4XZB | Genus

Total Genus 128

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	128
sequence length	312
structure length	312
Chain Sequence	ERTPVEENGRLQVVGTALLNQHNKPFQLRGISTHGLQWFGQFANKDAFQTLRDDWKANVVRLAMYTDPNANGYIAQPEWLKAKVKEGVQAALDLGMYVIIDWHILNDNDPNLYKEQAKRFFAEMAREYGKYPNVIYEIANEPNGNDVTWEEKIRPYADEVIRTIRSIDRDNLIIVGTGTWSQDVDDVASDPLPYKNIMYAVHFYSGTHTQWLRDRVDAALQAGTPVFVSEWGTSDASGDGGPYLEEAEKWIEFLNERGISWVNWSLCDKNEASAALRPGADPHGGWGDDHLSDSGRFIKAKLIEALEHHHHH

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	CelA
publication title	Structure of endo-glucanase GsCelA P1 at 1.62 Angstroms rcsb
source organism	Geobacillus sp. 70pc53
total genus	128
structure length	312
sequence length	312
ec nomenclature	ec 3.1.2.4: 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase.
pdb deposition date	2015-02-04

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4xzbA00

4R27A 2DT0A 1KGXA 1V02A 4FLSA 3AIEA 4HOWA 1B2YA 1A3HA 4QLLA 5CPTA 2ZXAA 1XCXA 1FOBA 1C7TA 3AXXA 1MXGA 3VIMA 4X9YA 2WMJA 2VRKA 1NWSA 3MO4A 1JL8A 2D23A 1E70M 3AMGA 3L4YA 3ZSTA 1CXHA 2YL8A 4U31A 4P8XA 3U7VA 1DWAM 3FY1A 2FH6A 1UWUA 5JIWA 1HJSA 1J01A 1BG4A 4TVCA 4PTXA 1C3FA 4WJXA 3ALGA 1OWQA 1IV8A 5DEZA 2OSXA 1VIWA 3WUFA 2IXVA 3IAPA 3L2LA 4GO8A 4J3UA 3KL0A 1UKOA 1KGWA 2XM2A 3AFBA 2J7FA 5GNZA 4FK9A 3WENA 3DYPA 1CNVA 1PZ2A 1KWGA 2D22A 1TE1A 5ABHA 5JBEA 3UEQA 3CZLA 1MQQA 3CTTA 1UWRA 2Q8XA 3GM8A 3VILA 4CCEA 3SCUA 3CUGA 3AMCA 2VX4A 5CXPA 1ISXA 1J10A 5AYBA 3AI0A 4JL2A 1GOQA 5FKYA 3VX1A 4D6JA 4W7VA 1QPKA 4EAMA 5HPCA 1MQPA 1CXIA 1GHRA 3WQ4A 3N15A 1XH0A 2XSBA 1VB9A 2JEPA 1CBGA 2VCCA 3LPOA 2EPOA 1KR0A 3VVGA 2CBIA 4RE2A 4M8UA 1EOMA 1H0GA 1SYTA 4OOZA 5FD0A 3VIFA 2UY2A 5IXEA 1WP6A 1JYNA 3SUVA 1XD0A 3L4TA 4C7FA 1JD9A 1BF2A 2WZHA 4W7WA 3WL0A 3WNPA 3BAKA 3PZTA 5BXSA 1WZAA 3AHYA 1NOFA 2CEQA 1W3JA 4JFSA 2VT0A 1B3VA 1N82A 1LLOA 1QW9A 