4XEIA

Orthorhombic isomorph of bovine arp2/3 complex
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
415
structure length
400
Chain Sequence
MAGRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-related protein 3
publication title Crystals of the Arp2/3 complex in two new space groups with structural information about actin-related protein 2 and potential WASP binding sites.
pubmed doi rcsb
total genus 102
structure length 400
sequence length 415
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-12-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 4xeiA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xeiA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xeiA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4xeiA04
4B1XB 3CHWA 4BVPA 3WEEA 5B8HA 1GLBG 5I9EB 3MN5A 2VWBA 3VEOA 3CI5A 1GLFO 4BR2A 5KQ8A 4NO7A 5F1XA 3DXMA 3CJ7A 3R6MA 4PKHA 3WXLA 3U4LA 2FSJA 4QS7A 3C7NA 3U9ZA 3FFKB 3U9DA 2P9UA 2NZTA 3CJ1A 2IVNA 3C0BA 3OHRA 4J8FA 5BPMA 5BRDA 3WUHA 4BQLA 1BWFO 5KPRA 3KHYA 1ZC6A 4H0TB 4I6MA 3SK3A 4H0PA 4MO5A 3QMLA 4LC9B 3ZEUB 1J6ZA 3DXKB 4WYBA 3A8YA 3FE1A 5BN9A 3UE5A 4BRMA 1RFQA 4BR4A 5AFUA 5AQMA 3ENOA 1Y64A 3H46O 1D4XA 2FSKA 3A5MC 2A6AA 4H5WA 4E1JA 1U6ZA 2YJFA 2P9SA 2VCPA 1K8KB 2Q31A 1NGJA 2QW9A 4BGAA 4EAHD 3WEEB 2V7YA 3A5NC 3P4IA 2KHOA 2DPNA 2QXLA 3WQUA 1GLJO 3JS6A 2W40A 2FF6A 3VEYA 4B1UB 4YDUA 5EVZA 1BUPA 4JN4A 3GL1A 3DXMB 1HX1A 5F2RA 3FR0A 4BR9A 4BRGA 5AQVA 1BA1A 3C7NB 4MLEA 1QQOA 5E26A 2E20A 2P9UB 1HKBA 1QHAA 3UKUB 5AZJA 3O8MA 2A40A 2J4RA 3CQYA 3D2EA 2OANA 1C0FA 4I6MB 2P9LA 2ASPA 4L3QA 1YXQA 2IIRA 4B9QA 4H5VA 2AP1A 3VGMA 2A41A 3O6WA 3HSCA 3TPQA 2I7NA 5BREA 3DAWA 3H3OB 5TKYA 2HOEA 3BP8A 4HWIA 4EFHA 2QWOA 1NGEA 1MDUB 1XUPO 2E2QA 1E4FT 3LDOA 4H5NA 2E2OA 5JLFA 2P9SB 4FL9A 4WQ5C 3H3NO 2I7PA 4BRAA 4IJAA 1ATNA 4CBWA 3H1QA 3AAPA 3LDPA 1YUWA 4FWMA 1MA9B 3QDKA 4PL8A 4A61A 1Z6RA 4B1YB 2E8AA 3EZWA 3MMVA 1QQMA 2Q0RA 2A3ZA 4RCHA 1NGCA 3O1BA 3CQXA 3HTVA 4AM7A 2BUPA 3LDLA 4H0VB 4FWKA 4QS8A 2GELA 5E84A 5AZJB 4O8KA 4XEIA 2FSNA 1EQYA 3IUCA 2CGJA 4K42A 2CGLA 