4YZCA

Crystal structure of pire1alpha in complex with staurosporine
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
402
structure length
382
Chain Sequence
SVVIVGKISFCPKDVLGHGAEGTIVYRGMFDNRDVAVKRILPDREVQLLRESDEHPNVIRYFCTEKDRQFQYIAIELCAATLQEYVEQEPITLLQQTTSGLAHLHSLNIVHRDLKPHNILISMPNAHGKIKAMISDFGLCKKLAVRHFRRGVPGTEGWIAPEMLSCKENPTYTVDIFSAGCVFYYVISEGSHPFGKSLQRQANILLGACSLDCLHPEKHEDVIARELIEKMIAMDPQKRPSAKHVLKHPFFWSLEKQLQFFQDVSDRIEKESLDGPIVKQLERGGRAVVKMDWRENITVPLQTDLRKFRTYKGGSVRDLLRAMRNKKHHYRELPAEVRETLGSLPDDFVCYFTSRFPHLLAHTYRAMELCSHERLFQPYYFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase/endoribonuclease IRE1
publication title Long-Range Inhibitor-Induced Conformational Regulation of Human IRE1 alpha Endoribonuclease Activity.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 105
structure length 382
sequence length 402
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2015-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF06479 Ribonuc_2-5A Ribonuclease 2-5A
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4yzcA02
1.20.1440.180 Mainly Alpha Up-down Bundle de novo design (two linked rop proteins) de novo design (two linked rop proteins) 4yzcA03
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4yzcA01
5EH0A 4AW5A 3FUPA 5CQUA 2VTPA 2WMQA 3GNIB 4UWCA 3DDPA 3MFUA 3VBQA 5DR6A 3UPXA 4BRXA 4MX9A 3V5QA 3MIAA 5EI2A 5HZNA 2BDFA 1MRUA 5JK3A 3E63A 4IM0A 1H28A 4PPBA 4TYHB 3WBLA 2FVDA 3TXOA 1MRYA 3R0TA 3EQBA 5CQWA 3I1AA 1F0QA 3MTLA 3Q3BA 3FXZA 3ZMMA 5AA8A 3NRMA 2QR8A 3DFCB 4YBKA 2V7OA 1U5QA 3D5WA 4O84A 1H1QA 3BX5A 3ERKA 5A3XA 2OJJA 4IXPA 1R0PA 2JDTA 3IGOA 3IW4A 5JGAA 1J7UA 5EW9A 5K0KA 4B9DA 3LKMA 5HCZA 3RNIA 3VS6A 5EDRA 4NT4A 3SDJA 4EHZA 1YOJA 2Y4IB 3ZUTA 2WEIA 5AAGA 2IN6A 3GUBA 4L52A 4EH8A 3PVWA 3PJ1A 3QWJA 3H9FA 2ZV8A 3HEGA 4C62A 2CCIA 1Q5KA 2XNPA 2PMLX 3WF6A 3N4VA 4R78A 5CU0A 2YJRA 4BGHA 5K4JA 4JQ7A 2JDVA 4L3LA 2F57A 3QGYA 3AC3A 4TNBA 4FKIA 3VS0A 1UU7A 5KMOA 4HCVA 2VTRA 2FYSA 4NJDA 3IO7A 4WNOA 1F5QA 3AD5A 4I5HA 4AS0A 3NWWA 3QHRA 2X2KA 2W17A 4A9UA 2G15A 1PRYA 1QPJA 4ENYA 4BICA 3P7AA 1YI4A 2J0IA 2QO7A 4WO5A 3LLTA 1OL6A 