2J7EA 2ZX8A 4QLJA 1W3KA 3VPLA 4PYSA 1VEMA 1E0VA 5D9NA 3ECQA 3VIPA 4Z2HA 1XYFA 1VJZA 4AWEA 3VDAA 1ZB5A 3LPFA 3ZOAA 5C70A 2EPLX 3J7HA 3WL1A 1OD8A 3WN6A 5IHSA 5A95A 1ITCA 4J3SA 1QNOA 1HXJA 1EHAA 4UFLA 1H11A 1GOWA 3BCFA 1W32A 3EDKA 3ZR5A 4ZEPA 3VU2A 4M56A 5ABGA 1W9DM 3UCQA 1TA3A 1HN1A 2NT0A 2W4XA 1SMAA 1Q6GA 4UZUA 2WK2A 1UKSA 3MMWA 3M7SA 4PMNA 1E73M 3VNZA 1KBKA 2G3IA 1BTCA 1GOIA 1CLVA 4B9ZA 2WMGA 4MDOA 4ACZA 3FAXA 4W88A 2AOSA 1WNOA 3B9EA 3OLDA 1K6AA 4AD2A 4YPJA 1RH9A 4H2CA 2DPEA 1NWTA 3NIYA 3BXWA 1HJQA 2DH3A 4UQCA 1HJWA 4A3HA 2EPMX 3FHAA 3WBEA 4CN6A 5A1AA 1Q4NX 1TA3B 4ACYA 4BQ2A 2E0PA 2DSKA 3WD2A 3OZPA 1M01A 4U2ZA 2WMHA 3AZRA 1BYCA 2J4GA 1VRXA 3K4DA 4J7RA 2CERA 1XC6A 4ACZB 3AS0A 4H8VA 1G1YA 5FCZA 1E6ZA 1BGGA 3EDEA 2XGIA 4P8WA 1LL7A 3W0KA 1CXKA 4BZYA 1GCYA 4IPLA 3AROA 1YQ2A 1AMYA 2CPUA 3QOMA 1TVNA 2WBGA 2WHKA 5DT7A 4MADA 2V5DA 2XVLA 3WD3A 4MNKA 2C7FA 2HVMA 4AD4A 1GUVA 4IUGA 1HKJA 3AQUA 4D6GA 1K9EA 2PBOA 1HL9A 4UQAA 1GQJA 1BVZA 5KEZA 1ODZA 1US3A 2WM0A 3AIUA 2C8NA 1E3XA 4PUDA 2WCGA 2A3AA 2WAGA 4S3JA 3W82A 2VMFA 2WZIA 5EMYA 1H0IA 1UKPA 2V3DA 4CN4A 5BXPA 3MSGA 3F4VA 3MMDA 1B0IA 4DUVA 1R8LA 4IM4A 1GZJA 1F4AA 4OIFA 1GOKA 4U5KA 3AIQA 2WC3A 3WELA 4H8HA 3AMDA 1V6XA 1UOKA 5AC4A 1UYQA 2F8QA 5E0CA 4DUWA 2ZWYA 1VFUA 2WCSA 3U7BA 4UOZA 4YHGA 1I1WA 4PMXA 4CGTA 1QNQA 3I3BA 1DEDA 3RCNA 1J0YA 4TTUA 2J77A 5HNNA 3GXMA 5GQBA 2VRJA 4LGXA 3A47A 1VEPA 3AHZA 3T08A 5HDRA 1HKIA 2VZSA 1O7AA 3NDZA 1WDPA 1R86A 2BY1A 3O9NA 1HIZA 1OIFA 3SEPA 2ZE0A 2V3FA 3I3EA 1JZ2A 1YHTA 1L0PA 1JAEA 4HMCA 3AS1A 4NRRA 2WMFA 3THDA 2ZX5A 2X2YA 3MMUA 2YL5A 1B3XA 2J75A 2YDQA 4RL3A 1UWQA 1BQCA 3N1AA 4AZCA 2VL4A 3OIHA 3CUIA 2BY2A 3QHNA 3VNYA 3DECA 1G5AA 3GNRA 2AAAA 1L8NA 1UQYA 3PZIA 2FHCA 3WDHA 2F2HA 3T0BA 2V38A 1J11A 4HTYA 3TP4A 4BF7A 2WW5A 4HOZA 2CESA 3WDPP 1EDTA 3THCA 1V6WA 4W7UA 3UR7A 3BMVA 3RILA 2PWEA 2ZUSA 1K9DA 2GJRA 7A3HA 