4YC8A

C-helix-out binding of dasatinib analog to c-abl kinase
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
269
structure length
259
Chain Sequence
DKWEMERTDITMKHKLEVYEGVWKKYSLTVAVKTLMEVEEFLKEAAVMKEIKHPNLVQLLGVCTREPPFYIITEFMTYGNLLDYLRECNRQEVNAVVLLYMATQISSAMEYLEKKNFIHRDLAARNCLVGENHLVKVADFGLSRLMTGDTYTAHAGAKFPIKWTAPESLAYNKFSIKSDVWAFGVLLWEIATYGMSPYPGIDLSQVYELLEKDYRMERPEGCPEKVYELMRACWQWNPSDRPSFAEIHQAFETMFQESS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Tyrosine-protein kinase ABL1
publication title Conformation-Selective Analogues of Dasatinib Reveal Insight into Kinase Inhibitor Binding and Selectivity.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 259
sequence length 269
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2015-02-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4yc8A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4yc8A01
3DBQA 4M69B 2C3KA 4F99A 1UVRA 2XEZA 4IWOA 4MVFA 4U80A 3DNDA 4U5JA 4RJ7A 4JOAA 4WHZA 4BB4A 2QHMA 4FTUA 2AC5A 3VS5A 4CMTA 3F2AA 3E8NA 2R5TA 4WG3A 4D5HA 3LKMA 3KC3A 5FDXA 5T6KA 1Q8TA 3FDNA 2CNVA 3LLAA 4RC2A 3OW4A 3RM6A 4DGLC 3AC2A 5CLPA 4YPSA 5BUEA 5M53A 3BU6A 4NZWB 2XIRA 4L43A 2WXVA 4UMQA 4EWHA 4PRJA 4GKHA 5HO8A 2XK6A 3PP1A 3PYYA 3SAYA 4GEOA 1YRPA 1JVPP 3Q60A 3TV4A 3UJGA 3TTIA 3ZLSA 3WF7A 3QZIA 2UW5A 4M84A 2IZSA 4QP3A 3IO7A 4M66A 4D28A 5DHJA 4R1VA 3FLQA 4QTBA 3UBDA 3QHWA 3DK6A 4W4VA 2W1ZA 5BYZA 3QQFA 4IB0A 2OFUA 4OLIA 3B2TA 5EM8A 3ZUTA 4AACA 4B8LA 1YOLA 5HLWA 3ANRA 5HU9A 5EYDA 3KVWA 4ACCA 5ANIA 5CT0A 2C3LA 3UC4A 1VR2A 5AR4A 5CYIA 4XP3A 3EH9A 5EI6A 4D2SA 3BCEA 2J4ZA 3MYGA 3QQHA 3WYXA 3QWKA 2AUHA 3LXLA 4BZDA 4RZWA 1XR1A 3ZRKA 2R3PA 4NFNA 5EYCA 3DJ6A 2C1BA 4KABA 1H1WA 4TWCA 1ZARA 4FV5A 4A06A 4AQCA 4FKLA 3UMXA 5CEPA 3KQ7A 3PJ3A 1JPAA 1ZXEA 2IZRA 3BELA 3D15A 3IQ7A 3Q5IA 3QTXA 3D94A 4O7ZA 2ZV7A 5E8VA 2C5VA 4QRCA 4JDIA 3QCXA 4RIWB 4ANNA 2XP2A 1NVQA 4O82A 3CJGA 2Q0BA 3FKOA 2ZV2A 4I0SA 3ZXTA 1S9JA 3RZFA 1MRUA 3GT8A 2OFVA 5I4NA 3OBJA 3FYJX 5IA4A 2QURA 5CALA 1WBOA 4FTCA 2GQRA 1WBTA 3NWWA 2Y4IC 4BDJA 5CAQA 