4YLW | Genus

Total Genus 139

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	139
sequence length	364
structure length	363
Chain Sequence	GDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPRARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
publication title	Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (DHODH) with No.33 compound rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	139
structure length	363
sequence length	364
ec nomenclature	ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date	2015-03-06

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4ylwA00

1H60A 1TPB1 1GTHA 4AH7A 5G1TA 1AW5A 1TREA 1PIIA 3DAQA 3VKJA 1TPVA 3EX4A 5DBUA 1GVQA 1R2TA 3WK2A 3WJXA 1OFQA 4EOUA 4NUWA 4MZ1A 4EWND 2JKEA 4IUOA 5D2VA 5G2WA 2CLOA 2ZZ4A 3NPWA 2FB2A 4P2VA 5C6MA 3A23A 1LDCA 1R2SA 4M7TA 2FTPA 3E12A 6TIMA 2DJLA 1M5WA 4R33A 1TMHA 3DI1A 4OT7A 1HUVA 4NQ1A 3PULA 3W75A 4BF9A 1AW2A 1EP3A 4CNPA 3LLFA 3DBPA 3IEBA 2X16A 3KXQA 4O14A 5D09A 3L5AA 5FESA 1P5BA 2ZA3A 5D33A 3M47A 3UWYA 1H7WA 3KRZA 4Y9AA 1GPWA 3UZ5A 4OV9A 5BW6A 3TNOA 5KINA 4HHPA 2WV8A 2JGQA 4CQAA 3W23A 1KM0A 2NZLA 3BG9A 4JNMA 3WK3A 2P10A 5HMSA 2G97A 3W6YA 1TRIA 4TX9A 3BW4A 3NQDA 2V5LA 5AOUA 3TW7A 3JRKA 3NDOA 3NL5A 3W74A 4O28A 3PAJA 4RR4A 1XKYA 4NNBA 1X8FA 1LOSA 3Q58A 3LHZA 3C3NA 4FIRA 2VEIA 4D2JA 3NQ6A 4Y8FA 5DN1A 3B05A 3W3OA 1CX9A 5KSWA 4UIOA 7TIMA 4FX8A 4CNOA 1WQ5A 2YW3A 3A5VA 3PB0A 4UR8A 5HWMA 5J5RA 2EKCA 2YX0A 1G67A 1U83A 2PRHA 2GQ9A 2UV8G 1CI1A 4XKYB 1ICQA 3JR2A 3R5EA 3W7RA 1IIHA 2NX3A 3TH6A 3OG3A 4H4IA 8TIMA 1OF6A 4UTUA 1O5KA 4I9AA 1W5NA 3G0UA 3NOEA 4M5PA 3S5NA 3LCFA 4FX7A 3NNTA 4JY9A 3CWNA 5DLCA 2E6YA 4OU1A 3QFEA 4IXXA 4YMZA 3TXVA 3FKRA 1KFJA 3W7DA 2ZZ3A 3MMTA 1J5TA 4IMDA 1Q6OA 3Q37A 4RK8A 4N6FA 4MYXA 4Z08A 1JCNA 1KTCA 3L66A 3WJZA 3TV8A 4HT3A 2YZRA 1OYAA 4LV9A 1TTQA 1QWGA 4Z1DA 4UTWA 3A9IA 3N2XA 5I3IA 3CTLA 3G3MA 4WX2A 4XBSA 1B9BA 2V5BA 1HTIA 1O4UA 3M0ZA 2VEPA 2GUUA 4G1KA 4LT9A 4ZVJA 3Q94A 1KM3A 1MEWA 4UTIA 