4YGJA

Nabr--interactions between hofmeister anions and the binding pocket of a protein
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGGHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Interactions between Hofmeister Anions and the Binding Pocket of a Protein.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4ygjA00
5BRWA 4Z1NA 1CNHA 3DC3A 3S8XA 2NMXA 4KAPA 4YXIA 3V3JA 1LG6A 3R16A 4K0TA 2HL4A 4R5BA 3DVBA 3S72B 3TVNX 4HBAA 1BNVA 4L5WA 4XIXA 3MHOA 1TEUX 2NNSA 3KIGA 1UGDA 3HKTA 1FR4A 3RYXB 3DVCA 1IF7A 3VBDA 1YO0A 1BZMA 4WUPA 2Q38A 4Q7SA 4XE1A 2NXTA 3S9TA 4Q7PA 4KNNA 3MNAA 5DVXA 3BL0A 1BN3A 5SZ6A 3OKUA 1BNQA 5IPZA 1URTA 4WW8A 5JQTA 1FSRA 1CNCA 3M14A 1V9IC 5EHVA 4G7AA 4C3TA 4YYTA 1LZVA 1TG3A 4E3DA 4CNVA 4XFWA 1KOPA 4HEYA 4KP8A 3RG4A 3M96A 3TMJA 4M2RA 2X7UA 1I9PA 3KWAA 1CVBA 3N4BA 5CJFA 3V3GB 4KP5A 1G3ZA 3M1QA 1HEBA 3V2MA 1A42A 4Q87A 3U47A 4YXOA 4E3GA 3EFTA 3B1BA 5E2KA 5JEGB 2NXRA 3P55A 4M2VA 3M2NA 4WL4A 2FNMA 4Q6DA 2ZNCA 1HCAA 3PJJA 5AMLA 2FOVA 3ZP9A 3IAIA 1YO1A 3MYQA 3M5TA 2QP6A 1RZBA 1CNXA 1CZMA 1TE3X 2GEHA 1G6VA 2OSFA 3MNHA 1BV3A 3FE4A 4FRCA 3NJ9A 4RFDA 1CA3A 3F8EA 4Q6EA 1G0EA 2WD2A 5E5UA 3M04A 5SZ2A 1CILA 3Q31A 3IEOA 4BF6A 4G0CA 4Q06A 4Q07A 3RYVB 3F7UA 2H4NA 5FLOA 4ZWZA 1FQMA 1BCDA 1G1DA 4QY3A 4Q81A 1ZGEA 2FNNA 1KOQA 3P3JA 1UGEA 5DSLA 4CNRA 2Q1BA 1G45A 4KNIA 1CCTA 3HFPA 1I9QA 1LUGA 1BN1A 2CBAA 1I9MA 4Q83A 3HKQA 4QJMA 3OKVA 3W6HA 1HEDA 4DZ9A 1G4OA 2OSMA 5SZ7A 3P44A 2WEOA 2W2JA 1FQLA 3M1KA 1ZNCA 4N16A 1IF5A 1AVNA 3KLDB 3S75B 5FNHA 4MO8A 4Q08A 4KV0A 1CNKA 1HUHA 3P5AA 1XPZA 2POVA 4L5UA 3DBUA 3V3IB 1RZCA 3RGEA 1MUAA 3DV7A 5E5RA 1CAOA 3M5EA 3MZCA 1EOUA 4Z1EA 1H4NA 4PYYA 4Z1KA 5DSOA 1RZAA 3MHLA 5FLRA 3P4VA 2GD8A 4ZAOA 2NWPA 2ABEA 2FOQA 5E2RA 1CANA 3KOKA 3M2ZA 3RZ7A 1CVFA 4KNJA 3V5GA 1IF4A 3P3HA 1G48A 5C8IA 4K1QA 3FFPX 1AM6A 5EZTX 5JEPB 5DSJA 1G0FA 1KWRA 2HKKA 1UGFA 3U3AX 5FNKA 3DAZA 5JESB 4E5QA 4YGFA 3JXHC 3MNUA 1CNGA 4X5SA 1CVHA 5FNGA 4Q78A 4QJWA 1HVAA 1TBTX 1I9NA 5FNLA 4KUWA 4WW6A 1CCUA 2FNKA 3N2PA 5FDCA 2FMGA 3DCSA 3S74B 