4YYCA

Crystal structure of trimethylamine methyltransferase from sinorhizobium meliloti in complex with unknown ligand
Total Genus 173
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
173
sequence length
487
structure length
479
Chain Sequence
GPGPSLPYIQRRIREYEVLDEEGLQLIERNADVVLEEIGIEFRDDAEALDLWKAAGADVRGQRVHFPKGLCRELLKTAPKDFTWHARNPERNAQIGGKATVFAPVYGPPFVRDLDGNRRYATIEDFRNFVKLAYMAPSMHSSGGTVCEPVDIAVNKRHLDMVYSHIRYSDKPFMGSVTAPERAEDTVAMAKILFGDDFVENNAVTLNLINANSPMVFDETMLGAAKVYARHNQACVVSPFILSGAMSPVTVAGTLTQILAEVLAGAAFTQLIRKGAPVLFGTFAASISMQSGAPTFGTPEPSLVSYGAAQLARRLGLPFRTGGSLCGSKVPDAQAAHESANTLNMTLLAGTNFVLHAAGWLEGGLVSSYEKFMIDQDQLGMMQKMAEGVDLSEDAQALDAIREVGPGSHYLGCAHTYRSPLADNNSFEQWEIEGEKRIEQRANALARSWLEHYEAPYLDPAIDEALKEFIAKRKDSMPD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Putative trimethylamine methyltransferase
publication title Protein purification and crystallization artifacts: The tale usually not told.
pubmed doi rcsb
source organism Rhizobium meliloti
total genus 173
structure length 479
sequence length 487
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06253 MTTB Trimethylamine methyltransferase (MTTB)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.480 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel TIM Barrel 4yycA00
2QNEA 4YYCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3Q4DA 2DQXA 2E0PA 3TJ4A 1NSJA 1VEMA 5A6KA 4TVCA 1R87A 1X98A 3S83A 1RP9A 3L4XA 4YTUA 1MW3A 2J7GA 3EDKA 4I9TA 1LRQA 3DFHA 2PWEA 1GOOA 3I3DA 2HMCA 1W1VA 2INEA 3D46A 4O18A 3E96A 4C6BA 4FALA 4ERAA 4AZ6A 4MLRA 4B4FA 3W7IA 1GYLA 1AL8A 1QR7A 2WVVB 4UTJA 3RPMA 1V7YA 4DI8A 4PMYA 3CT2A 5HMFA 1G7UA 3FNDA 1IF2A 1K8XA 4HN8A 1EEPA 1XIEA 4Q6XA 4RE4A 3R4IA 3IIOA 4KEUA 1HX0A 1OC7A 4B2DD 3E0LA 2CWXA 3MW7A 3WNPA 3G18A 1TRDA 1W3JA 2HTMA 3P82A 1XYBA 4R3UA 3KCLA 2HE5A 2CPUA 3E12A 3G1YA 3DC0A 3RMJA 4QDMA 4QJ3B 5FF0A 4JIIX 5AFDA 1H09A 4AXKA 2GUYA 2DUZA 1O5KA 3HQNA 3LBMA 3WMBA 4JTLA 1K8ZA 3RJXA 2OZ0A 2RDTA 4N6FA 1FH8A 1H0GA 2PF0A 4S3FA 2ACRA 3GW0A 1MXSA 4G1NA 3BCDA 2WMFA 4QQUA 4ACYA 2QJMA 1X1NA 3VTRA 3XINA 2G3MA 3A3HA 1N2VA 1FP9A 2NSOA 1I60A 5KZMA 4V1YA 3ZIZA 3PBVA 3EKLA 4GUHA 