3EWHA 4K0YA 5HI2A 4HYSA 4UN0C 2FA2A 5L8JA 5CSHA 1IEPA 4JLCA 3IOPA 4PX6A 2ZV8A 1UKIA 4DGGA 5HVYA 2GPHA 2ESMA 5DEWA 4MCVA 1JAMA 4BZNA 1M2RA 2CN5A 3R2BA 4C38A 1BMKA 1QPJA 4F9WA 5HBEA 3SVVA 3MY0A 1XH7A 4ANSA 3ORMA 3GENA 5BVWA 3NAXA 4H3PA 3O7LB 4IAZA 4PNIA 4AZSA 5J7HA 1H4LA 1J3HA 1PMUA 4ITJA 4WT6A 4E73A 4FEWA 5C8MA 3VWAA 5ITAA 3S1HA 4DTAA 1PXPA 1OITA 1P4OA 4IWPA 2RSVA 3LMGA 3ETAA 5KMOA 1WBWA 1KOBA 4HNIA 3MWUA 3EB0A 3ORKA 3E7OA 4JNWA 3SG8A 4LI5A 3AG9A 3OT3A 4ZZMA 3UE4A 3RGFA 5AAEA 5J1WA 3OEZA 1U59A 4QQCA 3I6UA 2IZUA 5AM7A 4IAKA 4DHFA 3KA0A 3U87A 3VBXA 3QD0A 2RFNA 1H25A 2P4IA 1KSWA 3A8XA 4C59A 4D55A 3W2PA 5F4NA 2YIWA 1Q8YA 4FKUA 2CSNA 4PDPA 3Q32A 2HOGA 2E2BA 2WOUA 4ITHA 3RNIA 4HVHA 3KRWA 4TT7A 2XNNA 5AR8A 1XKKA 4KBAA 1YOMA 2JBPA 3OXTA 3U4WA 1WFCA 5LMBA 2GS6A 3NYVA 2UZUE 3S4QA 1DI9A 2W1FA 2WTVA 3ZCLA 4EONA 5D11A 2VTQA 3F5UA 3HAVA 3FUPA 4G1WA 3VVHA 3UOHA 2UW8A 2QU6A 4E26A 2IVVA 4L3JA 5IUHA 4MF1A 3ANQA 3TWJA 2ZV9A 2WFYA 2WTKC 5FP5A 5C9CA 2I0EA 2HAKA 3KMUA 4I4FA 2WQNA 1JKKA 2W05A 2Y6OA 3DZQA 3V6RA 2C4GA 2NO3A 2IO6A 3GQIA 4AWIA 2OZAA 3CPBA 4FZDB 3VW6A 5LJJA 2LGCA 1JKTA 4L00A 4I5MA 1OBGA 2QI8A 3FZOA 4LUDA 4O0YA 4I41A 2BDWA 4HVSA 5K9IA 3AXWA 4BDHA 1YOJA 4YMJA 5M44A 3EHAA 3SXSA 3UZRA 3HVCA 3ZMMA 3S95A 4A4XA 1SZMA 1WCCA 3M1SA 1DS5A 2IJMA 3BIZA 3FJQE 5EDQA 3HX4A 2IWIA 2W4KA 3LPBA 4UXLA 3NW5A 3ZFYA 1ZMWA 5BPYA 4BVUA 1OKZA 3MFSA 4C4EA 3W32A 3OTVA 4RQVA 1F3MC 3TTJA 3ZEWA 1R78A 3ZO1A 4CQGA 3GGFA 3THBA 1ZAOA 2XA4A 3TZ7A 4DFNA 5I9ZA 4F63A 5M57A 4O2PA 1IRKA 4Y83A 3DFAA 3ORNA 3R9DA 2GSFA 2XIZA 5AUXA 4I5HA 4DFZE 4DH5A 4J98A 1NVSA 4E1ZA 1ZYJA 5HX8A 4B0GA 4L7FA 1JWHA 4RC4A 4DH1A 4O6LA 2W1CA 3NPCA 5K4IA 5C26A 4M12A 3UZPA 3UIBA 2YFXA 5AM6A 4TPTA 3EN4A 2XNPA 1YI6A 2PUUA 3O71A 3SG9A 1XH4A 3P7AA 3PXRA 4GH2A 4RIXA 4NEUA 4Y72A 5M4CA 1XJDA 3BKBA 3TL8A 5J95A 2AC3A 4FV3A 4FUXA 5C27A 4ZZNA 4AGWA 5CANA 1OMWA 4FSQA 2FUMA 1SNUA 2OJFE 3ZBFA 1PMNA 2JIVA 5JFVA 4FL3A 4NTTA 3NLBA 3P7BA 4ZSJA 4DEAA 3KXZA 4I94A 2QR7A 4C36A 4USDA 4YJVA 3RVGA 3ATSA 2XS0A 4CYIA 3FMDA 4ZLYA 4E8AA 4DA5A 4D2PA 3D9VA 2P0CA 