4FG9A 4N6ZA 4BYIA 5IG1A 3KRLA 4N0SA 4U3YA 2QQ7A 3VHEA 4IZ5A 2GPHA 3C1XA 1OI9A 2ZYBA 4KB8A 3UO5A 4PMPA 4MQ2A 2WMBA 5CEQA 1RDQE 3NPCA 4CFNA 5CVHA 1UNLA 2OI4X 3HKOA 3ZM9A 4I1ZA 2FA2A 3DKFA 3PXQA 4EORA 4TL0A 3FI3A 3OUKA 3ANQA 1JQHA 3KEXA 4V0GB 4O27B 3ZDUA 4BDDA 3QZGA 3BBWA 1U46A 5F4NA 2J0LA 3FWQA 5AP3A 5HOAA 5H8BA 1URCA 4APCA 4EI4A 4RIXA 5IQCA 4FZDB 4U9AA 5HHWA 5M4CA 4IX6A 4PX6A 3QKKA 4MNFA 1H0VA 4MH7A 3VQHA 2UZEA 5I9UA 2ESMA 2C0IA 3I6UA 1BI8A 3EFJA 2XNGA 3A7FA 4XP2A 4CKIA 2VN9A 3NGAA 4WKQA 4RX9A 5FM3A 1GJOA 3EH9A 3R04A 5HD7A 5GIPE 3LFSA 4QMPA 4XG9A 4F64A 1R3CA 5JFWA 4C8BA 4OTQA 4XG8A 4IWOA 4DYMA 2QOIA 4O0UA 4C02A 5GINE 3F5XA 3IPHA 4FT5A 4A4XA 3BQCA 4DLIA 3MVMA 4ALWA 3RAKA 4I6FA 3Q9ZA 4BTKA 2OIQA 4D1ZA 3ORLA 2XP2A 3BYVA 3NUAA 3PRFA 3QAME 2YCFA 2XNOA 4U44A 3TJCA 5A9UA 1F3MC 5HIDA 2HCKA 3BGPA 4YJPA 3KMWA 1X8BA 3MH0A 4RGJA 4PNKA 4FEUA 4LOOA 1UU8A 4U40A 4CV8A 4ENXA 4CMUA 3SOAA 2BRMA 3GP0A 5KCVA 5D7VA 1ND4A 3FLNC 2PUPA 3TDVA 5KMNA 4J52A 2OGVA 4LFIA 5CF8A 3RWQA 3CE3A 3SXRA 3MPMA 1Q24A 4RJ3A 3MI9A 5F9EA 1VEBA 3QQHA 5DR9A 4ALUA 2XH5A 1WZYA 3VF9A 3E7VA 4ZLOA 3R22A 3LCSA 3E8NA 2Q0BA 3NX8A 4B6LA 3FI8A 4AGUA 4G3CA 5E1SA 3F66A 5M57A 5BVWA 4IM2A 1ZAOA 3V01A 4BHZA 4BBFA 2R3RA 3MFTA 4HVIA 3R00A 4PRJA 3DQWA 2PWLA 3P4KA 4O0RA 4ZSGA 4ARKA 4AW2A 4BN1A 4ITJA 4BZNA 3EJ1A 4EWHA 5IA4A 3QTXA 4DLJA 2E2BA 3CY3A 4EH4A 1FPUA 5HG9A 1HCLA 2YM4A 3PJCA 2EB3A 2WMUA 3R2YA 4YJVA 4JG8A 4ZP5A 2YZLA 3TZ7A 2C5XA 3GVUA 4ANOA 4GUBA 4UEUA 5M53A 2RG5A 4KA3A 4R6VA 2JBOA 3BHVA 3M1SA 4FX3A 4O38A 3LCOA 4W9XA 4ZSEA 3UIMA 3B8QA 5A4EA 3Q4ZA 4AE6A 5JQ5A 1FVTA 5A6NA 2KULA 1OKWA 2ZM3A 1Q8YA 4X3FA 2J2IB 3BE9A 3ZSGA 4ZJVA 5ICPA 3G2FA 5CU2A 2C68A 4DGOA 3ID6C 4JVGA 3I4BA 4ZZNA 2YM3A 4FNYA 1ZRZA 1ZWSA 3DK3A 4DFXE 4ZTMA 1ZY5A 1KE9A 2PL0A 1Y8YA 1M7NA 3OXTA 4BVUA 2FH9A 2YAKA 4QMNA 3NUSA 3D5XA 2A0CX 2VTOA 3PWYA 3Q5ZA 5L2QA 4HOKA 5M4UA 3VBXA 4KIKB 2O64A 4XEYA 2OICA 3UIBA 1FOTA 4AN3A 4E1ZA 2G2HA 4QTAA 4RQVA 2YM8A 4NJ3A 5LMKA 2BFYA 2BRNA 4MXYA 4W9WA 4EOLA 4XOZA 4YLJA 1CDKA 5LCJA 4M68A 4H58A 4HYIA 4AW1A 4FTLA 4FTKA 3DPKA 4FSQA 3S00A 4JQ8A 5DEWA 4YJNA 1E1XA 3DGKA 3F88A 5DI1A 2ITZA 4G3GA 5JZNA 1ZARA 4ITIA 