4X3FC

Crystal structure of the intracellular domain of the m. tuberculosis ser/thr kinase pkna
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
288
structure length
273
Chain Sequence
SPRVGVTLSGRYRLQRLIATGGMGQVWEAVDNRLGRRVAVKVLKSEFSSDPEFIERFRAEARTTAMLNHPGIASVHDYGESQMEGRTAYLVMELVNGEPLNSVLKRTGRLSLRHALDMLEQTGRALQIAHAAGLVHRDVKPGNILITPTGQVKITDFGIAMVMGTAQYIAPEQALGHDASPASDVYSLGVVGYEAVSGKRPFAGDGALVAMKHIKEPPPPLPPDLPPNVRELIEITLVKNPAMRYRSGGPFADAVAAVRAGRRPPRPSQTPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase PknA
publication title The crystal structure of the catalytic domain of the ser/thr kinase PknA from M. tuberculosis shows an Src-like autoinhibited conformation.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 80
structure length 273
sequence length 288
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2014-11-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4x3fC02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4x3fC01
4O1OA 5DFPA 2E9NA 4U40A 4W9WA 4AOJA 2B54A 3DU8A 3GQLA 4QQ5A 4PPBA 1VYZA 3QD2B 3WYXA 4O21A 3ZMMA 3EL7A 3ZYAA 2YWPA 2P3GX 5EQYA 1ZARA 4U3ZA 2G15A 4CCUA 4BCPA 5J7HA 3UGCA 2PVKA 3NSZA 5CU0A 3IS5A 4YC8A 5LVLA 3RPYA 4JX7A 3I5ZA 2UZWE 5AP3A 4BCFA 3TTJA 4C62A 3KREA 5D1JA 5IQEA 4FK3A 3F66A 3R73A 3AXWA 2W9FB 3BLRA 4E6QA 3DKGA 4LGDA 4QP8A 4DFXE 1Y8YA 4FTLA 4RWJA 4E4LA 1J7IA 3O0GA 4AFJA 5B2MA 2BFXA 5H2UA 2IZUA 2WQNA 1OL5A 4FUYA 4L7FA 1XH9A 2R3LA 2Z8CA 1U5RA 4LG4A 1JPAA 4JXFA 2OKRA 4ZY4A 3QQLA 5BVNA 4ONAA 2Z7QA 5DYJA 5A46A 3Q5IA 4ITHA 1ZMVA 3DBFA 2Y9QA 3HX4A 4RFMA 4WO5A 1GIIA 3JY9A 4IVBA 4QMXA 3EQHA 1GOLA 4CFUA 5KKRC 4BDCA 3ZHPC 2XIXA 4U42A 2P2IA 5AP0A 3T9TA 3ODZX 3ZO4A 3R83A 3D0EA 4M3QA 2ZOQA 1UV5A 3QRIA 4F9AA 1YWRA 5KMKA 2EXCX 2VX3A 3DS6A 4KS8A 3FEGA 5IA5A 3LM0A 4BDFA 3KK8A 5ANKA 3Q4CA 3W2SA 1ZAOA 3V6RA 4JDKA 1YQJA 3QXPA 1XBCA 3QA0A 4V01A 4K33A 2W9ZB 4ACCA 4NT4A 4D2RA 3C5IA 4CMTA 3VS7A 3R7VA 3Q9YA 3AQVA 4DH8A 3PLSA 2XKCA 4I3ZA 3HP2A 4BI1A 4I5PA 2B9FA 4FKPA 4I22A 4WNOA 3LFBA 3BHYA 2QOHA 3JVSA 3MY0A 5J9YA 3RPRA 4ZZNA 3PE1A 5KNJA 5HO6A 3LLTA 3VUDA 