The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
63
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sequence length |
351
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structure length |
258
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Chain Sequence |
MGKSHKCDFTKEKYLLSGEKEVSCEIDANPADDITFICPNLCFHTVNIAKNINQNKATMSIQDLLYGSVVYGNTLFISPYVRTNTPFYCFCNLDTVTIQKFLKINRFLKDDDELSIISKRGIMSVFVRSNNNVIKGCDFGNNNKNYFSHPISVAGVNNKVCKIQGKPGELVGFKCAFEENGKVEPPNCFDQVLHKNKVTDLKTLIPGYASYTNKHSSKYPYYLKIPHFVNEQYTIQCCSNNAQNEYTFELDIQPGESE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Immune system
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| molecule keywords |
Merozoite surface protein P41
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| publication title |
The Structure of Plasmodium falciparum Blood-Stage 6-Cys Protein Pf41 Reveals an Unexpected Intra-Domain Insertion Required for Pf12 Coordination.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Plasmodium falciparum
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| total genus |
63
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| structure length |
258
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| sequence length |
351
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-03-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07422 | s48_45 | Sexual stage antigen s48/45 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Sandwich | Immunoglobulin-like | Immunoglobulin-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2YMO A; 2LOE A; 4YS4 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3QJS B; 1PZ3 A; 3MRP B; 2BS9 A; 4PSR A; 4EI0 A; 2BSE A; 1MCO L; 3OPZ H; 2VDL H; 2XJK A; 4FAB L; 2YXF A; 2FB4 H; 4ZFF B; 4AL8 C; 1DQJ A; 2J2Z A; 1HIM H; 2DM7 A; 4GY4 A; 2AV1 A; 4KXD A; 4PJ5 A; 2YAE A; 5LWY L; 2GJJ A; 1MNU H; 3BI9 X; 4ZOE A; 3B9V A; 1W0W A; 5BVP H; 2WCG A; 4GKZ B; 2XWT B; 3U4E A; 2BIH