4YWPA

Sucrose binding site in genetically engineered carbonic anhydrase ix
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHSFQVTFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLLQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDVGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTEGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLAECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title A sucrose-binding site provides a lead towards an isoform-specific inhibitor of the cancer-associated enzyme carbonic anhydrase IX.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 72
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-03-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4ywpA00
1ZE8A 1ZFKA 1JV0A 3HKQA 1DMXA 5FDCA 4HT0A 3HS4A 5SZ1A 4CNWA 5A25A 3RYJB 3S78B 3OIKA 4XIXA 4ZX1A 1IF7A 1ZGEA 2EZ7A 4BF1A 4HT2A 9CA2A 5CLUA 4Q78A 4MDLA 1J9WA 3OILA 3RGEA 1YO2A 1BNTA 1BV3A 1HVAA 1IF5A 3MYQA 4E4AA 5EHEA 3M1WA 5DRSA 1XQ0A 3UYQA 4KUVA 5EIJA 1DMYA 3IAIA 1FQMA 1CCUA 1FR4A 3FW3A 3RLDA 4RUXA 5EHVA 5FL6A 4FVOA 3P5LA 3OYSA 2CBBA 3U7CA 5EKHA 3RYXB 1BN1A 5JDVB 4CA2A 2NNOA 4IDRX 5BRVA 4ZWZA 1CNWA 1FSQA 5AMLA 3P5AA 3M1QA 2ILIA 5E2KA 5SZ7A 5FLSA 1BNMA 4QTLA 4TWLA 2WEHA 5SZ3A 1IF8A 5DSIA 4Q81A 4RFCA 2NWZA 3RYZA 4CNXA 4CNVA 1FQLA 3TMJA 4E9OX 5EKJA 4KV0A 2FNKA 1UGAA 2GD8A 4M2UA 1MUAA 1URTA 4Q6EA 3RZ5A 4QSAA 3T82A 2H4NA 5CACA 3JXGA 2NNGA 1CNIA 1CAYA 3MMFA 1RZBA 1T9NA 1RZEA 4K0ZA 3P55A 4FIKA 3KOKA 1OKMA 3MNUA 1YO0A 1I90A 3F8EA 1CNYA 1G52A 4XIWA 4E3FA 1DCBA 3RYYA 4Q09A 3RJ7A 4UOVA 5LMDA 1KOPA 4JSSA 1CIMA 4N0XB 4ILXA 3VBDA 1JCZA 5BRWA 4Q8YA 3V2JA 4Q7PA 4Z1KA 4YGJA 5AMDA 1Z93A 3S71B 4Q6DA 4Z1EA 3S73B 3U3AX 4DZ7A 3P4VA 1FR7A 1CNCA 4MO8A 4Q99A 2GEHA 3M67A 3M96A 2Q1QA 1THKA 4Q0LA 2O4ZA 4KNNA 5JESB 2CA2A 2WD3A 4MLXA 4QJPA 4ZWYA 5FLOA 5FLQA 1CVFA 3D8WA 1G6VA 3W6HA 1CCTA 4TWMA 4E3DA 5C8IA 4CNRA 5FNKA 1BN3A 2HNCA 4Q49A 1TG9A 3N4BA 4QSJA 4M2VA 1TB0X 4PQ7A 5G0CA 4Q7WA 3N0NA 3M5SA 2NWOA 2WEJA 2WEGA 3M5TA 4LU3A 4Q06A 1RZAA 3GZ0A 2F14A 3MDZA 5E2NA 2CBAA 1UGBA 5FLPA 1AVNA 3N2PA 2POVA 1I8ZA 4QJMA 4KNJA 5FL4A 3HKTA 1G1DA 4Q90A 4MTYA 3BETA 5FNHA 2FOSA 2IT4A 3P3JA 2NXSA 3MHMA 