4YJRA

Syk kinase domain in complex with inhibitor gtc000225
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
270
structure length
263
Chain Sequence
YLDRKLLTLEDKELGTVKKGYYQMKKVVKTVAVKILKNEANDPALKDELLAEANVMQQLDNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRHVKDKNIIELVHQVSMGMKYLEESNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADENKAQTHGKWPVKWYAPECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVTAMLEKGERMGCPAGCPREMYDLMNLCWTYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Tyrosine-protein kinase SYK
publication title Discovery of GSK143, a highly potent, selective and orally efficacious spleen tyrosine kinase inhibitor.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 87
structure length 263
sequence length 270
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2015-03-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4yjrA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4yjrA01
3L8XA 5BVEA 2HXQA 2H8HA 3FPMA 4JBQA 2C5OA 3MIAA 4BRXA 4Z3VA 4GEOA 1FINA 2X2KA 2C0TA 4ZTLA 5TOZA 3FZSA 3TN8A 1OPJA 2JBPA 3MSSA 4IVCA 2HWPA 4U0IA 4XLVA 5DEWA 3TIZA 5I9ZA 4KKHA 3FEGA 3Q4TA 3QX4A 4FC0A 3WF7A 4ERWA 1PHKA 4FGRA 3QUPA 4RPVA 3FMNA 4FIHA 5HO6A 1BL7A 4FT9A 3UOJA 3ORMA 5KMKA 3ZHPC 1U5QA 2GCDA 3ORLA 3BU6A 1VZOA 4KSQA 4BI0A 2YIXA 3VJOA 4JG8A 4NJ3A 4X2NA 4YSMA 2WELA 4FG7A 4FZAB 4S31A 4ANNA 3C4CA 4PTEA 3FY0A 4UZDA 4FKWA 3ETAA 4AS0A 4PMPA 4DF3A 3ORIA 3MB7A 2HXLA 3HA8A 1Q5KA 4WO5A 4CCUA 2JDOA 5A54A 5IMEA 4EHZA 2GHMA 2XK4A 3OWPA 3NZ0A 3OCGA 4EH5A 5FBOA 4OT6A 3ZXZA 3OTUA 1CDKA 3WYYA 5HX6A 3VUMA 4IX6A 4LI5A 4TRLA 3KXMA 3ZLWA 2JIIA 3IW8A 5EK7A 3UYTA 2GS6A 5I9WA 4ACHA 3FSFA 4NL0A 3VW8A 4E4NA 3D2IA 4DGOA 3EIDA 4WIHA 1Y8GA 2WB8A 3P08A 3TM0A 4CYIA 1GZOA 3LFCA 4S32A 4C62A 3FZOA 4MCVA 3HEGA 5B7VA 4EJ7A 4O0UA 1MQ4A 2ZV8A 3MPAA 3PIZA 4RSSA 5J1VA 3PIYA 2YHVA 3MH2A 4DEDA 4AUAA 4C0TA 4JDKA 2KTYA 3G9LX 4O6LA 5H8GA 4DCAA 4DEEA 3QAME 3BHHA 4USDA 5ETCA 2PSQA 2PUIA 1Q24A 2G01A 3ZEWA 1R0PA 4FV7A 1ZYLA 3E64A 3ELJA 4N0SA 5CVGA 4O0WA 1OL2A 1WBTA 4YZMA 2XS0A 1Q61A 3PSBA 4IAAA 