4XG2A

Crystal structure of ligand-free syk
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
273
structure length
259
Chain Sequence
YLDRKLLTLEELGSTVKKGYYQMKKVVKTVAVKILKNPALKDELLAEANVMQQLDNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRHVKDKNIIELVHQVSMGMKYLEESNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADENYYKAKWPVKWYAPECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVTAMLEKGERMGCPAGCPREMYDLMNLCWTYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords Tyrosine-protein kinase SYK
publication title Crystal structures of spleen tyrosine kinase in complex with novel inhibitors: structural insights for design of anticancer drugs
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 259
sequence length 273
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2014-12-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4xg2A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4xg2A01
1SVGA 4I92A 1RW8A 4IC8A 5FEEA 2CGXA 3TTJA 1ZYLA 2C0OA 4S34A 4JRVA 4PP9A 5G6VA 2YABA 2UW7A 3Q4TA 2J0LA 2HK5A 5IH5A 3QCXA 3GC8A 3PIXA 4LUEA 3VF9A 4MD9E 5DR2A 3LE6A 5HG9A 5C8MA 4RJ3A 1URCA 2GMXA 4BDAA 4LMNA 4ZTMA 5LMBA 3R7OA 3ZU7A 3A8XA 4L44A 2CPKE 5ANJA 3QTUA 4F1OA 5LOHA 3DGKA 3ZLYA 1JKLA 2GQGA 2UZDA 5BQ0A 2QOHA 1WBWA 4YBKA 3SV0A 4Z7GA 4OTFA 2B9JA 2F2UA 3CLYA 3WARA 1U5RA 3CTJA 3TN8A 3LXNA 3QQKA 1MRYA 5CSXA 3ZUUA 3BYOA 3EQHA 4IX5A 2XKEA 4YTCA 3ACKA 4TYJA 3TJCA 3ZLXA 3MWUA 4I4EA 5FG8A 3R83A 4L43A 2V62A 4PMTA 4NWMA 5ITAA 2YAAA 1OVEA 4FV3A 3W2RA 4FTUA 3FI4A 3LFDA 4X3FC 2OU7A 3JPVA 4TW9A 1WBPA 3PPJA 4U0IA 4DYMA 5AUZA 2UW3A 4NT4A 5IMEA 1KE9A 4I21A 4YNOA 4XV2A 5LVOA 4JDHA 4MXXA 3DBEA 3R1QA 5IDNA 3E8EA 4DFYA 5L6PA 1S9IA 1KE7A 3MH0A 4EOIA 4AFEA 4YP8A 2QOKA 4XV9A 4JRNA 5L6WL 3IPHA 3B8QA 3PFQA 4R1VA 3AC5A 4YJNA 2PMLX 3QGYA 4ZZMA 5DMZA 5EDPA 3U54A 5CNNA 4C0TA 4ZS4A 4L68A 5C8KA 3TZ9A 3QQLA 3PTGA 1CDKA 3NS9A 5HIEA 4II5A 1OIRA 5AEPA 2A4LA 4Y5HA 4EL9A 4QTEA 4F70A 2R9SA 1YHSA 5LXMA 3F5PA 3FL5A 4YLKA 3VW8A 4U43A 1M7QA 4KABA 5EW3A 3HP2A 4M15A 2VAGA 4BBEA 4XEYA 5FM2A 5IQAA 4FZAB 4JOAA 