4ISEA 2PBDA 2P9NA 3O4WA 2E2NA 5AQYA 4A62A 3D2EB 2E1YA 4FOEA 1RDWX 5EY4A 2E1ZA 2HF3A 2P9LB 1MWKA 2QWLA 3ATVA 1KAXA 1ZBSA 2GWJA 2D4WA 3ULEB 2GWKA 2ITMA 1U2VA 4FWRA 3H6EA 3ZX3A 1T6CA 5JMVA 3S41A 3J8AA 3VEVA 1XQSC 2P9KA 1S3XA 3FZKA 2YHYA 3O1WA 1NGBA 3ID8A 1LOTB 4ISGA 3ZETA 1X9JA 3BUZB 4A2AA 2P9PA 3W0LA 1JCGA 3VPZA 1Q18A 3M6GA 4C23A 2ZGYA 1BO5O 3EL2A 2H3GX 2FXUA 1RGIA 1S22A 2YI1A 3BEXA 4BRKA 3L4IA 3CJCA 5AQKA 2YHWA 2ZGZA 4CD1A 1QZ6A 3I33A 2YHXA 1JCFA 4BRLA 3R8EA 4FWOA 4CZFA 5LJWA 4CBUA 5AQFA 4PKGA 4CZLA 4DHYA 2QWRA 3F9MA 2D1KA 1ATRA 1GLAG 3G25A 2ASMA 2E88A 5AQUA 4FSVA 1MWMA 2IVPA 4CD3A 2V51B 4JAXA 4IZ9A 3WXIA 3JXUA 1NGHA 5ADXH 5KPTA 1HLUA 1KXPA 4JHDA 1TYQA 3CERA 4QS9A 2Q36A 3SJHA 1NWKA 4YDUC 2P9KB 3BF3A 3DJCA 5LY3A 1Z05A 3AY9A 4F9OA 3ZETB 1BA0A 3IMXA 2P9PB 1X3MA 1NLVA 2QWNA 2HMPA 3GBTA 4FPBA 4H5RA 1X3NA 2HF4A 3VESA 5AQOA 3A5OC 1HKGA 2NRHA 5FPDA 5LJVA 4IWVA 3D2FA 3D7EO 3U8XA 1V4SA 5AQNA 5AQSA 4DB3A 5BPLA 5CE3A 2CGKA 3W3DA 3O08A 4BRFA 1BDGA 3GOIA 4BRIA 1NGIA 1P8ZA 2ZF5O 1XC3A 1YVNA 3MN9A 4FWPA 3FZLA 3LDQA 2D0OA 1GLDG 1G99A 4MO4A 4PL7A 1T6DA 1HJOA 2CH6A 5BRHA 2FLOA 1TUUA 2FF3B 4KBOA 4BRHA 5AQJA 3MN6A 3M1FA 4JHDB 1OKJA 1TYQB 3A0IX 1YAGA 2Q0UA 3WXJA 3VGLA 1BU6O 3IFRA 5AQXA 2P9IA 1DKGD 4FWNA 5KQDA 3VERA 4BR0A 3AARA 3GDQA 4H0XB 3ENHA 1BOTO 3WT0A 3GE1A 2Q97A 5BR9A 3FGUA 4EIAA 4CZMA 4H5TA 4FOIA 3WXKA 4K41A 3VF4A 5AQLA 3KVGA 5AQGA 2A42A 2E2PA 5FPEA 2QM1A 2GEMA 4FWSA 3CJAA 1WOQA 3CJBA 2Q1NA 4FWQA 4H03B 3CETA 5ELZA 3CJ9A 4BG9A 1ATSA 4A2BA 5BRFA 1CZAN 4JD2A 3L6QA 2QWQA 3CIPA 3MCPA 3VEZA 1BG3A 2EWSA 2F9WA 4ISFA 4WQ4A 3B8AX 2A5XA 1KAZA 3EKSA 5AQPA 2P9IB 3QFPA 3QBWA 3KZBA 2CH5A 3DWLA 4K43A 2IVOA 2WUSA 3SLCA 3SMSA 3VGKA 3VETA 2V52B 1NMDA 5F0XA 5AQWA 5ADXA 3VEXA 2D0PA 3FLCO 2P9NB 4BR7A 4XH4A 2ZWHA 4Z94A 4CZKA 1JCEA 3QBXA 2YCHA 3UKUA 1HKCA 2W41A 3EO3A 3LM2A 4CZJA 1NBWA 3ZX2A 1IG8A 3AAQA 4BR5A 1U2VB 4GNIA 1ESVA 3O80A 5AQQA 4CZGA 4M63C 4BRDA 1DEJA 4CJ7A 4RTFD 1HPMA 5FPMA 3R9PA 3HI0A 5AQRA 4PKIA 4JD2B 3ATUA 3MN7A 1HUXA 1C0GA 4CI6A 4BRNA 4AM6A 5AQIA 3VF2A 5FPNA 1NGDA 4H0OA 1H1VA 3UB5A 4CZHA 