA 3N4TA 5FG8A 4CV9A 4KBAA 4XG9A 3ERKA 3HV4A 5L6PA 3QHRA 1ZAOA 4XLIA 3HEGA 4MX9A 3DB6A 3KMMA 5I9UA 1PMEA 2YCSA 3EN4A 4FOCA 5DRDA 3N51A 4U9AA 4DCAA 4E5WA 2QOHA 5FXQA 4D1SA 2VWVA 4D9UA 1ZOHA 5E90A 3BGZA 3HP5A 1FOTA 4GU6A 5LARA 4NCTA 2Y6OA 2OWBA 3LFEA 3W8LA 2KULA 4BRXA 1U54A 5JZJA 3L8SA 2HCKA 3Q4UA 3O17A 4IXPA 1UVRA 3EL7A 4DGNA 4NYEA 1H4LA 2RKUA 3DQXA 2ITZA 4QMOA 3F3ZA 5J7BA 2BRBA 5AR3A 5AV0A 3LMIA 2PL0A 3F5GA 3QZHA 3WI6A 3DBQA 3PSDA 3ODYX 4XG2A 4ZS4A 4RWJA 4LRKA 4XOYA 2OF2A 4FKIA 4FG9A 3EHAA 2CSNA 2RFEA 4JVGA 4J98A 2R3KA 4O7YA 3VVHA 3AXWA 4F4PA 4USFA 2RFSA 3FMKA 5D1JA 5AP7A 3SOAA 1TKIA 2JD5A 2VWUA 4U42A 2BILB 1KE5A 3M2WA 5IQCA 4X3FB 5IUGA 5HCYA 3PP0A 3R1YA 4EH6A 3NDMA 4O7LA 1O6LA 1YHWA 4ACCA 4FT7A 1VJYA 3PA4A 5A4TA 4FEUA 3UNJA 3BGPA 3E8NA 4AOTA 3RHXA 5LMKC 3FMNA 3KK8A 3LCTA 3QTUA 2CNQA 2X7GA 4QMXA 4DH5A 2PVLA 4PDOA 3BU5A 3OCBA 4I4EA 3BBWA 3C4EA 4M15A 1PXMA 4ZSEA 3Q04A 5BVKA 5KBQA 3LQ5A 3LCKA 4EQCA 3PJ1A 2EUFB 4ANMA 2O5KA 2Z2WA 3GFEA 5HX6A 2XEYA 2V55A 3CE3A 3BYSA 4KINA 2XK3A 3PZEA 3PFQA 4WHZA 3SXRA 4XMOA 4RQVA 4FTOA 1OB3A 3COKA 4Q5HA 3D15A 1M17A 4ACHA 3AMYA 4MBJA 2BUJA 3R7VA 5HVYA 3Q96A 5C27A 4MCVA 4FVPA 1FPUA 3DBFA 2IZTA 4JOAA 4ZTMA 3COMA 4U6RA 4L7SA 2QURA 3EKNA 1JQHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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