4FL2A 3T9TA 5F95A 4FKTA 3FL5A 4IFGA 4RG0A 4X2KA 3HLLA 1H01A 4QMPA 4EZ3A 5AAFA 3Q2JA 1U5QA 4V0GA 3VS2A 3QD3A 4RVLA 4JRVA 5HD7A 5K3YA 1X8BA 4CTCA 4WD5A 4K9YA 3LM0A 4FSNA 1REKA 2PZYA 4GK3A 4QMWA 4KRCA 4DG0E 2QC6A 2FB8A 5CASA 5CEQA 3FEGA 3FI2A 5HO7A 2YDIA 4NT4A 2OU7A 2E9PA 3P08A 4C35A 4FEUA 4J52A 5CQUA 2QOFA 3HGKA 5D7AA 3H9FA 4MNFA 2W1HA 5HIBA 3OXIA 3HMIA 3ZO3A 4BCOA 3BRBA 3VUTA 2X8DA 3IECA 3NCGA 4I20A 4YZMA 3BGQA 4DFLA 4YJOA 4MWIA 4BTKA 3MN3A 4G5JA 3RPVA 2F4JA 3FQEA 5AFVA 3HL7A 4J71A 1UNGA 3CCNA 3L8PA 3FMJA 3GUBA 4FKRA 4BGQA 4W9WA 3W2QA 3MH0A 4IWDA 4X3FC 5BNJA 4UZDA 4OTQA 2OICA 2JFLA 4BIEA 5BYLA 3D4QA 1KE9A 3NRMA 3MJ2A 5IKWA 4JJRA 3U55A 4BCFA 1Q99A 5HD4A 3KRXA 1QPEA 2GS2A 4BI0A 3DBDA 2R0UA 3JUHA 4TKSA 5CY3A 4L42A 5AP5A 2C6TA 5HBHA 1IR3A 4AA5A 1LUFA 5DOSA 5FGKA 4KIKA 2YA9A 1OI9A 3AQVA 4FG9A 5EKNA 5IPJA 4LQMA 3PY1A 2R3OA 4YTHA 3HYHA 3MIAA 4IMYA 1WZYA 3F69A 3FXXA 3VJNA 5AUVA 1YHWA 5HVJA 4E4NA 4QT1A 5JFSA 4E5WA 5ANKA 2QCSA 4QTAA 3WARA 4RSSA 3UQCA 3ZRMA 3QYWA 3MI9A 3RK7A 1WVYA 3MFTA 4GV1A 4EZ5A 4O0VA 2YM6A 3EN6A 4TWOA 3DFCB 4I0RA 4I6FA 3D7TB 4AOIA 3F9NA 1B6CB 2VD5A 3EKNA 3RMFA 4F70A 3WF9A 3VAPA 4DGOA 5JFXA 5IH6A 4F9CA 2J9MA 4RJ4A 3UVQA 4LMUA 2IVTA 5FWKK 3QQGA 3WF6A 3FZRA 4YJTA 3IONA 1E1XA 5A4QA 4DCAA 2VV9A 1PXJA 4A9SA 4M68A 1YWNA 1RQQA 2UZTA 4FG7A 3EJ1A 4QD6A 3PWYA 4JVGA 3TV6A 3VN9A 4B4LA 5HZNA 3LXNA 1ZY4A 2IPXA 2WHBA 2X8EA 2PYWA 3I5ZA 2WB8A 4G3DA 2V7OA 4QMXA 5KBRA 4EQCA 1OPKA 5GHVA 4CLJA 1FVVA 2YN8A 5KMLA 5HORA 2VRXA 4F1OA 5JZJA 5A4LA 3IKAA 2VWXA 2XNGA 2J5EA 3GC0A 4RVKA 4FE2A 3DQWA 1TQIA 5EW3A 5K0KA 3SXFA 3PLSA 2EVAA 4F9BA 5M4UA 4M13A 2JKMA 2PL0A 3BHVA 4G5PA 3GOPA 4YHFA 4R78A 3DZOA 4X6RA 5EOLA 4EQUA 4I93A 4NW6A 5I3RA 3C1XA 4U43A 3HMPA 4IJPA 3I7BA 4H3BA 2HELA 3Q4ZA 4ZEGA 4P5ZA 1L8TA 3KY2A 5EOBA 5KMIA 2VWIA 2YLEA 3P9JA 3TG1A 5AUZA 2W9ZB 4XUFA 2XCHA 4FYNA 2WU6A 3PJCA 4K8AA 4JQ7A 1WVWA 2IVSA 4TYEA 4BCGA 1OL6A 5BX0A 2C0OA 1R1WA 4R7BA 3G9LX 1SVHA 1EH4A 3EQCA 4TRLA 5E8WA 4D1XA 3QZHA 3A61A 2ITZA 4W4XA 5IQHA 2OJGA 3E62A 3P5KA 2P3GX 4ZY6A 2BTSA 1W98A 3CD3A 5E9EA 3CTHA 1H00A 