4KRUA 3GYCA 2ZICA 5A6JA 1V3MA 2VUYA 1JXKA 2ZUNA 1W9BM 1TZ7A 2BNJA 4AZCB 4WKAA 4AMCA 1VEOA 4BQ5A 3WMSA 4JFUA 1MXDA 2WWCA 5BXTA 3KEHA 1E6SM 2XVGA 1B30A 2VO5A 3M46A 1R87A 2ZX7A 1HX0A 5GPRA 5D9MA 1CIUA 2VNCA 2DSVA 4P7LA 4J3XA 1BFNA 2UY3A 3WQVA 1EGZA 4ATWA 1EIBA 3W26A 1E4LA 2DQXA 2UWFA 1W2VA 5A8QA 3S6TA 3RO8A 3VGEA 3RIKA 2D0FA 4XX6A 4UQDA 2D0HA 3ARYA 4UFMA 5CGMA 2OYLA 3WUEA 3IANA 3F5LA 3VMNA 2J74A 4PCTA 4AY1A 4AXNA 4FLQA 3CZEA 3LPPA 4LX4A 1E43A 2YOCA 3ZO9A 4CCCA 4CUCA 1PAMA 1XSIA 1OSEA 1MW0A 2CHNA 1CPUA 3L4WA 3FXYA 1WE5A 2XSAA 3IAQA 1B3WA 3RM4A 1ZJBA 3TTSA 3O2LA 3AMLA 2JF7A 1W9VA 4RE4A 3A6OA 5DO8A 1H49A 2XFYA 1HVQA 5E0FA 4MB5A 2FGLA 1E6QM 1OBAA 1TVPA 2UY4A 4FLOA 4M81A 1BYAA 5D9OA 3NSNA 2VTFA 4GQRA 1UR9A 1WKYA 3MKKA 1QI4A 3T2OA 2EBNA 5A2AA 2VZOA 3MS8A 1MW3A 1XH2A 3N04A 2D24A 3WD1A 3VGBA 1CDGA 1E4MM 2G41A 1UD2A 2E9LA 2O92A 4U2YA 4D1JA 4HMDA 4PMYA 4OJYA 5ECUA 5IFPA 1MW1A 3W81A 4UOJA 3WDRA 1DWHM 1GORA 3FW6A 4B9YA 2W61A 4OKDA 1F4HA 3T2QA 2VX7A 4GIAA 1B3YA 1GPFA 1DHKA 1ZU8A 2CBJA 1ISYA 2ZUVA 1V3KA 4ZXLA 1QVBA 5I77A 4MAZA 4UQ9A 3VMPA 3NJ3A 4C7DA 3IJ8A 4J28A 4H7VA 8CGTA 5I23A 4UFKA 1NP2A 5I2UA 1XH1A 3CZ8A 2IUZA 3W24A 4D71A 1NOUA 3ZIZA 1E15A 2ZXQA 4OBSA 3GZAA 4W87A 1XV8A 3ARXA 5IFTA 1GVYA 2EJ1A 1X6NA 4YHEA 4A4AA 3UG4A 3BH4A 2EPNA 5EB8A 4QCFA 4AYSA 1E4IA 2A3EA 1O6IA 3AZSA 1FP8A 1W1TA 1FFRA 1V6YA 1MYRA 4AZ5A 2OWCA 3T0AA 4AIUA 1QI2A 2YL9A 1JNDA 4GO9A 1MVYA 1JD7A 2DT3A 1UR4A 3BGAA 3K8MA 4JL1A 1E6RA 1CLXA 2D20A 1ZL1A 5E6YA 2DSZA 5A6SA 3A4XA 1CGYA 5D8WA 2VZUA 4HMEA 2PI6A 2BV9A 2JE8A 4GZIA 1OGBA 3SCNA 4CVWA 4P7NA 4AIOA 3ZT6A 4JCLA 2VC9A 5I0DA 4B3KA 1GQIA 4TOQA 4AD0A 1W1VA 3OLEA 3WEOA 1GJUA 2WHMA 4PMZA 3AHVA 3WDQA 3CMGA 2XFRA 2PWFA 4DWSA 3CH9A 3WH6A 3AICA 1JZ4A 1LWJA 1JDCA 3CGTA 3LMYA 4CN1A 2WVTA 3OG2A 2DIJA 3WEZA 1D3CA 2VURA 2BVDA 1B90A 1PX8A 3GH4A 2XJ7A 3GBEA 3PZGA 1B31A 1J0ZA 2VCAA 3VM7A 