3W2UA 4NRSA 2GVGA 3B8TA 2PWVA 2VDIA 1ZNNA 3UXLA 2D3NA 1FX6A 3U0HA 3F5JA 3WQGA 1GKRA 2Z1SA 1HGYA 4ACZA 3R89A 1HKJA 1CZ1A 1CCWB 3AWOA 3KOZA 1VEOA 1NARA 4QEHA 2NQ9A 3JZUA 4MNJA 4O4WA 5H2ZA 4Q8TA 4CNPA 2V81A 2ZBTA 3LV5A 3T55A 3EDFA 3SCNA 1OX4B 1R3QA 2WMIA 1UASA 5DRIA 3LHVA 2PDBA 2F61A 5MHBA 3ITXA 1W3TA 4QLLA 3O8AA 3UCQA 3QV6A 1YRRA 3W1NA 3NZPA 2AL2A 3AUJA 7ENLA 4AEFA 4OKDA 1XLIA 3MBDA 1IR2A 1E9ZB 1XIHA 2DPEA 3WENA 3ZO9A 2EG6A 4LB4A 3HO8A 4QIUA 3ELFA 3R11A 1X8FA 3UPWA 3QR0A 1TJ2A 5C71A 3DYOA 2OGYA 3QYSA 5AZ0A 4GZEA 1X38A 3UR2A 3VGBA 4C6DA 3SN1A 3CLWA 3HPFA 1HFBA 4IF2A 1CTNA 4MJ2A 1NWSA 4K8EA 2ISDA 3S2MA 4W4QA 4U3CA 3LPGA 4O50A 2VCBA 5BW6A 4H7CA 2JF7A 2YPIA 2PTYA 1F6PA 3S9IA 2Y1HA 4QG9A 3UWQA 4CLMA 1QPQA 1W1YA 3QJAA 4QDPA 2YCIX 4WR3A 4N9CA 1L6WA 1QO2A 2ACUA 2UZ9A 2WJFA 3PUEA 3GD6A 4Q4KA 4C7GA 3TP4A 4QISA 1Q65A 4JN7A 3TYAA 1WO2A 3RLUA 3QOMA 1N55A 1CB7B 3JRKA 1XV8A 2NQJA 3PWIA 4JDYA 2E6FA 4IWWA 1TR9A 2ZRVA 3OYXA 2QMJA 4ENLA 5EL1A 4NJKA 3TC6A 5AECA 4Z1YA 1BG4A 6TIMA 3UFYA 3GVGA 3DHFA 1OHLA 4TIMA 3WIJA 3ZR4A 1RJRA 4AZCA 1ADDA 1PS9A 2ZRWA 5IBXC 2V2DA 3PZIA 3KVKA 5REQA 5EMUA 3GE7A 4WF7A 3GFYA 2VEFA 2L5HA 1IR1A 3JW7A 4FEZA 5HJYA 2XN2A 5CH9A 4X22A 3BAWA 2XVGA 3BWWA 4ZZ9A 3LHYA 2E6AA 1CEOA 1OD8A 3QQ0A 4WSKA 7PTDA 4WKAA 2FHCA 1GPWA 1OG0A 4TX9A 1EIBA 3TDFA 1RSCA 2E77A 7XIMA 1QHZA 5EBUA 2G4FA 5C2XA 2VI0A 3NL2A 4JOMA 4I6KA 3R6IA 4H6QA 2Q01A 3OJGA 4L65A 2OMAA 4CCDA 3U3HA 3SCVA 5LKYA 2VZUA 1R85A 2EXOA 3RCYA 1GQJA 1HL2A 4GQBA 1XBZA 1BKHA 3A9BA 3W3OA 2OQLA 3D5HA 3FN9A 2P76A 3QVQA 3TOYA 1JNDA 5AY7A 4GUFA 4UR8A 3IV8A 1E9YB 1R9XA 4LSBA 3ZSTA 5BXSA 3EDDA 2CHNA 3DFSA 2UY5A 1OJXA 2FDSA 1ECEA 3TSBA 3UNDA 2NT0A 3CH0A 3QRHA 2JF6A 3STFA 1S3HA 4WIWA 1LBLA 2A7RA 1GPFA 2XIJA 2GYIA 4XD4A 2YLAA 1YNPA 3STPA 5EMKA 1E5NA 3WD0A 4I7VA 3BCJA 4LS1A 3PSWA 3LB0A 3S1GA 1KRMA 4GBUA 4GFSA 4DBEA 4OHQA 1OD0A 1US0A 4XD3A 2C1HA 2HWGA 2QCFA 2DZPA 2VC6A 5CC6A 4QCEA 3N2MA 1TZ7A 3ZT5A 1F3XA 1RA0A 3ARSA 4AF0B 3CH9A 4IQLA 3LXAA 4R85A 4FHAA 1HKKA 3WQEA 4PUNA 4IL0A 5A94A 1OCJA 3H7VA 3FLUA 5E6YA 3D6NA 1G5AA 4CD8A 1MYRA 4LOCA 4FNRA 4Z2JA 6PTDA 1MUMA 2V3EA 2ZXDA 3SSJA 3C2RA 2FPYA 2Y0FA 3WD4A 1VFLA 3UPBA 1P0KA 3FJ6A 