A; 3QDA A; 1U3Z A; 1AJ7 L; 3K6I A; 4W9D C; 4EKX A; 4JFH E; 3U30 C; 1IM9 A; 5F7D A; 3UXF A; 1MZY A; 1UXS A; 3U0P B; 4IML B; 5MHS E; 5GGV L; 5E2W H; 2OR9 H; 2R0L L; 1FA4 A; 2NY2 B; 3MJ9 A; 5KVF L; 1CGS H; 3VTM A; 3OKK B; 1BMZ A; 2O5X L; 4I9W D; 3OKM A; 3HZK B; 4PJI B; 3FAX A; 5GS1 B; 1ACZ A; 3P2B A; 1NCC H; 2A74 C; 2DOC A; 3R7R A; 2QPS A; 4EUP H; 1NDG A; 4MX7 B; 2I60 L; 2Z93 B; 3GS4 A; 1GJU A; 5DLM H; 1Y07 A; 4EEE A; 3L8Q A; 4TVP H; 4E41 A; 2VZV A; 1GAF L; 1KTR L; 1T66 C; 5FR3 A; 2EIN B; 5AW7 B; 2QPU A; 1ADQ A; 4FZ8 L; 4HIH B; 4M6N L; 4LEO A; 2GI7 A; 4M9P A; 4XCC H; 5D7L B; 4FFZ A; 1FZO B; 4Y5Y A; 1N5A A; 1MW1 A; 4XMK H; 1SUJ A; 1PZ5 B; 5DJC A; 3UOA B; 1J12 A; 4ZFZ B; 4HUX A; 4FC3 E; 3DXA A; 3HFM L; 3KYN A; 3T0A A; 2D0G A; 2C9U A; 4YHZ L; 1TJM A; 1LO3 H; 5BS0 E; 4OZH E; 2BFV L; 2XQB H; 3H9H A; 3QWR A; 5DRW B; 4JO2 L; 4QHU A; 3MR9 A; 3CCH A; 3OGC A; 4KFZ C; 5CP3 A; 3ENE A; 1RD6 A; 2VDK L; 2WKO A; 5IVO A; 4HX1 A; 2X1X R; 3V9C A; 5HHQ A; 1RIU H; 1VAC A; 2ZUX A; 4FTV A; 3Q6F B; 1P7K A; 2VXT H; 2E9J A; 4AMK L; 1E7U A; 1MWO A; 2W0P A; 3JV0 A; 4R8W L; 3RPB A; 4DP2 X; 5I5R A; 2VDP B; 2VL5 B; 3FTV A; 3EIF A; 4OZ4 A; 2ZOL B; 2N1K A; 3IRP X; 3D06 A; 2ESV B; 2ENJ A; 4DP5 X; 4WK4 B; 3WKQ A; 4G80 B; 2EEA A; 5I1I H; 1IGY A; 1F3D H; 4JHW H; 2PW2 A; 4UQ3 B; 4M62 H; 3GUF A; 4TNF A; 4WUU E; 1C5C L; 1KTD B; 4OZG B; 4IU3 B; 4X6C E; 5HHP A; 4WW2 A; 2P5E D; 4N2I A; 4M1G L; 4R4N C; 4D2N A; 3ZR5 A; 2YD5 A; 4PJG E; 5GRX G; 4IBS A; 2GC4 C; 2VQT A; 1TTB A; 4HJI A; 5KSA A; 4ZNC D; 1J7V R; 4XPB H; 4E36 A; 3NSX A; 4RNR B; 4HJG A; 3MLP A; 5AD0 A; 4KVC H; 2JCC B; 3HE6 D; 1B4T A; 3OAU H; 4QHM B; 3MNW B; 4U2Z A; 1O0V A; 4WK2 B; 4XNM B; 4N4Y B; 3GI8 L; 4O5L H; 3MOA H; 5TFS H; 3OPZ L; 4EDW L; 5I6X B; 4XML L; 1CCZ A; 2CGZ A; 3LH8 A; 1XF1 A; 4RAU A; 1R5V B; 4JBS A; 1X7S A; 35C8 L; 3RPK A; 3C5Z D; 5FF6 B; 2IDS A; 3P73 B; 3PJN A; 5BZX A; 1B4J L; 5I6L A; 4XXW C; 2LTQ B; 2X1P A; 1NUN B; 4JFD E; 3TZV C; 1KXV C; 1BD2 E; 1ASP A; 4PP2 