4X6QC

An isoform-specific myristylation switch targets riib pka holoenzymes to membranes
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
337
structure length
334
Chain Sequence
SVKEFLAKAKEDFLKKWETPSQNTAQLDQFDRIKTLGTGSFGRVMLVKHKESGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVAGGEMFSHLRRIGRFEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFTEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords cAMP-dependent protein kinase type II-beta regulatory subuni
publication title An Isoform-Specific Myristylation Switch Targets Type II PKA Holoenzymes to Membranes.
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 103
structure length 334
sequence length 337
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2014-12-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4x6qC01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4x6qC02
4YLLA 4G5PA 3UG1A 3KFAA 5AP7A 3PSCA 2X6EA 2XNMA 5DPVA 3Q4UA 5BX0A 3OTUA 3CQWA 5KE0A 2CKOA 5AWMA 4C33A 2HZ4A 1G3NA 3HV5A 3F3UA 4YZNA 3ALNA 4RFZA 4AOTA 3HAVA 3COHA 4ZZNA 2EXCX 4L6QA 4AW5A 4YHFA 4D2TA 3DU8A 1NXKA 3MB7A 1FOTA 4J99A 2OFVA 2Z7QA 1ZMUA 2VGPA 3W32A 2QHMA 2UW5A 2X2MA 4XUFA 5E8TA 4ACMA 4DHFA 3DK7A 4X2GA 4S2ZA 2J5FA 4MH7A 3SAYA 3ODZX 5G6VA 5HE3A 4MK0A 4RG0A 3M2WA 4O86A 3NEWA 4U44A 3E3PA 1PXMA 5LARA 5KNJA 4O7NA 3V3VA 4I5HA 3OY3A 1PYEA 2I0HA 1W0XC 3ZEWA 2XKCA 4FL1A 2B1PA 3FMJA 3RAWA 3UODA 4U79A 3FLNC 1SM2A 5IF1A 3R9NA 4U5JA 1NW1A 1FBNA 4YLJA 3AT2A 5CEOA 2UZBA 4DCAA 3QXPA 4FTMA 1OMWA 2ZOQA 1Y8YA 5ACKA 1J7UA 2W9FB 3R73A 4FT9A 4E8AA 3HV3A 3GCPA 4KAOA 4ZSGA 3OXTA 4PDSA 5K5NA 4N70A 4EHEA 4FZ7A 3H0ZA 3NYVA 4W4YA 3NPCA 3P23A 3PA4A 4WKQA 4OW8A 4LL0A 3PRIA 3DV3A 2O64A 4C34A 3V5TA 5DA3A 4AX8A 3ORKA 4BVUA 4O0YA 3A4PA 1SVHA 3LE6A 3EKKA 4G3FA 2I0VA 4GS6A 4BWXA 4ZY4A 3QQLA 2I0EA 4F4PA 2UZEA 3OMVA 4AN2A 1ATPE 4ZMFA 4ANSA 5EG3A 3DFAA 4JQ7A 4ALWA 4BIDA 4EUUA 2BRNA 2XF0A 5HE2A 4CGAA 3IGOA 3NAYA 4QMLA 2RG6A 1MRYA 3SDJA 2CNUA 2OJFE 3I60A 2V5QA 5HCXA 3AMBA 2QCSA 2X6DA 3WZDA 4AZTA 4CT1A 2ZDTA 3PY0A 3CEKA 5A9UA 5IKWA 