4W8AA 1GOMA 1HKMA 3BCDA 3W28A 1OB0A 4KGLA 1PPIA 4TTGA 2FDMA 1E0XA 3WY1A 1EOKA 5A6LA 7TAAA 3KL5A 4QDMA 3RPMA 1CYGA 1EDQA 1Y7VA 3DHPA 4QLKA 2WLZA 3AYSA 4DWSB 3DYMA 4CU6A 5GNXA 1BYBA 2PB1A 1W3LA 2DDXA 2DT2A 4DM1A 2CYGA 4U3AA 2QLYA 3MU7A 4PCSA 4J27A 1CGXA 1MWOA 2WC7A 4D6EA 4GI6A 2VZVA 3PZUA 1PX3A 2W62A 1QNSA 1SFSA 4PUEA 3SCTA 3WIJA 3VKKA 3CHDA 1XRVA 3E1F1 4Z2JA 5A8MA 3DYOA 5BXRA 3W4RA 3ZSSA 3SCSA 5JUVA 1JZ8A 2BVYA 3RDKA 4D6IA 1UG6A 3OGSA 4CD5A 1EH9A 1CGVA 3A4AA 3FAWA 5IDIA 1MFUA 5DT5A 4Q7NA 1UA7A 1MW2A 2VQUA 4UFJA 1BLIA 1IT0A 1R85A 4P8UA 1VAHA 4W86A 4JKKA 2WVUA 4MNJA 2CHOA 4F66A 1CZ1A 2X0HA 4HA1A 1UUQA 3LPGA 5CSYA 4WIWA 5CPQA 1U30A 3DC0A 1WCGA 5LA1A 3N17A 4L4OA 1E5NA 4U3CA 3RM9A 3SUUA 1NWRA 1OCQA 1D2KA 5LA2A 3GDBA 3WSUA 1CGUA 2YLAA 1LL6A 3NUKA 3UERA 4W84A 1LQ0A 2O9TA 3WEMA 4PMQA 1V3JA 3BLKA 3VIOA 3JUGA 2J7HA 5D8ZA 1KBBA 5ABFA 1AVAA 3W29A 3GXDA 5JIPA 1JAKA 3F5JA 3T09A 2VX5A 5I24A 4N0RA 1HL8A 1UWSA 3HN3A 4JKLA 2NSXA 1HNYA 3GXIA 3VGFA 2GDUA 2X09A 2VR5A 4UCFA 4W5ZA 2JFEX 3BAJA 3K4AA 1DWFM 1DP0A 2WMIA 4DM2A 2A3CA 4KGJA 1WZKA 4TUFA 3ZM8A 1JYXA 2ZIDA 4OBRA 3B8SA 3IJ9A 4AEFA 5GNYA 1CTNA 1C92A 2D2OA 2VOTA 1DWGM 4Z2LA 4Y7EA 2XG9A 2W67A 5ABFB 1ZJAA 3HMCA 4H8UA 5M17A 2ZXDA 2WYSA 5FIPA 1PIFA 3A4WA 1ITXA 1H2JA 2GDVA 1WZMA 5TD4A 2WLYA 1V08A 4GINA 2XFFA 4X0NA 4EK7A 2WMIB 2J78A 3GH7A 2G3MA 2NW0A 2DGAA 1VFMA 2CKSA 4UFHA 2IXUA 1IZJA 3CUHA 1QBBA 3QGVA 4KH2A 4P7RA 1KQZA 3ARSA 2VQTA 2MANA 4R5EA 1C8XA 6TAAA 4KWUA 5DF0A 3BAWA 3SCQA 4E2OA 1UD8A 1KXQA 2W91A 3GNPA 1RD6A 3UESA 4URIA 3PZVA 3QHMA 3VGDA 1J9YA 3WNNA 1ESWA 1AQMA 3AOFA 3GH5A 1OT1A 2D0GA 4HA4A 3WNMA 2NT1A 1JDDA 3II1A 1E72M 4AW7A 2X1IA 2XIBA 5A6MA 1WDQA 2Y2WA 2JF6A 4M82A 3NCOA 4DWSC 5JBFA 4F9DA 1BGAA 4XUYA 4LYRA 2CNCA 4W85A 4XB3A 5A2CA 1E6PA 2WBKA 1IZKA 4DUXA 1JZ7A 3PTMA 3OLIA 1B9ZA 2PWGA 4B3LA 2JEQA 4P7QA 4B16A 1E6NA 5BRQA 2QHAA 2WCAA 1LF1A 