4YVYA 3M2XA 3PO6A 4ZAOA 4PXXA 4WW6A 4YWPA 1RAZA 3HKUA 4YGFA 4L5WA 1LZVA 2CABA 3V5GA 1HEBA 4RIUA 1CVAA 3IBUA 4QSIA 5EZTX 4ITOA 1XEGA 4M2RA 5JGSB 3CZVA 8CA2A 1CVEA 3DVDA 1CCSA 1UGDA 1ZSAA 1CAOA 1V9EA 3M3XA 4FPTA 1G53A 4FVNA 5CJFA 12CAA 1IF9A 3OY0A 4R5AA 4Q8ZA 5G03A 4HEZA 3NB5A 5DVXA 2VVBX 3NI5A 4Q83A 3U47A 5J8ZA 4LP6A 5FNLA 1EOUA 3K34A 4Q87A 1CVBA 3DCSA 4X5SA 4CQ0A 1CNBA 1FQRA 3DVBA 3LXEA 3S72B 3IGPA 3DC3A 4HEYA 3K7KA 3MHCA 1I9LA 1XPZA 3M04A 5DSJA 4E3GA 4HEWA 4Q8XA 3KONA 4QJOA 1CNXA 1Z97A 5JQTA 1OKNA 5EH5A 5FL5A 3S8XA 3M2NA 5EH7A 1RZDA 3S74B 5FLRA 2Q38A 3D9ZA 4Q9YA 3DD8A 3UYNA 2OSFA 5EH8A 4Y0JA 1CALA 3RZ7A 5FNGA 2NXTA 3DCWA 5SZ0A 1FSRA 3D0NA 5JEPB 3CAJA 5DSOA 4QK3A 1BNNA 3F4XA 2NMXA 2POUA 3R17B 2FOVA 3M2YA 4ZWXA 2NXRA 1CNKA 4PYXA 2EU2A 4Q08A 1ZH9A 3D93A 2WEOA 1CA2A 1FLJA 4QY3A 1UGFA 5DSPA 4RN4A 4N16A 3B4FA 4PYYA 4XE1A 5DSLA 3PYKA 1I9QA 5DSRA 4ZWIA 3OIMA 2QOAA 1BICA 5IPZA 3M40A 1CNHA 1F2WA 1TBTX 1DCAA 2NWYA 5FLTA 2FNMA 2W2JA 4ITPA 3MHIA 3OKUA 1TH9A 4PZHA 3SBHA 1G4JA 1LG5A 3T5ZA 3ZNCA 1CRAA 1HUGA 1HEDA 1JD0A 4Q7VA 3M1JA 1XEVA 3MWOA 2NNSA 1BNQA 2HKKA 3MNAA 1G0EA 2POWA 4K13A 4QSBA 5E2MA 1RJ6A 1FSNA 1LG6A 3D92A 1AM6A 4QK1A 5CA2A 3SBIA 4BCWA 3DD0A 1HUHA 3HLJA 1YDDA 4QK2A 4RFDA 1UGEA 5AMGA 4KP8A 1RZCA 4M2WA 4RUZA 1HCAA 4K0SA 4JS6A 1I9NA 3TVOX 2FMZA 4Z0QA 2OSMA 3P44A 3F7UA 3V3JA 4QJXA 1RAYA 3MNHA 3V3HB 1I91A 4HBAA 1I9OA 2NN1A 3FFPX 1G46A 3KKXA 3M14A 5BNLA 4QJWA 5DOHA 4WW8A 4YGNA 5HPJA 1Z9YA 3S9TA 4L5UA 2AX2A 1G54A 3T5UA 4WUQA 3MNJA 1HEAA 1CA3A 1LUGA 1UGGA 1H9NA 4K1QA 3V3IB 1OKLA 2FNNA 1HECA 3KIGA 5FNIA 4YGKA 5DSKA 5FNJA 1ZNCA 2X7UA 2QO8A 1AZMA 2CBCA 3OYQA 1CNGA 3M1KA 5L3OA 5SZ2A 1BN4A 1BNUA 3S77B 1OQ5A 1CNJA 3MHOA 1CAMA 1TEUX 2HL4A 3DV7A 1CAKA 3CYUA 4KNMA 4LHIA 3RG4A 1BZMA 3V2MA 4JSAA 4DZ9A 7CA2A 1I9PA 4R5BA 4WL4A 5DSMA 2AW1A 1G48A 1H4NA 1YDAA 3V7XA 4L5VA 4KNIA 1CRMA 4HF3A 5E28A 4E5QA 5SZ5A 1ZGFA 5A6HA 1YDCA 1TE3X 3M2ZA 4MLTA 5JEHB 1G3ZA 3MZCA 4QJ0A 5DSQA 4JSZA 1LGDA 3RZ8A 2CBDA 4COQA 5SZ4A 4Q7SA 1CINA 1ZSCA 3N3JA 5JG5B 2HFWA 5FDIA 2HD6A 1HCBA 1I9MA 5L6KA 3K2FA 3DC9A 4WUPA 4E3HA 2NN7A 1KWQA 2HOCA 4G7AA 3F7BA 1KEQA 2ZNCA 3DAZA 3T85A 3P58A 4G0CA 5E5RA 2NWPA 4K0TA 3TVNX 