4FOCA 4MCVA 3TWJA 4E6CA 4EH9A 4YBKA 2WTIA 4AE9A 2I40A 1OL7A 2WB8A 3LFBA 4YJVA 4ERWA 4I4EA 5LMKC 2J0IA 4C61A 4CVAA 4L3JA 4F7NA 4MD9E 4CLIA 4PPAA 5IUIA 1W84A 3A7JA 4Z55A 2E9OA 5KBRA 4FTOA 4RRVA 4WNOA 5IDNA 3W2PA 5M4FA 2GS7A 3CXWA 1AQ1A 5IDPA 2OJ9A 3HA6A 3I0OA 4J7BA 5HX6A 1ZXEA 2H6DA 5A4CA 5J1WA 3BBWA 4CFXA 4RVMA 3KF7A 4FV7A 1KE6A 4EQMA 1BI7A 2YAKA 2A1AB 3QRKA 4YP8A 3QC9A 3UDBA 5AUWA 3NW5A 4BRXA 5LWMA 4FT0A 3Q04A 4GG7A 4GU6A 1H1QA 3QQJA 3ZRLA 1GIHA 3HDNA 5GJFA 3ULIA 3PWDA 2V7AA 3SOAA 3QTZA 3EQCA 4F1MA 2YN8A 3F7WA 4RJ3A 2FSTX 4BZNA 4GJ3A 3II5A 3R9HA 5TOZA 3FI3A 3FZOA 4C4GA 2GHLA 3FI8A 3ZLXA 2YCFA 3ZOSA 5HLPA 3EFWA 3GCVA 5BVOA 4RQVA 3TIYA 3AMAA 4QMVA 3FYJX 4OTQA 3W8QA 2HENA 4RA5A 3MSSA 4FKIA 4K6ZA 3QFVA 1Q41A 3OCSA 3R02A 1KE5A 3R6XA 4O22A 4EK3A 4R7IA 3EN5A 3PXFA 2ITVA 4WNPA 4Y5QA 4CFWA 3PFQA 2C6KA 4GW8A 5IEXA 2ESMA 1SMHA 2ZYBA 3QKLA 2XJ1A 4M68A 5EW8A 3VS3A 4N6ZA 2HZ0A 3M42A 4IANA 4TZRA 5HNGA 3WYXA 4DEAA 3ZC6A 4A4LA 2IPXA 5I9UA 5IQIA 3OBGA 1W8CA 3E8NA 4ZJIA 2LAVA 2O0UA 3P4KA 4G2FA 5CY3A 2WQEA 4X6RA 4I5MA 3FQEA 2JITA 2HIWA 5BVEA 4YJOA 3KULA 5B2MA 5E92A 1VYWA 1Y8GA 1UNHA 5DBXA 5IQAA 1G8AA 3MIYA 4BGGA 3HP2A 1KV2A 2C68A 3R9DA 2O63A 2QOQA 4FG8A 3UOJA 4JIAA 3LFEA 4C4HA 5CWZA 4JLCA 4II5A 5FXSA 1PKGA 4U40A 3V51A 1JKLA 4ZJJA 4B7TA 1U5QA 4CMUA 2Q0NA 1GZNA 2REIA 3AD5A 1R1WA 2R3FA 4I1ZA 4U3ZA 3RJCA 2YJSA 4M7IA 3BPRA 2Z02A 3DTCA 4F9WA 2O65A 4XG4A 2BZHB 4D28A 4DFNA 4JDHA 4YC3A 4XRLA 4PDYA 3Q2MA 5EHOA 4ASEA 3Q2JA 3RK9A 1BMKA 4QYHA 5KMKA 5L8JA 3HGKA 3PA3A 4WA9A 4AOJA 3QTQA 4RJ8A 2PVJA 4TYJA 4D1ZA 4QMWA 2ZV8A 4UWBA 4BBEA 5FGKA 5J1VA 3B8QA 4JG8A 3U4WA 5EKNA 4KIKA 5EW3A 3DQWA 4FSYA 5FBOA 4BBFA 2XNPA 1U54B 2XEYA 5CF4A 5IQHA 2WTJA 5CEQA 3UZTA 2OIBA 2GQGA 4IX3A 2WMQA 4FV3A 5AR2A 5GZ8A 3UC3A 3ZLSA 5LCKA 4GFGA 5HESA 4QMYA 3GU5A 1OKVA 3PY3A 3U54A 3CD8A 3AD6A 4QP6A 4YJSA 4E6DA 4CSVA 4HGLA 5EQPA 1NVSA 1FMOE 2XJ2A 5HU9A 5EQEA 3V5LA 2X8EA 3DXPA 2W1HA 3HRCA 2XYUA 5I0BA 3N51A 3NNXA 2QG7A 5H2UA 3QD0A 3O17A 3D2IA 5IA4A 3EMGA 5HNBA 4FKGA 4E4LA 3HECA 4IVBA 3UTOA 2PVNA 4UXLA 2QOIA 1STCE 4WIHA 