4Z2KA 3AXIA 1GVIA 1QI3A 1JDAA 2XPKA 1US2A 1Q6CA 2J47A 2YBTA 2BXYA 3DHUA 3ALFA 2J62A 3IJ7A 2XIIA 1E3ZA 4PRWA 3QHOA 4B15A 1H41A 1QI5A 4E8DA 4CD7A 2Y5EA 1QHZA 3N11A 1EHNA 1KXHA 2CIPA 2E8ZA 3AIBA 5A94A 1J18A 2CETA 1TMQA 4HU8A 1JFXA 1KXVA 2YIHA 1JI1A 4GI9A 3VM5A 4EE9A 4AZ7A 3PN8A 4S3KA 1E4NA 2YA2A 1FA2A 5I6SA 3GNOA 2GJXA 3CUFA 4BCEA 1LJYA 2WMKA 4JHZA 1V3LA 2EO7A 1UR0A 3NSMA 3SCVA 4AISA 1E55A 5D9PA 2Z1SA 2PC8A 3RJXA 1NQ6A 3VD3A 2VVNA 5EBAA 1AQHA 3K8LA 3PZ9A 5A8OA 4HPGA 1AQ0A 3AMKA 5CZKA 3OB8A 3VUPA 1ZBVA 3PZMA 2YL6A 5A6BD 2PBGA 5I78A 3VTRA 3PTQA 4ML4A 1HVXA 2GSJA 1FP9A 4QP0A 2G4FA 4PTMA 2XWEA 1LWHA 1ODUA 1VF8A 3G6MA 3L4XA 2YDSA 1Q6FA 4PEEA 5C71A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1GON A;  2XHY A;  4J3V A;  5CLW A;  4PMU A;  3MUY 1;  2OSW A;  4MTV A;  5EFF A;  1KCL A;  2Y8K A;  4MNL A;  1QNR A;  1XCW A;  2WKG A;  3AIW A;  1C93 A;  1QBA A;  1U2Y A;  1ZS2 A;  4D6C A;  3WH5 A;  3WF0 A;  4F79 A;  2A3B A;  4AIE A;  2XUC A;  6CGT A;  2YJQ A;  1HF6 A;  1FH7 A;  4MDP A;  1I75 A;  3MUZ 1;  2XWD A;  3AHT A;  1S46 A;  3CO4 A;  5CGT A;  2W63 A;  3WH9 A;  4XV0 A;  5IHR A;  2VI0 A;  5I79 A;  4OZO A;  2BXZ A;  3VIG A;  3AIV A;  4E8C A;  1RPK A;  1UD4 A;  4MB1 A;  1MQR A;  3U5Y A;  1DTU A;  3WQ5 A;  1Z32 X;  1UR1 A;  4WSJ A;  2WKL A;  3CZK A;  5A2B A;  3KL3 A;  1EO5 A;  1J0H A;  3ARQ A;  3EMC A;  2F61 A;  1H3G A;  1QW8 A;  1GW1 A;  4W93 A;  1CXL A;  3VDC A;  2J7G A;  1PJ9 A;  4ZE4 A;  3WFL A;  1QHO A;  2WVV A;  1E9L A;  2GJP A;  1BVN P;  1OGG A;  1TR1 A;  3PHA A;  3OBA A;  1V6U A;  1EQP A;  1JNE A;  1CXF A;  2VR4 A;  1NOW A;  3ZT7 A;  2X8R A;  2WPG A;  1JG9 A;  2V3E A;  5AYI A;  3VD7 A;  4PN2 A;  2GUY A;  5ABE A;  4IIS A;  2Y4S A;  4W8B A;  1X6L A;  2CIT A;  3OA5 A;  4PBG A;  4PMD A;  3FHQ A;  2ZXB A;  1KCK A;  1EO7 A;  1UD6 A;  4D6F A;  1CGT A;  4NF7 A;  3K8K A;  1DWI M;  