3CHDA 2VRJA 5L6UA 1ONEA 1JL8A 4MGGA 4XSLA 3IJIA 1XI3A 1ADSA 1V51A 3TEVA 1I2RA 4KS0A 4NXSA 3VUPA 3TWAA 3W85A 3B8WA 3VIHA 4LUSA 1FCQA 4CCZA 9RUBA 3OO2A 1A0CA 4PEKA 4NZ1A 1KD0A 3M5VA 3WQDA 2I5IA 1SO5A 4R9XA 1K7XA 5JBEA 3M43A 1JPIA 1UMYA 2VFGA 2R82A 1A80A 1OIFA 4DUWA 2Q02A 4UZSA 4EPKA 3HFTA 4AY7A 1MZRA 4HP5A 3O7UA 4GX8A 3PK7A 3ZVHB 3B0VC 1H41A 4E2VA 1WDWA 4UZUA 2DSKA 4FXRA 3FHAA 3NSXA 3UBPC 3U9IA 2HPIA 4MADA 2WCGA 4FPSA 2XJ7A 2PA6A 1AQ0A 4X63A 1T99A 3DHDA 4HOWA 1EGVA 1R3TA 4HA3A 3A3WA 2OYMA 1XX1A 3SO7A 3OLGA 1EFZA 4IHCA 2QW5A 3ZVIA 3W7DA 1GEHA 4NX5A 2FTWA 3WH7A 3C0QA 3SSZA 1AW5A 2EBNA 3PM6A 4FOKA 1SGJA 5PTDA 5G4HC 4LCSA 2VOTA 2OEJA 4JICA 3SW6A 3TH6A 4M56A 2QDEA 1QRQA 2DVXA 3HPZA 3PBUA 3LBCA 4OQVA 3AIEA 2CEQA 2ZICA 4EX4A 5T9BG 3QH2A 2V5JA 1WOBA 2Z2UA 1TJPA 3CPGA 3S5NA 3AISA 2EF9A 1KXHA 4J2MA 3AXIA 4Q4QA 3IUIA 3L5LA 3N3MA 4ZXLA 3W1PA 4Z1DA 3QN3A 3W0KA 5I03A 1DE6A 4TMBA 2YKKA 1UR9A 4LBRA 1SSGA 3IACA 4GY1A 1Q8JA 1CPUA 5CZKA 3CQIA 2ZOXA 3TONA 3CMJA 1P1XA 5EY5A 1RPKA 1OFEA 1ZFJA 3VFCA 4L4LA 3OLEA 5FD0A 3WQ4A 3WEMA 3WBYA 2OWWA 1TTPA 4Z17A 1VAHA 1AW2A 4S3CA 1J0HA 3M7SA 3HN3A 3ABQA 3FJNA 1L9WA 3H23A 2Y6ZA 5H1WA 2XISA 2J66A 2E5BA 4GNJA 1AUSL 2QF7A 3CO8A 1KR1A 3CTTA 1TV4A 3BANA 1PCWA 3VIKA 4YHEA 3UWUA 3M6YA 1BD0A 1DWHM 1OZMA 2HVMA 2E8YA 4H7VA 1VLWA 3W01A 3A24A 4C6PA 3UETA 2CLKA 3BTNA 1DQWA 1WXYA 3U57A 2VEIA 3BLFA 1OVDA 4XISA 3O6DA 2HVOA 1IWPA 2D73A 3SI9A 1W9DM 1SZGA 5I3GA 4DO7A 8A3HA 4TOQA 4S39A 2DUAA 3WLJA 1JXKA 4ZE5A 2GWNA 2E9MA 4UFLA 1XRTA 5C9XA 1EO7A 5FEZA 3AUOA 1WKFA 4LRTA 3VIPA 5HAOA 4MDPA 4MJMA 4DXVA 4YLWA 5FJTA 4N4PA 4NAFA 3AMKA 2CLOA 1LOLA 5A3HA 4B16A 1GJWA 1L8NA 1IT0A 4H04A 1MNSA 4O1CA 3OZOA 3BG9A 2C15A 1MXGA 2V3DA 4JTGA 4NHVA 3VDGA 4UTTC 1TREA 4MOZA 2V9DA 1TWWA 3QMSA 3L68A 5BWAA 3P14A 2PZNA 1I45A 3PS7A 1A5BA 1P0EA 3CWOX 4CQCA 4O54A 2VZSA 1RBOB 2W91A 4RNJA 3F4WA 1UH4A 4BF9A 2ZUSA 4H8UA 4Y7EA 3LSBA 5AYBA 3CUHA 3RITA 3CV2A 3FA4A 1QK0A 5TBOA 5B80A 1W5NA 2IKHA 4XZNX 1RD5A 3V5CA 2RDUA 1ZU8A 3BLLA 4Y9AA 4MUPA 5HMEA 1MO0A 5K9XA 5TAOA 5FSEC 2F8QA 4IFKB 2ZDSA 3N2OA 7TAAA 2QLYA 1SW7A 3O07A 4IPIA 4Y9PA 3L12A 1K7FA 2QCMA 4Q6JA 2V69A 3W6YA 1MEIA 3BV7A 4H9TA 1TWZA 1SO4A 