4A4OA 4YJTA 1Q8TA 4L43A 5H8BA 3VUMA 3PWYA 5GIPE 4I23A 1PXJA 3HMOA 1IASA 3ZBXA 1XH6A 2E9NA 2IZRA 3BGPA 3G0EA 3NUPA 3OXIA 4C4FA 2XKDA 3QA8A 4I22A 3ROCA 5L4QA 4O38A 4BIBA 3I4BA 4IMYA 4R78A 3UQGA 1CTPE 2PE0A 2C6TA 4CEGA 1TKIA 4AA0A 4ZAUA 3ZFMA 4RIXB 4O7TA 3QD3A 4EBWA 2X7GA 3BEAA 4X2JA 2R3IA 4NJ3A 4JL9A 4BBMA 2YWVA 2VTRA 1UNGA 3D5UA 3FC1X 1KE8A 3ZZWA 1ZZLA 5AA9A 3L8SA 3FMLA 4UWYA 4I6QA 2YABA 3DXNA 2C5NA 2V22A 1Q61A 1XBAA 5LQFA 4L3LA 3BV2A 5DVRA 4UY9A 2OF4A 4YPDA 4WUNA 1QCFA 4AA4A 3JVSA 3N9XA 1BL6A 3BQCA 2PUPA 4AW1A 3WYYA 1URWA 5EQYA 2V0DA 4Y73A 5HBJA 5E8UA 1PMEA 2WQMA 3CR0A 3L9PA 1R39A 4L67A 3P0MA 3TIZA 5FQDC 3R7EA 4FKVA 3VUKA 3FZTA 5HX8A 4XP3A 3VNTA 4BWPA 4DH1A 3TV6A 4ZXTA 2VWZA 5CSPA 4WHZA 3SXRA 2IO6A 4HYSA 4O0UA 4X3FC 3W18A 1VJYA 4M0YA 2FB8A 3QQUA 4IC7A 3F2AA 3ZRKA 3UIMA 1OUYA 3KULB 3DBDA 1G5SA 2PMNX 4ZJVA 3EQIA 4I5PA 4FEXA 3DS6A 4DH5A 1GZKA 1XWSA 2R3HA 4O96A 3TTIA 4F70A 3HL7A 3CE3A 4KNBA 2XNNA 5CU3A 1JSUA 2C3KA 4NEUA 4NCTC 2ZV2A 3BELA 3GFEA 2JIUA 2PWLA 3SXSA 3U4UA 4EOIA 3GGFA 3FY0A 4MAOA 2ZB1A 5AJQA 4EHZA 1R78A 3E8CA 3VUHA 2BR1A 5AA8A 4O7LA 3I0QA 4HVHA 4FL3A 1PMNA 3QZHA 4DGLC 2G9XA 4FTKA 4EWQA 2PVLA 3Q53A 5CZHA 4ZTHA 4D4RA 3VJNA 3ATSA 2XNGA 4OT6A 2KTYA 5IA5A 3FQSA 4DGGA 4KBCA 3VUTA 1B38A 4Z7GA 4TY1A 4ZSAA 2JDVA 5F4NA 4CZYB 2VGOA 3ACKA 5L6OA 3W16A 2QVSE 3MIAA 3UC4A 3FQHA 3LQ5A 3QRTA 1VYZA 1WBSA 3R0TA 4WRGA 4XLVA 5JEBA 4KIKB 3JR1A 4FF8A 4AGCA 4D2VA 2WD1A 4TWPA 3C4WA 3E87A 4MXZA 4HZRA 5AIKA 4ENYA 2CGVA 4IW0A 4FUYA 4L68A 2RIOA 2VRXA 5K4JA 1GZOA 2R2PA 3C4FA 4YGAA 5EM6A 4DEDA 3SW7A 4R1YA 4RC2A 4OTHA 4WUAA 1UKHA 1ZYLA 3NRMA 2EB2A 4PMSA 3TCPA 1PY5A 1LR4A 2B9HA 3SKCA 4BGHA 4FKQA 2YDKA 4IB5A 3AD4A 4YZ9A 5L8KA 5LVMA 5M08A 2GQSA 2GS2A 4CYIA 4ALVA 4KA3A 2X1NA 2ZB0A 5BQ0A 5I5ZA 4EJNA 3JS2A 4C3PA 3E3BX 2DWBA 4USDA 4JBQA 3L9LA 4FEWA 4JVGA 5DT0A 5BVNA 4DAWA 4JQ8A 3D14A 3PP1A 4F9BA 2GNIA 2XJ0A 4J96A 3TDVA 1ZZ2A 3R8UA 4LUEA 3TUCA 4JBVA 2ITPA 2YEXA 1ZOEA 4YZMA 1REJA 2QHNA 2QR8A 3KB7A 1Q3WA 4FIIA 1YI4A 3ANQA 4QP4A 4QP1A 3E7OA 4TWCA 5GINE 1H0VA 5KMIA 5FM2A 2B9FA 4TKSA 4L9IA 