4YK0A

Crystal structure of the cbp bromodomain in complex with cpi098
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
113
structure length
113
Chain Sequence
IFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords CREB-binding protein
publication title Regulatory T Cell Modulation by CBP/EP300 Bromodomain Inhibition.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 38
structure length 113
sequence length 113
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2015-03-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4yk0A00
4OGJA 4FLPA 5DYUA 3ZYUA 5CTLA 5HLSA 5CQ7A 3RCWA 5FE5A 4LC2A 4LZSA 3SVGA 5DYCA 3I3JA 4CLBA 5KTWA 5ENEA 5EWVA 5CQTA 5ENGA 4YY4A 5LVQA 3ONIA 4C67A 5H85A 4QEWA 5TCMA 5EWCA 5IGLA 4QSSA 3O33A 5I80A 5E73A 2OUOA 3P1DA 5IBNA 4TTEA 4MR4A 5CRZA 5EU1A 4QR4A 3NXBA 5E9IA 5JI8A 5EWHA 5DLZA 5HEMA 5BT3A 4TT6A 5IG6A 4UIZA 5F61A 3UVYA 5CPEA 3MULA 4Q0OA 4A9IA 5D3PA 4ALGA 2I8NA 4TT4A 5LKUA 2D82A 2G4AA 2F6JA 3GG3A 4QUTA 3P5OA 3O34A 5FBXA 5LJ1A 5EQ1A 4CUQA 4IOQA 5F1LA 5D0CA 5EPRA 2YQDA 4J0RA 4Z6HA 5CQ6A 4QR5A 4O7EA 1WUGA 4CFKA 5ACYA 4HXLA 5E74A 5F3AA 5FB0A 5EPSA 5A5RA 2YW5A 3UVXA 5LKZA 5CZGA 5EI4A 5C7NA 5FE2A 4J1PA 2DVRA 5A5QA 4YBSA 4NR9A 5I29A 3UV2A 5ENFA 5CQ4A 5A5OA 4A9EA 5D3LA 3LXJA 4J0SA 4TT2A 5EM3A 4TU6A 4QB3A 4O7BA 4PS5A 5A82A 5D3SA 5C89A 2DWWA 3AADA 4YC9A 2E3KA 5EV9A 4UYGA 4X2IA 4IR5A 5CUBA 4QEVA 4XUAA 5L98A 5EP7A 5CQ8A 4UYHA 4MR6A 4YYIA 3MB4A 4LYIA 4A9MA 4NQMA 2RFJA 4LYWA 5ENJA 5JWMA 5C8GA 3Q2FA 5E9MA 4N4GA 4GPJA 5D3NA 5LVRA 4O72A 4YH4A 5FH7A 2WP1A 4A9OA 2NXBA 5ENCA 5IIDA 3K2JA 5CUEA 4C66A 5HRXA 5FDZA 4KCXA 4NUEA 4QBMA 3G0JA 2YYNA 4YYNA 4UITA 3JVJA 4O7AA 4UYDA 5DBMA 4HXKA 4UYEA 4MR3A 4O74A 5EVAA 4A9JA 3QZTA 4UIWA 1EQFA 4A9NA 2H60A 3UVDA 1ZS5A 2E7NA 5D3TA 4LDFA 5EK9A 4QC3A 2L85A 4ZC9A 5FE4A 5II2A 3P1FA 4NYVA 4PCEA 4YADA 5F2PA 3LJWA 5CQ3A 3UW9A 5A81A 4UIYA 4YYJA 4UIXA 4QEUA 5FFYA 4YATA 5D25A 4QC1A 5CY9A 5E9LA 5KO4A 5L8UA 5AD2A 3Q2EA 2L5EA 5LKTA 1E6IA 4IR6A 2YELA 