A; 3RGV D; 2NSQ A; 4Z77 B; 3U7Y L; 2OAA A; 4F8T A; 5E8D L; 5CD5 D; 3K0Y A; 4HK0 A; 2KDG A; 3QIW C; 3IS1 X; 2W0F B; 5I74 C; 3VGH A; 1CTN A; 1AS6 A; 2Y23 A; 5T1M B; 4TVP D; 1AD9 A; 4Z76 A; 4MNH B; 2O1A A; 1T7X A; 4QRR E; 1OPG L; 3U4B L; 4UTC A; 4NDM A; 3CTT A; 5FGS A; 4MJI D; 2OL3 H; 4XC3 L; 4GRL A; 3DOH A; 3IPE A; 4A6Y A; 3F00 A; 1M2O A; 4XWO C; 4X5X B; 1KEN H; 1VER A; 1UWG H; 1J1P H; 3GMP B; 5F44 A; 3ISW A; 3MRK A; 5T33 H; 1MFC H; 3TO2 A; 2HX7 A; 1ROC A; 3PPE A; 4K8R H; 3D25 A; 1H3T A; 2WO2 B; 4O2E B; 2RHE A; 3CVH B; 1H15 A; 1SJX A; 1MCW M; 1UZ8 B; 3I50 L; 3MLV L; 2A6D A; 4IYK A; 4HYT B; 4PJ9 C; 2FNB A; 3U1Q A; 2PCY A; 3BGM A; 4DK6 A; 1CLV A; 4ES9 A; 5C3I A; 4PLO B; 5SV4 A; 1GGB H; 5TQ0 L; 2HT2 C; 3CDG A; 4Q9B A; 2BC4 B; 2XQB L; 3HI6 H; 4LCY A; 2OMU B; 1ETJ A; 4M93 B; 3HHS B; 2XZQ L; 5JA8 B; 4G2A A; 4XMP H; 2AI0 L; 3O3E B; 3HC4 L; 2W5P A; 3U0T A; 2JKW A; 5L4I A; 1QBB A; 4HME A; 1GGC H; 1U41 A; 3LZQ A; 1I9I H; 3VXR B; 2IG2 H; 4I3S H; 3T4A C; 4P46 A; 3VMO A; 4W81 A; 1CBV H; 1UFG A; 3MOD H; 1I85 A; 1UEY A; 2X2U A; 4HQQ H; 4OUO A; 1ZAN L; 4CW1 B; 4QD2 E; 4HDI B; 5EO1 B; 2L8A A; 2H1P H; 1F1A A; 1HCZ A; 5JIH A; 1OSE A; 1YEI L; 2A38 A; 3L3G A; 1OSZ B; 4JKP L; 3WN5 A; 2Z4T A; 2CA3 A; 1ZK5 A; 4G9D B; 1EWH A; 5CZX C; 4YBQ D; 2YUV A; 3L3O C; 1JTO A; 4XPB L; 1UAT A; 5DK0 A; 5MEP B; 2HPT A; 3PJL A; 3LV3 A; 3C9N B; 4JUS A; 3TA4 D; 1CN4 A; 4I48 A; 5IJK A; 2YMX H; 3D87 B; 2H6P B; 2IGT A; 2X0V A; 4WTZ G; 4XPH L; 5J1S C; 2V5S A; 4NO2 A; 1ZT1 A; 1ZTX H; 2EE9 A; 4J3W A; 4J7R A; 1IKN C; 2UZI L; 5IQ9 B; 1PEW A; 4WWP A; 3OXR B; 2ZXB A; 3QDG A; 4P59 H; 3BVN A; 1FI8 C; 2J8U E; 1ZY9 A; 3BUP A; 3RWH B; 1CT8 B; 1TVB A; 3Q6G L; 2R2B B; 4KNQ A; 2HX8 A; 3MFF B; 1GXE A; 3OF6 D; 4K23 L; 4L05 A; 2BPB A; 3R18 A; 4LLQ B; 4F2F A; 4G7R B; 2WXK A; 2MCP H; 3EFF B; 4UZG A; 5DJY A; 4XXC C; 4FNL L; 4FXK B; 2AQR A; 3V79 C; 1HFU A; 4UB0 H; 3U6X S; 3OGO E; 3LN9 A; 4J3V A; 1I82 A; 3GI9 H; 4CVX A; 3BSZ L; 1R0A L; 2GK0 B; 3JT0 A; 3ARD