5CALA 1VZOA 1CSNA 4I41A 4TYHA 5AV4A 2YIYA 2XCKA 4ACGA 4FGRA 3R1YA 1BL7A 3KK9A 3OP5A 4O7RA 1V0PA 4LGGA 3ZHPC 2YITA 1JQHA 2HCKA 4I92A 2PE2A 4Z16A 2VWBA 4RX8A 3P78A 5FG8A 1T45A 4AE6A 5M57A 3C0HA 4DTAA 2R0IA 2F4JA 1XH9A 3DBFA 4J8MA 3MFSA 3KRWA 5AR3A 2W1ZA 4WOVA 2YCSA 3HV6A 3Q4CA 4X21A 3V5WA 4RGJA 5K4IA 2CPKE 4AA5A 4LGHA 3MYGA 4RSSA 1H1WA 2HAKA 3NNWA 4I5CA 1HCKA 4EH5A 4IBMA 5AUTA 1H07A 1FQ1B 4PP7A 5FRIA 3QA0A 3PUPA 3R7IA 3U87A 3VBQA 4YC8A 3QUDA 4JBOA 3CIKA 4X3FA 3LJ2A 1YKRA 2UVXA 3FSFA 2CLQA 4LRJA 3V5QA 4IB0A 5M4UA 3QWKA 4FTCA 2OXYA 3RP9A 5C4LA 3MW1A 5JGDA 5CSHA 3FV8A 4XV2A 5CAPA 3D7ZA 4UZHA 3ZSGA 5A4EA 2CNVA 3D7TA 4O82A 5KKRC 4W4WA 4WNKA 5GJGA 4L01A 3UYTA 4YNOA 4IWQA 3D0EA 3ZLWA 2WPAA 4YMJA 4NCTA 5HORA 5AEPA 5JH6A 4RJ7A 3OF0A 4XOYA 2Y6OA 2XIRA 3QF9A 4U80A 2A4LA 2C1BA 3TACA 3U8WA 2VTPA 2EXMA 2P4IA 3DAJA 4UB7A 4DH7A 5CU0A 3U6IA 4QP7A 4NK9A 4ANQA 1W82A 3S3IA 5HIEA 2WXVA 3C0GA 3C4ZA 3PJ3A 1M17A 4C58A 4EEVA 5EHYA 3TM0A 4FI1A 5E8YA 4F0FA 5IQCA 3QUEA 4KBKA 1RJBA 3K54A 3LM0A 4AGDA 4OTFA 3C7QA 5K3YA 3GOPA 3E8EA 1XH8A 5DR6A 3ALOA 1DI9A 4R6VA 4L45A 1ZYSA 2YM8A 1Q24A 3ORZA 3DOGA 3PRFA 3AC8A 5EI8A 3RK7A 4C0TA 3RZFA 4EHVA 4FKSA 3P86A 2IZTA 2YLEA 1OKWA 2C6DA 3K5VA 3OUKA 1JAMA 4QP9A 3BE2A 3Q4TA 3UMXA 5KHWA 5CASA 2QI8A 2OW3A 4BTMA 1WBPA 1J7LA 3EQHA 3A61A 1I09A 2JDRA 4TN6A 2QNJA 4V0GA 3POOA 4PY1A 4F7LA 3CPCA 5JFWA 2JIVA 2R0UA 3SVVA 2VWVA 2C0TA 4RJ4A 3SQQA 2R4BA 3VC4A 5M07A 5HHWA 5M06A 5FDXA 2X39A 4CTBA 4BKZA 5KUPA 3H4JA 3R22A 5AM6A 3SG9A 4F6WA 2VTIA 3EFKA 3OFMA 1K3AA 2BRHA 4M8TA 2PZIA 3LCOA 4G9RA 1RDQE 4J53A 5B7VA 5EOLA 3EL8A 5CYIA 2BAKA 3HMIA 4YNEA 5L2SA 2XKFA 5AUXA 1OIUA 3CGFA 4QYFA 1LUFA 4X0MA 3Q6UA 3IOPA 2B4SB 3A60A 3F6XA 4FV2A 1PW2A 4YJPA 3W33A 2VU3A 4FKUA 2BCJA 2OIDA 4NU1A 5HKMA 4DN5A 3S95A 4F7JA 4K77A 3KXMA 3QTXA 5H8EA 4BR3A 4TYHB 3RPVA 4HNFA 4UV0A 3PJCA 4IAZA 4CLJA 4FTUA 5IISA 4NYEA 3G2FA 4I0TA 4C37A 2R3MA 1KOAA 4KWPA 4ONAA 3TKIA 3SD0A 4JJRA 5ETCA 2JD5A 1GAGA 3FC2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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