3SBIA 3CZVA 3CYUA 2CBEA 4JSZA 5BYIA 3OYSA 3MWOA 1V9EA 2VVAX 4CA2A 4RFCA 1UGBA 3D0NA 5E28A 4RUZA 3MHMA 3DD0A 1TTMA 4MDLA 1BN4A 1UGAA 4PQ7A 3FW3A 4HU1A 3K2FA 4ZWXA 1ZSAA 4IDRX 4ZWYA 5SZ4A 4QK3A 5DSQA 1I8ZA 1XQ0A 1RZDA 4E3FA 3M2YA 1CNYA 3RYYA 1CNIA 1T9NA 3RYJB 1ZGFA 4Z1JA 5CACA 1FLJA 2CABA 4LHIA 3T84A 5JGSB 3EFIA 5FNIA 3W6IA 4Q90A 4KNMA 3L14A 3ML2A 4QEFA 5EHWA 1XEVA 4Q7VA 3OYQA 3KNEA 3K34A 3MHCA 1G54A 7CA2A 3P58A 1TB0X 2FMZA 5A6HA 5DOGA 3QYKA 2Q1QA 2HOCA 4R59A 4MDMA 4YGLA 5E2SA 1I9OA 3ZNCA 4DZ7A 3D93A 1CAZA 5FLQA 1RJ6A 3KKXA 4PXXA 1CAKA 4QSAA 4Z0QA 4R5AA 1DCAA 3D9ZA 4WUQA 1KEQA 3SAXA 2FW4A 1OQ5A 1Z93A 1HUGA 3M5SA 3NB5A 4KUVA 4E9OX 3DA2A 1CAYA 4Q0LA 2FOYA 3V3HB 1I90A 1H9QA 4CNXA 3TVOX 4Q7WA 4PZHA 2AW1A 2NNVA 5L6KA 1CVEA 4N0XB 6CA2A 5HPJA 4Y0JA 4QK2A 3P5LA 1IF6A 3IGPA 4HEZA 3S78B 5DSKA 4LP6A 3K7KA 5EKMA 5A25A 1BICA 2CA2A 1TEQX 3IBIA 2QO8A 3ML5A 3CA2A 3SAPA 4QJXA 3RLDA 4Q8XA 3BL1A 1RJ5A 1JCZA 3RZ0B 4QSBA 1FQNA 2CBDA 4HT0A 3RZ1B 4QK1A 5FL5A 5DSNA 4ZX0A 4QSJA 5FLPA 2ILIA 2NNOA 4YX4A 2WD3A 3DCCA 3M3XA 1FR7A 5AMGA 3MNIA 5DSRA 5FLTA 4E49A 4XZ5A 5SZ0A 1TG9A 4ITOA 5FLSA 3S77B 3S73B 5EOIA 1CRMA 1F2WA 3KS3A 4Q99A 3RJ7A 3RYZA 1RAYA 3JXFA 4YWPA 3MHIA 2POWA 1OKMA 1I9LA 1KWQA 1Z97A 2NWZA 2CBBA 4YHAA 5JG5B 1JV0A 3N0NA 4ILXA 1CALA 3M67A 3D8WA 3U7CA 1G4JA 3DC9A 4LU3A 5FNJA 4MLXA 5JEHB 3IBNA 3DCWA 3F4XA 4FPTA 4BF1A 1LG5A 4QTLA 3S97A 4ETQC 1ZH9A 1CINA 5LMDA 3HLJA 5G01A 3RZ8A 4YGJA 1DCBA 4FIKA 2EU2A 2X7SA 3R17B 4CACA 1CCSA 4MTYA 3T83A 5SZ3A 9CA2A 3JXGA 3SBHA 4HF3A 3MNKA 4RUYA 12CAA 4YVYA 1RAZA 5BNLA 1G52A 4FU5A 4Q8YA 2WEJA 4ZX1A 3IBUA 1CRAA 1FSQA 4QSIA 5AMDA 4QJ0A 3LXEA 5DSIA 4QIYA 1BNTA 1XEGA 3T5UA 4CQ0A 2NN1A 1YDDA 3OIMA 4IWZA 4RIVA 3PYKA 5FNMA 5EKHA 5G03A 5BRVA 2F14A 3T5ZA 4HEWA 1BNUA 1HECA 5SZ5A 4Q09A 3MNJA 4M2UA 5CLUA 2NXSA 4XIWA 3CAJA 3UYNA 2H15A 5BRUA 3M1JA 3V2JA 4YGKA 5JQ0A 2POUA 5L3OA 4TWLA 4JSSA 4KUYA 5EH5A 3KOIA 5E2MA 1YO2A 4MDGA 3F7BA 1CAJA 3MDZA 4GL1X 5J8ZA 2X7TA 4K0SA 5FL6A 1YDBA 4JS6A 5FL4A 1CAHA 4JSWA 4K13A 2VVBX 4K0ZA 1HCBA 4FVNA 2AX2A 2WEHA 