4N4SA 1BI7A 4F6UA 4I23A 3ZZWA 5JEBA 1VYWA 2IW9A 4R8QA 2C6EA 4XH6A 1WCCA 4RIXB 2FO0A 3Q04A 3ZS5A 1YDSE 1U54B 3R6XA 2VWWA 3FMHA 3Q5ZA 3VUDA 4C57A 3COHA 4FV5A 2HIWA 4BC6A 3NUXA 3AXWA 4EK3A 5EYDA 3I0OA 1OMWA 5CYIA 3H4JA 5F94A 5C8NA 4IX3A 2PZPA 2A4LA 2V7AA 5HICA 2IJMA 4UYNA 4I6BA 5BMMA 2HK5A 4AA4A 4CT2A 3HGKA 3ET7A 4FIIA 4DBNA 4UV0A 2UW4A 1DI9A 5TR6A 1IA9A 3EJ1A 4G5PA 5EYCA 4BCNA 4D2PA 4DFZE 3U87A 4R77A 1WZYA 3IGOA 2VRXA 1TKIA 1PJKA 2Z2WA 4AX8A 4QMUA 5M4FA 5LVPA 1H08A 2XRUA 4DG3E 5HBJA 3FL5A 2B53A 3QRJA 3R1QA 1UWHA 4HZSA 4OTFA 5FEQA 4FR4A 3BYMA 3EN5A 4BCFA 1PXJA 2ONLA 5FM3A 5BYYA 3HAVA 3HVCA 4FBXA 2PY3A 2UZTA 4F6WA 4GRBA 5AAFA 3UTOA 2IG7A 4BIEA 4NH1A 3Q3BA 5HHWA 5IEXA 3TDVA 3QCYA 1G5SA 3MY0A 4LL5A 4YJNA 3F2RA 1IEPA 4AOTA 4ASXA 3I5NA 1P4FA 3OY1A 4ITHA 2V62A 4YTFA 3B2TA 3QTIA 4ZTNA 3EQGA 4MQ2A 3EYGA 3S95A 2ITUA 1PMEA 3LQ5A 5GHVA 5TT7A 5BVNA 2G2HA 2QOFA 5KNJA 3UZTA 1DI8A 3UQFA 1Q3WA 2GHGA 2R64A 3H9OA 4O38A 3A4PA 4DYMA 2OXXA 5CAUA 5KBRA 2PMOX 3VHEA 1REKA 3DY7A 4NM5A 4U8ZA 4I24A 5EM6A 4D2SA 4NWMA 4O21A 2UW5A 4I41A 5FTGA 2VNWA 2WTKC 2VNYA 5AV0A 4BWPA 3PY0A 3GU5A 4ZP5A 4HYIA 3OBJA 5L8KA 2VAGA 5AIKA 3WIGA 3G5DA 3PPKA 3ZRMA 2PU8A 5EI8A 5EYMA 1NT2A 1VYZA 3H10A 3OXZA 1JKLA 3JY9A 4ANLA 1YOMA 4GIHA 2YDJA 3IW7A 2C6KA 4FL2A 2XK8A 3DQWA 4RT7A 5EG3A 4ZLOA 4DT8A 3PXQA 4YTHA 3QQKA 3D5WA 1GIIA 4IACA 2VTHA 3QGYA 5HESA 2ESMA 4L01A 5HE3A 3QWJA 1M7QA 2VGPA 3ORXA 3P23A 2JDVA 4GG5A 4F9YA 5I9UA 5HD4A 3Q9XA 4LV5A 2W5AA 2EXEA 1ZXEA 4GYIA 4NFMA 2QOKA 5C03A 3UPZA 5BNJA 4PF4A 4BGGA 1BKXA 1M7NA 2CNQA 3R04A 5DE2A 3TUDA 3E93A 3TG1A 4G3EA 3UVQA 2UW8A 4NZWB 3OT3A 4IZ5A 2Y0AA 3V5TA 2CKQA 4MD9E 5AR3A 4AA0A 4QQTA 4FKIA 2OH0E 2YIQA 1ZYDA 2IZTA 4NT4A 1M52A 5FP5A 2OLCA 2YITA 4RLKA 3V5PA 5HTIA 4Q9SA 5DIAA 3ZEPA 4B4LA 3E8DA 3OXIA 2O63A 1PMNA 3AOXA 1DAYA 3KK8A 3TJDA 2YLEA 2R5TA 4JBOA 1CMKE 3WF8A 4YUQA 2W17A 5CWZA 5DN3A 4A7CA 5IPJA 3QC9A 2W7XA 4YZDA 5DMZA 4D4SA 2EXCX 2WMSA 3V8SA 3OC1A 4HGLA 2VGOA 1ERKA 3KXNA 2XCKA 5DT4A 2I1MA 5E4HA 4O7YA 1FOTA 3FDNA 4CG8A 4W4YA 3R7OA 5CEPA 3ZM4A 5IA4A 4FTLA 1XH6A 2I0HA 3NDMA 4G9RA 3NNWA 