4Z1SA 5CUCA 5HELA 5D24A 3MUKA 5E9KA 5HENA 5I7YA 4YYGA 4MEOA 4NQNA 5BT4A 4NR8A 4O76A 5IGKA 5G4SA 2OO1A 3MQMA 4TZ8A 2YEKA 4ZQLA 5TB6A 5A85A 5H1UA 5J0DA 3S92A 4PTBA 5CUAA 3JVLA 5I40A 4WHUA 2YEMA 5LJ0A 5FE6A 2RS9B 4ALHA 4Z93A 3LQJA 5A83A 3DAIA 4MEQA 5EPBA 4E96A 4HXOA 2WP2A 4IR4A 4NR4A 4UYFB 2DATA 4TQNA 5DKCA 5HCLA 4Y03A 5CUDA 1JSPB 4BHWA 4YABA 2F6NA 2LSPB 2D9EA 4HBWA 4HXMA 5DFCA 3O37A 2RNWA 4UYFA 2R0YA 3FKMX 3HMFA 5EGUA 3U5NA 4XYAA 5HQ7A 5CS8A 4NR6A 4NRAA 5HQ6A 4LZRA 4NS5A 4UIVA 5KU3A 4NUCA 4WHWA 4QYLA 2GRCA 3U5KA 4KV4A 2RNYA 4QSWA 4NR7A 5FE8A 5AD3A 5C87A 4DONA 5L96A 4KV1A 5HRVA 4PCIA 4A9HA 5F62A 5I1QA 4A9LA 3O35A 2R0SA 4F3IA 4N3WA 5L97A 4A9KA 3HMEA 5FFVA 5CP5A 4N4IA 2RO1A 3JVKA 5A5SA 4QUUA 3S91A 3IU6A 5HQ5A 4XY9A 3LQIA 3JVMA 5CQAA 5LKXA 4CUSA 4PY6A 4XUBA 5FE1A 4TS8A 3QZSA 4BW4A 5LUUA 5FG4A 4HXNA 5FE3A 5E7DA 4LZ2A 5E9VA 5ENHA 5F36A 5KTUA 5IGMA 5CQ5A 4ZW1A 3U5JA 5I88A 5KHMA 5K29A 5ETDA 5FH8A 4HXRA 5CUGA 2MJVB 3O36A 4IR3A 5CU8A 4QSRA 5FG5A 5H1TA 2YDWA 5L99A 4O71A 4YAXA 5A5NA 4QSVA 3IU5A 5I83A 4TYLA 5FG6A 4NXJA 5DLXA 2I7KA 5FFWA 4BW2A 5CFWA 4QSUA 5E0RA 4QNSA 4CUPA 5HRWA 3QZVA 5EWDA 5F1HA 5G4RA 2DVSA 2L84A 4LRGA 5D3JA 1WUMA 5D3RA 5FB1A 3UVWA 2RI7A 4Q0NA 4LYSA 3P1CA 4PKLA 4BW1A 4O70A 5F63A 3SVFA 4YYKA 5COIA 5DKHA 2N9GA 5ENBA 2RNXA 5CRMA 4NYXA 4HBXA 4XY8A 5D3HA 5FE0A 1X0JA 5F25A 4CUTA 4QSQA 4HBVA 3U5LA 5CGPA 3LQHA 4TU4A 4MENA 5AMFA 4YY6A 3SVHA 5AMEA 5DKDA 5HFRA 4O77A 4CFLA 3UV4A 4NUDA 5D26A 5DY7A 4WIVA 4QYDA 5E9YA 5E3GA 4LR6A 4HBYA 4QR3A 5HJCA 5EISA 4O7FA 3TLPA 4QY4A 4YYDA 4Z6IA 5F60A 5IGNA 5ETBA 5D7XA 2DVQA 4YYMA 2E7OA 3AQAA 5EA1A 3U5OA 5DFBA 4IOOA 5I89A 5BT5A 3U5MA 4TZ2A 5A7CA 4BJXA 3HMHA 3P1EA 4OUFA 5C4QA 2KTBB 4IORA 4NR5A 5II1A 5FE7A 4J3IA 4CURA 5LJ2A 1JM4B 4YYHA 4HXSA 5C85A 4HXPA 4QSTA 4CL9A 5EWWA 3D7CA 4AKNA 4NRBA 5L8TA 4O78A 4YK0A 4N4HA 5FE9A 3MB3A 4MEPA 4O75A 5ENIA 5DFDA 2FSAA 5DYAA 4RVRA 2OSSA 3DWYA 5H1VA 5EICA 4BW3A 4Z1QA 2R10A 5HFQA 2R0VA 4NRCA 4UIUA 4NYWA 3U5PA 4MR5A 2DKWA 5I7XA 5DX4A 