3IOKA 4IVDA 4ZTMA 1Q97A 2QR7A 3VS0A 4C4FA 1GY3A 4PL3A 3ULZA 4FEWA 3DKOA 4I5MA 4J96A 2DYLA 2I0VA 1DAWA 5M55A 4N6ZA 4BR3A 4Z9LA 2WTVA 4CYJA 4BFMA 3QQKA 4O27B 4BCKA 3BYUA 3F5UA 2ITXA 3PJ3A 4ERWA 3G9NA 2UW9A 5EM7A 4A9UA 4O84A 3Q9XA 4RJ6A 4EHGA 2YISA 4OBOA 3IW5A 5E8SA 4O0SA 4RWKA 4LMNA 3R9DA 1MRUA 4I41A 5ACKA 4B4LA 1K2PA 4O7RA 3V8TA 4NM3A 2PE1A 5CF8A 4D28A 4LGHA 3HUCA 5I9UA 3DBEA 5TE0A 3OEZA 3ZM4A 5H8BA 5IQHA 4F9BA 4AU8A 4DG2E 1V0BA 5HX6A 3CC6A 2YIRA 4ZMEA 1KWPA 3AC2A 2PTKA 4DCEA 5TKDA 1QPJA 3Q32A 3R8UA 4E1ZA 2ZAZA 3GOKA 2XRWA 3V6SA 5K5NA 2J9MA 2ZV8A 3LCDA 3ANRA 4MXOA 3VUGA 4AFEA 4CFWA 4QD6A 2JAVA 4MBIA 4DN5A 3VHKA 4FKOA 2Y0AA 3CTHA 4XX9A 5L2TA 4QPMA 1XBAA 2UZDA 3TDVA 1PMEA 3JPVA 3NUAA 3WI6A 2VGOA 3FDNA 1XH5A 3IPHA 3NWWA 3QC4A 2Z7LA 5HHWA 5KO1A 3LCKA 2ITYA 4FV2A 4JG7A 3NIEA 4G3FA 1H08A 5JFVA 2UZVA 2X8EA 4G16A 3I0OA 5AR7A 4H3PA 2ITOA 4LYNA 3VJNA 4F0IA 3P78A 3UO4A 4NUSA 3R7OA 4P7EA 4RPVA 2X6EA 5CS6A 3U51A 3LQ8A 2IVTA 4CGAA 4FA2A 2UW5A 5CWZA 1XH8A 5D11A 4ZTSA 3RAKA 4U0IA 5CAUA 2PSQA 2ACXA 5CSWA 3RMFA 3E8EA 4NW6A 3CXWA 3F69A 1FVRA 2UVZA 5E1EA 3BRBA 4L46A 3EQGA 4TW9A 5FRIA 3RNIA 4D4VA 3IOPA 3NDMA 2C5YA 3PY0A 4H58A 1SVHA 3GBZA 3LCOA 4E93A 5K5XA 2HW7A 1SNUA 4QYEA 3HRFA 3F5XA 4ZLYA 3AD4A 2VTJA 2ZV7A 3R02A 3QKLA 3WF8A 5FQDC 4G6OA 5ANOA 3MJ1A 3KL8A 3QTIA 4G5PA 4TTHB 3PVGA 4XG4A 3C51A 3REPA 4TWNA 3UO6A 4GS6A 5G1XA 4HVDA 4YU2A 5CEKA 2CKPA 4RJ4A 3LXNA 4ANOA 3FLQA 3HV6A 3TNQB 2OJIA 4AAAA 1Y6AA 3U4UA 3FI8A 2Q0BA 3FZPA 3KULA 4MHAA 4ZSAA 5IA0A 2A0CX 4FT0A 4IM2A 4LOPA 4BDAA 4X0MA 4C37A 5CQWA 5DPVA 5GIPE 5ETFA 4CFVA 3OTUA 2R5TA 3FPMA 4RJ5A 2J5EA 2CCHA 3GXLA 3RK5A 4A9YA 4BC6A 3R30A 4QOXA 2CKOA 4O82A 5HIDA 5IA1A 5AAEA 3C9WA 2I0EA 3QRTA 3T9IA 1H27A 2ETKA 4FTRA 2FSOX 1PXKA 2QO2A 5AEPA 2PUPA 1RW8A 1F0QA 1TKIA 2Q83A 2XBAA 2B55A 3MN3A 4FKGA 3CP9A 4EHZA 3UOHA 4BZNA 2Y4PA 3COIA 3LVPA 4RGJA 3MW1A 3ANQA 3DK7A 2JDOA 5C8KA 4EC9A 4A06A 1V0OA 2E9UA 3IKAA 5CF4A 4FTJA 5L2WA 2PZPA 3WF7A 4PNIA 5BVFA 3MY5A 4C33A 1XHAA 2I0YA 4AGCA 5JKGA 1Q41A 3AC1A 3NUNA 4RX8A 3G2FA 4KBCA 3H9OA 2WMBA 2WQOA 3IW6A 4RSSA 4AOIA 1IAHA 3ZO2A 