4K2RA 5J95A 4RBLA 3NVMB 5C03A 2ITVA 4OR5A 4QD6A 3KL8A 4GG5A 4WG4A 4FK3A 4Z7GA 2C6EA 5HNGA 3R9DA 4C4EA 2EXMA 3C13A 2X6EA 4UWYA 3FHRA 2H34A 2HW7A 1Q99A 4QYHA 4TN6A 4YSMA 5T3QA 1RW8A 2W1CA 2BR1A 2VD5A 4YBJA 4YJUA 2CKPA 3VS5A 4B8MA 4JIAA 4AFEA 2YDIA 2ITTA 2QD9A 5I3RA 4DBNA 3H9OA 4G5JA 3SQQA 2J50A 4D2RA 2OWBA 3OWJA 2XF0A 2YZAA 4AW0A 4EK3A 1Q3WA 3CGOA 4FTMA 3FMLA 3A7GA 3IW8A 2XCHA 1U4DA 4GIHA 5AIKA 4E3CA 3QKLA 5JRQA 3FSFA 2PU8A 5AM7A 2WQMA 3DNDA 3LFFA 3FZPA 5A4CA 4P5ZA 3EN6A 4II5A 3CIKA 2QLQA 1S9JA 2YAAA 1URWA 3OS3A 4FIGA 4MWIA 2ZB1A 4IM3A 4XUFA 3LFNA 3THBA 3G33A 2X7FA 4M13A 3O8TA 4TWNA 4GSBA 4D2VA 3GQLA 5DWRA 4BI1A 4M66A 3I6WA 5LMAA 3AMYA 3KFAA 3UJGA 2WAJA 2BTSA 4EUUA 3ZSHA 4DCAA 1M17A 4BCQA 4H3PA 3EFKA 5HU9A 3DAJA 4LUDA 2QONA 3OP5A 4C7TA 3WF5A 3E87A 4XRLA 5CXHA 2X8IA 4AE9A 3A60A 3AC2A 5BPYA 3AG9A 3MH2A 3QTWA 4EH6A 5FDXA 1YDSE 3CPCA 3FLYA 3MY1A 3CEKA 4UZHA 2ITOA 4JBPA 5FP5A 5CF6A 4BYJA 4AZEA 2Q83A 4BI2A 2XEYA 3DZOA 4ANBA 4UYNA 3MSSA 3AD4A 3WARA 4IH8A 4FYNA 2I1MA 3C4EA 3ZRLA 1OPJA 2ZJWA 2WPAA 1NW1A 1VYZA 2OFUA 3F69A 5C9CA 4OUCA 1WBOA 3O7LB 2DWBA 2WU6A 4K8AA 4O82A 1BUHA 4TWPA 4C4JA 3WZUA 5T68A 3FBVA 4PDSA 4ACDA 3LMIA 2ITYA 2VTQA 4G17A 3U51A 1NVSA 3H3CA 5AJQA 3SXSA 5IMEA 5IQHA 4B7TA 4M97A 2XM8A 4ZSLA 3LCDA 3RMFA 3EHAA 4IHPA 4EH2A 4P7EA 3UG1A 4E5AX 4NCTA 4FSZA 5AP5A 4PTEA 2YFXA 4RFZA 3R7UA 2XS0A 2JIVA 4IAYA 5HVJA 1IEPA 3OD6X 3DXQA 4EBVA 2UVZA 2VO0A 5HU3A 4ZJJA 4HYUA 4WSQA 4FV1A 4IWQA 3HRCA 5FP6A 5FWKK 2J0KA 4GKIA 2DS1A 2JLDA 4WBBB 3FC1X 1LPUA 3GXLA 4DAWA 3HVCA 1V1KA 2NP8A 3MN3A 4YJRA 4AQCA 4M69A 2RIOA 3UQGA 4U3ZA 4FT9A 3ZH8A 4M3QA 2BPMA 3QTRA 4ASXA 3NNVA 5CEMA 1Y6BA 3R7YA 3U4UA 5C8NA 3P7CA 5F1ZA 4G5PA 3HMMA 2QO2A 1KWPA 4I93A 4C37A 5DT0A 5DYJA 4QQTA 2PVFA 3QALE 5AV0A 3C0IA 4MD8E 1Q61A 5HX6A 5KZIA 4CT2A 3F5UA 5C01A 5BX0A 4EH5A 2ZOQA 4XCUA 5LQFA 5KE0A 3AQVA 3WF9A 3FYKX 3EKKA 2REIA 2VWZA 2HXQA 3IGGA 1H27A 4FTNA 2WMVA 5FTOA 3R9RA 2BZHB 2CJMA 3DT1A 2E9UA 4XYFA 3CQEA 1CKPA 3D7ZA 4L01A 5FBNC 3ZU7A 4TW9A 3HA8A 3NUYA 4F9BA 1GZOA 2R9SA 2VV9A 4I94A 5CX9A 5FBOA 2BZJA 1IG1A 1PMUA 1JWHA 1GIHA 3GCPA 3VBYA 3UOLA 2RF9A 2Z7SA 4NIFB 3HLLA 5CLPA 4BDKA 2UW3A 