B; 2QJD A; 3QEQ D; 4K8R D; 5AFA A; 3IDU A; 5G5D B; 3K6S B; 1LDP H; 4M61 A; 4KGL A; 1RH8 A; 1OK0 A; 2XBT A; 5IVZ B; 1ULV A; 4TOY L; 3O3A B; 5MP6 H; 3U79 A; 1GPO L; 2FJU B; 4YHO H; 3V6F B; 1I8A A; 1WBX A; 1E9Q B; 1U92 B; 2GQH A; 2F6A A; 5AVU B; 5B39 G; 3DVG A; 4K8R L; 3BH4 A; 5ADO L; 1TQW A; 4XVS H; 1M3J A; 1PS3 A; 1AQM A; 2WWO A; 1GHF H; 1NFK A; 3T6Z A; 3BP7 A; 5ICX B; 5AAM A; 3NZH L; 1KWK A; 1DBJ L; 3GXP A; 5EBL A; 3BE1 H; 2P5W D; 1IX2 A; 4ODU B; 5DFT A; 4WI2 A; 4D9R E; 1EAJ A; 4F33 B; 1ZS2 A; 5EUO A; 3CFU A; 3T0E D; 1MJ7 H; 4IS6 A; 3VD7 A; 2IDU A; 3S96 B; 1RZ8 B; 2NY1 D; 3PAB B; 4AEF A; 5DD0 L; 5E6I B; 2VLL A; 2ZXG A; 3UZE A; 3MRI B; 4NUG H; 1N7M L; 2BM3 A; 4G8G A; 1GGC L; 4FER A; 1IBZ A; 2IG2 L; 1NAM A; 3QZW B; 4KXA A; 2HTK D; 4MJ5 A; 4WVR A; 2R69 H; 3WIA A; 1KN4 L; 1HZK A; 2CR0 A; 4LNR A; 3PGC A; 1RPQ A; 3FT2 A; 2AAB H; 3NG5 A; 3P3T A; 3D12 B; 2DQT H; 4FYT A; 3CLW A; 3RZC D; 1DBK H; 2DIE A; 5J8O A; 3LQA L; 5AW9 B; 2CLZ B; 5KYN A; 1ZLD A; 5BZZ A; 3LPP A; 4PY7 A; 2EDB A; 5KSB E; 4GUO A; 2XWJ A; 3EUD A; 4MHH I; 1ZIB A; 2C1P B; 2F53 D; 4POY A; 2A0L C; 3VQM A; 1WS8 A; 2APT A; 4KI5 E; 2APW A; 1ZTX L; 1X5Z A; 4HFW B; 4UT7 H; 1J8H A; 15C8 H; 5E9D D; 4ZUV B; 3WXV H; 5IQ7 L; 3NJN A; 4QXU L; 4K9J A; 4EN3 C; 4Z7N E; 3KYK L; 4ZS6 C; 5FAA A; 3DAR A; 3SDA A; 2AXG A; 5LN4 A; 3GSN B; 5ESV B; 1W15 A; 3SDX F; 4DZB B; 1UTD A; 2VLJ D; 4HEP A; 1WAE A; 3QQN A; 1MNN A; 2G30 A; 1WZA A; 3L1O H; 1MVU B; 2XWB A; 1MHC B; 3MJW A; 1LP9 A; 4N0C D; 4FQX B; 3SGK C; 4OFD A; 2ZYH A; 1NFA A; 2A6I B; 1R34 A; 3AWE A; 3D3V D; 3VWK B; 1A8Z A; 3HUJ E; 5JPN C; 2X4P A; 2EC9 T; 3H9Z A; 4WWK D; 2VUY A; 4JN2 A; 2ALW A; 5HHO A; 5D7S H; 3EDF A; 3W38 A; 4K3J H; 3PHS A; 3BQU A; 4HAG A; 1A6A B; 4DO6 A; 1S5H A; 1KCV H; 3QUH A; 1A7Q L; 2CDE B; 3BXN A; 3FUE A; 2I7S A; 3ZRC C; 4KTE H; 4JO1 L; 4DOH E; 3U25 A; 3JVG A; 1UAS A; 2W0K A; 4HC1 A; 5GGS A; 4FCA A; 3SOB L; 5TE4 H; 3TWC H; 3QG6 A; 3DUU B; 3IXT B; 2MCM A; 1W16 A; 3S5L A; 4UIM B; 5CIL