2PVHA 1ZWSA 3LJ0A 5K4IA 4DH5A 4JAJA 5HU9A 4KIPA 1GZOA 2GDOA 4ASZA 2XNEA 4JOAA 3MFRA 4S31A 4RJ8A 5HG5A 3CD8A 3QGWA 3I79A 1WBNA 2JKKA 2XJ2A 2YCSA 4TRLA 1B38A 5B2KA 3F7ZA 2QOIA 2ESMA 3VBQA 4C2WA 5J79A 5KCVA 2QLQA 3UBDA 4ZK5A 4CFMA 4EKKA 1ZY5A 4IE9A 3G9LX 3D5WA 4YBKA 3PXQA 4LMUA 3JR1A 4DHFA 1H01A 1Q8WA 4IADA 5CU3A 4DG0E 4C4GA 2BR1A 3NUYA 4H3BA 4YC3A 4E4MA 4YJUA 2R3NA 4UMTA 5JSMA 3DT1A 3IW7A 3BE2A 2W1CA 3N51A 2PVJA 3OW4A 3TL8A 4DEGA 5F95A 4XYFA 2ETRA 5AV4A 4K18A 2J5FA 3ORIA 3Q53A 4YO6A 4DA5A 1M2QA 3F7WA 4V0GA 2KTYA 2ZV9A 2BFYA 3QX2A 4GFGA 4QMPA 2OZAB 2R3MA 2YACA 3KRJA 3FQSA 4QT1A 2JC6A 4FG7A 4IZYA 2ITWA 4FTQA 3F2RA 4XCUA 3QTWA 4DAWA 3F2NA 3DB6A 2XEYA 4L45A 5DN3A 3UQCA 2J0KA 2JKOA 3VUTA 3DV3A 3LCTA 3R1NA 1U46A 1PXLA 3VUKA 4BL1A 3ACKA 4Q5HA 3QTZA 5AV3A 4U3YA 3LKMA 4QQCA 4C57A 1BX6A 2R64A 3RAIA 3P7BA 3KXXA 3S95A 1UU3A 2BIYA 2FH9A 3TACA 2W1ZA 2BZHB 3LFAA 4BDEA 3EQBA 3MESA 1W0XC 3A7GA 3E8DA 5TR6A 5H8EA 3OCTA 3DJ7A 3COMA 4QTCA 3TDWA 2FB8A 3ZM9A 3ETAA 4R7BA 4TNDA 3MB7A 5FP6A 3QZGA 2YCFA 4KBKA 4XG9A 4U97A 2QO7A 3ZLXA 2UZOA 4R3CA 4O22A 1UA2A 4QO9A 2BRNA 2GFSA 3I7CA 3E64A 3OHTA 4Q9ZA 3HVCA 5ICPA 5J7BA 5CEQA 3S3IA 1R0EA 4EWHA 3V5WA 4DFZE 4H05A 2C68A 4CTCA 3W1FA 4FR4A 4BHZA 3PRIA 2OSCA 2VTTA 4OTIA 4AGUA 4YJSA 4DGMA 4ITIA 4PY1A 4CQGA 3ZS5A 4GW8A 4MNFA 3FL4A 4ENYA 2H9VA 4EH9A 3EJ1A 1S9IA 5JGBA 4BTKA 4L52A 2RG5A 4PP7A 2UW3A 4KB8A 5M06A 1Z9XA 4Q9SA 4OAVB 3QD0A 5H3QA 2C0TA 2X9FA 1UNGA 4BWPA 4D4YA 3NGAA 4CCBA 3TEIA 3RALA 3RCJA 3CE3A 2F7EE 4GUEA 4J95A 1ZYLA 3ULIA 4WIHA 4MBLA 5EH0A 2WXVA 3MS9A 5KZIA 4AS0A 3MJ2A 4USDA 3FXWA 4PUZA 1PYXA 1OKVA 4EH5A 4YLKA 4AGWA 4LV5A 1KV2A 3AG9A 3PRFA 5IQGA 3PIXA 4C4HA 4QQJA 1A06A 5M56A 3FQEA 4MWIA 3EQPA 4RG0A 5FTGA 3RAWA 4K8AA 3ZC5A 4FTKA 3OT3A 3PA4A 3HDMA 3SW7A 3TZ7A 3NX8A 2QLUA 5EHLA 4BB4A 3QL8A 4NM7A 4Y83A 3TZMA 3G6GA 4E5AX 3GC9A 3ZRLA 4EHEA 3S1HA 3MV5A 3AMBA 5DH3A 4BZOA 3JY0A 3FLYA 2UW6A 4ZZOA 4FTNA 1IG1A 3Q4TA 2RGPA 1KE7A 1Q3WA 2LGCA 4PTEA 5J95A 2EXMA 3U87A 3OS3A 4IB5A 3IECA 3NAXA 2QOOA 4RRVA 5HE1A 3TNIA 3HECA 3LXPA 4EQUA 4QNYA 5JH6A 5DGZA 1ZOGA 3HA8A 4JQ8A 