2GHMA 3FXXA 4IFGA 4X7QA 3SW4A 3R71A 4CFXA 4YPSA 4ANLA 2X2MA 1QMZA 2CSNA 2PUUA 3COIA 4U80A 3ZOSA 5GJGA 3BBTB 4OTPA 3UNZA 1PMNA 5D11A 4ZMFA 4NL0A 1CKJA 5F20A 3KXHA 2PVHA 3EMGA 4J98A 1KE8A 2BUJA 2UW9A 4WNKA 3QD2B 4I5PA 2W9FB 5AV1A 4IDTA 4LRJA 2PUIA 3DA6A 4LRMA 4XV9A 4PV0A 1L3RE 4U97A 5CANA 3K54A 2X4FA 3FLQA 3FAAA 4GW8A 2R2PA 1XBCA 2XB7A 1M7QA 2R0UA 4FKQA 4S33A 5FGKA 1IRKA 4QNAA 4MQ1A 4DGLC 1YXUA 4FV8A 5GIOE 4JDIA 5HEZA 3Q4TA 3G6HA 3W55A 1BLXA 2QHNA 2PZ5A 3DBEA 4QPAA 3B8RA 5TKDA 5LCKA 3BGQA 3D5VA 4I21A 4EOIA 3NW6A 4EL9A 2V55A 4PDPA 4DINA 5DH3A 4YZ9A 5CXZA 3W2QA 3DAEA 2A1AB 3VJNA 2CKEA 2VZ6A 1B39A 4CG9A 3SV0A 4Y83A 5HE3A 1K3AA 4YO6A 5TE0A 4FIIA 3NMUF 2A4LA 3ORXA 3QCSA 2PZYA 3EQHA 3RP9A 1KOAA 1IAHA 1ZMVA 4DFUA 1H0WA 4BDJA 2WTCA 4L53A 4FKWA 4F7NA 3ZS5A 5J1VA 2UVYA 4UX9A 2IG7A 1CKIA 1FGKA 1PF8A 1O6LA 2IPXA 3A7JA 2XIKA 3R02A 5CAOA 4ALVA 4EH9A 5C4KA 5DRBA 2R3IA 3ETAA 5AP7A 2HENA 3I81A 4CD0A 1XH5A 3KXGA 5A4QA 2PUNA 5BVDA 5DMZA 3L8SA 3AT3A 3LFCA 3C4ZA 3MS9A 4QQCA 1WBWA 4F1TA 2JD5A 4R5SA 3GCSA 4FUYA 3QRJA 2B53A 5AP0A 3NIZA 3NIEA 1W83A 3CR0A 2W1FA 3PYYA 2PVRA 4I20A 3ZONA 3KVXA 4C38A 4MD7E 1SZMA 1UKIA 1LR4A 2W4OA 4LL0A 2ERKA 3QD3A 4IC8A 5AR4A 3G0FA 2O8YA 4IWPA 3R8UA 3ZBXA 4BDBA 3U6JA 3Q96A 1GIJA 3F7WA 4C4GA 4EUTA 2JFMA 3DV3A 4JR3A 5HVYA 2XA4A 3R8VA 4X3JA 3JY9A 1YHSA 3ALOA 2PMNX 2XNNA 3E64A 3KULA 1AD5A 3U6IA 2YJSA 4AAAA 1ZOGA 4FIEA 2BHHA 2UZOA 5J9YA 2RFEA 5C4LA 4FKGA 4EH7A 4EZ3A 5E7RA 1J7IA 1Q8TA 3KN6A 3OT3A 2GHGA 3H9RA 1UNHA 3DKGA 1JSTA 2HELA 3FDNA 3VF8A 2G9XA 1W98A 4B0GA 4MXOA 4O2PA 3PSDA 3A61A 5IA0A 4Q9SA 3KXZA 2PK9A 4FSNA 5D1JA 4G31A 4DCEA 2VTMA 4FZAB 4JRVA 3V5WA 3NUPA 3QZHA 3UZPA 3Q9WA 4QMVA 2F9GA 4MYGA 3WIGA 5FEEA 2UW6A 2CLQA 1PYXA 4YZNA 4LV5A 4CMOA 4JX7A 5M06A 3ENMA 4C3RA 4G1WA 2GS2A 4EK6A 2I0EA 5K3YA 2VUWA 3P08A 5BVFA 3QD0A 3KREA 2W1EA 1FBNA 5EFQA 5FD2A 2UZWE 2XRUA 3PSCA 4QMMA 3FI4A 4MTAA 4JR7A 5D7AA 3N51A 3FZ1A 1ZYSA 4QP9A 4RMZA 5HVKA 3UNKA 1OL7A 3QCQA 4ORKA 4D4YA 4ZZOA 4E26A 2HY81 1UWJA 3R1SA 4RIYA 2W05A 3RK9A 4MVFA 3ODYX 5GZAA 4H1MA 1DAWA 4O96A 2UUEA 3L1SA 2WKMA 3AC5A 2VX3A 2GSFA 3FMJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5EH0 