5EOYA 2F9TA 1ZXOA 4IXCA 3RSEA 3WQTA 4CZIA 1NGFA 4FWLA 4FPAA 4K25A 4NB4A 3MK6A 3HM8A 5AFUH 3VOVA 1R59O 5BN8A 1GLLO 4GY2B 3GG4A 1TUYA 4IO8A 1WUAA 4Y0WA 3O5BA 4BRPA 2AA4A 3LDNA 4BQZA 1T44A 2V7ZA 1V4TA 4IJNA 3EKUA 3VEWA 4EHUA 5EX5A 2VYPA 1SQKA 4RWTA 1KAYA 4CZEA 1NGGA 1GLEG 3FZMA 3ZX0A 4BRQA 2QWMA 1NM1A 3TU5A 1GLCG 1NGAA 2GUPA 2NLXA 4XH5A 4BRCA 3IDHA 5AZIA 4BVOA 4O5FA 3MDQA 3UKRA 4MLHA 3HZ6A 3H45C 4B1VA 3M3ZA 3ULEA 1E4GT 3FZFA 2PAVA 5AQTA 4BC4A 4B1ZA 4BG8A 3SMPA 3QB0A 4BGBA 2QWPA 4HTLA 4B1WB 1QZ5A 3EN9A 3VF6A 2YJEA 3LL3A 4DCHA 5BPNA 1LCUA 4EHTA 3D2FB 3RSEB 2Q2RA 1SAZA 4WQ5A 5JICA 3LM9A 4BC5A 2BTFA 4CBXA 4M7YA 3HBTA 1QQNA 4JNEA 4DQ8A 4FO0A 5AQZA 3A5LC 2GTDA 5EXWA 1DGKN 5KPZA 3BF1A 1SZ2A 3H1VX 2ASOA 4M7XA 4BREA 4BROA 5AQHA 4BC2A 3ZEUA 3DXKA 4WQ4C 1IJJA 3FZHA 5AZIB 3I8BA 3L0QA 4BC3A 3VENA 3QICA 4XH1A 3UKRB 4H0YB 2UYTA 3QFUA 5AR0A 5JLHA 1K8KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3C6AA 4CF1A 3CXCM 2ZM6K 2VWBA 3TTCA 1VRTA 1GLFO 2P51A 5F1XA 3R6MA 3VQ8A 4DTSA 3IAYA 1LWFA 2FSJA 3MECA 4EP4A 3CC7N 1ZYQA 4I2QA 3V81A 2IVNA 3V9ZA 3T1HK 2X6NA 5GINA 1KTQA 5BRDA 3WUHA 4BQLA 3U3YA 3HSTB 5KPRA 1LWCA 1EX4A 4H0TB 1NK9A 1YJNN 3HL8A 3QMLA 4LC9B 3P31A 1J6ZA 3DXKB 4WYBA 1QSYA 3EE8A 3FE1A 4JI6K 3OS0A 5AQMA 3OJSA 1QSLA 4E1NA 3H46O 3BDPA 4H5WA 3THXB 3O3FA 4DSEA 3HOTA 4DTPA 4JI7K 1NGJA 3SAHA 1S1TA 2V7YA 1JL2A 3A5NC 4LY7A 5LL6Z 4B1UB 3BY5A 3MEEA 4BRGA 3QEPA 4MLEA 3I0RA 1WNSA 1U45A 2NRZA 4ELTA 3CM5A 3RVCA 4I9LA 3SV3A 2J4RA 2NUBA 1BI4B 2ITGA 2YX6A 3IG1A 3KKRA 3L2WA 4JKBA 1C0FA 2G8VA 1B92A 3SJJA 4H5VA 3VA3A 3VGMA 3O6WA 4DQSA 2JLEA 3VQ4A 4LF4K 2I7NA 3DAWA 1JLQA 1Q7YO 3C6UA 5TKYA 2HOEA 4EFHA 3OYJA 1TGOA 4NLCA 4JI1K 1DLOA 4RW7A 2HBLA 4H5NA 3PO5A 4M3YA 2R7YA 3MXMA 4BRAA 4IJAA 1ATNA 1DT9A 4CBWA 3TAGA 2WBNA 4GV3A 4X64K 3KK3A 3K57A 2E8AA 1T3VA 3P5JA 3THYA 1J5EK 3Q7CA 4CJQA 4KAZA 2YNGA 3CQXA 2BUPA 4G9ZA 2BANA 4H0VB 4FWKA 5M1NA 2G8UA 2FSNA 2FBTA 1EQYA 3NF9A 4K42A 5TKWA 1YI2N 2PBDA 2P9NA 2F7TA 3D2EB 2YNHA 3F9KA 5FRMA 4FJIA 1X9MA 3ZSQA 2UXCK 1RDWX 2HHIA 3J7YP 2HF3A 1LW2A 4MDAA 1Z26A 4CHNA 4KHUA 