4XV3A 3SOAA 3ZUUA 2JKMA 3TT0A 4EI4A 2YEXA 1PKGA 3GFEA 4HPUE 3UZRA 4RIWA 3JUHA 2A2AA 2ZM4A 1YXVA 3QTQA 4ZTLA 4EC8A 4IVCA 2YZAA 4JJRA 5A6OA 3PZHA 3R8PA 2W5BA 4I4EA 4C02A 2VWIA 3C4ZA 2JLDA 1H1SA 3LFCA 4RFYA 5EM6A 3MYGA 2E9OA 5HG8A 4BGHA 2YM8A 1OIYA 3O23A 4KIKA 4G3DA 2BUJA 4GYGA 4L8MA 4U44A 4JLCA 4WRSA 3V5PA 1Q24A 3EN6A 4CMOA 3FY0A 3CS9A 2XB7A 2ZMCA 4NCTC 3OWLA 2C47A 2BZIB 3HKOA 3R2YA 4KS7A 2GNHA 2X7OA 3FZOA 3R21A 3UIUA 5AUZA 1ZYSA 1SVGA 5IH4A 4K77A 5JFSA 1WBWA 4IJPA 3OG7A 5TO8A 2BMCA 3SD0A 3VUMA 3LJ2A 3LMGA 3SDJA 5L6OA 4TYHB 4R6VA 3ZFMA 3BWJA 5CT0A 3DA6A 5HBHA 1H26A 3QLGA 4C7TA 4FV5A 2B53A 2R3PA 4YSJA 1KE6A 3FLNC 4ZMFA 3SW4A 2UZEA 1EH4A 2GTMA 4KKGA 1YKRA 3R9RA 1W8CA 2GFCA 1V0PA 4MF0A 2BCJA 5DR2A 5CEPA 4YURA 5CLPA 4ACHA 3EL8A 4DLIA 4E73A 2C6TA 4EBVA 2GQRA 2GCDA 3FHRA 4CQEA 3Q6WA 2ERZE 2XK9A 4XRLA 5EDPA 4I6QA 2BZKB 3BYVA 3ELJA 4F09A 2XJ1A 4JIAA 1GAGA 3A7FA 3P23A 4XUFA 1HCLA 2P4IA 3F2AA 1PF8A 3CIKA 4J52A 2XNOA 4G3CA 5BNJA 2NO3A 3HYHA 5LCKA 3UIMA 4UX9A 5EYCA 3VBVA 1Q99A 3DBCA 3ZLSA 3DQXA 5EDRA 1OZ1A 3MB6A 4BBFA 4WSYA 3ENHA 4F64A 1Q62A 2C3JA 3MY1A 4DT9A 2PYWA 4UALA 4FSTA 5CQUA 3BWFA 4BDIA 2ZJWA 4OTWA 1STCE 4OR5A 4BIDA 3G6HA 4CT2A 4F9WA 3A7HA 3FMHA 2VWYA 2ZM1A 3TV4A 3UE4A 4RVLA 4QNAA 1K3AA 3OBGA 3SG9A 2W1IA 2OO8X 2BDFA 3P0MA 4QMWA 4DBNA 2YDJA 2XA4A 3KXNA 3ERKA 3BE9A 4EOMA 5ANDA 3BHHA 1OBDA 1VEBA 3GC8A 3NR9A 4RBLA 5CX9A 1M2PA 2R9SA 3FKLA 4FIFA 4RLKA 5IUHA 4O0XA 5JQ5A 1ZYCA 4FKQA 3P7AA 5BUJA 1O6KA 1H8FA 1H4LA 3C5UA 3RAHA 1BUHA 4KRDA 3FUPA 4YMJA 2GNGA 2GNFA 4FTIA 1G8AA 1YI3A 2W4JA 3E8CA 3R01A 1CM8A 4X6QC 3WZDA 2OGVA 2C3KA 2G2IA 2W96B 4LGGA 2CNVA 5A3XA 3O8TA 4O7WA 3PG3A 2I0HA 4W4VA 4IX3A 1YW2A 4C8BA 1JLUE 5EW9A 4C2VA 4HVSA 2J0LA 5DNRA 4LUDA 3R9NA 5K0KA 3IW8A 4TWPA 1OI9A 2OWBA 5H9BA 4UY9A 3TKUA 4FSRA 3NVMB 2J6MA 2PMOX 4FBXA 1UNHA 3D4QA 1PXIA 3DAEA 3PPZA 2HZNA 4CMUA 3EIDA 3OWPA 2VTQA 4XNEA 4QQTA 4G17A 2WIHA 4Q2AA 2WMXA 3RINA 4RC2A 2VTNA 1H07A 3W8QA 4W4WA 4GT4A 4ZS0A 4CV8A 3CY2A 2GS6A 1CKIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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