5GINE 3B2WA 2QCSA 5JN2A 4PTCA 3TWJA 2X7FA 2A19B 3D4QA 3DK6A 3JY9A 4EOSA 5HGIA 2VX0A 4GH2A 4CV9A 2E9VA 2IZSA 3G5DA 1U46A 3MFTA 1WBTA 4PTGA 4F9CA 3TNPC 4EH6A 4C3FA 5TO8A 3ZRMA 3PXYA 5BUJA 3IGOA 5JT2A 4GT5A 3QUDA 4QQTA 5DWRA 3NYXA 4I5HA 1APME 2Z7RA 3DB8A 3C50A 4LRJA 3CY2A 3EQGA 2WTDA 5H8EA 3TIYA 4OW8A 3SOCA 2YHVA 3H9OA 3QD2B 4AZVA 1BI7A 3D9VA 3S4QA 4AACA 5A6NA 3LPBA 3KRRA 2QHNA 4FSMA 2CGUA 2XK4A 2FA2A 3KQ7A 3W33A 4BKZA 1OL6A 3WZKA 4BCJA 3DNDA 2VTTA 3D5XA 4JX7A 4Y73A 5DI1A 3VUDA 4N6YA 4KUJA 5HVYA 5HNIX 3ELJA 1M14A 1OKZA 3KRXA 4EH3A 5CEKA 3QTRA 2BZKB 2QO9A 4QMMA 4RGJA 1YXVA 4YJUA 3U51A 4BCPA 4C62A 4OTGA 4KKEA 2CNVA 3FMLA 3QAME 4H05A 4QP2A 4YUQA 3GOPA 5FD2A 3WF6A 4BDEA 4O0YA 2W1GA 4BR3A 4BBFA 5HORA 2IW9A 4BKJA 3G33A 4AOIA 5KCVA 1ZYJA 2ZM3A 4D5HA 4ANMA 2GS7A 2BVAA 3VO3A 2VWYA 4G34A 4IW0A 4H36A 5JSMA 2PZYA 4QYYA 4ORKA 4YLLA 5CWZA 3TNWA 5EQYA 3OBJA 4IJ9A 4EYMA 3OW3A 2BAKA 1YOLA 3HMIA 1JSUA 3F3ZA 3KKVA 3RHXA 5C1QB 2X0GA 2XNPA 4O0VA 5AV1A 2WOTA 1PXOA 4BDGA 1LR4A 4AGCA 2R7BA 3BYVA 4USFA 3DK3A 2JIIA 1G3NA 3ERKA 4J71A 3EMGA 2YLFA 4V05A 5EHLA 4WOVA 4R7BA 3QKKA 2PUUA 5ICPA 5CI7A 2W4OA 2WTIA 4ZJJA 1V0BA 2PVLA 2XNMA 3RZFA 3DLZA 4FZ7A 3I6WA 4GKIA 4W8DA 3FKLA 3DZOA 5E8TA 4DFXE 1NXKA 2VZ6A 4IWQA 2JLDA 5J8IA 3SW4A 5AP3A 3ZDIA 3IW5A 5CT7A 4D4SA 4O6EA 1JSVA 4W8EA 4XG6A 2BILB 1WCCA 3JY0A 2QLQA 4CKRA 3PVGA 5TE0A 4F9YA 3EL8A 1YWNA 4CQGA 3FZPA 3R8ZA 3A7HA 4M3QA 1XWSA 1NVQA 3VIDA 4TZRA 3CQEA 2PUPA 3SG8A 4W4YA 4BDCA 3PDTA 2XIZA 2XKDA 2IVVA 2J0JA 4XRLA 4AWIA 5A14A 4EJNA 2XRWA 2HZ0A 2GCDA 4WHZA 5KBRA 3KA0A 3F5UA 4BC6A 4JBVA 3EYGA 3I0OA 5AR5A 5CQWA 3VS6A 3DXNA 4BTJA 4H58A 3IGGA 2OO8X 3RTPA 3TNIA 1PMUA 4G2FA 4D2VA 3H3CA 3LLAA 1U54A 1KSWA 3UOJA 2XH5A 3DBFA 3BPRA 4M84A 4CT1A 1YOMA 3SD0A 1M7NA 5CEQA 4FKTA 4FTRA 2YIXA 2H6DA 1OZ1A 4FKOA 3V04A 5M09A 3CEKA 5HE1A 2W5AA 3FZTA 3ORNA 3R7GA 1OL5A 5H2UA 4FEXA 4EI4A 1QPEA 3KXGA 2JC6A 4K77A 5HOAA 3SX9A 3ORTA 4IB0A 2R3KA 3DBQA 2JDSA 4QMZA 3UGCA 3SGCA 1YI3A 5BPYA 2WAJA 4HPTE 4UB7A 1ERKA 4P2KA 2PY3A 5EM7A 2PVNA 2UZNA 3ODYX 4G6NA 3UQGA 3LAUA 5E91A 3QL8A 3TEIA 3ZFMA 