2QKFA 1GTEA 3HO8A 2QCMA 1HO4A 4JTLA 1QOPA 3SZ8A 1ME7A 2QCFA 3BLEA 3MBFA 5L6UA 4GFSA 2ZZ7A 4QISA 2BWGA 2C0AA 1UJPA 3TC6A 1WDWA 4QITA 4JTSA 1W54A 1DL3A 3TROA 1OX6A 2BLEA 3G18A 1YPIA 5D30A 3NZ1A 3CIWA 1SZFA 1EP1A 1IGSA 3U8GA 2FB3A 5C54A 1JRBA 1B4KA 4DF1A 5BRBA 4DF2A 3FJ6A 4HKPA 2FQIA 1SZGA 1TJPA 3HOJA 3CEUA 2WSQA 5LSMA 1A53A 1GYNA 3E9AA 3P80A 4DO4A 1OX5A 3IVSA 4WY0B 2NWRA 2A7PA 4O1BA 1G69A 3P84A 3TC7A 2DZUA 2DZWA 1SQ7A 2P1FA 2QCCA 2V0TA 3PG9A 4ADTA 2B4GA 4RLIA 1FCUA 4GBUA 3L9CA 1WOAA 4XTDA 4UTTC 4FXSA 1C8VA 4OWGA 4RKAA 3QF0A 3RFAA 1GT8A 3W7GA 3KVLA 1QCWA 1NF7A 2C6QA 1Q45A 2CLEA 1JULA 2ISSA 3LXBA 5CPNA 3TXZA 3LBCA 3UWZA 4WD0A 1FCBA 1SW7A 3L0NA 4S2BA 3KFTA 4KFOA 4RZ5A 3WJWA 4WQ6A 4NJKA 1LOQA 3GDRA 4NU7A 4O50A 4YWIA 4EIVA 1QO2A 3MJYA 1LORA 3LDVA 2GQAA 4U28A 4NNAA 4AEOA 4KFPA 5IBXA 4ZMGA 1FDJA 3NM3A 2ATSA 2DZVA 1QR7A 4ZL1A 1P0NA 3LV5A 1D3GA 2RKXA 1RPXA 1I2PA 1Z42A 2ABAA 1KBJA 4MJZA 3R2GA 5DCBA 4WJEA 4BI7A 1G6CA 3LI0A 3W1QA 1OFBA 1UUMA 4UNKA 3EXTA 2AAMA 3PUOA 4MIMA 3V1PA 5CZSA 1EWEA 5K9DA 3W7QA 4JTFA 3L5MA 1TTPA 1S5TA 4WZHA 4S2CA 3TW6A 3EX6A 2QAFA 4ZQRA 2H3DA 3PBWA 3STEA 3YPIA 2J9ZA 4KKXA 2VKZG 2FIQA 3DFQA 4IGHA 4PH6A 1KFCA 4TIMA 4IQLA 2QJHA 2PRLA 3I6RA 5HUPA 3C61A 4UC5A 4WOZA 3F4NA 2NV1A 3LTPA 3VE7A 3FJLA 2BTMA 3O16A 1RQHA 4LY8A 3T78A 3I68A 1VLIA 1E51A 3W2NA 3TIMA 1ME9A 1MEHA 1OG0A 3RK8A 4YLWA 3CPRA 3EWXA 1T8XA 1DJQA 5F2IA 5F4XA 4JX4A 4GWEA 4RZ4A 1K3UA 3BK0A 4LS1A 4LU0A 4FNTA 4RCXA 1TPEA 3O8AA 4O1DA 4R34A 4O10A 1YTEA 3C52A 1W56A 1N7KA 3QYQA 2QUUA 2V81A 4JTEA 5KZMA 1LRQA 4W9TA 3NAVA 3BG5A 3PUDA 3DZ1A 1VZWA 4AB4A 1TQXA 4NX0A 2NLIA 2E6FA 3T40A 2V9DA 3NG3A 2Q8LA 4AHQA 4K8EA 2WO5A 2CLLA 2Y7FA 3LCWA 3IGUA 3SSJA 1S3HA 1IF2A 3PBVA 4FNPA 2FLIA 1EUAA 2PRMA 4IMGA 1QPRA 4JTTA 3NQ8A 1UBSA 1XBYA 2NUYA 2A7RA 1G4PA 3T7VA 5F1VA 2ATMA 3GAYA 1TPC1 3GNDA 4XTIA 1WBHA 1ZENA 3HG4A 4XWUA 3NA8A 3H53A 4QSHA 1F6PA 4LW7A 4J9JA 3R89A 1LRNA 1SO6A 1EIXA 1DQWA 3QZEA 3A21A 3C2EA 2E6AA 3PBYA 5HR6A 1ZAJA 4UFJA 4Y6GA 2F84A 4S1FA 2QAPA 