2FBVA 4IDHA 3CF5L 2GV9A 1U04A 4DLGA 4Z4IA 4OKEA 1DTQA 4FJNA 3IS9A 4FJ7A 4FLVA 1ZBFA 4CECA 3J8AA 2P9KA 2OTLN 3ID8A 3KD1E 1XHZA 1RDAA 4MQ3A 3W0LA 4LFCK 1KFSA 4CJ3A 3EE9A 3LWLA 1Q18A 3G4SN 2NRRA 3NHGA 1NJIO 3OYNA 2HMIA 2ZGZA 3OS1A 2XY7A 3R8EA 4FWOA 4CZFA 2O8CB 4CGDA 3F9MA 3VN5A 4IOAL 3BGRA 3OA9A 4DQRA 2E88A 3K5OA 2IVPA 1M90O 2XY8A 1JXEA 3DLGA 3SYZA 2V51B 4YOTA 3DLLL 1SL0A 3K9KA 1VSLA 4DF4A 2XY5A 1NGHA 3ZSYA 1QVGM 1FXXA 4J2DA 4YOXA 4JHDA 4PA1A 1X9SA 4QS9A 2GX9A 2Q36A 3SJHA 2KFNA 1NWKA 4AHSA 3U3GA 3K5MA 4E0DA 4YOVA 3AY9A 3SAGA 5HROA 1BA0A 3IMXA 4BDZA 2P9PB 1X3MA 2QEXN 3ULDA 4OJRA 4YY3K 2HHWA 4NYNA 4H5RA 3O9TA 1JLCA 1Q82O 1NNEA 1X3NA 2HF4A 3VESA 4BECA 3A5OC 4Y1DA 3ZSRA 1U4BA 2Q3SA 3M5RA 2NRHA 4IWVA 3D2FA 1B9DA 4RW9A 4FJGA 3C65A 3T69A 4X65K 1ILYA 2X74A 5SZTA 4JLHA 3TTFA 3MN9A 4JI4K 3K58A 3FZLA 3F5TA 1GLDG 1T6DA 1TUUA 5KGXA 2NRVA 3ZT2A 3MN6A 1RNHA 2Z1GA 5SWMA 4KHSA 4IFEA 4CJUA 2X6SA 3LANA 1BU6O 3SQ0A 3IFRA 4CCHA 4CFDA 5AQXA 3AVBA 2KKZA 2D0CA 4U7BA 1BOTO 3WT0A 3I56N 3VQDA 1RBUA 4FJKA 3IRXA 4NLBA 4EIAA 4CZMA 4N41A 4FOIA 1XNRK 2QK9A 4K8XA 1RTIA 1YJWN 3K59A 1JKHA 1KVBA 3LPTA 3BZKA 5HBMA 4DSIA 3CJAA 5K14A 3VQAA 4DV4K 3NH0A 2Q1NA 3WNEA 4FWQA 3K2PA 2DFFA 4KI4A 2DY4A 4H03B 3CETA 4W5OA 4DSJA 1XHXA 3G0ZA 3MAQA 5BRFA 4PWDA 3K9JA 2E6MA 4DTXA 2HNDA 1VQLN 3NGYA 1TVRA 2BE2A 1TKDA 4JD2A 3QEWA 2W00A 2EWSA 2KLAA 5C2DA 1WSGA 4DS4A 1BCMA 2HBMA 4F2SA 4LF8K 4GVMA 1NOZA 1JLFA 3DWLA 1Q9YA 3SLCA 4E7LA 3VTHA 3CM6A 3VETA 4J2BA 3O9RA 1NMDA 5F0XA 4GW6A 5AQWA 5ADXA 3VEXA 4ILHA 2P9NB 3WNGA 2DFEA 1RT7A 4JEPA 4CZKA 4M41A 3EZ5A 1HKCA 3EO3A 4AHVA 4DV3K 3ZX2A 4Z4GA 4DS5A 4CGFA 2ZE2A 4CEQA 5AQQA 4CZGA 4BRDA 4UQGA 3B6PA 3OYEA 4JI0K 3O4QA 3ALYA 3HI0A 5AQRA 1RT5A 2VG6A 1T03A 3VQBA 3SCXA 3NVKA 2QA4N 1C1AA 4CJKA 1YTAA 4DG1A 4KPYA 3VTIA 4IXCA 3RSEA 4FJ9A 5HL7L 3VOVA 3P39A 4KTZA 1R59O 2DFHA 3AVGA 3VQQA 4M42A 4WE1A 4Y0WA 3O5BA 2AA4A 4CEFA 1D9DA 2V7ZA 3EKUA 3AVNA 3VEWA 4EHUA 3KK2A 5I42A 1SQKA 4RWTA 1KAYA 4DFJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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