4D4YA 4FE2A 4G6LA 3PIYA 5CVGA 2XK9A 2JDOA 4O38A 3BWJA 4FUXA 3NUUA 2KTYA 5F4NA 2R3MA 4F9AA 3IOPA 5IA2A 3MH2A 2CLQA 1A06A 4EH5A 4FX3A 4WA9A 2BROA 5J5SA 4L8MA 2VWZA 2ZMDA 3RAWA 2VUWA 5AJQA 3PPZA 4BHNA 5I9WA 4ANNA 4CRLA 3CCNA 3FZ1A 3TV7A 3V5PA 3WZDA 1H0WA 5D7AA 5KUPA 4GW8A 4IDTA 1UKIA 4ZY5A 1Q8UA 2QR8A 5AIRA 4C4GA 3ZBXA 3FC1X 2CSNA 4XS2A 3GP0A 4UZDA 3ZO1A 5K0XA 3KEXA 2WTJA 4XJ0A 3DQWA 5AR3A 5E8SA 2CNUA 4TWCA 3K2LA 4C57A 5ETIA 4ZTQA 1A9UA 4U80A 4QNAA 4X7QA 4BWPA 4HW7A 2XIXA 2UVYA 2XK3A 1UVRA 5FEDA 4EOPA 2JKKA 4S31A 4KS8A 4CFFA 3R9OA 1YDTE 4EH2A 4F6UA 5JK3A 5LMKC 1FOTA 4YJPA 3ATSA 1WBNA 3BEGA 2BALA 4L46A 5L8KA 3AOXA 3Q9XA 2QKRA 3OG7A 4WSQA 5IKWA 3L9LA 1GIHA 4C3RA 2ZMCA 2OSCA 3V5QA 3V6RA 3KK9A 1H24A 2HENA 4RA5A 3TKUA 3R9RA 4OLIA 3NYNA 1M2RA 3FMKA 1ZMVA 4CCBA 2WMXA 2YCQA 3W2PA 2QHMA 4FZDB 5C4KA 3UIMA 1OMWA 4NW5A 3FQHA 4FICA 4FL1A 4KRCA 3QA8A 4DFBA 1URWA 2GNHA 3FYJX 3HA6A 2W4KA 2QI8A 4EHVA 5IQCA 1E1VA 1J91A 1U4DA 5GNKA 4B7TA 1WBVA 2E9UA 4JX3A 2IW8A 2C30A 3U4UA 2CCIA 2X7OA 3R7IA 3ZTXA 4GFOA 2SRCA 5HI2A 2YDKA 1V0PA 5HICA 3V5LA 5IEVA 5GZ9A 1GNGA 2YCSA 1P4OA 3KRWA 3NNVA 4IJPA 3FKOA 5AV3A 4JIKA 3DY7A 3E63A 4F9WA 5K5XA 1MQBA 4V0GA 2CN8A 2EVAA 4GVJA 5J9ZA 4AGWA 3EN4A 4ASZA 4ZLOA 4XP2A 4GYGA 5EKOA 2IVSA 3VS0A 4ANQA 3SXFA 5KMKA 4QP7A 2BZHB 2VTLA 4TNBA 2HXQA 3Q9ZA 4A9SA 2XRUA 4QMPA 1PW2A 4AU8A 4ENXA 2JKQA 1LPUA 2O0UA 4IZAA 4XG8A 1OITA 4BF2A 4FIFA 1DAYA 4GK2A 4K18A 3DJ5A 1XBCA 1BMKA 3A61A 4I5MA 3CIKA 3NPCA 3PA4A 4MWIA 4PMPA 4BCKA 4OAVB 1VYZA 3GOKA 2X2MA 2XJ1A 3TUCA 3KN5A 3O0GA 2CJMA 4DT9A 2XNBA 3LXKA 4L67A 4L7FA 4PY1A 3NW5A 2YZAA 4XLIA 5FTOA 5LARA 1V0OA 5EG3A 3LCSA 3ZS5A 4E4XA 4YSJA 3S0OA 3CJFA 4C35A 4EUTA 2C5NA 3BEAA 3OW4A 4LV8A 3AD4A 5CZIA 1F5QA 4BCFA 3OWKA 3PA5A 4GMYA 3V01A 3FLNC 4I0SA 5LMAA 3RAKA 4TNDA 3RVGA 2PE2A 3CBLA 3HDMA 3RM6A 2P2IA 1ZMUA 2WMSA 3UO5A 4F7JA 3MFSA 3C4ZA 2UW6A 2HOGA 2C1AA 3FXZA 2WELA 4CV8A 4XG7A 2XYUA 3FZSA 3NW6A 2QKWB 4FSTA 4QD6A 2R5TA 3MSSA 2Z60A 1FGKA 3ODZX 3HAVA 3IKAA 3VBTA 3DJ7A 4WSYA 5I9UA 2BPMA 4A07A 2BDFA 4OBPA 2RFSA 2R3NA 4EK4A 5DR9A 4F0IA 1XR1A 3LCKA 