2E77A 1I8JA 5AHEA 1Z41A 2AQWA 1SR9A 4L4LA 3P5ZA 3GVGA 3WFAA 3IV3A 2BSLA 1D9EA 3MW7A 4UTWC 4FNUA 3M41A 1DHPA 4AF0A 1B4EA 1GYLA 1JRCA 3S1VA 1HG3A 1H7XA 3P8JA 4XZ9A 1K03A 1Q6QA 3CC1A 4FEZA 2ZA1A 3WK0A 4O57A 4TO8A 3CLMA 3LHTA 3ZR4A 4A22A 4GUGA 1KFEA 1YLVA 1SU5A 2CFFA 1LYXA 2Y85A 4I7UA 4I7VA 1SW3A 1UCWA 3VNDA 3QMRA 3W7EA 2VELA 2X1SA 4MFDA 5E93A 4I7WA 2V82A 2C15A 3WJYA 3LRMA 1DORA 3M5XA 1YADA 2E5BA 4DBEA 1PE1A 2VFFA 4OGZA 5AFDA 1VHNA 3ZFHA 3NZRA 1QO5A 2NWSA 3GDKA 1H50A 2ZZ1A 4XQ6A 1R2RA 3F4WA 1DJNA 1U5JA 2PURA 1I2RA 1W3IA 2B0MA 3M6YA 1I2OA 1VLWA 1PV8A 3B03A 3GB6A 4K37A 1LBFA 2WPBA 1H7PA 3MBDA 2TPSA 5EA9A 3QMTA 3G1FA 1LRTA 2ZTKA 5HUOA 4JIPA 1VC4A 2JGYA 3CU2A 2YFOA 3HPXA 3MHGA 3NXFA 1YTKA 2QJGA 1FXQA 1ZAIA 4JTKA 3W1NA 4Q32A 3LM7A 1VJIA 3M5YA 3PWAA 5LKYA 4FX6M 4PCFA 3HQ1A 5H2ZA 4JX5A 1P4CA 3B4UA 5LGZA 1WXJA 5F2MA 5F4WA 2Y6ZA 4IOTA 4DO5A 1B3OA 4Z0SA 4WUIA 4R7JA 1QPNA 2YGYA 3HGJA 1KM6A 4UTTA 5KZDA 1VYPX 1VHCA 3STCA 4JS3A 3TFXA 3TAKA 1FWTA 3S42A 4K7VA 3GXPA 2CZFA 1YXCA 3DKJA 1M7PA 3C8FA 4N9DA 2W0UA 4O12A 5I3HA 5AC8A 3TR2A 1VCGA 4HN4A 5IBXC 1EP2A 3HG3A 3TQVA 5AHNA 2Z6IA 3IIZA 4JTIA 1VYRA 1W5MA 4LVAA 3WK1A 2EF9A 2Q3OA 5AHMA 5TIMA 3TX9A 2A5HA 3LX9A 1GWJA 5D2YA 5I3KA 1Q6LA 3F1QA 4ML9A 3C56A 1OHLA 3HMJG 3W1TA 1Z48A 5HQEA 3W22A 3F03K 5AHIA 4B5NA 4POCA 4JX6A 3UZJA 1JCMP 2YCEA 2Q3RA 3BW2A 3LRKA 4RJEA 2WSYA 4DPPA 4CQ9A 1NF0A 2B7OA 1H7RA 5LNSA 4O13A 2C13A 5CPOA 5G5IA 3VFLA 2CLIA 2C1HA 5E0KA 3IGXA 5LHEA 1FXPA 3PSVA 4MPQA 3T55A 2QCHA 3G0SA 4IPIA 3W73A 4UMAA 1YDOA 4A29A 3N9SA 2QUTA 3MYPA 2E5DA 4NJGA 2VFGA 1KM2A 4BFAA 1XL9A 1V7YA 3G1DA 1W5QA 1NEYA 1LROA 1OVDA 2B7PA 2GJNA 2WKJA 4IXHA 3GR8A 3W2UA 3KX6A 4NXSA 5J5DA 1R47A 3FS2A 3O06A 5MHBA 4AMAA 4NT0A 4O52A 3L0KA 3G1SA 1R30A 3S5OA 1AK5A 1TPFA 4O53A 1OX4A 4UTJA 3NQFA 1TV8A 3L68A 2VENA 1XDLA 5HR7A 1I2QA 4GJ1A 4N6EA 5FF3A 5AB3A 1SO4A 5LNVA 1F05A 5G2IA 3G8RA 2H90A 5GVJA 2LLEA 3THAA 1AG1O 4JXCA 1THFD 3TJLA 5C55A 5LNWA 3OVQA 4GE8A 4BWLA 5AYZA 5HJLA 2DU2A 5FI8A 3BV4A 2Y7GA 