L; 4YST A; 1XGP B; 2DQD L; 2Z31 C; 3S36 H; 4GS7 B; 5IVN A; 1ESO A; 5AVV B; 4WEU D; 1I3R A; 3ZDW A; 4OZH B; 2RAM A; 1R6V A; 1XIW D; 1HSB B; 2WLH A; 3WJJ A; 3FHA A; 3L4W A; 1NKO A; 1A6T A; 2VH5 L; 4JRX D; 2VQU A; 3X1G A; 2IH9 A; 5KBK A; 3DGD A; 4MMX C; 4TVP E; 5CJQ H; 1PAZ A; 4YGV B; 1UGK A; 3QIU C; 3V5D A; 5LBS A; 5A2A A; 3TN0 C; 3OKL B; 2WSK A; 3HPJ A; 1DBB H; 4QRS A; 4JPI B; 2W94 A; 3TA3 A; 2YQ3 A; 3FS9 A; 3PQY D; 1QLF B; 1HCV A; 1SVZ A; 4WUU B; 1KPV B; 1G7J A; 4X6C B; 5J3H C; 2DMC A; 4QXT B; 5EBW A; 1TJI H; 3T3M F; 4LLV B; 4WO4 A; 3RVX D; 4PJG B; 1S3R A; 4XR8 C; 5IES H; 2Y9R T; 3AQY A; 1DQT A; 1IGC H; 1OAK H; 4UT9 H; 2OP4 H; 5D96 C; 3WYR A; 2HFT A; 4JPK H; 2B4C L; 3SCM B; 1CL7 L; 1DBM L; 1I1F B; 2X28 A; 3PFQ A; 1A4J B; 1D5B A; 1YRK A; 3CFC H; 2NTF B; 3O2D H; 4PVL A; 5DHV B; 3J8F 7; 2ZWS A; 3ESO A; 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4WDI B; 4ZPV B; 2QZ5 A; 2P52 A; 2IVF C; 1YEE L; 1JFH A; 5D1X B; 1JGU L; 3MKK A; 1X5G A; 2NNA A; 3MV9 D; 4XMW A; 3ZT6 A; 5IHW A; 1UA6 L; 3TU6 A; 2H3X C; 5SX4 H; 3VGA B; 3ARF A; 4PRE B; 5E8P B; 2FUQ A; 3DMM D; 5D6D A; 1J5O L; 1QVO B; 2WXL A; 5CIP A; 1FYT D; 3CQQ A; 2ZXA A; 3P4O B; 4QIR A; 4JRL A; 3VCL B; 1BQL L; 4UQD A; 4X98 A; 4RGO L; 4A7G A; 4QLW A; 3CX5 J; 4IU2 A; 1PTZ A; 1I7U B; 4KK8 D; 2LAG B; 5EN3 A; 3SY0 A; 4JFY B; 3O4L E; 3QUY D; 1QEW B; 1VGE H; 5HVF B; 1HCF X; 4PB0 H; 1J0J A; 5EOT B; 1E4X I; 4JPK L; 2OJE A; 3D08 A; 1VHP A; 5D7J D; 1MLC A; 3HS0 B; 3G04 A; 1N10 A; 3G6A A; 1CXE A; 1FN4 A; 3LQZ A; 3GYR A; 4KJY A; 3CXH J; 5LGJ A; 1ND0 A; 4YHN A; 5I1K H; 4E9W A; 2IMM A; 4OFI A; 1UM6 L; 5AW2 B; 3B1U A; 5I5J A; 3T0E E; 1WIU A; 3QWN A; 5I1H L; 1TYR A; 4L37 A; 1I4F B; 4P5T A; 4GI6 A; 4RGN E; 5E6Y A; 5EII G; 1N2R B; 3SDD B; 4U1K B; 5FUC E; 1ZA3 A; 4XN7 A; 3GTT A; 3QPQ D; 5FKP A; 1MAM L; 2CJU L; 4B9Y A; 3P3Y A; 4AUY A; 4DAG L; 1T5X B; 2G5R A; 5L88 H; 3ETB F; 4HV8 A; 5IIE A; 1WT5 A; 3GB7 B; 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