2DVVA 4CUUA 4QSXA 4QZSA 4YBMA 5I86A 5A5PA 4A9FA 5DW1A 4YBTA 1F68A 5FH6A 5E3DA 3UV5A 4O7CA 5DW2A 5DYXA 4N4FA 5HM0A 4YH3A 5KTXA 4QSPA 3MXFA 5F5ZA 4OGIA 3G0LA 1N72A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OGJA 4FLPA 5DYUA 3ZYUA 5CTLA 5HLSA 5CQ7A 3RCWA 5FE5A 4LC2A 4LZSA 3SVGA 5DYCA 3I3JA 4CLBA 5KTWA 5ENEA 5EWVA 5CQTA 5ENGA 4YY4A 5LVQA 3ONIA 4C67A 5H85A 1PUOA 4QEWA 5TCMA 5EWCA 5IGLA 4QSSA 3O33A 5I80A 5E73A 2OUOA 3P1DA 5IBNA 4TTEA 4MR4A 5CRZA 5EU1A 4QR4A 3NXBA 5E9IA 5JI8A 5EWHA 5DLZA 5HEMA 5BT3A 4TT6A 5IG6A 4UIZA 5F61A 3UVYA 5CPEA 3MULA 4Q0OA 4A9IA 5D3PA 3VKGA 4ALGA 2I8NA 4TT4A 5LKUA 2D82A 2G4AA 2F6JA 3GG3A 4QUTA 3P5OA 3O34A 5FBXA 5LJ1A 5EQ1A 4CUQA 4IOQA 5F1LA 5D0CA 5EPRA 2YQDA 4J0RA 4Z6HA 5CQ6A 4QR5A 4O7EA 1WUGA 4CFKA 5ACYA 4HXLA 5E74A 5F3AA 5FB0A 5EPSA 5A5RA 2YW5A 3UVXA 5LKZA 5CZGA 5EI4A 5C7NA 5FE2A 4J1PA 2DVRA 5A5QA 4YBSA 4NR9A 5I29A 3UV2A 5ENFA 5CQ4A 5A5OA 4A9EA 5D3LA 3LXJA 4J0SA 4TT2A 5EM3A 4TU6A 4QB3A 4O7BA 4PS5A 5A82A 5D3SA 5C89A 2DWWA 3AADA 4YC9A 2E3KA 5EV9A 4UYGA 4X2IA 4IR5A 5CUBA 4QEVA 4XUAA 5L98A 5EP7A 5CQ8A 4UYHA 4MR6A 4YYIA 3MB4A 4LYIA 4A9MA 4NQMA 2RFJA 4LYWA 5ENJA 5JWMA 5C8GA 3Q2FA 5E9MA 4AKGA 4N4GA 4GPJA 5D3NA 3D1BA 4O72A 5LVRA 4YH4A 5FH7A 2WP1A 4A9OA 2NXBA 5ENCA 5IIDA 3K2JA 5CUEA 4C66A 5HRXA 5FDZA 4KCXA 4NUEA 4QBMA 3G0JA 2YYNA 4YYNA 4UITA 3JVJA 4O7AA 4UYDA 5DBMA 4HXKA 4UYEA 4MR3A 4O74A 5EVAA 4A9JA 3QZTA 4UIWA 1EQFA 4A9NA 2H60A 3UVDA 1ZS5A 2E7NA 5D3TA 4LDFA 5EK9A 4QC3A 2L85A 4ZC9A 5FE4A 5II2A 3P1FA 4NYVA 4PCEA 4YADA 5F2PA 3LJWA 5CQ3A 3UW9A 5A81A 4UIYA 4YYJA 4UIXA 4QEUA 5FFYA 4YATA 5D25A 4QC1A 5CY9A 5E9LA 5KO4A 5L8UA 5AD2A 3Q2EA 2L5EA 5LKTA 1E6IA 4IR6A 2YELA 4Z1SA 5CUCA 5HELA 5D24A 3MUKA 5E9KA 5HENA 5I7YA 4YYGA 4MEOA 4NQNA 5BT4A 4NR8A 4O76A 5IGKA 5G4SA 2OO1A 3MQMA 4TZ8A 2YEKA 4ZQLA 5TB6A 5A85A 5H1UA 5J0DA 3S92A 4PTBA 5CUAA 3JVLA 5I40A 4WHUA 2YEMA 5LJ0A 5FE6A 2RS9B 4ALHA 4Z93A 3LQJA 5A83A 3DAIA 4MEQA 5EPBA 4E96A 4HXOA 2WP2A 4IR4A 4NR4A 4UYFB 2DATA 4TQNA 5DKCA 5HCLA 4Y03A 