3A8XA 4ALVA 3Q2MA 2C6LA 2C6OA 4IHPA 5HOAA 2UVXA 4TL0A 5A9UA 1R1WA 3QWKA 4P5QA 5E8ZA 5E9EA 4F0GA 3R8VA 4AN9A 2QR8A 4KS8A 4WHZA 5I9VA 5AV2A 3FZPA 2X9EA 4O0XA 4YC6A 2X0GA 4LGGA 3ORKA 1JKTA 3F9NA 2VWYA 2CGWA 3QX2A 1QPDA 3NIEA 4C4HA 4HGTA 4RIYA 5K3YA 3T8OA 3V5QA 2Y4IC 3UO6A 3D7ZA 4RX9A 2YACA 1YHSA 2JITA 4GU9A 4GCJA 4OTRA 3VS3A 3DKFA 3W32A 2F49A 4CYJA 3KKVA 4RG0A 3RAKA 4E4XA 4AT3A 2BIKB 3LE6A 3A7FA 3LZBA 1URWA 1YRPA 3HV7A 4M67A 2WOTA 4O27B 4TZRA 5LMAA 4E5BA 4EYJA 5BUEA 2WTCA 5JQ5A 4CFXA 4GJ3A 2BAKA 1OITA 4R7HA 3U54A 5HORA 4AOJA 1ZZLA 3PLAE 1JOWB 4JBPA 4BF2A 4J71A 3EOCA 4CFWA 3O7LD 5IEVA 3SOCA 2ZV7A 3DV3A 3ROYA 3MFRA 1CSNA 1YOLA 2C5NA 3W18A 4EBWA 1CTPE 1R78A 4ERKA 2EVAA 4O6EA 4EWQA 5LVMA 3S00A 4IDTA 3GT8A 4V01A 2ITOA 1FGIA 4O7TA 5FDPA 2XYNA 3DK3A 3IO7A 3DZOA 1YHWA 2ITVA 5J7HA 4IVAA 1X8BA 4FSTA 4MD8E 4OTWA 2C0OA 1HCLA 2A27A 2ZDTA 4QMXA 3E63A 4CD0A 2Z7LA 2C1AA 2YABA 4NCTC 3TNIA 1V1KA 4O2ZA 2XMYA 2W96B 4AE6A 2PPQA 3R01A 3R21A 4AGDA 1TVOA 4I6FA 3PXYA 3BU3A 3VHKA 4E7WA 4R7IA 2WAJA 3QZIA 3R7YA 4E4MA 5CNNA 4H3BA 4BCGA 4F1MA 1KE7A 4FIJA 1Q8ZA 1XH7A 3MN3A 1WFCA 2GDOA 3TT0A 3SXFA 3MVLA 3ORZA 2YCQA 3ID6C 4FNWA 3MBLA 4ANQA 2I0EA 1Q8YA 3F6XA 5D1JA 5L2QA 3KMWA 2F2UA 2H96A 1WMKA 3I4BA 3IS5A 3ORTA 4FNYA 3UPXA 3W8QA 2PVRA 1ZYSA 2QOBA 2YDKA 2DQ7X 5E1SA 1GAGA 2HWOA 3AC3A 3L8SA 2C68A 3DNEA 4FIGA 3QD4A 3LVPA 5LMKC 3S0OA 4WRGA 3SX9A 4K11A 3D5XA 3Q32A 4RMZA 3RK5A 4FSQA 1UNLA 1YWNA 2JFLA 1XH8A 3K5VA 4F65A 4L6QA 3W33A 4APCA 5AP0A 4A9TA 2HZIA 1BI8A 3OXTA 3N4UA 4I93A 3RZFA 5K5NA 3V6SA 2W9ZB 3FC1X 3KF7A 1A9UA 3UZRA 3QBNA 2F57A 4P2KA 2UVYA 1OZ1A 3C4WA 3KRJA 3OHTA 3T3VA 1HCKA 3HRBA 5AM7A 4EL9A 1PW2A 3FWQA 4UMTA 3PP1A 4U44A 3R8ZA 2ONLC 3UG1A 1P4OA 3C1XA 3LFDA 4NUSA 3DJ6A 3VW6A 4BI1A 4BIDA 4ZS4A 2XKEA 3UIMA 4E73A 4MQ1A 3IW6A 4E6CA 2OZAB 3ULIA 4U45A 5KMIA 3MA6A 2OG8A 3C7QA 3PG1A 4FV1A 2PE0A 3SDJA 3ULZA 3MFSA 2JEDA 4NEUA 3F3UA 1FMKA 3AT4A 4FSUA 2C3JA 4QMPA 2QODA 4OTQA 4MXOA 2J9MA 1H1WA 3NUSA 4RC4A 4PPCA 5E90A 4YTCA 4BDJA 3SLSA 2C0IA 3HP2A 2X1NA 3P4KA 3ZDUA 1FQ1B 5EQEA 4FICA 3FYKX 4E6QA 4GFMA 5BX0A 3FKNA 3UNKA 