2NVAA 2EEXA 3RO6A 3P81A 4Q8OA 3O3RA 4NKCA 1TVNA 4LF1A 2VX5A 2QPXA 2WJEA 2ISFA 5C8BB 1IQ8A 3OHIA 3W74A 5DT5A 1EYWA 4GZ7A 5FJUA 4C6OA 2CESA 2QAPA 2YIHA 5LIWX 2G41A 4PZVA 2E8ZA 2A3AA 1VJIA 2CWNA 2E5DA 1YBQA 5LA1A 2R24A 2EJAA 2ZRXA 4M29A 1JZ2A 4GI4A 5T26A 2FB3A 2QS8A 5SWUA 2PDLA 4JHOA 1A0EA 4JQ3A 2XN1A 1LWJA 2Z25A 3OVGA 4US5A 3NPXA 3UNTA 3ONCA 4MPKA 3KW3A 4H8VA 1LUCA 3BJSA 4I9MA 4MZ1A 4NYYA 2PTWA 4DAFA 4MHBA 4E2BA 3BMVA 1KFWA 3BMWA 2GDVA 3SQMA 1FTXA 4IUOA 4CU6A 5DBUA 2YSWA 1UQYA 2OR2A 5MKGA 3WFLA 2PU0A 3IUHA 5L9FA 3AMGA 5F4WA 4B92A 4LYPA 1DJXA 4EIVA 3USBA 4Q8NA 1V3MA 1EJUC 4AVOA 2PU1A 3WQOA 2ALDA 3PAOA 5CLWA 3ZZ1A 3VM7A 1B9ZA 5CG7A 4I5RA 2ZDRA 5D2WA 1B9BA 3D0CA 3W7OA 4XKYA 3W9ZA 1N7KA 3S2NA 1AMKA 3GR8A 3J7HA 4HOXA 3A64A 2PF8A 2C79A 3BG3A 1XLEA 1KWGA 3G0XA 4K2SA 4O8AA 1QJWA 2Q6ZA 4L5ZA 4LYRA 3TU9A 1A5OC 3PZVA 4IG2B 3PN8A 5E9AA 2PRMA 3W7NA 3LLDA 3F2CA 1PX8A 4R34A 1P5BA 3DEQA 3S9ZA 4UTHA 2B31A 2IKJA 1PKYA 4A8IA 2E40A 2MUCA 3TMLA 4UQCA 3S5ZA 2HV5A 2AAAA 4CEXC 3GXPA 3GXFA 1PSCA 2VZOA 5LYRA 2JE8A 4DBSA 2AKMA 1SJDA 4KKXA 1O4UA 3MHUA 5LIUX 1PJ9A 1Z89A 1S5TA 2GUUA 1CDGA 3T2OA 4FSAA 4YYFA 4ZQMA 2X0SA 3IANA 1DIKA 1VC4A 2A2IA 3NSNA 3WFZA 5D8ZA 1J0KA 4LTSA 3WBXA 1VBRA 5DFAA 4TX6A 3V4BA 4B3KA 2P8BA 3PG9A 3PPFA 4A8LA 4FXFA 1TIWA 2VFIA 3FJ4A 1JZ8A 3BMXA 2B0MA 3DG6A 3B04A 2XTKA 1PZ1A 5CZJA 2W4XA 4HZ8A 2XSXA 2YCKX 4B2DA 4UQAA 1JFXA 4C7DA 3GTNA 1TV3A 1D7KA 5CPLA 5IFTA 3U7VA 4DB7A 5J04A 4ADUA 1AD1A 3KXQA 4F9DA 5HWJA 3UCCA 3DFYA 3GSMA 4HPNA 3GZAA 1DTUA 4HA4A 2XDFA 2VHLA 1TE1A 2WHKA 2FH6A 4UFIA 5HA7A 1QI3A 3WMCA 4WJEA 9CGTA 3MKVA 4GYJA 1HXJA 2PGFA 3TSDA 3K1DA 4KWUA 3SAZA 1I1XA 1KA9F 3WQFA 3WLLA 5LGXA 3QW3A 3TROA 3UWVA 4O10A 4J3WA 3FFSA 2POTA 5DMLA 4DWSD 3IIZA 5ABHA 3UZXA 2AGKA 1V5XA 2OTDA 4NJJA 2ISSA 1LWIA 5A8MA 4GBDA 4LY4A 3TA6A 2NQ5A 1K3UA 4H6EA 1OYAA 5I3JA 1IE7C 3QY7A 2VRQA 5KSWA 5H8UA 5BXPA 4E0CA 3M47A 4OWGA 2ZUTA 1RCOB 3ANVA 3H2AA 2HXTA 1B5TA 1C8XA 2FZ9A 3S46A 4MG4A 5FESA 1NJJA 1QUMA 1AH4A 3ENLA 2P8CA 4EWND 4US6A 1OFRA 2WZMA 2F6UA 2OOGA 4UFJA 4LT9A 2Z7GA 2VVNA 1XYLA 3RG6A 1GQKA 4Q7NA 1FQ0A 4WJ8A 3W7KA 2Z28A 3RLVA 3RUBL 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