A;  4AW5 A;  3FUP A;  5CQU A;  2VTP A;  2WMQ A;  3GNI B;  4UWC A;  3DDP A;  3MFU A;  3VBQ A;  5DR6 A;  3UPX A;  4BRX A;  4MX9 A;  3V5Q A;  3MIA A;  5EI2 A;  5HZN A;  2BDF A;  1MRU A;  5JK3 A;  3E63 A;  4IM0 A;  1H28 A;  4PPB A;  4TYH B;  3WBL A;  2FVD A;  3TXO A;  1MRY A;  3R0T A;  3EQB A;  5CQW A;  3I1A A;  1F0Q A;  3MTL A;  3Q3B A;  3FXZ A;  3ZMM A;  5AA8 A;  3NRM A;  2QR8 A;  3DFC B;  4YBK A;  2V7O A;  1U5Q A;  3D5W A;  4O84 A;  1H1Q A;  3BX5 A;  3ERK A;  5A3X A;  2OJJ A;  4IXP A;  1R0P A;  2JDT A;  3IGO A;  3IW4 A;  5JGA A;  1J7U A;  5EW9 A;  5K0K A;  4B9D A;  3LKM A;  5HCZ A;  3RNI A;  3VS6 A;  5EDR A;  4NT4 A;  3SDJ A;  4EHZ A;  1YOJ A;  2Y4I B;  3ZUT A;  2WEI A;  5AAG A;  2IN6 A;  3GUB A;  4L52 A;  4EH8 A;  3PVW A;  3PJ1 A;  3QWJ A;  3H9F A;  2ZV8 A;  3HEG A;  4C62 A;  2CCI A;  1Q5K A;  2XNP A;  2PML X;  3WF6 A;  3N4V A;  4R78 A;  5CU0 A;  2YJR A;  4BGH A;  5K4J A;  4JQ7 A;  2JDV A;  4L3L A;  2F57 A;  3QGY A;  3AC3 A;  4TNB A;  4FKI A;  3VS0 A;  1UU7 A;  5KMO A;  4HCV A;  2VTR A;  2FYS A;  4NJD A;  3IO7 A;  4WNO A;  1F5Q A;  3AD5 A;  4I5H A;  4AS0 A;  3NWW A;  3QHR A;  2X2K A;  2W17 A;  4A9U A;  2G15 A;  1PRY A;  1QPJ A;  4ENY A;  4BIC A;  3P7A A;  1YI4 A;  2J0I A;  2QO7 A;  4WO5 A;  3LLT A;  1OL6 A;  4FG9 A;  4N6Z A;  4BYI A;  5IG1 A;  3KRL A;  4N0S A;  4U3Y A;  2QQ7 A;  3VHE A;  4IZ5 A;  2GPH A;  3C1X A;  1OI9 A;  2ZYB A;  4KB8 A;  3UO5 A;  4PMP A;  4MQ2 A;  2WMB A;  5CEQ A;  1RDQ E;  3NPC A;  4CFN A;  5CVH A;  1UNL A;  2OI4 X;  3HKO A;  3ZM9 A;  4I1Z A;  2FA2 A;  3DKF A;  3PXQ A;  4EOR A;  4TL0 A;  3FI3 A;  3OUK A;  3ANQ A;  1JQH A;  3KEX A;  4V0G B;  4O27 B;  3ZDU A;  4BDD A;  3QZG A;  3BBW A;  1U46 A;  5F4N A;  2J0L A;  3FWQ A;  5AP3 A;  5HOA A;  5H8B A;  1URC A;  4APC A;  4EI4 A;  4RIX A;  5IQC A;  4FZD B;  4U9A A;  5HHW A;  5M4C A;  4IX6 A;  4PX6 A;  3QKK A;  4MNF A;  1H0V A;  4MH7 A;  3VQH A;  2UZE A;  5I9U A;  2ESM A;  2C0I A;  3I6U A;  1BI8 A;  3EFJ A;  2XNG A;  3A7F A;  4XP2 A;  4CKI A;  2VN9 A;  3NGA A;  4WKQ A;  4RX9 A;  5FM3 A;  1GJO A;  3EH9 A;  3R04 A; 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