4N6YA 4QTEA 1PXIA 5DYJA 3E8DA 4FEQA 3MESA 1ZY5A 1U5RA 2Y9QA 4HPTE 4AT4A 4B6LA 2H8HA 3GCUA 4Y95A 4L52A 4G6NA 5FUTA 4QP8A 3BX5A 3QGWA 3HUCA 4ZMEA 2YJSA 2PVFA 5HU3A 3CGFA 3G33A 4K2RA 4X2FA 2YERA 3G0EA 3ORIA 1CKIA 4BGHA 2PE2A 4RFYA 3EQBA 3IK3A 4YJQA 3MFRA 4KB8A 1OL2A 4YZ9A 4DT8A 5BVDA 3K3IA 4LV8A 1I09A 3HV5A 4EH3A 3F61A 2JKKA 3G90X 1W83A 4EUTA 1XH5A 2ZDUA 2ZM3A 4G34A 1PYXA 5FP6A 5E8XA 2YM4A 3QTZA 5CEMA 4TTHB 4KBKA 5HLNA 3OBGA 4EC8A 4PPAA 4AZTA 2HWPA 3FE3A 5LVLA 3W2RA 5HGIA 5FXRA 4WKQA 4FA2A 3OUKA 4GK4A 3ZH8A 5LMKC 3C4CA 2WPAA 4M15A 2XJ0A 4C02A 1LEZA 2XVDA 1SMHA 2HW6A 3AT2A 2EWAA 1RJBA 3EFKA 2PVMA 4MXZA 2JDTA 4RLKA 4WUAA 4XG2A 3TNIA 1ZLTA 3BHHA 4NIFB 5D41A 5HNGA 5A4TA 5ETIA 4BDCA 3KXGA 4X2JA 3O8TA 5EQEA 1PXMA 2WQMA 3KXHA 2IW6A 3LM5A 2ZMDA 2QG7A 4AZVA 2PMLX 4LGGA 4AW2A 5L8LA 1OVEA 4NM0A 2VTSA 2J0JA 4UWYA 3RPOA 2WMUA 1W8CA 2OGVA 3PVUA 3R1YA 2YIQA 5C01A 5CU4A 2XNBA 5HG5A 3WOWA 4NUSA 2GNIA 4DYMA 5A4EA 3U6JA 5D12A 2IW8A 1OUYA 3UOLA 4KIOA 5HE2A 2JAMA 2WTDA 1XBAA 3NGAA 3MGYA 3C9WA 4FSMA 3DAEA 4DG2E 4EHGA 5LVPA 2VO6A 2VO7A 3V04A 1UKHA 3F3WA 4JG7A 4UMUA 3FQHA 3PVWA 5CEOA 1JSTA 2NRYA 3C50A 2E9OA 3K2LA 4OTIA 4RMZA 3VBQA 3ZOSA 3R21A 4NH1A 4H1MA 1A06A 4DEHA 2BRNA 2BFXA 3LCOA 3ZM9A 2KULA 2XZSA 4IIRA 3UO5A 1R0EA 2QKWB 3CTQA 3MBLA 2GHGA 5ICPA 3AMBA 4S31A 4C7TA 5CAVA 3I4BA 5AX9A 4RLLA 5EW9A 4NM7A 1ZWSA 3CEKA 4FYOA 4YLJA 4R3RA 4XRLA 2HWOA 3OWLA 4E93A 4S30A 4XOZA 4QP2A 2PE1A 3VRYA 2QO2A 1WBPA 3U51A 3E88A 4F0IA 4CZYB 5M4IA 4FTJA 4HVIA 1DI8A 2QKRA 3NR9A 4YTFA 2RKUA 3Q9WA 4UXQA 5B7VA 5JGAA 4IAAA 4ALUA 4HNFA 4YR8A 2RG6A 1LR4A 3QWJA 5CZHA 4KNBA 4FKPA 3BI6A 1ZZLA 4BTJA 3EQPA 4C4IA 4EH9A 4YU2A 5KCVA 3MH1A 5AV4A 1PKDA 2C5NA 4RIYA 3HMNA 4PMPA 5GJFA 4USFA 3PSCA 3P4KA 2WEIA 2BIKB 4FTOA 4C2WA 2BTRA 3C4WA 3E3BX 3OUNB 4MXXA 5IA5A 4AT3A 3LFEA 5GIOE 2X1NA 5CI6A 3LE6A 4IANA 4U0IA 5E4HA 2CGWA 2YCQA 2F49A 3ODZX 3TNQB 2B53A 4QPMA 4QMMA 5IQEA 2O2UA 1AGWA 3H3CA 3QZGA 3RK9A 3SA0A 4HGLA 1ZYCA 4PNKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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