4Q49A 5G0BA 2QOAA 4QJPA 2IT4A 3HS4A 3S71B 1RZEA 3NI5A 3GZ0A 3IBLA 2NWOA 1BNMA 1CIMA 5G0CA 1TH9A 3DD8A 4ZWIA 1CNWA 3T82A 2NWYA 4RH2A 4RIUA 1ZSCA 4Q9YA 3DVDA 4RN4A 5EH8A 3T85A 1Z9YA 1CAMA 1CNBA 1Y7WA 3M40A 2FOSA 4COQA 1HEAA 4JSAA 5FDIA 4UOVA 1IF9A 3UYQA 5DSPA 4ITPA 3OILA 4WR7A 5E2NA 3M2XA 1FQRA 4HT2A 1UGGA 1ZFQA 3V3FA 3M1WA 5JGTB 1ZFKA 1UGCA 1G46A 3D92A 5EHEA 1LGDA 1YDCA 3U45X 4E3HA 2EZ7A 4TWMA 2NNGA 2NN7A 4QJOA 2O4ZA 1JD0A 1IF8A 5DOHA 3C7PA 4FL7A 1OKLA 1ZSBA 3M98A 3S76A 8CA2A 5JG3B 2FOUA 5DRSA 1CVDA 1G53A 2HD6A 3PO6A 5CA2A 4YGNA 1H9NA 5JDVB 4Q8ZA 3MMFA 1MOOA 1DMYA 4RUXA 1DMXA 3BETA 3HKNA 3B4FA 1FSNA 4BCWA 2EU3A 3HKUA 1J9WA 4M2WA 4CNWA 2HFWA 1CNJA 5EH7A 1ZE8A 4PYXA 1CA2A 2WEGA 4MLTA 3OIKA 3KONA 1CVAA 1I91A 4L5VA 5DSMA 5EIJA 2CBCA 3V7XA 3OY0A 1CVCA 4QIZA 1BNWA 5SZ1A 2HNCA 1AZMA 1OKNA 1BNNA 1THKA 1YDAA 4E4AA 3RZ5A 3N3JA 3RG3A 4FVOA 4YXUA 5EKJA 1CAIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5BRW A;  4Z1N A;  1CNH A;  3DC3 A;  3S8X A;  2NMX A;  4KAP A;  4YXI A;  3V3J A;  1LG6 A;  3R16 A;  4K0T A;  2HL4 A;  4R5B A;  3DVB A;  3S72 B;  3TVN X;  4HBA A;  1BNV A;  4L5W A;  4XIX A;  3MHO A;  1TEU X;  2NNS A;  3KIG A;  1UGD A;  3HKT A;  1FR4 A;  3RYX B;  3DVC A;  1IF7 A;  3VBD A;  1YO0 A;  1BZM A;  4WUP A;  2Q38 A;  4Q7S A;  4XE1 A;  2NXT A;  3S9T A;  4Q7P A;  4KNN A;  3MNA A;  5DVX A;  3BL0 A;  1BN3 A;  5SZ6 A;  3OKU A;  1BNQ A;  5IPZ A;  1URT A;  4WW8 A;  5JQT A;  1FSR A;  1CNC A;  3M14 A;  1V9I C;  5EHV A;  4G7A A;  4C3T A;  4YYT A;  1LZV A;  1TG3 A;  4E3D A;  4CNV A;  4XFW A;  1KOP A;  4HEY A;  4KP8 A;  3RG4 A;  3M96 A;  3TMJ A;  4M2R A;  2X7U A;  1I9P A;  3KWA A;  1CVB A;  3N4B A;  5CJF A;  3V3G B;  4KP5 A;  1G3Z A;  3M1Q A;  1HEB A;  3V2M A;  1A42 A;  4Q87 A;  3U47 A;  4YXO A;  4E3G A;  3EFT A;  3B1B A;  5E2K A;  5JEG B;  2NXR A;  3P55 A;  4M2V A;  3M2N A;  4WL4 A;  2FNM A;  4Q6D A;  2ZNC A;  1HCA A;  3PJJ A;  5AML A;  2FOV A;  3ZP9 A;  3IAI A;  1YO1 A;  3MYQ A;  3M5T A;  2QP6 A; 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