3L2IA 2WNZA 4JYFA 3OEXA 4LVFA 1L2UA 2V8ZA 1TPUA 3DHDA 3EXSA 3MHUA 4UTMA 3EB2A 4PODA 2WQPA 4LNYA 3GZ3A 4OE7A 1FDZA 1KM5A 5H91A 4BK9A 1WA3A 3N14A 3OHIA 2FJKA 3NL6A 1FY6A 1SFLA 1TO3A 5ABTA 1YXDA 3W1UA 3CEPA 2ZDRA 5LNRA 4AXKA 2VXNA 1T0OA 3UWQA 1F5ZA 2G5WA 1OYCA 4LWWA 3QQ1A 5D05A 3S1WA 4YXGA 3ANYA 1TTJA 4O54A 3IVUA 1VYSX 5G4EA 2DZTA 3GDLA 3BO9A 4PEKA 3GDMA 1OF8A 5C2XA 3VE9A 3HBLA 3AO0A 1FCVA 2XN2A 3FLUA 3E02A 3EWUA 1F2JA 3UPWA 4ADSA 3MO7A 4UCGA 4AF0B 1KTNA 1VR6A 4JYDA 3TA6A 3UY7A 3TJXA 1LZOA 4O0ZA 5FEZA 1XUUA 1H5YA 3HPZA 3LXAA 1ICPA 1BWLA 2G95A 1JVNA 2DORA 1G4TA 4PA8A 3EWWA 1P1XA 3DKLA 2KZHA 2FPVA 5F2GA 2E5CA 4MY9A 2NXIA 1YDVA 2ZZ2A 1PCKA 3MP5A 4AHPA 1XCFA 4LC6A 4PL1A 3H54A 1MEIA 3PSWA 4GUIA 2RHGA 3GDTA 3SW6A 2C19A 3LCXA 4IX2A 3RU6A 2XFWA 2FPYA 4Y96A 3W1RA 3FOKA 1NSJA 2CW6A 1W1ZA 4O8RA 1RD5A 2HS8A 4CCCA 3O1NA 3KHJA 4ZQCA 3C6CA 2VOMA 1VQTA 1SO5A 2GJLA 2J88A 3PBUA 1KBIA 2YPIA 1JCJA 5K2ZA 5CZTA 3N3MA 2C18A 3SIZA 2A4AA 3S1UA 1TTIA 3EWYA 5K9CA 3LGEA 1JCLA 2DZSA 3QEZA 4HPJA 1EWDA 2NXHA 2B7QA 2ZRWA 5T26A 3C2RA 4K38A 3WJSA 4FB7A 1NVMA 4N9CA 3SECA 3A5FA 4LV4A 3LHWA 4NVTA 5G2HA 2ZRUA 3BVJA 1TPWA 2NX1A 5F2LA 4WY0F 3OVPA 3QQ0A 4TU1A 2HSAA 3N34A 3MWAA 5DBTA 4CQ8A 5EKYA 5CGQA 3DFSA 3B04A 3QC3A 2DZXA 3O63A 1GG1A 3B0UX 3TFCA 3HGOA 3LERA 4WXYA 2HS6A 3W70A 1FUYA 5K3VA 5D2XA 2PC4A 4DO6A 3E0IA 5LNUA 2QUVA 4CCEA 1OABA 3MHFA 3OA3A 1D3HA 1TRDA 1VS1A 4HNVA 1TV7A 4N4QA 2O7SA 3FYPA 3W7PA 3W85A 2EPHA 1TYGA 4HNNA 1GG0A 5FF4A 2Z6JA 3AJXA 1F73A 4OQVA 1MXSA 4AWUA 1XFBA 4O1AA 5K4XA 1XBXA 1OFRA 3G22A 2WNQA 1I2NA 1F6KA 2H6RA 4AAJA 2Z1BA 4MY1A 3PY2A 3UY8A 2OX1A 3RMJA 1W0MA 3O6YX 1VGAA 4K36A 1FBAA 4JICA 3O6CA 4A3UA 3HG5A 1HO1A 4DPQA 1MZHA 3G0XA 5C5YA 2QJIA 1VH7A 3O15A 5F1UA 3GNNA 3DI0A 1FWSA 3IIVA 1LLWA 1UASA 3TU9A 4GUHA 3GXTA 4Z0JA 4CCDA 2GOUA 5EMUA 1LBLA 4BI6A 2OT1A 4KFNA 4KWWA 4BR1A 4FNQA 1KV5A 3W88A 3BLFA 2GQ8A 1SW0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4YLWA

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