2P2HA 4BZDA 5M53A 3MH1A 3ALNA 4E26A 5EM5A 2QURA 5BQ0A 3R7IA 4Q5HA 4Z7GA 1YI4A 3KA0A 3U51A 4C02A 4ZTSA 2VTJA 2QOQA 3IW5A 3L1SA 3MWUA 5D7AA 1XO2B 4FE2A 4CFVA 2BTSA 1WBNA 4CSVA 3BKBA 1AGWA 2FSTX 2OI4X 1WBSA 1WBPA 4IB0A 3LLTA 3OVVA 5K0XA 2QVSE 5EI2A 4AOIA 2ITYA 3F88A 3RNIA 4F7NA 3R1SA 4G31A 4KAOA 4X3FB 4G6NA 4BDHA 4BCOA 2FUMA 3OOGA 2R0UA 4AFEA 3FLQA 5EKOA 1T46A 5JZNA 5EW8A 2WTIA 1YXSA 4FV2A 4S30A 2XF0A 3CKXA 4U40A 3Q4UA 2BIYA 3D0EA 4XV3A 5IQHA 1ZOEA 5GNKA 4CQGA 4I0TA 4CTBA 3V5WA 4RJ5A 3PA5A 1JVPP 4FKPA 3ANQA 4DEIA 4HNFA 3R9NA 2XK7A 4HYHA 4MEDA 2HAKA 2CGVA 4DTAA 5L6WL 1XR1A 2GNLA 1I09A 3C13A 1JBPE 2XB7A 5HVYA 4XRJA 2W1IA 1PXNA 4OBOA 5DT3A 4C2WA 4O0SA 4OTDA 4U3ZA 2C5XA 4TNDA 4IAIA 2CCIA 1SMHA 1ZOGA 2EB2A 4MAOA 4GFOA 3QALE 3EHAA 4CXAA 3NYXA 2WTWA 3QL8A 5E8SA 4BYIA 3RAWA 3BLQA 4FSZA 2R9SA 4QPSA 2WMBA 1VEBA 5HVKA 3VO3A 5LMBA 4XV2A 2XVDA 3CQWA 3FYJX 4MTAA 3RI1A 3LCDA 4WUNA 3A7HA 2PVHA 4NFNA 4RJ3A 4AGUA 2XKDA 4AW5A 4J8MA 4DEAA 3LXKA 4IADA 2XP2A 4RVKA 5CSHA 4AZWA 4FEWA 1JKSA 2GNGA 4BCKA 3O23A 1EH4A 4BDEA 2E9NA 2A1AB 3OCSA 2J50A 4UBAA 3R9DA 2BUJA 2XKCA 3I1AA 5AUWA 1GY3A 1Y91A 4L42A 4HVIA 3TZ8A 3UODA 4DH7A 2ITZA 3DK7A 3SXRA 4DFYA 5L2WA 4KD1A 5AUZA 4CMUA 3ZBXA 1IAHA 3W2CA 5FWKK 4FTOA 4TYGA 4ACGA 4ASDA 3U6JA 1OB3A 3IGGA 3FXXA 3IOKA 4IZYA 4HYSA 1XKKA 2W1GA 1M2PA 3DBEA 2BZJA 1YQJA 2R3PA 3PYYA 4Y95A 5FD2A 4EH6A 3W10A 3KB7A 1UKIA 4GSBA 5EI6A 3PY3A 3DS6A 4UXLA 4C58A 2CMWA 5A6NA 2G9XA 5AEPA 1J91A 3DKCA 2GQGA 2JGZA 3TL8A 3DJ7A 3COIA 4GH2A 4QMVA 4YC8A 2X7OA 2VTOA 4J53A 5CY3A 4C61A 4RVMA 4XLIA 2NO3A 5KUPA 2CJMA 5J95A 3E3PA 4UXQA 4YHJA 5EHLA 5FXRA 3LPBA 5B2KA 3PJ2A 5E92A 3KCKA 2FA2A 3UOKA 4B6LA 2OZOA 4MF0A 5ITAA 3F3VA 3IPHA 2C5YA 5CT0A 4EZ5A 4PMTA 2IPXA 3RK7A 3DTCA 4XP0A 2B1PA 3V51A 4QRCA 5B2MA 3GU7A 3OP5A 4I5CA 4XJ0A 4Y5QA 5HIBA 5AR2A 1T45A 2A19B 3JVRA 4DHFA 4EC9A 3GQIA 3LQ8A 2VWBA 3FC2A 3R1NA 4KABA 2R3QA 5HU3A 5IUGA 3TNQB 4IFGA 3O0GA 3ZXTA 3L9PA 2B4SB 4GL9A 3TTJA 1LUFA 4EC8A 3ZM9A 5EOLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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