4I0TA 3R02A 1OIUA 2RG5A 4O0WA 4RX9A 4HVSA 5M57A 3C0GA 4O7VA 3MI9A 4AGDA 2B9HA 2LGCA 3BYUA 2X4FA 3M11A 4HOKA 1SVHA 3L9MA 3KMUA 4FV2A 5FTQA 4E6DA 5HIDA 5BMSA 4LM5A 5AR2A 4JG6A 5CVHA 5M4FA 2QU6A 4FTNA 3KXZA 2C3JA 3PXRA 2NRUA 4DGNA 2W1EA 5K4JA 3UDBA 5D1JA 4P4CA 4PDOA 3THBA 1RJBA 4CG9A 2VWVA 1H08A 5EK7A 2IG7A 2UZEA 4G1WA 5DR6A 2DUVA 3G0FA 4B0GA 2QC6A 3Q9YA 4KBCA 4FV5A 4Y85A 3WF5A 2XCHA 4D55A 3KVWA 2OIBA 4FT5A 3VVHA 4AQCA 3BHVA 1XH9A 4UN0C 3QQJA 1PXPA 4S32A 5DBXA 4ZLYA 3V8WA 3E3BX 4BFMA 3AC8A 4CG8A 5EM8A 4CXAA 3ZXTA 4D9UA 4KWPA 2BHHA 3QTSA 2OH0E 3LXPA 4HJOA 5AV2A 3UO4A 5LMKA 1LEWA 4NFNA 4BI2A 1J7IA 2BTRA 4CKIA 2ZB1A 4FC0A 3NCZA 3VHKA 3N51A 5IUHA 2QURA 3FEGA 3U6IA 1NVRA 4I93A 2ETRA 1Q24A 2WEIA 4L3JA 4TYIA 5TF9A 2P3GX 4JAIA 3ZFYA 2YM5A 1KWPA 1LP4A 3CR0A 3LZBA 3MY5A 3WZEA 3MDYA 2QOBA 3A7GA 2JDVA 4U45A 2J2IB 3FDNA 3COHA 5JQ5A 4K6ZA 2C4GA 4N57A 4U97A 1CMKE 2YEXA 5BVNA 4PMSA 3ZM9A 3D15A 4BCIA 2BUJA 4J96A 5ACBC 1TKIA 4EKKA 3ORIA 2WKMA 3ZUVA 2OICA 3BKBA 3I60A 3OVVA 4FGBA 5HG5A 1Z57A 3EQPA 3ID6C 2RIOA 3IDCA 3EQDA 3OFMA 3C4XA 4G17A 3AC3A 4LG4A 2P33A 4IX4A 3MFRA 4KKHA 5IQIA 4JG8A 5EYCA 5M4CA 1OB3A 3QFVA 4FNWA 4Z9LA 3V3VA 5DPVA 4Q5EA 4RWIA 2X6DA 3G9NA 4IAYA 5B2MA 3O23A 5E1EA 4FKWA 3V5WA 4LRKA 1UU9A 4GU9A 4ALUA 4O0XA 3G6HA 4BGHA 1PXMA 4FV7A 2RF9A 5AUVA 2W05A 2QLUA 5T3QA 4DH7A 3PIZA 3LCDA 2LAVA 2OJ9A 4HZRA 1UU8A 4RFZA 3KVXA 4KA3A 4HVDA 5AM7A 4RX5A 5ANGA 3QRTA 5L2QA 2R3GA 5KNJA 2PUNA 4FT3A 3DKCA 3PY1A 4B8MA 1UKHA 1H0VA 3FWQA 4BCQA 2C6EA 3BZ3A 3AMYA 3FPMA 2WQEA 3FLSA 3PP1A 4RIOA 2W1IA 3FY2A 4CKJA 2BIYA 4TYHA 5KE0A 4UWBA 1ZZ2A 2C6TA 3F5GA 5HLPA 4GUBA 1I09A 3QUPA 1H26A 3M42A 2FH9A 1FQ1B 4LOQA 1DAWA 2PWLA 3TACA 2W4JA 2ZYBA 4GS6A 5HCZA 4D4VA 3OWPA 4CFUA 2B52A 3SG9A 5AR4A 4DTAA 3JYAA 3ORZA 4FKLA 3P1AA 3R7YA 1KE6A 5HO8A 4LFIA 2GTNA 4WNMA 2OZAA 2E9OA 3HDNA 3KF7A 3MIYA 4JNWA 3F3WA 3HGKA 4PDPA 4QQJA 4RWJA 1E9HA 3CXWA 3UOKA 5B2LA 2UW4A 3DKOA 4DE4A 4WNOA 2E9PA 2PZPA 3HV7A 1NA7A 2Z2WA 3GB2A 3E64A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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