3SCR A;  4M29 A;  3TTY A;  1ISV A;  2DSU A;  2WVV B;  1J0I A;  2QPS A;  3WF1 A;  2J25 A;  1VBU A;  4XZW A;  2WZE A;  4JFV A;  3TON A;  1FFQ A;  1V0N A;  3BSG A;  3APG A;  3GBD A;  4IPN B;  4Z2I A;  3SUS A;  3WH7 A;  1UKT A;  3WD0 A;  4DWS D;  3CZJ A;  1Q6E A;  1OM0 A;  1W2P A;  4AZH A;  4AZB A;  3IK2 A;  1XHG A;  1Q6D A;  2CBV A;  3WBA A;  3HU7 A;  4BA0 A;  2BY3 A;  9CGT A;  5HOS A;  4J3W A;  2ZUM A;  3TA9 A;  4P7O A;  5CG0 A;  1V3I A;  4MAV A;  4W89 A;  3WQ6 A;  1OT2 A;  1C8Q A;  1CEN A;  5A6B A;  2BS9 A;  1ZBW A;  1UZ4 A;  2UY5 A;  2HIS A;  1JF6 A;  2J79 A;  1FH9 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1JD9 A;  4W7W A;  4RNJ A;  3WQO A;  1P0B A;  1WZA A;  1VD6 A;  2ABB A;  4LS2 A;  3HPA A;  4EF9 A;  1LLO A;  1WKE A;  1QW9 A;  5I00 A;  2J7E A;  4QLJ A;  1W3K A;  2PGR A;  4PYS A;  1ALD A;  1E0V A;  2FLI A;  2NSO A;  3TJI A;  4LY4 A;  3ECQ A;  1PV8 A;  5CPO A;  3QQ1 A;  1T7L A;  3VDA A;  2QDE A;  4NJJ A;  2W0U A;  4XZI A;  3QTG A;  3EOE A;  5C7V A;  5AEC A;  4RNI A;  3J7H A;  3GND A;  5IBX C;  1XYM A;  2Z0I A;  3EPN A;  4YNG A;  3WN6 A;  5IHS A;  1ITC A;  1QNO A;  4UFL A;  1H11 A;  2JQX A;  3MYP A;  4JTG A;  1W32 A;  3EDK A;  3ZR5 A;  1N7K A;  3M5X A;  4FIQ A;  3HGS A;  1Z41 A;  4GHR A;  5T9B G;  3W86 A;  2X40 A;  4M6U A;  1Q6G A;  1YW1 A;  2WK2 A;  1FUY A;  2PRM A;  1GOI A;  3HFT A;  4B9Z A;  2WMG A;  4MDO A;  1IXQ A;  3OLD A;  4H7Z A;  3AAM A;  2KZH A;  5F4X A;  4F0L A;  4HHL A;  2DPE A;  2DZW A;  3NIY A;  3BXW A;  2AL2 A;  2HBV A;  2GSE A;  2OX4 A;  2FIQ A;  3HUR A;  4A3H A;  1YDV A;  3UXI A;  3FHA A;  3WBE A;  3SSJ A;  3ANY A;  2W9M A;  4BQ2 A;  3AO0 A;  2E0P A;  4GME A;  1S5W A;  4IPI A; 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4XZBA

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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