5CUDA 1JSPB 4BHWA 4YABA 2F6NA 2LSPB 2D9EA 4HBWA 4HXMA 5DFCA 4AKIA 3O37A 2RNWA 4UYFA 2R0YA 3FKMX 3HMFA 5EGUA 3U5NA 4AI6A 4XYAA 5HQ7A 5CS8A 4NR6A 4NRAA 5HQ6A 4LZRA 4NS5A 4UIVA 5KU3A 4NUCA 4WHWA 4QYLA 2GRCA 3U5KA 4KV4A 2RNYA 4QSWA 4NR7A 5FE8A 5AD3A 5C87A 4DONA 5L96A 3ERRA 4KV1A 5HRVA 4PCIA 4A9HA 5F62A 5I1QA 4A9LA 3O35A 2R0SA 4F3IA 4N3WA 5L97A 4A9KA 3HMEA 5FFVA 5CP5A 4N4IA 2RO1A 3JVKA 5A5SA 4QUUA 3S91A 3IU6A 5HQ5A 4XY9A 3LQIA 3JVMA 5CQAA 5LKXA 4CUSA 4PY6A 4XUBA 5FE1A 4TS8A 3QZSA 4BW4A 5LUUA 5FG4A 4HXNA 5FE3A 5E7DA 4LZ2A 5E9VA 5ENHA 5F36A 5KTUA 5IGMA 5CQ5A 4ZW1A 3U5JA 5I88A 5KHMA 5K29A 5ETDA 5FH8A 4HXRA 5CUGA 2MJVB 3O36A 4IR3A 5CU8A 4QSRA 5FG5A 5H1TA 2YDWA 5L99A 4O71A 4YAXA 5A5NA 4QSVA 3IU5A 5I83A 4TYLA 5FG6A 4NXJA 5DLXA 2I7KA 5FFWA 4BW2A 5CFWA 4QSUA 5E0RA 4QNSA 4CUPA 5HRWA 3QZVA 5EWDA 5F1HA 5G4RA 2DVSA 2L84A 4LRGA 5D3JA 1WUMA 5D3RA 5FB1A 3UVWA 2RI7A 4Q0NA 4LYSA 3P1CA 4PKLA 4BW1A 4O70A 5F63A 3SVFA 4YYKA 5COIA 5DKHA 2N9GA 5ENBA 2RNXA 5CRMA 4NYXA 4HBXA 4XY8A 5D3HA 5FE0A 1X0JA 5F25A 4CUTA 4QSQA 4HBVA 3U5LA 5CGPA 3LQHA 4TU4A 4MENA 5AMFA 4YY6A 3SVHA 5AMEA 5DKDA 5HFRA 4O77A 4CFLA 3UV4A 4NUDA 5D26A 5DY7A 4WIVA 4QYDA 5E9YA 5E3GA 4LR6A 4HBYA 4QR3A 5HJCA 5EISA 4O7FA 3TLPA 4QY4A 4YYDA 4Z6IA 5F60A 5IGNA 5ETBA 5D7XA 2DVQA 4YYMA 2E7OA 3AQAA 5EA1A 3U5OA 5DFBA 4IOOA 5I89A 5BT5A 3U5MA 4TZ2A 5A7CA 4BJXA 3HMHA 3P1EA 4OUFA 5C4QA 2KTBB 4IORA 4NR5A 5II1A 5FE7A 4J3IA 4CURA 5LJ2A 1JM4B 4YYHA 4HXSA 5C85A 4HXPA 4QSTA 4CL9A 5EWWA 3D7CA 4AKNA 4NRBA 5L8TA 4O78A 4YK0A 4N4HA 5FE9A 3MB3A 3VKHA 4MEPA 4O75A 5ENIA 5DFDA 2FSAA 5DYAA 4RVRA 2OSSA 3DWYA 5H1VA 5EICA 4BW3A 4AKHA 4Z1QA 2R10A 3D1DA 5HFQA 2R0VA 4NRCA 4UIUA 4NYWA 3U5PA 4MR5A 2DKWA 5I7XA 5DX4A 1ZKRA 2DVVA 4CUUA 4QSXA 4QZSA 4YBMA 5I86A 5A5PA 4A9FA 5DW1A 4YBTA 1F68A 5FH6A 5E3DA 3UV5A 4O7CA 2EJNA 5DW2A 5DYXA 4N4FA 5HM0A 4YH3A 5KTXA 4QSPA 3MXFA 5F5ZA 4OGIA 3G0LA 1N72A
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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