3DVCA 3W6IA 1CZMA 1G4OA 3RZ0B 1G0FA 3BL0A 1ZFQA 3R16A 5DOGA 3RYVB 3PJJA 3KWAA 1A42A 4QEFA 4QIZA 3HKNA 1CAJA 1TTMA 1MOOA 4KP5A 1Y7WA 1ZSBA 3JXHC 4FL7A 3ZP9A 3IBNA 1G45A 5E2SA 4HU1A 3DCCA 2FW4A 5EHWA 4WR7A 5E5UA 5SZ6A 3L14A 5G01A 4KUYA 5DSNA 3S76A 1CAIA 5JG3B 1IF6A 3IEOA 4IWZA 3S75B 3Q31A 5BRUA 1V9IC 3HFPA 2VVAX 2FMGA 3DBUA 3S97A 5G0BA 1CAZA 4YHAA 4C3TA 1CANA 3IBIA 4FU5A 1BNVA 4E49A 1CVHA 1BCDA 3KNEA 1YDBA 3JXFA 4RH2A 2WD2A 2EU3A 3P3HA 4Z1NA 2ABEA 3EFIA 3CA2A 3V3FA 1FQNA 4ZX0A 4RUYA 4YGLA 4R59A 2X7TA 3M98A 3C7PA 4YXUA 4GL1X 2QP6A 4FRCA 4BF6A 1RJ5A 3KOIA 4JSWA 1CVCA 4YX4A 2FOUA 3SAXA 5EKMA 3FE4A 3ML2A 3OKVA 1TEQX 4KAPA 6CA2A 4ETQC 1CVDA 1TG3A 3T84A 3KS3A 3MNIA 3U45X 3RG3A 3T83A 4YXIA 3B1BA 2FOQA 2FOYA 1UGCA 3KLDB 4XZ5A 4MDMA 3MNKA 5FNMA 5JGTB 4Q07A 4KUWA 4XFWA 3M5EA 3EFTA 3MHLA 5JQ0A 3QYKA 1CILA 4YXOA 1KWRA 4RIVA 1CAHA 5EOIA 2X7SA 4Z1JA 1BNWA 4QIYA 2CBEA 1YO1A 3DA2A 3SAPA 3V3GB 5BYIA 3ML5A 4YYTA 1H9QA 1IF4A 2H15A 3BL1A 5E2RA 3RZ1B 2NNVA 1KOQA 4CACA 5JEGB 4MDGA 2Q1BA 3IBLA 3NJ9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1ZE8 A;  1ZFK A;  1JV0 A;  3HKQ A;  1DMX A;  5FDC A;  4HT0 A;  3HS4 A;  5SZ1 A;  4CNW A;  5A25 A;  3RYJ B;  3S78 B;  3OIK A;  4XIX A;  4ZX1 A;  1IF7 A;  1ZGE A;  2EZ7 A;  4BF1 A;  4HT2 A;  9CA2 A;  5CLU A;  4Q78 A;  4MDL A;  1J9W A;  3OIL A;  3RGE A;  1YO2 A;  1BNT A;  1BV3 A;  1HVA A;  1IF5 A;  3MYQ A;  4E4A A;  5EHE A;  3M1W A;  5DRS A;  1XQ0 A;  3UYQ A;  4KUV A;  5EIJ A;  1DMY A;  3IAI A;  1FQM A;  1CCU A;  1FR4 A;  3FW3 A;  3RLD A;  4RUX A;  5EHV A;  5FL6 A;  4FVO A;  3P5L A;  3OYS A;  2CBB A;  3U7C A;  5EKH A;  3RYX B;  1BN1 A;  5JDV B;  4CA2 A;  2NNO A;  4IDR X;  5BRV A;  4ZWZ A;  1CNW A;  1FSQ A;  5AML A;  3P5A A;  3M1Q A;  2ILI A;  5E2K A;  5SZ7 A;  5FLS A;  1BNM A;  4QTL A;  4TWL A;  2WEH A;  5SZ3 A;  1IF8 A;  5DSI A;  4Q81 A;  4RFC A;  2NWZ A;  3RYZ A;  4CNX A;  4CNV A;  1FQL A;  3TMJ A;  4E9O X;  5EKJ A;  4KV0 A;  2FNK A;  1UGA A;  2GD8 A;  4M2U A;  1MUA A;  1URT A;  4Q6E A;  3RZ5 A;  4QSA A;  3T82 A;  2H4N A;  5CAC A;  3JXG A;  2NNG A;  1CNI A;  1CAY A;  3MMF A;  1RZB A;  1T9N A; 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